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类吗啡类拮抗物的结构与抑食活性的3D-QSAR研究 被引量:2
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作者 李华 许禄 苏锵 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2000年第10期1479-1483,共5页
用比较力场分析研究了 3 ,4 二甲基 4 ( 3 羟基苯基 )哌啶及其衍生物类吗啡拮抗物的结构与抑食活性的关系 ,考察了网格结构和探针原子的影响 .结果表明 。
关键词 三维定量构效关系 类吗啡类拮抗物 减肥药 comfa
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苯胺苯酚类皮革化学品毒性3D-QSAR研究 被引量:2
2
作者 黄旭 温演庆 +3 位作者 罗杨 何健锋 张东飞 何有节 《皮革与化工》 CAS 2013年第6期1-5,共5页
选用36种皮革中常用的苯胺苯酚类化合物及它们的半最大效应浓度EC50,使用比较分子立场分析法(CoMFA)和比较分子相似性分析法(CoMSIA)对这36种化合物进行了三维定量构效效应(3D-QSAR)分析。建立了这36种化合物的3D-QSAR的CoMFA模型和CoM... 选用36种皮革中常用的苯胺苯酚类化合物及它们的半最大效应浓度EC50,使用比较分子立场分析法(CoMFA)和比较分子相似性分析法(CoMSIA)对这36种化合物进行了三维定量构效效应(3D-QSAR)分析。建立了这36种化合物的3D-QSAR的CoMFA模型和CoMSIA模型,其中CoMFA模型q2=0.719,r2=0.974,CoMSIA模型q2=0.749,r2=0.970。这些参数说明了该模型具有良好的拟合能力和预测能力,该类化合物毒性与其静电场、立体场、疏水场和氢键场分布具有良好的相关性,为进一步了解此类化合物毒性作用机制提供了理论参考。 展开更多
关键词 3dqsar 苯胺 苯酚 生物毒性 comfa COMSIA 毒性预测
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苯胺苯酚类LC_(50)的3D-QSAR模型建立与分析
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作者 何健锋 温演庆 +3 位作者 罗杨 黄旭 杨洁 何有节 《皮革科学与工程》 CAS 北大核心 2014年第1期44-47,52,共5页
使用比较分子立场分析法(CoMFA)和比较分子相似性分析法(CoMSIA)对30种涉及皮革及制品的苯胺苯酚类化合物进行了三维定量构效效应(3D-QSAR)分析。以此类化合物半数致死浓度LC50为参考,建立了3D-QSAR的CoMFA模型和CoMSIA模型。其中CoMFA... 使用比较分子立场分析法(CoMFA)和比较分子相似性分析法(CoMSIA)对30种涉及皮革及制品的苯胺苯酚类化合物进行了三维定量构效效应(3D-QSAR)分析。以此类化合物半数致死浓度LC50为参考,建立了3D-QSAR的CoMFA模型和CoMSIA模型。其中CoMFA模型q2=0.724,r2=0.953,CoMSIA模型q2=0.657,r2=0.904。这些参数符合模型稳定性要求,说明苯胺苯酚类化合物毒性与其结构具有良好的相关性。 展开更多
关键词 3dqsar 苯胺 苯酚 LC50 comfa COMSIA 毒性预测
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HIV-1整合酶抑制剂的3D-QSAR研究 被引量:2
4
作者 仝建波 曹旭 《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2019年第6期889-893,共5页
采用Topomer CoMFA方法对26个香豆素衍生物进行三维定量构效关系研究,建立了3 D-QSAR模型,所得优化模型的非交叉相关系数、交互验证系数以及外部验证的复相关系数分别为0.973,0.666和0.960,结果表明该模型具有良好的稳定性和预测能力.... 采用Topomer CoMFA方法对26个香豆素衍生物进行三维定量构效关系研究,建立了3 D-QSAR模型,所得优化模型的非交叉相关系数、交互验证系数以及外部验证的复相关系数分别为0.973,0.666和0.960,结果表明该模型具有良好的稳定性和预测能力.运用这些信息进行分子对接,在理论上验证所构建的模型具有较高的可信性.此外,QSAR的研究结果可为新药合成提供理论参考. 展开更多
关键词 三维定量构效关系 易位体比较分子场 分子对接
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Comparative molecular field analysis (CoMFA) of new herbicidal sulfonylurea compounds 被引量:1
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作者 刘洁 李正名 +4 位作者 王霞 马翼 赖城明 贾国锋 王玲秀 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 1998年第1期50-53,共4页
A series of new herbicidal sulfonylurea compounds were investigated aiming at developing a three dimensional quantitative structure activity relationship (3D QSAR) model using the CoMFA technique. On this base, some m... A series of new herbicidal sulfonylurea compounds were investigated aiming at developing a three dimensional quantitative structure activity relationship (3D QSAR) model using the CoMFA technique. On this base, some molecular structures were modified to improve their activities. A model of the target acetolactate syntheses (ALS) enzyme was established for the first time, which is useful to design and synthesis of new ALS enzyme inhibitor. 展开更多
关键词 comfa 3d qsar ALS ENZYME herbicidal SULFONYLUREA
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GABA_A/BZ受体激动剂4-喹啉酮衍生物的DISCOtech及CoMFA研究
6
作者 王珍菊 程瑾 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1197-1201,共5页
γ-氨基丁酸是重要的抑制性神经传递物质,4-喹啉酮衍生物作用于GABA_A受体具有广泛的生物活性。本文采用DIS- COtech法构建大鼠GABA_A/BZ受体4-喹啉酮衍生物激动剂的药效团模型,同时根据分子骨架叠合规则构建CoMFA模型,模型的交叉验证... γ-氨基丁酸是重要的抑制性神经传递物质,4-喹啉酮衍生物作用于GABA_A受体具有广泛的生物活性。本文采用DIS- COtech法构建大鼠GABA_A/BZ受体4-喹啉酮衍生物激动剂的药效团模型,同时根据分子骨架叠合规则构建CoMFA模型,模型的交叉验证系数为0.681,非交叉验证系数为0.967,药效团模型和CoMFA模型具有一致性。根据模型分析配体-受体间的相互作用,设计一系列化合物并预报了其活性,为设计高活性的化合物提供参考。 展开更多
关键词 GABAA/BZ受体 4-喹啉酮衍生物 药效团模型 3d-qsar comfa
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DATA类逆转录酶抑制剂的三维定量构效关系 被引量:6
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作者 熊远珍 陈芬儿 冯筱晴 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第16期1627-1630,共4页
采用对接方法得到HIV-1抑制剂DATA(二芳基三嗪类)分子的活性构象,进一步用比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性分析(CoMSIA)法对DATA类逆转录酶抑制剂(RTIs)的三维定量构效关系(3D-QSAR)进行了研究,建立3D-QSAR模型,以指导进一步结... 采用对接方法得到HIV-1抑制剂DATA(二芳基三嗪类)分子的活性构象,进一步用比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性分析(CoMSIA)法对DATA类逆转录酶抑制剂(RTIs)的三维定量构效关系(3D-QSAR)进行了研究,建立3D-QSAR模型,以指导进一步结构修饰.用此模型预测了5个DATA类似物,预测偏差较小,表明了所建立的模型具有较强的预测能力. 展开更多
关键词 三维定量构效关系(3dqsar) dATA类似物 比较分子场分析(comfa) 比较分子相似性分析(CoMSIA)
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新型肟醚拟除虫菊酯化合物杀粘虫活性3D-QSAR研究 被引量:4
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作者 柳爱平 胡礼 +4 位作者 刘兴平 裴晖 陆爱军 刘钊杰 姚建仁 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期863-866,共4页
用比较分子力场分析(CoMFA)方法对50个自主设计并合成的新型芳基烷基肟醚化合物杀粘虫活性的定量构效关系进行了研究。所得模型交叉验证参数q2为0.598,非交叉验证相关系数r2为0.949,标准偏差SE=0.136,F=92.419,影响药效的立体场与静电... 用比较分子力场分析(CoMFA)方法对50个自主设计并合成的新型芳基烷基肟醚化合物杀粘虫活性的定量构效关系进行了研究。所得模型交叉验证参数q2为0.598,非交叉验证相关系数r2为0.949,标准偏差SE=0.136,F=92.419,影响药效的立体场与静电场的贡献分别50.6%和49.4%。CoMFA等值线图表明化合物肟苯环对位取代基是影响其杀粘虫活性的主要因素,体积和电性增加有利于提高化合物的杀粘虫活性。该模型三维等值线图为该类化合物的结构改造提供了理论依据。 展开更多
关键词 新型肟醚化合物 杀粘虫活性 三维定量构效关系(3dqsar) 比较分子力场分析(comfa)
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3-D QSAR study on a set of nitroaromatic compounds
9
作者 Xu, M Zhang, AQ +1 位作者 Han, SK Wang, LS 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2002年第3期189-193,共5页
The 3-D relationships between the structures of 25 nitroaromatic compounds and their toxicities have been investigated using the comparative molecular field analysis (CoMFA) method, and a 3-D QSAR model with considera... The 3-D relationships between the structures of 25 nitroaromatic compounds and their toxicities have been investigated using the comparative molecular field analysis (CoMFA) method, and a 3-D QSAR model with considerable prediction ability is obtained. In comparison with traditional 2-D techniques, CoMFA helps to give a better interpretation of toxic mechanism of tested compounds. 展开更多
关键词 nitroaromatic COMPOUNd 3-d qsar comfa.
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黄酮类化合物的3D-QSAR研究 被引量:6
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作者 陈凝木子 黄齐茂 +3 位作者 郭嘉 池汝安 吴元欣 巨修练 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期183-187,共5页
从NCI数据库中,筛选出67个与矢车菊黄素类似的天然黄酮化合物。采用CoMFA方法研究其构效关系,构建CoMFA模型,其模型相关系数为q^2=0.599,r^2=0.919,验证模型的预测能力和拟合能力较好。通过分子场等势图,可直观分子周围立体和静电特征... 从NCI数据库中,筛选出67个与矢车菊黄素类似的天然黄酮化合物。采用CoMFA方法研究其构效关系,构建CoMFA模型,其模型相关系数为q^2=0.599,r^2=0.919,验证模型的预测能力和拟合能力较好。通过分子场等势图,可直观分子周围立体和静电特征对化合物活性的影响,为设计高活性黄酮衍生物提供理论依据。 展开更多
关键词 微管蛋白 黄酮细胞毒性 三维定量构效关系 比较分子力场分析方法
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新型苯环5-(取代)苯甲酰胺基苯磺酰脲类化合物的比较定量构效关系研究 被引量:5
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作者 王美怡 马翼 +1 位作者 李正名 王素华 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第7期1361-1364,共4页
采用比较分子力场分析(CoMFA)方法,对26个新型苯环5-(取代)苯甲酰胺基苯磺酰脲类化合物的除草活性进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,建立了三维定量构效关系CoMFA模型(R2=0.948,F=91.364,SE=0.141).结果表明,此类磺酰脲类化合物的... 采用比较分子力场分析(CoMFA)方法,对26个新型苯环5-(取代)苯甲酰胺基苯磺酰脲类化合物的除草活性进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,建立了三维定量构效关系CoMFA模型(R2=0.948,F=91.364,SE=0.141).结果表明,此类磺酰脲类化合物的除草活性与苯环5位取代基的立体结构和电场性质密切相关.根据CoMFA模型的立体场和静电场三维等值线图不仅直观地解释了结构与活性的关系,而且为进一步设计高活性的目标化合物提供理论依据. 展开更多
关键词 比较分子力场分析(comfa) 三维定量构效关系(3dqsar) 苯环5-(取代)苯甲酰胺基苯磺酰脲 类化合物
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不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂的三维定量构效关系研究 被引量:1
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作者 刘桦 蒲铃铃 +2 位作者 宋海星 曾莉萍 梁桂兆 《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期719-727,共9页
运用不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂,挑选出最优电荷场Gasteiger-Marsili,用COMFA和CoMSIA两种方法建立3D-QSAR模型,以分析化合物结构与分子活性之间的关系。COMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数分别为q2=0.673和q2=0.612,拟合... 运用不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂,挑选出最优电荷场Gasteiger-Marsili,用COMFA和CoMSIA两种方法建立3D-QSAR模型,以分析化合物结构与分子活性之间的关系。COMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数分别为q2=0.673和q2=0.612,拟合验证系数分别为r^2=0.891和r^2=0.973,外部验证复相关系数分别为r2 pred=0.669和r2 pred=0.658,结果表明两种模型都有良好的可信度和预测能力。COMFA和CoMSIA模型在三维等视图上相互对照和验证,得到的结论与分子对接结果一致,确立了分子结构对抑制剂活性影响的具体作用方式,对指导药物的设计与改造,新VEGFR-2抑制剂的合成提供参考。 展开更多
关键词 VEGFR-2抑制剂 电荷场 comfa COMSIA 3d-qsar模型
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抗癌性AHMA衍生物三维定量构效关系研究
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作者 陈锦灿 沈勇 +1 位作者 钱力 郑康成 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期47-50,共4页
应用比较分子场分析法(CoMFA)对一系列抗癌性AHMA类衍生物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,建立了交叉验证的CoMFA模型。所建最佳模型的交叉验证相关系数q2为0.702,非交叉验证相关系数r2为0.993,估算的标准误差S=0.085,统计方差比F... 应用比较分子场分析法(CoMFA)对一系列抗癌性AHMA类衍生物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,建立了交叉验证的CoMFA模型。所建最佳模型的交叉验证相关系数q2为0.702,非交叉验证相关系数r2为0.993,估算的标准误差S=0.085,统计方差比F(4,25)=448.5,用该模型对测试集化合物进行了预测,预测结果与实验值非常接近,表明模型具有很好的预测能力。论文对该系列抗癌化合物的三维定量构效关系进行了深入讨论,结果进一步表明,在R取代基第一个原子上引入拉电子基团或原子,同时选择给电子的R1基团及较大体积的取代基R2,能有效地改善这类化合物的抗癌活性。 展开更多
关键词 AHMA衍生物 抗癌 3dqsar 比较分子力场分析(comfa)
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吡啶类葡萄糖激酶激动剂的三维定量构效关系分析 被引量:5
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作者 张贝娜 武涛 +3 位作者 宰小丽 陈诚 唐光辉 舒茂 《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期492-498,共7页
葡萄糖激酶GK是调节体内葡萄糖代谢和参与血糖动态平衡的主要靶点之一。本文针对46个具有GK激动剂活性的吡啶类衍生化合物进行构效关系研究,研究了其结构与活性的关系。基于分子共同骨架叠合用分子力场分析法(COMFA),比较分子相似指数法... 葡萄糖激酶GK是调节体内葡萄糖代谢和参与血糖动态平衡的主要靶点之一。本文针对46个具有GK激动剂活性的吡啶类衍生化合物进行构效关系研究,研究了其结构与活性的关系。基于分子共同骨架叠合用分子力场分析法(COMFA),比较分子相似指数法(COMSIA)两种经典三维定量构效关系(3D-QSAR)方法,建立相应模型,进行分子结构和抗糖尿病活性分析。COMFA模型的交叉验证系数q^2为0.613,相关系数r^2为0.989;COMSIA模型交叉验证系数q^2为0.621,相关系数r^2为0.982。数据证明两种模型都显示出较好的预测性,为设计新的活性更高的小分子激动剂提供了可靠信息。 展开更多
关键词 葡萄糖激酶 糖尿病 3d-qsar C0MFA C0MSIA
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3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂的三维定量构效关系研究 被引量:1
15
作者 李国荣 吴丽阳 +2 位作者 袁牧 季红 张超 《华西药学杂志》 CAS CSCD 2017年第2期127-131,共5页
目的建立3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。方法采用分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)来研究3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂的构效关系。结果建立了合理、可靠的3-羧基香豆素类乳酸... 目的建立3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。方法采用分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)来研究3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂的构效关系。结果建立了合理、可靠的3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂CoMFA(q^2=0.630,r^2=0.994,r_(pred)~2=0.909)和CoMSIA(q^2=0.676,r^2=0.972,r_(pred)~2=0.574)模型。结论构建的3D-QSAR模型揭示了3-羧基香豆素类化合物的结构和生物活性间的关系,可为该类乳酸转运抑制剂的进一步优化设计提供科学依据。 展开更多
关键词 3-羧基香豆素 乳酸转运抑制剂 抗肿瘤剂 分子力场分析法 比较分子相似性指数分析法 三维定量构效关系
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