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野生大豆盐碱胁迫响应基因GsZFP1的克隆及序列分析
被引量:
9
1
作者
罗晓
曹蕾
+5 位作者
王明超
胡梦然
柏锡
纪巍
才华
朱延明
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期20-26,共7页
盐碱胁迫是影响植物生长、发育和产量的重要因素,野生大豆是优良的非生物胁迫抗性材料。为了获得在植物渗透胁迫反应中起关键作用的功能基因,研究以耐盐碱东北野生大豆(Glycine sojaL.G07256)为试材,利用前期构建的野生大豆碱胁迫基因...
盐碱胁迫是影响植物生长、发育和产量的重要因素,野生大豆是优良的非生物胁迫抗性材料。为了获得在植物渗透胁迫反应中起关键作用的功能基因,研究以耐盐碱东北野生大豆(Glycine sojaL.G07256)为试材,利用前期构建的野生大豆碱胁迫基因芯片表达谱,从中选出一个在盐碱胁迫早期上调表达,经Blast分析预测属于C2H2类型的锌指转录因子(探针号Gma.17534.1.S1_at),命名为GsZFP1。对GsZFP1基因进行芯片结果的sqRT-PCR验证,并通过同源克隆的方法克隆得到GsZFP1的cDNA序列。利用"ORF Finder"及ExPASy的ProtParam工具分析表明GsZFP1蛋白长度为325 aa,分子质量约35.14 ku,预测等电点为9.99。其锌指结构特征为Cys-X2-Cys-X3-Phe-X5-Phe-X2-His-X3-4-His,并且不含QALGGH保守结构域。该基因是野生大豆中首次被发现的不含QALGGH motif C2H2类型的锌指蛋白,并且参与到非生物胁迫反应。该结果将为研究GsZFP1基因在非生物胁迫中的功能,并为认识不含QALGGH保守结构域的C2H2类型的锌指蛋白在非生物胁迫中的作用奠定基础,为耐渗透胁迫基因工程研究提供潜在的基因资源,为植物耐渗透胁迫机理研究提供依据。
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关键词
野生大豆
盐碱胁迫
GsZFP1
锌指蛋白
序列分析
qalggh
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职称材料
题名
野生大豆盐碱胁迫响应基因GsZFP1的克隆及序列分析
被引量:
9
1
作者
罗晓
曹蕾
王明超
胡梦然
柏锡
纪巍
才华
朱延明
机构
东北农业大学生命科学学院
出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期20-26,共7页
基金
国家自然科学基金(31171578)
教育部高等学校博士学科点专项科研基金(20102325120002)
黑龙江省高校科技创新团队建设计划资助(2011TD005)
文摘
盐碱胁迫是影响植物生长、发育和产量的重要因素,野生大豆是优良的非生物胁迫抗性材料。为了获得在植物渗透胁迫反应中起关键作用的功能基因,研究以耐盐碱东北野生大豆(Glycine sojaL.G07256)为试材,利用前期构建的野生大豆碱胁迫基因芯片表达谱,从中选出一个在盐碱胁迫早期上调表达,经Blast分析预测属于C2H2类型的锌指转录因子(探针号Gma.17534.1.S1_at),命名为GsZFP1。对GsZFP1基因进行芯片结果的sqRT-PCR验证,并通过同源克隆的方法克隆得到GsZFP1的cDNA序列。利用"ORF Finder"及ExPASy的ProtParam工具分析表明GsZFP1蛋白长度为325 aa,分子质量约35.14 ku,预测等电点为9.99。其锌指结构特征为Cys-X2-Cys-X3-Phe-X5-Phe-X2-His-X3-4-His,并且不含QALGGH保守结构域。该基因是野生大豆中首次被发现的不含QALGGH motif C2H2类型的锌指蛋白,并且参与到非生物胁迫反应。该结果将为研究GsZFP1基因在非生物胁迫中的功能,并为认识不含QALGGH保守结构域的C2H2类型的锌指蛋白在非生物胁迫中的作用奠定基础,为耐渗透胁迫基因工程研究提供潜在的基因资源,为植物耐渗透胁迫机理研究提供依据。
关键词
野生大豆
盐碱胁迫
GsZFP1
锌指蛋白
序列分析
qalggh
Keywords
Glycine soja; salt and alkali stress; GsZFP1; zinc finger protein; sequence analysis;
qalggh
;
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
Q945.78 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
野生大豆盐碱胁迫响应基因GsZFP1的克隆及序列分析
罗晓
曹蕾
王明超
胡梦然
柏锡
纪巍
才华
朱延明
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
9
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职称材料
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