QIAGEN实时PCR与COBASTaqMan检测血清HBVDNA预测慢性乙型肝炎肝组织病理状态的性能比较

目的比较QIAGEN实时PCR与COBAS TaqMan检测血清HBV DNA水平预测慢性乙型肝炎肝组织病理状态的性能。方法慢性乙型肝炎患者278例,其中HBeAg阳性和阴性分别为162例和1 16例。采用QIAGEN实时定量PCR和COBAS TaqMan系统检测血清HBV DNA。肝组织病理学诊断采用Scheuer评分系统,其中病理学分级和分期包括G0~G4和S0~S4。结果血清HBV DNA（QIAGEN）和HBV DNA（C（）BAS）在HBeAg阳性患者G2与G3,S1、S2、S3与S4之间的差异有统计学意义（P均〈0.05）;在HBeAg阴性患者G1与G2、G3,S1与S2、S3、S4之间的差异有统计学意义（P均〈0.05）。血清HBV DNA（QIAGEN）与HBV DNA（COBAS）定量的不一致率,在HBeAg阳性患者G1-2、G3和S1-3、S4分别为4.24%（5/1 18）、9.09%（4/44）和3.68%（5/136）、7.69%（2/26）,在HBeAg阴性患者G1、G2-3和S1、S2-4分别为6.02%（5/83）、3.03%（1/33）和3.29%（2/61）、3.64%（2/55）。血清HBV DNA（QIAGEN）和HBV DNA（COBAS）预测HBeAg阳性患者≥G3、≥S4的ROC曲线下面积分别为0.645和0.695、0.703和0.755,预测HBeAg阴性患者≥G2、≥S2的ROC曲线下面积分别为0.848和0.817、0.756和0.756。血清HBV DNA（QIAGEN）和HBV DNA（COBAS）预测HBeAg阳性患者≥S4的最佳截断值分别为≤3.784×10~6 IU/mL和≤6.668×10~7IU/mL,对应的灵敏度、特异度分别为0.654和1.000、0.735和0.581;预测HBeAg阴性患者≥G2的最佳截断值分别为≥5.821×10~3IU/mL和≥9.311×10~3 IU/mL,对应的灵敏度、特异度分别为0.970和0.909、0.614和0.651。结论血清HBV DNA预测肝组织病理状态的特点为预测HBeAg阴性患者≥G2的效能最大,并且血清HBV DNA（QIAGEN）与HBV DNA（COBAS）预测HBeAg阴性患者≥G2的性能有高度一致性。

15种常见食(药)用菌的3种总DNA提取方法比较研究

本文研究了15种主要食(药)用菌共16个样品的3种总DNA提取方法之比较,它们分别是CTAB法、食品DNA提取试剂盒法和QIAGEN试剂盒法。提取结果分别经过核酸蛋白分析仪、电泳以及RAPD检测。紫外检测结果表明3种方法提取到的总DNA质量均不理想,电泳结果表明3种方法均能提取出小平菇、红菇、香菇、双孢蘑菇、竹荪、黑木耳、姬松茸等7种食(药)用菌总DNA,RAPD检测结果表明CTAB法适用于所有15种食(药)用菌提取用于PCR的总DNA。根据以上结果,我们认为可以选用CTAB法作为在检测这些食(药)用菌的转基因成分时的总DNA提取方法。