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基于嵌入式ARM的微流控PCR检测系统设计
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作者 张帅 胡志刚 +3 位作者 杜喆 祖向阳 王新征 马蓓蓓 《传感器与微系统》 CSCD 北大核心 2024年第1期76-79,83,共5页
为了实现微流控设备功能的集成化、提高交互系统的可操作性,提出一种基于嵌入式ARM的微流控聚合酶链式反应(PCR)控制系统及上位机软件的设计方案。系统硬件采用多个嵌入式ARM控制器与功能模块相互协调,制定可扩展的通信机制和协议,实现... 为了实现微流控设备功能的集成化、提高交互系统的可操作性,提出一种基于嵌入式ARM的微流控聚合酶链式反应(PCR)控制系统及上位机软件的设计方案。系统硬件采用多个嵌入式ARM控制器与功能模块相互协调,制定可扩展的通信机制和协议,实现微流控PCR检测过程中的流路运动、温度控制、荧光信号采集等功能的集成控制。采用Qt结合SQLite数据库设计了上位机软件,利用多线程和节点映射,实现对硬件模块的协调控制以及检测信息存储。实验表明:该系统运行稳定,人机交互效果好,可操作性高,满足微流控PCR的集成功能需求。 展开更多
关键词 嵌入式ARM 微流控聚合酶链式反应 控制系统 上位机软件 Qt软件
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宫颈糜烂患者单纯疱疹病毒Ⅱ型感染情况分析 被引量:13
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作者 张丽 杨慧兰 +2 位作者 刘仲荣 樊建勇 毕建军 《中国皮肤性病学杂志》 CAS 北大核心 2012年第4期319-320,325,共3页
目的探讨宫颈糜烂患者单纯疱疹病毒(HSV-Ⅱ)感染情况。方法用实时荧光定量PCR法对212例受试者宫颈棉拭子中HSV-Ⅱ进行检测。结果 162例宫颈糜烂患者中,HSV-Ⅱ阳性率为29.01%(47/162),50例正常对照组中,HSV-Ⅱ阳性率为10.00%(5/50),两组... 目的探讨宫颈糜烂患者单纯疱疹病毒(HSV-Ⅱ)感染情况。方法用实时荧光定量PCR法对212例受试者宫颈棉拭子中HSV-Ⅱ进行检测。结果 162例宫颈糜烂患者中,HSV-Ⅱ阳性率为29.01%(47/162),50例正常对照组中,HSV-Ⅱ阳性率为10.00%(5/50),两组差异有统计学意义(P<0.05)。Ⅰ,Ⅱ和Ⅲ度宫颈糜烂患者HSV-Ⅱ阳性率分别为19.64%(11/56),27.78%(15/54)和40.38%(21/52),提示宫颈糜烂程度与HSV-Ⅱ的阳性率呈正相关(r=0.186,P<0.05)。结论 HSV-Ⅱ感染与宫颈糜烂密切相关,且随宫颈糜烂程度的增加,HSV-Ⅱ感染率增加。应加强对宫颈糜烂患者HSV-Ⅱ的检测。 展开更多
关键词 实时荧光定量PCR 单纯疱疹病毒 宫颈糜烂
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结肠癌转移相关基因1在结肠癌组织中的表达及其临床意义 被引量:2
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作者 王珂 蒋谦 俞军 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2012年第12期1081-1084,共4页
目的探讨结肠癌组织中结肠癌转移相关基因1(MACC-1)的表达与结肠癌临床病理特征的关系。方法采用实时荧光定量PCR和免疫印迹法(Western blotting)检测48例结肠癌组织及其相应癌旁组织中MACC-1 mRNA和蛋白的表达水平。结果结肠癌组织中MA... 目的探讨结肠癌组织中结肠癌转移相关基因1(MACC-1)的表达与结肠癌临床病理特征的关系。方法采用实时荧光定量PCR和免疫印迹法(Western blotting)检测48例结肠癌组织及其相应癌旁组织中MACC-1 mRNA和蛋白的表达水平。结果结肠癌组织中MACC-1 mRNA相对表达量为(8.52±2.39)×10-4,明显高于癌旁组织中的(1.47±1.24)×10-5,差异有统计学意义(P<0.05)。结肠癌组织中MACC-1蛋白表达的灰度值为7.73±0.03,高于癌旁组织的1.02±0.01(P<0.05)。结肠癌患者组织中MACC-1 mRNA和蛋白的表达与肿瘤的分化程度、浸润深度、TNM分期显著相关(P<0.05),而与年龄、性别无关(P>0.05)。结论 MACC-1表达的检测对结肠癌的诊断具有一定的临床意义,且MACC-1的表达水平与结肠癌的浸润和转移密切相关,可作为判断结肠癌转移的肿瘤标志物之一。 展开更多
关键词 结肠癌 结肠癌转移相关基因1 实时荧光定量PCR 免疫印迹法
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氟哌啶醇致新西兰兔QT间期延长及其对L型钙通道mRNA表达水平的影响 被引量:2
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作者 阿迪力.阿不都热合曼 闫冬 +1 位作者 邹洲 帕尔哈提.克热木 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期615-618,共4页
目的观察不同剂量氟哌啶醇对新西兰兔心电图QT间期的影响及其对L型钙通道mRNA表达水平的影响。方法采用体表心电图技术,通过BL-410生物机能实验系统动态记录Ⅱ导联心电图的变化,观察不同剂量氟哌啶醇对新西兰兔心电图的影响。提取心肌... 目的观察不同剂量氟哌啶醇对新西兰兔心电图QT间期的影响及其对L型钙通道mRNA表达水平的影响。方法采用体表心电图技术,通过BL-410生物机能实验系统动态记录Ⅱ导联心电图的变化,观察不同剂量氟哌啶醇对新西兰兔心电图的影响。提取心肌组织总RNA,采用RT-PCR方法,观察氟哌啶醇对L型钙通道mRNA表达水平的影响。结果氟哌啶醇能引起的QT间期延长,剂量越大延长越明显。氟哌啶醇对QT间期的影响主要发生在给药后0~120min,360min后基本恢复正常。RT-PCR结果显示氟哌啶醇使L型钙通道mRNA表达水平明显增高。结论氟哌啶醇可使QT间期延长,其机制可能与增强L型钙通道mRNA表达有关,从而增加发生室性心律失常的潜在危险性。 展开更多
关键词 氟哌啶醇 新西兰兔 心律失常 QT间期 RT-PCR mRNA
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Effects of IκBα and its mutants on NF-κB and p53 signaling pathways 被引量:3
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作者 Xian Li Da Xing +5 位作者 Ju Wang De-Bin Zhu Lan Zhang Xiao-Jia Chen Fen-Yong Sun An Hong 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2006年第41期6658-6664,共7页
AIM: To study the effects of IκBα and its mutants (IκBαM, IκBα3N, IκBαM44C) on NF-κB, p53 and their downstream target genes. The relationship of NF-κB, p53, and IκBα was further discussed. METHODS: pEC... AIM: To study the effects of IκBα and its mutants (IκBαM, IκBα3N, IκBαM44C) on NF-κB, p53 and their downstream target genes. The relationship of NF-κB, p53, and IκBα was further discussed. METHODS: pECFP-IκBα, pECFP-IκBαM (amino acides 1-317, Ser32, 36A), pECFP-IκBα243N (amino acides 1-243), pECFP-IκBα244C (amino acides 24±317), pEYFP-p65 and pp53-DsRed were constructed and transfected to ASTC-α-1 cells. Cells were transfected with pECFP-Cl as a control. 30 h after the transfection, location patterns of NF-κB, p53 and IκBα(IκBαM, IκBα243N, IκBα224C) were observed by a laser scanning microscope (LSM510/ConfoCor2, Zeiss). RNA extraction and reverse transcription were performed in cells transfected or co-transfected with different plasmids. Effects of IκBα and its mutants on the transprition level of NF-κB, NF-κB downstream target gene TNF-α, p53 and p53 downstream target gene Bax were observed by real time QT-PCR. In all experiments β-actin was reference. Results are expressed as the target/reference ratio of the sample divided by the target/reference ratio of the control. Different transfected cells were incubated with CCK-8 for 2 h in the incubator. Then the absorbance at 450 nm was measured by using a microplate reader. RESULTS: Cells that were transfected with p53- DsRed revealed a predominant nuclear localization. YFP-p65 mainly existed in the cytoplasm. Cells were transfected with CFP-IκBα, CFP-IκBαM, and CFP-IκBα243N respectively and revealed a predominant cytosolic localization. However, cells transfected of CFP-IκBα244C revealed a predominant nuclear localization. The rnRNA levels of p65, TNF-α, p53 and Bax in CFP-IκBα transfected cells did not change significantly, while in YFP-p65/CFP-IκBα co-transfected cells, IκBα decreased the transcription of p65 downstream gene TNF-α (2.24 ± 0.503) compared with the YFP-p65/ CFP-C1 co-transfected cells (5.08 ± 0.891) (P 〈 0.05). Phosphorylation defective IκBα (IκBαM) decreased the transcription levels of all the four genes compared with the control (P 〈 0.05). The N terminus of IκBα(IκBα243N) increased the transcription of NF-κB (1.84 ± 0.176) and TNF-α (1.51 ± 0.203) a little bit. However, the C terminus of IκBα(IκBα244C) increased the transcription of NF-κB, TNF-α, p53 and Bax significantly (8.29 ± 1.662, 14.16 ± 2.121, 10.2 ± 0.621, 3.72 ± 0.346) (P 〈 0.05). The CCK-8 experiment also showed that IκBα244C and p53 synergistically mediate apoptosis. CONCLUSIONS: IκBα and its mutants (IκBαM, IκBα243N, IκBαM244C) have different effects on NF- KB and p53 signaling pathways, according to their different structures. IκBαbounds with NF-KB and p53 in cytoplasm steadily, and inhibits both of the two signaling pathways, p53 and IκBα244C may be co-factor in inducing apoptosis. The C terminal of IκBαnhanced cell death, which suggests that it may be a pro-apoptotic protein existed in cells. 展开更多
关键词 Nuclear factor-κB Inhibitor of NF-κB alpha P53 Real-time qt-pcr
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利用PCR-SSCP对人MINK基因的研究 被引量:3
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作者 杨平 MartinArmstrong +1 位作者 戴德哉 WalterLuyten 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期14-16,共3页
人类MINK基因的两种突变导致长QT综合征(LQTS)。我们设计了两对引物利用PCR-SSCP结合直接测序法在病人及健康者中对MINK基因进行分析,结果发现第149位密码子产生A→G转换。在所研究的对象中,此变化在病人及正常对照者中均有存在。... 人类MINK基因的两种突变导致长QT综合征(LQTS)。我们设计了两对引物利用PCR-SSCP结合直接测序法在病人及健康者中对MINK基因进行分析,结果发现第149位密码子产生A→G转换。在所研究的对象中,此变化在病人及正常对照者中均有存在。提示MINK基因的此突变性质为非病理性的多态突变。 展开更多
关键词 人MINK基因 PCR-SSCP 长QT综合征 基因突变
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实时荧光PCR法检测结核杆菌的临床价值 被引量:3
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作者 魏进武 廖俐雅 +2 位作者 余登琼 吴朝菊 袁世梅 《中外医疗》 2021年第20期20-23,36,共5页
目的分析实时荧光PCR(QT-PCR)法检测结核杆菌的临床价值。方法方便选取2018年1月—2020年9月该院门诊和住院部接收的疑似肺结核患者作为研究对象,其中7066例使用涂片法检测,942例应用QT-PCR法进行结核分枝杆菌复合群核酸检测,561例使用... 目的分析实时荧光PCR(QT-PCR)法检测结核杆菌的临床价值。方法方便选取2018年1月—2020年9月该院门诊和住院部接收的疑似肺结核患者作为研究对象,其中7066例使用涂片法检测,942例应用QT-PCR法进行结核分枝杆菌复合群核酸检测,561例使用固体培养法检测,其中共352名患者的样本同时进行了3种方法检测。观察涂片法、QT-PCR法、固体培养法的阳性检出率,对比涂片法和QT-PCR法检测的阳性率、特异性、灵敏度以及准确率。结果固体培养法的结核杆菌的阳性例数为205例,阳性率为36.54%。涂片法结核杆菌的阳性例数为162例,阳性检出率为2.29%;QT-PCR法结核杆菌的阳性例数为281例,阳性率为29.83%。涂片法检测的特异性为90.61%、灵敏度为69.78%、准确率为82.39%;QT-PCR法检测特异性为86.85%、灵敏度为83.45%、准确率为85.51%,QT-PCR法灵敏度与阳性率均高于涂片法,差异有统计学意义(χ^(2)=7.250、1206.103,P<0.05)。结论应用QT-PCR法对结核杆菌进行检测,具有较高的准确性,特异性、灵敏度较好,同时与固体培养法联合使用能够提高检测准确率,相较涂片法更适合应用于结核杆菌的检测。 展开更多
关键词 qt-pcr 结核杆菌检测 涂片法 固体培养法
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应用PCR技术对先天性长QT综合征KCNQ1基因进行定点突变的研究
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作者 李伟 杨钧国 +2 位作者 任法鑫 康彩练 张守焰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期589-593,共5页
利用聚合酶链反应(PCR)技术对长QT综合征(LQTS)KCNQ1基因进行定点突变的研究。首先设计两对引物(包含预定的突变),通过3轮PCR扩增,扩增出含有所需突变位点的片段,然后将片段克隆入T载体中,通过酶切连接的方法将突变点引入到pIRES2 EGFP ... 利用聚合酶链反应(PCR)技术对长QT综合征(LQTS)KCNQ1基因进行定点突变的研究。首先设计两对引物(包含预定的突变),通过3轮PCR扩增,扩增出含有所需突变位点的片段,然后将片段克隆入T载体中,通过酶切连接的方法将突变点引入到pIRES2 EGFP KCNQ1中,随后用Effectene转染试剂介导转染HEK293细胞。结果在真核表达载体pIRES2 EGFP KCNQ1基础上获得了KCNQ1cDNAC934T的突变体,测序表明在序列中发生了预期的突变。将含突变点的pIRES2 EGFP KCNQ1转染HEK293细胞后,在荧光显微镜下观察到被转染的HEK293细胞发出绿色荧光,表明含突变点的pIRES2 EGFP KCNQ1得到了表达。 展开更多
关键词 长QT综合征 KCNQ1 PCR 定点突变
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胶原蛋白海绵对拔牙创愈合过程中基因ALP表达的影响 被引量:4
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作者 李俊福 陈岱韻 +3 位作者 姜娟 吴长春 赵作勤 王旭霞 《泰山医学院学报》 CAS 2018年第10期1087-1089,共3页
目的探讨胶原蛋白海绵填入拔牙创后牙槽窝早期骨愈合过程中成骨相关基因ALP表达的变化。方法健康成年大鼠16只,建立大鼠拔牙模型,左侧拔牙创内填入胶原蛋白海绵为实验侧,右侧拔牙创为空白对照侧。拔牙术后1周、2周、4周、8周处死动物取... 目的探讨胶原蛋白海绵填入拔牙创后牙槽窝早期骨愈合过程中成骨相关基因ALP表达的变化。方法健康成年大鼠16只,建立大鼠拔牙模型,左侧拔牙创内填入胶原蛋白海绵为实验侧,右侧拔牙创为空白对照侧。拔牙术后1周、2周、4周、8周处死动物取材,利用实时定量PCR法检测实验侧与对照侧ALP表达变化。应用SPSS19.0软件对数据进行统计学分析。结果术后1周、2周、4周、8周,实验侧牙槽窝组织ALP基因表达相对定量均显著高于对照侧组织(P<0.05)。结论基因ALP在填入胶原蛋白海绵的拔牙创组织的表达上调。 展开更多
关键词 胶原蛋白海绵 基因表达 ALP基因 实时定量PCR
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小鼠Sirt2基因的组织表达谱及其成肌细胞分化过程中的时序表达 被引量:3
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作者 吴国芳 王磊 周继平 《青海畜牧兽医杂志》 2017年第6期27-30,共4页
本实验目的在于检测Sirt2在小鼠各组织器官及成肌分化过程中的表达情况,通过实时定量PCR及Westernblot检测Sirt2在小鼠各组织中的表达,发现Sirt2表达具有广泛性,其中在肌肉与心脏中高表达。进一步检测Sirt2基因在成肌细胞C2C12不同分化... 本实验目的在于检测Sirt2在小鼠各组织器官及成肌分化过程中的表达情况,通过实时定量PCR及Westernblot检测Sirt2在小鼠各组织中的表达,发现Sirt2表达具有广泛性,其中在肌肉与心脏中高表达。进一步检测Sirt2基因在成肌细胞C2C12不同分化时间点的mRNA及蛋白表达情况,结果显示Sirt2在C2C12分化早期高表达,在分化晚期表达降低。Sirt2在成肌细胞分化过程中的差异表达显示,其可能在肌肉发育过程中发挥作用。 展开更多
关键词 Sirt2基因 小鼠 实时定量PCR WESTERNBLOT
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4-苯基丁酸对棕榈酸诱导的胰岛β细胞内质网应激的效应 被引量:1
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作者 于平 孙琦 +2 位作者 潘慧 安芳 朱惠娟 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2014年第14期2004-2006,共3页
目的探讨4-苯基丁酸(4-PBA)对棕榈酸诱导的大鼠RIN-m5F细胞内质网应激(ERS)的效应。方法大鼠RIN-m5F细胞用基础培养基孵育24 h,转为无糖1640培养基,孵育24 h,加入1 mmol/L棕榈酸及不同浓度4-PBA共孵育24 h。QT-PCR(实时荧光定量聚合酶... 目的探讨4-苯基丁酸(4-PBA)对棕榈酸诱导的大鼠RIN-m5F细胞内质网应激(ERS)的效应。方法大鼠RIN-m5F细胞用基础培养基孵育24 h,转为无糖1640培养基,孵育24 h,加入1 mmol/L棕榈酸及不同浓度4-PBA共孵育24 h。QT-PCR(实时荧光定量聚合酶链反应)检测4-PBA处理前后ERS相关因子GRP78、CHOP及caspase3mRNA的表达变化。蛋白免疫印迹方法(Western blotting)测定相应蛋白的表达水平。结果棕榈酸刺激后细胞内GRP78、CHOP及caspase3 mRNA表达水平增加。10 mmol/L 4-PBA处理后,CHOP、caspase3表达量降低;蛋白免疫印迹结果显示,棕榈酸刺激后CHOP、caspase3蛋白表达增加,10 mmol/L4-PBA处理后表达降低。结论 4-PBA可能通过CHOP途径减轻RIN-m5F细胞的ERS,对细胞凋亡具有一定的抑制作用。 展开更多
关键词 内质网应激 4-苯基丁酸 RIN-m5F细胞 实时荧光定量聚合酶链反应 蛋白免疫印迹
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