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利用Bayes分层广义线性模型剖析大豆籽粒性状的遗传基础
被引量:
4
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作者
闫宁
谢尚潜
+6 位作者
耿青春
徐宇
李广军
刘兵
汪霞
李其刚
章元明
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期258-268,共11页
以溧水中子黄豆(P1)和南农493-1(P2)组合的504个正反交F2:3~F2:7家系群体为材料, 调查大豆粒长、粒宽、粒厚、长宽比、长厚比、宽厚比和百粒重性状在2007—2011年的表型观测值, 扫描F2群体SSR分子标记信息, 用Bayes分层广义线性...
以溧水中子黄豆(P1)和南农493-1(P2)组合的504个正反交F2:3~F2:7家系群体为材料, 调查大豆粒长、粒宽、粒厚、长宽比、长厚比、宽厚比和百粒重性状在2007—2011年的表型观测值, 扫描F2群体SSR分子标记信息, 用Bayes分层广义线性模型方法检测了上述性状的主效QTL、QTL′环境(QE)互作、QTL′细胞质(QC)互作和QTL′QTL(QQ)互作。共检测到89个主效QTL、33对QE、20对QC和35对QQ互作。上述7个性状的主效QTL分别有7、10、10、19、19、17和7个; QQ互作分别有1、10、6、0、6、9和3对, 没有检测到显性′显性互作; QE互作分别有5、7、6、3、6、2和4对; QC互作分别有2、1、3、8、4、2和0对。主效、QQ互作、QC互作和QE互作QTL的总贡献率分别为12.42%~61.79%、0~23.21%、0.35%~1.51%和0~14.16%, 表明主效QTL贡献最大, QQ互作次之, QE互作最小。各类QTL都有一因多效现象, 同一基因座可通过不同方式影响性状表达。这些结果揭示了大豆粒形性状的遗传基础, 为标记辅助育种提供了参考信息。
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关键词
大豆
籽粒大小和形状
上位性
主效
qtl
qtl×
环境
互
作
qtl×细胞质互作
Bayes分层广义线性模型
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职称材料
题名
利用Bayes分层广义线性模型剖析大豆籽粒性状的遗传基础
被引量:
4
1
作者
闫宁
谢尚潜
耿青春
徐宇
李广军
刘兵
汪霞
李其刚
章元明
机构
南京农业大学/作物遗传与种质创新国家重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期258-268,共11页
基金
国家自然科学基金项目(30971848)
教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NECT-05-0489)
+1 种基金
江苏省自然科学基金项目(BK2008335)
中央高校基本科研业务费专项资金创新团队项目(KYT201002)资助
文摘
以溧水中子黄豆(P1)和南农493-1(P2)组合的504个正反交F2:3~F2:7家系群体为材料, 调查大豆粒长、粒宽、粒厚、长宽比、长厚比、宽厚比和百粒重性状在2007—2011年的表型观测值, 扫描F2群体SSR分子标记信息, 用Bayes分层广义线性模型方法检测了上述性状的主效QTL、QTL′环境(QE)互作、QTL′细胞质(QC)互作和QTL′QTL(QQ)互作。共检测到89个主效QTL、33对QE、20对QC和35对QQ互作。上述7个性状的主效QTL分别有7、10、10、19、19、17和7个; QQ互作分别有1、10、6、0、6、9和3对, 没有检测到显性′显性互作; QE互作分别有5、7、6、3、6、2和4对; QC互作分别有2、1、3、8、4、2和0对。主效、QQ互作、QC互作和QE互作QTL的总贡献率分别为12.42%~61.79%、0~23.21%、0.35%~1.51%和0~14.16%, 表明主效QTL贡献最大, QQ互作次之, QE互作最小。各类QTL都有一因多效现象, 同一基因座可通过不同方式影响性状表达。这些结果揭示了大豆粒形性状的遗传基础, 为标记辅助育种提供了参考信息。
关键词
大豆
籽粒大小和形状
上位性
主效
qtl
qtl×
环境
互
作
qtl×细胞质互作
Bayes分层广义线性模型
Keywords
Soybean
Seed size and shape traits
Main-effect
qtl
Epistasis
qtl
-by-environment interaction
qtl
-by-cyto-plasm interaction
Bayes hierarchical generalized linear model
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用Bayes分层广义线性模型剖析大豆籽粒性状的遗传基础
闫宁
谢尚潜
耿青春
徐宇
李广军
刘兵
汪霞
李其刚
章元明
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
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