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野生稻单片段代换系苗期耐旱性评价及QTL鉴定
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作者 廖冰 黄秀艳 +2 位作者 陈科 傅雪琳 何平 《广东农业科学》 CAS 2024年第3期70-80,共11页
【目的】干旱是影响水稻生产力的主要非生物因素之一,筛选抗旱水稻可有效保障水稻产量。【方法】选取以南方野生稻和展颖野生稻为供体、‘华粳籼74’(HJX74)为受体构建的93份单片段代换系(Single-segment substitution lines,SSSLs)为... 【目的】干旱是影响水稻生产力的主要非生物因素之一,筛选抗旱水稻可有效保障水稻产量。【方法】选取以南方野生稻和展颖野生稻为供体、‘华粳籼74’(HJX74)为受体构建的93份单片段代换系(Single-segment substitution lines,SSSLs)为供试材料,以HJX74为对照,采用20%PEG-6000模拟干旱条件进行苗期耐旱性试验,以4个生长发育性状指标(相对苗高、相对苗干质量、相对根干质量、相对根长)作为评价指标,采用隶属函数法对SSSLs进行排序、筛选相关性状,并筛选与HJX74差异显著的SSSLs,进行QTL鉴定与加性效应分析,初步鉴定与苗期耐旱性状相关的QTL。【结果】4个生长发育性状指标与平均隶属函数值的相关性分析结果均为极显著正相关,可作为SSSLs苗期耐旱性鉴定和评价指标。隶属函数法分析结果显示,93份SSSLs平均隶属函数值范围为0.20~0.71,HJX74平均隶属函数值为0.54;有29个SSSLs的平均隶属函数值> HJX74的平均隶属函数值,其中,M124的隶属函数值最大,表明M124具有较强的耐旱性。通过单因素方差分析,从8个SSSLs(M78-1、M78-2、M124、M107、M151、M103、M130、M115)鉴定出7个相对苗高QTLs(qRSH1-1、qRSH1-2、qRSH2-1、qRSH3-1、qRSH3-2、qRSH5-1、qRSH6-1),分别分布在1、2、3、5、6号染色体,其加性效应为0.05~0.06,表型贡献率为6.97%~9.01%;从3个SSSLs(M79、M145、M148)中鉴定出3个相对根干质量QTLs(qRRDW10-1、qRRDW11-1、qRRDW11-2),分别分布在10、11号染色体,其加性效应为0.12~0.20,表型贡献率为12.51%~19.95%;从2个耐旱SSSLs(M80、X149)中鉴定出1个相对苗干质量QTL(qRSDW5-1),分布在5号染色体,加性效应为0.07,表型贡献率为10.5%。【结论】筛选出13份SSSLs携带苗期耐旱QTLs,为后续苗期耐旱QTLs精细定位与克隆研究奠定基础。 展开更多
关键词 单片段代换系 干旱胁迫 PEG-6000 野生稻 隶属函数 qtl鉴定
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基于黄褐棉导入系的抗黄萎病QTL鉴定分析 被引量:1
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作者 邓琳 刘静 +7 位作者 张咪 黄芳 周水娟 刘倩 梅艳 王泽 王凯 汪保华 《江苏农业科学》 2018年第15期68-72,共5页
棉花是我国重要的经济作物,对纺织工业发展和提高人民生活水平具有重要作用。陆地棉是最主要的栽培棉种,占棉花产量的90%以上,然而其对黄萎病抗性仍有待提高。黄褐棉对黄萎病抗性强,且作为与陆地棉遗传距离较远的异源四倍体野生棉,很可... 棉花是我国重要的经济作物,对纺织工业发展和提高人民生活水平具有重要作用。陆地棉是最主要的栽培棉种,占棉花产量的90%以上,然而其对黄萎病抗性仍有待提高。黄褐棉对黄萎病抗性强,且作为与陆地棉遗传距离较远的异源四倍体野生棉,很可能具备一些优异的抗病等位基因供发掘利用。以陆地棉PD94042为轮回亲本,以黄褐棉为供体亲本,经过杂交以及高世代回交,并结合分子标记辅助选择,建立一套渐渗有黄褐棉的导入系,成功检测到10个黄萎病抗性相关数量性状基因座(quantitative trait locus,简称QTL),解释表型变异范围为14.0%~39.3%。这些结果为进一步开展QTL精细定位,服务于棉花抗黄萎病育种实践奠定了基础。 展开更多
关键词 黄褐棉 陆地棉 导入系 抗棉花黄萎病 相关数量性状基因座 qtl鉴定分析
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低温环境下水稻种子活力QTL鉴定 被引量:7
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作者 姚晓云 熊运华 +4 位作者 黄永萍 吴延寿 杨平 刘进 尹建华 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期633-640,共8页
【目的】提高水稻芽期低温抗性,发掘低温环境下水稻种子活力相关基因,可为培育抗冷品种提供新的基因和种质资源。【方法】以耐冷型粳稻龙稻5号和冷敏感型籼稻中优早8杂交衍生的重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体为试验材料... 【目的】提高水稻芽期低温抗性,发掘低温环境下水稻种子活力相关基因,可为培育抗冷品种提供新的基因和种质资源。【方法】以耐冷型粳稻龙稻5号和冷敏感型籼稻中优早8杂交衍生的重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体为试验材料,鉴定自然和人工低温环境下种子活力相关的QTL。【结果】不同低温胁迫环境下,龙稻5号种子具有较强的活力,中优早8种子的发芽率均显著低于龙稻5号;群体中不同株系低温发芽率存在较大差异,籼粳属性影响水稻种子低温环境下发芽率,但相关性未达到显著水平。共检测到10个控制低温环境下种子活力相关的QTL,自然和人工低温胁迫环境下各检测到5个相关的QTL,分布于第2、3、7、8、11和12号染色体上,3个QTL在不同环境下共性表达;共检测到17对上位性互作位点,第1、2、3和12号染色体区域上位性效应明显,加性效应QTL qLTGN2和qLTG12参与上位性互作。【结论】自然和人工低温胁迫环境下种子活力表型和QTL有较好的重复性,稳定表达的QTL qLTG8、qLTG11和qLTG12对低温环境下发芽率具有明显的调控效应,且上位性互作也是调控水稻芽期耐冷性的重要组成部分。 展开更多
关键词 水稻 低温环境 种子活力 发芽率 qtl鉴定
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水稻单片段代换系抽穗期QTL鉴定及遗传分析 被引量:3
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作者 杨雷 柳絮 +3 位作者 吴振映 王文英 姚方印 刘开启 《山东农业科学》 2011年第5期4-7,共4页
适宜的抽穗期是水稻(Oryza sativa)获得理想产量的前提。本研究利用带有晚抽穗基因的单片段代换系(SSSL)为供体,华粳籼74为受体亲本,发展F2次级分离群体。通过t测验比较单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间抽穗期的差异,同时对代换片段... 适宜的抽穗期是水稻(Oryza sativa)获得理想产量的前提。本研究利用带有晚抽穗基因的单片段代换系(SSSL)为供体,华粳籼74为受体亲本,发展F2次级分离群体。通过t测验比较单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间抽穗期的差异,同时对代换片段上的抽穗期QTL进行鉴定。以P≤10-6为阈值鉴定出抽穗期QTL,此QTL位于水稻的第6染色体。调查记录F2次级分离群体单株抽穗期,并对统计结果进行卡方(χ2)测验。结果显示,F1代单株表现为早抽穗,F2代早抽穗和迟抽穗植株数符合3∶1的分离比,早抽穗表现为显性。 展开更多
关键词 水稻 抽穗期 qtl鉴定 单片段代换系 遗传分析
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野生稻单片段代换系芽期耐旱性评价及QTLs鉴定 被引量:1
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作者 黄秀艳 栗俊波 +2 位作者 廖冰 傅雪琳 何平 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2023年第4期32-40,共9页
于2020-2021年以60份来自展颖野生稻和南方野生稻的单片段代换系(Single chromosome segments substitution lines, SSSLs)及其受体亲本‘华粳籼74’(‘HJX74’)为试验材料,在20%PGE-6000干旱胁迫浓度下开展水稻芽期耐旱性试验,以6个生... 于2020-2021年以60份来自展颖野生稻和南方野生稻的单片段代换系(Single chromosome segments substitution lines, SSSLs)及其受体亲本‘华粳籼74’(‘HJX74’)为试验材料,在20%PGE-6000干旱胁迫浓度下开展水稻芽期耐旱性试验,以6个生长发育性状指标的相对值(相对芽长、相对根长、相对胚芽鞘长、相对根数、相对根干质量、相对芽干质量)作为评价指标,采用隶属函数法对SSSLs进行排序并筛选相关性状与‘HJX74’有显著差异的SSSLs,进行QTL鉴定与加性效应分析,初步鉴定与芽期耐旱性状相关的QTL。结果表明:供试SSSLs平均隶属函数值范围为0.14~0.71,‘HJX74’平均隶属函数值为0.58,有12个SSSLs的平均隶属函数值大于‘HJX74’。通过单因素方差分析,筛选出以相对芽长为指标的2份耐旱SSSLs和以相对根数为指标的4份耐旱SSSLs。在20%PGE-6000模拟干旱胁迫处理条件下,以发芽第8天的相对芽长和相对根数为指标鉴定耐旱QTLs, 2份SSSLs(X24、X8)鉴定出1个相对芽长QTL,即qRSL1-1,加性效应分别为0.07、0.08,表型贡献率分别为11.17%、13.85%;4份SSSLs(M77、M120、M133和M142)鉴定出3个相对根数QTLs,即qRRN10-1、qRRN11-1、qRRN12-1,其加性效应为0.11~0.24,表型贡献率为16.64%~36.34%。表明这些SSSLs携带芽期耐旱QTLs,可以作为水稻耐旱基因发掘材料。 展开更多
关键词 染色体单片段代换系 野生稻 耐旱性评价 qtl鉴定
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渐渗系IL6的遗传评价和渗入片段的鉴定 被引量:2
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作者 王为 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2009年第5期394-398,共5页
用海岛棉3-79的6号染色体渐渗系(简称IL6)和背景亲本TM-1构建了F2、F2:3群体,在2年的田间重复实验中调查了18个重要农艺性状,作遗传评价。并获得F2群体的分子数据,进行QTL定位和单标记分析。结果表明:亲本IL6中的渐渗片段,组成有3-79的... 用海岛棉3-79的6号染色体渐渗系(简称IL6)和背景亲本TM-1构建了F2、F2:3群体,在2年的田间重复实验中调查了18个重要农艺性状,作遗传评价。并获得F2群体的分子数据,进行QTL定位和单标记分析。结果表明:亲本IL6中的渐渗片段,组成有3-79的6号染色体,3-79的非6号染色体和大部分的TM-1片段。IL6的产量、品质性状都优于受体亲本TM-1,遗传分析也发现产量、品质性状增效基因位点来自IL6,说明所渗入片段起着关键作用。亲本农艺性状表现和遗传分析结果表明,IL6渗入片段含有总铃数、单株铃数、衣分、果枝数、比强度、麦克隆值等性状的主基因。而QTL定位和单标记分析结果显示,IL6渗入片段含有单株铃数、衣分、果枝数、株高、子指、整齐度等性状的QTLs。 展开更多
关键词 渐渗系IL6 农艺性状 遗传分析 qtl鉴定
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Identification of Quantitative Trait Loci (QTLs) Determining Flowering in the Robusta Coffee (Coffea canephora Pierre)
7
作者 Priyono Dwi Nugroho 《Journal of Agricultural Science and Technology(B)》 2013年第4期296-305,共10页
The quantitative trait loci (QTLs) analysis for flower traits were performed based on three crossing of Coffea canephora in Indonesia. This study successfully identified 19 QTLs related to flowering. These QTLs cons... The quantitative trait loci (QTLs) analysis for flower traits were performed based on three crossing of Coffea canephora in Indonesia. This study successfully identified 19 QTLs related to flowering. These QTLs consisted of 1) three QTLs associated with green candle flowering time located at linkage groups of A and D; 2) one QTL associated to white candle flowering time located at linkage groups of B; 3) two QTLs associated to blossom flowering time located at linkage groups of B; 4) two QTLs associated to number of flowers located at linkage groups of G and H; 5) five QTLs associated to score of flowers quality located at linkage groups of A, C and D; 6) five QTLs associated to number of star flowers located at linkage groups of D, E, F and G. Due to some QTLs are overlapping on the same linkage group, thus, these 19 QTLs for flower traits might be considered as 15 different ones which distributed on 14 regions of the eight linkage groups. Although pleiotropic genes might be the most likely explanation for the collocation of these QTLs, the present data are not sufficient to distinguish between a pleiotropic gene and a cluster of different loci controlling several traits. These results can be a first step for molecular breeding on Robusta coffee mainly in order to improve potential suitable characteristics such as number of flowers and number of normal flowers as well as to reduce adverse characteristics such as number of star flowers. 展开更多
关键词 Coffea canephora qtlS flowering time number of flower quality of flower star flower type.
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利用BIL和CSSL群体鉴定外观品质主效QTL
8
作者 姚晓云 王嘉宇 +6 位作者 杨平 彭志勤 黄永萍 刘进 毛艇 徐正进 尹建华 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期3634-3642,共9页
为进一步探究稻米外观品质分子调控机制,挖掘新的环境钝感型主效QTL,本研究以‘屉锦’和‘北陆129’杂交衍生的回交重组自交系(BIL)和染色体片段代换系(CSSL)群体为试验材料,对稻米外观品质进行QTL鉴定。结果显示,双亲外观品质存在明显... 为进一步探究稻米外观品质分子调控机制,挖掘新的环境钝感型主效QTL,本研究以‘屉锦’和‘北陆129’杂交衍生的回交重组自交系(BIL)和染色体片段代换系(CSSL)群体为试验材料,对稻米外观品质进行QTL鉴定。结果显示,双亲外观品质存在明显差异,‘屉锦’整精米率较高、垩白少和粒型短圆,外观品质性状间存在明显的相关性。BIL群体检测到32个调控外观品质的QTL,15个QTL稳定表达;CSSL群体鉴定了16个相关QTL,主效QTL在不同群体中共性表达;QTL成簇分布于第1、2、3、8、9和11染色体上,6个区段包含30个位点,占QTL总数的62.50%,其中主效QTL簇qAQ1、qAQ8和qAQ9在不同群体与环境下效应明显、重演性较好,是进一步深入研究的"热点"区域。这将进一步丰富外观品质性状的分子调控机理,也为主效QTL簇的精细鉴定提供坚实基础。 展开更多
关键词 水稻(Oryza sativa) 外观品质 不同群体 qtl鉴定
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Identification of QTLs for yield and yield components of barley under different growth conditions 被引量:3
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作者 Da-wei XUE Mei-xue ZHOU +6 位作者 Xiao-qin ZHANG Song CHEN Kang WEI Fan-rong ZENG Ying MAO Fei-bo WU Guo-ping ZHANG 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2010年第3期169-176,共8页
Waterlogging is a major abiotic stress limiting barley (Hordeum vulgare L.) yield and its stability in areas with excessive rainfall.Identification of genomic regions influencing the response of yield and its componen... Waterlogging is a major abiotic stress limiting barley (Hordeum vulgare L.) yield and its stability in areas with excessive rainfall.Identification of genomic regions influencing the response of yield and its components to waterlogging stress will enhance our understanding of the genetics of waterlogging tolerance and the development of more tolerant barley cultivars.Quantitative trait loci (QTLs) for grain yield and its components were identified using 156 doubled haploid (DH) lines derived from a cross between the cultivars Yerong (waterlogging-tolerant) and Franklin (waterlogging-sensitive) grown under different conditions (waterlogged and well drained).A total of 31 QTLs were identified for the measured characters from two experiments with two growth environments.The phenotypic variation explained by individual QTLs ranged from 4.74% to 55.34%.Several major QTLs determining kernel weight (KW),grains per spike (GS),spikes per plant (SP),spike length (SL) and grain yield (GY) were detected on the same region of chromosome 2H,indicating close linkage or pleiotropy of the gene(s) controlling these traits.Some different QTLs were identified under waterlogging conditions,and thus different markers may have to be used in selecting cultivars suitable for high rainfall areas. 展开更多
关键词 Barley (Hordeum vulgare L.) Waterlogging tolerance YIELD Quantitative trait locus qtl
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