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基于Qbeta噬菌体装甲RNA技术的诺如病毒RNA标准参考样品的研制
被引量:
6
1
作者
张奇
姚琳
+7 位作者
江艳华
李风铃
张媛
许东勤
朱文嘉
郭莹莹
王联珠
翟毓秀
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期42-50,共9页
目的:针对目前检测领域缺乏诺如病毒(Norovirus,No V)核酸标准样品这一瓶颈,基于Qbeta噬菌体装甲RNA技术构建内含GII型No V检测靶标RNA的病毒样颗粒(virus like particles,VLPs)标准参考样品。方法:人工合成包含Qbeta噬菌体成熟...
目的:针对目前检测领域缺乏诺如病毒(Norovirus,No V)核酸标准样品这一瓶颈,基于Qbeta噬菌体装甲RNA技术构建内含GII型No V检测靶标RNA的病毒样颗粒(virus like particles,VLPs)标准参考样品。方法:人工合成包含Qbeta噬菌体成熟酶编码基因、衣壳蛋白编码基因、包装位点、ISO/T15216-2 2012中规定的GII型No V检测靶标对应的c DNA序列及辅助多克隆位点的DNA片段QINVGII,将其克隆到p ET-28a(+)载体中,构建重组质粒p ET-QINVGII。将p ET-QINVGII转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞并诱导表达。表达产物经SDS-PAGE和透射电镜分析后,利用氯化铯密度梯度离心,制备纯化VLPs,并对纯化后的VLPs开展均匀性、稳定性及定值研究。结果:SDS-PAGE结果证实重组大肠杆菌在14.1k Da左右有目的条带表达;透射电镜下可观察到大量结构完整、直径约为25nm的VLPs。定值结果显示,制备的VLPs样品中GII型No V检测靶标RNA的含量为(1.06±0.06)×107copies/μl;均匀性分析结果表明样品均匀性良好,即F=2.24< F0.05 ( 9 , 20 ) ;稳定性结果表明,制备的 VLPs 在 37 ℃ 可保存 12 天、室温( 20 ~25 ℃ )可保存 24 天、 4 ℃ 至少可保存 90 天、-20 ℃ 至少可保存 200 天、-80 ℃ 至少可保存 300 天。结论:基于 Qbeta 噬菌体制备的 NoV 装甲 RNA 均匀性和稳定性良好,拷贝数高,为 NOV 分子检测提供了良好的标准参考样品。
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关键词
诺如病毒
装甲
RNA
qbeta
噬菌体
标准参考样品
实时荧光定量
RT-PCR
原文传递
题名
基于Qbeta噬菌体装甲RNA技术的诺如病毒RNA标准参考样品的研制
被引量:
6
1
作者
张奇
姚琳
江艳华
李风铃
张媛
许东勤
朱文嘉
郭莹莹
王联珠
翟毓秀
机构
上海海洋大学
中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部水产品质量安全检测与评价重点实验室农业部水产品质量安全风险评估实验室
獐子岛集团股份有限公司
出处
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期42-50,共9页
基金
中国水产科学研究院基本科研业务费重点项目(2016HYZD11)
科技部科技基础性工作专项(2013FY113300)
国家科技支撑计划(2015BAD17B03)资助项目
文摘
目的:针对目前检测领域缺乏诺如病毒(Norovirus,No V)核酸标准样品这一瓶颈,基于Qbeta噬菌体装甲RNA技术构建内含GII型No V检测靶标RNA的病毒样颗粒(virus like particles,VLPs)标准参考样品。方法:人工合成包含Qbeta噬菌体成熟酶编码基因、衣壳蛋白编码基因、包装位点、ISO/T15216-2 2012中规定的GII型No V检测靶标对应的c DNA序列及辅助多克隆位点的DNA片段QINVGII,将其克隆到p ET-28a(+)载体中,构建重组质粒p ET-QINVGII。将p ET-QINVGII转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞并诱导表达。表达产物经SDS-PAGE和透射电镜分析后,利用氯化铯密度梯度离心,制备纯化VLPs,并对纯化后的VLPs开展均匀性、稳定性及定值研究。结果:SDS-PAGE结果证实重组大肠杆菌在14.1k Da左右有目的条带表达;透射电镜下可观察到大量结构完整、直径约为25nm的VLPs。定值结果显示,制备的VLPs样品中GII型No V检测靶标RNA的含量为(1.06±0.06)×107copies/μl;均匀性分析结果表明样品均匀性良好,即F=2.24< F0.05 ( 9 , 20 ) ;稳定性结果表明,制备的 VLPs 在 37 ℃ 可保存 12 天、室温( 20 ~25 ℃ )可保存 24 天、 4 ℃ 至少可保存 90 天、-20 ℃ 至少可保存 200 天、-80 ℃ 至少可保存 300 天。结论:基于 Qbeta 噬菌体制备的 NoV 装甲 RNA 均匀性和稳定性良好,拷贝数高,为 NOV 分子检测提供了良好的标准参考样品。
关键词
诺如病毒
装甲
RNA
qbeta
噬菌体
标准参考样品
实时荧光定量
RT-PCR
Keywords
Norovirus Armored RNA
qbeta
bacteriophage Reference material Real-time RT-PCR
分类号
Q33 [生物学—遗传学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于Qbeta噬菌体装甲RNA技术的诺如病毒RNA标准参考样品的研制
张奇
姚琳
江艳华
李风铃
张媛
许东勤
朱文嘉
郭莹莹
王联珠
翟毓秀
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
6
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