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基于网络药理学和分子对接技术探讨七方胃痛颗粒治疗慢性萎缩性胃炎的机制
1
作者
周玲
唐梅文
+3 位作者
刘文健
许琦
陈文隆
谢佳涛
《实用中医内科杂志》
2024年第9期63-68,I0010-I0012,共9页
目的通过运用网络药理学和分子对接技术,初步探讨七方胃痛颗粒治疗慢性萎缩性胃火(chronicatrophic gastritis,CAG)的潜在作用机制。方法通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库获取七方胃痛颗粒的活性成分和潜在作用靶点,利用GeneCards、OMIM、Ph...
目的通过运用网络药理学和分子对接技术,初步探讨七方胃痛颗粒治疗慢性萎缩性胃火(chronicatrophic gastritis,CAG)的潜在作用机制。方法通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库获取七方胃痛颗粒的活性成分和潜在作用靶点,利用GeneCards、OMIM、PharmGKB数据库获取CAG疾病基因,对疾病基因和药物靶点取交集,获取七方胃痛颗粒治疗CAG的潜在靶点。使用Cytoscape软件、String数据库分别绘制中药-活性成分-靶点-疾病相关基因网络图,蛋白相互作用网络(PPI)。利用R软件中“Bioconductor”进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。利用分子对接技术验证小分子和蛋白的对接情况,对活性化合物和关键靶点相结合的活性进行验证,利用AutoDock Vina和PyMOL进行分子对接和结果的可视化。结果最终得到七方胃痛颗粒药物有效成分221个,潜在靶点4120个,CAG相关靶点886个,药物与疾病的交集靶点114个。蛋白互作网络中核心基因为HIF1A、AKT1、FOS、STAT1、MAPK1等,GO功能富集分析中生物过程得到3999个条目,分子功能得到488个条目,细胞成分得到316个条目;KEGG信号通路富集获得170条信号通路。分子对接显示,七方胃痛颗粒治疗CAG的主要活性成分及其作用靶点丹参酮ⅡA-RELA,槲皮素-RELA,槲皮素-STAT1,槲皮素-FOS,槲皮素-HIF1A有较好的结合性。结论七方胃痛颗粒及其加减方可增强胃黏膜防御力,减轻炎症刺激从而起到缓解CAG的作用,为临床提供新的治疗依据。
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关键词
七
方
胃
痛
颗粒
慢性萎缩性
胃
炎
网络药理学
分子对接
作用机制
下载PDF
职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接技术探讨七方胃痛颗粒治疗慢性萎缩性胃炎的机制
1
作者
周玲
唐梅文
刘文健
许琦
陈文隆
谢佳涛
机构
广西中医药大学第一附属医院
广西中医药大学研究生院
出处
《实用中医内科杂志》
2024年第9期63-68,I0010-I0012,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81760862)。
文摘
目的通过运用网络药理学和分子对接技术,初步探讨七方胃痛颗粒治疗慢性萎缩性胃火(chronicatrophic gastritis,CAG)的潜在作用机制。方法通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库获取七方胃痛颗粒的活性成分和潜在作用靶点,利用GeneCards、OMIM、PharmGKB数据库获取CAG疾病基因,对疾病基因和药物靶点取交集,获取七方胃痛颗粒治疗CAG的潜在靶点。使用Cytoscape软件、String数据库分别绘制中药-活性成分-靶点-疾病相关基因网络图,蛋白相互作用网络(PPI)。利用R软件中“Bioconductor”进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。利用分子对接技术验证小分子和蛋白的对接情况,对活性化合物和关键靶点相结合的活性进行验证,利用AutoDock Vina和PyMOL进行分子对接和结果的可视化。结果最终得到七方胃痛颗粒药物有效成分221个,潜在靶点4120个,CAG相关靶点886个,药物与疾病的交集靶点114个。蛋白互作网络中核心基因为HIF1A、AKT1、FOS、STAT1、MAPK1等,GO功能富集分析中生物过程得到3999个条目,分子功能得到488个条目,细胞成分得到316个条目;KEGG信号通路富集获得170条信号通路。分子对接显示,七方胃痛颗粒治疗CAG的主要活性成分及其作用靶点丹参酮ⅡA-RELA,槲皮素-RELA,槲皮素-STAT1,槲皮素-FOS,槲皮素-HIF1A有较好的结合性。结论七方胃痛颗粒及其加减方可增强胃黏膜防御力,减轻炎症刺激从而起到缓解CAG的作用,为临床提供新的治疗依据。
关键词
七
方
胃
痛
颗粒
慢性萎缩性
胃
炎
网络药理学
分子对接
作用机制
Keywords
qifang
weitong
granules
(
七
方
胃
痛
颗粒
)
chronic atrophic gastritis
network pharmacology
molecular docking
mechanism of action
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接技术探讨七方胃痛颗粒治疗慢性萎缩性胃炎的机制
周玲
唐梅文
刘文健
许琦
陈文隆
谢佳涛
《实用中医内科杂志》
2024
0
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职称材料
已选择
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