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题名筇竹钾转运体QtHAK12的克隆及表达分析
被引量:2
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作者
赵小艳
李倩
王澍
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机构
西南林业大学园林园艺学院国家林业与草原局西南风景园林工程技术研究中心
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出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2022年第9期2908-2915,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(31860229)
云南万人计划青年拔尖人才项目(YNWR-QNBJ-2019-028)共同资助。
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文摘
钾元素在竹笋中含量较高,也是竹笋品质的重要指标之一。为了研究高亲和性K;转运蛋白KUP/HAK/KT家族成员在竹笋K+吸收过程中发挥的重要作用。本研究利用RACE技术从筇竹(Qiongzhuea tumidinoda)中克隆得到一个KUP/HAK/KT家族成员的同源基因,命名为QtHAK12(登录号:MT078986)。同时,对QtHAK12基因进行生物信息学及表达模式分析。结果表明,QtHAK12基因片段全长为2467 bp,编码区为1647 bp,包含548个氨基酸。生物信息学分析表明,该编码蛋白具有10个跨膜区域,定位于细胞质膜上,并且具有KUP/HAK/KT钾转运体的典型结构“K-trans”结构域。聚类结果表明,QtHAK12编码蛋白与狗尾巴草(Setaria viridis)、小米(Setaria italica)、水稻(Oryza sativa)等作物HAK蛋白相似度高达89%以上,同源性分别为90.17%、90.17%、89.89%。RT-qPCR结果显示,QtHAK12基因在不同组织(笋,根,茎,叶)中均有表达,且为非诱导表达。低钾和高盐处理下,筇竹不同组织表达量呈现出根>茎>叶的规律。与对照组相比,在50 mmol/L KCl处理下,根部处理12 h后QtHAK12基因表达上调,而其他组织处理12、24 h后,QtHAK12基因表达均下调。另外,与对照组相比,在500 mmol/L NaCl处理下,不同组织处理不同时间后,QtHAK12基因的表达均呈下调趋势。
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关键词
筇竹(Qiongzhuea
tumidinoda)
qthak12
RACE克隆
生物信息学分析
表达分析
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Keywords
Qiongzhuea tumidinoda
qthak12
RACE cloning
Bioinformatics analysis
Expression analysis
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分类号
S795
[农业科学—林木遗传育种]
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