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利用Bayesian方法进行牙鲆体质量和主要形态性状的QTL定位及互作分析
1
作者
崔妍
高会晓
+2 位作者
仇雪梅
杨润清
刘海金
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期374-379,共6页
为了定位牙鲆Paralichthys olivaceus体质量和形态性状的QTL,利用雌核发育方法获得双单倍体牙鲆群体的157个个体,同时构建了包含481个SSR标记和141个EST-SSR标记的遗传连锁图谱,并采用Bayesian模型选择方法对研究性状进行主效应QTL定位...
为了定位牙鲆Paralichthys olivaceus体质量和形态性状的QTL,利用雌核发育方法获得双单倍体牙鲆群体的157个个体,同时构建了包含481个SSR标记和141个EST-SSR标记的遗传连锁图谱,并采用Bayesian模型选择方法对研究性状进行主效应QTL定位和上位性互作分析。结果表明:共检测到38个主效应QTL和50对上位互作效应,其中,大部分主效应QTL位于5、6、9、22号染色体,上位互作效应所解释的表型方差为2.3%~23.1%;8个主效应QTL和7对互作QTL表现出多效性,均分别对两个以上的性状起作用。本研究结果将有助于提高牙鲆育种中对有益经济性状的选择效率。
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关键词
Bayesian选择模型
牙鲆DH群体
互作分析
r/qtlbim
遗传连锁图谱
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职称材料
玉米株高性状QTL的贝叶斯定位分析
2
作者
胡文明
汤在祥
+1 位作者
张恩盈
徐辰武
《扬州大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期41-46,共6页
为探索控制玉米株高的主效QTL、互作QTL及其遗传结构,通过基于贝叶斯理论的R/qtlbim QTL定位分析软件包,对一个玉米F2:3群体株高性状进行QTL分析。通过一维扫描,初步检测到8个主效QTL,分别位于第3~7染色体上,单个QTL的贝叶斯因子(以2lo...
为探索控制玉米株高的主效QTL、互作QTL及其遗传结构,通过基于贝叶斯理论的R/qtlbim QTL定位分析软件包,对一个玉米F2:3群体株高性状进行QTL分析。通过一维扫描,初步检测到8个主效QTL,分别位于第3~7染色体上,单个QTL的贝叶斯因子(以2logBF衡量)为2.237~6.196。通过二维后验概率扫描发现大量较弱的互作信号,多数集中在3~7染色体上。通过贝叶斯因子分析,获得控制玉米株高的最优遗传结构,该遗传结构包含6个主效应QTL,QTL间不存在互作效应。逐步回归拟合分析表明,该遗传结构达到极显著水平,可解释37.383%表型变异,6个QTL均达到极显著水平,单个QTL的表型变异贡献为3.924%~10.776%。这表明,株高的遗传结构相对较为简单,QTL互作对株高的影响较小,可忽略不计。
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关键词
玉米
株高
数量性状基因座位
贝叶斯统计
r
qtlbim
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职称材料
题名
利用Bayesian方法进行牙鲆体质量和主要形态性状的QTL定位及互作分析
1
作者
崔妍
高会晓
仇雪梅
杨润清
刘海金
机构
大连海洋大学水产与生命学院
大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室
中国水产科学研究院
出处
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期374-379,共6页
基金
国家公益性行业(农业)科研专项(2014B004
2014A04XK01)
国家科技支撑计划项目(2012BAD26B01)
文摘
为了定位牙鲆Paralichthys olivaceus体质量和形态性状的QTL,利用雌核发育方法获得双单倍体牙鲆群体的157个个体,同时构建了包含481个SSR标记和141个EST-SSR标记的遗传连锁图谱,并采用Bayesian模型选择方法对研究性状进行主效应QTL定位和上位性互作分析。结果表明:共检测到38个主效应QTL和50对上位互作效应,其中,大部分主效应QTL位于5、6、9、22号染色体,上位互作效应所解释的表型方差为2.3%~23.1%;8个主效应QTL和7对互作QTL表现出多效性,均分别对两个以上的性状起作用。本研究结果将有助于提高牙鲆育种中对有益经济性状的选择效率。
关键词
Bayesian选择模型
牙鲆DH群体
互作分析
r/qtlbim
遗传连锁图谱
Keywords
Bayesian model selection
DH population of Pa
r
alichthys olivaceus
analysis of inte
r
action
r/qtlbim
genetic linkage map
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
玉米株高性状QTL的贝叶斯定位分析
2
作者
胡文明
汤在祥
张恩盈
徐辰武
机构
扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部植物功能基因组学重点实验室
苏州大学医学部公共卫生学院
出处
《扬州大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期41-46,共6页
基金
国家重点基础研究发展计划项目(973-2011CB100106)
国家自然科学基金资助项目(30971846
+2 种基金
31171187
31100882)
江苏省高等学校自然科学研究重大项目(09KJA210002)
文摘
为探索控制玉米株高的主效QTL、互作QTL及其遗传结构,通过基于贝叶斯理论的R/qtlbim QTL定位分析软件包,对一个玉米F2:3群体株高性状进行QTL分析。通过一维扫描,初步检测到8个主效QTL,分别位于第3~7染色体上,单个QTL的贝叶斯因子(以2logBF衡量)为2.237~6.196。通过二维后验概率扫描发现大量较弱的互作信号,多数集中在3~7染色体上。通过贝叶斯因子分析,获得控制玉米株高的最优遗传结构,该遗传结构包含6个主效应QTL,QTL间不存在互作效应。逐步回归拟合分析表明,该遗传结构达到极显著水平,可解释37.383%表型变异,6个QTL均达到极显著水平,单个QTL的表型变异贡献为3.924%~10.776%。这表明,株高的遗传结构相对较为简单,QTL互作对株高的影响较小,可忽略不计。
关键词
玉米
株高
数量性状基因座位
贝叶斯统计
r
qtlbim
Keywords
maize
plant height
quantitative t
r
ait loci
Bayesian statistics
r/qtlbim
分类号
S513 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用Bayesian方法进行牙鲆体质量和主要形态性状的QTL定位及互作分析
崔妍
高会晓
仇雪梅
杨润清
刘海金
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
下载PDF
职称材料
2
玉米株高性状QTL的贝叶斯定位分析
胡文明
汤在祥
张恩盈
徐辰武
《扬州大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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