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miR395abcd与其靶基因ATRX在不同耐寒木薯品种中对低温响应的差异性分析
被引量:
8
1
作者
曾长英
周玉飞
彭明
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期2441-2447,共7页
通过实时定量PCR方法分析了mi R395abcd与其靶基因ATRX在两个木薯品种的4种低温处理下的差异表达情况,靶基因的定量引物设计在与mi RNA结合区的上游、结合边缘、结合区3个位置。结果显示mi R395abcd与其靶基因在两个木薯品种、4种低温...
通过实时定量PCR方法分析了mi R395abcd与其靶基因ATRX在两个木薯品种的4种低温处理下的差异表达情况,靶基因的定量引物设计在与mi RNA结合区的上游、结合边缘、结合区3个位置。结果显示mi R395abcd与其靶基因在两个木薯品种、4种低温处理和3个靶基因引物位置的表达量均不同,且mi R395abcd在C4和SC124两个品种间4种低温处理的6组两两比较中的相对表达量呈现完美的反向关系。进一步比较发现mi R395abcd与靶基因的负相关性在C4中最好,尤其是位于mi RNA与m RNA结合区上游的a引物的消长关系在AH(驯化后寒害:25~14℃驯化5 d后再降至4℃)和NAH(非驯化寒害:25℃直接降至4℃)中表现得最典型。具体而言,mi R395abcd在C4的AH和NAH处理中上调而在SC124的AH和NAH处理中下调表达,前期表型分析中AH和NAH处理下C4的低温胁迫症状小于SC124,预示着mi R395abcd的上调表达有利于木薯减轻低温伤害,其表达差异能够表征C4和SC124在耐低温性能的表型差异,且mi R395abcd对其靶基因ATRX的调控在木薯低温响应过程中起着正向保护作用。
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关键词
MI
r395abcd
靶基因
木薯
耐低温
差异表达分析
原文传递
题名
miR395abcd与其靶基因ATRX在不同耐寒木薯品种中对低温响应的差异性分析
被引量:
8
1
作者
曾长英
周玉飞
彭明
机构
中国热带农业科学院热带生物技术研究所
贵州省亚热带作物研究所
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期2441-2447,共7页
基金
国家国际科技合作专项(2013DFA32020)
海南省重大科技项目子课题(ZDZX2013023-1)
+1 种基金
海南省自然科学基金(313075)
中央级公益性科研院所基本科研业务费(ITBB2015RC01)共同资助
文摘
通过实时定量PCR方法分析了mi R395abcd与其靶基因ATRX在两个木薯品种的4种低温处理下的差异表达情况,靶基因的定量引物设计在与mi RNA结合区的上游、结合边缘、结合区3个位置。结果显示mi R395abcd与其靶基因在两个木薯品种、4种低温处理和3个靶基因引物位置的表达量均不同,且mi R395abcd在C4和SC124两个品种间4种低温处理的6组两两比较中的相对表达量呈现完美的反向关系。进一步比较发现mi R395abcd与靶基因的负相关性在C4中最好,尤其是位于mi RNA与m RNA结合区上游的a引物的消长关系在AH(驯化后寒害:25~14℃驯化5 d后再降至4℃)和NAH(非驯化寒害:25℃直接降至4℃)中表现得最典型。具体而言,mi R395abcd在C4的AH和NAH处理中上调而在SC124的AH和NAH处理中下调表达,前期表型分析中AH和NAH处理下C4的低温胁迫症状小于SC124,预示着mi R395abcd的上调表达有利于木薯减轻低温伤害,其表达差异能够表征C4和SC124在耐低温性能的表型差异,且mi R395abcd对其靶基因ATRX的调控在木薯低温响应过程中起着正向保护作用。
关键词
MI
r395abcd
靶基因
木薯
耐低温
差异表达分析
Keywords
mi
r395abcd
,Target,Cassava,Chilling tolerance,Differential expression analysis
分类号
S533 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
miR395abcd与其靶基因ATRX在不同耐寒木薯品种中对低温响应的差异性分析
曾长英
周玉飞
彭明
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2015
8
原文传递
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参考文献
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