一例RAB3GAP1变异所致的Warburg micro综合征1型的分析

目的探讨1例发育落后患儿的临床及遗传学特征。方法对患儿进行全外显子组测序分析,并用Sanger测序对变异位点进行验证。结果全外显子组测序显示患儿携带两个RAB3GAP1基因的杂合性剪接变异:c.2607-1G>C和c.899+2dupT,分别遗传自其表型正常的母亲和父亲。结论确诊了1例罕见的Warburg micro综合征1型。患儿的表型与文献报道一致,并存在腭弓发育不良、显著的高腭弓及牙齿发育不良等罕见表现。

宿主RAB3GAP2基因单核苷酸多态性与流感疫苗免疫应答的关联性

目的探讨宿主RAB3GAP2基因的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)与流感疫苗免疫应答的关联性。方法采用巢式病例对照研究方法,于2009-2019年在中国2个地区招募健康人群接种三价流感灭活疫苗,采集接种前和接种后28d血清样本,检测血凝抑制抗体;三种流感病毒疫苗成分抗体均血清阳转者(应答组)和均未血清阳转者(低应答组)进行RAB3GAP2基因5个SNP位点的基因型检测,比较两组基因型频率分布。结果流感疫苗低应答组和应答组分别纳入227名和365名研究对象。宿主RAB3GAP2基因rs12404566位点的AA基因型频率与TT+TA基因型相比在低应答组中更高(OR=3.67,95%CI:1.09-12.35);rs2289189位点的CG+GG基因型频率与CC基因型相比在低应答组中更高(OR=1.93,95%CI:1.20-3.10);5个SNP位点组成的GTTTG单体型频率与GTGTC单体型相比在低应答组中更高(OR=1.90,95%CI:1.14-3.18)。结论宿主RAB3GAP2基因SNP与流感疫苗的免疫应答存在关联性,可为优化流感疫苗个体化接种提供参考。

一种免疫诱导型鲤启动子的克隆与功能分析

为发掘适用于基因工程抗病育种的鱼类启动子,通过实时荧光定量PCR实验对鲤Rab GTP酶(Ras-associated binding-GTPases 1a3,Rab1a3)基因的表达模式进行了分析,证实该基因在鳃、头肾等与机体免疫防御功能密切相关的组织内转录水平较高,且免疫激活后转录显著增强,符合基因工程抗病育种所需的外源免疫基因转录模式。从鲤细菌人工染色体文库中,使用Rab1a3基因特异引物筛选获得包含该基因区域的文库克隆,测序获得该基因完整序列,以及上下游调控序列。通过生物信息学手段,预测到长度为1014 bp的鲤Rab1a3基因启动子序列,该启动子不具有典型的TATA盒或CpG岛特征,存在多个免疫相关转录因子结合位点。在草鱼肾组织细胞系内验证该启动子活性,结果显示,绿色荧光蛋白基因和萤火虫荧光素酶基因都能够在该启动子驱动下表达,证实该片段具有启动子活性,且启动子活性在受到免疫诱导后增强,双荧光素酶报告基因检测结果显示,该启动子活性在免疫刺激后增强至免疫刺激前的8.67倍。研究表明,鲤Rab1a3基因启动子有望被开发成为免疫诱导型的基因工程元件,驱动外源免疫基因在鱼体内适时表达,抵御外界病原感染,同时避免非必要条件下的过度表达形成生长负担。