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RABS隔离系统、FFU以及oRABS的取风方式 被引量:2
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作者 钱小进 《机电信息》 2013年第11期31-34,共4页
以GMP为切入点,介绍了RABS隔离系统,阐述了其主要组成部分FFU,同时探讨了主动式oRABS隔离系统的取风方式,验证了oRABS隔离系统下风管式取风的可行性。
关键词 GMP rabs隔离系统 orabs FFU 取风方式
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Rabs and axonal regeneration
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作者 Cheryl Qian Ying Yong Bor Luen Tang 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期566-569,共4页
Membrane trafficking processes are presumably vital for axonal regeneration after injury, but mechanistic understanding in this regard has been sparse. A recent loss-of-function screen had been carried out for factors... Membrane trafficking processes are presumably vital for axonal regeneration after injury, but mechanistic understanding in this regard has been sparse. A recent loss-of-function screen had been carried out for factors important for axonal regeneration by cultured cortical neurons and the results suggested that the activity of a number of Rab GTPases might act to restrict axonal regeneration. A loss of Rab27b, in particular, is shown to enhance axonal regeneration in vitro, as well as in C. elegans and mouse central nervous system injury models in vivo. Possible mechanisms underlying this new finding, which has important academic and translational implication, are discussed. 展开更多
关键词 ARF RAB Rab27b AXON regeneration AXONAL transport CORTICAL neurons central nervous system injury membrane TRAFFICKING Myosin-V
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靶向调控Rab23表达及影响头颈部鳞状细胞癌MicroRNA筛选与验证分析
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作者 杨扬 李昆 +3 位作者 孙卫国 胡永亮 史阅韩 李廷慧 《实用皮肤病学杂志》 2024年第3期133-138,共6页
目的基于生物信息学方法筛选调控Rab23表达以及影响头颈部鳞状细胞癌预后相关的MicroiRNA(miRNA)并验证,为进一步探讨头颈部鳞状细胞癌的发生和侵袭作用机制提供新的研究思路和方法。方法依据miRWalk数据库筛选调控Rab23表达的潜在miRNA... 目的基于生物信息学方法筛选调控Rab23表达以及影响头颈部鳞状细胞癌预后相关的MicroiRNA(miRNA)并验证,为进一步探讨头颈部鳞状细胞癌的发生和侵袭作用机制提供新的研究思路和方法。方法依据miRWalk数据库筛选调控Rab23表达的潜在miRNA,根据TCGA公共数据库和miRWalk数据库筛选影响头颈部鳞状细胞癌生存期的差异表达miRNA,双重筛选交集后确定调控Rab23表达及影响头颈部鳞状细胞癌预后相关的miRNA分子,再通过实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)、蛋白免疫印迹和双荧光素酶实验进行结果验证。结果筛选出250个差异表达miRNA,其中8个是潜在调控Rab23表达的miRNA。hsa-miR-363-3p是既能调控Rab23表达,又可显著影响头颈部鳞状细胞癌预后的miRNA。RT-qPCR、蛋白免疫印迹实验证实hsa-miR-363-3p与Rab23在肿瘤细胞和转染细胞模型中呈负调控;双荧光素酶实验验证hsa-miR-363-3p能够靶向作用于Rab23基因。结论hsa-miR-363-3p参与靶向调控Rab23表达,可能参与了头颈部鳞状细胞癌的侵袭和转移的作用机制。 展开更多
关键词 鳞状细胞 生物信息学 hsa-miR-363-3p Rab23 筛选
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猪源Rab基因shRNA文库与稳定细胞株的构建及其对猪伪狂犬病病毒增殖的影响
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作者 梁东阁 姚晨 +7 位作者 柴雅静 蔡梦攀 褚贝贝 鲁维飞 王江 曾磊 刘忠虎 明胜利 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1250-1258,共9页
【目的】探究Rab家族蛋白在猪伪狂犬病病毒(Porcine pseudorabies virus,PRV)感染宿主细胞中的作用。【方法】以猪肾上皮细胞(PK15)为试验模型,构建Rab基因shRNA文库,并用嘌呤霉素筛选获得稳定的能够抑制猪源Rab基因表达的细胞株。用实... 【目的】探究Rab家族蛋白在猪伪狂犬病病毒(Porcine pseudorabies virus,PRV)感染宿主细胞中的作用。【方法】以猪肾上皮细胞(PK15)为试验模型,构建Rab基因shRNA文库,并用嘌呤霉素筛选获得稳定的能够抑制猪源Rab基因表达的细胞株。用实时荧光定量PCR检测细胞敲减效率,通过流式细胞术检测敲减Rab基因对PRV增殖的影响;用Western blotting检测PRV-gB蛋白表达量,使用实时荧光定量PCR检测敲减Rab基因后PRV-gB、PRV-TK基因以及相关细胞炎性因子表达量。【结果】试验成功构建包含13种Rab基因敲减细胞系的shRNA文库。流式细胞术检测结果显示敲减Rab基因能显著抑制PRV-GFP增殖(P<0.05);病毒滴度与Western blotting检测结果表明,敲减Rab基因极显著抑制子代病毒的产生以及PRV-gB蛋白的表达(P<0.01)。实时荧光定量PCR检测结果显示,敲减Rab基因会显著或极显著抑制PRV-gB、PRV-TK基因表达(P<0.05;P<0.01);敲减Rab14和Rab27基因后细胞中IFN-β、ISG15、IL-1β、IL-18基因表达量均显著或极显著升高(P<0.05;P<0.01)。【结论】敲减Rab基因能够抑制PRV增殖。研究结果为进一步研究Rab基因在PRV生活周期中发挥的作用奠定基础。 展开更多
关键词 Rab基因 猪伪狂犬病病毒(PRV) 慢病毒 shRNA文库
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油菜素内酯对低温胁迫下冬小麦Rab15-like基因表达的影响
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作者 张军保 陈宇姝 +7 位作者 田诗 于梦迪 王雪松 曹佳昂 邵庆一 杨森 金忠民 刘丽杰 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期28-34,45,共8页
探索低温胁迫下油菜素内酯(Brassinosteroid,BR)对冬小麦叶片和分蘖节中Rab15-like基因表达的影响,以寒地冬小麦品种“东农冬麦1号”为试验材料,利用RT-PCR法克隆Rab15-like基因CDS序列,运用生物信息学方法分析该序列基本理化性质、二... 探索低温胁迫下油菜素内酯(Brassinosteroid,BR)对冬小麦叶片和分蘖节中Rab15-like基因表达的影响,以寒地冬小麦品种“东农冬麦1号”为试验材料,利用RT-PCR法克隆Rab15-like基因CDS序列,运用生物信息学方法分析该序列基本理化性质、二级结构和三级结构特征、Rab15-like蛋白保守性,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测BR处理对不同温度条件下冬小麦分蘖节和叶片中Rab15-like基因表达的影响。结果表明,Rab15-like基因编码区序列长度为1 265 bp,Rab15-like基因含有一个453 bp开放阅读框,编码150个氨基酸序列,Rab15-like蛋白为LEA家族第二大类蛋白,主要分布在细胞膜上,为稳定亲水性蛋白。RT-qPCR分析结果表明,Rab15-like基因表达量与温度变化相关,在叶片中,随着环境温度降低,Rab15-like基因表达先上调后下调,当环境温度达-10℃时表达量最高;在分蘖节中,随着温度降低,Rab15-like基因表达持续上调,-25℃时表达量最高。BR处理促进低温条件下该基因在叶片中表达,对5、0和-10℃条件下分蘖节中该基因表达影响较小,但显著促进-25℃条件下该基因表达(P<0.05)。Rab15-like基因表达受温度影响,说明Rab15-like基因可能参与冬小麦响应低温胁迫的信号途径。外源BR处理促进低温条件下该基因在冬小麦叶片和分蘖节中表达。 展开更多
关键词 油菜素内酯 低温胁迫 冬小麦 Rab15-like基因
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一个格里塞利综合征2型家系分析
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作者 赵倩 陈俊羽 +2 位作者 唐雪梅 赵晓东 杨曦 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期345-350,共6页
目的探讨由RAB27A基因缺陷导致的格里塞利综合征2型(Griscelli syndrome type 2,GS2)的临床及免疫学特征。方法收集1家系2例GS2患儿组成的临床资料、生化检查及病理活检结果,采集头发显微镜检查,抽取外周静脉血进行免疫系统基因外显子... 目的探讨由RAB27A基因缺陷导致的格里塞利综合征2型(Griscelli syndrome type 2,GS2)的临床及免疫学特征。方法收集1家系2例GS2患儿组成的临床资料、生化检查及病理活检结果,采集头发显微镜检查,抽取外周静脉血进行免疫系统基因外显子阵列测序,桑格测序验证患儿及父母RAB27A基因突变位点,采用蛋白印迹法检测外周血单个核细胞RAB27A蛋白表达水平,采用流式细胞术进行CTL细胞及NK细胞毒性功能检测,健康对照为正常同龄儿童。结果2例患者为亲兄妹,生后均表现毛发色素减退合,均以反复发热、反复呼吸道感染合并噬血细胞性淋巴组织细胞增生症(HLH)为主要临床表现,妹妹伴全身弥漫靶形损害样皮疹。2例患者头发内均有不规则黑色素团块堆积,妹妹皮损组织病理示表皮基底层黑色素细胞不规则分布,RAB27A基因5号外显子发生c.377 delC纯合移码突变,其父母为近亲结婚,均为携带者,2例患儿RAB27A蛋白表达均明显降低,NK细胞及CTL的细胞毒功能均受损。2例患儿均未接受化疗及造血干细胞移植(HSCT),先后因HLH死亡。结论GS2的确诊依赖临床表现及基因检测,免疫功能检测亦有助于诊断,同种异体造血干细胞移植是目前根治GS2的唯一方法。 展开更多
关键词 格里塞利综合征2型 RAB27A基因 家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症
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甜菜小G蛋白BvRab基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析
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作者 付荻 刘赫 +1 位作者 于冰 李海英 《中国糖料》 2024年第1期1-12,共12页
【目的】在全基因组范围内鉴定甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员,为研究甜菜小G蛋白BvRab基因家族功能奠定基础。【方法】本研究利用生物信息学手段对甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员进行筛选鉴定并进行理化性质、基因结构、蛋白保守基序、... 【目的】在全基因组范围内鉴定甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员,为研究甜菜小G蛋白BvRab基因家族功能奠定基础。【方法】本研究利用生物信息学手段对甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员进行筛选鉴定并进行理化性质、基因结构、蛋白保守基序、系统进化、染色体定位及共线性、启动子顺式作用元件和蛋白质互作预测分析。【结果】共鉴定到58个甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员。同一类型中的不同基因具有较为一致的外显子和内含子结构,家族成员共有5个蛋白保守基序;甜菜小G蛋白BvRab基因家族包含8个亚家族;家族成员不均匀地分布在甜菜的9条染色体上;BvRab基因家族成员与番茄、拟南芥中的小G蛋白Rab基因家族亲缘关系较近,与水稻中的小G蛋白Rab基因家族亲缘关系较远;BvRab基因家族成员启动子中含有多个激素应答元件和逆境应答元件;BvRab蛋白与参与植物生长发育及逆境应答相关的多种转录因子相互作用。【结论】本研究鉴定出58个BvRab基因家族成员,该基因家族成员可能在植物生长发育及逆境应答方面发挥重要作用。 展开更多
关键词 甜菜 小G蛋白 Rab基因家族 生物信息学分析
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Mechanism by which Rab5 promotes regeneration and functional recovery of zebrafish Mauthner axons
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作者 Jiantao Cui Yueru Shen +2 位作者 Zheng Song Dinggang Fan Bing Hu 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第6期1816-1824,共9页
Rab5 is a GTPase protein that is involved in intracellular membrane trafficking. It functions by binding to various effector proteins and regulating cellular responses, including the formation of transport vesicles an... Rab5 is a GTPase protein that is involved in intracellular membrane trafficking. It functions by binding to various effector proteins and regulating cellular responses, including the formation of transport vesicles and their fusion with the cellular membrane. Rab5 has been reported to play an important role in the development of the zebrafish embryo;however, its role in axonal regeneration in the central nervous system remains unclear. In this study, we established a zebrafish Mauthner cell model of axonal injury using single-cell electroporation and two-photon axotomy techniques. We found that overexpression of Rab5 in single Mauthner cells promoted marked axonal regeneration and increased the number of intra-axonal transport vesicles. In contrast, treatment of zebrafish larvae with the Rab kinase inhibitor CID-1067700markedly inhibited axonal regeneration in Mauthner cells. We also found that Rab5 activated phosphatidylinositol 3-kinase(PI3K) during axonal repair of Mauthner cells and promoted the recovery of zebrafish locomotor function. Additionally, rapamycin, an inhibitor of the mechanistic target of rapamycin downstream of PI3K, markedly hindered axonal regeneration. These findings suggest that Rab5 promotes the axonal regeneration of injured zebrafish Mauthner cells by activating the PI3K signaling pathway. 展开更多
关键词 axonal regeneration Mauthner cell nerve regeneration Rab5 ZEBRAFISH
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在抑郁症大鼠模型中MiRNA-103-3p调控Rab10促进神经细胞自噬
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作者 张叶明 张袁祥 +2 位作者 沈学彬 王国栋 朱磊 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1315-1326,共12页
目的探讨与神经保护相关的基因Rab10在抑郁症体内外模型中发挥的功能和作用机制。方法选取36只大鼠作为慢性应激模型组(CUMS组),每只大鼠单笼饲养,进行6周慢性不可预测温和应激,另选取12只作为对照组。CUMS组大鼠完成6周CUMS刺激后,根... 目的探讨与神经保护相关的基因Rab10在抑郁症体内外模型中发挥的功能和作用机制。方法选取36只大鼠作为慢性应激模型组(CUMS组),每只大鼠单笼饲养,进行6周慢性不可预测温和应激,另选取12只作为对照组。CUMS组大鼠完成6周CUMS刺激后,根据旷场实验数据和体质量分成3组(12只/组):CUMS+生理盐水组、CUMS+AAV载体组和CUMS+AAV过表达Rab10组,CUMS+saline组大鼠侧脑室注射生理盐水;CUMS+AAV组大鼠侧脑室注射AAV空病毒载体;CUMS+AAV-oe-Rab10组大鼠侧脑室注射AAV过表达Rab10载体实现Rab10基因过表达,CUMS刺激在整个实验期间持续进行。对照组大鼠始终不进行任何刺激。利用大鼠行为学指标的变化评价大鼠抑郁状态。构建CORT诱导的PC12细胞模型,CCK-8法检测细胞活力。通过TargetScan数据库预测与Rab10相互作用的miRNA及miRNA结合位点,并结合双荧光素酶和RIP实验探究miRNA-103-3p与Rab10的相互作用。在CORT刺激的PC12细胞中过表达Rab10,或在转染miRNA-103-3p inhibitor基础上沉默Rab10,qRT-PCR法检测miRNA-103-3p和Rab10的表达水平;Western blotting检测细胞中Rab10、BDNF、CREB、p62、Beclin-1、Wnt3a、Gsk3β、磷酸化(p)-Gsk3β和β-catenin的蛋白含量。结果病毒过表达Rab10后明显改善CUMS大鼠行为学指标(P<0.05)。qRT-PCR和Western blotting证实Rab10基因在CUMS大鼠海马与CORT诱导的PC12细胞中表达下调(P<0.05)。生物信息学结合双荧光素酶和RIP实验证实miRNA-103-3p靶向Rab10(P<0.05)。过表达Rab10或沉默miRNA-103-3p激活了Wnt/β-catenin信号通路,上调BDNF、CREB和Beclin-1的含量,下调p62蛋白的表达(P<0.05);下调miRNA-103-3p的基础上沉默Rab10逆转了miRNA-103-3p的作用(P<0.05)。结论miRNA103-3p靶向Rab10激活Wnt/β-catenin信号通路,改善神经细胞的可塑性,促进细胞自噬,从而对抗CORT诱导的PC12细胞损伤。 展开更多
关键词 Rab10 miRNA-103-3p 神经可塑性 自噬 抑郁症
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Rab35、TRIM8在子宫内膜癌中的表达及其与患者临床病理特征和预后的关系
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作者 李丹 左学骞 +3 位作者 赵海波 孙洪芳 徐志钦 桑银洲 《检验医学与临床》 2024年第6期820-824,共5页
目的探讨Rab35、三结构域蛋白8(TRIM8)在子宫内膜癌(EC)中的表达,并分析其与患者临床病理特征和预后的关系。方法选择2017年1月至2020年1月沧州市人民医院收治的180例EC患者,取手术切除的癌组织和癌旁组织。采用免疫组化法检测Rab35、TR... 目的探讨Rab35、三结构域蛋白8(TRIM8)在子宫内膜癌(EC)中的表达,并分析其与患者临床病理特征和预后的关系。方法选择2017年1月至2020年1月沧州市人民医院收治的180例EC患者,取手术切除的癌组织和癌旁组织。采用免疫组化法检测Rab35、TRIM8表达,比较EC癌组织和癌旁组织中Rab35、TRIM8表达差异,以及不同临床病理特征患者EC组织中Rab35、TRIM8表达阳性率差异。采用多因素Logistic回归分析影响EC患者预后的因素,采用Kaplan-Meier生存曲线分析EC患者生存情况。结果EC癌组织Rab35表达阳性率高于癌旁组织(P<0.05),TRIM8表达阳性率低于癌旁组织(P<0.05)。FIGO分期ⅢA期、低分化、肌层浸润深度≥1/2、有淋巴结转移的EC患者癌组织Rab35表达阳性率高于FIGO分期Ⅰ~Ⅱ期、中高分化、肌层浸润深度<1/2、无淋巴结转移的EC患者(P<0.05),FIGO分期ⅢA期、低分化、肌层浸润深度≥1/2、有淋巴结转移的EC患者癌组织TRIM8表达阳性率低于FIGO分期Ⅰ~Ⅱ期、中高分化、肌层浸润深度<1/2、无淋巴结转移的EC患者(P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示FIGO分期ⅢA期、有淋巴结转移、Rab35表达阳性是EC患者死亡的危险因素(P<0.05),TRIM8表达阳性是EC患者死亡的保护因素(P<0.05)。Rab35表达阳性EC患者的累积生存率低于Rab35表达阴性患者(Log-Rankχ~2=11.523,P<0.001);TRIM8表达阳性EC患者的累积生存率高于TRIM8表达阴性患者(Log-Rankχ~2=9.683,P<0.001)。结论EC组织中Rab35表达阳性率上调,TRIM8表达阳性率下调,且与EC低分化、FIGO分期ⅢA期、肌层浸润深度、淋巴结转移以及低生存率有关。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 Rab35 三结构域蛋白8 临床病理特征 预后
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Tanshinone ⅡA improves Alzheimer’s disease via RNA nuclearenriched abundant transcript 1/microRNA-291a-3p/member RAS oncogene family Rab22a axis
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作者 Long-Xiu Yang Man Luo Sheng-Yu Li 《World Journal of Psychiatry》 SCIE 2024年第4期563-581,共19页
BACKGROUND Alzheimer’s disease(AD)is a neurodegenerative condition characterized by oxidative stress and neuroinflammation.Tanshinone ⅡA(Tan-ⅡA),a bioactive compound isolated from Salvia miltiorrhiza plants,has sho... BACKGROUND Alzheimer’s disease(AD)is a neurodegenerative condition characterized by oxidative stress and neuroinflammation.Tanshinone ⅡA(Tan-ⅡA),a bioactive compound isolated from Salvia miltiorrhiza plants,has shown potential neuroprotective effects;however,the mechanisms underlying such a function remain unclear.AIM To investigate potential Tan-ⅡA neuroprotective effects in AD and to elucidate their underlying mechanisms.METHODS Hematoxylin and eosin staining was utilized to analyze structural brain tissue morphology.To assess changes in oxidative stress and neuroinflammation,we performed enzyme-linked immunosorbent assay and western blotting.Additionally,the effect of Tan-ⅡA on AD cell models was evaluated in vitro using the 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide assay.Genetic changes related to the long non-coding RNA(lncRNA)nuclear-enriched abundant transcript 1(NEAT1)/microRNA(miRNA,miR)-291a-3p/member RAS oncogene family Rab22a axis were assessed through reverse transcription quantitative polymerase chain reaction.RESULTS In vivo,Tan-ⅡA treatment improved neuronal morphology and attenuated oxidative stress and neuroinflammation in the brain tissue of AD mice.In vitro experiments showed that Tan-ⅡA dose-dependently ameliorated the amyloid-beta 1-42-induced reduction of neural stem cell viability,apoptosis,oxidative stress,and neuroinflammation.In this process,the lncRNA NEAT1-a potential therapeutic target-is highly expressed in AD mice and downregulated via Tan-ⅡA treatment.Mechanistically,NEAT1 promotes the transcription and translation of Rab22a via miR-291a-3p,which activates nuclear factor kappa-B(NF-κB)signaling,leading to activation of the pro-apoptotic B-cell lymphoma 2-associated X protein and inhibition of the anti-apoptotic B-cell lymphoma 2 protein,which exacerbates AD.Tan-ⅡA intervention effectively blocked this process by inhibiting the NEAT1/miR-291a-3p/Rab22a axis and NF-κB signaling.CONCLUSION This study demonstrates that Tan-ⅡA exerts neuroprotective effects in AD by modulating the NEAT1/miR-291a-3p/Rab22a/NF-κB signaling pathway,serving as a foundation for the development of innovative approaches for AD therapy. 展开更多
关键词 TanshinoneⅡA Alzheimer’s disease Nuclear-enriched abundant transcript 1 Member of RAS oncogene family Rab22a Reactive oxygen species
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三阴乳腺癌组织中TUFT1和Rab5-GTP的表达水平及临床意义
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作者 史素芳 宋亚娟 +3 位作者 尹天露 李勇 贾东晓 刘伟光 《中国实验诊断学》 2023年第3期267-269,共3页
目的研究三阴乳腺癌(TNBC)组织中TUFT1和Rab5-GTP的表达水平,分析两种蛋白表达的相关性及TUFT1与患者临床病理特征的关系。方法选取2021年3月至2021年12月住院手术的TNBC患者80例,收集其癌组织。免疫组化法检测TUFT1和Rab5-GTP在癌组织... 目的研究三阴乳腺癌(TNBC)组织中TUFT1和Rab5-GTP的表达水平,分析两种蛋白表达的相关性及TUFT1与患者临床病理特征的关系。方法选取2021年3月至2021年12月住院手术的TNBC患者80例,收集其癌组织。免疫组化法检测TUFT1和Rab5-GTP在癌组织中的表达情况,分析两种蛋白表达的相关性;评估TUFT1与TNBC患者临床病理特征之间的关系。结果在TNBC组织中,观察到TUFT1主要在癌细胞胞膜上和胞质内均有染色,以胞质内染色最强,Rab5-GTP在胞质内染色,两种蛋白的表达呈正相关(P<0.05);TUFT1表达与患者年龄无关(P>0.05),而与肿瘤大小、组织学分级、腋窝淋巴结转移均呈正相关(均P<0.05)。结论TUFT1和Rab5-GTP的表达水平与三阴乳腺癌病程的进展关系密切。 展开更多
关键词 三阴乳腺癌 TUFT1 Rab5-GTP 临床病理特征
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miR-138-5p靶向调控RAB22A表达抑制胶质瘤细胞的增殖、迁移和侵袭
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作者 李旭 王璞修 刘国力 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第3期401-406,共6页
目的:探讨miR-138-5p对胶质瘤细胞增殖、迁移与侵袭的影响以及其作用机制。方法:U251细胞分为miR-NC组(对照组)、miR-mimics组、miR-inhibitor组以及miR-mimics+RAB22A-pcDNA3.1组。qRT-PCR检测miR-138-5p在胶质瘤细胞中的表达量;CCK8... 目的:探讨miR-138-5p对胶质瘤细胞增殖、迁移与侵袭的影响以及其作用机制。方法:U251细胞分为miR-NC组(对照组)、miR-mimics组、miR-inhibitor组以及miR-mimics+RAB22A-pcDNA3.1组。qRT-PCR检测miR-138-5p在胶质瘤细胞中的表达量;CCK8实验检测U251细胞的增殖能力;Transwell实验检测U251细胞的迁移和侵袭能力;Targetscan数据库预测miR-138-5p的下游靶基因;运用双荧光素酶报告基因实验验证细胞周期蛋白RAB22A是miR-138-5p的靶基因;RNA结合蛋白免疫沉淀实验进一步验证miR-138-5p与RAB22A之间的相互作用;运用蛋白免疫印迹实验检测组织和细胞中RAB22A的蛋白表达水平。结果:与正常人星形胶质细胞相比较,miR-138-5p在胶质瘤细胞中表达量降低(P<0.05);CCK8和Transwell实验结果表明,在U251细胞中,过表达miR-138-5p能显著抑制细胞的增殖、迁移和侵袭能力(P<0.05);运用Targetscan数据库预测miR-138-5p下游靶基因为RAB22A,miR-138-5p作用于RAB22A的3'UTR区域,双荧光素酶报告基因实验与蛋白免疫沉淀实验结果证实miR-138-5p与RAB22A之间的相互作用;RAB22A在胶质瘤细胞中明显高表达(P<0.05),在U251细胞中过表达miR-138-5p明显抑制RAB22A的表达(P<0.05)。结论:miR-138-5p在胶质瘤细胞中表达降低,miR-138-5p通过下调RAB22A表达而抑制细胞增殖、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 miR-138-5p RAB22A 胶质瘤 增殖 迁移 侵袭
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miR-125b-5p通过负调控RAB3D基因表达抑制骨肉瘤细胞增殖与迁移 被引量:2
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作者 谈秋瑜 吴旭 +2 位作者 纪方 吴少云 颜亮 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期68-75,共8页
目的 探讨miR-125b-5p调控RAB3D在骨肉瘤增殖与迁移中的作用机制。方法 通过qRT-PCR检测正常骨细胞hFOB1.19、骨肉瘤细胞系(MG63、HOS)中miR-125b-5p的表达水平。骨肉瘤细胞系中通过脂质体转染升高或降低miR-125b-5p的表达,通过EDU和Tra... 目的 探讨miR-125b-5p调控RAB3D在骨肉瘤增殖与迁移中的作用机制。方法 通过qRT-PCR检测正常骨细胞hFOB1.19、骨肉瘤细胞系(MG63、HOS)中miR-125b-5p的表达水平。骨肉瘤细胞系中通过脂质体转染升高或降低miR-125b-5p的表达,通过EDU和Transwell实验检测骨肉瘤细胞增殖和迁移的变化;通过生物信息学软件预测miR-125b-5p可能调控的靶基因为RAB3D;通过Western blot检测正常骨细胞h FOB1.19、骨肉瘤细胞系(MG63、HOS)中RAB3D的表达水平;骨肉瘤细胞系中通过脂质体转染升高或降低miR-125b-5p的表达,通过Western blot及qRT-PCR实验检测骨肉瘤细胞中RAB3D mRNA及蛋白表达水平;并在骨肉瘤细胞中通过脂质体转染升高或降低RAB3D的表达,通过EDU和Transwell实验检测骨肉瘤增殖和迁移的变化;随后在骨肉瘤细胞中通过脂质体转染同时升高miR-125b-5p和RAB3D的表达量,通过EDU和Transwell实验检测骨肉瘤细胞增殖和迁移的变化。结果 qRT-PCR结果表明在骨肉瘤细胞(MG63、HOS)中miR-125b-5p的表达明显下调(P<0.05)。3种生物信息学软件预测RAB3D是miR-125b-5p可能调控的靶基因。qRT-PCR、Western blot结果显示,miR-125b-5p表达量升高,骨肉瘤细胞(MG63、HOS)中RAB3D的蛋白表达量下降(P<0.05);miR-125b-5p表达量降低,骨肉瘤细胞(MG63、HOS)中RAB3D的蛋白表达量下降(P<0.05),而RAB3D的mRNA水平没有发生变化。细胞增殖及迁移实验结果显示,miR-125b-5p与RAB3D对细胞增殖及迁移的影响相反,而同时在骨肉瘤细胞内升高miR-125b-5p与RAB3D的表达量,RAB3D对骨肉瘤细胞增殖及迁移的影响在重新升高miR-125b-5p表达量时被阻断(P<0.05)。结论 miR-125b-5p在转录后水平通过调控RAB3D的表达抑制了骨肉瘤细胞的增殖和迁移。 展开更多
关键词 miR-125b-5p RAB3D 骨肉瘤细胞 细胞增殖 细胞迁移
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高表达RAB7A通过促进肿瘤侵袭影响胃癌患者的预后 被引量:1
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作者 张敏 刘生宝 +7 位作者 张诺 张文静 夏勇生 宋雪 张小凤 左芦根 李静 胡建国 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1734-1743,共10页
目的探讨Ras相关蛋白7A(RAB7A)在胃癌组织中的表达对预后的影响及其作用机制。方法基于癌症公共数据库和本院接受胃癌根治术的104例患者,分析RAB7A在胃癌及癌旁组织中表达的差异以及其与患者临床病理学参数和预后的关系;采用生物信息学... 目的探讨Ras相关蛋白7A(RAB7A)在胃癌组织中的表达对预后的影响及其作用机制。方法基于癌症公共数据库和本院接受胃癌根治术的104例患者,分析RAB7A在胃癌及癌旁组织中表达的差异以及其与患者临床病理学参数和预后的关系;采用生物信息学富集分析预测RAB7A影响胃癌侵袭途径的作用和机制;通过慢病毒转染获得过表达和低表达RAB7A的胃癌细胞系(MGC803),采用免疫印迹、划痕及Transwell实验探究RAB7A对ECM降解的影响以及RAB7A对胃癌细胞迁移、侵袭的作用和机制。结果癌症公共数据库分析显示胃癌组织中RAB7A的表达高于正常对照组,且负面影响患者生存期(P<0.01)。本院患者数据显示,胃癌组织中RAB7A的表达高于癌旁组织(P<0.01),且与外周血胚抗原、糖类抗原19-9水平正相关(P<0.001)。单因素结合Cox多因素分析显示,RAB7A高表达是影响胃癌5年生存率的独立危险因素(HR:2.882;95%CI:1.459~5.693);ROC曲线分析显示,以RAB7A相对表达量2.625为截断值,其预测患者术后5年死亡的敏感性为84.62%,特异性为71.15%。生物信息学富集分析显示,RAB7A参与了胃癌组织ECM降解和PI3K/AKT信号激活;体外实验证实,过表达RAB7A可激活胃癌细胞PI3K/AKT信号(P<0.01),增强基质金属蛋白酶(MMP-2和MMP-9)表达(P<0.01),以及胃癌细胞迁移和侵袭能力(P<0.01)。结论RAB7A在胃癌组织中高表达并影响患者预后,其作用和激活胃癌PI3K/AKT信号并促进ECM降解和肿瘤侵袭有关。 展开更多
关键词 胃癌 RAB7A 预后 侵袭 PI3K/AKT
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基于蛋白质组学探讨RAB7对肾小球足细胞线粒体自噬的影响
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作者 胡文杰 陈慧宇 +3 位作者 祝晓丽 魏良兵 秦秀娟 高家荣 《中南药学》 CAS 2023年第12期3153-3161,共9页
目的通过蛋白质组学探究RAB7作为线粒体自噬生物标志物对肾小球足细胞线粒体自噬的影响。方法将6只SD大鼠随机分为对照组和模型组(n=3),尾静脉注射阿霉素复制慢性肾小球肾炎(CGN)模型。采用蛋白质组学技术联合自噬数据库鉴定CGN大鼠的... 目的通过蛋白质组学探究RAB7作为线粒体自噬生物标志物对肾小球足细胞线粒体自噬的影响。方法将6只SD大鼠随机分为对照组和模型组(n=3),尾静脉注射阿霉素复制慢性肾小球肾炎(CGN)模型。采用蛋白质组学技术联合自噬数据库鉴定CGN大鼠的差异自噬相关蛋白。体内采用Western blot方法验证相关蛋白的表达,体外采用嘌呤霉素氨基核苷(PAN)诱导肾小球足细胞损伤模型,使用免疫荧光、透射电镜、Western blot等方法检测线粒体自噬变化。结果共筛选出12个自噬相关蛋白,其中RAB7 degree值最高。体内经Western blot验证的SNRPE、CTNNBI、CAT、RAB7A、SOD2蛋白表达水平与蛋白质组学数据一致。体外实验中,与正常组比较,模型组中RAB7、Parkin和PINK1蛋白表达水平降低(P<0.01);RAB7过表达后,与正常组比较,模型组中自噬标志物LC3Ⅱ/LC3Ⅰ、Beclin1蛋白表达水平升高(P<0.01),P62蛋白表达水平降低(P<0.01)。结论RAB7可能是CGN中线粒体自噬生物标志物,影响肾小球足细胞线粒体自噬。 展开更多
关键词 慢性肾小球肾炎 蛋白质组学 RAB7 肾小球足细胞 线粒体自噬
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PLIN2通过Rab18上调ACSL3表达促进巨噬细胞脂质蓄积
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作者 张星星 张荣 +5 位作者 杨丽 刘兰 罗健雄 王语婷 胡博雅 袁中华 《中国动脉硬化杂志》 CAS 2023年第12期1020-1028,共9页
[目的]探讨脂滴包被蛋白2(PLIN2)增加巨噬细胞内脂质蓄积的机制。[方法]将实验分为氧化型低密度脂蛋白(ox-LDL)组、不同PLIN2表达组、不同活性Rab18组,测定高表达和沉默表达PLIN2巨噬细胞中的Rab18和脂酰辅酶A长链合成酶3(ACSL3)蛋白水... [目的]探讨脂滴包被蛋白2(PLIN2)增加巨噬细胞内脂质蓄积的机制。[方法]将实验分为氧化型低密度脂蛋白(ox-LDL)组、不同PLIN2表达组、不同活性Rab18组,测定高表达和沉默表达PLIN2巨噬细胞中的Rab18和脂酰辅酶A长链合成酶3(ACSL3)蛋白水平,不同活性Rab18的高表达PLIN2巨噬细胞中的PLIN2、Rab18、ACSL3蛋白表达水平。采用Western blot检测蛋白表达水平,采用免疫荧光观察细胞内相关蛋白定位情况,采用油红O染色观察细胞内脂质蓄积情况。[结果]高表达PLIN2的细胞中Rab18、ACSL3表达水平明显增加(P<0.05),且PLIN2与Rab18、ACSL3在细胞内存在共定位的现象。转染Rab18显性突变体Q67L质粒(Rab18活性增强)后的PLIN2高表达巨噬细胞中ACSL3表达水平明显升高(P<0.05),细胞内脂滴的数量也明显增多(P<0.05)。[结论] PLIN2可通过Rab18上调ACSL3表达促进巨噬细胞脂质蓄积。 展开更多
关键词 脂滴包被蛋白2 Rab18 脂酰辅酶A长链合成酶3 脂质蓄积
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RILPL2在乳腺癌组织中的表达水平及其与临床病理指标的关系
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作者 刘伟光 王艳伟 +7 位作者 刘方舟 崔学静 李勇 董晓伟 李硕 戴璐娴 盛安康 史素芳 《中国实验诊断学》 2023年第10期1147-1150,共4页
目的观察Rab溶酶体相互作用蛋白样2(RILPL2)在乳腺癌组织和癌旁正常组织中的表达水平,分析RILPL2与患者临床病理指标之间的关系。方法选取2021年1月至12月因乳腺癌需手术治疗而住院的患者90例,收集其癌组织和癌旁正常组织。免疫组织化... 目的观察Rab溶酶体相互作用蛋白样2(RILPL2)在乳腺癌组织和癌旁正常组织中的表达水平,分析RILPL2与患者临床病理指标之间的关系。方法选取2021年1月至12月因乳腺癌需手术治疗而住院的患者90例,收集其癌组织和癌旁正常组织。免疫组织化学法检测RILPL2在乳腺癌组织和癌旁正常组织中的阳性表达率;蛋白免疫印迹法检测RILPL2在乳腺癌组织和癌旁正常组织中的相对表达水平;评估RILPL2的阳性表达与乳腺癌患者临床病理指标之间的关系。结果RILPL2主要在细胞的胞质和胞膜中表达,乳腺癌组织中RILPL2的阳性表达率为32.22%(29/90),明显低于癌旁正常组织的66.7%(60/90)(P<0.05)。RILPL2在乳腺癌组织的相对表达水平(0.990±0.038)明显低于癌旁正常组织中的相对表达水平(0.625±0.023)(P<0.05)。RILPL2蛋白的阳性表达与患者年龄无关,而与肿瘤分期、组织学分级和淋巴结转移有关(均P<0.05)。结论RILPL2在乳腺癌组织中的表达与其生长与转移密切相关,RILPL2可作为评估乳腺癌病程进展的生物学。 展开更多
关键词 乳腺癌组织 Rab溶酶体相互作用蛋白样2 临床病理特征
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沉默SIRT1降低胆管癌细胞对5-氟尿嘧啶的耐药:基于抑制FOXO1/Rab7自噬通路 被引量:2
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作者 辛辰 王笑影 +5 位作者 李响 陈宇 王雪 宁佳曦 杨适 王忠琼 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期454-459,共6页
目的探讨SIRT1靶向FOXO1/Rab7自噬通路调节胆管癌细胞5-氟尿嘧啶(5-FU)耐药的机制。方法不同浓度(50、100、150、200μg/mL)的5-FU处理HCCC-9810细胞构建HCCC-9810/5-FU耐药细胞模型,免疫荧光检测细胞中SIRT1表达情况,Western blot和q-... 目的探讨SIRT1靶向FOXO1/Rab7自噬通路调节胆管癌细胞5-氟尿嘧啶(5-FU)耐药的机制。方法不同浓度(50、100、150、200μg/mL)的5-FU处理HCCC-9810细胞构建HCCC-9810/5-FU耐药细胞模型,免疫荧光检测细胞中SIRT1表达情况,Western blot和q-PCR检测SIRT1、FOXO1、Rab7表达水平,Western blot检测自噬相关蛋白Beclin1、LC3、p62表达水平。SIRT1 siRNA和NC siRNA转染HCCC-9810/5-FU耐药细胞,CCK-8检测细胞耐药性,划痕实验检测细胞迁移能力,RT-qPCR检测FOXO1、Rab7 mRNA水平,Western blot检测SIRT1、FOXO1、Rab7、Beclin1、LC3、p62蛋白表达水平。结果不同浓度(50、100、150、200μg/mL)的5-FU均能抑制HCCC-9810细胞增殖。与对照组相比,HCCC-9810/5-FU耐药细胞中SIRT1荧光强度略有增强;SIRT1、Rab7、p62、FOXO1和Beclin 1蛋白表达上调(P<0.01),LC3Ⅱ/LC3Ⅰ比值增加(P<0.001);SIRT1、Rab7和FOXO1 mRNA水平上调(P<0.05)。沉默SIRT1表达后,HCCC-9810细胞的5-FU耐药性降低,细胞迁移能力降低,SIRT1(P<0.01)、Rab7(P<0.05)、p62(P<0.05)、FOXO1(P<0.01)和Beclin1(P<0.001)蛋白表达降低,LC3Ⅱ/LC3Ⅰ比值降低(P<0.001);FOXO1和Rab7 mRNA水平降低(P<0.05)。结论沉默SIRT1的表达抑制FOXO1/Rab7自噬通路激活。 展开更多
关键词 SIRT1 FOXO1/Rab7自噬通路 胆管癌细胞 5-氟尿嘧啶 耐药性
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植物病原真菌囊泡转运相关Rab家族蛋白研究进展 被引量:1
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作者 谭祥宇 陈莹 +2 位作者 李雨欣 尉婧 李二峰 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第5期744-751,共8页
对植物病原真菌Rab家族蛋白的结构特征、蛋白循环通路、上下游信号调控因子及生物学功能等进行了综述,深入探讨了其对植物病原真菌致病机制的影响,分析了植物病原真菌Rab家族蛋白研究深度及研究方向上的不足,以期为解析植物病原真菌Rab... 对植物病原真菌Rab家族蛋白的结构特征、蛋白循环通路、上下游信号调控因子及生物学功能等进行了综述,深入探讨了其对植物病原真菌致病机制的影响,分析了植物病原真菌Rab家族蛋白研究深度及研究方向上的不足,以期为解析植物病原真菌Rab家族蛋白调控致病的分子机制以及植物真菌病害的防治提供指导策略。 展开更多
关键词 植物 病原真菌 Rab家族蛋白 囊泡转运 调控因子
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