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lncRNA在骨质疏松中作用的初步研究
1
作者
李北辰
徐芳蓉
+2 位作者
杨崇正
刘衡
孙强
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期1100-1106,共7页
目的:探究原发性骨质疏松(osteoporosis,OP)中差异基因及lncRNA RAD51-AS1的作用,为原发性骨质疏松的诊断及治疗提供新思路。方法:利用GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中的GSE35956芯片数据进行分析,使用DEseq2对mRNA进行差异分析...
目的:探究原发性骨质疏松(osteoporosis,OP)中差异基因及lncRNA RAD51-AS1的作用,为原发性骨质疏松的诊断及治疗提供新思路。方法:利用GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中的GSE35956芯片数据进行分析,使用DEseq2对mRNA进行差异分析获得差异基因(differentially expressed gene,DEG),使用ClusterProfiler对差异分析的基因进行富集分析;随后对芯片进行长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)重注释以发掘差异lncRNA,运用实时定量PCR(qRT-PCR)对正常人及骨质疏松患者的骨髓间充质干细胞(human bone marrow mesenchymal stem cell,hBMSC)进行表达量验证。最后用MTT、克隆形成和ALP染色观察RAD51-AS1对hBMSC增殖及成骨分化的影响。结果:共获得关于m RNA的1440个DEG,其功能主要富集于受体配体活性和单核细胞分化等过程。同时也获得关于lncRNA的105个DEG,发现RAD51-AS1在骨质疏松患者中表达显著下调。沉默RAD51-AS1后发现hBMSC的增殖减少和ALP活性下降。结论:PI3K-Akt信号转导途径和单核细胞分化在骨质疏松中发挥重要作用。lncRNA RAD51-AS1可以调节骨髓间充质干细胞增殖及分化,以缓解骨质疏松进程。
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关键词
骨质疏松
生物信息学
长链非编码RNA
rad51-as1
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职称材料
题名
lncRNA在骨质疏松中作用的初步研究
1
作者
李北辰
徐芳蓉
杨崇正
刘衡
孙强
机构
南京医科大学附属南京医院脊柱外科
南京医科大学人体解剖学系
出处
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期1100-1106,共7页
基金
南京市卫生科技发展专项资金项目(ZKX14032,ZKX19025)。
文摘
目的:探究原发性骨质疏松(osteoporosis,OP)中差异基因及lncRNA RAD51-AS1的作用,为原发性骨质疏松的诊断及治疗提供新思路。方法:利用GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中的GSE35956芯片数据进行分析,使用DEseq2对mRNA进行差异分析获得差异基因(differentially expressed gene,DEG),使用ClusterProfiler对差异分析的基因进行富集分析;随后对芯片进行长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)重注释以发掘差异lncRNA,运用实时定量PCR(qRT-PCR)对正常人及骨质疏松患者的骨髓间充质干细胞(human bone marrow mesenchymal stem cell,hBMSC)进行表达量验证。最后用MTT、克隆形成和ALP染色观察RAD51-AS1对hBMSC增殖及成骨分化的影响。结果:共获得关于m RNA的1440个DEG,其功能主要富集于受体配体活性和单核细胞分化等过程。同时也获得关于lncRNA的105个DEG,发现RAD51-AS1在骨质疏松患者中表达显著下调。沉默RAD51-AS1后发现hBMSC的增殖减少和ALP活性下降。结论:PI3K-Akt信号转导途径和单核细胞分化在骨质疏松中发挥重要作用。lncRNA RAD51-AS1可以调节骨髓间充质干细胞增殖及分化,以缓解骨质疏松进程。
关键词
骨质疏松
生物信息学
长链非编码RNA
rad51-as1
Keywords
osteoporosis
bioinformatics
long non-coding RNA
rad51-as1
分类号
R681 [医药卫生—骨科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
lncRNA在骨质疏松中作用的初步研究
李北辰
徐芳蓉
杨崇正
刘衡
孙强
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022
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