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基于开源RAG架构的校企专利技术合作问答应用研究 被引量:1
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作者 郝世博 史东昊 唐裕晨 《技术与市场》 2024年第5期1-11,共11页
构建系统准确的专利技术合作信息挖掘方法,可以降低技术交流信息壁垒并助力校企开展技术对接工作,促进科技成果转化。通过明确校企技术合作场景下各方信息需求,基于开源检索增强生成(retrieval-augmented generation,RAG)问答架构FastGP... 构建系统准确的专利技术合作信息挖掘方法,可以降低技术交流信息壁垒并助力校企开展技术对接工作,促进科技成果转化。通过明确校企技术合作场景下各方信息需求,基于开源检索增强生成(retrieval-augmented generation,RAG)问答架构FastGPT集成的大模型文本表征、知识库检索和文本生成等核心能力,构建适用于校企技术合作信息推荐场景的智能问答系统并开展领域应用实践。应用结果表明:问答系统的多属性QA知识库和联网查询充分整合了技术合作咨询场景所需的多源知识,通过知识库检索可将个性化咨询问题与对应知识信息进行精准关联匹配,而经提示语引导生成的回答内容能够对齐咨询意图,可将检索召回的知识文本准确加工为符合情景需求的回答形式,整体问答流程简明且易于操作。 展开更多
关键词 校企专利技术合作 知识库问答 检索增强生成(rag) 大语言模型
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基于cytb和rag2基因探讨叶须鱼属分子系统进化关系
2
作者 陈鲆 曾如奎 +12 位作者 杨德英 哈西 罗文杰 徐丹 刘飞 秦云鑫 熊金鑫 丁文祥 黄俊杰 刘日 唐子婷 何智 严太明 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期140-148,共9页
【目的】探究叶须鱼属的分子系统进化关系,筛选种间鉴定分子标记。【方法】构建叶须鱼属的cytb(5个种)和rag2(修长叶须鱼和裸腹叶须鱼)基因序列的NJ及贝叶斯系统进化树,并结合核苷酸多态位点、单倍型、核酸多态性、遗传距离、遗传分化... 【目的】探究叶须鱼属的分子系统进化关系,筛选种间鉴定分子标记。【方法】构建叶须鱼属的cytb(5个种)和rag2(修长叶须鱼和裸腹叶须鱼)基因序列的NJ及贝叶斯系统进化树,并结合核苷酸多态位点、单倍型、核酸多态性、遗传距离、遗传分化系数和基因流等,分析种间进化关系和种内遗传多样性。【结果】叶须鱼属每个种的cytb序列单独聚为一支,表明cytb基因序列能将叶须鱼属5个种区分开;种间高度遗传分化(F_(st)>0.25),物种之间基因流较弱(Nm<1);修长叶须鱼遗传多样性水平最高,锥吻叶须鱼遗传多样性水平最低。基于rag2基因序列的分子系统发育进化树显示,修长叶须鱼和裸腹叶须鱼均单独聚为一支,为独立的种。【结论】cytb和rag2可作为叶须鱼属种间鉴定的分子标记基因,这为叶须鱼属物种的鉴定和系统分类奠定了基础,也为叶须鱼属鱼类保护措施的制定提供了遗传学依据。 展开更多
关键词 叶须鱼属 CYTB基因 rag2基因 系统发育关系 遗传多样性
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基于LangChain的RAG问答系统设计与实现——以C语言课程问答系统为例 被引量:1
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作者 窦凤岐 胡珊 +1 位作者 李佳隆 张莹莹 《信息与电脑》 2024年第6期101-103,共3页
生成式人工智能(Artificial Intelligence,AI)问答系统虽然多数情况下能为用户提供比较满意的答案,但是这些问题的答案通常是基于已有的知识库训练而生成的。当涉及新的知识或者某个特定领域的问题时,生成式AI问答系统经常会生成一些错... 生成式人工智能(Artificial Intelligence,AI)问答系统虽然多数情况下能为用户提供比较满意的答案,但是这些问题的答案通常是基于已有的知识库训练而生成的。当涉及新的知识或者某个特定领域的问题时,生成式AI问答系统经常会生成一些错误的答案。为了克服生成式AI问答系统这种弊端,文章采用了检索增强生成(Retrieval Augmented Generation,RAG)技术,基于LangChain框架和ChatGLM大语言模型构建了C语言课程问答系统,具有较高的推广应用价值。 展开更多
关键词 rag LangChain 大语言模型 问答系统
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基于LLM和RAG的中邮网院智能客服系统研究
4
作者 张丽静 杜冬梅 +1 位作者 刘庆芳 刘海云 《邮政研究》 2024年第4期66-72,共7页
中邮网院客服为百万邮政员工提供培训、学习、考试等全方位服务支持的同时,存在着在学习高峰期回复不及时、全天候接待能力不足等问题。为解决这些问题,文章设计并实现了基于大语言模型、LangChain框架、pgVector向量数据库以及表示学... 中邮网院客服为百万邮政员工提供培训、学习、考试等全方位服务支持的同时,存在着在学习高峰期回复不及时、全天候接待能力不足等问题。为解决这些问题,文章设计并实现了基于大语言模型、LangChain框架、pgVector向量数据库以及表示学习等技术的智能客服系统原型,旨在利用大模型理解用户复杂的自然语言输入,随时随地以更高效、准确的方式回答用户所遇到的问题,在降低中邮网院客服人工成本的同时,提升用户体验感和满意度。经测试验证了基于检索增强生成和大语言模型实现智能客服的可行性,为中邮网院后续进行智能客服系统建设和选型提供了参考。 展开更多
关键词 大语言模型 rag LangChain 句向量表示学习模型 向量数据库
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利用CRISPR/Cas9技术构建RAG1基因敲除免疫缺陷猪模型的研究
5
作者 王清未 李振阳 +1 位作者 张效生 张林林 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第9期1-7,114,115,共9页
为了利用显微注射一步法构建RAG1基因敲除的免疫缺陷猪模型,试验利用CRISPR/Cas9技术针对猪的RAG1基因设计并筛选出高效的sgRNA,与体外转录的Cas9 mRNA按照4∶6比例混合后显微注射到猪体外受精的受精卵中,随后将基因编辑的受精卵移植到... 为了利用显微注射一步法构建RAG1基因敲除的免疫缺陷猪模型,试验利用CRISPR/Cas9技术针对猪的RAG1基因设计并筛选出高效的sgRNA,与体外转录的Cas9 mRNA按照4∶6比例混合后显微注射到猪体外受精的受精卵中,随后将基因编辑的受精卵移植到受体母猪输卵管内;仔猪出生后采集耳缘皮肤组织提取基因组进行PCR扩增、T7核酸内切酶Ⅰ酶切鉴定,以及利用Sanger法测序鉴定编辑后基因型;监测基因敲除的免疫缺陷仔猪在普通环境的生存周期;对死亡的仔猪进行剖检,采集胸腺和脾脏等免疫器官进行组织学分析。结果表明:通过在猪成纤维细胞系水平上进行RAG1基因敲除效率的筛选,筛选出针对猪RAG1基因第2外显子高效敲除的sgRNA序列,通过对猪受精卵胞质显微注射sgRNA和Cas9 mRNA混合物,获得2头RAG1基因敲除免疫缺陷仔猪,经鉴定发现RAG1基因的第2外显子碱基序列中有1 bp插入,造成移码突变,破坏了RAG1基因功能,致使仔猪免疫系统缺陷。出生的2头免疫缺陷仔猪在普通饲养环境的存活时间分别为19 d和33 d。RAG1基因敲除的免疫缺陷仔猪胸腺缺失,脾脏发育不良,无法在正常饲养环境中长时间存活。脾脏结构紊乱,出现炎症细胞浸润等免疫系统异常。说明通过CRISPR/Cas9技术进行显微注射可获得RAG1基因敲除的免疫缺陷猪模型。 展开更多
关键词 免疫缺陷动物 CRISPR/Cas9 rag1 sgRNA
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RagA缺失果蝇的构建及表型分析
6
作者 傅媛媛 沈苏林 +3 位作者 孟国强 刘倩倩 樊伟康 韦有恒 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1182-1189,共8页
【目的】Rag GTPase是真核生物中高度保守的Ras家族蛋白,在调节雷帕霉素靶点复合体1(mechanic target of rapamycin complex 1, mTORC1)活性和自噬等方面发挥重要作用。为了研究Rag GTPase的生理功能,本研究构建了RagA基因编码区缺失的... 【目的】Rag GTPase是真核生物中高度保守的Ras家族蛋白,在调节雷帕霉素靶点复合体1(mechanic target of rapamycin complex 1, mTORC1)活性和自噬等方面发挥重要作用。为了研究Rag GTPase的生理功能,本研究构建了RagA基因编码区缺失的突变黑腹果蝇Drosophila melanogaster,对其表型进行分析。【方法】将靶向RagA基因的gRNA表达质粒导入表达Cas9蛋白的黑腹果蝇中,随后通过PCR方法筛选获得RagA编码区缺失的RagA突变黑腹果蝇;利用遗传杂交的方法对腹果蝇RagA突变体的生殖及存活情况进行分析;利用FLP-FRT系统分别在脂肪体和雌性卵巢中诱导产生RagA突变的细胞克隆,分别分析RagA突变细胞生长和自噬水平的改变。【结果】利用CRISPR-cas9结合显微注射技术成功敲除RagA基因;RagA突变导致黑腹果蝇在胚胎期死亡,在细胞水平上使细胞生长明显降低、细胞内LAMP1和Rab7标记的自噬溶酶体堆积。【结论】本研究验证了RagA基因调节细胞代谢的功能,为进一步利用RagA突变果蝇研究RagA基因在发育中的功能分析和机制解析奠定基础。 展开更多
关键词 果蝇 自噬 Ras家族蛋白 rag GTPase 基因敲除
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基于RAG的煤矿安全智能问答模型
7
作者 洪亮 郭瑶 +1 位作者 刘兴丽 李宗雨 《黑龙江科技大学学报》 CAS 2024年第3期487-492,共6页
面向煤矿安全智能辅助预警决策需求,以瓦斯超限煤矿安全隐患知识为数据源,基于RAG检索增强生成,建立了一种煤矿安全智能问答模型。应用BGE-M3-Embedding、FAISS开源库等方法,构建瓦斯超限煤矿安全文本块的向量数据库,以及检索和生成模块... 面向煤矿安全智能辅助预警决策需求,以瓦斯超限煤矿安全隐患知识为数据源,基于RAG检索增强生成,建立了一种煤矿安全智能问答模型。应用BGE-M3-Embedding、FAISS开源库等方法,构建瓦斯超限煤矿安全文本块的向量数据库,以及检索和生成模块,采用BGE-M3-Embedding模型完成Query文本块向量的检索,召回top-k向量检索的上下文,实现煤矿安全瓦斯超限的相关提问,构建Prompt微调提示词,增强大语言模型生成答案。结果表明,Ragas自动评测Rag检索增强三种大语言模型效果,Baichuan2-13BAR、F忠实度及上下文相关指标最优,分别为0.91、0.83和0.87。搭建煤矿安全辅助决策的智能问答原型,验证了触发瓦斯超限煤矿安全隐患智能辅助决策的实效性、可靠性及迁移性。 展开更多
关键词 煤矿安全 rag检索增强生成 智能问答 智能辅助决策支持
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Coupled CFD-DEM Numerical Simulation of the Interaction of a Flow-Transported Rag with a Solid Cylinder
8
作者 Yun Ren Lianzheng Zhao +2 位作者 Xiaofan Mo Shuihua Zheng Youdong Yang 《Fluid Dynamics & Materials Processing》 EI 2024年第7期1593-1609,共17页
A coupled Computational Fluid Dynamics-Discrete Element Method(CFD-DEM)approach is used to calculate the interaction of a flexible rag transported by a fluid current with a fixed solid cylinder.More specifically a hyb... A coupled Computational Fluid Dynamics-Discrete Element Method(CFD-DEM)approach is used to calculate the interaction of a flexible rag transported by a fluid current with a fixed solid cylinder.More specifically a hybrid Eulerian-Lagrangian approach is used with the rag being modeled as a set of interconnected particles.The influence of various parameters is considered,namely the inlet velocity(1.5,2.0,and 2.5 m/s,respectively),the angle formed by the initially straight rag with the flow direction(45°,60°and 90°,respectively),and the inlet position(90,100,and 110 mm,respectively).The results show that the flow rate has a significant impact on the permeability of the rag.The higher the flow rate,the higher the permeability and the rag speed difference.The angle has a minor effect on rag permeability,with 45°being the most favorable angle for permeability.The inlet position has a small impact on rag permeability,while reducing the initial distance between the rag an the cylinder makes it easier for rags to pass through. 展开更多
关键词 rag flow around cylinder flow characteristics numerical simulation
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Efficiency-Driven Custom Chatbot Development: Unleashing LangChain, RAG, and Performance-Optimized LLM Fusion
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作者 S.Vidivelli Manikandan Ramachandran A.Dharunbalaji 《Computers, Materials & Continua》 SCIE EI 2024年第8期2423-2442,共20页
This exploration acquaints a momentous methodology with custom chatbot improvement that focuses on pro-ficiency close by viability.We accomplish this by joining three key innovations:LangChain,Retrieval Augmented Gene... This exploration acquaints a momentous methodology with custom chatbot improvement that focuses on pro-ficiency close by viability.We accomplish this by joining three key innovations:LangChain,Retrieval Augmented Generation(RAG),and enormous language models(LLMs)tweaked with execution proficient strategies like LoRA and QLoRA.LangChain takes into consideration fastidious fitting of chatbots to explicit purposes,guaranteeing engaged and important collaborations with clients.RAG’s web scratching capacities engage these chatbots to get to a tremendous store of data,empowering them to give exhaustive and enlightening reactions to requests.This recovered data is then decisively woven into reaction age utilizing LLMs that have been calibrated with an emphasis on execution productivity.This combination approach offers a triple advantage:further developed viability,upgraded client experience,and extended admittance to data.Chatbots become proficient at taking care of client questions precisely and productively,while instructive and logically pertinent reactions make a more regular and drawing in cooperation for clients.At last,web scratching enables chatbots to address a more extensive assortment of requests by conceding them admittance to a more extensive information base.By digging into the complexities of execution proficient LLM calibrating and underlining the basic job of web-scratched information,this examination offers a critical commitment to propelling custom chatbot plan and execution.The subsequent chatbots feature the monstrous capability of these advancements in making enlightening,easy to understand,and effective conversational specialists,eventually changing the manner in which clients cooperate with chatbots. 展开更多
关键词 LangChain retrieval augumental generation(rag) fine tuning
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hKDR^(+/+)人源化及Rag1^(-/-)基因缺陷新型双靶点遗传修饰荷瘤小鼠模型的建立 被引量:2
10
作者 刘甦苏 吴勇 +5 位作者 曹愿 赵皓阳 翟世杰 孙晓炜 李琳丽 范昌发 《实验动物与比较医学》 CAS 2023年第2期103-111,共9页
目的通过增强血管内皮生长因子受体(vascular endothelial growth factor receptor,VEGFR)人源化小鼠(hKDR^(+/+))接纳不同来源的小鼠肿瘤细胞系的潜力,建立能支持多种肿瘤细胞系成瘤的、可评价针对VEGFR靶点药物的新型荷瘤小鼠模型。... 目的通过增强血管内皮生长因子受体(vascular endothelial growth factor receptor,VEGFR)人源化小鼠(hKDR^(+/+))接纳不同来源的小鼠肿瘤细胞系的潜力,建立能支持多种肿瘤细胞系成瘤的、可评价针对VEGFR靶点药物的新型荷瘤小鼠模型。方法首先建立基于hKDR^(+/+)人源化小鼠模型评价针对VEGFR靶点抗体体内活性的方法,同时采用CRISPR/Cas9技术构建重组激活基因1(recombination activating gene 1,Rag1)敲除的C57BL/6N小鼠(命名为Rag1^(-/-)小鼠)。然后将Rag1^(-/-)小鼠与hKDR^(+/+)小鼠交配,筛选获得双基因纯合、双靶点基因修饰的hKDR^(+/+)/Rag1^(-/-)小鼠。最后在hKDR^(+/+)、Rag1^(-/-)、hKDR^(+/+)/Rag1^(-/-)和C57BL/6N小鼠上测试不同小鼠品系来源肿瘤细胞系的体内肿瘤生长差异。结果针对VEGFR靶点设计的抗体在hKDR^(+/+)小鼠体内表现出明显的抗肿瘤活性,与PBS组相比,肿瘤体积明显减小(P<0.01),肿瘤质量明显减轻(P<0.05)。Rag1^(-/-)小鼠、hKDR^(+/+)/Rag1^(-/-)小鼠的外周血B细胞和T细胞数量均明显减少(P<0.05,P<0.001)。C57BL/6小鼠来源的MC38细胞接种7 d后,在hKDR^(+/+)/Rag1^(-/-)、Rag1^(-/-)、C57BL/6N和hKDR^(+/+)四组小鼠体内均可见肿瘤生长。BALB/c小鼠来源的CT26细胞接种10 d后,仅在hKDR^(+/+)/Rag1^(-/-)和Rag1^(-/-)小鼠体内见到肿瘤生长,在C57BL/6N及hKDR^(+/+)小鼠中均未见肿瘤生长;接种后3周,hKDR^(+/+)/Rag1^(-/-)小鼠的成瘤体积明显大于Rag1^(-/-)小鼠(P<0.01)。结论获得了Rag1基因敲除小鼠,并进一步筛选获得新型hKDR^(+/+)/Rag1^(-/-)双靶点基因修饰小鼠模型;Rag1基因缺失时,不同品系小鼠来源的肿瘤细胞系更易成瘤。这提示可以通过降低hKDR^(+/+)人源化小鼠的免疫反应能力,增强或扩大该模型小鼠接纳肿瘤细胞系的范围,构建多种可用于评价VEGFR靶点药物的荷瘤小鼠模型。 展开更多
关键词 hKDR^(+/+)人源化小鼠 rag1^(-/-)基因敲除小鼠 VEGFR靶点 抗体 肿瘤
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Edgar Lawrence Doctorow’s Ragtime:Ragtime Music and the Musicalization of Fiction
11
作者 Nino Birkaia 《Journal of Literature and Art Studies》 2023年第10期775-779,共5页
The purpose of the present paper is to explore Edgar Lawrence Doctorow’s novel Ragtime(1975)as a masterful adaptation of musical form in fiction.It demonstrates the ways in which the use of musical devices of Ragtime... The purpose of the present paper is to explore Edgar Lawrence Doctorow’s novel Ragtime(1975)as a masterful adaptation of musical form in fiction.It demonstrates the ways in which the use of musical devices of Ragtime shapes the rhythmic/narrative structure of the novel.The article offers the reading of the novel as a musicalized fiction,or,in other words,as a form of musico-literary intermediality.It focuses on the chief characteristics of Doctorow’s novel such as a plurality of independent consciousnesses and a diversity of simultaneous points of view/voices.The novel by its very design is polyphonic.Manipulating polyrhythmic effects,mixed rhythms,repetitive phrases and leitmotifs,Doctorow is experimenting with the rhythm both on micro and macro textual levels. 展开更多
关键词 ragTIME ragged rhythms SYNCOPATION musicalization of fiction POLYPHONY
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Rag1、Rag2基因缺陷小鼠的构建及在异种肿瘤移植中的应用
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作者 沈如凌 石嘉豪 +3 位作者 盛哲津 冯晓龙 吴文婷 费俭 《实验动物与比较医学》 CAS 2016年第4期263-269,279,共8页
目的 建立重组激活基因,Rag1和Rag2基因缺陷小鼠模型,并对其表型和异种肿瘤移植的成瘤性进行分析.方法 通过传统的胚胎干细胞(ES)细胞打靶、囊胚注射方式,分别构建Rag1和Rag2基因缺陷小鼠模型;通过流式细胞术对缺陷小鼠外周血T/B淋巴... 目的 建立重组激活基因,Rag1和Rag2基因缺陷小鼠模型,并对其表型和异种肿瘤移植的成瘤性进行分析.方法 通过传统的胚胎干细胞(ES)细胞打靶、囊胚注射方式,分别构建Rag1和Rag2基因缺陷小鼠模型;通过流式细胞术对缺陷小鼠外周血T/B淋巴细胞含量进行检测;通过外源异种肿瘤细胞移植实验,对移植肿瘤细胞的成瘤性进行评价.结果 建立了Rag1和Rag2基因缺陷小鼠模型,两种基因突变纯合子小鼠模型外周血中T、B淋巴细胞含量较野生型小鼠显著降低;人源肿瘤细胞A549在上述两种基因突变纯合子小鼠中较BALB/c-nu(裸小鼠)或(NOD-SCID)非肥胖糖尿病/重症联合免疫缺陷小鼠表现出更强的成瘤性.结论 分别成功建立了Rag1和Rag2基因缺陷小鼠模型,两种小鼠模型均发生了T、B淋巴细胞生成障碍,导致免疫系统严重缺陷,可作为异种外源肿瘤移植的受体,用于小鼠荷瘤模型的建立. 展开更多
关键词 重组激活基因(rag1基因) rag2基因 基因缺陷 免疫缺陷 Recombination-activating GENES (ragl gene)
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基于RAG的管制员安全韧性分析方法研究
13
作者 袁乐平 谷泽坤 《中国安全生产科学技术》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期52-58,共7页
为探究人的韧性调整对空中交通管制系统安全性的推动作用,提出挖掘分析管制员日常作业安全韧性的方法。以文本挖掘数据为基础,结合韧性评估网格(RAG)构建管制员安全韧性评价指标体系;建立管制员安全韧性行为网络,通过TOPSIS算法,对评价... 为探究人的韧性调整对空中交通管制系统安全性的推动作用,提出挖掘分析管制员日常作业安全韧性的方法。以文本挖掘数据为基础,结合韧性评估网格(RAG)构建管制员安全韧性评价指标体系;建立管制员安全韧性行为网络,通过TOPSIS算法,对评价指标进行客观赋值;利用安全韧性评估模型结合网络关联路径量化管制员安全韧性。研究结果表明:安全韧性评分为0.73909,其中响应潜能重要性较大;“提醒/警告飞行员”、“监控空中动态”、“向飞行员提供指令或指示”、“遵循应急程序”4类安全韧性行为对系统安全性起到关键的正向影响作用。研究结果可为空管系统的安全韧性研究提供有效参考。 展开更多
关键词 管制员 韧性 复杂网络 韧性评估网格(rag)
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基于RAG1基因的中国近海13种石首鱼科鱼类系统进化关系 被引量:8
14
作者 马春艳 马凌波 +2 位作者 倪勇 沈盎绿 张永 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期9-16,共8页
为探讨中国近海石首鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增和序列测定,获得了石首鱼类9属13个种类的RAG1基因序列。对序列变异进行分析,基于Kimura双参数法计算属间和种间的遗传距离,并结合GenBank中的同源序列,以攀鲈为外群构建分子系统进化... 为探讨中国近海石首鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增和序列测定,获得了石首鱼类9属13个种类的RAG1基因序列。对序列变异进行分析,基于Kimura双参数法计算属间和种间的遗传距离,并结合GenBank中的同源序列,以攀鲈为外群构建分子系统进化树。将所得的分子数据与形态学分类进行比较,推论如下:(1)中国近海石首鱼类分为两个类群。(2)叫姑鱼亚科与石首鱼亚科以极高的置信度(90%)聚类,并处于系统进化树的基部,支持了形态学上二者是原始种类的分类观点。(3)分子系统树显示黄姑鱼属比银姑鱼属更为原始,但二者在形态分类上归为一个亚科的观点有待进一步商榷。(4)支持尖头黄鳍牙与银牙置于同一牙亚科的不同属的观点。(5)支持了形态学上黄鱼亚科分化最晚的结论。 展开更多
关键词 石首鱼科 rag1基因 系统进化
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不同rag基因型牙龈卟啉单胞菌在慢性牙周炎患者中的分布 被引量:8
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作者 汪贯华 张冬梅 潘亚萍 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期168-171,共4页
目的分析不同rag基因型牙龈卟啉单胞菌在慢性牙周炎患者中的分布状况。方法收集50例慢性牙周炎患者的150个龈下菌斑样本,采用16SrDNA聚合酶链反应(PCR)法检测牙龈卟啉单胞菌在牙周炎病变位点的检出率,并根据各rag基因型的特异性引物检... 目的分析不同rag基因型牙龈卟啉单胞菌在慢性牙周炎患者中的分布状况。方法收集50例慢性牙周炎患者的150个龈下菌斑样本,采用16SrDNA聚合酶链反应(PCR)法检测牙龈卟啉单胞菌在牙周炎病变位点的检出率,并根据各rag基因型的特异性引物检测牙龈卟啉单胞菌不同rag基因型在慢性牙周炎病变位点的分布。结果经16SrDNAPCR法检测,病变位点牙龈卟啉单胞菌阳性检出率为70.7%。各rag基因型在牙龈卟啉单胞菌阳性位点的总检出率:rag-1为60.4%,rag-2为23.6%,rag-3为44.3%,rag-4为15.1%;经统计学检验,rag-1和rag-3型检出率较高,高于rag-2和rag-4型(P<0.05)。结论慢性牙周炎患者龈下菌斑中的牙龈卟啉单胞菌存在rag基因多态性,rag-1和rag-3基因型牙龈卟啉单胞菌与中国辽宁地区人群慢性牙周炎的发生发展关系密切。 展开更多
关键词 牙龈卟啉单胞菌 基因型 rag基因
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正畸牙龈炎患者中牙龈卟啉单胞菌致病岛Rag基因的检测及其致病性分析 被引量:9
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作者 王建宁 张玉杰 肖水清 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期89-94,共6页
目的:分析不同rag基因型牙龈卟啉单胞菌(Pg)在正畸牙龈炎患者中的分布状况。方法:41例患者为戴用矫治器后发生牙龈炎者(正畸治疗组),36例为未戴矫治器牙周健康者(对照组),25例为中、重度牙周炎患者(牙周炎组)。利用多重PCR技术检测受试... 目的:分析不同rag基因型牙龈卟啉单胞菌(Pg)在正畸牙龈炎患者中的分布状况。方法:41例患者为戴用矫治器后发生牙龈炎者(正畸治疗组),36例为未戴矫治器牙周健康者(对照组),25例为中、重度牙周炎患者(牙周炎组)。利用多重PCR技术检测受试者龈沟液标本中牙龈卟啉单胞菌及致病岛rag基因,分析其与临床指标之间的相互关系。结果:牙龈卟啉单胞菌阳性率(%)在正畸治疗组、对照组和牙周炎组分别为70.7、36.1和92.0(P<0.01)。在Pg阳性患者(正畸治疗组和牙周炎组)rag基因型检出率依次为rag-3、rag-4、rag-1和rag-2。结论:不同rag基因型P.gingivalis在不同病变组织中的分布不同;rag-3型和rag-4型Pg与牙龈炎的发生发展有密切关系。 展开更多
关键词 牙龈卟啉单胞菌 致病岛rag基因 多重PCR 正畸学
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基于COI及RAG2基因序列15种金线鱼科鱼类分子系统进化关系 被引量:5
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作者 梁日深 陈冬青 +3 位作者 苏国茂 周萌 吴灶和 邹记兴 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期74-81,共8页
本研究基于线粒体DNACOI及核DNARAG2基因部分序列分析了印度-太平洋金线鱼科4属15种鱼类分子系统进化关系,综合2基因序列采用最大似然法构建了系统进化树。研究获得15种金线鱼科鱼类COI基因序列651bp及RAG2基因序列726bp,2基因片段均不... 本研究基于线粒体DNACOI及核DNARAG2基因部分序列分析了印度-太平洋金线鱼科4属15种鱼类分子系统进化关系,综合2基因序列采用最大似然法构建了系统进化树。研究获得15种金线鱼科鱼类COI基因序列651bp及RAG2基因序列726bp,2基因片段均不存在插入与缺失。构建的进化树上,(1)15种金线鱼科鱼类种内不同个体间均聚为一支,形成物种内的单系,节点支持率为100%。(2)金线鱼科4个属主要分成2个分支,金线鱼属与锥齿鲷属聚为一支,眶棘鲈属与副眶棘鲈属聚为另一支,与形态分类一致。(3)对于金线鱼属物种间的聚类情况,六齿金线鱼与深水金线鱼,印度洋金线鱼与金线鱼,苏门答腊金线鱼与日本金线鱼均紧密聚成姐妹分支,红金线鱼与姬金线鱼分类地位较为原始,位于上述金线鱼大分支的基部。而该物种间聚类结果与Mohd在形态上根据尾鳍上下叶的长度性状把金线鱼分成2大组群的结果不同。对于该分歧是由于分子进化速率与表型进化速率不一致导致,还是体色斑纹、鳍条数等性状不能作为区分金线鱼属鱼类分类关系的有效指标,还需今后进一步的研究。 展开更多
关键词 金线鱼科 系统发育 COI基因 rag2基因
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青春期牙龈炎牙龈卟啉单胞菌rag位点基因分型与致病力分析 被引量:3
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作者 于淼 李倜 +1 位作者 张玉杰 李智 《牙体牙髓牙周病学杂志》 CAS 2016年第11期659-661,共3页
目的:分析不同rag基因型牙龈卟啉单胞菌在青春期牙龈炎中的分布状况。方法:分别选取青春期牙龈炎(GI≥1,PD≥3 mm)64例及牙周健康者(GI=0,PD<3 mm)56例作为研究对象,采用16S r DNA聚合酶链反应(PCR)法检测受试者龈沟液标本中牙龈卟... 目的:分析不同rag基因型牙龈卟啉单胞菌在青春期牙龈炎中的分布状况。方法:分别选取青春期牙龈炎(GI≥1,PD≥3 mm)64例及牙周健康者(GI=0,PD<3 mm)56例作为研究对象,采用16S r DNA聚合酶链反应(PCR)法检测受试者龈沟液标本中牙龈卟啉单胞菌及致病岛rag基因,分析其与临床指标之间的相互关系。结果:病例组病变位点和对照组牙龈卟啉单胞菌阳性检出率分别为65.63%(42/64)、33.93%(19/56)(P<0.05)。牙龈卟啉单胞菌阳性患者(n=37)的rag基因型检出率依次为rag-3(16/37)、rag-1(9/37))、rag-4(7/37)和rag-2(5/37)。结论:青春期牙龈炎患者龈沟液中牙龈卟啉单胞菌存在rag基因多态性,其中rag-1和rag-3基因型牙龈卟啉单胞菌与青春期牙龈炎的发生发展关系密切。 展开更多
关键词 牙龈卟啉单胞菌 基因型 rag基因
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红笛鲷重组激活基因rag1原核表达条件的优化及纯化 被引量:3
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作者 张雪利 鲁义善 +2 位作者 谢吉国 简纪常 吴灶和 《广东海洋大学学报》 CAS 2012年第1期11-16,共6页
克隆编码红笛鲷(Lutjanus sanguineus)RAG1蛋白(recombination activating protein1)活性核心区的基因序列,并与pET-28a(+)载体连接,构建原核表达载体pET-28a-RAG1,将其转入大肠杆菌BL21(DE3)菌株,利用IPTG进行诱导表达。为提高融合蛋... 克隆编码红笛鲷(Lutjanus sanguineus)RAG1蛋白(recombination activating protein1)活性核心区的基因序列,并与pET-28a(+)载体连接,构建原核表达载体pET-28a-RAG1,将其转入大肠杆菌BL21(DE3)菌株,利用IPTG进行诱导表达。为提高融合蛋白的表达效率,运用传统的实验方法对诱导条件进行优化。SDS-PAGE分析表明,在37℃条件下,利用0.1 mmol/L IPTG诱导8 h后,RAG1重组融合蛋白的表达量最大,相对分子质量与预测值相符,该蛋白主要以包涵体形式高效表达,利用His Trap HP亲和柱使其得到进一步纯化;Western blot分析显示,该融合蛋白可与鼠抗His-tag单克隆抗体发生特异性结合,说明表达蛋白为目的蛋白。 展开更多
关键词 红笛鲷 rag1基因 原核表达 表达条件 优化 纯化 WESTERN BLOT分析
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慢性牙周炎状态下牙龈卟啉单胞菌rag-1基因的表达变化 被引量:5
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作者 汪贯华 张冬梅 潘亚萍 《上海口腔医学》 CAS CSCD 2009年第3期225-228,共4页
目的:分析不同牙周炎症状态下牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,P.gingivalis)rag-1基因mRNA的表达规律。方法:收集150例慢性牙周炎患者的龈下菌斑,PCR法检测P.gingivalis和rag-1基因。对P.gingivalisrag-1基因阳性的菌斑样本,... 目的:分析不同牙周炎症状态下牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,P.gingivalis)rag-1基因mRNA的表达规律。方法:收集150例慢性牙周炎患者的龈下菌斑,PCR法检测P.gingivalis和rag-1基因。对P.gingivalisrag-1基因阳性的菌斑样本,采用RT-PCR法检测rag-1mRNA的表达水平,并比较不同炎症状态下的表达差异。应用SPSS11.0软件包对数据进行配对t检验和秩相关检验。结果:轻度组、中度组和重度组的rag-1基因mRNA的相对表达水平分别为1.19±0.06、0.46±0.05和2.22±0.10(P<0.05)。结论:rag-1基因的mRNA表达水平随着牙周组织破坏程度及炎症状态的不同而改变。 展开更多
关键词 牙龈卟啉单胞菌 rag-1 基因表达 牙周炎
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