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RAMP与REMAP分子标记技术及其应用 被引量:6
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作者 王明霞 柳李旺 +3 位作者 龚义勤 赵丽萍 李培 黄丹琼 《分子植物育种》 CAS CSCD 2006年第6期859-865,共7页
引物设计是RAMP和REMAP标记分析的关键,二者都使用锚定的微卫星序列引物。目前已开发出多个RAMP锚定微卫星序列引物,与不同的RAPD引物进行扩增,得到更多的引物组合。REMAP使用反转录转座子的外向LTR引物和锚定微卫星序列引物。而RAMP分... 引物设计是RAMP和REMAP标记分析的关键,二者都使用锚定的微卫星序列引物。目前已开发出多个RAMP锚定微卫星序列引物,与不同的RAPD引物进行扩增,得到更多的引物组合。REMAP使用反转录转座子的外向LTR引物和锚定微卫星序列引物。而RAMP分析采用不对称PCR循环,在PCR扩增的后15个循环中,退火温度设为2个;REMAP则采用常规PCR循环。扩增产物可在聚丙烯酰胺凝胶、变性聚丙烯酰胺凝胶、琼脂糖凝胶上进行电泳分离,检测时可使用同位素、银染或溴化乙锭染色等技术。目前,这两种标记技术已在作物和动物种质资源的遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建、转基因植株基因稳定性分析等方面都有成功的应用。 展开更多
关键词 ramp remap 分子标记
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Low-Cost Strategies for Development of Molecular Markers Linked to Agronomic Traits in<i>Prunus</i>
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作者 Juan A. Salazar Mousa Rasouli +3 位作者 Reza Fatahi Moghaddam Zabihollah Zamani Ali Imani Pedro Martínez-Gómez 《Agricultural Sciences》 2014年第5期430-439,共10页
Evaluation of agronomic traits in Prunus breeding programs is a tedious process because of the long juvenile period of trees, the influence of juvenility and the existence of climatic factors affecting the expression ... Evaluation of agronomic traits in Prunus breeding programs is a tedious process because of the long juvenile period of trees, the influence of juvenility and the existence of climatic factors affecting the expression of the trait. For these reasons, marker-assisted selection (MAS) strategies are particularly useful in these cases. The objective of this work is the analysis of alternative low- cost strategies for development of molecular markers linked to agronomic traits in Prunus including the application of modified Bulked segregant analysis (BSA) using Simple sequence repeat (SSRs) markers and the application of Random amplified polymorphism microsatellite (RAMP) markers. First BSA results showed that two SSR loci were found to be tightly linked to flowering time in almond. On the other hand, RAMP analysis has been demonstrated to be a potentially valuable molecular marker for the study of genetic relationships in Prunus. Results showed the dominant nature of these markers with a great abundance and transferability although with a reduced polymorphism. In addition, RAMP application in F1 progenies showed its suitability for molecular characterization and mapping, and later Quantitative trait loci (QTL) or BSA analysis. 展开更多
关键词 PRUNUS Breeding FLOWERING molecular markers SSR ramp BSA marker-Assisted Selection
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8个忍冬品种遗传关系的RAMP分析 被引量:3
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作者 张玉瑶 张军 +4 位作者 梁海永 崔琴琴 孙国峰 李晓东 张金政 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第9期5098-5100,共3页
[目的]为忍冬种质资源的合理利用提供理论依据。[方法]运用RAMP标记技术对8个忍冬品种的遗传多样性进行分析,并采用UPGMA方法对其进行聚类。[结果]8个忍冬品种均具有较丰富的遗传多样性,其多态性比率为83.67%,遗传相似系数为0.5901~0.9... [目的]为忍冬种质资源的合理利用提供理论依据。[方法]运用RAMP标记技术对8个忍冬品种的遗传多样性进行分析,并采用UPGMA方法对其进行聚类。[结果]8个忍冬品种均具有较丰富的遗传多样性,其多态性比率为83.67%,遗传相似系数为0.5901~0.971 3,平均值为0.784 1。Nei's遗传距离和UPGMA分析结果显示,8个忍冬品种被聚为2大类,其中淡红忍冬与金银花的遗传相似系数最小(0.590 1),亲缘关系最远;贯月忍冬与格雷姆忍冬的遗传相似系数最大(0.971 3),亲缘关系最近。[结论]应用RAMP标记可有效分析忍冬品种的遗传多样性,为忍冬种质资源的鉴别、分类和有效利用提供依据。 展开更多
关键词 ramp分子标记 忍冬 品种鉴定 遗传多样性
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茄子IRAP和REMAP分子标记的开发 被引量:18
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作者 王利英 杜永臣 +3 位作者 张斌 石瑶 王秋锦 赵福宽 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1363-1367,共5页
根据烟草和大麦中反转录转座子Bare-1和Tto1的LTR保守区域设计引物,对14份茄子材料进行PCR扩增,分别采用琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测扩增产物,建立了茄子IRAP(inter-retrotransposon amplifiedpolym orphism)和REMAP(retrotransposo... 根据烟草和大麦中反转录转座子Bare-1和Tto1的LTR保守区域设计引物,对14份茄子材料进行PCR扩增,分别采用琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测扩增产物,建立了茄子IRAP(inter-retrotransposon amplifiedpolym orphism)和REMAP(retrotransposon-microsatellite amplified polymorphism)分子标记技术体系。两种方法均得到了多态性丰富的指纹图谱,为茄子品种鉴定和指纹图谱构建提供了新途径。 展开更多
关键词 茄子 分子标记 反转录转座子 IRAP remap
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甜瓜属REMAP分子标记体系的建立及应用 被引量:5
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作者 王东 江彪 +1 位作者 娄群峰 陈劲枫 《中国瓜菜》 CAS 2011年第3期6-9,共4页
基于甜瓜属Ty1-copia类逆转座子的长末端重复序列信息,结合ISSR引物序列,在体系优化的基础上建立了适用于甜瓜属物种的REMAP(retrotransposon-microsatellite amplified polymorphism)标记体系。对46份甜瓜属不同类型材料进行聚类分析,... 基于甜瓜属Ty1-copia类逆转座子的长末端重复序列信息,结合ISSR引物序列,在体系优化的基础上建立了适用于甜瓜属物种的REMAP(retrotransposon-microsatellite amplified polymorphism)标记体系。对46份甜瓜属不同类型材料进行聚类分析,证明该标记体系能有效检测甜瓜属不同类型材料间的多态性,可以用于甜瓜属作物品种鉴定及指纹图谱构建。 展开更多
关键词 甜瓜属 分子标记 remap 多态性
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一种新的分子标记方法——随机微卫星扩增多态DNA(RMAPD) 被引量:18
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作者 蓝贤勇 陈宏 +2 位作者 张永德 孙维斌 雷初朝 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期78-84,共7页
随机微卫星扩增多态DNA(RMAPD)是利用随机引物和微卫星的上游或下游引物一起作为该扩增的引物,在TaqDNA聚合酶、MgC l2、dNTPs和模板DNA等共同作用下进行PCR扩增的一种新型分子标记方法。其核心是RMAPD引物的有效性问题。通过对西农萨... 随机微卫星扩增多态DNA(RMAPD)是利用随机引物和微卫星的上游或下游引物一起作为该扩增的引物,在TaqDNA聚合酶、MgC l2、dNTPs和模板DNA等共同作用下进行PCR扩增的一种新型分子标记方法。其核心是RMAPD引物的有效性问题。通过对西农萨能奶山羊群体RMAPD电泳检测、数据统计分析及验证实验等证明RMAPD的引物是有效的。通过与微卫星和RAPD标记比较,发现RMAPD标记在扩增引物、扩增程序和重复性等方面区别于微卫星和RAPD标记;它是RAPD标记的一种广义的延伸,但又不完全等同于RAPD标记。因此,确定RMAPD是一种新的分子标记方法。该方法也具有DNA标记的特点,在群体遗传结构和亲缘关系分析以及标记辅助选择等动物遗传育种领域具有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 RMAPD RAPD 微卫星标记 ramp 分子标记
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DNA分子标记研究进展 被引量:40
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作者 黄映萍 《中山大学研究生学刊(自然科学与医学版)》 2010年第2期27-36,共10页
探究与了解遗传变异有助于我们从分子基础上理解各种生命现象。由于并非所有的物种都进行过基因组测序,因此,分子标记技术以及它们与表型的关系可以作为有用的标签帮助我们研究遗传变异。基于DNA的分子标记如:RFLP(restriction fragment... 探究与了解遗传变异有助于我们从分子基础上理解各种生命现象。由于并非所有的物种都进行过基因组测序,因此,分子标记技术以及它们与表型的关系可以作为有用的标签帮助我们研究遗传变异。基于DNA的分子标记如:RFLP(restriction fragment length polymorphism),RAPD(random ampli?ed polymorphic DNA),SSR(simple sequence repeats)and AFLP(ampli-?edfragment length polymorphism)等应用于生态学、分类学、进化方面、系统发生以及遗传学方面的研究。最近几年,出现了一批新的分子标记技术,这些新的分子标记技术最初源自几种基本的分子标记技术的结合。新的分子标记技术联合了基本分子标记技术的优点,提高了灵敏度以及检测基因的不连续性和特异性。新的分子标记技术利用了一组新的DNA元件如:反转录转座子、线粒体微卫星序列、叶绿体微卫星序列等,通过增加基因组的覆盖率而检测遗传的多样性。RAPD和AFLP同样应用在以cDNA为模板来研究基因的表达。这篇综述主要介绍了近二十年来各种分子技术以及其原理。 展开更多
关键词 遗传标记 分子标记 CAPS remap SRAP 反转录转座子
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