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PCR技术结合RAPD图谱鉴定食品中双歧杆菌的研究 被引量:2
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作者 董明盛 江汉湖 +2 位作者 张磊 陆承平 马长明 《中国畜产与食品》 2000年第5期201-203,共3页
通过筛选16S rDNA序列库,设计了一对双歧杆菌属特异性引物P175和P874在试验确定的反应条件下,该引物对能正确区分双歧杆菌和非双歧杆菌。RAPD技术用于种及菌株的鉴定。选用10种引物对9株标准菌株基因组DNA进行扩增,对其指纹图谱分析... 通过筛选16S rDNA序列库,设计了一对双歧杆菌属特异性引物P175和P874在试验确定的反应条件下,该引物对能正确区分双歧杆菌和非双歧杆菌。RAPD技术用于种及菌株的鉴定。选用10种引物对9株标准菌株基因组DNA进行扩增,对其指纹图谱分析表明S 256引物扩增的图谱可于双歧杆菌菌种及菌株鉴定的依据。通过对图谱相似性进行聚类分析,揭示了双歧杆菌属基因组的多态性及其遗传发育关系。 展开更多
关键词 PCR技术 rapd图谱 食品 双歧杆菌 鉴定方法 培养方法
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家兔RAPD图谱及双引物的运用研究 被引量:2
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作者 庞荣清 陈振文 +2 位作者 陈成功 潘兴华 陈志龙 《实验动物科学与管理》 2000年第2期21-23,共3页
运用单引物获得了较理想的五个家兔个体的RAPD图谱 ,并探讨了双引物的运用。结果表明 :RAPD可用于家兔品种 (系 )鉴定 ,具有较大运用潜力。双引物能比单引物扩增出更多的具有多态性的条带 。
关键词 rapd图谱 双引物 运用 家兔
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利用RAPD技术对三种伪角毛虫及五种全列虫(原生动物,纤毛虫)的属间及属内关系探讨(英文) 被引量:3
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作者 伊珍珍 宋微波 +3 位作者 陈子桂 胡晓钟 邵晨 李俐琼 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2006年第3期480-484,共5页
利用11种随机引物对腹毛类纤毛虫中两个相近属内8个海洋种(3种伪角毛虫和5种全列虫)进行了种间及种内关系的RAPD分析,所得清晰条带显示种间均具有明显的差异。计算和比较了种群间、同属种间及不同属间的相似性指数。利用RAPDistance软... 利用11种随机引物对腹毛类纤毛虫中两个相近属内8个海洋种(3种伪角毛虫和5种全列虫)进行了种间及种内关系的RAPD分析,所得清晰条带显示种间均具有明显的差异。计算和比较了种群间、同属种间及不同属间的相似性指数。利用RAPDistance软件构建的邻接( NJ)树表明:伪角毛虫属与全列虫属之间能很好地分开,而不同种群间表现了很好的同源性。本工作表明RAPD技术可以很可靠的用来区分形态相似种,同时也表明RAPD分析在纤毛虫属间水平的系统关系推定中存在一定的适用性。 展开更多
关键词 全列虫属 伪角毛虫属 rapd图谱 种间区分 系统关系
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RAPD analysis of genetic diversity of nine strains of Auricularia auricular cultivated in Heilongjiang Province 被引量:7
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作者 李玲 李杰 +3 位作者 邹丽 白素英 牛黎明 马玉堃 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2007年第2期136-138,共3页
Polymorphism of nine strains (CF05, CF09, 29, 916, AU9, Chang10, Chang7, 8808 and AU. Japanese) of A. auricular cultivated in Heilongjiang Province were analyzed by RAPD (Random Amplication polymorphic DNA). Thirt... Polymorphism of nine strains (CF05, CF09, 29, 916, AU9, Chang10, Chang7, 8808 and AU. Japanese) of A. auricular cultivated in Heilongjiang Province were analyzed by RAPD (Random Amplication polymorphic DNA). Thirteen primers were selected from forty PCR primers with 10bp long random primer. The results showed that nine strains of A. auricular have a high level of genetic diversity and the percentage of DNA polymorphic was 96.05. The genotypes of 9 strains of Auricularia auricular were identified by the fingerprints from primer 27 and primer 46 by RAPD analysis. The results are helpful for quickly identifying strains of A. auricular in its early breeding time, and also provides a powerful theoretic basis to differentiate strains (Auricularia auricular) whose morphology is very similar in breeding programs of edible fungus. 展开更多
关键词 Auricularia auricular rapd analysis DNA fingerprint Genetic diversity
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A genetic linkage map of marine shrimp Penaeus (Fenneropenaeus) chinensis based on AFLP, SSR, and RAPD markers 被引量:4
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作者 刘博 王清印 +2 位作者 李健 刘萍 何玉英 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2010年第4期815-825,共11页
The Chinese shrimp Penaeus (Fenneropaeneus) chinensis is an important species in marine fishery and aquaculture in China. A female Chinese shrimp Penaeus (Fenneropaeneus) chinensis was captured from west coast of the ... The Chinese shrimp Penaeus (Fenneropaeneus) chinensis is an important species in marine fishery and aquaculture in China. A female Chinese shrimp Penaeus (Fenneropaeneus) chinensis was captured from west coast of the Korean peninsula and mated with a "Yellow Sea No. 1" male to produce the first filial generation (F1) 100 F2 full-sib progeny from brother-sister crosses between F1 families was used for the mapping study. A genetic linkage map of the Chinese shrimp was constructed, based on 354 markers, including 300 amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers, 42 microsatellite (SSR) markers, and 12 randomly amplified polymorphism (RAPD) markers. Forty-seven linkage groups (LGs) were identified. The total map length was 4 580.5 cM, with an average spacing of 11.3 cM, covering 75.8% of the estimated genome size. The construction of this genetic linkage map was part of a genetic breeding program. This linkage map will contribute to the discovery of genes and quantitative trait loci (QTLs) in Chinese shrimp. 展开更多
关键词 AFLP linkage map Penaeus (Fenneropenaeus) chinensis rapd SSR
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Isolation, Phenotypic Identification and Fingerprint by RAPD-PCR of Oxalotrophoic Burkholderia cepacia from Egyptian Fertile Soil
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作者 Hala Abou Shady Mona Kilany Abd EI Gawad +1 位作者 Qadria Genedi Wafaa Farouk 《Journal of Life Sciences》 2012年第7期732-739,共8页
Soil oxalate degrading bacteria is an important source for removing of toxic oxalate compounds. Isolation, screening, characterization, identification and fingerprint of the soil oxalate degrading bacteria from Egypti... Soil oxalate degrading bacteria is an important source for removing of toxic oxalate compounds. Isolation, screening, characterization, identification and fingerprint of the soil oxalate degrading bacteria from Egyptian fertile soil was aimed in this work. Isolated bacteria were first characterized using API 20 NE system. Nine RAPD primers were used in genetic fingerprinting of the characterized bacteria using RAPD-PCR. The preliminary characterization and polyphasic taxonomy for mesophilic, aerobic oxalate-degrading bacteria isolated from Egyptian fertile soil including auxanography using API galleries confirmed that the isolate belonged to the genus Burkholderia cepacia, the percentage of identity was 99.8% for 5167777 profiles. Fingerprinting by RAPD-PCR showed a DNA fingerprint ranging from 0 to 9 bands, over a size range of 344 bp to 3,280 bp. 展开更多
关键词 Burkholderia cepacia oxalotrophic rapd-PCR FINGERPRINT API 20 NE ISOLATION identification.
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大白菜耐热性QTL定位与分析 被引量:29
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作者 于拴仓 王永健 郑晓鹰 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期417-420,共4页
应用 35 2个标记位点的大白菜AFLP和RAPD图谱 ,采用复合区间作图的方法对控制大白菜耐热性的数量性状基因位点 (QTL)进行定位和遗传效应研究。用苗期热害指数进行耐热性表型鉴定 ,共检测到 5个耐热性QTL位点 ,分布于 3个连锁群上。ht 1... 应用 35 2个标记位点的大白菜AFLP和RAPD图谱 ,采用复合区间作图的方法对控制大白菜耐热性的数量性状基因位点 (QTL)进行定位和遗传效应研究。用苗期热害指数进行耐热性表型鉴定 ,共检测到 5个耐热性QTL位点 ,分布于 3个连锁群上。ht 1、ht 3和ht 5表现为增效加性效应 ,ht 2和ht 4表现为减效加性效应。ht 2对大白菜耐热性的遗传贡献率最大 ,其次是ht 5。发现了与 5个QTLs紧密连锁的侧连分子标记 ,它们与QTL间的距离为 0 1~ 2 4cM。这为大白菜耐热性分子标记辅助选择提供了理论基础。 展开更多
关键词 大白菜 耐热性 QTL定位 数量性状位点 AFLP rapd图谱 复合区间作图 遗传效应 热害指数
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人类疾病模型小鼠的标准化维持方法研究 被引量:2
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作者 戚春婷 张瑞忠 +3 位作者 徐平 施美莲 施恩 金玫蕾 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2005年第2期91-96,共6页
目的研究人类疾病模型小鼠的可遗传生物学特性,建立品系的标准化维持方法。方法选用FVB TgN、MRL Mpj和SAMP1Ka三个疾病模型小鼠品系作为代表性实验对象,通过测定生长曲线、RAPD同工、酶电泳、行为学试验等方法,找出三个品系相对于各自... 目的研究人类疾病模型小鼠的可遗传生物学特性,建立品系的标准化维持方法。方法选用FVB TgN、MRL Mpj和SAMP1Ka三个疾病模型小鼠品系作为代表性实验对象,通过测定生长曲线、RAPD同工、酶电泳、行为学试验等方法,找出三个品系相对于各自对照品系的不同特征,并建立了标准化检测指标作为维持方法的依据。结果MRL Mpj的生长曲线相对于对照品系有明显的统计学差异;FVB TgN、MRL Mpj、SAMP1Ka等三个品系的RAPD图谱在阳性引物及扩增出的条带方面均不一致;同工酶电泳的结果表明不同品系的个体之间表型不完全相同;行为学试验更从多方面直观地显示了各品系的不同特征。结论人类疾病模型小鼠除了用常规检测方法外,还应建立各品系在生长曲线、RAPD、同工酶电泳、行为学试验等方面的特殊检测方法,及时检测模型小鼠品系的独特性状并作为保种依据,以避免遗传漂变的发生。 展开更多
关键词 疾病模型 标准化 人类 同工酶电泳 生长曲线 rapd图谱 小鼠品系 检测方法 生物学特性 MRL 行为学 实验对象 检测指标 检测模型 遗传漂变 代表性 试验 统计学 特征 对照 保种
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IGS基因及RAPD标记分析在加特隐球酵母基因分类中的应用(英文) 被引量:1
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作者 康颖倩 朱键 +2 位作者 罗振华 王和 三上襄 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期731-736,共6页
根据ITS1-5.8S-ITS2区域的特异核酸序列变化,加特隐球酵母Cryptococcus gattii(≡新型隐球酵母加特变种Cryptococcu neoformans var.gattii)可分为6种基因型。本研究通过检测加特隐球酵母的IGS基因,发现其IGS序列有着更丰富的变异和信... 根据ITS1-5.8S-ITS2区域的特异核酸序列变化,加特隐球酵母Cryptococcus gattii(≡新型隐球酵母加特变种Cryptococcu neoformans var.gattii)可分为6种基因型。本研究通过检测加特隐球酵母的IGS基因,发现其IGS序列有着更丰富的变异和信息位点。通过结合加特隐球酵母RAPD(随机扩增的多态性DNA)图谱比较研究,与IGS和ITS的序列分析结果大体一致,说明新近发现的加特隐球酵母ITS8型确实有别于以前报道过的其他加特隐球酵母ITS基因型。研究证明IGS1及IGS2基因片段分析可以作为加特隐球酵母基因分类鉴定中有效的辅助鉴别的分子生物学方法,联合多种基因分类鉴定的方法可以更有效地揭示新型隐球酵母加特变种种内不同基因亚型间的遗传进化关系。 展开更多
关键词 加特隐球酵母 IGS基因 ITS基因型 rapd图谱
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