新疆棉花黄萎菌不同致病类型的RAPD指纹分析

用 RAPD- PCR技术 ,对采自新疆各地的 2 7个棉花黄萎菌株的遗传分化及致病性进行了研究。从 1 2 0个随机引物中筛选出 1 1个随机引物 ,共在 2 0 4个位点上扩增出 RAPD谱带 ,其中 1 88个为多态性位点 ,占 92 .1 6%。RAPD电泳条带差异表明 ,新疆棉花黄萎病菌种群内部存在着显著的遗传分化。对 RAPD谱带进行聚类分析 ,将 2 7个菌株划分成 3大类群 ,这 3大类群与根据鉴别寄主反应划分的不同致病类型有一定的相关性 。

30个中国甘薯主栽品种的RAPD指纹图谱构建及遗传变异分析

研究以中国30个甘薯主栽品种为材料,对甘薯RAPD指纹图谱的构建进行了探讨。从102个RAPD引物中筛选出26个多态性丰富的引物用于PCR扩增,共扩增出255条多态性条带,平均每个引物扩增的多态性带数为9.8条。其中S32和S39多态性最高,仅用其中1个引物即能将这30个甘薯品种完全区分开,且由此构建的指纹图谱出现的概率很小,分别为4.77×10-7(1/221)和1.91×10-6(1/219)。结果进一步表明,这30个甘薯品种的遗传距离变异幅度较大,为0.0390～0.4306,平均遗传距离为0.3086。RAPD聚类分析表明,地域分布相近的甘薯品种和具有同一亲本的甘薯品种聚在一起,与这些甘薯品种的系谱图一致。

雌核发育鲢RAPD指纹和蛋白质电泳研究

用２３个随机引物对雌核发育鲢子一代（普通鲢作对照）进行了ＲＡＰＤ—ＰＣＲ反应，在２３个引物中除一个引物无扩增产物外，其它均可得到１～１０条ＤＮＡ带，平均每个引物产生５３８条带。其中７个引物产生多态现象，占总引物的３１４％。多态座位达１３６８％。用Ｓｈａｎｎｏｎ指数对ＲＡＰＤ数据进行遗传多样性（Ｈｏ）分析，得出所研究样本的Ｈｏ为０１７５。用血清酯酶和血清蛋白电泳作对比时没有发现在蛋白质水平的多态现象，说明ＲＡＰＤ技术是一种比较灵敏实用的ＤＮＡ多态检测方法。以ＲＡＰＤ所得数据进行了雌核发育鲢子代和普通鲢个体间的遗传相似性与遗传距离分析，为鲢选育提供了依据。

肉仔鸡个体间RAPD指纹的变异

以白羽肉仔鸡为研究材料,应用随机扩增多态DNA(RAPD)技术,利用已筛选出的17个随机引物对15个公仔鸡和15个母仔鸡个体间的遗传变异进行分析,实验结果表明,(1)17个引物在母鸡群共产生145个扩增片段,其中有102个是多态性片段,多态率为7034%;17个引物在公鸡群共产生了154个扩增片段,其中有92个是多态性片段,多态率为5974%。这些结果说明RAPD标记的多态性较高,作为一种DNA标记,它可以用于分析鸡群体的遗传结构;(2)公、母鸡群体内个体间的遗传相似系数分别为08621,08214;(3)可以利用RAPD技术检测肉鸡杂合群体内个体间的遗传变异程度,但必须使用大量的随机引物。

不同类型玉米RAPD指纹图谱的构建

采用 RAPD标记技术对在云南省种植的不同类型玉米构建指纹图谱 ,在种子检验中用于鉴别种子真伪。从 80个引物中筛选到多态性好 ,带型稳定的 5个引物 ,总共检出 42个等位基因 ,片段大小在 40 0 bp～ 1 4 0 0 bp之间。分别建立了这些玉米材料的 RAPD指纹图谱及相应的数字指纹。

闽南乌龙茶茶树种质资源RAPD指纹图谱构建及遗传多样性分析

利用RAPD分子标记技术构建了30份闽南乌龙茶茶树种质的DNA指纹图谱,结果表明使用同一扩增引物的特异谱带类型和不同扩增引物的谱带类型组合可以有效鉴别闽南乌龙茶茶树种质资源;10条RAPD引物共扩增出103条谱带,其中80条具有多态性,占77.67%。通过UPGMA法聚类分析,30份茶树种质被聚为2个类群,供试种质间的平均遗传相似系数为0.603,遗传关系树状图在分子水平上清楚的显示了闽南乌龙茶茶树种质资源间的亲缘关系,为评估供试样品的遗传演化地位并从中选择适宜种质作为亲本进行茶树育种研究提供依据。

膜荚黄芪和蒙古黄芪的RAPD指纹图谱分析研究

利用RAPD标记对膜荚黄芪和蒙古黄芪进行了指纹图谱的研究。采用BSA法从100个10碱基随机引物筛选出7个在膜荚黄芪基因池和蒙古黄芪基因池中表现多态性的引物。单株检测表明,引物OPC06具有膜荚黄芪特异性,在检测的膜荚黄芪个体中均能扩增出1条710 bp左右的特异带,而在蒙古黄芪的单株中未见扩增特异带,因此,将该膜荚黄芪扩增特异性条带命名为OPC06-710。试验表明,利用RAPD标记可在分子水平上达到快速、准确、可靠地鉴定膜荚黄芪和蒙古黄芪的目的。

淮河蚌埠段浮游生物群落RAPD指纹与水体重金属含量的相关性研究

在测定淮河蚌埠段河水重金属含量的基础上,对淮河蚌埠段浮游生物群落DNA多态性进行RAPD指纹技术分析,探讨了重金属含量与浮游生物群落RAPD指纹的相关性.结果表明,所筛选的11条随机引物共获得97条谱带,多态率为85.1％,所有引物在各位点可获得7～11条扩增谱带,平均8.9条.淮河蚌埠段河水中Mn、Fe和Pb的含量高于《中华人民共和国生活饮用水卫生标准》,Fe和Pb的含量高于世界卫生组织《饮用水标准》.Hierarchical cluster聚类分析表明,淮河蚌埠段浮游生物群落RAPD指纹与淮河蚌埠段水体重金属含量的聚类结果基本一致,浮游生物群落RAPD指纹与水体重金属浓度呈现较好相关性,为建立新的淮河水质监测与评价技术提供科学参考.

黄芪杂交种RAPD指纹图谱及其亲缘关系分析

对膜荚黄芪和斜茎黄芪及其杂交种(黄芪草),利用RAPD标记进行了指纹图谱及遗传相似系数分析。结果表明,黄芪草在引物P3和P5的扩增图谱中分别具有1条和2条特异带(P3-670、P5-680、P5-870),而父本膜荚黄芪与母本斜茎黄芪无此特异带;在引物P4的扩增下膜荚黄芪具有一条730 bp左右的特异带,而其余5份材料均未出现该特异带;黄芪草与其父本膜荚黄芪遗传相似系数较小,而与母本斜茎黄芪遗传相似系数较大,其遗传偏向母本。

稗草致病菌——尖角突脐孢菌菌株RAPD指纹图谱的分析

以我国主要稻区的稗草植株上分离的 1 7株尖角突脐孢菌菌株为试验材料 ,采用改良的SDS法提取其基因组DNA ,并运用优化的RAPD分析体系对其进行了分子标记遗传差异研究。从 2 5个随机引物中筛选出 2 0个扩增效果好的引物 ,对全部试验材料进行了RAPD扩增 ,共得到 2 39条有效带 ,其中多态性带 2 2 9条 (占 95 .8% )。依据扩增结果建立了 1 7株尖角突脐孢菌基因型的DNA指纹图谱并对其进行了有效区分。根据RAPD分析结果计算了菌株间的遗传距离 ,分析了它们的遗传差异并进行了聚类分析 ,结果表明 ,RAPD分子标记技术是能够用于杂草致病菌资源的鉴定的 ,并可以进一步应用于特定性状的基因标记研究。

鳜鱼遗传多样性的RAPD指纹分析

采用20个随机引物对三个不同水域(秋浦河、长江、万佛湖)的鳜鱼群体的基因组进行了RAPD检测。得到了群体内、群体间的遗传相似性系数及遗传距离,为鳜鱼的遗传多样性研究及地方品种的选育提供了重要的资料。

草鱼RAPD指纹的初步研究

运用 2 0个随机引物对草鱼 (Ctenopharyngodonidells)进行了随机扩增多态DNA(Ran domamplifiedpolymorphicDNA ,RAPD)分析 结果表明 ,所用引物都能对草鱼扩增出稳定的RAPD谱带 ,扩增的谱带数在 2～ 1 1之间 ,扩增的片段大小在 0 1kb～ 3 0kb之间 ;其中 ,OPM - 9等 6个引物能在草鱼个体间扩增出多态性片段 ,占引物总数的 33 3% ,OPM - 1等 1 4个引物对草鱼不同个体扩增的谱带是一致的 ,占引物总数的 66 7% 。

建鲤与兴国红鲤RAPD指纹的初步研究

运用 2 0个 10bp随机引物对建鲤 (Cyprinuscarpiovar .jian)和兴国红鲤 (Cyprinuscarpiovar .singuonensis)进行了RAPD -PCR反应。所用引物中 ,除 2个没有扩增产物外 ,其它引物都能对建鲤和兴国红鲤扩增出清晰的RAPD谱带 ,扩增的片段大小在 0 .2kb～ 3.0kb之间。其中 ,8个引物对建鲤个体的扩增有多态现象 ,占引物总数的 40 % ;5个引物对兴国红鲤个体的扩增有多态现象 ,占引物总数的 2 5 %。

橡胶树炭疽病菌的RAPD指纹分析

利用9条10碱基的随机引物,在分子水平上对来自海南、云南、广东的16株橡胶树炭疽病菌菌株的遗传变异程度进行RAPD指纹分析。结果表明,16株菌株被聚为3个RAPD指纹组;RAPD指纹组与菌株的地理来源有明显的相关性;而将病原菌接种于橡胶树品系PR107,所得到的病情指数与其RAPD指纹聚类组间没有明显的相关性。

毛竹黄、白笋个体的RAPD指纹图谱分析

报道了由37个随机引物扩增出的毛竹黄、白笋个体RAPD指纹图谱,从分子水平上证实了毛竹黄、白笋 个体存在真实的遗传差异。其中,29个引物在毛竹黄、白笋上扩增出相同的谱带,反映出两者在遗传背景上存在 一定的相似性;其余8个引物扩增出具有不同大小的多态性片段的RAPD谱带,反映出两者遗传上的差异。

ERIC—RAPD指纹技术用于野生酵母签定和标准谱库的构建

开发了ERIC—RAPD指纹技术，建立了酵母种的ERIC—DNA“指纹”，组成野生酵母的标准图谱库。对未知酵母种进行遗传聚类分析，确定其分类地位。并将该技术应用于生产样品分离野生酵母的菌种鉴定。

黄瓜品种RAPD指纹图谱的构建及遗传相似性分析

利用RAPD技术对22个具有广泛遗传基础的黄瓜品种进行了指纹图谱构建及遗传相似性分析，从240条RAPD随机引物中筛选出27条具有稳定多态性的引物。27条引物共扩增出163条带谱，其中多态性带70条，平均多态性比例为43．10％。9条RAPD引物产生的12个特异性标记可以单一地鉴别9个品种，利用不同引物的组合可将其他品种鉴别出来。通过UPGMA法进行聚类分析，当GSC=0．6888时，

双岐杆菌RAPD基因指纹图谱与耐药谱分析比较

本文采用近年来兴起的一种新的分子生物学技术即 AP- PCR对 2 0株 4种不同的双岐杆菌进行了 RAPD指纹图谱的构建 ,同时对临床常用抗生素进行了耐药谱分析 ,结果 4种不同双岐杆菌分别获得各自特征性 RAPD指纹图谱 ,但耐药性分析结果表明其耐药谱基本相同。

用RAPD方法研究草鱼、柏氏鲤和3个地理种群鲤的亲缘关系

用 2 4种随机引物对雅罗鱼亚科 (Leuciscinae)的草鱼、鲤亚科 (Cyprininae)的柏氏鲤和 3个地理种群鲤 (荷包红鲤、黑龙江野鲤和德国镜鲤 )进行RAPD分析 ,构建了这 5种鱼类的基因组指纹图谱。通过对获得的基因组指纹图谱的量化分析 ,利用UPGMA重建了它们之间的亲缘关系。结果鲤种内 3个地理种群之间的相似性高于鲤和柏氏鲤种间的相似性 ,而草鱼与另 4种鲤亚科鱼类亚科之间的差异明显高于柏氏鲤、黑龙江野鲤、荷包红鲤和德国镜鲤的种间或种内差异。