群体遗传学研究中的数据处理方法Ⅰ.RAPD数据的AMOVA分析

近年来 ,RAPD数据和AMOVA分析广泛地应用于群体遗传学和保护遗传学研究。然而 ,由于RAPD标记具显性特点 ,加上目前进行AMOVA分析所依赖的RAPDistance软件不完善 ,使得对RAPD数据进行AMOVA分析时存在许多不足。本文介绍了AMOVA分析的基本过程 ,同时引入一个新的程序DCFA用以替代RAPDistance ,并详述了将DCFA与WINAMOVA联用 ,对RAPD数据进行AMOVA分析的具体步骤与注意事项。最后 ,以产自中国和巴西 8个普通野生稻 (Oryzarufipogon)天然群体为例 ,演示了对RAPD表型数据进行AMOVA分析的过程 ,讨论了AMOVA分析结果在群体遗传结构上的意义。通过对AMOVA算法的分析 ,同时比较 4种距离系数所得AMOVA结果 ,我们认为在进行AMOVA分析时选择NEI LI距离和欧氏距离平方较为合适 。