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枝角类RAPD条件优化和遗传多样性分析 被引量:4
1
作者 陆开宏 石志猛 王扬才 《上海水产大学学报》 CAS CSCD 2003年第4期303-307,共5页
以蒙古裸腹(MoinamongolicaDaday)和多刺裸腹(M.macrocopaStraus)为材料,对枝角类RAPD扩增条件进行了摸索和优化,结果表明,枝角类PCR扩增反应的最佳体系为:在25μL体积中,模板DNA25ng/μL,dNTPs0.1mmol/L,TaqDNA聚合酶1U,引物0.1μm... 以蒙古裸腹(MoinamongolicaDaday)和多刺裸腹(M.macrocopaStraus)为材料,对枝角类RAPD扩增条件进行了摸索和优化,结果表明,枝角类PCR扩增反应的最佳体系为:在25μL体积中,模板DNA25ng/μL,dNTPs0.1mmol/L,TaqDNA聚合酶1U,引物0.1μmol/L,Mg2+1.5mmol/L,10×PCR缓冲液2.5μL。按照优化的RAPD条件进行实验,重现性良好。2种裸腹在盐胁迫条件下的种群遗传多样性分析表明,同种裸腹不同生存盐度之间的种群遗传相似度较高,分别为0.9134和0.9038;而多刺裸腹和蒙古裸腹两个种间的遗传相似度相对较低,约为0.5~0.6。 展开更多
关键词 裸腹溞 随机扩增多态性 DNA 遗传多样性 枝角类 rapd条件
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大头鳕和半滑舌鳎RAPD分析条件的优化 被引量:1
2
作者 鹿志创 高天翔 +2 位作者 李玉晖 庄志猛 樱井泰宪 《海洋湖沼通报》 CSCD 北大核心 2007年第3期96-103,共8页
大头鳕和半滑舌鳎是我国重要的两种经济鱼类,本论文以大头鳕和半滑舌鳎基因组DNA为模板,对RAPD分析中的DNA模板浓度进行了优化,确定最适浓度。并分别筛选出20条和18条扩增结果稳定性好、多态性强的随机引物用于大头鳕以及半滑舌鳎的RAP... 大头鳕和半滑舌鳎是我国重要的两种经济鱼类,本论文以大头鳕和半滑舌鳎基因组DNA为模板,对RAPD分析中的DNA模板浓度进行了优化,确定最适浓度。并分别筛选出20条和18条扩增结果稳定性好、多态性强的随机引物用于大头鳕以及半滑舌鳎的RAPD遗传变异分析。 展开更多
关键词 大头鳕 半滑舌鳎 rapd条件优化 引物筛选
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余甘子基因组DNA提取及RAPD反应条件优化 被引量:18
3
作者 蔡英卿 赖钟雄 +3 位作者 桑庆亮 郭志雄 郭玉琼 潘东明 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第1期89-92,共4页
以余甘子叶片为材料,研究了余甘子基因组DNA提取方法及RAPD反应条件.结果表明,采用改良的SDS方法,提取的DNA质量较高,适宜于RAPD-PCR分析.在25μL反应体积中,RAPD分析的优化反应体系为:0.6mmol·L-1Mg2+、500-600μmol·L-1dNTP... 以余甘子叶片为材料,研究了余甘子基因组DNA提取方法及RAPD反应条件.结果表明,采用改良的SDS方法,提取的DNA质量较高,适宜于RAPD-PCR分析.在25μL反应体积中,RAPD分析的优化反应体系为:0.6mmol·L-1Mg2+、500-600μmol·L-1dNTP、300nmol·L-1随机引物、25ngDNA、1.00-1.25UTaqDNA聚合酶. 展开更多
关键词 余甘子 基因组DNA 提取 rapd反应条件 优化
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人参基因组DNA的提取及RAPD-PCR反应条件的优化 被引量:6
4
作者 周桐 金东淳 +1 位作者 伊旭 武立丹 《延边大学农学学报》 2009年第3期189-193,共5页
探讨了人参基因组DNA提取方法及RAPD-PCR反应条件的优化.结果表明,用改良的CTAB方法提取的DNA均达到了RAPD-PCR分析的要求;优化的RAPD-PCR反应条件为:在25μL RAPD-PCR反应体系中,模板DNA 20 ng,dNTP 200μmol/L,MgCl21.5mmol/L,10×... 探讨了人参基因组DNA提取方法及RAPD-PCR反应条件的优化.结果表明,用改良的CTAB方法提取的DNA均达到了RAPD-PCR分析的要求;优化的RAPD-PCR反应条件为:在25μL RAPD-PCR反应体系中,模板DNA 20 ng,dNTP 200μmol/L,MgCl21.5mmol/L,10×Buffer 2.5μL,引物浓度0.4μmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U,其余以ddH2O定容至25μL.PCR反应程序为:94℃预变性5 min;94℃45 s,40℃退火1 min,72℃1 min,共40个循环;最后在72℃延伸5 min. 展开更多
关键词 人参 DNA rapd—PCR条件
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黑木耳菌丝体DNA提取及RAPD扩增条件的优化
5
作者 黄哲虎 赵丽 +1 位作者 陈丹 陈艳秋 《延边大学农学学报》 2008年第4期244-248,共5页
对黑木耳菌株基因组DNA进行RAPD-PCR反应体系及扩增程序优化.结果表明,采用CTAB法快速提取到较高质量黑木耳基因组总DNA用于RAPD-PCR扩增,确定黑木耳基因组DNA RAPD-PCR最适25μL反应体系为:模板DNA浓度15 ng/μL,Mg2+浓度2.0 mmol/L,Ta... 对黑木耳菌株基因组DNA进行RAPD-PCR反应体系及扩增程序优化.结果表明,采用CTAB法快速提取到较高质量黑木耳基因组总DNA用于RAPD-PCR扩增,确定黑木耳基因组DNA RAPD-PCR最适25μL反应体系为:模板DNA浓度15 ng/μL,Mg2+浓度2.0 mmol/L,Taq DNA聚合酶1 U,dNTP浓度150μmol/L,10碱基引物浓度10 pmol,10×缓冲液,其余用重蒸馏水补充.扩增程序为:预变性94℃5 min,变性94℃1 min,退火36℃1 min,延伸72℃1.5 min,共40个循环,72℃最终延伸7 min. 展开更多
关键词 黑木耳菌株 rapd反应条件优化 反应程序优化
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合浦珠母贝DNA的抽提和RAPD反应体系的优化 被引量:17
6
作者 郭奕惠 黄桂菊 喻达辉 《南方水产》 2006年第4期59-64,共6页
分别从保存于-70℃和95%乙醇的合浦珠母贝组织提取总DNA。结果表明,乙醇保存标本用双蒸馏水预处理后所提的DNA与-70℃保存的标本所提的DNA质量均较好。用抽提的DNA为模板优化RAPD条件,得到适合于合浦珠母贝的RAPDPCR反应条件为:20μL反... 分别从保存于-70℃和95%乙醇的合浦珠母贝组织提取总DNA。结果表明,乙醇保存标本用双蒸馏水预处理后所提的DNA与-70℃保存的标本所提的DNA质量均较好。用抽提的DNA为模板优化RAPD条件,得到适合于合浦珠母贝的RAPDPCR反应条件为:20μL反应体系中包括20ngDNA模板,1×PCRBuffer,0.1mmol·L-1dNTPs,2.5mmol·L-1MgCl2,0.2μmol·L-1引物,1UTaqDNA聚合酶。最佳退火温度40℃。PCR产物用非变性PAGE银染和琼脂糖EB染色检测所得到的主要带型相同,但PAGE能检测到更多的多态带。 展开更多
关键词 合浦珠母贝 DNA提取 rapd条件优化 PAGE-银染
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Optimization of RAPD Reaction System of Taxus cuspidate Sieb. et Zucc 被引量:2
7
作者 肖璐 许明子 +1 位作者 崔苗 刘博 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2010年第3期47-49,共3页
[Objective] The research aimed to study the optimization conditions of RAPD reaction system of Taxus cuspidata.[Method] Using the leaves of Taxus cuspidata as materials,DNA was extracted by using modified CTAB method.... [Objective] The research aimed to study the optimization conditions of RAPD reaction system of Taxus cuspidata.[Method] Using the leaves of Taxus cuspidata as materials,DNA was extracted by using modified CTAB method.The influences of template DNA concentration,primer concentration,dNTP concentration,Taq DNA polymerase amount and magnesium ion concentration on the amplification effects of RAPD of Taxus cuspidate were analyzed.[Result] Through analysis and comparison of various factors,the optimized reaction system was established as follows:in a total volume of 20 μl,containing 10 ng DNA,2.0 mmol/L Mg2+,0.2 mmol/L dNTPs,15 pmol/μl random primer,1.0 U Taq polymerase,2 μl 10×buffer,and the supplementary ddH2O.[Conclusion] The research provided technical support for further discussion on the related studies with the sexual identification of Taxus cuspidate. 展开更多
关键词 Taxus cuspidata rapd Reaction system
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