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大鼠β-防御素rBD-2的分子克隆及其在皮肤组织的诱导表达 被引量:8
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作者 陈新年 黄宁 +1 位作者 吴琦 王伯瑶 《华西医科大学学报》 CAS CSCD 2000年第4期441-444,共4页
从大鼠皮肤提取总 RNA,以 P1 5′→ 3′TTCAGTCATGAGGATCCATTAC和 P2 5′→ 3′GGTTCTTGGTCTTTTTATCTAC引物 ,采用 RT- PCR技术扩增得到一 c DNA片段 ,经核苷酸序列测定 ,并根据其推导的氨基酸序列与人 β-防御素 - 2和大鼠 β-防御素 ... 从大鼠皮肤提取总 RNA,以 P1 5′→ 3′TTCAGTCATGAGGATCCATTAC和 P2 5′→ 3′GGTTCTTGGTCTTTTTATCTAC引物 ,采用 RT- PCR技术扩增得到一 c DNA片段 ,经核苷酸序列测定 ,并根据其推导的氨基酸序列与人 β-防御素 - 2和大鼠 β-防御素 - 1进行同源性比较 ,结果显示 ,该 c DNA片段编码的氨基酸序列具高度同源性 (其成熟肽与 h BD- 2的同一性为 5 0 % ,相似性为 32 % ) ,均含 6个典型的半胱氨酸 ,这表明所克隆的 c DNA为大鼠 β-防御素 - 2亚类 ,因此命名为 r BD- 2。大鼠 β-防御素 - 2基因在大肠杆菌感染性损伤皮肤组织中的表达明显增强 ,与人 h BD- 2的表达相似 ,能够被诱导表达。以上结果提示 ,β-防御素 - 2可能是皮肤组织对感染性损伤的防御反应所产生的重要免疫介质。 展开更多
关键词 大鼠 Β-防御素 rbd-2 CDNA 皮肤感染
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脂多糖LPS对糖尿病大鼠肺泡巨噬细胞RBD-2表达的影响 被引量:4
2
作者 张伟义 朱涛 《西部医学》 2011年第9期1629-1633,共5页
目的以肺泡巨噬细胞为研究对象,观察脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)刺激下RBD-2(大鼠β防御素-2,Rat-βdefensins-2)在正常大鼠及糖尿病大鼠肺泡巨噬细胞表达的变化。方法以健康雄性SD大鼠制备糖尿病模型。32只大鼠随机分为四组:正常... 目的以肺泡巨噬细胞为研究对象,观察脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)刺激下RBD-2(大鼠β防御素-2,Rat-βdefensins-2)在正常大鼠及糖尿病大鼠肺泡巨噬细胞表达的变化。方法以健康雄性SD大鼠制备糖尿病模型。32只大鼠随机分为四组:正常对照组(A组)、糖尿病组(B组)、LPS组(C组)和糖尿病+LPS组(D组),每组均为8只。分离培养大鼠肺泡巨噬细胞,通过RT-PCR以及Western blotting分别检测RBD-2的RNA及蛋白质表达水平,同时通过Real Time PCR检测大鼠肺泡巨噬细胞的TLR-2以及TLR-4的mRNA的表达。结果大鼠糖尿病模型构建成功。RT-PCR以及Western blotting结果显示,与正常组相比,糖尿病组、正常组+LPS组、糖尿病+脂多糖组的RBD-2 mRNA以及蛋白质表达水平依次增加,差异显著(P<0.05)。Real Time PCR结果显示,与正常组相比,糖尿病组、正常组+LPS组、糖尿病+脂多糖组的TLR-4 mRNA的表达水平依次增加,差异显著(P<0.05),而TLR-2差异则不明显。结论 LPS刺激后糖尿病大鼠肺泡巨噬细胞RBD-2表达增加较糖尿病组更为显著,说明RBD-2变化对于增强糖尿病机体的非特异性免疫能力具有明显的帮助,同时糖尿病大鼠肺泡巨噬细胞RBD-2表达较正常组增高,说明处于糖尿病时期的大鼠机体处于炎症状态,并且这一通路的表达受体主要是TLR-4受体。 展开更多
关键词 大鼠 糖尿病 rbd-2 RT-PCR WESTERN BLOTTING
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基于深度学习的SARS-CoV-2RBD-ACE2结合亲和力预测方法 被引量:1
3
作者 吴敏明 李维华 +1 位作者 王玉霜 丁海燕 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期575-582,共8页
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的快速变异导致不断出现新的毒株.已有研究表明SARS-CoV-2的S蛋白受体结合域(Receptor Binding Domain,RBD)与宿主ACE2的结合亲和力与病毒的侵染能力相关.随着新型冠状病毒在全球的持续暴发,出现了大量RBD多点... 新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的快速变异导致不断出现新的毒株.已有研究表明SARS-CoV-2的S蛋白受体结合域(Receptor Binding Domain,RBD)与宿主ACE2的结合亲和力与病毒的侵染能力相关.随着新型冠状病毒在全球的持续暴发,出现了大量RBD多点突变的新毒株.通过生物试验方式获得突变毒株RBDACE2结合亲和力费时费力,远远落后于突变株的积累,不能满足对该病毒实时监控的需求.为了快速预测具有多点突变毒株的结合亲和力,设计了一种深度神经网络模型.该模型结合卷积神经网络、循环神经网络与注意力机制,从RBD序列上学习关键特征并预测RBD-ACE2的结合亲和力,在真实数据集上对模型进行训练和评估.实验结果表明新模型可以有效地预测关切变异株的RBD-ACE2结合亲和力,也有助于对SARSCoV-2突变株的传播能力进行监控. 展开更多
关键词 新型冠状病毒 rbd-ACE2结合亲和力 深度神经网络
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SARS-CoV-2广谱中和抗体性质鉴定
4
作者 陈秀婷 汪毅祯 +2 位作者 商慧娴 王思令 郑子峥 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期693-697,共5页
目的:对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)广谱中和抗体XMA09进行性质鉴定,探究其广谱中和突变株的潜在机制,为SARS-CoV-2的疫苗设计与广谱中和抗体筛选提供参考。方法:通过ExpiCHO真核表达系统与Protein A层析柱表达纯化XMA09蛋... 目的:对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)广谱中和抗体XMA09进行性质鉴定,探究其广谱中和突变株的潜在机制,为SARS-CoV-2的疫苗设计与广谱中和抗体筛选提供参考。方法:通过ExpiCHO真核表达系统与Protein A层析柱表达纯化XMA09蛋白;冷冻电镜技术确定XMA09识别的受体结构域(RBD)上的关键氨基酸位点;间接ELISA与表面等离子共振(SPR)技术检测XMA09对SARS-CoV-2及其突变株Spike蛋白的亲和力;采用基于水疱性口炎病毒(VSV)的假病毒系统检测XMA09对SARS-CoV-2野生型及突变株的中和能力。结果:本研究发现XMA09识别的表位较为保守,对多种突变株Spike蛋白均具有强结合能力,能广谱中和关切突变株(VOCs),包括广泛流行的Omicron亚突变株BA.4/5。结论:XMA09是SARS-CoV-2广谱中和抗体,具有作为SARS-CoV-2治疗性抗体的潜力,并可为SARS-CoV-2的广谱疫苗设计与抗体药物开发提供参考意义。 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 受体结合结构域(RBD) 广谱中和抗体
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Accurate Diagnosis of SARS-CoV-2 JN.1 by Sanger Sequencing of Receptor-Binding Domain Is Needed for Clinical Evaluation of Its Immune Evasion
5
作者 Sin Hang Lee 《Journal of Biosciences and Medicines》 2024年第4期69-78,共10页
Background: Omicron JN.1 has become the dominant SARS-CoV-2 variant in recent months. JN.1 has the highest number of amino acid mutations in its receptor binding domain (RBD) and has acquired a hallmark L455S mutation... Background: Omicron JN.1 has become the dominant SARS-CoV-2 variant in recent months. JN.1 has the highest number of amino acid mutations in its receptor binding domain (RBD) and has acquired a hallmark L455S mutation. The immune evasion capability of JN.1 is a subject of scientific investigation. The US CDC used SGTF of TaqPath COVID-19 Combo Kit RT-qPCR as proxy indicator of JN.1 infections for evaluation of the effectiveness of updated monovalent XBB.1.5 COVID-19 vaccines against JN.1 and recommended that all persons aged ≥ 6 months should receive an updated COVID-19 vaccine dose. Objective: Recommend Sanger sequencing instead of proxy indicator to diagnose JN.1 infections to generate the data based on which guidelines are made to direct vaccination policies. Methods: The RNA in nasopharyngeal swab specimens from patients with clinical respiratory infection was subjected to nested RT-PCR, targeting a 398-base segment of the N-gene and a 445-base segment of the RBD of SARS-CoV-2 for amplification. The nested PCR amplicons were sequenced. The DNA sequences were analyzed for amino acid mutations. Results: The N-gene sequence showed R203K, G204R and Q229K, the 3 mutations associated with Omicron BA.2.86 (+JN.1). The RBD sequence showed 24 of the 26 known amino acid mutations, including the hallmark L455S mutation for JN.1 and the V483del for BA.2.86 lineage. Conclusions: Sanger sequencing of a 445-base segment of the SARS-CoV-2 RBD is useful for accurate determination of emerging variants. The CDC may consider using Sanger sequencing of the RBD to diagnose JN.1 infections for statistical analysis in making vaccination policies. 展开更多
关键词 Omicron JN.1 SARS-CoV-2 Sanger Sequencing RBD L455S Mutation Immune Evasion Vaccination Policies CDC
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MPLA衍生物的设计、合成及作为RBD⁃hFc新冠疫苗佐剂的活性研究
6
作者 廖攀 苏诗微 +4 位作者 陈丽清 罗翔 廖国超 孙平华 叶连宝 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 2024年第3期301-313,350,共14页
目的设计合成单磷酸脂质A(monophosphoryl lipid A,MPLA)的衍生物,考察其作为新冠病毒疫苗佐剂的开发潜力及C⁃1或C⁃6′位取代基对其活性的影响。方法以商业易得的葡萄糖胺为起始原料,经糖基化、缩合、磷酰化和氢化等反应完成目标化合物... 目的设计合成单磷酸脂质A(monophosphoryl lipid A,MPLA)的衍生物,考察其作为新冠病毒疫苗佐剂的开发潜力及C⁃1或C⁃6′位取代基对其活性的影响。方法以商业易得的葡萄糖胺为起始原料,经糖基化、缩合、磷酰化和氢化等反应完成目标化合物的合成。以临床应用的铝佐剂为阳性对照,将所得化合物与RBD⁃hFc重组蛋白新冠疫苗合用,于第0天和第14天经肌肉注射免疫小鼠。然后,分别在初次免疫后的第14、28、42、90天采血,通过检测抗体滴度与亚型、抗体血清抑制RBD结合ACE2的能力及中和抗体水平评价了目标化合物作为佐剂的免疫活性。结果合成得到5个MPLA的衍生物,产物及中间体结构经NMR和HRMS确证;生物活性测试结果表明,化合物1具有比铝佐剂更优的佐剂活性,化合物3和4的活性与铝佐剂相当。结论MPLA衍生物具有作为新冠病毒疫苗佐剂的开发潜力;初步构效关系分析表明,将MPLA的C⁃1位羟基以甲氧基和氨基替换会降低其活性,而将其C⁃6′的羟基以氨基取代可以提高活性。 展开更多
关键词 MPLA衍生物 佐剂 RBD⁃hFc 重组蛋白新冠疫苗
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β-防御素-1,2在实验性大鼠牙龈炎牙周炎模型牙龈上皮组织中的表达 被引量:4
7
作者 徐莉 董福生 +3 位作者 许丽华 蒋强国 李彬 段立立 《牙体牙髓牙周病学杂志》 CAS 北大核心 2011年第1期6-10,共5页
目的:通过建立大鼠牙龈炎、牙周炎模型并检测大鼠β-防御素-1,2(RBD-1,RBD-2)在其牙龈上皮三个区域的分布,探讨RBD-1、RBD-2在大鼠牙龈炎牙周炎发生、发展过程中的变化。方法:用正畸结扎丝结扎大鼠双侧上颌第一磨牙,经临床和HE组织学染... 目的:通过建立大鼠牙龈炎、牙周炎模型并检测大鼠β-防御素-1,2(RBD-1,RBD-2)在其牙龈上皮三个区域的分布,探讨RBD-1、RBD-2在大鼠牙龈炎牙周炎发生、发展过程中的变化。方法:用正畸结扎丝结扎大鼠双侧上颌第一磨牙,经临床和HE组织学染色确认结扎后2周、6周大鼠牙龈炎、牙周炎模型建立成功后,取大鼠上颌骨连同牙和牙周组织,制备切片,SP免疫组化染色法检测正常组、牙龈炎组、牙周炎组大鼠牙龈上皮中RBD-1、RBD-2的表达。结果:RBD-1、RBD-2在三组的牙龈上皮中都有表达,主要表达于口腔龈上皮棘细胞层和颗粒层细胞胞浆,在沟内上皮棘细胞层呈微弱表达,结合上皮、结缔组织、骨组织无表达;RBD-1在口腔龈上皮的表达强度各组无明显差异(P>0.05);RBD-2则在牙龈炎组表达强度显著升高,在牙周炎组表达强度显著降低(P<0.05);RBD-1、RBD-2在沟内上皮的表达则为牙龈炎组和牙周炎组显著低于正常组(P<0.05)。结论:RBD-1在大鼠牙龈上皮中呈组成性表达,而RBD-2的表达随炎症发展而改变;提示防御素在牙周组织的健康维护和牙周炎症进展中均起重要作用。 展开更多
关键词 牙龈炎 牙周炎 牙龈上皮 大鼠β-防御素-1 2 免疫组化
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糖基化修饰对新型冠状病毒刺突蛋白受体结合区(Spike RBD)与受体ACE2结合影响的非变性质谱研究 被引量:1
8
作者 罗宇翔 黄静 李惠琳 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第6期687-696,I0003,共11页
新型冠状病毒肺炎(新冠)疫情给人类生命安全和社会发展带来巨大威胁。新冠病毒表面的刺突(spike)蛋白受体结合区域(RBD)和宿主细胞膜表面的血管紧张素转化酶2(ACE2)结合是病毒入侵的关键步骤。表征RBD和ACE2结合时的结构基础和动态变化... 新型冠状病毒肺炎(新冠)疫情给人类生命安全和社会发展带来巨大威胁。新冠病毒表面的刺突(spike)蛋白受体结合区域(RBD)和宿主细胞膜表面的血管紧张素转化酶2(ACE2)结合是病毒入侵的关键步骤。表征RBD和ACE2结合时的结构基础和动态变化有利于理解病毒入侵的机制,为药物研发提供思路。结构质谱是蛋白质结构表征中广泛应用的方法,本工作通过非变性质谱(native MS)研究糖蛋白RBD和ACE2样品及其复合物。首先,优化了使用PNGase F切除RBD N-糖时的条件,对切糖后RBD蛋白的异质性进行分析,并进一步考察了切糖前后RBD与ACE2形成蛋白复合物的稳定性。结果表明,RBD N-糖的切除会导致其与ACE2形成的复合物稳定性降低。本工作可为RBD的N-糖基化作用分析提供参考,并为后续实验RBD是否需要切N-糖处理提供指导建议。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎(COVID-19) 刺突蛋白 受体结合区域(RBD) 血管紧张素转化酶2(ACE2) 糖蛋白 N-糖酰胺酶F 非变性质谱
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Evaluation of Peppermint Leaf Flavonoids as SARS-CoV-2 Spike Receptor-Binding Domain Attachment Inhibitors to the Human ACE2 Receptor: A Molecular Docking Study
9
作者 Marcelo Lopes Pereira Júnior Rafael Timóteo de Sousa Junior +2 位作者 Georges Daniel Amvame Nze William Ferreira Giozza Luiz Antônio Ribeiro Júnior 《Open Journal of Biophysics》 2022年第2期132-152,共21页
Virtual screening is a computational technique widely used for identifying small molecules which are most likely to bind to a protein target. In the present work, a molecular docking study is carried out to propose po... Virtual screening is a computational technique widely used for identifying small molecules which are most likely to bind to a protein target. In the present work, a molecular docking study is carried out to propose potential candidates for preventing the RBD/ACE2 attachment. These candidates are sixteen different flavonoids present in the peppermint leaf. Results showed that Luteolin 7-O-neohesperidoside is the peppermint flavonoid with a higher binding affinity regarding the RBD/ACE2 complex (about -9.18 Kcal/mol). On the other hand, Sakuranetin presented the lowest affinity (about -6.38 Kcal/mol). Binding affinities of the other peppermint flavonoids ranged from -6.44 Kcal/mol up to -9.05 Kcal/mol. The binding site surface analysis showed pocket-like regions on the RBD/ACE2 complex that yield several interactions (mostly hydrogen bonds) between the flavonoid and the amino acid residues of the proteins. This study can open channels for the understanding of the roles of flavonoids against COVID-19 infection. 展开更多
关键词 CORONAVIRUS Sars-CoV-2 Peppermint Flavonoids RBD/ACE2 Inhibitors
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SARS-CoV-2亚单位疫苗制备及免疫原性初步研究
10
作者 徐骁 黄涛 +6 位作者 刘铁柱 芜为 孙丽娜 李川 李建东 王世文 王希良 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期943-951,共9页
严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(Severe acute respiratory symptom coronavirus 2,SARS-CoV-2)自2019年年末出现以来,给全人类造成了严重的公共卫生事件和社会经济负担。本实验以SARS-CoV-2突变株XBB1.5的受体结合域(Receptor bindin... 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(Severe acute respiratory symptom coronavirus 2,SARS-CoV-2)自2019年年末出现以来,给全人类造成了严重的公共卫生事件和社会经济负担。本实验以SARS-CoV-2突变株XBB1.5的受体结合域(Receptor binding domain,RBD)序列为疫苗核心分子串联SARS-CoV-2的全长S蛋白制备了亚单位纳米颗粒疫苗。将S蛋白的6个氨基酸残基突变为6个脯氨酸残基,提高表达量和蛋白质分子的稳定性。而且将弗林酶酶切位点进行突变以增加蛋白质的稳定性。在羧基端串联昆虫铁蛋白的氨基酸序列,利用铁蛋白纳米颗粒多面体可结合抗原蛋白的特性,增加抗原递呈。在氢氧化铝和CpG1018双佐剂组合免疫小鼠后,可诱导小鼠产生针对SARS-CoV-2多种变异株的中和抗体,且可诱导小鼠产生了较强的细胞免疫和体液免疫。本研究表明,XBB1.5突变株RBD区域串联S蛋白全长序列及昆虫铁蛋白制备的纳米颗粒疫苗可以有效预防SARS-CoV-2变体,是一个很好的候选疫苗分子。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 亚单位疫苗 受体结合域 血管紧张素转化酶2
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新型冠状病毒RBD蛋白原核表达及多克隆抗体的制备 被引量:3
11
作者 彭晓燕 陆盼盼 胡祖权 《生物技术进展》 2023年第1期102-106,共5页
为原核表达严重急性呼吸综合征冠状病毒2(简称新型冠状病毒,severe acute respiratory syndrome-coronavirus 2,SARS-CoV-2)S蛋白受体结合域(receptor binding domain,RBD)并制备多克隆抗体,利用基因克隆技术将RBD基因连接到原核表达载... 为原核表达严重急性呼吸综合征冠状病毒2(简称新型冠状病毒,severe acute respiratory syndrome-coronavirus 2,SARS-CoV-2)S蛋白受体结合域(receptor binding domain,RBD)并制备多克隆抗体,利用基因克隆技术将RBD基因连接到原核表达载体pGEX-6p-1和pET-32a(+)上,电转化至大肠杆菌XL1-Blue感受态细胞,利用优化后的表达条件大量表达重组蛋白,经亲和层析纯化后通过SDS-PAGE检测蛋白的表达情况。利用GST-RBD融合蛋白作为免疫抗原免疫小鼠制备多克隆抗体,ELISA和Western blot分析抗血清的效价和特异性。PCR鉴定和序列测定结果显示,成功构建了重组载体pGEX-RBD和pET-RBD,在大肠杆菌中实现了GST-RBD和RBD-His融合蛋白的可溶性高效表达。研究获得的多克隆抗体的滴度达到约1∶3000,并具有良好的结合特异性。原核表达的可溶性新型冠状病毒RBD重组蛋白具有良好的免疫原性,为后续制备基因工程抗体奠定了实验基础。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 受体结合域 原核表达 融合蛋白 多克隆抗体
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仙台病毒递送新型冠状病毒RBD蛋白鼻内免疫接种增强呼吸道黏膜和系统性免疫应答的初步研究
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作者 袁明城 张剑 +7 位作者 陈洋 薛潘 武福星 袁若栋 董阳超 徐志凯 张芳琳 雷迎峰 《空军军医大学学报》 CAS 2023年第7期609-614,共6页
目的 研究仙台病毒(SeV)作为递送载体在增强新型冠状病毒(SARS-CoV-2)RBD蛋白诱导呼吸道黏膜和系统性免疫应答的特征。方法 利用同源重组技术构建SARS-CoV-2 RBD与抗体Fc融合蛋白编码基因的真核表达质粒,将其转染293-T细胞中进行表达并... 目的 研究仙台病毒(SeV)作为递送载体在增强新型冠状病毒(SARS-CoV-2)RBD蛋白诱导呼吸道黏膜和系统性免疫应答的特征。方法 利用同源重组技术构建SARS-CoV-2 RBD与抗体Fc融合蛋白编码基因的真核表达质粒,将其转染293-T细胞中进行表达并用Western blotting验证;将RBD-Fc融合蛋白表达质粒转染293-T细胞大量表达并使用亲和层析进行蛋白纯化;通过SeV递送RBD-Fc蛋白进行鼻内免疫接种,同时设置RBD-Fc组、SeV组、PBS组作为对照,各组分别在2周后加强免疫1次,3周后检测血清样本和肺泡灌洗液(BALF)中特异性抗体水平。结果 RBD、Fc蛋白编码基因片段通过重叠PCR方法得到融合蛋白基因片段(RBD-Fc),成功构建pCAGGS-RBD-Fc真核表达质粒;Western blotting结果显示RBD-Fc融合蛋白的表达条带符合预期大小,大量表达后经亲和层析获得一条单一的接近Mr 60 000的条带,与预期大小一致,纯度高;与RBD-Fc组、SeV组、PBS组相比,SeV递送RBD-Fc蛋白通过鼻腔加强免疫小鼠后的血清样本和BALF中均可检测到RBD特异性IgG(血清样本:P<0.01;BALF样本:P<0.05),且BALF中RBD特异性IgA相比RBD-Fc组有一定升高。结论 SeV在递送SARS-CoV-2 RBD蛋白进行鼻内免疫接种方面能够诱导一定水平的黏膜免疫和系统性免疫,为呼吸道传染病的黏膜疫苗研究奠定了初步的实验基础。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 rbd-Fc蛋白 黏膜免疫 仙台病毒
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Therapeutic Implications of Monoclonal Antibody
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作者 Mohammad Shane Alam Farhana Riyaz Shah +3 位作者 Muntser Mohammad Fadoul Alhassen Saif Elden B. Abdalla Abdul Mateen Md. Shakir Ahmad 《Journal of Biosciences and Medicines》 CAS 2023年第3期85-104,共20页
Background: The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic is a distinct public health issue that calls for the quick development of novel treatments and viral detection. Due to their high specificity and reliabilit... Background: The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic is a distinct public health issue that calls for the quick development of novel treatments and viral detection. Due to their high specificity and reliability, monoclonal antibodies (mAbs) have emerged as useful diagnostic and therapeutic tools for a variety of diseases. As a result, several scientists have jumped right into developing Ab-based assays for the identification of SARS-CoV-2 and Ab drugs for use as COVID-19 therapy agents. Since the receptor-binding domain (RBD) of the SARS-CoV-2 spike protein is essential for viral infection and has a known precise structure, it has become a key target for the creation of therapeutic antibodies. The use of Ab cocktails is anticipated to be a key component of an efficient COVID-19 treatment plan since SARS-CoV-2 is an RNA virus with a high mutation rate, particularly when subjected to the selection pressure of aggressively applied preventive vaccinations and neutralizing Abs. Furthermore, SARS-CoV-2 infection could provoke an overzealous immune response, leading to a cytokine storm that accelerates the onset of a severe disease. Abs to counteract cytokine storms are also actively being researched as COVID-19 therapies. Abs are now used in SARS-CoV-2 detection assays, including immunoglobulin and antigen tests, in addition to their use as medicines. In order to stop the spread of COVID-19, such Ab-based detection tests are essential surveillance tools. In this article, we’ll go over several important ideas related to mAb-based COVID-19 pandemic detection tests and treatments. Objective: To understand the role of hybridoma technology in therapeutic implications. 1) To study the basic concepts and options in hybridoma technology;2) To study the applications of hybridoma technology;3) To explore how hybridoma technology is applied in diagnostic histopathology. Method: For this method generally there is use of mouse or mammals are transfect with the Ags to find out the formation of antibody afterwards isolate the antibody which has been formed after injecting the antigens for a number of weeks. Following are the steps for mAbs: Step 1: In this step immunization of mouse is done;Step 2: Spleen is used for the isolation of B cells;Step 3: Cultivation of cancerous cells;Step 4: Merging of B cells with Myeloma cells;Step 5: This step cell lines are separated;Step 6: in the next step screening the suitable cell lines;Step 7: observation of multiplication in vitro as well as in vivo;Step 8: Harvesting. Discussion: Now a day there are many diseases which has been cured easily at the mean time it’s very difficult to diagnose and get the treatment. Due to advancement of monoclonal antibodies are used in the diagnosis and treatments such as COVID-19, SARS and SARS COV-2. Therefore important part of the monoclonal antibodies are its used in the diagnosis as well as in the treatment tools. 展开更多
关键词 Monoclonal Antibody Cancerous Cell Receptor-Binding Domain (RBD) Immune System SARS-CoV-2 and COVID-19
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表达SARS-CoV-2 Omicron突变株RBD的重组4型腺病毒的构建与鉴定
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作者 李莎 李山虎 +2 位作者 黄芳 吴成君 王芃 《国际病毒学杂志》 北大核心 2024年第2期114-118,共5页
目的构建和鉴定表达新型冠状病毒(severe acute respiratory symptom coronavirus 2,SARS-CoV-2)Omicron株刺突蛋白受体结合域(receptor binding domain,RBD)的重组4型腺病毒。方法使用重叠延伸PCR和无缝克隆构建增强型绿色荧光蛋白和RB... 目的构建和鉴定表达新型冠状病毒(severe acute respiratory symptom coronavirus 2,SARS-CoV-2)Omicron株刺突蛋白受体结合域(receptor binding domain,RBD)的重组4型腺病毒。方法使用重叠延伸PCR和无缝克隆构建增强型绿色荧光蛋白和RBD双顺反子表达盒,将PCR得到的ccdB片段和pBR322-Ad4质粒进行同源重组获得中间质粒pBR322-Ad4-ccdB,使用PacI和SpeI酶切质粒pBR322-Ad4-ccdB后回收载体片段,回收片段与双顺反子表达盒在E.coli GB08Red中同源重组获得重组质粒pBR322-Ad4-RBD,用AsiSI线性化后转染HEK293T细胞获得重组腺病毒Ad4-RBD,RT-PCR验证RBD蛋白的转录,Western blot验证重组腺病毒中RBD蛋白的表达。结果重组腺病毒Ad4-RBD的滴度达到5×108 PFU/mL,并能在细胞中稳定表达外源基因。结论成功构建了表达SARS-CoV-2 Omicron株RBD蛋白的重组4型腺病毒,为SARS-CoV-2 Omicron株疫苗的研发提供了科学有效的依据。 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 Omicron株 RBD蛋白 重组4型腺病毒
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严重急性呼吸综合征冠状病毒2受体结合域蛋白的分泌表达及其免疫原性分析
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作者 童光伟 赵大鹏 +3 位作者 刘丽 高宁 尹金良 卢颖林 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2024年第8期911-916,931,共7页
目的原核可溶性表达严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory symptom coronavirus 2,SARSCoV-2)受体结合域(receptor binding domain,RBD)蛋白,纯化后免疫小鼠,检测其免疫原性,为SARS-CoV-2候选疫苗的制备提供新的思路... 目的原核可溶性表达严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory symptom coronavirus 2,SARSCoV-2)受体结合域(receptor binding domain,RBD)蛋白,纯化后免疫小鼠,检测其免疫原性,为SARS-CoV-2候选疫苗的制备提供新的思路。方法扩增SARS-CoV-2 RBD蛋白基因片段,酶切后与pNCMO2表达载体连接,构建重组表达质粒pNC-RBD。将重组原核表达质粒转化入短小芽孢杆菌感受态细胞,扩大培养并降温诱导蛋白表达。利用亲和层析纯化目的蛋白,经氢氧化铝佐剂吸附后经背部皮下免疫雌性BALB/c小鼠,以仅免疫铝佐剂为对照,每组10只。ELISA法检测体液免疫效果,体外增殖试验测定细胞免疫效果,ELISA法测定多种细胞因子的体外分泌,流式细胞术测定细胞分型。结果重组表达质粒pNC-RBD经菌落PCR及测序证明构建正确。重组蛋白相对分子质量约22000,可分泌表达。纯化后重组蛋白纯度达95%以上。免疫小鼠后血清结合抗体和中和抗体效价分别可达1∶10000和1:750左右,均显著高于佐剂组(t分别为2.845和2.528,P均<0.01);体外可刺激淋巴细胞增殖,并促进IL-1β及IFNγ的分泌;细胞分型试验结果表明促进了CD4~+和CD8~+T细胞淋巴细胞增殖。结论成功可溶性表达了SARS-CoV-2 RBD蛋白,其免疫原性良好,为以RBD蛋白为基础研制SARS-CoV-2基因工程疫苗奠定了基础。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 受体结合域蛋白 可溶性表达 免疫原性
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信号肽对SARS-CoV-2 S1、RBD、RBD二聚体蛋白在Expisf9昆虫细胞中分泌表达的影响
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作者 吴清胜 李媛媛 姚春萍 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2024年第3期280-286,共7页
目的比较不同信号肽对SARS-CoV-2 S1、受体结合域(receptor binding domain,RBD)、RBD二聚体蛋白在Expisf9昆虫细胞中分泌表达的影响。方法选取SARS-CoV-2 S1(M1-E661)、RBD(R319-P545)、RBD二聚体(R319-K537串联)3种蛋白的基因序列,按... 目的比较不同信号肽对SARS-CoV-2 S1、受体结合域(receptor binding domain,RBD)、RBD二聚体蛋白在Expisf9昆虫细胞中分泌表达的影响。方法选取SARS-CoV-2 S1(M1-E661)、RBD(R319-P545)、RBD二聚体(R319-K537串联)3种蛋白的基因序列,按照N-端信号肽序列不同[内源(Endo)、蜂素honeybee melittin(HBM)、GP64、GP67、几丁质酶chitinase(Chi)、HIV-ENV]和C-端标签序列的不同,分为25组。通过Bac-to-Bac系统构建25种重组杆状病毒,建立25组三级毒种库。将B2和C4病毒分别接种至对数生长前期细胞(2.8×10^(6)个/mL)和对数生长中期细胞(1.2×10^(7)个/mL)。将各组病毒培养至100 mL(500 mL摇瓶),进行蛋白表达,并取样进行SDS-PAGE、Western blot和ELISA检测。S1、RBD、RBD二聚体蛋白各选择表达量较高的2组,进行重复验证。结果B2、C4病毒接种至高密度细胞,分泌表达量未提高,接毒后培养4和5 d的分泌表达量存在显著差异。A7(Endo-S1-tag)的分泌表达量明显低于A9(HIV-ENV-S1-tag),A4(Gp67-S1-tag)分泌表达量最高,A1(Endo-Endo-S1-tag)分泌表达量显著低于A7(Endo-S1-tag);B6(HIV-ENV-RBD-tag)分泌表达量显著高于B4(Gp67-RBD-tag)及其他信号肽组;C4(Gp67-RBD-dimer-tag)分泌表达量明显高于C3(Gp64-RBD-dimer-tag)。分别选择每种蛋白表达量较高的2组(A4、A9;B4、B6;C3、C4)进行重复验证确定,结果显示,A4、B6、C4的分泌表达量最高。结论S1、RBD二聚体蛋白分泌表达量最高的信号肽相同,是GP67信号肽,而RBD蛋白的最适信号肽是HIV-ENV信号肽。表明N-端序列会影响蛋白的分泌,信号肽序列有一定的通用性,但也与要表达的目的蛋白序列有关。 展开更多
关键词 信号肽 分泌表达 SARS-CoV-2 S1蛋白 受体结合域 杆状病毒-昆虫细胞系统
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新型冠状病毒刺突蛋白及其受体的结构与功能 被引量:8
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作者 江明金 温金华 +3 位作者 潘德城 周健 吕燕妮 魏筱华 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1497-1501,共5页
新型冠状病毒肺炎是一种由新型冠状病毒感染引发的急性传染病,已进入全球大流行状态。刺突蛋白(spike protein,S蛋白)是新型冠状病毒感染细胞的关键蛋白,在病毒的宿主嗜性和毒力等方面发挥重要作用。S蛋白三聚体结构自发呈现封闭和开放... 新型冠状病毒肺炎是一种由新型冠状病毒感染引发的急性传染病,已进入全球大流行状态。刺突蛋白(spike protein,S蛋白)是新型冠状病毒感染细胞的关键蛋白,在病毒的宿主嗜性和毒力等方面发挥重要作用。S蛋白三聚体结构自发呈现封闭和开放的构象状态对于受体的结合及膜融合构象变化的启动至关重要,其独特的弗林蛋白酶识别位点可能是导致高传染性的重要因素。因此,研究新型冠状病毒S蛋白及其受体的结构与功能,对进一步揭示新型冠状病毒入侵机制及相关靶向药物研发具有重要意义。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 S蛋白 受体 血管紧张素转化酶2 受体结合结构域-血管紧张素转化酶2复合物 结构 功能 入胞途径
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两种表达系统来源新冠病毒RBD蛋白免疫小鼠后的IgG抗体水平对比研究 被引量:2
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作者 胡立强 苏涛 +3 位作者 张勇 杨浩 陶怡然 陶泽 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1053-1061,共9页
当前新冠肺炎疫情仍在全球蔓延,给中国及世界的公共卫生安全和经济发展带来了严峻挑战。SARS-CoV-2病毒入侵机体的关键过程是刺突蛋白受体结合域RBD通过结合宿主细胞ACE2受体实现感染,而此过程与病原快速检测、疫苗以及药物干预等主要... 当前新冠肺炎疫情仍在全球蔓延,给中国及世界的公共卫生安全和经济发展带来了严峻挑战。SARS-CoV-2病毒入侵机体的关键过程是刺突蛋白受体结合域RBD通过结合宿主细胞ACE2受体实现感染,而此过程与病原快速检测、疫苗以及药物干预等主要抗病毒策略的研究与开发密切相关。因此,本研究旨在比较哺乳细胞和昆虫细胞重组表达来源的新冠病毒刺突蛋白受体结合结构域RBD免疫小鼠后产生IgG抗体水平的变化,评估不同来源和不同剂量抗原的抗体滴度水平和持续时间,希望将有助于疫苗、药物以及病原检测等相关研究。通过SDS-PAGE和质谱技术鉴定出昆虫和哺乳动物细胞表达系统制备的bRBD和hRBD蛋白质的分子量略有差异,主要为糖基化修饰不同所致;流式细胞术检测发现,bRBD和hRBD与ACE2受体过表达细胞结合率分别为88.5%和92.7%,表明二者均具有较好的活性;利用Quick Antibody免疫佐剂通过肌肉注射对Balb/c小鼠进行免疫接种,设置10μg、20μg 2个免疫抗原的剂量,共接种2次,并在初次免疫后第2、4、6、8、12、24周从尾部取血,分离获得血清;酶联免疫吸附结果显示,10μg和20μg的bRBD和hRBD蛋白质免疫均能够快速引起小鼠的免疫反应产生IgG抗体,4~6周抗体滴度达到峰值;2种抗原均具有良好的免疫持久性。2种抗原及2个免疫剂量诱导小鼠产生的抗体滴度无明显差异;血清抗体中和试验发现,bRBD和hRBD蛋白质免疫小鼠后产生的特异性抗体,均能够抑制SARS-COV-2 Spike假病毒对ACE2阳性细胞的感染。这些结果表明,昆虫细胞和哺乳动物细胞表达系统生产的RBD蛋白,通过良好的佐剂接种均能快速引起机体有效的体液免疫应答,产生特异性中和抗体,有望用于各种RBD突变体抗体的制备。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 刺突蛋白 受体结合区蛋白 抗体 疫苗
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新型冠状病毒特异性纳米抗体的筛选和鉴定 被引量:3
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作者 史震中 徐晓驰 +1 位作者 吴文惠 许剑锋 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期720-725,共6页
目的通过噬菌体展示技术,从骆驼外周血中筛选针对SARS-CoV-2 RBD结构域的特异性纳米抗体,并对纳米抗体的亲和力、结合表位和中和活性进行评估。方法利用重组RBD免疫骆驼,从骆驼外周血中分离淋巴细胞,提取RNA并逆转录为cDNA,接着通过巢式... 目的通过噬菌体展示技术,从骆驼外周血中筛选针对SARS-CoV-2 RBD结构域的特异性纳米抗体,并对纳米抗体的亲和力、结合表位和中和活性进行评估。方法利用重组RBD免疫骆驼,从骆驼外周血中分离淋巴细胞,提取RNA并逆转录为cDNA,接着通过巢式PCR扩增VHH基因,电转化至pMECS噬菌粒载体中,构建噬菌体展示抗体库并进行免疫淘选,鉴定可以与RBD特异性结合的纳米抗体。分别利用Octet Red96e和HPLC测定纳米抗体与重组RBD的亲和力和结合表位,通过SARS-CoV-2假病毒中和实验测定纳米抗体的中和活性。结果从外周血淋巴细胞中成功扩增出VHH基因,构建的噬菌体展示抗体库库容为1.33×10^(8) CFU/ml;经过2轮免疫淘选,鉴定出2株特异性纳米抗体——NB2D11和NB4E9,K_(D)值分别为2.21和0.31 nmol/L;NB2D11和NB4E9具有非竞争性的结合表位,中和SARS-CoV-2假病毒的IC_(50)值分别为340.7和35.5 nmol/L。结论筛选到的2株高亲和力特异性纳米抗体可以有效地地阻断SARS-CoV-2假病毒与ACE2的结合,为COVID-19的诊断和治疗奠定了基础。 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 RBD 噬菌体展示技术 纳米抗体
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新冠病毒S蛋白RBD突变侵染性增强潜在分子作用机制 被引量:3
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作者 刘巨钊 杨玉萍 +4 位作者 徐建波 吕鸿昌 陈俊宇 张春椿 崔琦 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期35-40,共6页
新冠病毒(SARS-CoV-2)出现越来越多侵染性更强的突变体,比较有代表性的毒株是B.1.351和B.1.617,它们的共同特点是在S蛋白484号位点有氨基酸突变。484号位点是一个与hACE2上的残基K31相互作用的位点。从分子动力学和蛋白质对接的角度入手... 新冠病毒(SARS-CoV-2)出现越来越多侵染性更强的突变体,比较有代表性的毒株是B.1.351和B.1.617,它们的共同特点是在S蛋白484号位点有氨基酸突变。484号位点是一个与hACE2上的残基K31相互作用的位点。从分子动力学和蛋白质对接的角度入手,通过研究新冠病毒的E484K和E484Q突变,发现与hACE2直接作用的氨基酸残基(A475、N487)间的氢键键长缩短。动力学结果表明,475~489这段氨基酸序列具有高度的活跃性,是一个不应该被忽略的药物设计靶点。可以为开发新冠病毒抑制剂提供新靶点,一定程度上预测新冠病毒未来进化方向,同时也为类似的冠状病毒的突变研究提供新思路。 展开更多
关键词 新冠病毒 S蛋白 RBD hACE2 分子动力学模拟
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