基于生物信息学预测LINC00511结合E2F1激活RCOR2促进乳腺癌的恶性进展

目的 基于生物信息学分析LINC00511在乳腺癌和癌旁正常组织中的表达差异,根据三联体结构理论探索其在乳腺癌恶性进展中的作用机制。方法 通过TCGA数据库中的乳腺癌转录组表达量差异分析以及既往的文献确定研究对象LINC00511。采用lncMAP数据库对目标lncRNA(long non-coding RNA)下游转录因子进行预测。将预测结果与差异mRNA基因取交集并经相关性分析选取显著正相关的转录因子E2F1作为研究对象。采用RPISeq数据库评估lncRNA与转录因子相互作用可能性,最终选取与转录因子E2F1显著正相关的差异基因RCOR2作为靶基因。最后,利用JASPAR数据库预测靶基因启动子区域与转录因子的结合序列。结果 LINC00511在乳腺癌组织中显著高表达,基于生物信息学预测LINC00511可能是通过与转录因子E2F1结合后激活靶基因RCOR2发挥作用,E2F1与RCORC2的结合序列AGGGCGGGAAG。结论 LINC00511-E2F1-RCOR2形成的三联体结构促进乳腺癌的恶性进展,可作为乳腺癌一个潜在的用于诊断及预后评估的分子生物学标志物。