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广东省结核分枝杆菌MIRU和RD105缺失基因分型研究 被引量:1
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作者 黄新春 魏文静 +8 位作者 李海成 赵皎 郭卉欣 巫株华 黎贞燕 孙琦 张晨晨 陈涛 周琳 《广东医学》 CAS 北大核心 2017年第12期1827-1832,共6页
目的了解广东省结核分枝杆菌(MTB)随时间、地区的动态流行分布特点。方法应用24位点MTB散在分布重复单位(MIRU)分析广东省2013年455例MTB,筛选适合广东省分型的最佳MIRU组合,然后应用该最佳MIRU组合分析广东省2009年的173例、2013年的45... 目的了解广东省结核分枝杆菌(MTB)随时间、地区的动态流行分布特点。方法应用24位点MTB散在分布重复单位(MIRU)分析广东省2013年455例MTB,筛选适合广东省分型的最佳MIRU组合,然后应用该最佳MIRU组合分析广东省2009年的173例、2013年的455例及2015年的225例MTB,此外,结合RD105缺失基因法鉴定这些菌株中的北京家族菌株,比例法进行药物敏感性试验(DST),聚类分析采用Bio Numerics(7.6)。结果 2015年北京家族菌株比率(70.2%)高于2009年(59.5%)和2013年(59.3%),其中,中部地区比率最高(71.3%),东部地区最低(55.0%)。MIRU-24位点的多态性存在差异,MIRU-12(HGI=0.999 1)能达到MIRU-15(HGI=0.999 2)相近的分辨率,MIRU-8分辨率较好(HGI=0.998 5)。853例MTB的系统发生树(MST)主要包括1个北京家族和2个非北京家族复合群,可分为Ⅰ、Ⅱ两群,广东省MTB的主要流行群是Ⅱ群,Ⅰ群中2009、2013年菌株比率高于2015年,东部地区菌株比率高(43.069%),中部地区低(27.206%),Ⅱ群则与之相反,北京家族菌株的MST主要包括1个复合群,包含407个独特型和46个簇。非北京家族菌株的MST主要包括2个复合群,包含309个独特型和6个簇。另外,广东省不同年份多药耐药(MDR)(χ~2=2.176,P=0.337)和广泛耐药(XDR)(χ~2=1.468,P=0.480)耐药率差异无统计学意义(P>0.05)。结论北京家族菌株是广东省的主要流行株,且随时间存在上升趋势,中部地区比率最高,该省MDR和XDR耐药趋势相对稳定,MIRU分型用于广东省MTB的分子流行病学研究可取得满意结果。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 rd105缺失 多位点数目可变串联重复序列分析
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一种鉴定结核分枝杆菌“北京家族”菌株的新方法 被引量:22
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作者 刘敬华 Christine +3 位作者 Pourel Yolande Hauck 赵秀芹 刘志广 万康林 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期172-175,共4页
目的研究结核分枝杆菌“北京家族”菌株鉴定的新方法——RD105缺失检测的可行性。方法分别应用间隙寡核苷酸分型(Spoligotyping)和RD105缺失检测两种方法对结核分枝杆菌进行“北京家族”的鉴定,比较分析两种方法进行菌株鉴定结果的... 目的研究结核分枝杆菌“北京家族”菌株鉴定的新方法——RD105缺失检测的可行性。方法分别应用间隙寡核苷酸分型(Spoligotyping)和RD105缺失检测两种方法对结核分枝杆菌进行“北京家族”的鉴定,比较分析两种方法进行菌株鉴定结果的差异。结果共对来自北京、福建、新疆和吉林的342株结核分枝杆菌临床分离菌株进行了鉴定,“北京家族”菌株261株,占76.32%。非“北京家族”菌株81株,占23.68%。两种方法鉴定结果的符合度达100%。结论简单、快速的新方法——RD105缺失检测可替代原始经典方法Spoligotyping用于结核分枝杆菌“北京家族”菌株的鉴定。 展开更多
关键词 北京家族 间隙寡核苷酸分型 长片段序列多态性 rd105缺失
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