广东省结核分枝杆菌MIRU和RD105缺失基因分型研究

目的了解广东省结核分枝杆菌(MTB)随时间、地区的动态流行分布特点。方法应用24位点MTB散在分布重复单位(MIRU)分析广东省2013年455例MTB,筛选适合广东省分型的最佳MIRU组合,然后应用该最佳MIRU组合分析广东省2009年的173例、2013年的455例及2015年的225例MTB,此外,结合RD105缺失基因法鉴定这些菌株中的北京家族菌株,比例法进行药物敏感性试验(DST),聚类分析采用Bio Numerics(7.6)。结果 2015年北京家族菌株比率(70.2%)高于2009年(59.5%)和2013年(59.3%),其中,中部地区比率最高(71.3%),东部地区最低(55.0%)。MIRU-24位点的多态性存在差异,MIRU-12(HGI=0.999 1)能达到MIRU-15(HGI=0.999 2)相近的分辨率,MIRU-8分辨率较好(HGI=0.998 5)。853例MTB的系统发生树(MST)主要包括1个北京家族和2个非北京家族复合群,可分为Ⅰ、Ⅱ两群,广东省MTB的主要流行群是Ⅱ群,Ⅰ群中2009、2013年菌株比率高于2015年,东部地区菌株比率高(43.069%),中部地区低(27.206%),Ⅱ群则与之相反,北京家族菌株的MST主要包括1个复合群,包含407个独特型和46个簇。非北京家族菌株的MST主要包括2个复合群,包含309个独特型和6个簇。另外,广东省不同年份多药耐药(MDR)(χ~2=2.176,P=0.337)和广泛耐药(XDR)(χ~2=1.468,P=0.480)耐药率差异无统计学意义(P>0.05)。结论北京家族菌株是广东省的主要流行株,且随时间存在上升趋势,中部地区比率最高,该省MDR和XDR耐药趋势相对稳定,MIRU分型用于广东省MTB的分子流行病学研究可取得满意结果。

一种鉴定结核分枝杆菌“北京家族”菌株的新方法

目的研究结核分枝杆菌“北京家族”菌株鉴定的新方法——RD105缺失检测的可行性。方法分别应用间隙寡核苷酸分型（Spoligotyping）和RD105缺失检测两种方法对结核分枝杆菌进行“北京家族”的鉴定，比较分析两种方法进行菌株鉴定结果的差异。结果共对来自北京、福建、新疆和吉林的342株结核分枝杆菌临床分离菌株进行了鉴定，“北京家族”菌株261株，占76．32％。非“北京家族”菌株81株，占23．68％。两种方法鉴定结果的符合度达100％。结论简单、快速的新方法——RD105缺失检测可替代原始经典方法Spoligotyping用于结核分枝杆菌“北京家族”菌株的鉴定。