ABB全新保护测控产品家族Relion~为智能电网打基石

创新是ABB长期位居全球电力和自动化技术领导地位的最主要因素。近年来,在中国这个快速发展的全球第三大经济体和最具活力的市场里。

面向GPU的单颗粒冷冻电镜软件RELION并行与优化

单颗粒冷冻电镜是结构生物学研究的重要手段之一,基于贝叶斯理论的冷冻电镜3维图像数据处理软件RELION(regularized likelihood optimization)具有很好的性能和易用性,受到广泛关注.然而其计算需求极大,限制了RELION的应用.针对RELION算法的特点,研究了基于GPU的并行优化问题.首先全面分析了RELION的原理、RELION程序的算法结构及性能瓶颈;在此基础上,针对GPU细粒度体系结构对程序进行优化设计,提出了基于GPU的多级并型模型.为了获得良好的性能,对RELION的数据结构进行重组.为了避免GPU存储空间不足的问题,设计了自适应并行框架.实验结果表明:基于GPU的RELION实现可以获得良好的性能,相比于单CPU,整个应用的加速比超过36倍,计算密集型算法的加速比达到75倍以上.在多GPU上的测试结果表明基于GPU的RELION具有很好的可扩展性.

Accelerating the cryo-EM structure determination in RELION on GPU cluster

The cryo-electron microscopy(cryo-EM)is one of the most powerful technologies available today for structural biology.The RELION(Regularized Likelihood Optimization)implements a Bayesian algorithm for cryo-EM structure determination,which is one of the most widely used software in this field.Many researchers have devoted effort to improve the performance of RELION to satisfy the analysis for the ever-increasing volume of datasets.In this paper,we focus on performance analysis of the most time-consuming computation steps in RELION and identify their performance bottlenecks for specific optimizations.We propose several performance optimization strategies to improve the overall performance of RELION,including optimization of expectation step,parallelization of maximization step,accelerating the computation of symmetries,and memory affinity optimization.The experiment results show that our proposed optimizations achieve significant speedups of RELION across representative datasets.In addition,we perform roofline model analysis to understand the effectiveness of our optimizations.

从洲际输电网到配电的全面智能终端方案——访厦门ABB输配电自动化设备有限公司总经理董君伟先生

世界对电能需求巨大，每年耗电数万亿千瓦时，随着更多国家实行工业化，这一数字还会继续攀升。电力在现代社会各方面起着重大的作用，没有电力的支持，社会生活和生产根本就无法正常进行。基于电力在现代社会中的重要性，对电力的维护就显得格外重要。

近二十年来道教的宗教历史渊源问题研究述要

近二十年来,学术界关于道教的宗教历史渊源问题研究,所取得的成果主要集中体现在,上古宗教和巫文化传统、古巴蜀地区民间信仰和巫术、战国秦汉时期的方仙信仰以及盛行于两汉的谶纬思潮对道教形成的直接影响等关系层面之揭橥和考释。文章旨在对此诸关系层面一一作出介绍,并适当穿插自己的看法和评论。