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RELN信号通路基因与基于聚类分析模型的孤独症语言发育的关系
被引量:
1
1
作者
沈屹东
董慧茜
+2 位作者
赵靖平
夏昆
欧建君
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第7期858-864,共7页
目的:孤独症是一种病因未明的神经发育性疾病,患者临床异质性过高是目前孤独症病因研究面临的主要问题之一。本研究根据儿童孤独症患者语言发育情况建立分类模型,利用其降低异质性,探讨孤独症患者语言发育与RELN信号通路基因(RELN、VLDL...
目的:孤独症是一种病因未明的神经发育性疾病,患者临床异质性过高是目前孤独症病因研究面临的主要问题之一。本研究根据儿童孤独症患者语言发育情况建立分类模型,利用其降低异质性,探讨孤独症患者语言发育与RELN信号通路基因(RELN、VLDLR、LRP8、DAB1、CDK5、FYN)单核苷酸多态性的关系。方法:本研究病例组儿童招募自湖南、山东、河南三省共5个医疗及自闭症培训机构,依据招募先后分为两部分(第1部分为训练样本,招募时间为2006年10月至2011年5月,第2部分为验证样本,招募时间为2011年7月至2012年5月)。将孤独症患者语言发育进程里程碑指标中“能够说第1个字的年龄”(X_(1))和“从能够说第1个字到第1个词组之间的时间”(X_(2))作为参数,应用两步聚类法对训练样本的374例孤独症患者进行聚类分析,根据聚类结果建立Bayes判别方程,而后使用该方程对验证样本的310例孤独症患者进行语言发育亚组划分,分析RELN通路上相关基因单核苷酸多态性与各亚组之间的关系。结果:聚类分析将第1部分374例样本分为3类,第1类患者X_(1)为(11.83±4.37)个月,X_(2)为(24.55±8.67)个月;第2类患者X_(1)为(12.17±3.46)个月,X_(2)为(7.07±3.79)个月;第3类患者X_(1)为(30.94±7.60)个月,X_(2)为(4.73±4.80)个月。依据聚类结果建立相应的判别方程:Y_(A)=−14.442+0.525X_(1)+0.810X_(2);Y_(B)=−4.964+0.477X_(1)+0.264X_(2);Y_(C)=−19.843+1.175X_(1)+0.241X_(2)。交叉核实法显示方程误判概率为3.8%。在对验证样本进行亚组划分前,纳入分析的341个单核苷酸多态性位点等位基因频率均未通过校正后的检验水准(P>2.44×10^(−5));而亚组划分后,第2类患者LRP8基因rs1288502位点等位基因频率在病例组与对照组间差异有统计学意义(P=6.45×10^(−6))。结论:通过孤独症患者语言发育情况建立的判别方程在分析RELN信号通路基因与孤独症的关系时有助于降低样本异质性,且RELN信号通路相关基因中LRP8基因与孤独症患者特定类型的语言发育相关。
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关键词
孤独症
reln信号通路
聚类分析
判别分析
单核苷酸多态性
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职称材料
题名
RELN信号通路基因与基于聚类分析模型的孤独症语言发育的关系
被引量:
1
1
作者
沈屹东
董慧茜
赵靖平
夏昆
欧建君
机构
国家精神心理疾病临床研究中心
中南大学湘雅医院心理卫生中心
中南大学医学遗传学研究中心
出处
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第7期858-864,共7页
基金
国家重点基础研究发展计划(2012CB517901)
湖南省自然科学基金(2020JJ5830)。
文摘
目的:孤独症是一种病因未明的神经发育性疾病,患者临床异质性过高是目前孤独症病因研究面临的主要问题之一。本研究根据儿童孤独症患者语言发育情况建立分类模型,利用其降低异质性,探讨孤独症患者语言发育与RELN信号通路基因(RELN、VLDLR、LRP8、DAB1、CDK5、FYN)单核苷酸多态性的关系。方法:本研究病例组儿童招募自湖南、山东、河南三省共5个医疗及自闭症培训机构,依据招募先后分为两部分(第1部分为训练样本,招募时间为2006年10月至2011年5月,第2部分为验证样本,招募时间为2011年7月至2012年5月)。将孤独症患者语言发育进程里程碑指标中“能够说第1个字的年龄”(X_(1))和“从能够说第1个字到第1个词组之间的时间”(X_(2))作为参数,应用两步聚类法对训练样本的374例孤独症患者进行聚类分析,根据聚类结果建立Bayes判别方程,而后使用该方程对验证样本的310例孤独症患者进行语言发育亚组划分,分析RELN通路上相关基因单核苷酸多态性与各亚组之间的关系。结果:聚类分析将第1部分374例样本分为3类,第1类患者X_(1)为(11.83±4.37)个月,X_(2)为(24.55±8.67)个月;第2类患者X_(1)为(12.17±3.46)个月,X_(2)为(7.07±3.79)个月;第3类患者X_(1)为(30.94±7.60)个月,X_(2)为(4.73±4.80)个月。依据聚类结果建立相应的判别方程:Y_(A)=−14.442+0.525X_(1)+0.810X_(2);Y_(B)=−4.964+0.477X_(1)+0.264X_(2);Y_(C)=−19.843+1.175X_(1)+0.241X_(2)。交叉核实法显示方程误判概率为3.8%。在对验证样本进行亚组划分前,纳入分析的341个单核苷酸多态性位点等位基因频率均未通过校正后的检验水准(P>2.44×10^(−5));而亚组划分后,第2类患者LRP8基因rs1288502位点等位基因频率在病例组与对照组间差异有统计学意义(P=6.45×10^(−6))。结论:通过孤独症患者语言发育情况建立的判别方程在分析RELN信号通路基因与孤独症的关系时有助于降低样本异质性,且RELN信号通路相关基因中LRP8基因与孤独症患者特定类型的语言发育相关。
关键词
孤独症
reln信号通路
聚类分析
判别分析
单核苷酸多态性
Keywords
autism
reln
signaling pathway
cluster analysis
discrimination analysis
singlenucleotide polymorphism
分类号
R749.94 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
RELN信号通路基因与基于聚类分析模型的孤独症语言发育的关系
沈屹东
董慧茜
赵靖平
夏昆
欧建君
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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职称材料
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