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Analysis of the Phenotype and the Restriction Enzyme Mapping Level of Mutations Induced by the New Mutagen Glycidyl Methacrylate 被引量:5
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作者 XIE DA-YING GAO HUI-LAN +4 位作者 ZUO JIN ZHANG WEI LI ZHONG-SHENG YANG HUI-FANG FANG FU-DE 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 1990年第2期146-155,共10页
Glycidyl methaerylate (GMA) is a recently recognized chemical mutagen. In order to explore the mutagenicity and mutagenic process of GMA, plasmid pBR322 was used for in vitro binding, mutant screening, and restriction... Glycidyl methaerylate (GMA) is a recently recognized chemical mutagen. In order to explore the mutagenicity and mutagenic process of GMA, plasmid pBR322 was used for in vitro binding, mutant screening, and restriction enzyme mapping. The binding between GMA and DNA in vitro has been verified by means of a spectrophotometric method. When pBR322 and GMAbound pBR322 were used to transform Eschenchia coli HB101, the following results were obtained: (1) The transformation efficiency of GMA-bound pBR322 was much lower than that of pBR322 alone. (2) GMA-bound pBR322 induced phenotype changes in competent cells (i.e., tetracycline-resistance inactivation or ampicillin-resistance inactivation). There were two mutants of pBR322, Ap~RTc~S and Ap~STc~R, in the transformants and a deductive mutant Ap~STc~S in the nontranstormants. (3) All of the selected mutants were stable and heritable. (4) When restriction enzyme maps were used to analyze the mutant Ap~RTc~S, four of seven maps were changed. some sites were shifted to other resistant gene regions, for example, sites of Bgll, EcoRl, Ilindlll. Hinclll, etc., and there was a new recognition site for Hindi (252). We did not observe any DNA fragment insertion or deletion on any maps. Our results suggest that when GMA is covalently linked to the plasmid DNA, it gives rise to a premutagenic lesion of DNA that is converted in vivo into a point mutation. (C)1990 Academic Press, Inc. 展开更多
关键词 analysis of the Phenotype and the restriction Enzyme mapping Level of Mutations Induced by the New Mutagen Glycidyl Methacrylate
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水稻籼粳特异性RFLP标记及广亲和品种亲缘关系分析 被引量:25
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作者 钱惠荣 沈波 +3 位作者 林鸿宣 陆军 庄杰云 郑康乐 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 1994年第2期65-71,共7页
应用160个RFLP标记分析了21个水稻广亲和品种和6个籼粳测验种.发现其中68个标记对以区分籼粳测验种。21个广亲和品种根据与籼粳测验种共有片段比率的大小可以分为籼、粳和籼粳中间型三类。68个标记在15个籼粳品种中... 应用160个RFLP标记分析了21个水稻广亲和品种和6个籼粳测验种.发现其中68个标记对以区分籼粳测验种。21个广亲和品种根据与籼粳测验种共有片段比率的大小可以分为籼、粳和籼粳中间型三类。68个标记在15个籼粳品种中进一步筛选,得到24个籼粳特异性RFLP标记,它们在亚种内杂文带型相同而亚种间则不一样。其中RG358,G318为籼稻专一性探针,在粳稻中发现为零等位。以此24个探针为基础构建了广亲和品种亲缘关系的树状图。讨论了籼粳特异性RFLP标记在水稻遗传育种实践中的应用。 展开更多
关键词 籼粳特异性 亲缘关系 亲和性 水稻
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应用PCR-RFLP和芯片生物分析系统鉴别河豚鱼品种 被引量:8
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作者 陈双雅 陈文炳 +3 位作者 张津 陈伟玲 徐敦明 周昱 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第22期200-202,共3页
应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态分析和芯片生物分析系统建立5种河豚的分子生物学品种鉴定新方法。首先提取鱼的DNA进行细胞色素b基因的PCR扩增,然后用DdeⅠ、HaeⅢ和NlaⅢ三种限制性内切酶进行酶切,在Agilent DNA1000芯片上对... 应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态分析和芯片生物分析系统建立5种河豚的分子生物学品种鉴定新方法。首先提取鱼的DNA进行细胞色素b基因的PCR扩增,然后用DdeⅠ、HaeⅢ和NlaⅢ三种限制性内切酶进行酶切,在Agilent DNA1000芯片上对酶切片段进行分离。该方法可成功区分5个河豚鱼品种,是一种快速、简便、有效的鱼类品种鉴定分析手段。 展开更多
关键词 河豚 PCR-rflp 芯片生物分析系统 品种鉴定
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16S rDNA-RFLP法快速鉴定蒙古国传统乳制品中的乳酸菌 被引量:6
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作者 艾日登才次克 于洁 +4 位作者 杜晓华 李莉 王炜宏 孙天松 张和平 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2009年第2期63-68,共6页
以17株标准菌株为参照,采用限制性片段长度多态性(RFLP)分析和16S rDNA序列分析相结合的技术,对分离自蒙古国5个地区传统乳制品中的55株乳酸菌进行了快速鉴定。结果表明,通过限制性内切酶AluⅠ、HaeⅢ、BsmaⅠ、TspRⅠ和HinfⅠ的指纹图... 以17株标准菌株为参照,采用限制性片段长度多态性(RFLP)分析和16S rDNA序列分析相结合的技术,对分离自蒙古国5个地区传统乳制品中的55株乳酸菌进行了快速鉴定。结果表明,通过限制性内切酶AluⅠ、HaeⅢ、BsmaⅠ、TspRⅠ和HinfⅠ的指纹图谱分析,将49株乳杆菌和2株片球菌准确鉴定到种,其他4株肠球菌鉴定到属。采用16S rDNA-RFLP方法鉴定乳酸菌具有准确性,可靠性和高效性。 展开更多
关键词 乳酸菌 快速鉴定 限制性片段长度多态性(rflp) 16S RDNA序列分析
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4种笛鲷属鱼类mtDNA的RFLP研究 被引量:5
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作者 肖翔 刘楚吾 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期22-30,共9页
用RFLP(限制性片段长度多态性,Restriction fragment length polymorphism)技术研究了红鳍笛鲷Lutjanus erythropterus Bloch、紫红笛鲷Lutjanus argentimaculatus Forskal、勒氏笛鲷Lutja-nus russelli Bleeker和约氏笛鲷Lutjanus john... 用RFLP(限制性片段长度多态性,Restriction fragment length polymorphism)技术研究了红鳍笛鲷Lutjanus erythropterus Bloch、紫红笛鲷Lutjanus argentimaculatus Forskal、勒氏笛鲷Lutja-nus russelli Bleeker和约氏笛鲷Lutjanus johni Bloch的遗传多样性关系,检测到4种笛鲷的分子标记。通过差速离心、核酸酶消化、苯酚抽提,从4种笛鲷肝脏组织中分离纯化线粒体DNA(mtDNA),用19种5到6碱基对的限制性内切酶进行单酶、双酶和部分酶切,琼脂糖凝胶电泳,进行了RFLP分析,构建了4种笛鲷mtDNA的物理图谱。红鳍笛鲷、紫红笛鲷、勒氏笛鲷和约氏笛鲷的mtDNA大小分别为17.36±0.09kb、17.58±0.08kb、17.50±0.18kb和17.56±0.12kb。红鳍笛鲷和紫红笛鲷种群间平均mtDNA多态度π为0.106 2,红鳍笛鲷和勒氏笛鲷群体间平均mtDNA多态度π为0.130 5,红鳍笛鲷和约氏笛鲷群体间平均mtDNA多态度π为0.151 5,紫红笛鲷和勒氏笛鲷群体间平均mtD-NA多态度π为0.130 3,紫红笛鲷和约氏笛鲷群体间平均mtDNA多态度π为0.119 5,勒氏笛鲷和约氏笛鲷群体间平均mtDNA多态度π为0.139 4。红鳍笛鲷和紫红笛鲷种群间净遗传距离Pnet为0.102 0,红鳍笛鲷和勒氏笛鲷群体间净遗传距离Pnet为0.128 5,红鳍笛鲷和约氏笛鲷群体间净遗传距离Pnet为0.149 1,紫红笛鲷和勒氏笛鲷群体间净遗传距离Pnet为0.127 0,紫红笛鲷和约氏笛鲷群体间净遗传距离Pnet为0.115 7,勒氏笛鲷和约氏笛鲷群体间净遗传距离Pnet为0.137 8。 展开更多
关键词 笛鲷属Lutjanus 线粒体DNA物理图谱 限制性片段长度多态性
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玉米DNA限制性片段长度多态(RFLPs)的研究 被引量:2
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作者 季良越 罗福和 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 1993年第2期120-126,共7页
文章简要介绍了10余年来有关玉米DNA限制性片段长度多态(RFLPs)的研究,说明RFLP的分析原理和特点,构建玉米RFLP连锁图的方法,以及玉米RFLPs在遗传育种中的主要应用。
关键词 杂交 数量性状 遗传 玉米
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RFLP在作物育种中的应用 被引量:3
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作者 沈革志 《上海农业学报》 CSCD 1992年第2期91-96,共6页
RFLP分析是一门新兴的分子生物学技术。在构建RFLP遗传图和确立RFLP标记与性状连锁关系的基础上,RFLP分析可作为一种有效的工具,应用于遗传研究和育种实践。
关键词 rflp 作物 育种
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肝豆状核变性RFLP连锁分析的建立及症状前诊断和杂合子检出的研究 被引量:5
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作者 徐评议 梁秀龄 +1 位作者 刘焯霖 潘锡榜 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1994年第6期325-328,共4页
RB1基因位于DI3q14-21,与Wilson氏病基因紧密连锁,遗传距离为4.4cm(centimorgan),其3'端第17号内含子中p68RS2.0标记的等位片段与白种人相同,但基因频率存在差异,杂合子频率为4... RB1基因位于DI3q14-21,与Wilson氏病基因紧密连锁,遗传距离为4.4cm(centimorgan),其3'端第17号内含子中p68RS2.0标记的等位片段与白种人相同,但基因频率存在差异,杂合子频率为43%。应用该标记对11个WD家系进行RFLP连锁分析,检出3名症状前患者,11名杂合子及3名正常纯合子,证实p68RS2.0标记可用于Wilson氏病的症状前诊断及杂合子筛选。 展开更多
关键词 肝豆状核变性 多态性 连锁分析 限制性片段长度 基因 诊断
全文增补中
T-RFLP技术在厌氧氨氧化菌群结构分析中的应用 被引量:4
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作者 储昭瑞 李相昆 +1 位作者 孟令威 张杰 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第2期26-30,共5页
为实现对样品中厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析,提出一种基于末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP)分析环境样品中厌氧氨氧化菌群结构的方法.通过对SILVA(R108)SSU Ref数据库中已知厌氧氨氧化菌16S rD-NA序列的模拟PCR和酶切分析,选... 为实现对样品中厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析,提出一种基于末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP)分析环境样品中厌氧氨氧化菌群结构的方法.通过对SILVA(R108)SSU Ref数据库中已知厌氧氨氧化菌16S rD-NA序列的模拟PCR和酶切分析,选取合适的PCR引物(Amx368f-Amx820r)和限制性内切酶(MspI和RsaI),使得不同厌氧氨氧化菌属对应不同末端片段长度(T-RFs),从而完成对厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析.重复性和灵敏性检验结果表明,该方法能够有效、稳定地应用于环境样品中厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析. 展开更多
关键词 厌氧氨氧化 末端限制性片段长度多态性技术 菌群结构分析 模拟聚合酶链式反应 环境样品
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Analysis of bulked segregants to identify molecular markers linked with cocoon weight and cocoon shell weight in the silkworm Bombyx mori L
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作者 SateeshKumar 徐孟奎 +2 位作者 陈玉银 Ponnuvel,K.M Datta,R.K 《Journal of Zhejiang University Science》 CSCD 2002年第3期348-354,共7页
Two silkworm strains viz, B20 A (high cocoon shell ratio) and C.Nichi (low cocoon shell ratio) were sib mated for 10 generations to determine the homozygosis. Both bulked segregant analysis(BSA) and near isogenic line... Two silkworm strains viz, B20 A (high cocoon shell ratio) and C.Nichi (low cocoon shell ratio) were sib mated for 10 generations to determine the homozygosis. Both bulked segregant analysis(BSA) and near isogenic lines (NIL) studies were done to identify the RFLP markers closely linked to cocoon shell parameters. Three hundred and fifty two random clones were identified as the low copy number sequence and used for identification of Restriction Fragment Length Polymorphic (RFLP) marker linked to cocoon weight and cocoon shell character. In the bulk segregant analysis, DNA from the parents (B20 A, C.Nichi), F 1 and F 2 progeny of high shell ratio (HSR) and low shell ratio (LSR) were screened for hybridization with the random clones. Polymorphic banding pattern achieved through southern hybridization with different probes indicated the probable correlation of polymorphism with high and low cocoon shell character which are possible landmarks in identifying the putative marker(s) for the cocoon shell character. Out of the 100 probes tried with parents, F 1, F 2 and their bulks, 10 probes were found to be closely linked to cocoon shell characters. 展开更多
关键词 restriction fragment length polymorphic (rflp) Molecular marker Bombyx mori L Shell ratio Bulked segregant analysis(BSA) Near isogenic lines
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功能作图的混合效应模型开发
11
作者 王子健 叶梅霞 +1 位作者 张涵 邬荣领 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期163-172,共10页
【目的】以大肠杆菌菌株丰度和功能作图模型为研究基础,通过在功能作图模型中引入群体的固定效应和个体间亲缘关系造成的随机效应,探究混合效应对功能作图模型性能的影响。【方法】本研究在功能定位框架基础上,使用大肠杆菌动态培养的... 【目的】以大肠杆菌菌株丰度和功能作图模型为研究基础,通过在功能作图模型中引入群体的固定效应和个体间亲缘关系造成的随机效应,探究混合效应对功能作图模型性能的影响。【方法】本研究在功能定位框架基础上,使用大肠杆菌动态培养的生长数据作为实际案例,将亚群和SNP基因型作为固定效应的来源,将固定效应因素融入定位模型,提出了Q矩阵模型的扩展;在保留使用方差–协方差模型对随机残差建模的前提下,使用Legendre模型对随机效应建模,开展了固定效应加一般性的随机效应的混合效应模型分析(模型1);利用限制性似然估计的方法推导其方差–协方差参数、随机效应和固定效应,开展了固定效应和亲缘关系造成随机效应的混合模型(模型2)分析;利用Zwald检验法推导各标记位点p值的计算方法。【结果】(1)2种模型中,95%的标记呈现出p值与期望值相吻合的特点,p值分布在QQ图中的上翘结果满意。(2)模型2相比模型1检测到了更多的SNP位点,表明模型2对亲缘关系造成的随机效应解释性更强。(3)计算机模拟结果显示:样本量较小、遗传力较低时,模型假阳性率为4.77%;当样本量为800,遗传力为1%时,模型对QTL的发现率可超过70%;或当样本量为400,遗传力超过1.5%时,QTL发现率也可超过70%。【结论】本研究提出的在功能作图模型中引入固定效应和亲缘关系造成的随机效应的混合模型的方法较好地完善了功能定位理论,对固定效应中的协变量因素具有较好的校正功能,可有效剖分随机效应与剩余残差;为后续完善功能定位,开发固定效应加亲缘关系(Q+K)模型的软件包奠定了良好基础。 展开更多
关键词 功能作图 关联分析 混合效应 限制性最大似然估计 数量性状位点
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中国4个弓形虫虫株GRA6基因的比较分析 被引量:20
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作者 谢德华 翁亚彪 +4 位作者 李华文 郑唤钦 林瑞庆 张德林 朱兴全 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期1495-1500,共6页
通过对国内来源于不同宿主的ZS人株、SH人株、CN猪株、QH绵羊株4个弓形虫虫株,以及国际标准强毒株RH株的致密颗粒抗原(GRA6)基因进行PCR-RFLP分析,首次对中国弓形虫虫株进行了基因分型研究,旨在了解中国弓形虫基因型的分布情况,从而为... 通过对国内来源于不同宿主的ZS人株、SH人株、CN猪株、QH绵羊株4个弓形虫虫株,以及国际标准强毒株RH株的致密颗粒抗原(GRA6)基因进行PCR-RFLP分析,首次对中国弓形虫虫株进行了基因分型研究,旨在了解中国弓形虫基因型的分布情况,从而为进一步的分子遗传学研究以及弓形虫病的防制提供资料。PCR-RFLP分析显示两种带型:RH、SH、CN3株弓形虫为一种带型,QH和ZS2株弓形虫为另一种电泳带型。GRA6序列分析结果显示:RH、SH、CN3株弓形虫的GRA6基因序列上的MseΙ酶切位点与国外报道的RH株一致,同属于基因型Ι,为强毒株;QH和ZS2株弓形虫的MseΙ酶切位点与国外报道的弱毒株BEVERLEY株和ME49株一致,同属于基因型Ⅱ,与PCR-RFLP分析结果一致。除MseΙ酶切位点外,中国的几个虫株GRA6序列与GenBankTM注册的RH株及BEVERLEY和ME49两个弱毒株有个别碱基的差异。结果证明中国人源弓形虫包含了Ι、Ⅱ两种基因型,而动物源性弓形虫则因宿主和来源地不同亦有Ι、Ⅱ两个基因型。 展开更多
关键词 虫株 比较分析 rflp分析 酶切位点 分析结果 基因型 遗传学研究 PCR MSe 致密颗粒 国际标准 基因分型 分布情况 弓形虫病 基因序列 强毒株 弱毒株 H株 带型 中国人 来源地 动物源 宿主 RH 显示 国外 绵羊 抗原
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胡子鲇mtDNA多态性及限制性酶切图谱 被引量:7
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作者 戴建华 殷文莉 +1 位作者 杨代淑 熊全沫 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第2期144-149,共6页
用8种限制性内切酶对胡子鲇(ClariasfuscusLacepede)肝脏线粒体DNA(MitochondrialDNA,mtDNA)进行了分析。XhoⅠ、EcoRⅠ、PstⅠ、BamHⅠ、XbaⅠ、HindⅢ在m... 用8种限制性内切酶对胡子鲇(ClariasfuscusLacepede)肝脏线粒体DNA(MitochondrialDNA,mtDNA)进行了分析。XhoⅠ、EcoRⅠ、PstⅠ、BamHⅠ、XbaⅠ、HindⅢ在mtDNA分子上分别有2、3、1、1、3和5个切点。胡子鲇种内存在mtDNA酶切片段长度多态性(Restrictionfragmentlengthpolymorphisms,RFLP)。经BglⅠ、BglⅡ酶解,mtDNA都出现两种酶切类型,Ⅰ型各具2个片段,Ⅱ型各具1个片段。mtDNA分子量为10.242×106u,长度约为16.68kb。用双酶解法建立了胡子鲇mtDNA的限制性酶切图谱,并对RFLP现象进行了分析。 展开更多
关键词 鱼纲 胡子鲇 MTDNA 酶切图谱 多态性
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水稻抗白叶枯病基因X_(a-14)在分子标记连锁图上的定位 被引量:22
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作者 谭震波 章琦 +1 位作者 朱立煌 王春莲 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1998年第6期30-33,共4页
选取对水稻白叶枯病原菌6个菲律宾小种均为感病的籼稻品种珍珠矮为母本,携带抗病基因Xa-14的粳稻近等基因系CBB14(抗菲律宾5号小种P5)为父本配制杂交组合。F1植株对相对应的菌系P5表现全生育期抗病,F2群体在分... 选取对水稻白叶枯病原菌6个菲律宾小种均为感病的籼稻品种珍珠矮为母本,携带抗病基因Xa-14的粳稻近等基因系CBB14(抗菲律宾5号小种P5)为父本配制杂交组合。F1植株对相对应的菌系P5表现全生育期抗病,F2群体在分蘖前期接种鉴定结果表明,抗、感植株的分离符合3∶1显性单基因分离比。根据对F2群体中选择的99个单株进行的RFLP分析的结果,构建了水稻第4连锁群的分子图谱,并把抗病基因Xa-14定位于RG620和G282之间。 展开更多
关键词 水稻 白叶枯病 基因定位 rflp分析 抗性基因
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水稻细胞质雄性不育恢复系ZSP-1恢复基因的初步定位 被引量:8
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作者 杨存义 陈乐天 +1 位作者 陈芳远 刘耀光 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期30-33,共4页
调查了用细胞质雄性不育新恢复系ZSP 1配制的杂交组合珍汕 97A/ZSP 1和星A/ZSP 1的F1结实率及F2 个体花粉育性 ,发现恢复系ZSP 1的恢复性是由 2对独立遗传基因控制 .在此基础上 ,选用了与野败型雄性不育恢复基因Rf 3和Rf 4紧密连锁的RFL... 调查了用细胞质雄性不育新恢复系ZSP 1配制的杂交组合珍汕 97A/ZSP 1和星A/ZSP 1的F1结实率及F2 个体花粉育性 ,发现恢复系ZSP 1的恢复性是由 2对独立遗传基因控制 .在此基础上 ,选用了与野败型雄性不育恢复基因Rf 3和Rf 4紧密连锁的RFLP标记对 2个F2 群体进行连锁分析 ,发现ZSP 1具有的 2个恢复基因与这些标记紧密连锁 ,初步把ZSP 1的恢复基因定位于Rf 3和Rf 4区域 . 展开更多
关键词 水稻 细胞质 雄性不育 恢复系 ZSP-1 恢复基因 基因定位 rflp分析
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土壤微生物分子生态学研究中总DNA的提取 被引量:72
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作者 赵勇 周志华 +3 位作者 李武 刘彬彬 潘迎捷 赵立平 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期854-860,共7页
建立了一种土壤DNA提取方法。根据DNA产量和纯度2个评价指标,从3种手提土壤DNA方法中优选出方法B为手提DNA方法(Labmethod),它包括样品预处理,细胞裂解,粗DNA纯化,其中细胞裂解组合了玻璃珠击打,SDS裂解,溶菌酶裂解。进一步应用PCR-限... 建立了一种土壤DNA提取方法。根据DNA产量和纯度2个评价指标,从3种手提土壤DNA方法中优选出方法B为手提DNA方法(Labmethod),它包括样品预处理,细胞裂解,粗DNA纯化,其中细胞裂解组合了玻璃珠击打,SDS裂解,溶菌酶裂解。进一步应用PCR-限制性片段长度多态性(Restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)技术及PCR-温度梯度凝胶电泳(Temperaturegradientgelelectrophoresis,TGGE)技术,结合DNA产量、纯度、片段大小以及所反映的微生物群落结构特性等指标评价了手提方法(Labmethod)得到的总DNA质量,并将这些结果与2种应用较广的商业试剂盒(MoBioUltraCleanSoilDNAKit和Bio101FastDNASPINKit(ForSoil))所得DNA的各种指标进行了比较。结果表明,手提方法(Labmethod)的粗DNA产量低于Bio101Kit的,但高于MoBioKit的。这些方法所得DNA的长度都在21kb左右,Labmethod提取的DNA没有严重被剪切现象,而2种试剂盒提取的DNA都有不同程度的剪切。手提方法得到的DNA经纯化后,应用细菌及真菌特异引物进行PCR扩增,均能获得目的片段,表明该方法能从土壤中同时有效提取细菌和真菌总基因组DNA。并且,手提方法所得DNA的细菌16SrDNA和真菌18SrDNA的PCR-RFLP图谱与两种商业试剂盒的图谱基本相似,但3种方法提取的DNA在细菌16SrDNAV3区和真菌28SrDNA片段的PCR-TGGE图谱上都存在一定差异,主要表现在一些弱势条带的有无或强弱上。这说明手提方法提取的总DNA与2种商业试剂盒一样,在一定程度上能反映微生物群落的多样性和组成。总之,手提DNA方法(Labmethod)所用试剂普通,价格便宜,能在4h以内获得够质够量的土壤DNA用于微生物分子生态学研究,较适合于广大普通实验室进行土壤DNA提取工作。 展开更多
关键词 土壤DNA提取 DNA质量 PCR扩增 限制性片段长度多态性分析 温度梯度凝胶电泳分析
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青海湖裸鲤mtDNA遗传多样性的初步研究 被引量:27
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作者 赵凯 李军祥 +4 位作者 张亚平 罗静 李太平 吴华 田海宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期445-448,共4页
本文用BclⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、PstⅠ、KpnⅠ、PvuⅡ共 6种限制性内切核酸酶 ,分析了 15尾青海湖裸鲤mtDNA的限制性片段长度多态性 ,共检测出 2 0个酶切位点 ,发现BclⅠ、BamHⅠ和PvuⅡ三种酶切类型具有多态性。根据不同个体mtDNA的酶切... 本文用BclⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、PstⅠ、KpnⅠ、PvuⅡ共 6种限制性内切核酸酶 ,分析了 15尾青海湖裸鲤mtDNA的限制性片段长度多态性 ,共检测出 2 0个酶切位点 ,发现BclⅠ、BamHⅠ和PvuⅡ三种酶切类型具有多态性。根据不同个体mtDNA的酶切类型 ,青海湖裸鲤存在 4种mtDNA单倍型 ,计算mtDNA多态度π值为 0 .0 0 43,初步认为青海湖裸鲤在线粒体DNA上存在较丰富的群体内变异。 展开更多
关键词 青海湖裸鲤 MTDNA 限制性片段长度多态性 遗传多样性
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鲫鱼遗传多样性的初步研究 被引量:21
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作者 罗静 张亚平 +1 位作者 朱春玲 肖武汉 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1999年第1期28-36,共9页
用17种限制性内切酶对鲫属普通鲫鱼低背型、高背型、异育银鲫、日本白鲫及华南鲤的变种红鲤共 124个个体的线粒体DNA(mtDNA)进行了 RFLP分析,14种酶具多态,共计43种限制性态型、 11种单倍型。结果表明:(... 用17种限制性内切酶对鲫属普通鲫鱼低背型、高背型、异育银鲫、日本白鲫及华南鲤的变种红鲤共 124个个体的线粒体DNA(mtDNA)进行了 RFLP分析,14种酶具多态,共计43种限制性态型、 11种单倍型。结果表明:(1)基于 mtDNA群体间的净遗传距离所构建的聚类关系对应于形态分类。(2)普通鲫鱼的群体遗传分化指数GST值表明云南和湖北的普通鲫鱼已出现地理分化。它们之间无相同的限制性单倍型,因此,在短期内未发生基因交流;云南普通鲫鱼 GST值为0.142,各水域的群体中均出现相同的单倍型Ⅰ型,表明处于半家养状态的鲫鱼与近水域间存在基因交流。(3)核型上能明显区分的云南普通鲫鱼低背型和高背型群体,各自在线粒体DNA上存在较丰富的群体内变异,但高背型群体具独特的单倍型,故不支持关于高背型群体可能是近期内由低背型经染色体的简单多倍化而形成的推论。 展开更多
关键词 鲫鱼 线粒体DNA rflp 遗传多样性
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光敏核不育水稻农垦58S与正常品种“农垦58”在pmsl区段无育性基因分离 被引量:15
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作者 王风平 梅明华 +1 位作者 徐才国 张启发 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1997年第10期922-925,共4页
光敏核不育水稻农垦58S系由正常品种“农垦58”(Oryza sativa L.ssp.japonica)自然突变产生。为弄清该突变基因在染色体上的位置,曾用覆盖整个水稻基因组的300余个RFLP探针对农垦58S和“农垦58”进行了对比分析,得到了7个具多态性的探针... 光敏核不育水稻农垦58S系由正常品种“农垦58”(Oryza sativa L.ssp.japonica)自然突变产生。为弄清该突变基因在染色体上的位置,曾用覆盖整个水稻基因组的300余个RFLP探针对农垦58S和“农垦58”进行了对比分析,得到了7个具多态性的探针,其中2个探针RG30和RZ626正好落在第7染色体上以前定位的光敏核不育基因pmsl所在的区段。以这两个标记对农垦58S/“农垦58”组合F_2随机群体140单株进行了RFLP分析,按RFLP基因型分组对育性作方差分析,结果表明,这2个标记位点与此群体中引起育性分离的位点无连锁关系。说明由正常“农垦58”变为光敏核不育农垦58S的突变基因不在pmsl区段。 展开更多
关键词 水稻 光敏核不育 品种 农垦58 无育性基因
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中国人Wilson病患者基因高频突变位点的快速检测 被引量:13
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作者 程楠 陆兵勋 +7 位作者 杜益刚 王训 胡纪源 胡文彬 李凯 韩咏竹 潘速跃 杨任民 《中风与神经疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期414-417,共4页
目的建立可用于临床的中国人Wilson病(WD)患者快速、高效的基因检测方法。方法PCR扩增142例非同源家系的WD患者ATP7B基因第8、12、13外显子(以30例健康人为正常对照),分别以限制性内切酶MspI、TaiI和BstDsI消化扩增产物,2%琼脂糖凝胶电... 目的建立可用于临床的中国人Wilson病(WD)患者快速、高效的基因检测方法。方法PCR扩增142例非同源家系的WD患者ATP7B基因第8、12、13外显子(以30例健康人为正常对照),分别以限制性内切酶MspI、TaiI和BstDsI消化扩增产物,2%琼脂糖凝胶电泳分离,根据各外显子的限制性酶切图谱分析有无突变,其结果经DNA测序验证。结果48.59%(69/142)的患者在第8外显子检出Arg778Leu突变,其中纯合突变13例,杂合突变56例,染色体突变频率为28.87%(82/284);5.63%(8/142)的患者在第12外显子检出Thr935Met杂合突变,染色体突变频率为2.82%(8/284);24.65%(35/142)的患者在第13外显子检出Pro992Leu突变,其中纯合突变3例,杂合突变32例,染色体突变频率为13.38%(38/284)。检出突变的患者中有12例为Arg778Leu/Pro992Leu复合杂合突变,1例Arg778Leu/Thr935Met复合杂合突变,1例Arg778Leu纯合突变合并Pro992Leu杂合突变,总检出率为69.01%(98/142)。以上结果均经DNA测序证实。结论13外显子Pro992Leu突变是中国人WD患者的基因突变热点之一。采用限制性酶谱分析法能快速、准确检出WD患者基因高频突变位点,可用于对WD疑诊患者及其家系成员的基因诊断。 展开更多
关键词 WILSON病 基因突变 限制性内切酶图谱分析
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