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基于RFLP-PCR技术的宁夏玉米叶螨种群的鉴定
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作者 周兴隆 于丽 +4 位作者 刘文帅 陆占军 李健荣 杨晓婉 郭军成 《宁夏大学学报(自然科学版)》 CAS 2019年第1期56-60,共5页
为明确宁夏玉米叶螨的种群,以2018年6—8月采自宁夏不同生境、7个叶螨地理种群、60头叶螨为样本,进行FLP-PCR分析.结果表明,样本的酶切图谱均与截形叶螨图谱一致,可为害宁夏玉米的叶螨种群为截形叶螨.
关键词 叶螨 种群鉴定 rflp-pcr
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结肠小袋纤毛虫PCR-RFLP分型方法的建立
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作者 徐啊慧 冯彩彩 +6 位作者 丰山旺 赵立卓 齐闻新 张雯 胡苏辉 王天奇 闫文朝 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期829-833,840,共6页
目的建立高效、特异的结肠小袋纤毛虫遗传亚型分析方法。方法选择限制性内切酶ApoI和PflMI对结肠小袋纤毛虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2的PCR扩增产物进行酶切分析,建立PCR-RFLP分型方法,利用建立的PCR-RFLP方法对猪源、羊源和豚鼠源临床粪便... 目的建立高效、特异的结肠小袋纤毛虫遗传亚型分析方法。方法选择限制性内切酶ApoI和PflMI对结肠小袋纤毛虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2的PCR扩增产物进行酶切分析,建立PCR-RFLP分型方法,利用建立的PCR-RFLP方法对猪源、羊源和豚鼠源临床粪便样品进行遗传亚型分析。结果基于ApoI和PflMI的PCR-RFLP方法可以准确区分结肠小袋纤毛虫遗传变异型A和B,用PflMI可以进一步将遗传变异型B细分为B-c和B-t两个亚型。与镜检和测序结果比较,建立的PCR-RFLP方法具有良好的特异性和更高的灵敏性,不仅可以鉴定临床样品中结肠小袋纤毛虫单个亚型,而且可以鉴别单个样品中结肠小袋纤毛虫多个亚型的混合感染。结论本研究成功建立了结肠小袋纤毛虫PCR-RFLP方法,可用于结肠小袋纤毛虫遗传多态性鉴定和分子流行病学研究。 展开更多
关键词 结肠小袋纤毛虫 PCR-RFLP分析 豚鼠
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一种基于线粒体COI PCR-RFLP单酶切快速鉴定4种巨蛎属牡蛎的方法
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作者 崔中望 于诗奇 +1 位作者 缪雄平 阙华勇 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期68-73,共6页
本文报道了一种基于线粒体细胞色素氧化酶亚基I(mt COI)基因序列PCR-RFLP单酶切的牡蛎物种鉴定方法。本方法可快速鉴定福建牡蛎(Crassostrea angulata)、熊本牡蛎(Crassostrea sikamea)、香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)和近江牡蛎... 本文报道了一种基于线粒体细胞色素氧化酶亚基I(mt COI)基因序列PCR-RFLP单酶切的牡蛎物种鉴定方法。本方法可快速鉴定福建牡蛎(Crassostrea angulata)、熊本牡蛎(Crassostrea sikamea)、香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)和近江牡蛎(Crassostrea ariakensis)等中国沿海常见的4种巨蛎属(Crassostrea)牡蛎。该方法以甲基转移酶(Msp I)作为限制性内切酶,对4种巨蛎属牡蛎的线粒体DNA COI扩增序列进行酶切,以得到的特异性条带为依据进行物种鉴定。本方法的鉴定结果与COI测序方法的鉴定结果一致,并且筛选出的单一的限制性内切酶Msp I在4种牡蛎的COI序列中不存在酶切位点的突变,准确率达到100%,能够为巨蛎属牡蛎的物种鉴别提供简便可靠的技术支撑。 展开更多
关键词 巨蛎属(Crassostrea)牡蛎 线粒体COI PCR-RFLP
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Relationship between the rs2241766 ADIPOQ Polymorphism in a Black African Population and the Occurrence of Type 2 Diabetes
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作者 Aude Syntia Mbang Bengone Rosalie Nikiema-Ndong +6 位作者 Elisabeth Lendoye Alvine Sibylle Batou Edwige Nnegue Edzo Serge Bekale Daniela Nsame Frédéric Da Dari Félix Ovono Abessolo 《American Journal of Molecular Biology》 CAS 2024年第2期97-106,共10页
Background: Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a metabolic disease, characterized by chronic hyperglycemia. This pathology is linked to various genes whose interaction with the environment promotes its development. Th... Background: Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a metabolic disease, characterized by chronic hyperglycemia. This pathology is linked to various genes whose interaction with the environment promotes its development. The aim of this work was to determine the relationship between the rs2241766 (T/G) polymorphism of the ADIPOQ gene with type 2 diabetes in the black population. Material and Methods: This work was a case-control study, involving type 2 diabetics subjects (n = 94) and controls (n = 82). The study took place from September 2022 to September 2023. Patients were recruited in the Endocrinology Department of the Libreville University Hospital Center. Analysis was performed in the Biochemistry laboratory of the University of Health Sciences in Libreville and at the Research Institute of Health Sciences of Bobodioulasso. Genomic DNA was extracted using the protocol Qiagen kit and the PCR-RFLP method was used to determine the rs2241766 (T/G) polymorphism of the ADIPOQ gene. Results: Only 2 genotypes were found in this population, the TT genotype and the GT genotype. The proportions were not different between the two groups (p = 0.1095) neither the distribution of G and T alleles (p = 0.1095). On the other hand, the HDL hypocholesterolemia was frequent in subjects with the GT genotype compared to TT heterozygous (51.1% vs 48.9%, p = 0.0280;OR = 0.55 [0.30 - 1.01]). Conclusion: There was no association between the rs2241766 (T/G) variant of the ADIPOQ gene and the occurrence of type 2 diabetes in this population. On the other hand, a relationship between HDL hypocholesterolemia and the GT genotype has been established. 展开更多
关键词 Type 2 Diabetes Mellitus POLYMORPHISM rs2241766 ADIPOQ PCR-RFLP
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安徽省石台县日本血吸虫rDNA-ITS2和mtDNA-COX1遗传多态性研究
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作者 宇芙蓉 方佩斐 +1 位作者 施维 金郁 《安徽医专学报》 2023年第2期85-87,90,共4页
目的:研究安徽石台县日本血吸虫的核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因和线粒体细胞色素C氧化亚基1基因(mtDNA-COX1)的遗传变异。方法:收集两种不同来源的阳性钉螺(石台和南京),逸出尾蚴后感染小鼠,每只小鼠感染(20±2)尾蚴,3... 目的:研究安徽石台县日本血吸虫的核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因和线粒体细胞色素C氧化亚基1基因(mtDNA-COX1)的遗传变异。方法:收集两种不同来源的阳性钉螺(石台和南京),逸出尾蚴后感染小鼠,每只小鼠感染(20±2)尾蚴,35天后解剖小鼠,收集血吸虫成虫,PCR-RFLP扩增成虫的rDNA-ITS2和mtDNA-COX1基因,限制性核酸内切酶Taq I水解,观察结果;同时收集小鼠的肝脏和血液,HE染色观察肝脏肉芽肿的大小,ELISA检测小鼠血清中的谷丙转氨酶(ALT)。结果:石台组和南京组均获得500 bp的ITS2序列和1400 bp的mtDNA-COX1序列;两组的ITS2序列经Taq I酶切后,得到一样的片段;而mtDNA-COX1序列经Taq I酶切后,两组结果不同,石台组在1000 bp检测到1条清晰的条带,而南京组在此处无任何条带;两组小鼠的肝脏纤维化病理结果与谷氨酸转氨酶测定结果均无明显差异。结论:石台组和南京组的日本血吸虫虽然在致病性方面具有相似性,但在mtDNA-COX1基因序列存在差异,本研究为今后日本血吸虫的种群遗传结构研究提供科学依据。 展开更多
关键词 日本血吸虫 遗传多态性 PCR-RFLP ITS2 COX1
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鸡金银羽位点基因型PCR-RFLP鉴定方法的建立及其应用研究 被引量:1
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作者 崔梦笛 倪慧勇 +5 位作者 刘华格 褚素乔 王学静 许利军 王志永 樊宝良 《中国家禽》 北大核心 2023年第2期8-14,共7页
为了建立一个快速、简便、有效鉴定鸡金银羽位点基因型的方法,试验通过对金银羽等位基因位点核苷酸序列进行分析,设计合成一对引物,应用该对引物对海兰褐、伊莎褐和大午金凤等采用金银羽羽色自别雌雄的蛋鸡配套系商品代公鸡(金银羽等位... 为了建立一个快速、简便、有效鉴定鸡金银羽位点基因型的方法,试验通过对金银羽等位基因位点核苷酸序列进行分析,设计合成一对引物,应用该对引物对海兰褐、伊莎褐和大午金凤等采用金银羽羽色自别雌雄的蛋鸡配套系商品代公鸡(金银羽等位基因杂合,Ss)和母鸡(金羽等位基因半合子,s-)进行了PCR-RFLP基因型鉴定分析。结果显示,PCR-RFLP方法的鉴定结果与实际基因型一致;采用该方法从960只白羽太行鸡母鸡中鉴定得到3只不携带显性白羽等位基因的银羽母鸡(银羽等位基因半合子,S-);以海兰褐父母代父本公鸡(金羽等位基因纯合,ss)作为父本与用本方法鉴定得到的3只银羽太行鸡母鸡进行杂交,来模拟金银羽自别雌雄的海兰褐蛋鸡商品代鸡的生产,获得的后代雏鸡绒羽颜色表型和性别符合海兰褐商品代鸡金银羽羽色自别雌雄的规律。上述结果表明,建立的PCR-RFLP方法能够快速、简便、有效且低成本地鉴定鸡金银羽位点基因型,为银羽纯合品系的建立提供了一个有效的个体金银羽位点基因型鉴定的方法。 展开更多
关键词 金银羽 基因型 性别鉴定 分子标记 PCR-限制性片段长度的多态性(PCR-RFLP)
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石菖蒲药材及饮片掺混藏菖蒲PCR-RFLP鉴别方法研究 被引量:3
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作者 杜晓伟 宋平顺 倪琳 《中国中医药信息杂志》 CAS CSCD 2023年第5期121-126,共6页
目的通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法建立快速鉴别石菖蒲药材及饮片掺混藏菖蒲的方法。方法对石菖蒲和藏菖蒲的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列酶切位点进行比对分析,选择藏菖蒲的特异性酶切位点AluI,设计PCR-RFL... 目的通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法建立快速鉴别石菖蒲药材及饮片掺混藏菖蒲的方法。方法对石菖蒲和藏菖蒲的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列酶切位点进行比对分析,选择藏菖蒲的特异性酶切位点AluI,设计PCR-RFLP反应引物,对影响PCR-RFLP反应的退火温度、引物浓度、循环数、酶切时间等条件进行优化,对该方法的准确性进行考察。利用建立的PCR-RFLP鉴别方法对不同产地的石菖蒲、藏菖蒲及掺混样品进行适用性考察。结果建立了石菖蒲药材及饮片掺混藏菖蒲的PCR-RFLP鉴别方法,在退火温度60℃、循环数为30时,藏菖蒲或掺有藏菖蒲的石菖蒲样品经过特异性引物扩增后,能被AluI酶酶切,在100~300 bp检出2条单一DNA条带,石菖蒲样品则无此条带。该方法能对石菖蒲药材及饮片中掺混的藏菖蒲进行准确鉴别,并对石菖蒲中掺入藏菖蒲的检出限为3%。结论建立的PCR-RFLP鉴别方法稳定性好、灵敏度高,可用于石菖蒲与藏菖蒲鉴别及石菖蒲中掺混藏菖蒲的检测,为石菖蒲与藏菖蒲药材的质量控制提供参考。 展开更多
关键词 石菖蒲 藏菖蒲 掺混鉴别 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法
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基于ITS序列PCR-RFLP鉴别大蓟药材及饮片中掺伪飞廉、魁蓟的方法研究 被引量:1
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作者 张诗华 赖晶 +3 位作者 倪琳 宋平顺 李辰荃 郭朝晖 《天津中医药大学学报》 CAS 2023年第6期780-785,共6页
[目的]利用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP),建立快速鉴别大蓟混伪品飞廉和魁蓟的方法。[方法]通过比对ITS基因序列,分别筛选飞廉、魁蓟的限制性内切酶位点并设计鉴别引物。考察PCR反应的退火温度、循环数及不同酶的适用... [目的]利用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP),建立快速鉴别大蓟混伪品飞廉和魁蓟的方法。[方法]通过比对ITS基因序列,分别筛选飞廉、魁蓟的限制性内切酶位点并设计鉴别引物。考察PCR反应的退火温度、循环数及不同酶的适用性,对酶切反应时间和酶切底物量进行优化。同时对该方法适应性及掺伪比例的专属性、稳定性进行考察。[结果]当退火温度为58~60℃、循环数为30个时,样品均能扩增出一条379 bp的DNA条带。底物为8μL、酶切温度为37℃、酶切反应120 min时,ZraI酶将飞廉切割成120 bp和259 bp两条DNA条带;DNA底物为8μL、酶切温度为37℃、酶切反应60 min时,ApaLI酶将魁蓟切割成126 bp和253 bp两条DNA条带。[结论]试验建立的PCR-RFLP方法能够准确地鉴别大蓟混伪品飞廉、魁蓟,避免此类药材的混用,以保证临床用药安全。 展开更多
关键词 大蓟 飞廉 魁蓟 PCR-RFLP法 ITS序列
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梅花鹿鞭与马鹿鞭PCR-RFLP鉴别研究 被引量:1
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作者 周童 吴楠 +5 位作者 孟媛 姜菲菲 李佩瑶 张英 裴笑仙 艾金霞 《吉林医药学院学报》 2023年第2期81-86,共6页
目的建立一种应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)鉴别梅花鹿鞭与马鹿鞭的方法。方法根据梅花鹿与马鹿的细胞色素b基因序列的差异,设计并选取DNA限制性内切酶MseI来区分梅花鹿鞭和马鹿鞭。采用改良SDS法提取样本基因... 目的建立一种应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)鉴别梅花鹿鞭与马鹿鞭的方法。方法根据梅花鹿与马鹿的细胞色素b基因序列的差异,设计并选取DNA限制性内切酶MseI来区分梅花鹿鞭和马鹿鞭。采用改良SDS法提取样本基因组DNA,经PCR扩增后进行RFLP分析,并优化PCR-RFLP反应体系及反应条件,用优化的PCR-RFLP体系对市售鹿鞭样本进行鉴定。结果经PCR-RFLP分析,MseI可切割梅花鹿与马鹿Cyt b片段,前者被切成2个片段,后者被切成3个片段,从而将两者进行鉴别。结论本实验建立的PCR-RFLP方法可准确鉴别梅花鹿鞭与马鹿鞭。 展开更多
关键词 鹿鞭 聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性技术 梅花鹿鞭 马鹿鞭
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26S rDNA-RFLP分析在非酿酒酵母菌分类研究中的应用 被引量:14
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作者 徐艳文 杨莹 +1 位作者 薛军侠 刘延琳 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2007年第4期23-26,共4页
使用26S rDNA-RFLP分析,分析了分离自甘肃莫高葡萄酒厂的29株非酿酒酵母菌,被测菌株被分为10个类型。通过26S rDNA D1/D2区序列分析验证,证明此方法在葡萄酿酒酵母菌种多样性研究中良好的应用价值。
关键词 非酿酒酵母菌 葡萄酿酒酵母菌 rflp-pcr
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FASN基因的多态性及其与中国荷斯坦奶牛产奶性状的相关性分析 被引量:3
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作者 贺一博 潘琪琪 +7 位作者 姜宁 杨丹 刘雪婷 刘晓军 吴建民 任娟 李妍 沈冰蕾 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第6期97-100,共4页
为了分析脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FASN)基因的多态性及其与中国荷斯坦奶牛产奶性状的相关性,试验选取230头荷斯坦奶牛,采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(Restriction fragment length polymorphism-polymerase chain rea... 为了分析脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FASN)基因的多态性及其与中国荷斯坦奶牛产奶性状的相关性,试验选取230头荷斯坦奶牛,采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(Restriction fragment length polymorphism-polymerase chain reaction,RFLP-PCR),对FASN基因3'-UTR区和外显子部分片段的多态性进行检测,并对突变位点与奶牛产奶性状的相关性进行分析。结果表明:在所分析的片段中,检测到3'-UTR区存在一个C→T碱基的置换突变(g.51403203C>T);该突变位点为Bam HⅠ酶的自然酶切位点,酶切后存在CC、TC、TT三种基因型,TT基因型的乳脂率和脂蛋白比显著高于TC基因型、CC基因型(P<0.05),而三种基因型间乳蛋白率和305 d产奶量差异不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 荷斯坦奶牛 脂肪酸合成酶(FASN) 产奶性状 多态性 限制性片段长度多态性聚合酶链反应(rflp-pcr)
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副猪嗜血杆菌分离与基因分型鉴定 被引量:9
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作者 蒋征 李军星 +3 位作者 姜平 柴其然 余飞 钱黎婷 《畜牧与兽医》 北大核心 2008年第6期47-49,共3页
本研究选择6个具有明显多发性浆膜炎等症状的猪场,从患猪肺支气管中分离获得6株副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,HPs),采用RFLP-PCR针对tbpA基因进行基因型鉴定。结果显示,6个分离株属于4种不同的HPs基因型,证明我国HPs流行株存在多... 本研究选择6个具有明显多发性浆膜炎等症状的猪场,从患猪肺支气管中分离获得6株副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,HPs),采用RFLP-PCR针对tbpA基因进行基因型鉴定。结果显示,6个分离株属于4种不同的HPs基因型,证明我国HPs流行株存在多种基因型,采用PCR-RFLP分析副猪嗜血杆菌流行病学规律,具有实用意义。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 分离鉴定 rflp-pcr
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山羊FSHR基因5′端侧翼序列多态性对产羔性状的影响 被引量:4
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作者 姬云涛 曹斌云 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2007年第9期1-4,共4页
为了研究山羊FSHR基因对产羔性状的影响,用RFLP-PCR法对多胎和单胎布尔山羊、关中奶山羊和萨能奶山羊母羊FSHR基因5′端侧翼序列进行了多态性检测。结果发现,FSHR基因5′端侧翼序列经PstⅠ、HaeⅢ、SinⅠ和TaqⅠ酶切,在多胎母羊和单胎... 为了研究山羊FSHR基因对产羔性状的影响,用RFLP-PCR法对多胎和单胎布尔山羊、关中奶山羊和萨能奶山羊母羊FSHR基因5′端侧翼序列进行了多态性检测。结果发现,FSHR基因5′端侧翼序列经PstⅠ、HaeⅢ、SinⅠ和TaqⅠ酶切,在多胎母羊和单胎母羊群体中均未表现出多态性;不同山羊群体FSHR基因5′端侧翼序列中各存在一些碱基的差异,但这些差异均未影响FSHR基因的转录和山羊的产羔性状。说明所检测的FSHR基因5′端侧翼序列这些酶切位点与山羊的产羔性状之间没有遗传连锁关系。 展开更多
关键词 山羊 FSHR基因 产羔性状 rflp-pcr
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稻田土壤细菌宏基因组文库构建 被引量:1
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作者 张建萍 段桂芳 +2 位作者 周勇军 陆永良 余柳青 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第2期18-20,共3页
为了从土壤宏基因组文库中筛选获得具有微生物农药活性的化合物及其基因簇,本研究构建了稻田土壤细菌宏基因组文库。采用直接裂解法提取土样DNA并对其纯化,之后RFLP-PCR分析土样DNA中细菌16S rDNA基因的多样性,最后以提纯的土壤DNA为外... 为了从土壤宏基因组文库中筛选获得具有微生物农药活性的化合物及其基因簇,本研究构建了稻田土壤细菌宏基因组文库。采用直接裂解法提取土样DNA并对其纯化,之后RFLP-PCR分析土样DNA中细菌16S rDNA基因的多样性,最后以提纯的土壤DNA为外源片段,以Fosm id载体构建了土壤宏基因组文库。提取纯化后的DNA片段大于23 kb,RFLP-PCR分析土样DNA具有丰富的遗传多样性,构建获得的土样宏基因组文库约含10 000个克隆子,文库容量为3.56×108bp。本研究掌握了构建土壤宏基因组文库的方法,构建的宏基因组文库可为后续的文库筛选以及获得绿色环保的微生物农药奠定了基础。 展开更多
关键词 土壤 微生物农药 rflp-pcr分析 宏基因组文库
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Tumor Necrosis Factor-Alpha (TNF)-308G/A and Interleukin 8(IL-8)-251C/T Polymorphisms in Pulmonary Tuberculosis Patients from Congo
15
作者 Faust René Okamba Prudence Spinelie Koumba Pambou +4 位作者 Mandingha Kosso Etoka-Beka Brave Nzoussi Regis Gothard Bopaka Cyr Jonas Morabandza Gabriel Ahombo 《Open Journal of Immunology》 CAS 2023年第1期1-13,共13页
Background: Tuberculosis (TB) is one of the world’s deadliest infectious diseases. Tumor necrosis factor-Alpha (TNF-α) and Interleukin 8 (IL-8) are involved in the pathogenesis of pulmonary TB (PTB). However, the co... Background: Tuberculosis (TB) is one of the world’s deadliest infectious diseases. Tumor necrosis factor-Alpha (TNF-α) and Interleukin 8 (IL-8) are involved in the pathogenesis of pulmonary TB (PTB). However, the contribution of polymorphisms of these cytokines to PTB susceptibility needed more investigation across geographic regions and ethnic groups. Purpose: The aim of this study was to investigate the association of the TNF-α-308 G/A and IL-8-251T/A polymorphisms with PTB risk in the Congolese population. Methods: This case-control study included 150 PTB patients and 160 control subjects. Blood samples were collected from all participants and were used for the TNF-α-308 G/A and IL-8-251T/A genotyping by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) technique. Odds ratios (OR) were calculated to estimate the potential polymorphism associations. A P level of Results: A significant difference was found between PTB patients and controls regarding the TNF-α-308AA genotype (P = 0.035) distribution. Moreover, this genotype was associated with risk to TB (OR = 7.19, 95% CI = 0.85 - 60.65, P = 0.035). The A allele was significantly more frequent in PTB patients than in controls, and was associated with risk to PTB (OR = 1.68, 95% CI = 1.05 - 2.68, P = 0.014). Regarding the IL-8-251T/A gene, TA and AA genotypes were significantly more frequent in PTB patients compared to controls, and were associated with increased risk to PTB (OR = 2.64, 95% CI = 0.97 - 7.18, P = 0.031 and OR = 3.0, 95% CI = 1.13 - 7.98, P = 0.014, respectively). However, the IL-8-251 A allele was not associated to PTB susceptibility (OR = 0.27, 95% CI = 0.15 - 0.44). Conclusion: TNF-α-308G/A and IL-8-251T/A polymorphisms may be associated to PTB susceptibility in the Congolese population, and the AA genotype of both cytokines could be a risk factor. 展开更多
关键词 Pulmonary Tuberculosis Cytokine Polymorphism Tumor Necrosis Factor-Alpha INTERLEUKIN-8 PCR-RFLP
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基于ITS序列PCR-RFLP鉴别北柴胡混伪品藏柴胡
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作者 赖晶 倪琳 +5 位作者 蔺瑞丽 靳婉君 刘富强 宋平顺 马萧 滕宝霞 《现代中医药》 CAS 2023年第5期105-112,共8页
目的基于ITS序列用PCR-RFLP方法鉴别北柴胡药材掺伪藏柴胡的方法。方法分析并筛选出藏柴胡特有的限制性内切酶AseⅠ,用Primer Premier 5.0设计特异性引物,对引物PCR扩增条件和酶切试验进行优化,并对该方法的准确性进行了考察。结果PCR... 目的基于ITS序列用PCR-RFLP方法鉴别北柴胡药材掺伪藏柴胡的方法。方法分析并筛选出藏柴胡特有的限制性内切酶AseⅠ,用Primer Premier 5.0设计特异性引物,对引物PCR扩增条件和酶切试验进行优化,并对该方法的准确性进行了考察。结果PCR扩增的目的片段为331 bp,且建立的PCR反应方法对不同的酶均具有适应性。限制性内切酶AseⅠ将藏柴胡切成79 bp和252 bp两个片段,而北柴胡及其他柴胡均不能被酶切,且掺伪检出限为1%。结论PCR-RFLP方法实现了准确鉴别北柴胡中的混伪品藏柴胡。 展开更多
关键词 藏柴胡 北柴胡 ITS PCR-RFLP 分子鉴定
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微生物生态学研究方法进展 被引量:87
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作者 张洪勋 王晓谊 齐鸿雁 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期988-995,共8页
微生物培养及显微技术作为鉴定微生物种群的手段有很大的局限性 ,因为环境中大多数微生物处于“存活但不能培养”的状态。因此 ,不依赖于微生物培养的生物化学以及分子生物学方法正被广泛地用于微生物生态学研究。主要介绍了荧光技术 ,... 微生物培养及显微技术作为鉴定微生物种群的手段有很大的局限性 ,因为环境中大多数微生物处于“存活但不能培养”的状态。因此 ,不依赖于微生物培养的生物化学以及分子生物学方法正被广泛地用于微生物生态学研究。主要介绍了荧光技术 ,基于 PCR的分析技术和 展开更多
关键词 微生物生态学 研究方法 显微技术 微生物培养 生物化学 分子生物学方法 PCR PLFA
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牛TLR4基因的遗传多态性与乳房炎的关联分析 被引量:36
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作者 王兴平 许尚忠 +3 位作者 马腾壑 高雪 任红艳 陈金宝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期120-124,共5页
TLR4通过识别病原体而激活免疫细胞,在先天免疫和适应性免疫防御中起着重要作用。以中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛共397头为研究对象,利用创造酶切位点PCR法扩增243 bp的目的片段,通过限制性内切酶HinfⅠ酶切来检测TLR4第3外... TLR4通过识别病原体而激活免疫细胞,在先天免疫和适应性免疫防御中起着重要作用。以中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛共397头为研究对象,利用创造酶切位点PCR法扩增243 bp的目的片段,通过限制性内切酶HinfⅠ酶切来检测TLR4第3外显子的多态性,结果发现扩增产物的27 bp处C到T的突变使得多态位点产生,编码的氨基酸由苏氨酸变为异亮氨酸。A、B 2个等位基因在3个群体中均有分布,A等位基因占优势(大于78%),经χ2适合性检验,三河牛在该位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。运用SAS 8.2软件采用最小二乘法拟合线性模型,将该基因座不同基因型与奶牛乳房炎进行了关联分析,结果表明:AA基因型为乳房炎抗性基因型(P<0.05),A等位基因为乳房炎抗性的有利基因。 展开更多
关键词 TLR4基因 CRS-PCR PCR-RFLP 乳房炎 体细胞数 体细胞评分
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6个山羊品种高繁殖力候选基因BMP15多态性研究 被引量:39
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作者 何远清 储明星 +2 位作者 王金玉 方丽 叶素成 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期61-64,共4页
骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic prote in 15,BMP15)基因为控制Belc lare和Cambridge绵羊高繁殖力的主效基因。采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术检测BMP15基因中与绵羊高繁殖力相关的两个突变位点在高繁殖力山羊品种济宁青山羊(130只... 骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic prote in 15,BMP15)基因为控制Belc lare和Cambridge绵羊高繁殖力的主效基因。采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术检测BMP15基因中与绵羊高繁殖力相关的两个突变位点在高繁殖力山羊品种济宁青山羊(130只母羊、20只公羊)以及低繁殖力山羊品种(波尔山羊30只母羊、文登奶山羊30只母羊、辽宁绒山羊30只母羊、内蒙古绒山羊50只母羊、北京本地山羊30只母羊)中的单核苷酸多态性,同时研究这两个突变位点对济宁青山羊高繁殖力的影响。结果表明,在6个山羊品种中都没有检测到BMP15的B2突变(C→T);检测到的BMP15的B4突变(G→T)在6个山羊品种中均呈现杂合子状态。这表明BMP15基因中影响Belc lare和Cambridge绵羊高繁殖力的突变位点对济宁青山羊的高繁殖力没有显著影响。 展开更多
关键词 山羊 繁殖力 骨形态发生蛋白15基因 PCR-RFLP PCR-SSCP
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猪黑素皮质素受体1(MC1R)基因与毛色表型的研究 被引量:19
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作者 邓素华 高军 +8 位作者 任军 陈克飞 丁能水 艾华水 林万华 王文君 刘宝生 赖芬菊 黄路生 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第10期949-954,共6页
猪的毛色表型虽然与经济性状没有直接相关 ,但它却对经济效益产生重要影响 ,在猪育种实践、商品猪生产等方面都有应用。结合PCR AccⅡ RFLP、PCR BspHⅠ RFLP及PCR SSCP技术 ,分析了 16个全同胞家系和金华猪、嘉兴黑猪、玉山黑猪、乐... 猪的毛色表型虽然与经济性状没有直接相关 ,但它却对经济效益产生重要影响 ,在猪育种实践、商品猪生产等方面都有应用。结合PCR AccⅡ RFLP、PCR BspHⅠ RFLP及PCR SSCP技术 ,分析了 16个全同胞家系和金华猪、嘉兴黑猪、玉山黑猪、乐平花猪、上高两头乌猪及嵊县花猪等 6个地方猪种随机采样个体的黑素皮质素受体 1(MC1R)基因型。结果显示 ,地方猪种在MC1R位点携带高频率的显性黑等位基因ED1 ,表明我国地方猪种的黑毛色可能主要由显性黑等位基因ED1 调控。通过对嵊县花猪MC1R位点的分析 ,首次发现PCR SSCP证据的新序列 ,与已知的其他 5个等位基因带型不同。家系个体的分析结果进一步验证了ED1 对EP、e为完全显性 ,EP 展开更多
关键词 MCIR基因 PCR-HELPs PCR-SSCP 毛色
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