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RESTRICTION ENDONUCLEASE ANALYSIS OF MITOCHONDRIALDNA FROM HUMAN LUNG ADENOCARCINOMA CELLLINE SPC-A-1
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作者 胡义德 钱桂生 +3 位作者 陈维中 李淑平 王关嵩 毛宝龄 《Chinese Journal of Cancer Research》 SCIE CAS CSCD 1999年第4期253-256,共4页
Objective: To understand the role of mitochondrial DNA (mtDNA) in carcinogenesis. Methods: single-step method was used to isolate the mtDNA from human lung adenocarcinoma cell line SPC-A-1. The mtDNA was analyzed by r... Objective: To understand the role of mitochondrial DNA (mtDNA) in carcinogenesis. Methods: single-step method was used to isolate the mtDNA from human lung adenocarcinoma cell line SPC-A-1. The mtDNA was analyzed by restriction fragment length polymorphism (RFLP) with 11 kinds of restriction endonuclease, which were Pvu II, Xho I, Pst I, EcoR I, BstE II, Hind III, Hpa I, Bc1 I, EcoR V, Sca I and Xba I. Restriction map of mtDNA from SPC-A-1 cell was obtained by the single and double-digestion method. Results: It was found that no variation at 32 restriction-sites could be detected in the coding region of mtDNA from SPC-A-1 cell line. But a new site was found at nucleotide 16276 (EcoR V) within the noncoding region. Conclusion: These results indicate that the primary structure of gene coding region of mtDNA isolated from SPC-A-1 cell is highly stable. While the major variation of nucleotide is probably located in the noncoding region. 展开更多
关键词 Lung carcinoma Mitochondrial dna restriction fragment length polymorphism MUTATION
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土壤微生物分子生态学研究中总DNA的提取 被引量:72
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作者 赵勇 周志华 +3 位作者 李武 刘彬彬 潘迎捷 赵立平 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期854-860,共7页
建立了一种土壤DNA提取方法。根据DNA产量和纯度2个评价指标,从3种手提土壤DNA方法中优选出方法B为手提DNA方法(Labmethod),它包括样品预处理,细胞裂解,粗DNA纯化,其中细胞裂解组合了玻璃珠击打,SDS裂解,溶菌酶裂解。进一步应用PCR-限... 建立了一种土壤DNA提取方法。根据DNA产量和纯度2个评价指标,从3种手提土壤DNA方法中优选出方法B为手提DNA方法(Labmethod),它包括样品预处理,细胞裂解,粗DNA纯化,其中细胞裂解组合了玻璃珠击打,SDS裂解,溶菌酶裂解。进一步应用PCR-限制性片段长度多态性(Restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)技术及PCR-温度梯度凝胶电泳(Temperaturegradientgelelectrophoresis,TGGE)技术,结合DNA产量、纯度、片段大小以及所反映的微生物群落结构特性等指标评价了手提方法(Labmethod)得到的总DNA质量,并将这些结果与2种应用较广的商业试剂盒(MoBioUltraCleanSoilDNAKit和Bio101FastDNASPINKit(ForSoil))所得DNA的各种指标进行了比较。结果表明,手提方法(Labmethod)的粗DNA产量低于Bio101Kit的,但高于MoBioKit的。这些方法所得DNA的长度都在21kb左右,Labmethod提取的DNA没有严重被剪切现象,而2种试剂盒提取的DNA都有不同程度的剪切。手提方法得到的DNA经纯化后,应用细菌及真菌特异引物进行PCR扩增,均能获得目的片段,表明该方法能从土壤中同时有效提取细菌和真菌总基因组DNA。并且,手提方法所得DNA的细菌16SrDNA和真菌18SrDNA的PCR-RFLP图谱与两种商业试剂盒的图谱基本相似,但3种方法提取的DNA在细菌16SrDNAV3区和真菌28SrDNA片段的PCR-TGGE图谱上都存在一定差异,主要表现在一些弱势条带的有无或强弱上。这说明手提方法提取的总DNA与2种商业试剂盒一样,在一定程度上能反映微生物群落的多样性和组成。总之,手提DNA方法(Labmethod)所用试剂普通,价格便宜,能在4h以内获得够质够量的土壤DNA用于微生物分子生态学研究,较适合于广大普通实验室进行土壤DNA提取工作。 展开更多
关键词 土壤dna提取 dna质量 PCR扩增 限制性片段长度多态性分析 温度梯度凝胶电泳分析
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青海湖裸鲤mtDNA遗传多样性的初步研究 被引量:27
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作者 赵凯 李军祥 +4 位作者 张亚平 罗静 李太平 吴华 田海宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期445-448,共4页
本文用BclⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、PstⅠ、KpnⅠ、PvuⅡ共 6种限制性内切核酸酶 ,分析了 15尾青海湖裸鲤mtDNA的限制性片段长度多态性 ,共检测出 2 0个酶切位点 ,发现BclⅠ、BamHⅠ和PvuⅡ三种酶切类型具有多态性。根据不同个体mtDNA的酶切... 本文用BclⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、PstⅠ、KpnⅠ、PvuⅡ共 6种限制性内切核酸酶 ,分析了 15尾青海湖裸鲤mtDNA的限制性片段长度多态性 ,共检测出 2 0个酶切位点 ,发现BclⅠ、BamHⅠ和PvuⅡ三种酶切类型具有多态性。根据不同个体mtDNA的酶切类型 ,青海湖裸鲤存在 4种mtDNA单倍型 ,计算mtDNA多态度π值为 0 .0 0 43,初步认为青海湖裸鲤在线粒体DNA上存在较丰富的群体内变异。 展开更多
关键词 青海湖裸鲤 MTdna 限制性片段长度多态性 遗传多样性
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16S rDNA-RFLP技术鉴定西藏地区乳制品中的乳杆菌 被引量:16
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作者 于洁 孙志宏 +5 位作者 张家超 艾日登才次克 张彦斌 杨梅 孙天松 张和平 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期804-810,共7页
将16S rDNA PCR技术和RFLP技术相结合,对分离自乳制品中的乳杆菌进行分类和鉴定。从我国西藏地区传统发酵乳中分离出51株乳杆菌,采用通用引物扩增16S rDNA,利用限制性内切酶AluI,HaeⅢ和HinfⅠ将16S rDNA扩增产物进行酶切后,经聚丙烯酰... 将16S rDNA PCR技术和RFLP技术相结合,对分离自乳制品中的乳杆菌进行分类和鉴定。从我国西藏地区传统发酵乳中分离出51株乳杆菌,采用通用引物扩增16S rDNA,利用限制性内切酶AluI,HaeⅢ和HinfⅠ将16S rDNA扩增产物进行酶切后,经聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱将菌种鉴定到种的水平。根据16S rDNA-RFLP的结果从中选出8株有代表性的菌株进行生理生化实验和16S rDNA序列的测定,实验结果与RFLP鉴定结果相吻合,表明此方法是一种快速、准确的可用于大量乳杆菌分类和鉴定的方法。 展开更多
关键词 乳杆菌 鉴定 限制性片段长度多态性(RFLP) 16S Rdna序列
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浙江地方猪种线粒体DNA多态及遗传多样性研究 被引量:11
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作者 章胜乔 徐继初 +2 位作者 张亚平 傅衍 陈永久 《Zoological Research》 CAS CSCD 1998年第2期125-130,共6页
本实验用ApaⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、BclⅠ、BglⅠ、BglⅡ、ClaⅠ、DraⅠ、EcoRI、EcoRV、HaeⅡ、HincⅡ、HindⅢ、HpaⅠ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅠ、PvuⅡ、SacⅠ、SalⅠ... 本实验用ApaⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、BclⅠ、BglⅠ、BglⅡ、ClaⅠ、DraⅠ、EcoRI、EcoRV、HaeⅡ、HincⅡ、HindⅢ、HpaⅠ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅠ、PvuⅡ、SacⅠ、SalⅠ、ScaⅠ、SmaⅠ、StuⅠ、XbaⅠ和XhoⅠ等25种识别6个碱基对的限制性内切酶分析了浙江地方品种猪、浙江野猪等30个个体的线粒体DNA,共检出30种限制性态型(morph),可归结成3种单倍型,其中BamHⅠ-B、BclⅠ-B、DraⅠ-B和XbaⅠ-C为首次发现;各单倍型间平均遗传距离(p)为0.005,群体的平均多态度(π)为0.0008,均处于遗传多样性贫乏范围,提示浙江地区猪可能起源于一个共同的祖先。结合前人资料,对金华Ⅲ系猪进行分析,分析结果提示金华Ⅲ系猪可能有两个母系起源。 展开更多
关键词 线粒体 dna 限制性片段 多态性
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交河故城古车师人的线粒体DNA分析 被引量:11
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作者 崔银秋 段然慧 +4 位作者 季朝能 朱泓 李惟 毛裕民 周慧 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2002年第8期1510-1514,共5页
从距今 2 0 0 0~ 2 5 0 0年左右的交河故城古代人骨中提取古 DNA,用 4对重叠引物对线粒体基因组的调控区 (3 63 bp)进行了扩增及测序 .线粒体基因组编码区的扩增片段用于限制性片段多样性分析 .结果显示4个个体中具有 3个 DNA序列 ,其... 从距今 2 0 0 0~ 2 5 0 0年左右的交河故城古代人骨中提取古 DNA,用 4对重叠引物对线粒体基因组的调控区 (3 63 bp)进行了扩增及测序 .线粒体基因组编码区的扩增片段用于限制性片段多样性分析 .结果显示4个个体中具有 3个 DNA序列 ,其中来自不同墓穴的两个个体的序列相同 ,说明这两者间有密切的母系遗传关系 .系统发育分析表明古车师的这 4个个体分散分布在现代新疆维吾尔人的序列之中 .从这些结果可以初步得出结论 ,即古车师人群并不是一个同源群体 ,在早期铁器时代 。 展开更多
关键词 交河矿城 古车师人 线粒体 dna 测序 限制性片段多样性分析 系统发育分析 古人类学
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用DNA限制性片段长度多态性鉴定中国旋毛虫3个分离株 被引量:22
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作者 诸欣平 刘明远 +2 位作者 王凤云 周蕾 宋铭忻 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 1998年第2期101-105,共5页
以旋毛虫国际标准虫株T.spiralis(Ts)、T.nativa(Tn)和T.nelsoni(Tne)作对照,利用限制性片段长度多态性(RFLP)差异对分离自我国黑龙江省3株旋毛虫进行虫种归属鉴定。5种内切酶实验结... 以旋毛虫国际标准虫株T.spiralis(Ts)、T.nativa(Tn)和T.nelsoni(Tne)作对照,利用限制性片段长度多态性(RFLP)差异对分离自我国黑龙江省3株旋毛虫进行虫种归属鉴定。5种内切酶实验结果显示:黑龙江猪株(HL)与Ts酶切图谱相同;犬株(WC)与Tn酶谱相同;猫株(SW)与Tn的DraⅠ,PstⅠ,HaeⅢ酶谱相近,而与Tne酶谱差异显著。提示:黑龙江猪株系Ts;犬株系Tn;猫株在分类归属上似乎与Tn靠近。 展开更多
关键词 旋毛虫 限制性片段长度 多态性 虫种鉴定
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家养双峰驼线粒体DNA遗传多样性的研究 被引量:12
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作者 权洁霞 张亚平 +1 位作者 韩建林 门正明 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第5期383-390,共8页
利用ApaⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、BcⅠ、BglⅠ、BglⅡ、Dral、EcoRⅠ、EcoRⅤ、HindⅢ、 KpnⅠ、 PvuⅡ、 SacⅠ、 SalⅠ、ScaⅠ、 SmaⅠ、 XbaⅠ和 Xhol 18种限制性内切酶的... 利用ApaⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、BcⅠ、BglⅠ、BglⅡ、Dral、EcoRⅠ、EcoRⅤ、HindⅢ、 KpnⅠ、 PvuⅡ、 SacⅠ、 SalⅠ、ScaⅠ、 SmaⅠ、 XbaⅠ和 Xhol 18种限制性内切酶的 mtDNA限制 性片段长度多态(RFLP)分析,对我国双峰驼3个类群的遗传多样性及其亲缘关系进行了研 究。结果表明,在双峰驼mtDNA中未发现长度变异和个体内异质现象;从3个类群的87个个 体中,共检出了35种限制性态型,12种mtDNA单倍型,家驼群内核苷酸歧异度(π)为0.227%, 这表明我国的家驼在mtDNA水平存在较丰富的遗传多样性;单倍型分布的差异显著性检验 及单倍型的共享度分析表明,mtDNA在这3个类群之间没有明显的遗传分化,其较丰富的遗 传变异主要来自群体内的差异,与类群间的遗传分化关系不大;通过mtDNA单倍型间聚类分 析,可将家驼整个群体划分为A、B两大类,A型分布频率为94.26%,B型为5.74%,且其分化程 度较高,遗传距离(P)为0. 0464。 展开更多
关键词 双峰驼 线粒体dna RFLP 遗传资源
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大豆品种间DNA限制性片段长度多态性(RFLP)的分析 被引量:6
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作者 张德水 惠东威 +2 位作者 庄炳昌 杜保兴 陈受宜 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第4期486-490,共5页
用62个大豆DNA分子探针与5种限制性内切酶组合,对大豆基因组DNA限制性片段长度多态性(RFLP)进行分析。结果表明,所选用的两对材料,其多态性RFLP标记的频率均高达60%,可作为RFLP作图较理想的亲本;RFLP标记的多态性类型多数表现为共显性... 用62个大豆DNA分子探针与5种限制性内切酶组合,对大豆基因组DNA限制性片段长度多态性(RFLP)进行分析。结果表明,所选用的两对材料,其多态性RFLP标记的频率均高达60%,可作为RFLP作图较理想的亲本;RFLP标记的多态性类型多数表现为共显性,少数为显性,其中一些标记揭示了2个或2个以上的独立分离的基因座位;不同限制性内切酶在揭示多态性的能力上差异不显著,在杂交片段长度上差异显著并都大于预期值;大豆RFLP的形成主要是由DNA的重排所引起。 展开更多
关键词 多态性 大豆 品种间 dna RFLP
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板齿鼠线粒体DNA的研究 被引量:5
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作者 李菁菁 温硕洋 +2 位作者 戚根贤 谢以权 彭统序 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第1期54-59,共6页
本文应用ApaI、BamHI、BclI、BglI、ClaI、EcoRI、EcoRV、HindII、PstI、PvuII、SacI、ScaI和XbaI等13种限制性内切酶对板齿鼠线粒体DNA(mtDNA)进行限制性片段... 本文应用ApaI、BamHI、BclI、BglI、ClaI、EcoRI、EcoRV、HindII、PstI、PvuII、SacI、ScaI和XbaI等13种限制性内切酶对板齿鼠线粒体DNA(mtDNA)进行限制性片段长度多态(RFLP)分析,并用双酶解法构建其限制性内切酶图谱。结果表明板齿鼠存在3种mtDNA单倍型,可通过限制酶PvuII、HindII和ApaI区分,呈现DNA多态性和种内遗传变异。与小家鼠、褐家鼠mtDNA限制性片段的数据相比较,板齿鼠和这两种鼠mtDNA存在明显差异。板齿鼠mtDNA限制性内切酶图谱的建立,为进一步系统研究鼠科动物的遗传分化提供了依据。 展开更多
关键词 板齿鼠 线粒体dna 限制性内切酶 图谱 dna多态性
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家蚕卵线粒体DNA限制性内切酶长度多态性研究 被引量:9
11
作者 廖顺尧 刘运强 +2 位作者 鲁成 周泽扬 向仲怀 《西南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2001年第1期29-32,共4页
利用 2 9种限制性内切酶对 34个不同品种家蚕卵mtDNA进行酶切分析 ,发现一化、二化品种与多化品种的HaeⅢ酶切图谱有差异 ,但不同的地理品种间没有出现酶切多态性现象。另外 ,一些家蚕品种的受精卵和非受精卵mtDNA在BglⅠ和PstⅠ酶切下 ... 利用 2 9种限制性内切酶对 34个不同品种家蚕卵mtDNA进行酶切分析 ,发现一化、二化品种与多化品种的HaeⅢ酶切图谱有差异 ,但不同的地理品种间没有出现酶切多态性现象。另外 ,一些家蚕品种的受精卵和非受精卵mtDNA在BglⅠ和PstⅠ酶切下 ,呈现不同的酶切带型。同时 。 展开更多
关键词 家蚕 线粒体dna 限制性长度多态性 限制性内切酶 蚕卵
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不同宿主肝片吸虫DNA限制性片段长度多态性分析 被引量:6
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作者 徐恒 沈斌 +1 位作者 吴峰 刘世贵 《中国人兽共患病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1997年第6期26-28,共3页
本文首次对分离自黄牛、水牛和牦牛的肝片吸虫的基因组DNA,以BamHⅠ、BglⅡ、EcoRⅠ、HindⅢ和PStⅠ等6种限制性内切酶消化后进行琼脂糖电泳,分析比较它们基因组DNA的限制性片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,R... 本文首次对分离自黄牛、水牛和牦牛的肝片吸虫的基因组DNA,以BamHⅠ、BglⅡ、EcoRⅠ、HindⅢ和PStⅠ等6种限制性内切酶消化后进行琼脂糖电泳,分析比较它们基因组DNA的限制性片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,RFLP);同时用地高车标记的牦牛肝片吸虫基因组DNA为探针对不同宿主肝片吸虫DNA进行Southern印迹杂交,限制性内切酸酶切结果显示只有两种限制性内切酶(BamHⅠ和EcoRⅠ)在寄生于牦牛的肝片吸虫中检测到多态性,而水牛肝片吸虫与黄牛肝片吸虫基因组DNA之间没有检测到多态性,根据此结果计算了牦牛肝片吸虫与黄牛肝片吸虫和水牛肝片吸虫基因型间的遗传距离,Southern杂交结果显示牦牛肝片吸虫基因DNA的杂交谱带与黄牛肝片吸虫、水牛肝片吸虫基因组DNA的杂交港带存在一定的差异,本文的实验结果表明牦牛肝片吸虫与黄牛肝片吸虫、水牛肝片吸虫的亲缘关系相对较远,而水牛肝片吸虫与黄牛肝片吸虫的亲缘关系较近。 展开更多
关键词 肝片吸虫 dna RFLP 宿主
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5种笛鲷mtDNA及Cytb基因片段的RFLP比较 被引量:14
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作者 王中铎 刘楚吾 郭昱嵩 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期327-332,共6页
采用线粒体DNA限制性片段长度多态性分析(mtDNARFLP)和线粒体DNA的细胞色素b基因(Cytb)的部分序列扩增限制性片段长度多态性分析(mtDNAPCRRFLP)两种方法,对笛鲷属5种鱼类进行种间系统发育的比较研究,结果显示:(1)画眉笛鲷依照其形态学... 采用线粒体DNA限制性片段长度多态性分析(mtDNARFLP)和线粒体DNA的细胞色素b基因(Cytb)的部分序列扩增限制性片段长度多态性分析(mtDNAPCRRFLP)两种方法,对笛鲷属5种鱼类进行种间系统发育的比较研究,结果显示:(1)画眉笛鲷依照其形态学上体侧条带颜色差异,可分为褐带画眉笛鲷和黄带画眉笛鲷两个种;(2)千年笛鲷和星点笛鲷、褐带画眉笛鲷和黄带画眉笛鲷、金带笛鲷和金焰笛鲷之间遗传距离相对较近;(3)两种分析方法都可以为种的区分提供方便有效的分子标记;(4)两种分析方法在构建发育系统树上不完全一致。本文从mtDNA角度深入研究了南海海域笛鲷的系统发生,表明了mtDNA作为一种广泛应用的分子标记的实用性,同时也有一些潜在问题需要进一步研究。 展开更多
关键词 笛鲷属 线粒体dna限制性片段长度多态性分析 PCR-RFLP 系统发生 细胞色素B 假基因
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DNA修复基因XRCC1的399位点多态性同肺癌易感性关系的Meta分析 被引量:13
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作者 黄德生 何苗 周宝森 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 2006年第11期813-816,825,共5页
目的:综合评价DNA修复基因XRCC1(X-ray cross-complementing group 1)的399位点多态性同肺癌易感性的关系。方法:检索中国生物医学数据库和Medline,获得有关XRCC1基因399位点多态性同肺癌易感性关系的研究结果,并进行Meta分析。... 目的:综合评价DNA修复基因XRCC1(X-ray cross-complementing group 1)的399位点多态性同肺癌易感性的关系。方法:检索中国生物医学数据库和Medline,获得有关XRCC1基因399位点多态性同肺癌易感性关系的研究结果,并进行Meta分析。所有文献均采用病例对照研究,以非条件Logistic回归校正年龄、性别和吸烟状况等混杂因素后的OR值为效应指标,对文献进行评价筛选、异质性检验。利用Meta分析软件Rev Man 4.2对各研究原始结果进行统计处理,并计算合并OR值及其95%可信区间。结果:本次Meta分析共纳入15项研究,累计病例6818例,对照7610例。Arg/Gln和Gln/Gln等位基因同Arg/Arg比较,OR值分别为0.99(95% CI:0.91~1.06)和1.04(95% CI:0.92~1.17),Z值分别为-0.37和0.67,对应的P值分别为0.71和0.50。结论:尚无足够证据证明DNA修复基因XRCC1的399位点多态性同肺癌易感性有关。 展开更多
关键词 肺肿瘤 dna结合蛋白质类 多态性 限制性片段长度 比值比 META分析
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藏绵羊线粒体DNA遗传多样性研究 被引量:36
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作者 涂正超 张亚平 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第2期132-135,共4页
本文用ApaⅠ、AvaⅡ、BamHⅠ、BclⅡ、ClaⅠ、EcoRⅤ、HindⅢ、HpaⅠ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅡ、XbaⅠ、XhoⅠ等14种内切酶,分析了12头藏绵羊mtDNA的限制性片断长度多态性,共检测出... 本文用ApaⅠ、AvaⅡ、BamHⅠ、BclⅡ、ClaⅠ、EcoRⅤ、HindⅢ、HpaⅠ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅡ、XbaⅠ、XhoⅠ等14种内切酶,分析了12头藏绵羊mtDNA的限制性片断长度多态性,共检测出35个酶切位点,发现AvaⅡ、ClaⅠ、PvuⅡ三种酶切类型具有多态性。根据不同个体的mtDNA的酶切类型,发现藏绵羊存在三种mtDNA单倍型,计算mtDNA多态度π值为0.0012,表明藏绵羊mtDNA多态性比较贫乏。 展开更多
关键词 绵羊 遗传多样性 线粒体dna
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16S rDNA-RFLP法快速鉴定蒙古国传统乳制品中的乳酸菌 被引量:6
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作者 艾日登才次克 于洁 +4 位作者 杜晓华 李莉 王炜宏 孙天松 张和平 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2009年第2期63-68,共6页
以17株标准菌株为参照,采用限制性片段长度多态性(RFLP)分析和16S rDNA序列分析相结合的技术,对分离自蒙古国5个地区传统乳制品中的55株乳酸菌进行了快速鉴定。结果表明,通过限制性内切酶AluⅠ、HaeⅢ、BsmaⅠ、TspRⅠ和HinfⅠ的指纹图... 以17株标准菌株为参照,采用限制性片段长度多态性(RFLP)分析和16S rDNA序列分析相结合的技术,对分离自蒙古国5个地区传统乳制品中的55株乳酸菌进行了快速鉴定。结果表明,通过限制性内切酶AluⅠ、HaeⅢ、BsmaⅠ、TspRⅠ和HinfⅠ的指纹图谱分析,将49株乳杆菌和2株片球菌准确鉴定到种,其他4株肠球菌鉴定到属。采用16S rDNA-RFLP方法鉴定乳酸菌具有准确性,可靠性和高效性。 展开更多
关键词 乳酸菌 快速鉴定 限制性片段长度多态性(RFLP) 16S Rdna序列分析
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快速提取肠道微生物基因组DNA的方法 被引量:27
17
作者 金晶 彭颖 李晓波 《现代生物医学进展》 CAS 2007年第1期100-103,共4页
目的:肠道微生物的研究日益成为热点,如何获取高质量、较完整的肠道菌群基因组DNA是肠道微生物研究中的关键。本文通过对酚/氯仿法提取总DNA过程进行考察和优化,建立一种简便酚/氯仿抽提法。方法:考察和优化酚/氯仿法提取总DNA的过程,... 目的:肠道微生物的研究日益成为热点,如何获取高质量、较完整的肠道菌群基因组DNA是肠道微生物研究中的关键。本文通过对酚/氯仿法提取总DNA过程进行考察和优化,建立一种简便酚/氯仿抽提法。方法:考察和优化酚/氯仿法提取总DNA的过程,并根据DNA产量、纯度以及ERIC-PCR及16S rNDA-RFLP所反映的微生物群落结构特性的指标,并与QIAamp?DNA Stool Mini Kit提取的进行比较,评价了所建立的快速提取方法。结果:用简便酚/氯仿法得到基本完整的基因组DNA,ERIC-PCR和16S rDNA-RFLP结果与QIAamp?DNA Stool Mini Kit法基本相同。结论:该方法快速并成本低,适合肠道微生物研究中总DNA提取,尤其适合处理大批量的样品。 展开更多
关键词 肠道微生物 简便酚/氯仿抽提法 ERIC-PCR 16S r dna-RFLP
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稻属叶绿体DNA限制性片段长度多态性 被引量:4
18
作者 朱世华 王明全 汪向明 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 1999年第3期139-142,共4页
对稻属(oryza)的14个种和李氏禾属(Leersia)的2个种共138份材料进行了叶绿体DNA限制性片段长度多态性的分析。用内切酶EcoRI酶切、4个叶绿体DNA探针杂交,共发现1o种叶绿体DNA变异类型。在稻属各个种内没有观察到叶绿体DNA的变异,... 对稻属(oryza)的14个种和李氏禾属(Leersia)的2个种共138份材料进行了叶绿体DNA限制性片段长度多态性的分析。用内切酶EcoRI酶切、4个叶绿体DNA探针杂交,共发现1o种叶绿体DNA变异类型。在稻属各个种内没有观察到叶绿体DNA的变异,叶绿体DNA变异类型基本上以稻属的染色体组型水平划分,因此认为精属的叶绿体DNA在进化过程中变异程度很低。推测CCDD组的o.alta、o.grandiglumis和o.latifolia及CC组的o.officinals和o.eichingeri各有共同的原始祖先。遗传距离分析显示CC、CCDD、BBCC组之间亲缘关系很近,这3个组与EE组亲缘关系也较近。李氏禾属的2个种L.perrieri和L.tisseranti与稻属的遗传距离很远。 展开更多
关键词 稻属 李氏禾属 叶绿体dna 限制性片段长度
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中国人胃癌和正常组织基因组DNA中癌基因Ha-ras的限制性片段长度多态性研究 被引量:3
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作者 单祥年 严明 +3 位作者 黄鹰 茅一萍 王世浚 赵寿元 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1990年第2期154-160,共7页
本文报道以PHS-49为探针,分析了中国人群中36例胃癌患者癌组织和25位正常人体组织基因组DNA中Ha-ras基因的BamHI限制性片段长度多态性(RFLPs)。发现了10种不同长度的片段和18种基因型。其中4种小于6kb的BamHI片段是迄今国外未见报道的,... 本文报道以PHS-49为探针,分析了中国人群中36例胃癌患者癌组织和25位正常人体组织基因组DNA中Ha-ras基因的BamHI限制性片段长度多态性(RFLPs)。发现了10种不同长度的片段和18种基因型。其中4种小于6kb的BamHI片段是迄今国外未见报道的,这可能是中国人群遗传多态性的一个特征。此外,在胃癌组织中发现Ha-ras的一些稀有等位基因和基因型的频率明显高于正常人群。对两名胃癌患者家系中的11名成员也作了RFLPs分析,发现有些成员出现3条和4条限制性片段的杂合个体,表明这些个体的染色体上含有的Ha-ras基因不只一份拷贝。对上述现象的可能原因作了分析和讨论。 展开更多
关键词 胃癌 家系分析 rflps Ha-ras基因
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五种杨树叶绿体DNA的提取及RFLP分析 被引量:5
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作者 卢孟柱 卞祖娴 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 1992年第4期465-468,共4页
近几年,叶绿体DNA的研究越来越受到重视,因为叶绿体不仅是植物光合作用的器官,而且DNA分子结构紧凑,相对于核DNA而言,分子量小,结构简单,更易从分予水平上作精细分析。另外,叶绿体DNA具有稳定性、进化缓慢性及编码序列的保守性,因而是... 近几年,叶绿体DNA的研究越来越受到重视,因为叶绿体不仅是植物光合作用的器官,而且DNA分子结构紧凑,相对于核DNA而言,分子量小,结构简单,更易从分予水平上作精细分析。另外,叶绿体DNA具有稳定性、进化缓慢性及编码序列的保守性,因而是研究植物系统发育的好材料。虽然在许多植物中,叶绿体DNA分子非常保守。 展开更多
关键词 杨树 叶绿体 dna 提取 RFLP
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