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Isolation and Characterization of NBS-LRR Class Resistance Homologous Gene from Wheat 被引量:3
1
作者 ZHANG Nan WANG Shen WANG Hai-yan LIU Da-qun 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2011年第8期1151-1158,共8页
One resistance gene analog fragment named RGA-CIN14 was isolated from TcLr19 wheat,which contains kinase-2,kinase-3a,and the GLPL motif of the NBS-spanning region,using degenerated primers according to the nucleotide ... One resistance gene analog fragment named RGA-CIN14 was isolated from TcLr19 wheat,which contains kinase-2,kinase-3a,and the GLPL motif of the NBS-spanning region,using degenerated primers according to the nucleotide binding site (NBS) conserved domain.Based on the RGA-CIN14,a full-length cDNA,CIN14,which was 2 987 bp encoding 880 amino acids,was obtained by using the method of the rapid amplification cDNA ends (RACE).Bioinformatics analysis showed that the deduced amino acids of CIN14 protein consisted of a NB-ARC conserved domain and many leucine-rich repeats (LRR) domains.The phylogenetic tree analysis indicated a considerable identity of the protein encoded by CIN14 with that of wheat leaf rust resistance gene Lr1,but a lower similarity with Lr21.The expression profile of the CIN14 gene detected by semi-quantitative RT-PCR showed that the CIN14 gene was not induced by Puccinia triticina and it was a constitutive gene with low abundance in the wheat leaf tissue.The resistance homology sequence was successfully obtained,which provides the shortcut for cloning of the resistance gene in TcLr19 wheat. 展开更多
关键词 wheat leaf rust resistance gene NBS-LRR resistance gene analogs rgas) rapid amplification cDNA end (RACE) RT-PCR
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Identification and Cloning of Resistance Gene Analogues (RGAs) Encoding NBS-LRR Proteins from Gossypium arboreum L.
2
作者 AZHAR Muhammad Tehseen BASHIR Aftab BRIDDON Rob W MANSOOR Shahid 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期42-,共1页
Plants have developed a complicated defense mechanism during evolution to resist the harmful pathogens they encountered.The mechanism involves the interaction of the plant resistance(R)
关键词 NBS Encoding NBS-LRR Proteins from Gossypium arboreum L Identification and Cloning of resistance gene analogues LRR rgas
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Cloning and Characterization of a Family of Disease Resistance Gene Analogs from 6VS of Haynaldia villosa
3
作者 KONG Fan-jing, MA You-zhi, CHEN Xiao and XIN Zhi-yong(Institute of Crop Breeding and Cultivation , Chinese Academy of Agricultural Sciences , Beijing 100081,P. R. China Open Laboratory of Saline Lake Resources and Environment of Ministryof Land and Resources , Beijing 100037 , P.R. China) 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2003年第8期937-942,共6页
In the present study, microdissection of 6VS and the cloning of the resistance gene analogs(RGA)from them were reported. The 6VS were microdissected with needle and 10 types of resistance gene analogs were obtained by... In the present study, microdissection of 6VS and the cloning of the resistance gene analogs(RGA)from them were reported. The 6VS were microdissected with needle and 10 types of resistance gene analogs were obtained by PCR with degenerate oligonucleotide primer designed according to resistance genes. They were designated as Hvrgak1-Hvrgak10, GenBank accession numbers are AF387113-AF387121, AY040671- AY040672. Identity among RGAs was about 10-50%, and identity with cloned R gene from plants was 5-20%. Southern hybridization analysis results showed 3 RGAs, Hvrgak2, Hvrgak4, and Hvr-gak5 were linked with wheat powdery mildew resistance. These RGAs may be used as direct entrance or probes for cloning the disease resistance genes. 展开更多
关键词 6VS of Haynaldia Villosa MICRODISSECTION resistance gene analogs(rga) CLONING
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大豆品种RGA分析与疫霉根腐病抗性鉴定 被引量:9
4
作者 孙石 赵晋铭 +5 位作者 武晓玲 郭娜 王源超 唐卿华 盖钧镒 邢邯 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1704-1711,共8页
采用7个具有不同毒性基因的大豆疫霉菌株,对黄淮地区48个优良大豆种质资源进行了苗期接种鉴定,筛选出一批具有不同抗性的优异抗源,说明黄淮地区蕴藏着丰富的大豆抗病资源。以相似系数0.682聚类,48个大豆品种可以分成8类。同时,根据抗病... 采用7个具有不同毒性基因的大豆疫霉菌株,对黄淮地区48个优良大豆种质资源进行了苗期接种鉴定,筛选出一批具有不同抗性的优异抗源,说明黄淮地区蕴藏着丰富的大豆抗病资源。以相似系数0.682聚类,48个大豆品种可以分成8类。同时,根据抗病基因在保守区域序列同源性的原理,利用RGA-PCR方法对48个品种的遗传多样性进行分析,从48个大豆品种的抗病基因同源序列中共扩增出53条谱带,各品种之间谱带较清晰且呈现明显的多态性,以相似系数0.746聚类,48个大豆品种可以分成7类。尽管抗性表型和RGA聚类的类与类之间没有一一对应关系,但抗谱广的品种,能较好地聚在一类,如丰收黄、科丰36、即墨油豆等。因此,综合利用抗性表型和RGA分析可以为大豆疫霉根腐病抗性基因鉴定、品种的培育和合理布局提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 大豆 抗病基因同源序列分析 多态性 抗性鉴定
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小麦钙依赖蛋白激酶基因TaCDPK17的克隆及其抗逆功能初步分析
5
作者 甘露 谢美娟 +5 位作者 卢振华 李明 丁博 邱丽娜 谢晓东 王俊斌 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期1-8,共8页
为探究钙依赖蛋白激酶(CDPK)在小麦生长和逆境应答中的作用,从普通小麦中克隆了TaCDPK17基因,并对其进行了序列结构、表达模式和抗逆功能初步分析。结果表明,TaCDPK17基因编码区长1701 bp,编码566个氨基酸,具有CDPK家族的典型结构特征,... 为探究钙依赖蛋白激酶(CDPK)在小麦生长和逆境应答中的作用,从普通小麦中克隆了TaCDPK17基因,并对其进行了序列结构、表达模式和抗逆功能初步分析。结果表明,TaCDPK17基因编码区长1701 bp,编码566个氨基酸,具有CDPK家族的典型结构特征,包括1个保守的丝氨酸/苏氨酸激酶结构域和4个EF手型结构域。对TaCDPK17与其他12种植物的CDPK17进行进化树分析表明,TaCDPK17与禾本科作物,特别是节节麦、大麦的CDPK17序列有较高同源性。TaCDPK17基因启动子区域富含与激素调控、光照响应,以及非生物应答胁迫相关的顺式调控元件,其中,脱落酸(ABA)响应元件(ABRE)和茉莉酸甲酯响应元件(CGTCA)数量较多。基于实时荧光定量PCR的表达分析结果显示,TaCDPK17受100μmol/L ABA、100μmol/L茉莉酸甲酯、20%PEG6000和250 mmol/L NaCl诱导后,表达量有不同程度升高。在2μmol/L ABA和100 mmol/L NaCl胁迫处理条件下,过表达TaCDPK17的拟南芥种子萌发率显著高于野生型对照。同时,过表达TaCDPK17缓解了ABA或渗透胁迫处理对幼苗根生长的抑制作用。在气孔关闭过程中,过表达TaCDPK17的转基因植物对ABA更敏感,与野生型植物相比,表现出更强的气孔关闭趋势。这些结果表明,TaCDPK17在小麦逆境胁迫和激素信号应答中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 小麦 钙依赖蛋白激酶 基因克隆 表达分析 抗逆
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小麦抗病基因同源序列(RGAs)的克隆与分析(英文) 被引量:9
6
作者 刘松青 何莎 +3 位作者 蒋芳 韦先超 周翰林 涂睿 《中国农学通报》 CSCD 2007年第3期83-88,共6页
RGA(抗性基因同源序列)法是克隆植物抗性基因的一种经济有效的方法,成为近年来的研究热点。本实验综合分析了拟南芥,西红柿,水稻,烟草等植物已克隆的抗性基因,并以这些抗性基因的NBS(核酸结合位点),LRR(富含亮氨酸重复),STK(丝氨酸/苏... RGA(抗性基因同源序列)法是克隆植物抗性基因的一种经济有效的方法,成为近年来的研究热点。本实验综合分析了拟南芥,西红柿,水稻,烟草等植物已克隆的抗性基因,并以这些抗性基因的NBS(核酸结合位点),LRR(富含亮氨酸重复),STK(丝氨酸/苏氨酸激酶)保守结构域设计并合成了几十对RGA引物,对小麦抗条锈病材料进行PCR扩增,获得以Xal-NBS为引物的R88RGA片段,经克隆和序列比对分析,发现该片段与逆境条件下植物抗病信号传导相关,与蛋白激酶同源性达到96%。此项研究对抗病机理的研究和基因的发掘有重要的指导意义。 展开更多
关键词 抗病基因同源序列(rgas) 克隆 小麦
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黄瓜RGA基因的半定量RT-PCR表达分析 被引量:6
7
作者 丁国华 许春梅 +2 位作者 于虹 周秀艳 秦智伟 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期659-664,共6页
以黄瓜(Cucumis sativusL.)抗霜霉病品种东农129为材料,利用RT-PCR半定量法研究了接种霜霉病菌(Pseudoperonospora cubensisRostow)、喷施水杨酸(SA)和氯化钙(CaCl2)等不同处理对黄瓜抗病基因类似序列(RGA)表达的影响.结果表明:CsRGA1和... 以黄瓜(Cucumis sativusL.)抗霜霉病品种东农129为材料,利用RT-PCR半定量法研究了接种霜霉病菌(Pseudoperonospora cubensisRostow)、喷施水杨酸(SA)和氯化钙(CaCl2)等不同处理对黄瓜抗病基因类似序列(RGA)表达的影响.结果表明:CsRGA1和CsRGA5基因的表达受霜霉病菌的侵染而启动或加强,外施SA和CaCl2都能够增强其表达;CsRGA4和CsRGA8属于组成型表达基因,其表达可能与霜霉病菌的侵染无关;CsRGA2的表达与外施SA和CaCl2缺乏密切关联. 展开更多
关键词 黄瓜 抗病基因类似序列 半定量RT-PCR 表达分析
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RGA法克隆候选抗病基因的研究进展 被引量:15
8
作者 徐兵强 杜中军 黄俊生 《分子植物育种》 CAS CSCD 2004年第3期421-428,共8页
RGA法是克隆植物抗病基因的一条新途径,也是近年来分子生物学领域的一个研究热点并受到植物病理学家广泛地关注。其作用原理是根据已克隆植物抗病基因的保守结构域设计简并引物,扩增获得RGAs,然后分析RGAs与抗病基因的关系,确定候选抗... RGA法是克隆植物抗病基因的一条新途径,也是近年来分子生物学领域的一个研究热点并受到植物病理学家广泛地关注。其作用原理是根据已克隆植物抗病基因的保守结构域设计简并引物,扩增获得RGAs,然后分析RGAs与抗病基因的关系,确定候选抗病基因并从而获得新的抗病基因。研究还发现,已克隆的RGAs与R基因紧密连锁。最近获得的RGAs主要是根据NBS-LRR和STK两种保守结构域而得到的。前者在植物基因组中广泛存在,而后者在植物信号传导中具有重要作用。为此,本文主要对上述两种保守结构域的结构特点和所获得的RGAs特点以及RGA法的应用前景进行了综述,以期让人们对RGA法有更进一步的认识。 展开更多
关键词 rga法克隆 抗病基因 分子生物学 作用原理 植物
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水稻品种RGA分析与抗瘟性鉴定 被引量:4
9
作者 李晔 范静华 +1 位作者 何月秋 朱有勇 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期11-15,共5页
根据抗病基因在保守区域序列同源的原理,利用RGA方法对云南省主要栽培品种和地方资源品种的遗传多样性进行了分析。从22个水稻品种的抗病基因同源序列中,共扩增出155条谱带,各品种之间谱带较清晰呈现明显的多态性,聚类分析结果可以明显... 根据抗病基因在保守区域序列同源的原理,利用RGA方法对云南省主要栽培品种和地方资源品种的遗传多样性进行了分析。从22个水稻品种的抗病基因同源序列中,共扩增出155条谱带,各品种之间谱带较清晰呈现明显的多态性,聚类分析结果可以明显将品种的抗感水平分开,也与温室人工接种试验结果相似。因此,利用RGA分析可以为水稻品种抗瘟性鉴定提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 水稻 抗病基因同源序列分析 多态性 抗性鉴定
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小麦抗白粉病基因Pm4b的RGA分析 被引量:3
10
作者 胡楠 伊艳杰 +2 位作者 刘红彦 柴春月 刘新涛 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第21期6379-6380,6430,共3页
为克隆抗性基因和发展Pm4b的特异分子标记奠定基础。利用10对RGA引物,对小麦抗白粉病基因的一些载体品种(系)进行扩增,将引物对R11F/R11R从Pm4b基因的载体品种VPM中扩增出的稳定多态性条带回收、克隆、测序,获得与小麦Pm4b基因的相关抗... 为克隆抗性基因和发展Pm4b的特异分子标记奠定基础。利用10对RGA引物,对小麦抗白粉病基因的一些载体品种(系)进行扩增,将引物对R11F/R11R从Pm4b基因的载体品种VPM中扩增出的稳定多态性条带回收、克隆、测序,获得与小麦Pm4b基因的相关抗病基因的同源片段,并对不同的小麦Pm基因载体品系作了检测分析。该稳定多态性条带全长1 321 bp。序列分析表明这个片段属于RGA类序列。用该标记检测小麦不同Pm基因载体品种(系),发现该多态性片段仅出现在Pm4b基因载体品种中。该研究可为分离抗性基因和发展Pm4b的特异分子标记奠定基础。 展开更多
关键词 小麦 白粉病 抗病基因 rga标记 序列分析
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小麦NBS类抗病相关基因片段RGA-A的初步研究 被引量:1
11
作者 张立荣 齐爱勇 +1 位作者 杨文香 刘大群 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第9期81-84,共4页
利用同源序列法分离小麦抗病相关基因同源序列。根据已经克隆的抗病基因保守结构NBS区设计引物,采用RT-PCR方法对小麦抗叶锈病近等基因系材料TcLr24进行扩增。获得了一条525bp条带RGA-A,通过BLASTp比较,序列中含有典型的NBS保守结构域,... 利用同源序列法分离小麦抗病相关基因同源序列。根据已经克隆的抗病基因保守结构NBS区设计引物,采用RT-PCR方法对小麦抗叶锈病近等基因系材料TcLr24进行扩增。获得了一条525bp条带RGA-A,通过BLASTp比较,序列中含有典型的NBS保守结构域,与很多已知植物抗病基因的功能相应区域一致,编码的蛋白与大麦中抗性蛋白亲缘关系较近。半定量RT-PCR分析表明,RGA-A受叶锈菌诱导表达,表明该基因在小麦叶片中与抗叶锈性相关。该NBS类抗病基因相关片段的获得为研究小麦抗病基因奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦抗叶锈病基因 抗病基因类似物(rga) 同源基因
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香蕉抗病种质NBS类RGAs的克隆及相关序列差异分析
12
作者 徐金刚 向旭 +2 位作者 蔡礼鸿 孟祥春 黄秉智 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第S1期200-209,共10页
根据植物NBS类抗病基因保守氨基酸序列P-loop和疏水氨基酸GLPL保守序列设计简并引物,从香蕉抗镰刀菌枯萎病(4号小种)材料GCTCV-119的基因组DNA及cDNA中扩增获得9个DNA片段和10条cDNA片段,均编码为通读的氨基酸序列,命名为"BR-1&quo... 根据植物NBS类抗病基因保守氨基酸序列P-loop和疏水氨基酸GLPL保守序列设计简并引物,从香蕉抗镰刀菌枯萎病(4号小种)材料GCTCV-119的基因组DNA及cDNA中扩增获得9个DNA片段和10条cDNA片段,均编码为通读的氨基酸序列,命名为"BR-1"-"BR-19",GenBank登录号依次为EF515833-EF515836, EU123871-EU123885。同源性分析表明,均与已报道的植物抗病基因有不同程度的同源性,具有P-loop(Kinase-1a)、Kinase-2、RNBS-B(Kinase-3a)以及GLPL等保守氨基酸序列,属于non-TIR-NBS类候选抗病基因。其中,BR-5和BR-6与番茄抗镰刀菌枯萎病番茄专化型I2、I2-1和I2-2基因聚为一类,可能与香蕉镰刀菌枯萎病的抗性相关。 展开更多
关键词 香蕉 抗病种质 抗病基因类似物(rga) 核苷酸结合位点(NBS)
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一个大豆孢囊线虫抗性相关基因RGA的克隆
13
作者 陈观水 潘大仁 周以飞 《分子植物育种》 CAS CSCD 2006年第1期29-34,共6页
大豆是主要的油料作物,起源于中国,在我国种质资源十分丰富。大豆孢囊线虫(SCN)(HeteroderoglycinesIchinohe)是一种土传的定居性内寄生线虫,不易防治,常引起大豆黄萎病等病害,是大豆生产上危害最大的病害之一。大豆孢囊线虫病生理小种... 大豆是主要的油料作物,起源于中国,在我国种质资源十分丰富。大豆孢囊线虫(SCN)(HeteroderoglycinesIchinohe)是一种土传的定居性内寄生线虫,不易防治,常引起大豆黄萎病等病害,是大豆生产上危害最大的病害之一。大豆孢囊线虫病生理小种多达十几种,在我国,大豆孢囊线虫病病原主要为3、4号生理小种。大豆抗孢囊线虫的研究一直是世界上大豆抗病育种研究的热点之一。在本课题的前期研究中,根据已克隆的植物抗孢囊线虫病基因的保守序列设计引物,对经常规鉴定为抗(感)孢囊线虫3号生理小种的15个大豆品种基因组DNA进行PCR扩增,在大豆抗病品种中获得一条大豆抗孢囊线虫的特异条带。本研究在此基础上利用该对引物,对高抗孢囊线虫3号小种的北京小黑豆基因组DNA进行扩增,并克隆了特异扩增片段,命名为RSCN3,经测序及BLAST分析,发现其DNA序列与GenBank、EMBL、DDBJ、PDB中的大豆似受体激酶RHG4、水稻TMK(leucinerichprotein,receptor-likekinase)基因等均有80%以上的同源性。根据该DNA序列推测其氨基酸序列,在其序列中共找到21个亮氨酸,将该序列与蛋白质序列同源性进行比较,结果发现与植物中的受体激酶、富含亮氨酸重复的蛋白激酶有较高的同源性。因此推测RSCN3克隆片断为一个与受体激酶有类似作用的抗病相关基因的RGA,并将该序列登录到GenBank中,登录号为:AY580161。 展开更多
关键词 大豆 孢囊线虫 抗病基因同源序列 基因克隆
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小麦抗叶锈近等基因系TcLr38 RGAs分析 被引量:3
14
作者 王文霞 宋志强 +1 位作者 杨文香 刘大群 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2009年第19期222-227,共6页
为获得Lr38的抗病类似物质,寻找与抗病基因表达相关的目的片段。根据已知植物抗病基因的NBS-LRR(核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复)类保守区域设计简并引物,应用RGA技术在小麦的未知基因cDNA中扩增和分离抗病基因同源序列。从小麦抗叶锈... 为获得Lr38的抗病类似物质,寻找与抗病基因表达相关的目的片段。根据已知植物抗病基因的NBS-LRR(核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复)类保守区域设计简并引物,应用RGA技术在小麦的未知基因cDNA中扩增和分离抗病基因同源序列。从小麦抗叶锈近等基因系TcLr38中获得了9个小麦抗病基因同源片段D-8、A-5、B-20、C-6、F-16、A-4、B-9、C-4和D-12。经BLASTp分析,9个片段都含有NB-ARC保守结构域,其中D-8、A-5、B-20、C-6、A-4、B-9、C-4和D-12与已知抗病基因的相应区域相一致,具有抗病基因NBS特征结构域激酶2a(Kinase-2a)、激酶3a(Kinase-3a)和疏水结构域(HD)。片段D-8、A-5、B-20、C-6、A-4、B-9、C-4和D-12可能与抗病基因表达相关。 展开更多
关键词 小麦叶锈 TcLr38 NBS—LRR 抗病基因同源序列
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水稻白叶枯病候选抗性基因SHNLR的RGAs克隆及分析 被引量:1
15
作者 张颖 王长春 +3 位作者 胡海涛 张维林 严成其 杨玲 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期51-57,共7页
旨在从含有疣粒野生稻抗白叶枯病基因的新种质SH5、SH76基因组中克隆抗病基因。利用RGAs法得到1个NBS-LRR类同源基因,暂命名为SHNLR(登录号为JF934724)。结果表明,SHNLR的开放阅读框长度为3 105 bp,编码1 034个氨基酸,含有CC、NB-ARC与... 旨在从含有疣粒野生稻抗白叶枯病基因的新种质SH5、SH76基因组中克隆抗病基因。利用RGAs法得到1个NBS-LRR类同源基因,暂命名为SHNLR(登录号为JF934724)。结果表明,SHNLR的开放阅读框长度为3 105 bp,编码1 034个氨基酸,含有CC、NB-ARC与LRR结构域,具备CC-NBS-LRR类植物抗病基因的结构特征。BLASTn和BLASTp比对显示SHNLR是单拷贝基因,未发现同源性较高且功能已知的基因,仅NBS保守域序列与番茄Prf基因的相似度最高。对SHNLR基因电子定位,发现其位于水稻第11号染色体的长臂末端,但与11号染色体上已定位或克隆的8个白叶枯病抗性基因具有不同序列或处于不同的位置。半定量RT-PCR分析表明,SHNLR在抗病新种质叶片中的表达明显受到白叶枯病菌Zhe173的诱导。因此推测SHNLR可能是1个与抗白叶枯病相关的R基因。 展开更多
关键词 rgas法 水稻 白叶枯病抗性基因 克隆 表达分析
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水稻品种多样性遗传分析与稻瘟病控制(英文) 被引量:24
16
作者 朱有勇 孙雁 +6 位作者 王云月 李炎 何月秋 何霞红 Christopher C.Mundt Tom W.Mew Hei Leung 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第7期707-716,共10页
以 2个籼型杂交稻———汕优 6 3(A)和汕优 2 2 (B)、2个地方糯稻品种———黄壳糯 (C)和紫糯 (D)和 3个粳稻品种———合系 4 1(E)、楚粳 12 (F)和 812 6 (G)为材料进行抗病基因同源序列 (ResistanceGeneAnalogue ,RGA)遗传分析。结果... 以 2个籼型杂交稻———汕优 6 3(A)和汕优 2 2 (B)、2个地方糯稻品种———黄壳糯 (C)和紫糯 (D)和 3个粳稻品种———合系 4 1(E)、楚粳 12 (F)和 812 6 (G)为材料进行抗病基因同源序列 (ResistanceGeneAnalogue ,RGA)遗传分析。结果表明 ,杂交稻品种间以及粳稻品种间的抗性遗传较为相似 ,其相似系数分别为 0 86和 0 84。糯稻品种间以及糯稻、杂交稻和粳稻间的抗性遗传差异较大 ,相似系数为 0 4 5。聚类分析表明 ,RGA结果与品种的系谱来源相吻合 ,与品种的田间抗性基本一致。根据品种的抗性遗传差异、农艺性状和经济性状的不同 ,在云南籼稻区的建水和石屏县以及温暖粳稻区的泸西县分别选用 5种 (A/C、A/D、B/C、B/D和A/B)和 2种 (E/C和E/F/G)不同的品种组合进行品种多样性混合间栽控制稻瘟病田间试验 ,结果表明 ,抗性遗传差异大 (相似性 :0 4 5~ 0 77)的 5个品种混合间栽组合对稻瘟病有极为显著的控制效果 ,尤其是在混合间栽中高度感病的优质地方稻品种稻瘟病的发病率、病情指数均有极显著的下降 ,防治效果达 5 4 4 7%~ 92 18% ;遗传差异较小 (相似性 :0 84~ 0 90 )的 2个混栽组合混栽对稻瘟病的控制效果不明显 ,稻瘟病的防治效果在 15 12 %~ 2 5 5 4 %。此外 。 展开更多
关键词 水稻 遗传多样性 抗病基因同源序列 稻瘟病控制
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海岛棉NBS类型抗病基因类似物的起源、多样性及进化 被引量:21
17
作者 涂礼莉 张献龙 +2 位作者 朱龙付 聂以春 郭小平 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1071-1077,共7页
利用已克隆植物的R基因NBS序列中保守模体合成简并引物 ,以海岛棉品系Pima 90 (Gossypiumbarba dense)基因组DNA为模板进行PCR扩增 ,通过T A克隆、测序和序列比较分析共得到 31条RGAs ,其中 1 9条具有连续的ORF。利用海岛棉的 31条RGAs... 利用已克隆植物的R基因NBS序列中保守模体合成简并引物 ,以海岛棉品系Pima 90 (Gossypiumbarba dense)基因组DNA为模板进行PCR扩增 ,通过T A克隆、测序和序列比较分析共得到 31条RGAs ,其中 1 9条具有连续的ORF。利用海岛棉的 31条RGAs与GenBank中陆地棉种质系M 2 4 9(Gossypiumhirsutum)的RGAs进行了比较分析 ,RGAs可分为两大类 :其中第Ⅰ类全部为陆地棉的RGAs;第Ⅱ类分别包括了陆地棉和海岛棉的RGAs。同时对海岛棉RGAs的核苷酸和氨基酸序列进行系统发育树分析 ,表明海岛棉RGAs可分为TIR(DrosophilaTollorhumaninter leukinreceptor like)和non TIR两类 ,与前人所报道的R基因进化一致。对 1 9条具有连续ORF的RGAs进行了结构分析 ,结果表明它们包括P loop、Kin 2、“PLAL”及Meyers等所定义的RNBS A、B、C 3个模体。结果表明 。 展开更多
关键词 NBS 抗病基因类似物 棉花 多样性 进化
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甘薯NBS类抗病基因类似物的分离与序列分析 被引量:26
18
作者 陈观水 周以飞 +1 位作者 林生 潘大仁 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期359-365,共7页
利用已克隆植物抗病基因NBS(Nucleotidebindingsite)序列中的保守模体(motif)“P-loop”和“GLPL”合成简并引物,以甘薯(Ipomoeabatatas)栽培品种青农2号基因组DNA为模板进行PCR扩增,通过T/A克隆、测序和序列分析,共得到15条具有连续OR... 利用已克隆植物抗病基因NBS(Nucleotidebindingsite)序列中的保守模体(motif)“P-loop”和“GLPL”合成简并引物,以甘薯(Ipomoeabatatas)栽培品种青农2号基因组DNA为模板进行PCR扩增,通过T/A克隆、测序和序列分析,共得到15条具有连续ORF的抗病基因类似物(Resistancegeneanalogues,RGAs)序列,它们之间核苷酸序列间的相似性系数在41.2%-99.4%之间,而相应推测的氨基酸序列间的相似性系数在20.6%-100%之间,同时对分离的RGAs的核苷酸和氨基酸序列进行系统发育树分析,表明甘薯RGAs可分为TIR(DrosophilaTollorhumaninterleukinreceptor-like)和nonTIR两类。对甘薯RGAs和5个已克隆植物NBS的氨基酸序列进行结构分析表明,它们包括“P-loop”、“Kinase-2”、“Kinase-3a”“、GLPL”4个抗病基因所共有的保守模体。这些表明甘薯与其它物种的NBS类RGAs可能具有同样的起源和进化机制。 展开更多
关键词 甘薯 NBS 抗病基因类似物 基因分离 序列分析
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小麦条锈病和白粉病成株抗性研究进展与展望 被引量:113
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作者 何中虎 兰彩霞 +3 位作者 陈新民 邹裕春 庄巧生 夏先春 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期2193-2215,共23页
利用成株抗性是小麦抗病育种的重要方向,本文综述了小麦条锈病和白粉病成株抗性鉴定方法、基因定位和克隆及其在育种中的应用。将报道的72个条锈病成株抗性数量性状遗传位点(quantitative trait loci,QTL)和82个白粉病成株抗性QTL整合... 利用成株抗性是小麦抗病育种的重要方向,本文综述了小麦条锈病和白粉病成株抗性鉴定方法、基因定位和克隆及其在育种中的应用。将报道的72个条锈病成株抗性数量性状遗传位点(quantitative trait loci,QTL)和82个白粉病成株抗性QTL整合到一张连锁图谱上,控制2种病害的基因簇(≥5个QTL)有8个,其中位于7DS的Yr18/Lr34/Pm38和1BS的Yr29/Lr46/Pm39对条锈病、叶锈病和白粉病均表现成株抗性,位于4DL的Yr46/Lr67位点可能也对白粉病表现成株抗性,Yr18/Lr34/Pm38和Yr36已被克隆,Yr29/Lr46/Pm39的克隆已取得良好进展,为培育兼抗和成株抗性相结合的品种提供了可用基因。总结了成株抗性在中国小麦育种中的应用现状,并用实例证实了培育成株抗性品种的可行性,建议对兼抗条锈病和白粉病成株抗性的咸农4号和小偃6号等进行遗传分析,育种工作者和品种审定部门需要转变观念,将成株抗性利用作为国内条锈病和白粉病抗性育种的重要内容。 展开更多
关键词 小麦 条锈病 白粉病 成株抗性 分子定位 基因克隆
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小麦NBS-LRR类抗病基因同源序列的分离与鉴定 被引量:14
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作者 黄萱 徐子勤 +1 位作者 陈立余 王健 《分子细胞生物学报》 CSCD 北大核心 2006年第2期91-96,共6页
根据已知植物抗病基因的保守区域设计引物,从抗锈病小麦品种西农88基因组DNA扩增出3条与植物抗病基因同源的序列,分别为WRGA1、WRGA2和WRGA14。这三条同源片段均含有典型的NBS-LRR类抗病基因所拥有的保守性结构域Kinase-2a、Kinase-3a... 根据已知植物抗病基因的保守区域设计引物,从抗锈病小麦品种西农88基因组DNA扩增出3条与植物抗病基因同源的序列,分别为WRGA1、WRGA2和WRGA14。这三条同源片段均含有典型的NBS-LRR类抗病基因所拥有的保守性结构域Kinase-2a、Kinase-3a和疏水结构域(HD).它们与部分已知NBS-LRR类抗病基因的氨基酸序列同源性为46.0%-9.9%,三个片段间在氨基酸水平上的同源性为80.7%-56.8%。Northern杂交表明WRGA1在小麦中受水杨酸正调控,属诱导型表达。 展开更多
关键词 小麦 NBS—LRR 同源克隆技术 抗病基因同源序列 水杨酸
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