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通过生物信息学验证RN1H4基因预测尤文肉瘤患者预后的作用
1
作者
孙楷
王春燕
于壮
《临床医学进展》
2022年第3期1758-1768,共11页
尤文肉瘤是恶性程度极高的骨原发肿瘤,好发于儿童和青少年。尤文肉瘤预后极差,具有高度的侵袭性,在青少年儿童肿瘤发病率中排在第二位。我们基于GEO数据库(Gene Expression Omnibus)中尤文肉瘤相关的数据,构建了一个由7个基因构成的风...
尤文肉瘤是恶性程度极高的骨原发肿瘤,好发于儿童和青少年。尤文肉瘤预后极差,具有高度的侵袭性,在青少年儿童肿瘤发病率中排在第二位。我们基于GEO数据库(Gene Expression Omnibus)中尤文肉瘤相关的数据,构建了一个由7个基因构成的风险分数计算模型。该模型联合年龄性别构建的预测模型可用于预测患者预后。在该风险分数计算模型中,筛选出了RN1H4基因。该基因在高风险组中显著表达。RN1H4高表达患者预后较差,辅助T细胞、单核细胞、中性粒细胞和树突细胞的浸润和RN1H4基因的表达量具有显著相关性。这些细胞浸润丰度也显著影响了病人预后。我们又检测了RN1H4基因高低表达两组差异基因。对差异基因做了GO和KEGG分析,预测了RN1H4在尤文肉瘤中发挥的作用。揭示了RN1H4在尤文肉瘤中的作用机制。
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关键词
生物信息学
尤文肉瘤
预后
rn1h4
GEO数据库
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职称材料
题名
通过生物信息学验证RN1H4基因预测尤文肉瘤患者预后的作用
1
作者
孙楷
王春燕
于壮
机构
青岛大学附属医院
潍坊市坊子区人民医院
出处
《临床医学进展》
2022年第3期1758-1768,共11页
文摘
尤文肉瘤是恶性程度极高的骨原发肿瘤,好发于儿童和青少年。尤文肉瘤预后极差,具有高度的侵袭性,在青少年儿童肿瘤发病率中排在第二位。我们基于GEO数据库(Gene Expression Omnibus)中尤文肉瘤相关的数据,构建了一个由7个基因构成的风险分数计算模型。该模型联合年龄性别构建的预测模型可用于预测患者预后。在该风险分数计算模型中,筛选出了RN1H4基因。该基因在高风险组中显著表达。RN1H4高表达患者预后较差,辅助T细胞、单核细胞、中性粒细胞和树突细胞的浸润和RN1H4基因的表达量具有显著相关性。这些细胞浸润丰度也显著影响了病人预后。我们又检测了RN1H4基因高低表达两组差异基因。对差异基因做了GO和KEGG分析,预测了RN1H4在尤文肉瘤中发挥的作用。揭示了RN1H4在尤文肉瘤中的作用机制。
关键词
生物信息学
尤文肉瘤
预后
rn1h4
GEO数据库
分类号
R738.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
通过生物信息学验证RN1H4基因预测尤文肉瘤患者预后的作用
孙楷
王春燕
于壮
《临床医学进展》
2022
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