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含伪结RNA二级结构预测的支持向量机方法
1
作者
张洪礼
张娜
+2 位作者
王常武
王宝文
刘文远
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2010年第10期1993-1996,共4页
RNA二级结构预测是生物信息学的一个研究重点和难点.伪结是RNA二级结构中最难预测的一种.本文利用多分类支持向量机对含平面伪结的RNA分子二级结构进行预测.第一步,利用多分类支持向量机进行预测,输出端得到相应碱基的E-NSSEL类别标识....
RNA二级结构预测是生物信息学的一个研究重点和难点.伪结是RNA二级结构中最难预测的一种.本文利用多分类支持向量机对含平面伪结的RNA分子二级结构进行预测.第一步,利用多分类支持向量机进行预测,输出端得到相应碱基的E-NSSEL类别标识.第二步,利用第一步的预测结果,把所有可能配对的标识是否配对通过支持向量机进行判断,并根据判断结果恢复RNA分子二级结构.实验证明,该方法能有效地提高含平面伪结的RNA分子二级结构的预测精度.
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关键词
多分类支持向量机
rna二级结够
E-NSSEL标识
平面伪
结
下载PDF
职称材料
题名
含伪结RNA二级结构预测的支持向量机方法
1
作者
张洪礼
张娜
王常武
王宝文
刘文远
机构
燕山大学信息科学与工程学院
出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2010年第10期1993-1996,共4页
基金
国家火炬计划项目(2008GH540088)资助
河北省教育厅自然科学研究计划项目(2009339)资助
文摘
RNA二级结构预测是生物信息学的一个研究重点和难点.伪结是RNA二级结构中最难预测的一种.本文利用多分类支持向量机对含平面伪结的RNA分子二级结构进行预测.第一步,利用多分类支持向量机进行预测,输出端得到相应碱基的E-NSSEL类别标识.第二步,利用第一步的预测结果,把所有可能配对的标识是否配对通过支持向量机进行判断,并根据判断结果恢复RNA分子二级结构.实验证明,该方法能有效地提高含平面伪结的RNA分子二级结构的预测精度.
关键词
多分类支持向量机
rna二级结够
E-NSSEL标识
平面伪
结
Keywords
multi-class support vector machine
rna
secondary structure
E-NSSEL labels
plane pseudoknots
分类号
TP301 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
含伪结RNA二级结构预测的支持向量机方法
张洪礼
张娜
王常武
王宝文
刘文远
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2010
0
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