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新型冠状病毒RNA依赖性RNA聚合酶抑制剂研究进展 被引量:2
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作者 堵兴轶 胡泽涛 +2 位作者 周欣梅 何新华 任旭红 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 2024年第4期500-517,536,共19页
由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型导致的新型冠状病毒感染席卷全球,寻找广谱抗病毒特效药一直是一项重大任务。RNA病毒的RNA依赖性RNA聚合酶是一类不同病毒间在结构和功能上高度保守的关键非结构蛋白,针对该聚合酶为靶点开发新的小分子... 由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型导致的新型冠状病毒感染席卷全球,寻找广谱抗病毒特效药一直是一项重大任务。RNA病毒的RNA依赖性RNA聚合酶是一类不同病毒间在结构和功能上高度保守的关键非结构蛋白,针对该聚合酶为靶点开发新的小分子抑制剂至关重要。本文作者从新型冠状病毒RNA依赖性RNA聚合酶的结构为出发点,详细阐述了该病毒RNA依赖性RNA聚合酶的作用机制以及不同种类抑制剂的特点。着重从药物化学的角度介绍了核苷类似物和非核苷类似物的作用特点和作用机制,综述了多种小分子聚合酶抑制剂化学结构与生物活性之间的关系。 展开更多
关键词 rna依赖性rna聚合酶 抑制剂 核苷类似物 非核苷类似物 新型冠状病毒
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RNA依赖性RNA聚合酶作为抗戊型肝炎病毒药物作用靶点的研究进展
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作者 何振文 刘丁语 +7 位作者 刘宝玲 张翩 王晓虎 王刚 黄元 陈晶 刘文俊 蔡汝健 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期4568-4577,共10页
戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)是造成急性肝炎最常见的原因之一。HEV基因组由5′非编码区、3个开放阅读框(ORF1、ORF2、ORF3)和3′非编码区组成,仅在HEV-1中发现了ORF4,并与ORF1重叠。各种编码蛋白在HEV的复制和感染中发挥着不... 戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)是造成急性肝炎最常见的原因之一。HEV基因组由5′非编码区、3个开放阅读框(ORF1、ORF2、ORF3)和3′非编码区组成,仅在HEV-1中发现了ORF4,并与ORF1重叠。各种编码蛋白在HEV的复制和感染中发挥着不同的作用,而HEV的复制是由ORF1编码的RNA依赖性RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)所介导的。HEV RdRp是由多个蛋白亚基组成的复合酶,具有7个保守基序,这些保守基序在RNA合成过程中发挥核苷酸识别、合成、延伸、修饰和稳定等作用,保证了RdRp的功能,在HEV的复制和转录中起到关键作用。因此,以RdRp作为抗HEV药物作用靶点的治疗方案具有很好的应用前景,是目前药物开发的一种主流思路。目前,已发现利巴韦林、索非布韦、2′-C-甲基胞苷(2CMC)等核苷类RdRp抑制剂和锌、GPC-N114等非核苷类RdRp抑制剂对HEV有较强的抑制作用,可作为潜在的抗HEV药物进行深入研究。笔者对HEV编码蛋白和HEV RdRp的结构与功能进行阐述,总结目前发现的对HEV有抑制作用的RdRp抑制剂,以期为HEV的药物开发提供一种新的思路。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒(HEV) rna依赖性rna聚合酶(RdRp) 药物开发
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肝炎病毒蛋白对双链RNA依赖性蛋白激酶的调节作用 被引量:13
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作者 成军 《国外医学(微生物学分册)》 2000年第5期1-2,12,共3页
乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)蛋白以及丁型肝炎病毒(HDV)基因组RNA与双链RNA依赖性蛋白激酶(PKR)之间可以进行特异性结合,使病毒感染的靶细胞对干扰素(IFN)的敏感性发生了改变。同时,肝炎病毒基因组及其编码产物与感染靶细胞中... 乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)蛋白以及丁型肝炎病毒(HDV)基因组RNA与双链RNA依赖性蛋白激酶(PKR)之间可以进行特异性结合,使病毒感染的靶细胞对干扰素(IFN)的敏感性发生了改变。同时,肝炎病毒基因组及其编码产物与感染靶细胞中PKR分子之间的结合,将产生广泛的生物学效应。 展开更多
关键词 肝炎病毒蛋白 双链rna依赖性蛋白激酶 调节作用
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RNA依赖性RNA聚合酶抑制剂类抗丙型肝炎药Setrobuvir 被引量:1
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作者 范鸣 《药学进展》 CAS 2013年第7期351-352,共2页
丙型肝炎(简称丙肝)病毒(HCV)是一种单股正链RNA病毒,入侵机体后可导致急、慢性肝炎以及肝硬化、肝衰竭甚至死亡。目前,HCV靶向治疗药物除了HCV蛋白酶抑制剂(PI,如telaprevir、boceprevir等)外,还有靶向HCV中RNA依赖性RNA聚合酶N... 丙型肝炎(简称丙肝)病毒(HCV)是一种单股正链RNA病毒,入侵机体后可导致急、慢性肝炎以及肝硬化、肝衰竭甚至死亡。目前,HCV靶向治疗药物除了HCV蛋白酶抑制剂(PI,如telaprevir、boceprevir等)外,还有靶向HCV中RNA依赖性RNA聚合酶NS5B的直接抗病毒药(DAA)。DS5B的功能就是合成互补的负链RNA,为复制子代正链RNA病毒提供模板。 展开更多
关键词 setrobuvir rna依赖性rna聚合酶 丙型肝炎病毒 直接抗病毒药
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猪繁殖与呼吸综合征病毒RNA依赖性RNA聚合酶中SDD功能区的突变分析 被引量:1
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作者 周艳 郑海红 +2 位作者 高飞 田德斌 袁世山 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2011年第8期649-659,共11页
猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV亚基因组的转录和基因组的复制由病毒复制酶引导.病毒首先合成两个多聚蛋白,随后多聚蛋白被加工分解成若干较小的非结构蛋白(nsps),从而产生了复制酶.病毒复制酶所在的nsp9含有特异性的功能性序列模体,在正... 猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV亚基因组的转录和基因组的复制由病毒复制酶引导.病毒首先合成两个多聚蛋白,随后多聚蛋白被加工分解成若干较小的非结构蛋白(nsps),从而产生了复制酶.病毒复制酶所在的nsp9含有特异性的功能性序列模体,在正链RNA病毒的RNA依赖性RNA聚合酶RdRp中共同含有这些保守的序列模体.为了验证PRRSV所特有的SDD模体是否能够替换为其他RNA病毒相应所含有的保守模体,以及SDD的每一个氨基酸对于RdRp催化活性的影响,将其分别替换为多种不同的氨基酸.研究发现,只有将nsp9中SDD替换为GDD,即丝氨酸替换为甘氨酸S3050G时,才能拯救出病毒,并且传代后此病毒在遗传上是稳定的.改变SDD中的任何一个天门冬氨酸都对病毒是致死性的,突变后破坏了聚合酶的活性和RdRp的翻译功能,但却没有使RdRp失去复制功能.所以研究认为,SDD模体是PRRSV的RdRp所特有和保守的,不能被替换为除GDD外的其他RNA病毒所含有的保守模体,套式病毒与其他正链RNA病毒在进化上具有一定的联系.研究表明,SDD模体的两个天门冬氨酸对于PRRSV亚基因组的转录是不可缺少的;从进化上看,SDD模体可能是正链RNA病毒GDD模体的一种变异形式. 展开更多
关键词 SDD rna 依赖性rna聚合酶 猪繁殖与呼吸综合征病毒 套式病毒目 复制 进化
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细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义RNA1靶向微小RNA-339-5p对乳腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响 被引量:2
6
作者 陈倩倩 张英丽 +1 位作者 李阳 唐音 《安徽医药》 CAS 2022年第7期1390-1394,共5页
目的 探讨长链非编码RNA细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义RNA1(lncRNA CDKN2B-AS1)对乳腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响及分子机制。方法 收集南阳市中心医院2017年1月2019年1月收治的37例乳腺癌患者的癌组织及癌旁组织。将MDA-MB-45... 目的 探讨长链非编码RNA细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义RNA1(lncRNA CDKN2B-AS1)对乳腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响及分子机制。方法 收集南阳市中心医院2017年1月2019年1月收治的37例乳腺癌患者的癌组织及癌旁组织。将MDA-MB-453细胞分为CDKN2B-AS1阴性对照(si-NC组)、CDKN2B-AS1小分子干扰RNA(si-CDKN2B-AS1组)、CDKN2B-AS1小分子干扰RNA+miR-339-5p阴性对照(si-CDKN2B-AS1+anti-miR-NC组)以及CDKN2B-AS1小分子干扰RNA+miR-339-5p特异性寡核苷酸抑制剂(si-CDKN2B-AS1+anti-miR-339-5p组)。采用RT-qPCR法对CDKN2B-AS1及微小RNA-339-5p(miR-339-5p)表达水平进行检测;细胞周期及增殖活性检测分别采用流式细胞术及MTT实验;采用Transwell小室技术对细胞迁移和侵袭进行检测;采用Western blotting法对增殖标记蛋白细胞增殖核抗原-67(Ki67)、细胞周期依赖性蛋白激酶抑制因子1A(P21)、上皮型钙黏蛋白(E-cadherin)、神经型钙黏蛋白(N-cadherin)蛋白表达进行检测;荧光素酶报告实验检测CDKN2BAS1对miR-339-5p的靶向调控。结果 在乳腺癌组织中CDKN2B-AS1表达水平上调[(2.23±0.08)比(1.00±0.06)](P<0.05)。抑制CDKN2B-AS1可增加G0期细胞比例[(43.29±3.76)%比(30.25±3.01)%]、P21表达水平升高,S期细胞比例[(21.91±3.10)%比(34.19±3.32)%]、细胞存活率[(53.02±5.38)%比(100.00±7.12)%]、迁移、侵袭数以及Ki67、E-cadherin、N-cadherin蛋白表达水平降低(P<0.05)。CDKN2B-AS1靶向调控miR-339-5p,抑制miR-339-5p逆转抑制CDKN2B-AS1对MDA-MB-453细胞增殖、迁移、侵袭的作用。结论 抑制CDKN2B-AS可抑制乳腺癌MDA-MB-453细胞增殖、迁移、侵袭,且靶向调控miR-339-5p表达。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义rna1 微小rna-339-5p(miR-339-5p) 增殖 迁移 侵袭
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依赖RNA的RNA聚合酶介导RNA干扰的扩增效应
7
作者 刘铁刚 张敏 邵荣光 《生命的化学》 CAS CSCD 2003年第4期258-260,共3页
RNA干扰(RNA interference,RNAi)是一种非常高效的基因沉默效应,RNA依赖性RNA聚合酶(RNA-de-pendent RNA polymerase,RdRP)介导的扩增作用可能是RNAi具有高效性的一个主要原因。了解RdRP在生物体中存在的证据、RdRP及其复合体的结构、次... RNA干扰(RNA interference,RNAi)是一种非常高效的基因沉默效应,RNA依赖性RNA聚合酶(RNA-de-pendent RNA polymerase,RdRP)介导的扩增作用可能是RNAi具有高效性的一个主要原因。了解RdRP在生物体中存在的证据、RdRP及其复合体的结构、次级siRNA的产生及转移性RNAi的发生机制等问题,对深入理解RNAi的作用机制和促进RNAi的临床应用有重要意义。 展开更多
关键词 rna依赖性rna聚合酶 rna干扰
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正链RNA病毒复制酶结构与功能研究进展 被引量:4
8
作者 王超 吴润 刘光清 《中国动物传染病学报》 CAS 2011年第5期76-82,共7页
正链RNA病毒是家族非常庞大,可以感染多种动、植物及人的一类病毒。研究这类病毒的复制机理和调控方式对于阐明病毒的致病机制,以及研制新型抗病毒药物和疫苗等具有重要意义。RNA依赖性RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)是... 正链RNA病毒是家族非常庞大,可以感染多种动、植物及人的一类病毒。研究这类病毒的复制机理和调控方式对于阐明病毒的致病机制,以及研制新型抗病毒药物和疫苗等具有重要意义。RNA依赖性RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)是正链RNA病毒进行复制的关键蛋白酶,研究其结构与功能是了解病毒复制机理的前提和基础。本文即对近年来关于正链RNA病毒RdRp的结构与功能研究进展情况进行综述。 展开更多
关键词 正链rna病毒 rna依赖性rna聚合酶 结构 功能
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急性冠脉综合征患者血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184水平与介入治疗后冠状动脉再狭窄发生的相关性研究
9
作者 王翔 王淼 +1 位作者 李宾 熊小雪 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第22期2752-2757,共6页
目的分析急性冠脉综合征(ACS)患者血清长链非编码RNA细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B基因反义RNA1(lncRNA CDKN2B-AS1)、微小RNA-184(miR-184)水平与经皮冠状动脉介入(PCI)治疗后冠状动脉再狭窄(RS)发生的相关性。方法选取2020年2月至... 目的分析急性冠脉综合征(ACS)患者血清长链非编码RNA细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B基因反义RNA1(lncRNA CDKN2B-AS1)、微小RNA-184(miR-184)水平与经皮冠状动脉介入(PCI)治疗后冠状动脉再狭窄(RS)发生的相关性。方法选取2020年2月至2023年3月在该院行PCI治疗的288例ACS患者,根据术后6个月复查造影结果分为RS发生组96例和RS未发生组192例。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184相对表达水平;采用Pearson相关性分析血清lncRNA CDKN2B-AS1与miR-184相关性;影响ACS患者PCI后RS发生的因素采用多因素Logistic回归分析;以受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184对ACS患者PCI后RS发生的评估价值。结果与RS未发生组相比,RS发生组血清lncRNA CDKN2B-AS1水平显著升高,miR-184水平显著降低,差异有统计学意义(P<0.05);两组超敏C反应蛋白(hs-CRP)、白细胞介素18(IL-18)、总胆红素(TBIL)及心肌肌钙蛋白I(cTnI)比较,差异有统计学意义(P<0.05);Pearson相关性分析显示,ACS患者血清lncRNA CDKN2B-AS1与miR-184水平呈显著负相关(r=-0.427,P<0.05);多因素Logistic回归分析结果显示,lncRNA CDKN2B-AS1、hs-CRP、IL-18、cTnI是影响ACS患者PCI后RS发生的危险因素,miR-184、TBIL是影响ACS患者PCI后RS发生的保护因素(P<0.05);ROC曲线结果显示,血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184及二者联合对ACS患者PCI后RS发生评估的曲线下面积(AUC)分别为0.787、0.844、0.929,二者联合对ACS患者PCI后RS发生评估的AUC显著高于血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184单独评估(Z_(二者联合-lncRNA CDKN2B-AS1)=4.490、Z_(二者联合-miR-184)=3.429,均P<0.05)。结论ACS患者血清lncRNA CDKN2B-AS1水平显著升高,miR-184水平显著降低,与ACS患者PCI后RS发生具有相关性,均是影响ACS患者PCI后RS发生的因素,且二者联合对ACS患者PCI后RS发生的评估效能更佳。 展开更多
关键词 急性冠脉综合征 经皮冠状动脉介入 冠状动脉再狭窄 长链非编码rna细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B基因反义rna1 微小rna-184
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非编码RNA和RNA沉默 被引量:1
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作者 毛新国 董玉琛 《生物技术通报》 CAS CSCD 2004年第1期6-12,22,共8页
生物体内存在大量的非编码RNA ,它们形态各异 ,功能也千差万别 ,在生物的生长、发育、分化进程中扮演着不同的角色 ,尤其是siRNA ,它是RNA沉默的诱因。RNA沉默是真核生物特有的现象 ,它需要一系列因子的参与 ,其中RNA依赖性的RNA聚合酶... 生物体内存在大量的非编码RNA ,它们形态各异 ,功能也千差万别 ,在生物的生长、发育、分化进程中扮演着不同的角色 ,尤其是siRNA ,它是RNA沉默的诱因。RNA沉默是真核生物特有的现象 ,它需要一系列因子的参与 ,其中RNA依赖性的RNA聚合酶是沉默起始的关键 ,Dicer酶是形成siRNA的基础 ,而RNA沉默诱导复合体 (RSIC)等是发生RNA沉默“链式反应” 展开更多
关键词 非编码rna rna沉默 小干扰rna rna依赖性rna聚合酶 rna沉默诱导复合体
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体外转录制备的siRNAs对SARS-CoV复制的抑制作用
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作者 石孝民 周高标 +5 位作者 毛丽伟 姜曼 黎万玲 何仰东 吴玉章 倪兵 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期438-441,共4页
目的体外研究针对SARSCoVRNA依赖性RNA聚合酶(RNAdependentRNApolymerase,RdRp)的小干扰RNA(SmallinterferenceRNA,siRNA)对SARSCoV感染的抑制效应。方法利用Ambion公司在线设计工具,设计出4条针对RdRp基因的siRNAs,并在体外利用试剂盒... 目的体外研究针对SARSCoVRNA依赖性RNA聚合酶(RNAdependentRNApolymerase,RdRp)的小干扰RNA(SmallinterferenceRNA,siRNA)对SARSCoV感染的抑制效应。方法利用Ambion公司在线设计工具,设计出4条针对RdRp基因的siRNAs,并在体外利用试剂盒进行转录合成。在SARSCoV感染前1d,将这4条体外转录的siRNAs用Lipofectamine2000试剂转染入VeroE6细胞中。感染后,每天观察感染细胞的细胞病变效应(Cytopathiceffect,CPE)。第5天,用空斑形成实验(Plaqueformationunit,PFU)检测感染细胞培养上清液中SARSCoV滴度。结果CPE结果显示,在感染后的前4d,各siRNAs均能有效地保护细胞免受感染;在第5天,4条siRNAs中有3条仍能有效保护细胞不被感染。PFU实验结果显示,在第5天,所有siRNAs转染的细胞培养上清液中,SARSCoV的滴度均显著低于阳性对照(P<0.001)。结论实验结果表明针对SARSCoV的RdRp基因的siRNAs能有效而特异地抑制该病毒在哺乳动物细胞中的复制和繁殖,提示如果应用合适的给药途径,RNAi策略可以用于体内抑制SARSCoV的感染。 展开更多
关键词 严重急性呼吸器官综合征 rna干扰 rna依赖性rna聚合酶 小干扰rna
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RNA:诱导基因沉默
12
作者 帅丽芳 赵勇 孙金海 《生物学杂志》 CAS CSCD 2005年第1期8-10,3,共4页
在生物体中,双链RNA(double_strandRNA,dsRNA)裂解后的小RNA可以诱导细胞质和基因组水平外源基因沉默。所谓基因沉默(genesilencing)是指生物体中特定基因由于种种原因不表达。小RNA能诱导互补信使RNA在转录后降解。RNA沉默是基因组水... 在生物体中,双链RNA(double_strandRNA,dsRNA)裂解后的小RNA可以诱导细胞质和基因组水平外源基因沉默。所谓基因沉默(genesilencing)是指生物体中特定基因由于种种原因不表达。小RNA能诱导互补信使RNA在转录后降解。RNA沉默是基因组水平的免疫现象,代表了进化过程中原始的基因组对抗外源基因序列表达的保护机制,在动植物进化中起着重要作用,RNA沉默具有抵抗病毒入侵、抑制转座子活动等作用,并调控蛋白编码基因的表达,具有十分诱人的应用前景。 展开更多
关键词 基因沉默 双链rna rna依赖性rna聚合酶
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RNA诱导基因沉默
13
作者 帅丽芳 赵勇 孙金海 《生物技术》 CAS CSCD 2005年第2期81-83,共3页
RNA沉默在动植物进化中起着重要作用,具有抵抗病毒入侵、抑制转座子活动等作用,并调控蛋白编码基因的表达。该文着重对RNA沉默现象的作用机制和模式、功能及其应用前景作一综述。
关键词 基因沉默 rna干扰 小干扰rna 双链rna rna依赖性rna聚合酶
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植物RNA干扰抗病毒机制研究进展 被引量:7
14
作者 方远鹏 李云洲 +4 位作者 岳宁波 赵志博 杨再福 王勇 龙友华 《山地农业生物学报》 2020年第5期50-56,共7页
目前,植物病毒病危害越来越严重,抗病毒研究越来越受到人们的关注。RNA干扰是植物抗病毒的重要机制之一,但很少有人对其进行系统的研究。RNAi关键蛋白主要包含3种:Dicer样(DCL)、RNA依赖聚合物(RDR)和Argonaute(AGO)。在抗病毒作用中,D... 目前,植物病毒病危害越来越严重,抗病毒研究越来越受到人们的关注。RNA干扰是植物抗病毒的重要机制之一,但很少有人对其进行系统的研究。RNAi关键蛋白主要包含3种:Dicer样(DCL)、RNA依赖聚合物(RDR)和Argonaute(AGO)。在抗病毒作用中,DCL1和DCL2、RDR2和RDR6、AGO1是最重要的。si RNAi介导的RNAi是RNAi最主要的机制,主要过程是DCL将ds RNA切割成"初级si RNA",RDR将si RNA重构成ds RNA,然后将新合成的ds RNA切割成更多的"次级si RNA",AGO与si RNA结合形成RNA沉默复合物(RISC)。RNA干扰可以通过互补碱基对切割RISC和靶病毒或RNA核酸序列,最终降解病毒或RNA核酸序列。本文归纳总结国内外RNAi机制相关蛋白及其功能、以及RNA i抗病毒机制,为植物抗病毒研究提供指导与依据。 展开更多
关键词 rna干扰 抗病毒机制 ARGONAUTE Dicer样 rna依赖性rna
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RNA病毒重组及发生机制 被引量:1
15
作者 李琛 时建立 +5 位作者 彭喆 刘畅 徐绍建 韩红 吴晓燕 李俊 《中国动物检疫》 CAS 2021年第2期82-92,共11页
重组在RNA病毒中很常见,但有关重组的许多关键问题目前尚无法解释。本文主要针对RNA重组的发生机制及其影响因素,解释重组频率发生变化的原因,阐述RNA重组未来仍需解决的问题。RNA重组是RNA病毒特殊的遗传信息交换方式,其频率在不同的RN... 重组在RNA病毒中很常见,但有关重组的许多关键问题目前尚无法解释。本文主要针对RNA重组的发生机制及其影响因素,解释重组频率发生变化的原因,阐述RNA重组未来仍需解决的问题。RNA重组是RNA病毒特殊的遗传信息交换方式,其频率在不同的RNA病毒中显著不同。目前,研究者普遍认为重组发生的机制可分为复制型、非复制型重组以及重配,并且借助新方法和新技术,逐渐了解了影响该过程的病毒和细胞因子。有研究表明,RNA病毒中RNA的重组和重配率非常高,这与RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)的保真性相关。因此,深入了解病毒重组机制并发现其中的规律,可实现对新型病毒以及新疫情的预警预报,从而有预见性地控制疫病的发生和流行。 展开更多
关键词 rna病毒 重组机制 rna依赖性 rna聚合酶
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The VP2 protein of grass carp reovirus(GCRV) expressed in a baculovirus exhibits RNA polymerase activity 被引量:4
16
作者 Liming Yan Huan Liu +1 位作者 Xiaoming Li Qin Fang 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2014年第2期86-93,共8页
The double-shelled grass carp reovirus (GCRV) is capable of endogenous RNA transcription and processing.Genome sequence analysis has revealed that the protein VP2,encoded by gene segment 2 (S2),is the putative RNA... The double-shelled grass carp reovirus (GCRV) is capable of endogenous RNA transcription and processing.Genome sequence analysis has revealed that the protein VP2,encoded by gene segment 2 (S2),is the putative RNA-dependent RNA polymerase (RdRp).In previous work,we have ex-pressed the functional region of VP2 that is associated with RNA polymerase activity (denoted as rVP2390-900) in E.coil and have prepared a polyclonal antibody against VP2.To characterize the GCRV RNA polymerase,a recombinant full-length VP2 (rVP2) was first constructed and expressed in a baculovirus system,as a fusion protein with an attached His-tag.Immunofluorescence (IF) assays,together with immunoblot (IB) analyses from both expressed cell extracts and purified Histagged rVP2,showed that rVP2 was successfully expressed in Sf9 cells.Further characterization of the replicase activity showed that purified rVP2 and GCRV particles exhibited poly(C)-dependent poly(G) polymerase activity.The RNA enzymatic activity required the divalent cation Mg2+,and was optimal at 28 ℃.The results provide a foundation for further studies on the RNA polymerases of aquareoviruses during viral transcription and replication. 展开更多
关键词 grass carp reovirus (GCRV) VP2 protein baculovirus recombinant rna polymerase
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lncRNA ADPGK-AS1对视网膜母细胞瘤细胞生物学行为的抑制作用及其调控机制 被引量:3
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作者 张俊 刘彩林 卜战云 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期207-215,共9页
目的探讨长链非编码RNA二磷酸腺苷依赖的葡萄糖激酶反义RNA1(lncRNA ADPGK-AS1)对人视网膜母细胞瘤(RB)细胞增生、迁移和侵袭的影响及其调控机制。方法收集2017年2月至2018年11月在驻马店市中心医院和郑州大学第一附属医院接受RB手术治... 目的探讨长链非编码RNA二磷酸腺苷依赖的葡萄糖激酶反义RNA1(lncRNA ADPGK-AS1)对人视网膜母细胞瘤(RB)细胞增生、迁移和侵袭的影响及其调控机制。方法收集2017年2月至2018年11月在驻马店市中心医院和郑州大学第一附属医院接受RB手术治疗的RB患者39例39眼的术中瘤旁组织和瘤体组织标本,采用实时荧光定量PCR法检测ADPGK-AS1和miR-623在标本组织中的相对表达量。体外培养人RB细胞Y-79,将培养细胞分为小干扰RNA正常对照组(siRNA-NC组)、siRNA-ADPGK-AS1组、微小RNA正常对照组(miR-NC组)、miR-623组、siRNA-ADPGK-AS1+anti-miR-NC组和siRNA-ADPGK-AS1+anti-miR-623组,采用MTT法检测各组细胞增生率;采用Transwell小室实验检测各组细胞迁移及侵袭数;采用双荧光素酶报告实验检测Y-79细胞中ADPGK-AS1和miR-623的靶向关系;采用Western blot法检测不同干预组细胞中Ki-67、基质金属蛋白酶(MMP)-2和MMP-9蛋白表达量。结果与瘤旁组织比较,RB组织中ADPGK-AS1相对表达量升高,miR-623相对表达量明显降低,差异均有统计学意义(t=40.522、48.497,均P<0.01);与siRNA-NC组比较,siRNA-ADPGK-AS1组细胞中Ki-67蛋白相对表达量明显下降,Y-79细胞增生A值显著降低,差异均有统计学意义(t=26.833、18.522,均P<0.01);siRNA-ADPGK-AS1组细胞中MMP-2和MMP-9蛋白相对表达量明显低于siRNA-NC组,差异均有统计学意义(t=22.123、26.183,均P<0.01);siRNA-ADPGK-AS1组迁移细胞数和侵袭细胞数均明显少于siRNA-NC组,差异均有统计学意义(t=12.385、19.201,均P<0.01);双荧光素酶报告实验证实ADPGK-AS1可靶向结合miR-623;miR-623组细胞中Ki-67、MMP-2、MMP-9蛋白相对表达量明显低于miR-NC组,差异均有统计学意义(t=22.137、22.200、21.094,均P<0.01);与miR-NC组比较,miR-623组Y-79细胞增生A值显著降低且迁移细胞数和侵袭细胞数均明显减少,差异均有统计学意义(t=16.398、11.400、17.846,均P<0.01);siRNA-ADPGK-AS1+anti-miR-623组细胞中Ki-67、MMP-2和MMP-9蛋白相对表达量均明显高于siRNA-ADPGK-AS1+anti-miR-NC组,差异均有统计学意义(t=20.795、17.493、23.479,均P<0.01);与siRNA-ADPGK-AS1+anti-miR-NC组比较,siRNA-ADPGK-AS1+anti-miR-623组增生A值明显升高且迁移细胞数及侵袭细胞数明显增多,差异均有统计学意义(t=15.600、14.495、17.855,均P<0.01)。结论敲低ADPGK-AS1基因可抑制RB细胞增生、迁移和侵袭,其作用机制与miR-623的表达上调有关。 展开更多
关键词 长链非编码rna 二磷酸腺苷依赖性葡萄糖激酶反义rna 1 微小rna 视网膜母细胞瘤
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抗病毒蛋白PKR的结构和功能 被引量:5
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作者 夏君 谢炯 张萍 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期205-209,共5页
病毒感染后,细胞合成分泌大量的干扰素(In—terferon,IFN),这些IFN通过自分泌或旁分泌的方式与细胞膜上的受体结合。激活STAT/JAK信号级联反应,调控300多个干扰素调控基因(Interferonstimulatedgenes,ISGs)的转录翻译水平,... 病毒感染后,细胞合成分泌大量的干扰素(In—terferon,IFN),这些IFN通过自分泌或旁分泌的方式与细胞膜上的受体结合。激活STAT/JAK信号级联反应,调控300多个干扰素调控基因(Interferonstimulatedgenes,ISGs)的转录翻译水平,其中包括经典的抗病毒蛋白PKR。PKR即双链RNA依赖性蛋白激酶,是一种丝/苏氨酸蛋白激酶。 展开更多
关键词 抗病毒蛋白 PKR 双链rna依赖性蛋白激酶 苏氨酸蛋白激酶 结构 调控基因 病毒感染后 合成分泌
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草鱼呼肠孤病毒分离株HZ08基因组L节段的全长克隆与序列分析 被引量:3
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作者 张超 王庆 +4 位作者 石存斌 曾伟伟 刘永奎 杨淞 吴淑勤 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2011年第1期116-123,共8页
从浙江省湖州地区采集发病草鱼(Ctenopharyngodon idellus)样品,取症状明显病鱼的肝、脾、肾组织,经过滤除菌处理后接种草鱼肾脏细胞(CIK)进行病毒分离。盲传8代,CIK细胞未出现明显细胞病变,但感染细胞固定后经电镜观察发现,细胞质内有... 从浙江省湖州地区采集发病草鱼(Ctenopharyngodon idellus)样品,取症状明显病鱼的肝、脾、肾组织,经过滤除菌处理后接种草鱼肾脏细胞(CIK)进行病毒分离。盲传8代,CIK细胞未出现明显细胞病变,但感染细胞固定后经电镜观察发现,细胞质内有大量病毒聚集,病毒无囊膜,近球形,直径约70nm,形态与已报道的草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus,GCRV)相似。十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)结果显示,病毒基因组由11个dsRNA组成,呈现水生呼肠孤病毒基因组典型特征。为了从分子水平上进一步了解该病毒的特性,应用单引物扩增技术获得了该病毒基因组L节段的全长。序列分析结果表明:完整的L1、L2、L3节段分别由3 927、3 870、3 753个碱基对组成,每个节段正链RNA仅含有1个开放阅读框,通过同源性比较,推测分别编码病毒的结构蛋白VP1、VP2、VP3,其中VP1推测为病毒RNA转录的鸟苷酸转移酶和甲基化酶,VP2为病毒的RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp),VP3为病毒NTP酶及解旋酶。3个推测结构蛋白的序列与GCRV 873株的同源性最高,分别为31%、45%、36%,并且具有与其他呼肠孤病毒相同的基序(motif)。各节段都具有相同的5'端和3'端保守序列,即5'-GUAAUUU......UUCAUC-3'。利用RdRp构建系统进化树,HZ08株与水生呼肠孤病毒聚为一簇,但单独列为1支,应为水生呼肠孤病毒属新成员。 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒 序列分析 rna依赖性rna聚合酶(RdRp)
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NLRP3炎性小体与TLR3和PKR的关系及在动脉粥样硬化中的研究进展 被引量:4
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作者 朱锐 吴校林 刘文卫 《医学综述》 2016年第4期685-687,共3页
动脉粥样硬化是心脑血管疾病发生的共同病理基础,动脉粥样硬化的形成与炎症反应关系密切。最近研究表明,天然免疫应答和获得性免疫应答参与动脉粥样硬化斑块的形成,进展和破裂,NLRP3炎性小体作为天然免疫的重要组分在机体免疫反应和动... 动脉粥样硬化是心脑血管疾病发生的共同病理基础,动脉粥样硬化的形成与炎症反应关系密切。最近研究表明,天然免疫应答和获得性免疫应答参与动脉粥样硬化斑块的形成,进展和破裂,NLRP3炎性小体作为天然免疫的重要组分在机体免疫反应和动脉粥样硬化炎症反应中起着核心作用,且NLRP3炎性小体激活途径也基本阐明,目前发现Toll样受体和双链RNA依赖性蛋白激酶可能在NLRP3炎性小体信号通路中起着重要的作用。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 NLRP3炎性小体 TOLL样受体 双链rna依赖性蛋白激酶
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