长链非编码RNA核富集转录本1对瘢痕成纤维细胞增殖、凋亡和迁移的影响

背景:已有研究阐明核富集转录本1(nuclear enriched abundant transcript 1,NEAT1)下调抑制了瘢痕成纤维细胞的进展,但具体机制尚不完全清楚。目的:探讨长链非编码RNA NEAT1调节miR-136-5p/泛素特异性蛋白酶4(ubiquitin specific protease 4,USP4)轴对瘢痕成纤维细胞生物学行为的影响。方法:将瘢痕成纤维细胞分为5组:si-NC组、空白对照组、si-NEAT1组、si-NEAT1+miR-136-5p inhibitor组、si-NEAT1+inhibitor-NC组,qRT-PCR检测NEAT1、miR-136-5p表达;CCK-8法及EDU染色检测细胞增殖能力;流式细胞术检测细胞凋亡情况;划痕愈合实验检测细胞迁移情况;Western blot检测USP4、p27、Bax、基质金属蛋白酶9、α-平滑肌肌动蛋白、Ⅰ型胶原蛋白α1链蛋白表达;双荧光素酶实验检测NEAT1与miR-136-5p、miR-136-5p与USP4的关系。结果与结论:①与si-NC组比较,si-NEAT1组NEAT1表达、A450值、EDU阳性细胞百分比、划痕愈合率以及USP4、基质金属蛋白酶9、α-平滑肌肌动蛋白、Ⅰ型胶原蛋白α1链蛋白表达降低(P<0.05),miR-136-5p表达、细胞凋亡率及p27、Bax蛋白表达升高(P<0.05);②miR-136-5p inhibitor逆转了沉默NEAT1对瘢痕成纤维细胞生物学行为的影响;③miR-136-5p与NEAT1、miR-136-5p与USP4存在靶向调控关系。结果表明,沉默NEAT1可能通过调控miR-136-5p/USP4轴抑制瘢痕成纤维细胞的增殖和迁移,诱导其凋亡。

前列腺癌组织LncRNA NEAT1、miR-377表达与患者5年生存情况的关系

目的探究前列腺癌组织长链非编码RNA核富集转录本1(LncRNA NEAT1)、微小RNA-377(miR-377)表达与患者5年生存的关系。方法选取2016年7月至2018年8月在邯郸市中心医院住院治疗的98例前列腺癌患者,检测前列腺癌组织及癌旁组织中LncRNA NEAT1、miR-377表达;记录患者5年内生存情况。分析前列腺癌组织LncRNA NEAT1、miR-377与临床病理特征、患者5年生存的关系以及二者的相关性,分析影响患者5年内生存的危险因素及LncRNA NEAT1、miR-377对患者5年内生存的预测价值。结果与癌旁组织比较,前列腺癌组织LncRNA NEAT1显著升高、miR-377显著降低(P<0.05);Ⅲ~Ⅳ期、Gleason评分>7分、血清前列腺特异性抗原(PSA)>10μg/L的患者前列腺癌组织LncRNA NEAT1分别高于Ⅰ~Ⅱ期、Gleason评分≤7分、血清PSA≤10μg/L的患者,miR-377分别低于Ⅰ~Ⅱ期、Gleason评分≤7分、血清PSA≤10μg/L的患者(P<0.05);前列腺癌组织LncRNA NEAT1与miR-377表达呈负相关(P<0.05);LncRNA NEAT1高表达、miR-377低表达患者5年累积生存率分别显著低于LncRNA NEAT1低表达、miR-377高表达患者(P<0.05);与生存组比较,死亡组前列腺癌组织LncRNA NEAT1显著升高,miR-377显著降低(P<0.05);前列腺癌组织LncRNA NEAT1高表达、miR-377低表达、TNM分期Ⅲ~Ⅳ期、Gleason评分>7分、血清PSA水平>10μg/L均是影响前列腺癌患者5年内生存的独立危险因素(P<0.05);前列腺癌组织LncRNA NEAT1和miR-377二者联合预测患者5年内生存的曲线下面积高于LncRNA NEAT1、miR-377各自单独预测(P<0.05)。结论前列腺癌组织LncRNA NEAT1呈高表达、miR-377呈低表达,对患者5年内生存具有较高的预测价值。

lncRNA NEAT1降表达人喉鳞状细胞癌细胞增殖凋亡变化及与miR-214靶向关系

目的观察长链非编码RNA(lncRNA)核富集转录体1(NEAT1)降表达的人喉鳞状细胞癌(LSCC)细胞增殖凋亡变化,探讨其与微小RNA-214(miR-214)的靶向关系。方法采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测人永生化表皮细胞Hacat和人LSCC细胞系(FD-LSC-1、Hep-2、TU177)中lncRNA NEAT1、miR-214,选择TU177细胞为受试细胞。取对数生长期TU177细胞,分为甲、乙组,分别转染si-lncRNA NEAT1(敲低lncRNA NEAT1表达)、si-NC(乱序无意义序列),培养至24 h时采用CCK8法观察两组细胞增殖情况、采用平板克隆形成实验观察两组细胞克隆形成情况、采用流式细胞术观察两组细胞周期和细胞凋亡情况、采用RT-qPCR法检测两组细胞lncRNA NEAT1及miR-214。另取对数生长期TU177细胞,分为一二三四组,一组顺序转染WT-lncRNA NEAT1、miR-214 mimic,二组顺序转染WT-lncRNA NEAT1、miR-NC,三组顺序转染MUT-lncRNA NEAT1、miR-214 mimics,四组顺序转染MUT-lncRNA NEAT1、miR-NC。采用双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA NEAT1及miR-214的靶向关系。结果与乙组相比,培养24、48、72 h时甲组TU177细胞OD值低,培养14 d时甲组TU177细胞克隆形成数少,甲组TU177细胞G0/G1期细胞比例高、S期细胞比例低,细胞凋亡率高(P均<0.05);与乙组相比,转染24 h时甲组TU177细胞lncRNA NEAT1相对表达量低、miR-214相对表达量高(P均<0.05)。培养48 h时一、二、三、四组TU177细胞细胞荧光素酶活性分别为0.63±0.08、0.99±0.01、1.02±0.02、0.98±0.03,与二组相比,一组细胞荧光素酶活性低(P<0.05)。结论敲低lncRNA NEAT1表达可抑制TU177细胞的增殖和克隆,阻滞细胞周期于G0/G1期,并促进细胞的凋亡。TU177细胞中lncRNA NEAT1与miR-214靶向相关。lncRNA NEAT1可能通过与miR-214靶向结合,抑制TU177细胞的增殖克隆,阻滞细胞周期于G0/G1期,促进细胞的凋亡。

精神分裂症病人外周血长链非编码RNA核富集转录本1表达与临床症状相关性分析

目的探讨长链非编码RNA核富集转录本1(lncRNA NEAT1)在精神分裂症(sch)病人外周血中的表达与临床症状的相关性。方法选择2019年6月至2022年3月在菏泽市第三人民医院及河北医科大学第一医院精神科收治的sch病人73例作为观察对象(sch组),另选取同期在该两家医院体检人员(无精神病障碍史及无精神疾病家族史)68例作为对照组,采用阳性与阴性症状量表(PANSS)评估病人临床症状,采用蒙特利尔认知评估量表(MoCA)评估病人认知功能,实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)法检测外周血单核细胞(PBMC)中lncRNA NEAT1表达水平,Spearman法分析lncRNA NEAT1与PANSS评分、MoCA评分的相关性,受试者操作特征(ROC)曲线分析lncRNA NEAT1水平对sch的诊断价值。结果对照组和sch组病人外周血lncRNA NEAT1表达水平分别为1.05±0.21、0.73±0.15,差异有统计学意义(P<0.001);ROC曲线分析显示:lncRNA NEAT1的曲线下面积为0.82,截断值为0.89,灵敏度为79.45%,特异度为73.93%;相关性分析表明:lncRNA NEAT1与PANSS量表总分和阴性症状量表评分呈负相关(r=−0.40、−0.49,P<0.05),且与MoCA量表中执行能力、注意力、延迟记忆和总分呈负相关(r=−0.38、−0.40、−0.40、−0.42,P<0.05)。结论lncRNA NEAT1在sch病人外周血中表达水平降低,与sch病人精神症状和认知功能有关,可能参与sch的发生发展。

胃癌患者血清lncRNA NEAT1的表达及其意义

目的检测胃癌患者外周血清中长链非编码RNA核富集转录本(NEAT)1的相对表达水平,探讨其应用于胃癌辅助诊断的可能性。方法选取2017年11月至2019年12月南通市肿瘤医院收治的胃癌初诊患者101例为胃癌组,胃良性病变患者60例为胃良性病变组,以及同期体检健康者76例为对照组。分别检测各组血清标本中lncRNA NEAT1相对表达水平和癌胚抗原(CEA)、糖类抗原19-9(CA19-9)水平,分析lncRNA NEAT1与临床病理参数的相关性,并用受试者工作特征(ROC)曲线评价lncRNA NEAT1、CEA、CA19-9单独及联合应用时的诊断效能。结果胃癌组、胃良性病变组及对照组血清中lncRNA NEAT1的相对表达水平分别为2.163(1.357,2.843)、1.176(0.677,1.381)、1.063(0.570,1.308),组间比较差异有统计学意义(H=52.467,P<0.001)。胃癌患者血清lncRNA NEAT1相对表达水平与患者性别(P=0.353)、年龄(P=0.382)无关,而与肿瘤最大径(P=0.031)、TNM分期(P=0.037)及淋巴结转移(P=0.046)有关。胃癌患者血清中lncRNA NEAT1相对表达水平与CEA、CA19-9均无相关性(P>0.05)。ROC曲线结果显示,lncRNA NEAT1诊断胃癌的曲线下面积和灵敏度均高于CEA、CA19-9单独诊断,三者联合诊断时效能最高。结论胃癌患者外周血lncRNA NEAT1相对表达水平升高,且与部分临床病理参数相关,lncRNA NEAT1有望成为胃癌辅助诊断新的标志物。

急性胰腺炎病人血清长链非编码RNA核富集转录体1、Toll样受体2表达变化及临床意义研究

目的探讨急性胰腺炎(AP)病人血清长链非编码RNA核富集转录体1(LncRNA NETA1)、Toll样受体2(TLR2)表达及临床意义。方法选取2017年5月至2020年12月石家庄平安医院收治的AP病人125例为研究对象,根据急性生理学和慢性健康状况评价Ⅱ(APACHEⅡ)对AP病人进行评分,并将病人分为轻症组56例,重症组69例;根据住院期间重症组AP病人预后情况,将病人分为预后不良25例,预后良好44例。同期选取该院健康体检者130例为健康组。实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测血清LncRNA NETA1水平,酶联免疫吸附测定(ELISA)检测血清TLR2水平;Pearson相关性分析探索AP病人血清LncRNA NEAT1、TLR2水平相关性及二者与病人APACHEⅡ评分的关系;受试者操作特征曲线(ROC曲线)分析血清LncRNA NEAT1、TLR2对AP病人重症的评估价值。结果与健康组比较,AP组血清LncRNA NEAT1(2.16±0.31比1.00±0.00)、TLR2水平[(6.43±1.05)µg/L比(0.59±0.24)µg/L]升高(P<0.05);与轻症组比较,重症组AP病人血清LncRNA NEAT1(2.31±0.33比1.98±0.27)、TLR2水平[(6.89±1.16)µg/L比(5.86±0.92)µg/L]升高(P<0.05);与预后良好组比较,预后不良组重症AP病人血清LncRNA NEAT1(2.43±0.36比2.14±0.27)、TLR2水平[(7.12±1.24)µg/L比(6.45±1.02)µg/L]升高(P<0.05);Pearson相关性分析结果表明,AP病人血清LncRNA NEAT1、TLR2呈正相关(r=0.65,P<0.05),二者与病人APACHEⅡ评分均呈正相关(r=0.50、0.52,P<0.05);ROC曲线结果显示,血清LncRNA NEAT1水平、TLR2单独及联合评估AP病人重症的曲线下面积(AUC)分别为0.73[95%CI:(0.64,0.82)]、0.75[95%CI:(0.67,0.84)]、0.88[95%CI:(0.82,0.94)],血清LncRNA NEAT1联合TLR2水平预测AP病人重症的AUC明显大于二者单独预测(P<0.05)。结论AP病人血清LncRNA NEAT1、TLR2表达水平显著升高,且与病人严重程度和预后有关,临床上检测LncRNA NEAT1、TLR2表达可能有助于AP病人的病情评估。

血清LncRNA NEAT1、TFF1在视网膜母细胞瘤中的表达及预后评估价值

目的分析视网膜母细胞瘤(Rb)患儿血清长链非编码RNA核内富集转录物1(LncRNA NEAT1)、三叶因子1(TFF1)表达及预后评估价值。方法选取2018年1月—2021年1月首都医科大学附属北京安贞医院南充医院眼科手术治疗的Rb患儿85例作为Rb组,以同期体检健康者60例为健康对照组。采用实时荧光定量PCR检测血清LncRNA NEAT1水平,采用酶联免疫吸附试验检测血清TFF1;分析血清LncRNA NEAT1、TFF1与临床病理特征的关系;Cox回归分析Rb预后影响因素;受试者工作特征(ROC)曲线分析血清LncRNA NEAT1、TFF1对Rb患儿预后的评估价值。结果Rb组血清LncRNA NEAT1水平高于健康对照组,血清TFF1低于健康对照组(t/P=38.305/<0.001、34.858/<0.001)。与肿瘤直径<20 mm、病理分化型Rb患儿比较,肿瘤直径≥20 mm、未分化型Rb患儿血清LncRNA NEAT1较高,TFF1较低(LncRNA NEAT1:t/P=17.925/<0.001,16.848/<0.001;TFF1:t/P=12.505/<0.001,8.120/<0.001)。血清LncRNA NEAT1高表达组3年无进展生存率低于低表达组(57.50%vs.88.89%),TFF1低表达组3年无进展生存率低于高表达组(57.14%vs.90.70%)(Log rankχ^(2)/P=13.551/<0.001、15.310/<0.001)。病理未分化型、血清LncRNA NEAT1升高是影响Rb预后的危险因素,血清TFF1升高是其保护因素[HR(95%CI)=1.523(1.147~2.024),1.473(1.108~1.957),0.612(0.413~0.908)];血清LncRNA NEAT1、TFF1及二者联合预测Rb预后的曲线下面积分别为0.836、0.861、0.921,二者联合大于血清LncRNA NEAT1、TFF1单项检测(Z=4.823、4.312,P均<0.001)。结论Rb患儿血清LncRNA NEAT1升高,血清TFF1水平降低,两者与肿瘤最大径及病理分型有关,均是影响Rb患儿预后的因素,两者联合有助于评估患者预后。

磁捕法对传染性非典型肺炎冠状病毒RNA富集体系的初步研究

目的 初步研究建立磁捕法对传染性非典型肺炎又称严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒RNA的富集、纯化体系,以提高逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测SARS冠状病毒RNA的敏感性。方法 根据国际基因库公布的SARS冠状病毒基因序列,自行设计引物、探针,体外克隆目的RNA片段作为标准物质;利用标准RNA以及模拟SARS血清标本的RNA,评价自行设计的SARS冠状病毒巢式RT-PCR检测体系和磁捕法SARS冠状病毒RNA富集检测体系的检测效果。结果SARS冠状病毒巢式RT-PCR检测体系,对于模拟血清SARS标本RNA的最低检测样本浓度为20拷贝/μl,而磁捕法SARS冠状病毒RNA富集检测体系的最低检测样本浓度为1拷贝/μl。结论 初步建立的磁捕法SARS冠状病毒RNA富集检测体系,可有效地对低浓度的RNA样本进行浓缩、纯化,有效提高SARS RT-PCR检测方法的敏感性。

LncRNA-NEAT1通过调控miR-129-5p/HMGB1轴诱导的肝细胞焦亡在急性肝损伤中的机制研究

目的 探讨长链非编码RNA核富集转录本1(LncRNA-NEAT1)通过调控miR-129-5p/高迁移率族蛋白1(HMGB1)轴诱导的肝细胞焦亡在急性肝损伤中的作用机制。方法 运用人肝细胞株L02,通过四氯化碳建立肝细胞损伤模型,检测谷丙转氨酶(ALT)和谷草转氨酶(AST)水平评估肝细胞损伤程度,采用CCK-8方法检测细胞增殖活性,检测白细胞介素(IL)-1β和IL-18评估细胞焦亡程度,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)检测LncRNA-NEAT1和miR-129-5p mRNA的表达水平;干扰NEAT1表达,用四氯化碳处理细胞,检测对照组和处理组细胞中ALT、AST、IL-1β、IL-18水平,采用RT-PCR检测LncRNA-NEAT1和miR-129-5p mRNA的表达水平;干扰NEAT1表达后,转染miR129-5p mimics,用四氯化碳处理细胞,检测对照组和处理组细胞中ALT、AST、IL-1β、IL-18水平,采用RT-PCR检测LncRNA-NEAT1和miR-129-5p mRNA的表达水平;采用双荧光素酶报告基因实验分别验证NEAT1与miR-129-5p、miR-129-5p与HMGB1的关系。结果 四氯化碳处理细胞后,肝细胞中ALT和AST水平显著增加,IL-1β和IL-18表达水平升高,细胞活性下降,NEAT1表达升高,miR-129-5p表达抑制,差异均有统计学意义(P<0.05);干扰NEAT1后,肝细胞中ALT、AST、IL-1β、IL-18水平下降,miR-129-5p表达显著增加,差异均有统计学意义(P<0.05);干扰NEAT1再转染miR-129-5p mimic后,抑制了肝细胞中ALT、AST、IL-1β、IL-18水平,减弱了NEAT1表达,增加了miR-129-5p表达,差异均有统计学意义(P<0.05);NEAT1靶向调控miR-129-5p表达,miR-129-5p靶向作用于HMGB1。结论 干扰NEAT1可能靶向调控miR-129-5p/HMGB1轴抑制在四氯化碳诱导的急性肝损伤中肝细胞的焦亡。

利用外源RNA作为内参结合qPCR准确检测SF2蛋白RIP富集RNA的效率

利用实时荧光定量PCR技术(Real-time Quantitative polymerase chain reaction,q PCR)检测0.1%甲醛交联RNA免疫共沉淀(RNA Immunoprecipitation,RIP)富集SF2蛋白相互作用的RNA效率,为研究可变剪接因子SF2相互作用RNA的富集效率提供准确的质检方案。采用RIP技术获取He La细胞中SF2蛋白相互作用的RNA,等比例加入外源酿酒酵母(BY4741)RNA,并以其β-actin作为内参基因,利用q PCR检测RIP富集SF2蛋白相互作用RNA的效率。结果显示,0.1%甲醛交联RIP技术特异性捕获得到SF2蛋白-RNA复合物;q PCR技术检测阳性基因PABP、Srsf1在SF2抗体捕获的产物和Ig G抗体的产物中相应RNA的浓度差异均在60倍以上。利用q PCR技术,以外源酿酒酵母(BY4741)RNA作为内参,能快速、准确定量检测RNA的富集效率。

血清长链非编码RNA核富集转录体1及可溶性细胞间黏附分子1水平与冠状动脉慢血流现象的关系

目的 探讨血清长链非编码RNA核富集转录体1(NEAT1)及可溶性细胞间黏附分子1(sICAM-1)水平与冠状动脉慢血流现象(CSFP)的关系。方法 选择2020年8月至2022年2月在四川省遂宁市中心医院疑诊为冠状动脉粥样硬化性心脏病而行冠状动脉造影检查的患者,以其中造影未见明显病变的110例为研究对象,将心肌梗死溶栓试验(TIMI)血流分级2级及以下且无冠状动脉狭窄、诊断为CSFP的70例患者作为CSFP组,以TIMI血流分级3级且无冠状动脉明显狭窄者40例作为对照组。利用荧光定量聚合酶链反应法检测血清NEAT1表达,酶联免疫吸附试验法检测血清sICAM-1表达。比较2组NEAT1及sICAM-1表达差异。Pearson线性相关分析方法分析血清NEAT1及sICAM-1水平与冠状动脉TIMI平均血流帧数的相关性。采用多因素Logistic回归方法分析CSFP的危险因素。采用受试者工作特征曲线分析血清NEAT1、sICAM-1单独及联合检测对CSFP的诊断效能。结果 CSFP组血清NEAT1、sICAM-1表达水平高于对照组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,血清NEAT1、sICAM-1表达与冠状动脉TIMI平均血流帧数呈显著正相关(r=0.456、0.503,均P<0.001)。血清NEAT1与sICAM-1的表达水平呈显著正相关(r=0.541,P<0.001)。有吸烟史、血清NEAT1、sICAM-1水平升高是CSFP的独立危险因素,白蛋白升高是CSFP的保护因素(均P<0.05)。血清NEAT1、sICAM-1单独及联合检测诊断CSFP的曲线下面积分别为0.698(95%置信区间:0.591~0.736)、0.789(95%置信区间:0.734~0.832)、0.836(95%置信区间:0.802~0.885),联合检测诊断CSFP的曲线下面积显著高于血清NEAT1、sICAM-1单独检测(Z=2.061、P=0.039,Z=6.403、P<0.001)。结论 CSFP患者血清NEAT1、sICAM-1水平升高。有吸烟史、血清NEAT1、sICAM-1水平升高是CSFP的独立危险因素,白蛋白升高是CSFP的保护因素。血清NEAT1、sICAM-1联合检测对CSFP具有较高的诊断价值。

A/U富集片段RNA结合蛋白的固相纯化与鉴定

RNA与细胞靶蛋白结合是RNA发挥其生物学功能的重要基础,因此,分离和鉴定RNA结合蛋白是研究RNA功能的必要步骤.目前,RNA结合蛋白的分离和鉴定方法较多,但各有优缺点.本实验利用可溶性碳二亚胺(EDC)介导的缩合反应,将A/U富集片段RNA共价偶联到固相介质amine M-270上,再用固定化RNA经亲和层析从细胞抽提物中分离纯化RNA结合蛋白,并以SDS-PAGE联合质谱分析和Western blotting等方法鉴定RNA特异性结合蛋白.最后通过荧光原位杂交和共聚焦显微镜证明这些RNA特异性结合蛋白确与RNA在细胞内结合.实践证明这一方法简单、高效、易于掌握.

lncRNA NEAT1沉默通过IL-10/STAT3信号通路调节小胶质细胞极化对脑缺血再灌注损伤大鼠的影响

目的探讨长链非编码RNA核富集转录体1(lncRNA NEAT1)沉默通过白细胞介素(IL)-10/信号传导与转录激活因子3(STAT3)信号通路调节小胶质细胞极化对脑缺血再灌注损伤(CIRI)大鼠的影响。方法SD大鼠随机分为假手术组(Sham组)、CIRI组、CIRI+si-NC组、CIRI+si-NEAT1组,每组24只。除Sham组外,其余各组大鼠采用线栓法构建CIRI模型。建模结束后,各组大鼠给予对应处理7 d。对大鼠神经功能缺损进行评分;观察脑组织病理学变化;检测脑梗死体积百分比,脑组织中离子钙接头蛋白分子1阳性(Iba1+)细胞中M1型、M2型极化标志物阳性(Iba1+CD86+、Iba1+CD206+)细胞的数量,IL-1β、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、IL-4、IL-10,lncRNA NEAT1、诱导型一氧化氮合酶(iNOS)、精氨酸酶-1(Arg-1)、IL-10 mRNA,IL-10、STAT3、磷酸化STAT3(p-STAT3)蛋白水平。结果与Sham组相比,CIRI组大鼠脑组织病理损伤严重,神经功能缺损评分、脑梗死体积百分比、脑组织中Iba1+CD86+、Iba1+CD206+阳性细胞数量、CD86/CD206比值、IL-1β、TNF-α、IL-4、IL-10水平、lncRNA NEAT1、iNOS、Arg-1、IL-10 mRNA水平、IL-10、p-STAT3/STAT3蛋白水平显著升高(P<0.05);与CIRI组和CIRI+si-NC组相比,CIRI+si-NEAT1组大鼠脑组织病理损伤减轻,神经功能缺损评分、脑梗死体积百分比、脑组织中Iba1+CD86+阳性细胞数量、CD86/CD206比值、IL-1β、TNF-α水平、lncRNA NEAT1、iNOS mRNA水平显著降低(P<0.05),Iba1+CD206+阳性细胞数量、IL-4、IL-10水平、Arg-1、IL-10 mRNA、IL-10、p-STAT3/STAT3蛋白水平显著升高(P<0.05)。结论沉默lncRNA NEAT1可能通过激活IL-10/STAT3信号通路,调控小胶质细胞极化,从而改善CIRI大鼠脑组织损伤。

lncRNA NEAT1通过抑制miR-let-7a激活BZW2促进喉乳头状瘤细胞的增殖和凋亡逃逸

目的探讨长链非编码RNA核富集转录本1(lncRNA NEAT1)对喉乳头状瘤(LP)细胞的增殖和凋亡逃逸的调控作用和机制。方法培养人喉乳头状瘤细胞Hs840.T,将正常人口腔上皮细胞(HOECs)作为对照。将Hs840.T分为lncRNA NEAT1过表达载体(pcDNA-NEAT1)组、pcDNA-NEAT1阴性对照(pcDNA-NC)组、沉默lncRNA NEAT1的小干扰RNA载体(siNEAT1)组、siNEAT1的阴性对照(siNC)组、miR-let-7a的模拟物(mimic)组、mimic阴性对照(mimic-NC)组、miR-let-7a抑制剂(inhibitor)组、inhibitor阴性对照(inhibitor-NC)组、沉默碱性亮氨酸拉链和W2结构域2(BZW2)的小干扰RNA载体(siBZW2)组、siBZW2的阴性对照(siBZW2-NC)组、pcDNA-NEAT1联合siBZW2给药(pcDNA-NEAT1+siBZW2)组、pcDNA-NEAT1联合siBZW2-NC给药(pcDNA-NEAT1+siBZW2-NC)组。qRT-PCR检测各组中lncRNA NEAT1及其预测靶分子miR-let-7a的表达。Western blot和qRT-PCR检测BZW2的表达。双荧光素酶报告基因实验检测Hs840.T中lncRNA NEAT1和miR-let-7a以及miR-let-7a和BZW2的靶向关系。MTT实验测定Hs840.T的增殖能力。Annexin V-FITC/PI双染法检测Hs840.T的凋亡逃逸能力。结果Hs840.T中的lncRNA NEAT1和BZW2表达高于HOECs(P<0.05),而miR-let-7a表达低于HOECs(P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验结果表明,Hs840.T中lncRNA NEAT1吸附抑制miR-let-7a并上调BZW2的表达(P<0.05),且BZW2是miR-let-7a的靶基因。与pcDNA-NC组相比,pcDNA-NEAT1组Hs840.T的增殖率增加(P<0.05),早期、晚期凋亡率均降低(P<0.05);与siNC组相比,siNEAT1组Hs840.T的增殖率降低(P<0.05),早期、晚期凋亡率均增加(P<0.05)。另外,与pcDNA-NEAT1+siBZW2-NC组相比,pcDNA-NEAT1+siBZW2组Hs840.T的增殖率降低(P<0.05),早期、晚期凋亡率均增高(P<0.05)。结论lncRNA NEAT1通过抑制miR-let-7a激活BZW2促进LP细胞的增殖和凋亡逃逸。

巴马小型猪冠状动脉微栓塞后白细胞介素-1受体相关激酶1、肿瘤坏死因子受体相关因子6及AU碱基富集区RNA结合因子1 mRNA的表达及意义

目的探讨巴马小型猪冠状动脉微栓塞(CME)后心肌组织白细胞介素-1受体相关激酶1(IRAK1)、肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)及AU碱基富集区RNA结合因子1(AUF1)的动态表达情况及其意义。方法将30只巴马小型猪分为假手术组(n=5)和CME组(n=25)。CME组经微导管于左前降支中远端注入微栓塞球混悬液;假手术组注射等量生理盐水。将CME组均分为5组于建模后3 h、6 h、9 h、12 h、24 h进行观察;假手术组小型猪于6 h后进行观察。光镜下观察各组心肌组织改变,并检测心肌组织IRAK1、TRAF6及AUF1 mRNA表达。结果建模后6 h,CME组血管内均可见微栓塞球,周围出现微梗死灶。建模后6 h,与假手术组比较,CME组心肌组织IRAK1、TRAF6及AUF1 mRNA的表达水平均显著增加(P<0.05)。CME组心肌组织IRAK1、TRAF6及AUF1 mRNA的表达水平都在建模后3 h和6 h升高,9 h达高峰,12 h和24 h下降;与3 h和24 h比较,CME组9 h心肌组织IRAK1、TRAF6及AUF1 mRNA的表达水平均显著增加(P<0.05)。结论 IRAK1、TRAF6及AUF1 mRNA高表达于CME后心肌组织,并呈现出明显的时间变化规律。

糖尿病肾病患者血清miR-495-3p和LncRNA NEAT1表达水平及其与患者预后的相关性研究

目的研究血清微小RNA(micro RNA,miR)-495-3p,长链非编码RNA核富集转录体1(LncRNA NEAT1)水平与糖尿病肾病(DN)患者预后的关系。方法纳入河北以岭医院2019年1月~2021年1月期间116例DN患者作为DN组,收集其临床资料,根据肾脏病理损伤程度分为Ⅰ级组、Ⅱ级组、Ⅲ级组和Ⅳ级组;根据治疗后6个月随访期间是否发展为终末期肾病分为预后良好组和预后不良组;另收集同期单纯2型糖尿病(T2DM)患者102例作为T2DM组和健康体检者100例作为对照组。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测血清miR-495-3p和LncRNA NEAT1水平;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清miR-495-3p和LncRNA NEAT1水平对DN患者预后的预测价值。结果对照组、T2DM组和DN组血清miR-495-3p水平(1.02±0.25,0.76±0.22,0.58±0.16)依次降低,LncRNA NEAT1水平(1.01±0.23,1.58±0.29,2.16±0.36)依次升高,差异均有统计学意义(F=117.238,391.506,均P<0.05)。DN中T2DM病程≥10年,eGFR≥60 ml/min/1.73 m^(2),FBG≥8mmol/L,24 h尿蛋白≥3 g/24 h的血清miR-495-3p水平(0.52±0.14,0.52±0.15,0.50±0.16,0.49±0.15)低于T2DM病程<10年,eGFR<60 ml/min/1.73 m^(2),FBG<8mmol/L和24 h尿蛋白<3 g/24 h(0.67±0.18,0.69±0.19,0.70±0.19,0.73±0.18);而LncRNA NEAT1水平(2.33±0.42,2.29±0.38,2.35±0.43,2.31±0.40)高于T2DM病程<10年,eGFR<60 ml/min/1.73 m^(2),FBG<8mmol/L和24 h尿蛋白<3 g/24 h(1.90±0.31,1.92±0.33,1.88±0.31,1.90±0.36),差异均有统计学意义(tmiR-495-3p=5.033,5.300,6.122,7.721,t LncRNA NEAT1=5.956,5.244,6.436,5.529,均P<0.05)。Ⅰ级组、Ⅱ级组、Ⅲ级组和Ⅳ级组血清miR-495-3p水平(0.74±0.19,0.61±0.16,0.50±0.08,0.39±0.06)依次降低,LncRNA NEAT1水平(1.69±0.30,2.08±0.32,2.34±0.35,2.74±0.39)依次升高,差异有统计学意义(F=32.060,46.730,均P<0.05)。预后不良组血清miR-495-3p水平(0.45±0.10)低于预后良好组(0.65±0.17),LncRNA NEAT1(2.53±0.47)水平高于预后良好组(1.97±0.36),差异有统计学意义(t=6.836,7.148,均P<0.05)。血清miR-495-3p,LncRNA NEAT1水平单独及联合预测DN患者预后不良的曲线下面积(AUC)分别为0.784(95%CⅠ:0.702~0.867),0.753(95%CⅠ:0.658~0.848)和0.834(95%CⅠ:0.755~0.912),特异度分别为71.1%,86.8%和77.6%,敏感度分别为62.5%,57.5%和77.5%。结论DN患者血清miR-495-3p低表达,LncRNA NEAT1高表达,二者水平与DN患者肾损伤及预后有关。

血清lncRNANEAT1在急性心肌梗死患者中的表达及其临床意义

目的探究血清长链非编码RNA(lncRNA)核富集转录体1(NEAT1)在急性心肌梗死(AMI)患者中的表达和临床意义。方法选取2018年6月—2020年12月长安医院收治的AMI患者77例(AMI组),另选取同期收治的不稳定型心绞痛(UAP)患者70例(疾病对照组)和体检健康者76名(正常对照组)。检测所有研究对象血清肌钙蛋白I(cardiac troponin I,cTnI)和心肌酶谱[肌酸激酶(CK)、肌酸激酶MB同工酶(CK-MB)、乳酸脱氢酶(LDH)、天门冬氨酸氨基转移酶(AST)]水平。采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测血清lncRNA NEAT1相对表达量。采用受试者工作特征(ROC)曲线评估lncRNA NEAT1诊断AMI的效能。采用Spearman相关分析评估lncRNA NEAT1相对表达量与血清心肌酶谱、cTnI水平的相关性。结果正常对照组、疾病对照组和AMI组lncRNA NEAT1相对表达量依次升高(P<0.001)。与正常对照组、疾病对照组相比,AMI组cTnI、CK、CK-MB、LDH、AST水平升高(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,血清lncRNA NEAT1相对表达量诊断AMI的曲线下面积为0.825,鉴别诊断AMI和UAP的曲线下面积为0.759。Spearman相关分析结果显示,AMI患者血清lncRNA NEAT1相对表达量与CK、CK-MB、LDH、AST和cTnI呈正相关(P<0.05)。结论AMI患者血清lncRNANEAT1呈高表达,可作为AMI潜在的生物标志物。

LncRNA NEAT1通过调节miR-125b-5p/IGFBP5轴对血管瘤内皮细胞增殖、凋亡、迁移的实验研究

目的 探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)核富集转录本1(nuclear enriched abundant transcript 1,NEAT1)通过调节微小核糖核酸(micro RNAs,miR)-125b-5p/胰岛素样生长因子结合蛋白5(insulinlike growth factor binding protein 5,IGFBP5)轴对血管瘤内皮细胞增殖、凋亡和迁移的影响。方法 实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)、蛋白免疫印迹(Western blot)分别检测血管瘤组织(2016年3月~2019年3月收集,n=18)、瘤旁组织样本(2016年3月~2019年3月收集,n=18)以及人脐静脉内皮细胞HUVES,人血管瘤内皮细胞HemECs,HDEC中NEAT1,miR-125b-5p及IGFBP5蛋白表达。构建沉默NEAT1,同时沉默NEAT1和miR-125b-5p的HemECs细胞系,通过细胞活力检测试剂盒(cell counting kit-8,CCK-8)、台盼蓝染色、流式细胞术、划痕愈合实验、Western blot分别观察NEAT1和miR-125b-5p对HemECs细胞增殖、凋亡、迁移及IGFBP5,增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)、B细胞淋巴瘤/白血病-2(B cell lymphoma/lewkmia-2,Bcl-2)和基质金属蛋白酶-9(matrix metalloproteinase-9,MMP-9)蛋白表达的影响;双荧光素酶报告基因实验检测NEAT1与miR-125b-5p,mi R-125b-5p与IGFBP5的关系。结果 与瘤旁组织比较,血管瘤组织中NEAT1(2.87±0.22 vs 1.00±0.00),IGFBP5蛋白(1.45±0.14 vs 0.27±0.02)表达水平升高,miR-125b-5p(0.24±0.02 vs 1.00±0.00)表达水平降低,差异具有统计学意义(t=35.400~161.220,均P <0.05);与HUVES细胞比较,HemECs,HDEC细胞中NEAT1(2.76±0.24,1.78±0.13 vs 1.00±0.00),IGFBP5蛋白(1.31±0.15,0.78±0.06 vs 0.24±0.02)表达升高,miR-125b-5p表达(0.19±0.02,0.45±0.04 vs 1.00±0.00)降低,差异具有统计学意义(t=17.320~99.204,14.697~33.680,均P<0.05),且HemECs细胞中NEAT1和IGFBP5蛋白表达量最高,miR-125b-5p表达量最低,因此,选取HemECs细胞为研究对象;与si-NC组比较,si-NEAT1组NEAT1(0.32±0.02 vs 1.01±0.12)表达、A值(0.45±0.04 vs 1.13±0.11)、细胞生长率(32.28%±2.79%vs 99.41%±0.22%)、划痕愈合率(20.33%±1.23%vs 49.24%±2.43%)及IGFBP5(0.41±0.04 vs 1.31±0.20),PCNA(0.36±0.04 vs 1.27±0.14),Bcl-2(0.48±0.04 vs 1.39±0.16)和MMP-9(0.21±0.02 vs 1.09±0.10)蛋白表达降低,mi R-125b-5p(1.87±0.15 vs 1.02±0.10)表达、细胞凋亡率(45.58%±3.34%vs 12.36%±1.07%)升高,差异具有统计学意义(t=10.809~58.755,均P <0.05);下调miR-125b-5p减弱了沉默NEAT1对HemECs细胞增殖、迁移的抑制及对细胞凋亡的促进作用(t=9.218~15.010,均P <0.05);NEAT1与miR-125b-5p,miR-125b-5p与IGFBP5存在靶向调控关系。结论 沉默NEAT1通过上调miR-125b-5p来抑制IGFBP5表达,从而抑制HemECs细胞增殖、迁移,并促进细胞凋亡。

反复呼吸道感染患儿外周血lncRNA NEAT1的表达及与Th1Th2平衡的关系

目的探讨长链非编码RNA核富集转录体1(LncRNA NEAT1)在反复呼吸道感染(RRI)患儿血浆中的表达情况,并分析其与Th1/Th2平衡的关系。方法选取2018年6月~2019年3月本院收治的68例RRI患儿为RRI组,并选取同期74例健康幼儿为健康组。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测血浆lncRNA NEAT1水平;以流式细胞仪检测Th1、Th2细胞占CD4+T细胞的比例,计算Th1/Th2比值;采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测血浆干扰素-γ(IFN-γ)、白介素-4(IL-4)水平;观察RRI患儿血浆lncRNA NEAT1、Th1、Th2、Th1/Th2水平与IFN-γ、IL-4,及lncRNA NEAT1表达水平与Th1/Th2平衡的关系。结果与健康组相比,RRI组患儿血浆lncRNA NEAT1表达水平、外周血CD4+Th2细胞比例、IL-4水平明显升高(t=9.198、10.218、27.449,P均<0.05),外周血CD4+Th1细胞比例、Th1/Th2比值、IFN-γ水平明显降低(t=10.689、14.572、23.665,P均<0.05);RRI组患儿血浆lncRNA NEAT1表达水平与IFN-γ呈负相关(r=0.383,P<0.05),Th1/Th2比值与IL-4、lncRNA NEAT1表达水平与Th1/Th2比值均呈负相关(r=0.428,P<0.05),Th1细胞比例、Th1/Th2比值与IFN-γ呈正相关(r=0.458、0.327,P均<0.05),lncRNA NEAT1表达水平、Th2细胞比例与IL-4(r=0.484、0.537,P均<0.05)呈正相关。结论RRI患儿血浆lncRNA NEAT1呈高水平,Th1/Th2比值呈低水平,lncRNA NEAT1与Th1/Th2有一定负相关性,两者可能相互作用,从而共同影响RRI发生发展。

PAIP1结合RNA测序及整合分析

目的分析PAIP1结合RNA的分子特征,探讨PAIP1的新功能。方法采用Illumina Xten测序平台对HeLa细胞进行建库测序,通过对PAIP1结合RNA进行整合分析,分析PAIP1结合RNA的分子特征,对PAIP1结合靶基因进行KEGG聚类分析。结果PAIP1具有广泛的RNA结合活性,结合显著富集在CDS和Intron区域;KEGG分析表明,PAIP1结合的RNA分子主要参与了焦点粘连、剪切体、RNA转运、蛋白多糖在癌症中的作用、HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路。结论PAIP1具有结合RNA分子的功能,是一个新的RNA结合蛋白,可能在肿瘤的发生、发展过程中发挥作用。