RNA甲基转移酶BCDIN3D的表达与乳腺癌预后的关系

目的探讨RNA甲基转移酶BCDIN3D的表达与乳腺癌患者预后的关系。方法选取2013年6月至2015年1月重庆市红十字会医院收治的乳腺癌患者80例,年龄19~65(46.7±4.7)岁;分子分型Luminal A、Luminal B、ERBB2+、Basal-like型分别10、32、20、18例;肿瘤分期T 0~1、T 2、T 3分别9、34、37例;淋巴结分期N 0~1、N 2、N 3分别9、38、33例。均行标准乳腺癌改良根治术,术中获取乳腺癌组织标本,采用免疫组织化学法(IHC)检测乳腺癌组织中BCDIN3D的表达情况。对患者进行随访,统计总生存期(OS)。采用COX比例风险模型分析乳腺癌患者预后的影响因素。结果80例乳腺癌患者中,BCDIN3D阳性表达者30例(37.5%);BCDIN3D阴性表达者50例(62.5%)。BCDIN3D阳性表达者与BCDIN3D阴性表达者间肿瘤分期和淋巴结分期差异有统计学意义(P<0.05),不同年龄、月经状态、分子分型差异均无统计学意义(P>0.05)。中位随访时间为42(23~64)个月,Kaplan-Meier分析结果显示,BCDIN3D阳性表达者、BCDIN3D阴性表达者的中位OS分别为41.2(95%CI:31.2~46.9)、49.5(95%CI:42.1~51.6)个月,BCDIN3D阳性表达者的OS短于BCDIN3D阴性表达者(χ^2=25.241,P<0.001)。COX分析结果显示,肿瘤分期、淋巴结分期、分子分型、BCDIN3D表达是影响乳腺癌患者OS的独立预后因素(P<0.05)。结论BCDIN3D阳性表达与乳腺癌患者预后不良有关。

RNA甲基转移酶METTL3在急性髓系白血病发生发展及耐药中的研究进展

急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)是成人最常见的血液系统恶性肿瘤,其广泛的基因组变化和分子突变为药物的开发提供了潜在靶点。目前靶向治疗药物及免疫治疗无法替代传统的“3+7”方案。30%~40%的初治AML患者对于传统蒽环类方案原发耐药,治疗效果极差,是AML治疗及研究领域的重大难题。甲基转移酶样3(methyltransferaselike 3,METTL3)作为重要的甲基转移酶在调节AML发生发展及耐药中具有重要意义。本文总结了METTL3在AML发生发展及耐药中的作用及其在抗白血病治疗中的潜力,以期为克服AML的耐药及复发提供新思路及潜在治疗靶点。

DNA甲基转移酶3b催化区保守序列shRNA真核表达载体构建

目的构建针对基因DNA甲基转移酶3bmRNA催化区保守序列的shRNA真核表达载体,并对其克隆进行鉴定。方法以DNMT3bmRNA序列为靶基因设计3条shRNA和一条阴性对照HK,应用基因重组技术将其克隆到真核表达载体PGensil-1中,构建真核表达载体P-DNMT3b-shRNA1、P-DNMT3b-shRNA2、P-DNMT3b-shRNA3、P-HK。将重组质粒转化到大肠杆菌DH5α中,接种于LB平板后分别挑取5个单克隆菌落进行扩增,经筛选后对提取质粒进行测序鉴定。结果重组质粒经SalⅠ酶切鉴定得到大小2个基因片段,大片段约为4.55kb,小片段约为440bp,与设计相同;四组重组质粒经测序鉴定显示插入完全正确。结论成功构建了P-DNMT3b-shRNA(1、2、3)及HK真核表达载体,为下一步实验奠定了基础。

METTL3介导的PDK1 mRNA m^(6)A修饰通过Akt/mTOR信号通路促进肺上皮细胞增殖

腺苷N6-位点甲基化(m^(6)A)在细胞增殖过程中发挥重要作用。RNA甲基转移酶3(METTL3)作为催化m^(6)A关键酶,其介导m^(6)A修饰在肺上皮细胞增殖中的作用机制尚不明确。本研究旨在探讨METTL3介导m^(6)A修饰调控肺上皮细胞增殖的效应及机制。结果显示,在肺上皮细胞中敲低METTL 3显著抑制细胞生长,而过表达METTL3则促进了细胞增殖(P<0.05)。进一步的蛋白质免疫印迹结果显示,细胞生长和增殖的关键蛋白质PCNA在METTL 3敲降的肺上皮细胞中蛋白质水平的表达显著下调,并且Akt以及mTOR的磷酸化水平显著降低(P<0.05)。细胞免疫荧光结果发现,METTL 3敲降的肺上皮细胞中m^(6)A修饰水平显著降低(P<0.05)。实时荧光定量PCR及蛋白质免疫印迹结果表明,Akt-mTOR信号通路上游调控分子PDK1的mRNA和蛋白质表达水平在METTL 3敲降的肺上皮细胞中显著下降(P<0.05)。机制上,m^(6)A-IP-qPCR和RIP-qPCR结果进一步表明,METTL3催化PDK 1 mRNA的3′UTR区域m^(6)A修饰,进而被YTH N6-甲基腺苷RNA结合蛋白1(YTHDF1)识别,增强其mRNA的稳定性。总之,本研究揭示了METTL3通过增强PDK1 m^(6)A修饰,进而激活Akt-mTOR信号通路,促进细胞增殖。本研究为METTL3在上皮细胞增殖中的新角色提供了证据,同时为治疗肺上皮细胞损伤修复提供了新的治疗靶点。

DNA甲基转移酶3b对乳腺癌细胞微小RNA表达的影响

目的通过DNA甲基转移酶抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)与siRNA干扰改变乳腺癌细胞MCF-7中DNA甲基化水平,探讨DNA甲基转移酶3b(Dnmt3b)表达对乳腺癌细胞相关mRNA、微小RNA(miRNA)的影响。方法通过5-Aza-CdR抑制乳腺癌细胞整体甲基化水平,免疫荧光染色检测其抑制效果,高通量测序检测乳腺癌细胞miRNA的表达,荧光定量PCR(qRT-PCR)检测乳腺癌细胞miRNA及乳腺癌相关基因的表达;通过siRNA干扰抑制乳腺癌细胞中Dnmt3b的表达,qRT-PCR和Western blotting检测siRNA干扰效率,细胞生长曲线反映细胞生长情况。结果5-Aza-CdR降低细胞整体甲基化水平,siRNA干扰后Dnmt3b的表达下降,细胞生长显著抑制;高通量测序显示5-Aza-CdR作用后67个miRNA表达有统计学差异(均P<0.05);qRT-PCR结果显示5-Aza-CdR作用后乳腺癌细胞中miR-200a、miR-411、miR-382、miR-409、miR-493、miR-127、miR-520a、miR-654表达显著上调(P<0.05);siRNA干扰Dnmt3b后乳腺癌细胞中miR-29b、miR-506、miR-200a、miR-203b、miR-409、miR-520a、miR-654的表达显著上调(P<0.05),而miR-200b、miR-127的表达显著下调(均P<0.05);5-Aza-CdR作用后乳腺癌细胞WWOX、MMP7的表达下调,TCF21、TIMP1的表达上调(均P<0.05);siRNA干扰Dnmt3b后乳腺癌细胞抑癌基因BRCA1、BRCA2及癌基因MMP7、survivin的表达均下调(均P<0.05)。结论Dnmt3b可影响乳腺癌细胞相关基因WWOX、TCF21、BRCA1、BRCA2、MMP7、TIMP1、PKM2、survivin及miR-29b、miR-506、miR-200a、miR-200b、miR-203b、miR-409、miR-127、miR-520a、miR-654的表达。

组蛋白H3K4甲基转移酶KMT2D研究进展

组蛋白-赖氨酸N-甲基转移酶2D(KMT2D),属于哺乳动物H3K4甲基转移酶家族成员,在成人组织中广泛表达,对于早期胚胎发育有重要作用。C-末端的SET区域负责组蛋白H3K4甲基化,维持KMT2D蛋白的稳定性。KMT2D与WRAD、NCOA6、PTIP、PA1和H3K27去甲基化酶UTX组成复合物,在其中起到支架蛋白的作用,维持UTX的稳定性。KMT2D主要催化哺乳动物H3K4单甲基化,与转录因子共同作用于增强子区域,从而调控基因表达。KMT2D在调节细胞发育、分化、新陈代谢和肿瘤抑制方面具有重要作用,其突变导致多种疾病发生。进一步研究KMT2D有助于揭示其异常所引发多种疾病的病因,并且对开发临床药物提供有力的帮助。

LncRNA-MIAT通过抑制miR-519d-3p激活EZH2促进甲状腺癌的恶性行为

目的:探讨长链非编码RNA MIAT(LncRNA-MIAT)对甲状腺癌细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的调控作用与分子机制。方法:用癌症基因组图谱(TCGA)和甲状腺癌(THCA)mRNA-seq数据分析LncRNA-MIAT和组蛋白甲基化转移酶2(EZH2)在甲状腺癌中的表达。用人正常甲状腺细胞系Nthy-ori 3-1和人甲状腺癌细胞系FTC-133作为靶细胞。qPCR法检测LncRNA-MIAT、miR-519d-3p、EZH2 mRNA的表达水平差异。RNA荧光原位杂交(FISH)检测LncRNA-MIAT在FTC-133细胞中的定位,Western blot检测EZH2蛋白的表达。荧光素酶报告基因检测LncRNA-MIAT和miR-519d-3p以及miR-519d-3p与EZH2的直接作用。将FTC-133细胞分为6组[空白对照组(control组)、空载体组(Empty vector组)、过表达LncRNA-MIAT组(LncRNA-MIAT组)、miR-519d-3p的抑制剂组(miR-519d-3p inhibitor组)、EZH2的抑制剂EPZ-6438处理组(EPZ-6438组)、miR-519d-3p抑制剂联合过表达LncRNA-MIAT组(LncRNA-MIAT+miR-519d-3p inhibitor组)]。用Edu试剂盒和平板克隆法检测细胞增殖。用流式细胞术检测细胞凋亡。用Transwell细胞迁移和侵袭实验检测细胞的行为。结果:LncRNA-MIAT和EZH2在甲状腺癌组织和细胞中的表达均上调,二者具有正相关性(r=0.466,P<0.05),miR-519d-3p在FTC-133细胞中表达下调(P<0.05)。经过双荧光素酶报告基因实验检测发现miR-519d-3p的靶基因是EZH2,且LncRNA-MIAT靶向抑制miR-519d-3p激活EZH2。与Empty vector组相比,LncRNA-MIAT组和miR-519d-3p inhibitor组的Edu阳性细胞百分比、细胞克隆数、细胞侵袭和迁移数均显著上调(P<0.05),细胞凋亡率均减少(P<0.05)。EZH2的抑制剂EPZ-6438则减少Edu阳性细胞百分比、细胞克隆数、细胞侵袭和迁移数(P<0.05),增加细胞凋亡率(P<0.05)。分别与LncRNA-MIAT组或miR-519d-3p inhibitor组比,LncRNA-MIAT+miR-519d-3p inhibitor组的Edu阳性细胞百分比、细胞克隆数、细胞侵袭和迁移数均显著上调(P<0.05),细胞凋亡率降低(P<0.05)。结论:甲状腺癌细胞中LncRNA-MIAT通过抑制miR-519d-3p激活EZH2促进甲状腺癌的恶性行为。

DA、CARM1、25-(OH)-D 3在糖尿病患者外周血中的表达及与NAFLD发生的关系

目的探讨多巴胺(DA)、共激活剂相关精氨酸甲基转移酶1(CARM1)、25-羟维生素D 3[25-(OH)-D 3]在糖尿病患者外周血中的表达及与非酒精性脂肪肝(NAFLD)发生的关系。方法选取2021年5月至2023年2月在该院治疗的2型糖尿病(T2DM)合并NAFLD患者70例作为T2DM合并NAFLD组,同时选取单纯T2DM患者66例作为T2DM组,选取体检健康者70例作为健康组,比较各组外周血DA、CARM1、25-(OH)-D 3水平,同时分析T2DM合并NAFLD组不同血糖控制、严重程度患者外周血DA、CARM1、25-(OH)-D 3水平。采用Pearson相关分析外周血DA、CARM1、25-(OH)-D3水平与糖化血红蛋白(HbA1c)、受控衰减参数(CAP)的相关性,受试者工作特征曲线分析外周血DA、CARM1、25-(OH)-D 3诊断重度NAFLD的价值。结果T2DM合并NAFLD组外周血DA和25-(OH)-D 3水平明显低于T2DM组和健康组(P<0.05),而CARM1水平明显高于T2DM组和健康组(P<0.05);T2DM组外周血DA和25-(OH)-D 3水平明显低于健康组(P<0.05),而CARM1水平明显高于健康组(P<0.05)。T2DM合并NAFLD组血糖控制差者DA和25-(OH)-D 3水平明显低于血糖控制好者(P<0.05),而CARM1水平明显高于血糖控制好者(P<0.05)。重度患者DA和25-(OH)-D 3水平明显低于轻中度患者(P<0.05),而CARM1水平明显高于轻中度患者(P<0.05)。外周血DA、25-(OH)-D 3水平与HbA1c、CAP呈负相关(P<0.05),CARM1水平与HbA1c、CAP呈正相关(P<0.05)。CARM1、25-(OH)-D 3、DA诊断重度NAFLD的曲线下面积分别为0.858(95%CI 0.768~0.948)、0.922(95%CI 0.856~0.989)、0.571(95%CI 0.427~0.715)。结论DA和25-(OH)-D 3水平在T2DM患者外周血中降低,而CARM1水平升高,尤其在T2DM合并NAFLD患者中变化更加明显;DA、CARM1、25-(OH)-D 3水平与血糖控制、NAFLD严重程度存在相关性,其中CARM1、25-(OH)-D 3水平在诊断重度NAFLD方面有一定应用价值。

血清DNMT1和lncRNA MEG3表达水平与帕金森病的关联性研究

目的探讨血清DNA甲基转移酶1(DNMT1)、长链非编码RNA人类母系表达基因3(lncRNA MEG3)表达水平与帕金森病(PD)的关联性。方法招募2020年3月至2023年1月青海红十字医院神经内科收治的PD患者106例作为PD组,另选择同期健康体检者103名作为对照组。比较两组的临床资料,分析PD患者血清DNMT1、lncRNA MEG3表达水平与临床指标的相关性。采用多因素logistic回归分析影响PD发生的因素,采用受试者工作特征(ROC)曲线评估血清DNMT1、lncRNA MEG3水平对PD的诊断价值。结果PD组血清DNMT1水平高于对照组,总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)及lncRNA MEG3水平低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,PD患者血清DNMT1水平与TC、TG、LDL-C水平呈负相关(P<0.05),与统一帕金森病评定量表(UPDRS)Ⅰ评分、UPDRSⅡ评分、UPDRSⅢ评分、Hoehn-Yahr(H-Y)分期呈正相关(P<0.05)。lncRNA MEG3水平与TC、TG、LDL-C水平呈正相关(P<0.05),与UPDRSⅠ评分、UPDRSⅡ评分、UPDRSⅢ评分、H-Y分期呈负相关(P<0.05)。多因素logistic回归分析结果显示,较高的血清DNMT1水平是促进PD发生的独立危险因素(P<0.05),较高的lncRNA MEG3水平是抑制PD发生的独立保护因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,血清DNMT1、lncRNA MEG3水平具有诊断PD的应用价值(P<0.05),且联合两指标可进一步提高诊断效能[AUC(95%CI)=0.906(0.865~0.947)],灵敏度和特异度分别为80.21%和89.34%。结论PD患者血清DNMT1呈高表达,lncRNA MEG3呈低表达,二者联合检测有助于临床诊断PD。

N6-甲基腺苷甲基转移酶样蛋白3在乳腺癌发生发展中的作用

N6-甲基腺苷是真核生物RNA中最普遍的表观遗传修饰,而甲基转移酶样蛋白3(methyltransferase-like protein 3,METTL3)作为该过程中最重要的修饰酶,在包括恶性肿瘤在内的众多疾病中发挥着重要的作用。METTL3通过上调N6-甲基腺苷修饰水平调控下游基因的表达,进而参与生理及病理过程。本文将总结METTL3在乳腺癌发生发展过程中的研究进展,并分析其所涉及的分子机制,为以METTL3为靶点的个体化精准治疗提供理论依据。

RNA干扰Dnmt1和Dnmt3b对小鼠胚胎成纤维细胞凋亡和基因组DNA甲基化水平的影响

DNA甲基转移酶1(DNMT1)负责DNA甲基化维持,DNA甲基转移酶3b(DNMT3b)主要负责DNA从头甲基化,在体细胞中同时干扰Dnmt1、Dnmt3b表达会给细胞带来何种影响还未见报道。实验以小鼠胚胎成纤维细胞为实验对象,用RNA干扰方法对Dnmt1和Dnmt3b进行敲低,研究分别干扰和同时干扰这两个基因对小鼠胚胎成纤维细胞凋亡、基因组甲基化水平的影响。研究发现,si RNA转染后24 h,Dnmt3b干扰组和Dnmt1+Dnmt3b同时干扰组细胞的增殖细胞核抗原(PCNA)mRNA水平显著降低(P<0.05);转染后48h,Dnmt3b单独干扰组、Dnmt1+Dnmt3b同时干扰组中细胞凋亡显著增加(P<0.05);Dnmt3b单独干扰组细胞基因组甲基化水平下降32%(P<0.01),Dnmt1+Dnmt3b同时干扰组细胞的基因组甲基化水平下降约44%(P<0.01)。结果表明,DNMT3b在小鼠胚胎成纤维细胞正常增殖、基因组甲基化水平的维持上具有重要作用。

m6A甲基转移酶METTL3在结直肠癌中的研究进展

越来越多的证据表明RNA甲基化作为mRNA最常见的修饰方式在肿瘤发生、发展中发挥重要的作用。结直肠癌是消化系统常见恶性肿瘤,严重危害中老年人健康。尽管关于结直肠癌的发生和发展的生物学机制已有许多研究,但对结直肠癌的诊断和预后作用仍存在较大的不足。随着对RNA甲基化研究的深入,发现m6A甲基转移酶METTL3与结直肠癌的发生、发展及预后显著相关;但是,其在结直肠癌中的作用尚存在争议。本文将对m6A甲基转移酶METTL3在结直肠癌发生、发展及预后中的作用进行综述。

组蛋白赖氨酸甲基转移酶2D调控H9c2细胞中HIF-1α/VEGF通路(英文)

组蛋白赖氨酸甲基转移酶2D(histone-lysine N-methyltransferase 2D,KMT2D)作为主要的组蛋白3第4位赖氨酸(H3K4)甲基转移酶,在调控胚胎发育、组织分化、代谢和肿瘤抑制方面发挥重要作用。在小鼠体内,敲除Kmt2d会导致严重的心脏发育缺陷最终造成胚胎期死亡。低氧诱导因子-1α(hypoxia-inducible factor 1α,HIF-1α)作为调节细胞应对低氧的关键转录因子,能够调控多种下游基因转录。有相关研究揭示,表观遗传调控者能够调节HIF-1α的稳定性和活性。同样,作为表观遗传调控者的组蛋白甲基转移酶KMT2D是否参与低氧条件下HIF-1α对下游基因的调控,目前仍未知。在本研究中,观察在Kmt2d正常或缺乏的情况下,心肌细胞H9c2对低氧环境的应答反应。结果显示,与常氧条件相比,低氧状态下HIF-1α、组蛋白乙酰化酶P300、KMT2D及其介导的H3K4一甲基化(H3K4 mono-methylation,H3K4me1)的蛋白质水平增加(P<0.05);HIF-1α下游基因血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,Vegf)的mRNA表达水平明显上调(P<0.01)。染色质免疫共沉淀实验(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP-qPCR)检测结果显示,H3K4me1和组蛋白3第27位赖氨酸乙酰化(histone 3 lysine 27 acetylation,H3K27ac)在Vegf基因启动子区域的结合丰度明显增加(P<0.05)。低氧条件下沉默Kmt2d之后,H3K4me1蛋白水平和Vegf的mRNA表达下降(P<0.05)。本研究表明,低氧条件下KMT2D参与调控HIF-1α和下游基因Vegf的表达。

RNAi及DNA芯片分析肝癌细胞系中受DNMT3B调控的下游基因(英文)

为揭示DNA甲基转移酶3B(DNMT3B)在肝癌中是否参与了肿瘤的发生,应用Westernblotting及细胞免疫化学方法分析DNMT3B蛋白在人的正常肝细胞株、肝癌癌旁细胞株及肝癌癌细胞株中的表达。构建了DN-MT3B的RNAi稳定表达的重组载体,并转染入肝癌细胞株SMMC-7721中。以半定量RT-PCR及Westernblot-ting分别鉴定DNMT3BRNAi表达载体对内源性DNMT3B的抑制效率。用高通量的cDNA基因芯片分析了SMMC-7721中DNMT3B抑制后有影响的下游基因谱。结果显示,DNMT3B在肝癌细胞株中的表达水平明显高于肝癌癌旁和正常肝细胞株。DNMT3B的RNAi稳定表达重组载体转染SMMC-7721细胞株2个月后,观察到DNMT3B明显受到抑制。cDNA基因芯片分析发现,DNMT3B抑制后诱导26条基因表达下调,115条基因表达上调,包括一些发育相关基因以及肿瘤相关基因,如SNCG、NOTCH1、MBD3、WNT11、MAOA、FACL4等。提示DNMT3B的高表达可能与肝癌的发生有关,并以调控其他相关基因的表达而起作用,包括与发育相关的重要基因。

桔梗皂苷D增强人直肠癌耐药细胞株SW1463/Oxa对奥沙利铂的敏感性

目的探讨桔梗皂苷D对人直肠癌耐药细胞株SW1463/奥沙利铂(Oxa)化学治疗敏感性的增强作用。方法取人直肠癌细胞系SW1463,建立稳定的耐奥沙利铂细胞株SW1463/Oxa。将构建成功的人直肠癌耐药细胞株SW1463/Oxa随机分为桔梗皂苷D组、Oxa组、桔梗皂苷D+Oxa组和对照组。MTT法检测细胞增殖曲线;RT-qPCR检测脱氧核糖核酸甲基转移酶3a(DNMT3a)、磷酸化组蛋白γ-H2AX、DNA双链修复蛋白RAD51、信号传导子和转录激活子3(STAT3)信使核糖核酸(mRNA)表达;Western blot检测细胞DNMT3a、γ-H2AX、RAD51、STAT3蛋白表达及磷酸化STAT3(p-STAT3)水平。结果成功构建人直肠癌耐药细胞株SW1463/Oxa;与对照组和Oxa组比,桔梗皂苷D组和桔梗皂苷D+Oxa组细胞增殖能力、DNMT3a、RAD51、STAT3 mRNA和蛋白表达以及p-STAT3水平降低(P<0.05),γ-H2AX mRNA和蛋白表达升高(P<0.05)。结论桔梗皂苷D能增强人直肠癌耐药细胞株SW1463/Oxa对Oxa的化疗敏感性,推测是通过抑制DNMT3a、RAD51、STAT3的表达,促进γ-H2AX的表达实现此作用的。

METTL3介导m6A修饰长链非编码RNA THAP7-AS1表达上调促进肺癌发生的作用及机制研究

背景与目的肺癌是对人类健康的一大威胁,有关肺癌发生发展的分子机制复杂且知之尚少,探索与肺癌发展相关的分子标志物有利于提高早期诊断和治疗的效果。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)THAP7-AS1已知在胃癌中高表达,但在其他癌症中研究较少。本研究旨在探究甲基转移酶样3(methyltransferase-like 3,METTL3)介导N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰lncRNA THAP7-AS1表达上调促进肺癌发生的作用及机制。方法收集120例肺癌与对应癌旁组织样本,lncRNA微阵列分析差异表达的lncRNA,实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测肺癌、癌旁组织、肺癌细胞系THAP7-AS1表达,分析THAP7-AS1对肺癌的诊断价值以及其表达水平与肺癌患者生存率、临床病理特征的关系。通过生物信息学分析、甲基化RNA免疫共沉淀(methylated RNA immunoprecipitation,meRIP)、RNA pulldown实验、RIP实验探究THAP7-AS1的分子调节机制;通过MTS、克隆形成、划痕、Transwell、体内异种移植实验测定各组SPC-A-1、NCI-H1299细胞增殖、迁移、侵袭、成瘤能力,Western blot检测磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(phosphoinositide 3-kinase/protein kenase B,PI3K/AKT)信号通路蛋白表达。结果肺癌组织、细胞系THAP7-AS1表达升高(P<0.05),对肺癌具有一定的诊断价值[曲线下面积(area under the curve,AUC)=0.737],其表达水平与患者总生存率、肿瘤大小、肿瘤原发灶-淋巴结-转移(tumor-node-metastasis,TNM)分期、淋巴结转移相关(P<0.05)。METTL3介导的m6A修饰能够增强THAP7-AS1表达。与SPC-A-1、NCI-H1299细胞NC组、sh-NC组相比,THAP7-AS1组增殖、迁移、侵袭能力提高(P<0.05),移植瘤体积、质量增大(P<0.05),sh-THAP7-AS1组增殖、迁移、侵袭能力下降(P<0.05)。THAP7-AS1与Cullin蛋白4B(Cullin 4B,CUL4B)存在特异结合。与SPC-A-1、NCI-H1299细胞Vector组相比,THAP7-AS1组增殖、迁移、侵袭能力、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha,PI3KCA)、磷脂酰肌醇-3激酶催化亚基δ(phosphoinositide-3 kinase-catalytic subunit delta,PI3KCD)、磷酸化磷脂酰肌醇3-激酶(phospho-phosphatidylinositol 3-kinase,p-PI3K)、磷酸蛋白激酶B(phospho-protein kinase B,p-AKT)、磷酸哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(phosphomammalian target of rapamycin,p-mTOR)表达水平升高(P<0.05)。结论LncRNA THAP7-AS1通过METTL3介导的m6A修饰稳定表达,与CUL4B结合激活PI3K/AKT信号通路,促进肺癌发生发展。

DNMT3B mRNA3′非编码区报告基因载体的构建与功能验证

目的构建用于鉴定microRNA(miRNA)靶基因的报告基因系统并进行功能验证,为研究动脉粥样硬化的发生发展机制奠定良好基础。方法在pGL3-control载体的荧光素酶基因下游克隆位点插入DNA甲基转移酶3B(DNMT3B)3′非编码区序列,经酶切、测序验证是否插入及正确性。生物信息学分析DNMT3B与miRNA-125b的靶向关系,并用miRNA-125b过表达载体与所构建载体共转染人血管平滑肌细胞,双荧光素酶报告基因系统检测荧光素酶活性。结果成功构建了DNMT3B3′非编码区报告基因载体,经酶切和测序鉴定正确;共转染细胞24h后,双荧光素酶报告基因系统检测荧光素酶活性,结果显示与空载体对照组相比,构建载体组荧光素酶活性下降了54.8%(P<0.01)。结论成功构建了DNMT3BmRNA 3′非编码区报告基因载体,且提示miRNA-125b靶向调控了DNMT3B。

LncRNA GAS5通过TIMP-3启动子甲基化促进软骨胶原蛋白降解的实验研究

目的骨关节炎(osteoarthritis,OA)是一种常见的关节疾病,可由内源性和表观遗传因素引起。软骨退变可恶化为OA。本研究旨在探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)GAS5在OA中的基本机制。方法14例正常膝关节软骨组织取自2018年7月至2020年7月因胫骨平台骨折在复旦大学附属中山医院吴淞医院行骨折内固定的患者,男8例,女6例;年龄19~40岁,平均(31±5)岁。35例OA膝关节软骨组织取自2018年7月至2020年7月在复旦大学附属中山医院吴淞医院就诊,诊断为OA且有膝关节置换手术指征的患者,男17例,女18例;年龄62~86岁,平均年龄(70±4)岁。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(real time-quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)检测金属蛋白酶抑制剂(tissue inhibitor of metalloproteinase,TIMP)-3 mRNA的表达情况。使用白细胞介素(interleukin,IL)-1β(10 ng/mL)建立OA细胞模型,分析OA基因芯片GSE16464。RT-qPCR和western-blot检测软骨分解代谢抑制因子TIMP-3的表达。用芯片定量聚合酶链反应(quantitative polymerase chain reaction,qPCR)检测TIMP-3启动子区富集的CpG岛情况。用生物信息学方法预测GAS5与TIMP-3的靶向关系,并用双荧光素酶报告基因检测法进行验证。结果在OA患者组织中TIMP-3 mRNA表达显著低于正常软骨组织,OA患者组与正常软骨组织软骨细胞TIMP-3启动子区甲基化阳性率分别为72.1%和35.7%。LncRNAGAS5在OA中高表达,LncRNAGAS5在OA中表达较正常软骨组织中表达明显上调(P<0.05)。Blast序列比对GAS5序列与TIMP-3启动子序列具有结合位点。沉默LncRNA GAS5促进TIMP-3表达,抑制OA软骨细胞胶原降解。双荧光素酶报告基因实验验证GAS5与TIMP-3具有靶向调控关系。结论OA软骨组织中TIMP-3低表达,而LncRNA GAS5表达上调;LncRNA GAS5可富集DNA甲基化转移酶,抑制TIMP-3的表达,促进软骨细胞胶原蛋白降解。

LncRNA SNHG25在直肠癌细胞中的表达及其调节miR-330-3p/SMYD3轴对直肠癌细胞迁移及侵袭的影响

目的探究长链非编码RNA(lncRNA)小核仁RNA宿主基因25(SNHG25)对直肠癌(RC)细胞迁移、侵袭的影响及微小RNA(miR)-330-3p/组蛋白甲基化转移酶3(SMYD3)轴在此过程中所发挥的作用。方法使用Real-Time PCR检测SNHG25在不同细胞系的表达及其沉默效率,Transwell实验检测下调SNHG25对RC细胞迁移和侵袭的影响。再次培养细胞,并依实验目的分为NC组(不作任何处理)、miR-330-3p mimics组(转染miR-330-3p模拟物)、miR-330-3p inhibitor组(转染miR-330-3p抑制物)、sh-SNHG25-1+miR-330-3p inhibitor组(转染sh-SNHG25-1+miR-330-3p抑制物)、SMYD3组(转染pcDNA-SMYD3)、si-SMYD3(转染si-SMYD3)、SMYD3+miR-330-3p mimics(转染pcDNA-SMYD3+miR-330-3p模拟物),Real-Time PCR检测各组细胞中miR-330-3p与SMYD3 mRNA表达;Transwell实验检测各组RC细胞迁移、侵袭能力。结果与人正常肠黏膜上皮细胞系(FHC)细胞比较,RC细胞(SW837、SW1463及HR8348)中SNHG25的表达增高,且在HR8348细胞中表达明显高于其他RC细胞系(3.12±0.17、1.96±0.15、4.87±0.22比1.00±0.03,P<0.05),选择HR8348细胞进行后续实验。与sh-NC比较,sh-SNHG25-1/2/3组细胞中SNHG25表达均被下调,且sh-SNHG25-1下调效率最高(1.02±0.01比0.21±0.02、0.52±0.03、0.36±0.04,P<0.05);sh-SNHG25-1组细胞中RC细胞迁移数量和侵袭数量均减少(205.13±21.23比120.34±11.98和89.92±8.15比30.27±3.59,P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验显示,SNHG25与miR-330-3p、miR-330-3p与SMYD3均存在负向调控关系。与NC组比较,miR-330-3p mimics组细胞中miR-330-3p表达增加(1.03±0.01比1.67±0.15,P<0.05),迁移细胞数量和侵袭细胞数量减少(210.08±12.96比131.36±10.45和77.45±8.69比21.74±2.04,P<0.05);miR-330-3p inhibitor组细胞中miR-330-3p表达降低(1.03±0.01比0.43±0.05,P<0.05),迁移细胞数量和侵袭细胞数量增多(210.08±12.96比246.95±16.34和77.45±8.69比122.03±9.51,P<0.05);与miR-330-3p inhibitor比较,sh-SNHG25-1+miR-330-3p inhibitor组细胞中miR-330-3p表达增高(0.43±0.05比0.76±0.04,P<0.05),细胞侵袭和迁移数量减少(246.95±16.34比167.54±11.79和122.03±9.51比52.88±5.07,P<0.05)。与NC组相比,SMYD3组细胞中SMYD3 mRNA表达增高(1.02±0.03比2.34±0.19,P<0.05),细胞的迁移和侵袭数量增多(215.26±15.38比351.04±20.96和86.33±9.65比129.87±11.52,P<0.05);si-SMYD3组细胞中SMYD3 mRNA表达降低(1.02±0.03比0.31±0.04,P<0.05),细胞的迁移和侵袭数量减少(215.26±15.38比128.54±15.47和86.33±9.65比28.92±4.91,P<0.05)。与SMYD3组相比,SMYD3+miR-330-3p mimics组细胞中SMYD3 mRNA表达降低(2.34±0.19比0.72±0.07,P<0.05),细胞的迁移和侵袭数量减少(351.04±20.96比168.08±13.44和129.87±11.52比63.01±5.18,P<0.05)。结论下调SNHG25表达可能通过调控miR-330-3p/SMYD3轴抑制RC细胞侵袭及迁移。

N6-甲基腺苷RNA甲基化修饰在肾纤维化中的研究进展

N6-甲基腺苷(m6A)是真核细胞最丰富的转录后修饰类型。多种类型的RNA,如信使RNA(mRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)、微小RNA(miRNA)、转移RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)等,均可发生m6A甲基化修饰。近期研究发现,异常m6A甲基化修饰是肾脏疾病中肾纤维化的“导火索”,可通过不同的靶点、信号通路等对肾间质纤维化产生促进或抑制作用,但具体机制仍需进一步研究。本文对m6A甲基化修饰在肾纤维化中的研究进展进行综述,旨在为临床新药研发提供新思路。