鼻咽癌组织的显微切割及其RNA线性扩增

从微小体积鼻咽癌活检标本中获取纯净癌细胞一直是鼻咽癌分子生物学研究中的难题.为了寻找一种能从鼻咽癌活检组织中获得高纯度、高质量RNA来完成cDNA微阵列(cDNA Microarray)实验的简便实用方法,采用RNAlater技术保存鼻咽癌活检组织,显微切割技术来获得高纯度鼻咽癌细胞,利用RNA线性扩增技术得到cDNA微阵列实验所需RNA.结果表明:利用RNAlater技术可以很好地保持组织RNA的稳定,通过优化显微切割和RNA线性扩增的条件获得了cDNA微阵列实验所需的高纯度、高质量RNA.

显微切割结合RNA线性扩增技术的应用

背景与目的:当对无间质细胞混杂的肿瘤细胞进行选择性分析时,显微切割技术是不可缺少的,然而,从显微切割所得的细胞中获取足够RNA量相当困难。本文的目的是寻找一特异方法,将鼻咽癌细胞从肿瘤间质细胞中分离出来,并对其扩增,以备进一步研究。方法:采用显微切割技术从鼻咽癌组织冰冻切片中获取鼻咽癌细胞,提取RNA并对微量RNA进行体外转录,然后,用RT-PCR分别验证扩增RNA的β-actin和GADPH基因表达水平。结果:从鼻咽癌组织中获取了20000～40000个细胞,抽提RNA,扩增后获得了片断大小为0.5～2.5kb的RNA,在β-actin、GADPH表达完整。结论:显微切割结合RNA线性扩增技术能成功地获取较为单一的鼻咽癌细胞,扩增后的RNA完整性较好,能运用于进一步研究中。

激光捕获显微切割结合RNA线性扩增技术在膀胱移行细胞癌相关基因研究中的应用(英文)

目的当对有间质细胞混杂的膀胱移行上皮细胞与膀胱移行细胞癌进行基因差异表达分析时,激光捕获显微切割技术(lasercap-turemicrodissection,LCM)是不可缺少的,然而从LCM所得的细胞中获取足够RNA量相当困难。本文首次将LCM与RNA线性扩增结合用于膀胱癌相关基因研究,目的是确定一条切实可行的技术路线,将膀胱移行上皮细胞从膀胱粘膜中分离出来,将膀胱癌细胞从肿瘤间质细胞中分离出来,并对其进行RNA体外线性扩增,以备进一步研究。方法采用LCM技术分别从正常膀胱粘膜及膀胱癌组织冰冻切片中获取膀胱移行上皮细胞及膀胱癌细胞,提取RNA,并对微量RNA进行体外线性扩增。然后用RT-PCR验证扩增前、后RNA中β-actin基因表达水平。结果对照实验I证实经LCM后RNA完整性较好;经对照实验Ⅱ初步确定设定条件下LCMshooting次数与可获得RNA量间对应关系。从膀胱粘膜种捕获膀胱移行上皮细胞25万shootings;从膀胱癌组织中获取癌细胞20万shootings。产物RNA扩增后获得片段大小为0.5-2.5kh的aRNA,且β-actin基因表达表达完整。结论LCM结合RNA体外线性扩增技术能成功地获取较为单一的研究目的细胞,扩增后RNA完整性较好,能用于进一步研究中。

一种用于基因芯片可靠的双轮RNA线性扩增技术

DNA微阵列能在一次实验中检测成千上万个基因的表达情况,有助于阐明疾病发生的分子机制及发现新的诊治靶标.但常规方法需要大量RNA,因而基于T7RNA线性扩增技术逐渐成为微阵列表达谱实验中最常用的探针制备方法.本方法将实验步骤进一步改进,增加额外的一轮体外转录,并结合Klenow酶标记技术来制备cDNA靶标和寡核苷酸芯片杂交.从纳克量级的总RNA起始,本方法和常规的RNA单轮线性扩增法相比,仍然准确地保留了约70%的基因表达信息.同一RNA样本的自身比较实验及重复实验结果也显示,该方法具有较高的可靠性和重复性.RNA双轮体外扩增法需要的起始RNA相对于常规的单轮扩增法减少了很多(10ng甚至更少),因而非常适合分析那些只能提供微量RNA的样本.

激光捕获显微切割结合RNA线性扩增技术在膀胱移行细胞癌相关基因研究中的应用

目的当对有间质细胞混杂的膀胱移行上皮细胞与癌细胞进行基因差异表达分析时,激光捕获显微切割技术(LCM)是不可缺少的。LCM与RNA线性扩增结合,目的是确定一条可行的技术路线,获取均质的、足量的RNA,以备进一步用于膀胱癌相关基因研究。方法采用LCM技术分别从正常膀胱黏膜及膀胱癌组织冰冻切片中获取膀胱移行上皮细胞及癌细胞,提取RNA,并对120ng上皮细胞RNA进行线性扩增,获得aRNA20μg。用逆转录聚合酶链反应(RTPCR)验证扩增前、后RNA中βactin基因表达水平。结果对照实验Ⅰ证实LCM后RNA完整性较好;产物RNA扩增后获得片段大小为0.5～2.5kb的aRNA,且βactin表达完整。结论LCM结合RNA线性扩增技术获取均一的、足量的、完整性好的目的细胞RNA,能用于进一步研究。