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RNA结合蛋白HuR调控lncRNA DLEU2促进食管鳞癌细胞增殖、侵袭的机制
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作者 王伟 何天乐 +1 位作者 李扬 杨素清 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2024年第4期883-888,共6页
目的探讨RNA结合蛋白人抗原(Hu)R对食管鳞癌细胞增殖、侵袭的影响及其与长链非编码RNA(lncRNA)淋巴细胞白血病缺失基因(DLEU)2的调控关系。方法收集食管鳞癌组织样本并在体外培养正常人食管鳞状上皮细胞Het-1A及食管鳞癌细胞系KYSE30、K... 目的探讨RNA结合蛋白人抗原(Hu)R对食管鳞癌细胞增殖、侵袭的影响及其与长链非编码RNA(lncRNA)淋巴细胞白血病缺失基因(DLEU)2的调控关系。方法收集食管鳞癌组织样本并在体外培养正常人食管鳞状上皮细胞Het-1A及食管鳞癌细胞系KYSE30、KYSE70、KYSE270,实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)实验检测HuR mRNA与DLEU2表达水平。利用Lipofectamime2000试剂对KYSE30细胞进行转染,并随机分组为对照组、pcDNA组、pc-HuR组、sh-NC组、sh-HuR组、sh-HuR+si-NC组和sh-HuR+si-DLEU2组。CCK-8法检测各组KYSE30细胞活性;平板克隆形成实验检测各组KYSE30细胞增殖能力;荷瘤裸鼠实验观察体内肿瘤生长情况;Transwell小室检测各组KYSE30细胞侵袭能力;Western印迹检测各组KYSE30细胞中HuR蛋白表达水平;RNA免疫沉淀(RIP)实验分析HuR与DLEU2的结合关系。结果在食管鳞癌组织和细胞系中,HuR mRNA和蛋白表达及DLEU2水平均显著升高(P<0.05),其中KYSE30细胞系中HuR基因与DLEU2表达水平最高,故选择KYSE30细胞进行转染实验。转染pc-HuR的细胞中HuR蛋白表达明显上调,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均显著增加(P<0.05);转染sh-HuR的细胞中HuR蛋白表达明显下调,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均显著降低(P<0.05)。RIP实验和qRT-PCR检测发现HuR与DLEU2有相互作用关系。同时转染sh-HuR和si-DLEU2的细胞中DLEU2水平明显降低,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均比转染sh-HuR明显更低(P<0.05)。过表达HuR显著增加移植瘤体积和重量,抑制HuR明显减小移植瘤的体积和重量,而同时抑制HuR和DLEU2时移植瘤的体积和重量比单独抑制HuR时明显更小(P<0.05)。结论HuR通过与DLEU2结合,促进食管鳞癌细胞的增殖、侵袭和移植瘤的体内生长。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 人抗原R 食管鳞癌 淋巴细胞白血病缺失基因2 增殖 侵袭
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抑制lncRNA TUG1下调核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1炎症小体在延缓阿尔茨海默病进展的作用 被引量:1
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作者 马婷婷 陈建红 +1 位作者 刘爱翠 李海宁 《解剖学报》 CAS CSCD 2024年第1期32-42,共11页
目的探讨敲低长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)抑制核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1(NLRP1)炎症小体在缓解阿尔茨海默病进展中的作用。方法选取9~10周龄遗传背景为C57/BL6的野生型小鼠(WT组,10只)或淀粉样前体蛋白(APP)/早... 目的探讨敲低长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)抑制核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1(NLRP1)炎症小体在缓解阿尔茨海默病进展中的作用。方法选取9~10周龄遗传背景为C57/BL6的野生型小鼠(WT组,10只)或淀粉样前体蛋白(APP)/早老素1(PS1)转基因小鼠(30只)。APP/PS1转基因小鼠随机分为模型(model)组,模型+敲低lncRNA TUG1组[model+lncRNA TUG1短发夹RNA(shRNA)组]和model+shRNA非靶标(NT)组,每组10只。分别采集12周龄第1天(3月龄)和32周龄第1天(8月龄)小鼠外周血和脑皮质组织,并分离皮质中的原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞,每个时间点每组5只小鼠。Real-time PCR分别测定3月龄和8月龄上述4个分组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和巨噬细胞移动抑制因子(MIF)mRNA的水平,以及原代星形胶质细胞中补体蛋白C1r和C1s mRNA的水平。ELISA法测定其外周血浆中MIF含量。对3月龄和8月龄小鼠脑皮质原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞共培养。CCK-8法测定上述2种细胞的增殖能力。Western blotting分别测定3月龄和8月龄上述4个分组小鼠脑皮质组织中MIF、白细胞介素1β前体(pro-IL-1β)、凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)、NLRP1及NLRP3蛋白的表达水平。采用免疫荧光染色法测定8月龄各分组小鼠脑皮质组织中β淀粉样蛋白(Aβ)表达。结果3月龄和8月龄时,与WT组小鼠相比,model组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF相对表达水平显著上调,原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞增殖能力增强(P<0.05)。与model组相比,model+lncRNA TUG1 shRNA组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF的相对表达水平显著降低,原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞增殖能力降低(P<0.05)。与WT组相比,model组小鼠外周血浆中MIF含量显著升高;小鼠脑皮质组织中pro-IL-1β、ASC、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)、NLRP1以及NLRP3的蛋白表达水平显著升高;Aβ免疫荧光强度明显增强(P<0.05)。与model组相比,model+lncRNA TUG1 shRNA组小鼠外周血浆中MIF含量显著降低;小鼠脑皮质组织中pro-IL-1β、ASC、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)和NLRP1的蛋白表达水平显著降低,Aβ免疫荧光强度明显降低(P<0.05),而NLRP3蛋白质的表达水平无明显变化(P>0.05)。与model组相比,model+shRNA NT组小鼠上述所有检测指标差异均无显著性(P>0.05)。结论APP/PS1转基因小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF因子表达上调与脑皮质内NLRP1炎症小体激活成正相关,敲低lncRNA TUG1可缓解阿尔茨海默病的进展。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 长链非编码rna 牛磺酸上调基因1 巨噬细胞移动抑制因子 核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1 免疫印迹法 小鼠
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RNA结合蛋白ELAVL1的功能及其调控病毒复制的研究进展
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作者 余祖华 高梦茹 +4 位作者 齐志颖 张静雨 何雷 陈建 丁轲 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1914-1925,共12页
胚胎致死异常视觉蛋白1(embryonic lethal abnormal vision like 1, ELAVL1),又被称为人类抗原R(human antigen R, HuR),是一种典型的RNA结合蛋白(RNA binding protein, RBP),通过与3′非翻译区(3′untranslated element, 3′UTR)的AU... 胚胎致死异常视觉蛋白1(embryonic lethal abnormal vision like 1, ELAVL1),又被称为人类抗原R(human antigen R, HuR),是一种典型的RNA结合蛋白(RNA binding protein, RBP),通过与3′非翻译区(3′untranslated element, 3′UTR)的AU富含元件(AU-rich element, ARE)结合,在mRNA转录和翻译过程中发挥重要作用。ELAVL1的作用十分广泛,可调控肿瘤的发生发展、凋亡、迁移与侵袭,是许多癌症治疗的关键靶点,还能参与调节编码器官发育和组织稳态的蛋白质和mRNA的水平,也有许多研究表明,ELAVL1通过转录后调控和翻译后修饰来调节病毒复制。本文主要综述了ELAVL1的生物学特点、功能、调控机制及其在病毒复制过程中的调控作用,旨在为进一步研究ELAVL1与畜禽病毒复制之间互作的机制提供理论参考。 展开更多
关键词 ELAVL1 rna结合蛋白 病毒 调控机制
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TNF-α刺激下RNA结合蛋白HuR在大鼠心脏成纤维细胞中的表达变化 被引量:1
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作者 柏丹娜 高群 +4 位作者 高延 张隽 卫国 刘媛媛 王海昌 《心脏杂志》 CAS 2011年第6期820-821,826,共3页
在心脏成纤维细胞(cardiac fibroblasts,CFs)中,炎症信号通路的持续活化,尤其是肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)依赖的分子信号通路的激活介导了细胞一系列的病理变化[1~3],但其详细的机制尚不完全清楚,
关键词 肿瘤坏死因子Α 心脏成纤维细胞 人类抗原R rna结合蛋白
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RNA结合蛋白HuR及TTP在结直肠癌中的表达和临床意义 被引量:1
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作者 孙宏建 侯志凌 +1 位作者 曹洪涛 段笃文 《黑龙江医药科学》 2015年第1期91-92,共2页
目的:检测RNA结合蛋白HuR及TTP在结直肠癌中的表达,分析两者在结直肠癌发生、发展中的作用、关系。方法:免疫组化法检测83例患者肿瘤组织以及26例癌旁正常组织中HuR及TTP的表达。结果:蛋白HuR在肿瘤细胞质中的表达明显高于癌旁正常组织... 目的:检测RNA结合蛋白HuR及TTP在结直肠癌中的表达,分析两者在结直肠癌发生、发展中的作用、关系。方法:免疫组化法检测83例患者肿瘤组织以及26例癌旁正常组织中HuR及TTP的表达。结果:蛋白HuR在肿瘤细胞质中的表达明显高于癌旁正常组织细胞质中的表达,而蛋白TTP在肿瘤组织中的表达则明显低于癌旁正常组织中的表达。经Spearman等级相关分析HuR和TTP表达呈负相关性(P<0.05)。结论:在结直肠癌的发生发展过程中,信使RNA的稳定因子HuR表达上调,而信使RNA的降解因子TTP下调或缺失。在结直肠癌的发生过程中可能起拮抗作用。胞质HuR蛋白的表达可促进肿瘤发生发展。 展开更多
关键词 结直肠癌 rna结合蛋白 人组织抗原R 锌指蛋白36
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RNA结合蛋白ZCCHC17在肝细胞癌中的研究进展
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作者 梁家东 刘肸琳 +2 位作者 黄云美 杨伟鹏 罗春英 《中国现代医生》 2024年第23期132-134,139,共4页
肝细胞癌是人类最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁人类生命健康。肝细胞癌常见的治疗手段包括手术治疗、放疗和化疗等。受肿瘤复发和转移等多种因素影响,肝细胞癌患者的预后及5年生存率并不理想。探索早期诊断的生物标志物是肝细胞癌研究... 肝细胞癌是人类最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁人类生命健康。肝细胞癌常见的治疗手段包括手术治疗、放疗和化疗等。受肿瘤复发和转移等多种因素影响,肝细胞癌患者的预后及5年生存率并不理想。探索早期诊断的生物标志物是肝细胞癌研究的热点之一。多项研究证实,RNA结合蛋白功能异常可使多种肿瘤相关标志物发生改变,进而影响肿瘤的发生发展。本文对RNA结合蛋白ZCCHC17的生物学功能、ZCCHC17与DNA甲基化的相关性及ZCCHC17与肝细胞癌的相关性等研究进展进行综述。 展开更多
关键词 rna结合蛋白ZCCHC17 肝细胞癌 生物学功能 甲基化 预后
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RNA结合蛋白FMRP在实体瘤中作用的研究进展
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作者 韩宜倩 周康杰 +3 位作者 蒋薇薇 张淼 毛晨曦 吴风雷 《山东医药》 CAS 2024年第25期99-102,共4页
迄今为止,绝大部分恶性肿瘤的病因和发病机制尚不完全清楚。基因表达调控能够从多个层面影响RNA分子结构并改变其稳定性,还能使其获得更多的生物学功能,从而对肿瘤的发生、发展产生重要影响。RNA结合蛋白(RBPs)是基因表达调控的关键效... 迄今为止,绝大部分恶性肿瘤的病因和发病机制尚不完全清楚。基因表达调控能够从多个层面影响RNA分子结构并改变其稳定性,还能使其获得更多的生物学功能,从而对肿瘤的发生、发展产生重要影响。RNA结合蛋白(RBPs)是基因表达调控的关键效应因子,能够参与人体多种重要的生理过程,其表达缺陷可导致多种疾病的发生,包括癌症。脆性X智力低下蛋白(FMRP)是由脆性X智力低下1(FMR1)基因编码的一种RBP。有研究报道,FMRP在多种肿瘤组织中过表达,可通过调控不同的信号通路,参与肿瘤细胞增殖、侵袭、迁移等生物学过程。但由于肿瘤的发生、发展机制极其复杂,往往存在多条信号通路的交叉重叠,许多信号通路中上下游分子和转录因子的作用尚不完全清楚。因此,FMRP在实体瘤中的作用机制仍需进一步探索。 展开更多
关键词 实体瘤 rna结合蛋白 脆性X智力低下蛋白 信号通路
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RNA结合蛋白(RBP)在恶性肿瘤进展中作用的研究进展
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作者 王洪亮 王海瑞 张连生 《当代医药论丛》 2024年第31期28-31,共4页
RNA结合蛋白(RBP)是一类能够与RNA分子结合的蛋白质,通过各种方式与目标RNA相互作用,影响目标RNA切割、编辑、定位和转录调控等。RBP在恶性肿瘤发生和发展过程中发挥着重要作用,参与到细胞增殖、迁移和侵袭。因此,应全面了解RBP在恶性... RNA结合蛋白(RBP)是一类能够与RNA分子结合的蛋白质,通过各种方式与目标RNA相互作用,影响目标RNA切割、编辑、定位和转录调控等。RBP在恶性肿瘤发生和发展过程中发挥着重要作用,参与到细胞增殖、迁移和侵袭。因此,应全面了解RBP在恶性肿瘤进展中的作用,为疾病的诊断和治疗提供新的方向和靶点。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 恶性肿瘤 研究进展
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慢性阻塞性肺疾病患者外周血中冷诱导RNA结合蛋白和髓样细胞触发受体-1的表达水平及其临床意义 被引量:1
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作者 张政 陈雪儿 卢献灵 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第7期1275-1280,共6页
目的探讨慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者外周血中冷诱导RNA结合蛋白(CIRBP)和髓样细胞触发受体-1(TREM-1)的表达水平及其临床意义。方法选取2022年10月—2023年6月40例住院的COPD患者为急性加重期组,其经过治疗进入稳定期后纳入稳定期组,同... 目的探讨慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者外周血中冷诱导RNA结合蛋白(CIRBP)和髓样细胞触发受体-1(TREM-1)的表达水平及其临床意义。方法选取2022年10月—2023年6月40例住院的COPD患者为急性加重期组,其经过治疗进入稳定期后纳入稳定期组,同期40例健康体检者为对照组。收集各组一般资料,采集外周血,通过酶联免疫吸附法测定血浆中CIRBP、TREM-1水平,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)法测定CIRBP mRNA和TREM-1 mRNA的相对表达量,并检测COPD患者和健康体检者的肺功能。结果COPD急性加重期外周血中的CIRBP、TREM-1表达水平均高于稳定期组,差异有统计学意义(均P<0.001);急性加重期和稳定期外周血中的CIRBP、TREM-1表达水平均高于对照组,差异有统计学意义(均P<0.001);在急性加重期和稳定期,CIRBP水平均与TREM-1水平呈正相关;急性加重期CIRBP、TREM-1水平与白细胞计数、中性粒细胞百分比、中性粒细胞/淋巴细胞比率呈正相关;稳定期CIRBP、TREM-1水平与第1秒用力呼气容积占预计值百分比、第1秒用力呼气容积/用力肺活量比值呈负相关,与白细胞计数、中性粒细胞百分比、中性粒细胞/淋巴细胞比率呈正相关。结论CIRBP和TREM-1的表达水平在COPD患者外周血中升高,CIRBP的表达与TREM-1表达具有相关性,并且与肺功能、白细胞计数、中性粒细胞百分比、中性粒细胞与淋巴细胞比率、单核细胞与高密度脂蛋白比率等临床指标相关,提示CIRBP和TREM-1可能共同参与COPD的发生发展。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 冷诱导rna结合蛋白 髓样细胞触发受体-1
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RNA结合蛋白在慢性肾脏病中的研究进展 被引量:1
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作者 张佳慧 张雪琴 +1 位作者 朱国强 陆晨 《中国现代医生》 2024年第3期115-118,共4页
当前慢性肾脏病已成为一个全球的公共健康问题而受到关注。我国慢性肾脏病的发病率呈逐年升高趋势,其发病机制复杂、病情缓慢迁延、并发症多等因素成为临床诊治的难题,如不能有效防治将成为沉重的社会和经济负担。随着对RNA结合蛋白的... 当前慢性肾脏病已成为一个全球的公共健康问题而受到关注。我国慢性肾脏病的发病率呈逐年升高趋势,其发病机制复杂、病情缓慢迁延、并发症多等因素成为临床诊治的难题,如不能有效防治将成为沉重的社会和经济负担。随着对RNA结合蛋白的研究不断深入,发现其与慢性肾脏病的发生、发展密切相关。本文对RNA结合蛋白与各种慢性肾脏病间的作用机制进行综述,以期为慢性肾脏病的临床诊断、治疗及预后提供新的方向。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 慢性肾脏病 基因调控 细胞凋亡
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冷诱导RNA结合蛋白联合IL-6的检测在妊娠期高血压疾病中的诊断价值
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作者 陈嘉彦 黄勇 +1 位作者 于晓雯 张欣 《标记免疫分析与临床》 CAS 2024年第10期1836-1841,共6页
目的探讨冷诱导RNA结合蛋白(CIRBP)联合白细胞介素-6(IL-6)检测在妊娠期高血压疾病中的诊断价值。方法前瞻性选取2022年7月至2023年10月入上海市第四人民医院妇产科病区经剖宫产分娩的高血压产妇30例作为实验组,选取正常产妇30例作为对... 目的探讨冷诱导RNA结合蛋白(CIRBP)联合白细胞介素-6(IL-6)检测在妊娠期高血压疾病中的诊断价值。方法前瞻性选取2022年7月至2023年10月入上海市第四人民医院妇产科病区经剖宫产分娩的高血压产妇30例作为实验组,选取正常产妇30例作为对照组,分别采用免疫组织化学染色、Western blot、qRT-PCR和ELISA法检测两组研究对象胎盘组织及血浆中CIRBP、IL-6的表达并进行对比分析。根据疾病程度将实验组患者分为妊娠期高血压组(12例)和重度子痫前期(18例)。比较两组患者的血浆中CIRBP和IL-6的表达水平。采用ROC曲线分析CIRBP+IL-6联合检测对疾病的诊断效能。结果实验组患者胎盘组织中CIRBP和IL-6阳性表达率明显高于对照组(P<0.05);实验组患者胎盘组织中CIRBP和IL-6 mRNA和蛋白表达明显高于对照组(P<0.05);实验组患者中血浆中CIRBP和IL-6表达明显高于对照组(P<0.05);重度子痫前期组患者血浆中CIRBP和IL-6表达明显高于妊娠期高血压组(P<0.05)。结论妊娠高血压患者胎盘组织及血浆中CIRBP和IL-6均呈高表达,且随着病程的加重不断升高,对诊断高血压产妇有深远的影响。 展开更多
关键词 妊娠期高血压 冷诱导rna结合蛋白 白细胞介素-6 免疫组织化学染色 诊断价值
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RNA结合基序蛋白15在脓毒症小鼠心肌中的表达及与中性粒细胞胞外诱捕网的相关性
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作者 刘纯瑶 杨丽婷 +2 位作者 牛泽粟 胡怡 潘东峰 《宁夏医科大学学报》 2024年第6期563-570,共8页
目的探讨RNA结合基序蛋白15(RBM15)在脓毒症心肌损伤小鼠中的表达及与中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)的相关性。方法腹腔注射脂多糖(LPS)建立小鼠脓毒症模型,以生理盐水处理小鼠作为对照组。LPS注射7 d后采用心脏多普勒超声检测小鼠心脏功... 目的探讨RNA结合基序蛋白15(RBM15)在脓毒症心肌损伤小鼠中的表达及与中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)的相关性。方法腹腔注射脂多糖(LPS)建立小鼠脓毒症模型,以生理盐水处理小鼠作为对照组。LPS注射7 d后采用心脏多普勒超声检测小鼠心脏功能;采用HE染色观察脓毒症小鼠心肌损伤情况;免疫荧光染色法检测心肌组织切片中瓜氨酸化组蛋白H3(CitH3)表达水平;ELISA法检测心肌组织中CitH3、中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)和血浆中髓过氧化物酶(MPO)的酶活性;RT-qPCR检测中性粒细胞相关分子[人核因子κB抑制蛋白α(ⅠκBα)、核因子κB(NF-κB)、B-细胞淋巴瘤因子10(Bcl10)、肽酰基精氨酸脱亚氨酶4(PAD4)]、RBM15及N6-甲基腺嘌呤(m6A)甲基化酶[甲基转移酶样3(METTL3)、甲基转移酶样14(METTL14)、肾母细胞瘤1关联蛋白(WTAP)、KIAA1429]。Western blot检测中性粒细胞相关分子ⅠκBα、核因子κB/p65(NF-κB/p65)、核因子κB/p50(NF-κB/p50)、Bcl10、PAD4、RBM15及m6A甲基化酶METTL3、METTL14、WTAP、KIAA1429。结果心脏多普勒超声检测小鼠心脏功能结果显示,与对照组相比,实验组小鼠左心室射血分数(LVEF)、短轴缩短率(FS)均降低(P均<0.001);HE染色结果显示,对照组小鼠心肌组织结构正常,实验组小鼠心肌部分断裂,可见炎性细胞浸润,细胞水肿;免疫荧光染色结果显示,实验组CitH3荧光强度增强,表达上调(P<0.05);ELISA结果显示,与对照组相比,脓毒症小鼠心肌组织中NETs相关分子CitH3、NE及血浆中MPO均升高(P均<0.01);RT-qPCR结果显示,与对照组相比,实验组Bcl10(P=0.960)、PAD4(P=0.324)、METTL14(P=0.592)、WTAP(P=0.505)mRNA表达水平差异均无统计学意义,ⅠκBα(P<0.01)、NF-κB(p65/p50)(P<0.05)、RBM15(P<0.05)mRNA表达水平上升,METTL3(P<0.05)、KIAA1429(P<0.05)mRNA表达水平均降低;Western blot结果显示,与对照组相比,ⅠκBα(P=0.171)、NF-κB/p65(P=0.191)、NF-κB/p50(P=0.063)、PAD4(P=0.687)、RBM15(P=0.176)、METTL3(P=0.430)、METTL14(P=0.089)、KIAA1429(P=0.238)蛋白表达水平差异均无统计学意义,WTAP蛋白表达水平升高(P<0.05),Bcl10蛋白表达水平降低(P<0.05)。RBM15 mRNA表达水平与CitH3(r=0.631,P=0.011)水平呈正相关性,与MPO(r=0.318,P=0.114)及NE(r=0.099,P=0.410)水平无相关性。结论RBM15、NETs在脓毒症心肌损伤中表达上调,且RBM15与NETs相关分子CitH3具有正相关性,RBM15可能通过调节NETs相关分子参与脓毒症心肌损伤。 展开更多
关键词 脓毒症心肌损伤 中性粒细胞胞外诱捕网 rna结合基序蛋白15
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RNA结合蛋白HuR的研究进展及其在肝细胞癌发生发展中的作用 被引量:2
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作者 苏莹 金春 +6 位作者 孙苏敏 李章昊 夏思伟 张自力 张峰 邵江娟 郑仕中 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期2283-2288,共6页
转录后事件,特别是mRNA翻转和翻译的改变,是哺乳动物细胞在应激反应中控制基因表达的主要机制。mRNA稳定性和翻译的变化主要是通过特定mRNA序列(顺式元件)与两种主要的反式作用因子--RNA结合蛋白(RNA-binding protein,RBP)和微小RNA(mic... 转录后事件,特别是mRNA翻转和翻译的改变,是哺乳动物细胞在应激反应中控制基因表达的主要机制。mRNA稳定性和翻译的变化主要是通过特定mRNA序列(顺式元件)与两种主要的反式作用因子--RNA结合蛋白(RNA-binding protein,RBP)和微小RNA(microRNA,miRNA)相互作用而启动的过程来控制的[1]。RBP参与RNA代谢的各个环节,包括RNA剪接、多聚腺苷酸序列编辑、RNA转移、维持RNA的稳定和降解、细胞内定位和翻译调控等。胚胎致死性视觉异常(embryonic lethal abnormal vision,ELAV/Hu)家族蛋白是唯一通过识别3'端非翻译区(3'-untranslated region,3'UTR)中的富含AU元件(AU-rich element,ARE)来稳定mRNA的RBP。多数Hu蛋白家族成员(Hu-B、C和D)只在中枢神经系统表达,HuR(ELAVL1)是唯一在人类中广泛表达的成员[2]。本文总结HuR的功能,并介绍其在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)方面的研究进展,以期为未来HCC的治疗研究提供新的可能靶点。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 hur蛋白 肝细胞癌
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RNA结合蛋白HuR的研究进展 被引量:4
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作者 张岩 梅柱中 《广东医学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第24期3820-3822,共3页
RNA结合蛋白HuR是胚胎致死异常视觉(ELAV)基因家族中的成员,又被称为类胚胎致死性异常视觉基因1(ELAV1)。ELAV家族目前已鉴定的成员包括HuR、HuB、HuC与HuD 4种,它们在细胞中主要通过基因的转录后调控机制来调节靶基因的表达,
关键词 rna结合蛋白 基因家族 调节靶基因 致死性 类胚胎 视觉
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RNA结合蛋白QKI可通过调节EMT相关基因转录物的切割形成circRNA促进胃癌的发生发展
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作者 崔逸爽 郑璇 +4 位作者 吴亚男 么艺涵 王珺 刘子情 孙国贵 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1462-1473,共12页
目的通过生物信息学分析震颤响应蛋白(quaking,QKI)参与胃癌(gastric cancer,GC)发生和发展的可能分子机制。研究QKI在GC细胞中的增殖、侵袭和迁移能力。方法联合TCGA和GTEx数据库分析QKI在常见人类癌症样本中的差异表达。分析QKI蛋白... 目的通过生物信息学分析震颤响应蛋白(quaking,QKI)参与胃癌(gastric cancer,GC)发生和发展的可能分子机制。研究QKI在GC细胞中的增殖、侵袭和迁移能力。方法联合TCGA和GTEx数据库分析QKI在常见人类癌症样本中的差异表达。分析QKI蛋白表达与肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)评分、微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)评分以及ESTIMATE评分的相关性,并分析QKI蛋白表达与总生存期(overall survival,OS)、无病生存期(disease free survival,DFS)及无进展生存期(progression free survival,PFS)的相关性。通过生物信息学分析获得可编码DEcircRNAs的EMT相关基因,构建QKI-EMT-circRNAs调控网络。在TMK1细胞中对差异表达的circRNAs和EMT相关基因进行表达验证,并验证敲降QKI后对TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力的影响。结果QKI在绝大多数肿瘤中差异表达,且与TMB、MSI以及肿瘤微环境(tumour microenvironment,TME)密切相关;QKI可作为高风险因子预测常见人类癌症患者的OS、DFS和PFS。QKI通过调控6个EMT相关基因转录本剪切形成8个circRNAs,它们均与胃癌患者预后明显相关。细胞实验表明,相对于正常胃上皮细胞,只有hsa_ccirc_0004015、CALD1和CDK14在TMK1细胞中表达下调。敲降QKI可抑制TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力。结论QKI通过调控6个EMT相关基因转录本剪切形成circRNAs,从而促进GC发生和发展。QKI在TMK1细胞中高表达,敲降QKI可抑制TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力。 展开更多
关键词 胃癌 QKI rna结合蛋白 上皮间充质转化 circrna 生物信息学分析
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采用MS2 pulldown和质谱分析法检测BT549细胞中的LncRNA SNHG15结合蛋白
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作者 陈少英 彭佩 +1 位作者 周艳春 顾巍 《癌变.畸变.突变》 CAS 2024年第5期395-398,共4页
目的:鉴定乳腺癌BT549细胞中与长链非编码RNA SNHG15结合的蛋白。方法:用慢病毒感染乳腺癌BT549细胞,构建稳定过表达SNHG15的BT549-SNHG15-MS2细胞株。通过MS2 pulldown和质谱分析法,检测BT549细胞中与SNHG15结合的蛋白。随后采用RNA免... 目的:鉴定乳腺癌BT549细胞中与长链非编码RNA SNHG15结合的蛋白。方法:用慢病毒感染乳腺癌BT549细胞,构建稳定过表达SNHG15的BT549-SNHG15-MS2细胞株。通过MS2 pulldown和质谱分析法,检测BT549细胞中与SNHG15结合的蛋白。随后采用RNA免疫共沉淀(RIP)和逆转录-定量PCR(RT-qPCR)法,以HEAD框肽5(DEAD box helicases 5,DDX5)为模板验证共沉淀蛋白和SNHG15的结合。结果:经MS2 pulldown和质谱分析筛选出386个潜在的SNHG15结合蛋白。RNA免疫沉淀结合RT-qPCR检测结果证实DDX5与SNHG15的结合。结论:本研究介绍了一种有效分析RNA-蛋白质相互作用的生物学方法,同时为深入研究SNHG15的作用机制提供了新的实验证据。 展开更多
关键词 长链非编码rna MS2 pulldown 小核仁rna宿主基因15 rna免疫沉淀 rna结合蛋白
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RNA结合蛋白在心血管疾病中作用机制的研究进展
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作者 刘嘉欣 杨五小 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年第8期1437-1441,共5页
综述RNA结合蛋白的生物学意义,重点介绍其在心房颤动、急性冠脉综合征及特殊类型心脏病方面的作用机制及研究进展,展望RNA结合蛋白转导蛋白β样蛋白2在心肌梗死疾病中的作用。
关键词 心血管疾病 rna结合蛋白 转导蛋白β样蛋白2 心肌梗死 综述
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创伤性颅脑损伤后冷诱导RNA结合蛋白的改变及其临床意义
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作者 吉慧军 曹阳 +4 位作者 李泽 刘远扬 高兵兵 于洋 刘竞鹏 《创伤外科杂志》 2024年第11期817-823,共7页
目的 研究细胞外冷诱导RNA结合蛋白(eCIRP)在创伤性颅脑损伤(TBI)患者及TBI动物模型大脑和血清中的表达变化,探讨冷诱导RNA结合蛋白(CIRP)是否可作为TBI的生物标志物。方法 12只健康雄性C57BL/6J小鼠(24~26g)随机分为假手术组和TBI组,... 目的 研究细胞外冷诱导RNA结合蛋白(eCIRP)在创伤性颅脑损伤(TBI)患者及TBI动物模型大脑和血清中的表达变化,探讨冷诱导RNA结合蛋白(CIRP)是否可作为TBI的生物标志物。方法 12只健康雄性C57BL/6J小鼠(24~26g)随机分为假手术组和TBI组,每组各6只。通过液压打击法构建小鼠TBI动物模型,假手术组打击力度为0个大气压,TBI组打击力度为1.1~1.3个大气压,利用HE染色法观察小鼠损伤侧脑组织病理形态学变化及病变体积,利用Western blot法检测小鼠脑组织CIRP蛋白的表达强度,ELISA法测定小鼠血清中CIRP、S100钙结合蛋白B(S100B)、TNF-α、IL-1β的分泌量。前瞻性选择2022年12月-2024年1月中国人民解放军总医院第一医学中心神经外科收治的中重度TBI患者(GCS 3~12分)及健康志愿者作为研究对象,其中中重度TBI患者8例,男性6例,女性2例;年龄30~66岁,平均49.1岁。健康志愿者10例,男性7例,女性3例;年龄26~64岁,平均45.3岁。采集血液后通过ELISA法测定血清中S100B、TNF-α、IL-1β的分泌量,利用统计学软件分析ELISA法测定的血清中CIRP与S100B、TNF-α、IL-1β水平的相关性。结果 与假手术组相比,TBI组小鼠24 h脑皮层有明显受损,半球体积损失百分比为(3.1±0.5)%,TBI组小鼠24 h大脑损伤部位中CIRP蛋白的相对表达量显著高于假手术组(P<0.001)。假手术组和TBI组小鼠血清中CIRP、S100B、TNF-α、IL-1β分泌量分别为(223.8±38.5)pg/mL vs.(516.5±93.9)pg/mL(P<0.001)、(34.7±7.7)pg/mL vs.(132.7±34.7)pg/mL(P<0.001)、(22.9±5.2)pg/mL vs.(41.2±7.3)pg/mL(P<0.001)、(59.5±8.1)pg/mL vs.(114.7±26.4) pg/mL(P<0.01);健康志愿者和TBI患者血清中CIRP、S100B、TNF-α、IL-1β分泌量分别为(11.4±4.7)pg/mL vs.(36.1±8.2)pg/mL、(82.3±10.6)pg/mL vs.(120.5±16.3)pg/mL、(41.9±7.7)pg/mL vs.(146.0±37.4)pg/mL、(82.9±17.8)pg/mL vs.(155.3±26.9)pg/mL,P均<0.001。TBI小鼠血清中CIRP与S100B、TNF-α、IL-1β水平呈正相关(r值分别为0.923、0.958、0.984);TBI患者人体血清中CIRP与S100B、TNF-α、IL-1β水平呈正相关(r值分别为0.740、0.664、0.662)。结论 CIRP在TBI后损伤皮层及血清中表达均升高,且CIRP与S100B、TNF-α、IL-1β表达水平呈正相关,可作为TBI的生物标志物。 展开更多
关键词 创伤性颅脑损伤 冷诱导rna结合蛋白 生物标志物
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冷诱导RNA结合蛋白介导氧化应激促进脑缺血再灌注损伤的机制研究
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作者 范阳 张西安 +3 位作者 豆涛涛 刘立承 皇甫慧源 刘展会 《临床医学进展》 2024年第8期1633-1644,共12页
目的:探究冷诱导RNA结合蛋白(cold-inducible RNA-binding protein, CIRP)是否能通过TLR4/MyD88途径介导氧化应激促进脑缺血再灌注损伤的发生发展过程,目前尚无报道。本研究将为脑缺血再灌注损伤的治疗提供新的靶点,亦为临床急性缺血性... 目的:探究冷诱导RNA结合蛋白(cold-inducible RNA-binding protein, CIRP)是否能通过TLR4/MyD88途径介导氧化应激促进脑缺血再灌注损伤的发生发展过程,目前尚无报道。本研究将为脑缺血再灌注损伤的治疗提供新的靶点,亦为临床急性缺血性脑卒中(acute ischemic stroke, AIS)患者术后缺血再灌注损伤的治疗应用提供了理论依据。方法:首先通过检测AIS患者术后外周血、构建HMC3细胞缺氧/复氧模型,观察缺血再灌注损伤对CIRP表达水平的影响;其次通过培养SH-SY5Y细胞,使用人重组CIRP蛋白(Recombinant human CIRP protein, rhCIRP)及C23干预,观察CIRP的表达及氧化应激水平。最后利用慢病毒敲减HMC3细胞的CIRP基因,再次构建细胞缺氧/复氧模型,探究CIRP通过TLR4/MyD88途径激活NADPH氧化酶,释放ROS上调Drp-1水平,进而促进线粒体分裂的分子机制。结果:AIS患者脑缺血再灌注后血清CIRP表达较术前显著升高。在人小胶质细胞HMC3缺氧/复氧模型中,细胞内CIRP表达水平显著升高且8小时后CIRP表达水平达到巅峰,并分泌到细胞外,激活炎症因子TNF-α、IL-6表达。rhCIRP可以作用于SH-SY5Y细胞促进TLR4、GP91、P47、DRP-1、MFN-2、Cleaved-caspase-3、TNF-α、IL-6的表达,介导氧化应激。而使用C23和敲减CIRP后则可以抑制上述蛋白和炎症因子的表达,保护组织细胞。结论:缺血再灌注损伤使小胶质细胞释放大量CIRP,分泌到细胞外,TLR-4/MyD88通路介导氧化应激,引起神经细胞缺血再灌注损伤。Objective: To explore whether CIRP can promote the occurrence and development of cerebral ischemia-reperfusion injury through TLR4/MyD88 pathway through oxidative stress, there is no report at present. This study will provide a new target for cerebral ischemia-reperfusion injury, and also provide a theoretical basis for the treatment and application of ischemia-reperfusion injury after acute ischemic stroke surgery. Methods: The effect of ischemia reperfusion injury on the expression of CIRP was observed by detecting the peripheral blood of patients with acute ischemic stroke after operation and constructing the hypoxia/reoxygenation model of HMC3 cells. Secondly, SH-SY5Y was cultured, and human recombinant CIRP protein (rhCIRP) and CIRP inhibitor (C23) were used to observe the level of CIRP and oxidative stress. Finally, the CIRP gene of HMC3 cells was knocked down by lentivirus, and the cell hypoxia/reoxygenation model was constructed again to explore the molecular mechanism of CIRP activating NADPH oxidase through TLR4/MyD88 pathway, releasing ROS to up-regulate the level of Drp-1, and promoting mitochondrial division. Results: The expression of serum CIRP in AIS patients after cerebral ischemia reperfusion was significantly higher than that before operation. In the hypoxia/reoxygenation model of human microglial cell HMC3, the expression level of CIRP in the cell increased significantly and reached the peak after 8 hours, and secreted to the outside of the cell to activate the inflammatory factor TNF-α, IL-6 expression. rhCIRP can be used as SH-SY5Y cells to promote TLR4, GP91, P47, DRP-1, MFN-2, Cleved-caspase-3, TNF-α, IL-6 expression, and mediate oxidative stress. C23 and knockdown of CIRP can inhibit the expression of the above proteins and inflammatory factors, and protect the tissue cells. Conclusion: Ischemia reperfusion injury causes microglia to release a large amount of CIRP, which is secreted into the extracellular space. The TLR-4/MyD88 pathway mediates oxidative stress, leading to neuronal ischemia-reperfusion injury. 展开更多
关键词 冷诱导rna结合蛋白 缺血再灌注损伤 急性缺血性中风 氧化应激 线粒体分裂
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利用RIP-Seq技术鉴定HepG2细胞中与HuR蛋白结合的lncRNAs 被引量:2
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作者 黄亚洲 刘叶文 +3 位作者 王玲玲 金晶 陈茜 李伟 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期417-426,共10页
长链非编码RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)可在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调节基因的表达,对细胞功能起着重要的调节作用。RNA结合蛋白可与很多的RNA结合,并在转录后水平发挥重要的调节作用。然而,RNA结合蛋白是否可以在... 长链非编码RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)可在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调节基因的表达,对细胞功能起着重要的调节作用。RNA结合蛋白可与很多的RNA结合,并在转录后水平发挥重要的调节作用。然而,RNA结合蛋白是否可以在细胞内广泛结合lncRNAs对其发挥调节作用,仍需进一步证实。本研究通过RNA结合蛋白免疫沉淀技术联合高通量测序(RNA binding protein immunoprecipitation-high throughput sequencing,RIP-Seq)的方法在人肝癌细胞株HepG2中,鉴定与人抗原R(human antigen R,HuR)蛋白相结合的lncRNA分子,并进行了初步的验证。首先,通过HuR-RIP实验分离与HuR蛋白结合的RNA分子,然后高通量测序及生物信息学分析。根据分析结果,鉴定出HepG2细胞中361条与HuR蛋白结合的lncRNAs分子,包括基因间lncRNA(large intergenic noncoding RNA,LincRNA)、内含子lncRNA、与编码基因正义链有重叠的lncRNA和与编码基因反义链有重叠lncRNA(antisense lncRNA)等。并进一步通过RIP-qPCR技术,对其中20条LincRNA分子进行了定量检测,验证测序结果。在HepG2细胞中敲低HuR基因表达,发现这些LincRNA分子中,11条LincRNA分子表达水平显著降低(P<0.05),2条LincRNA显著升高(P<0.05),剩余7条LincRNA表达量未发生变化(P>0.05)。本研究结果说明,HuR在细胞内可以广泛结合lncRNA分子,并且可能对结合的lncRNA分子的表达量产生影响,这也为进一步研究这些lncRNA的功能和HuR调控网络的研究提供了基础。 展开更多
关键词 人抗原R蛋白 长链非编码rna rna结合蛋白免疫沉淀技术-高通量测序 测序数据分析 HEPG2细胞
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