RNA结合蛋白ELAVL1的功能及其调控病毒复制的研究进展

胚胎致死异常视觉蛋白1(embryonic lethal abnormal vision like 1, ELAVL1),又被称为人类抗原R(human antigen R, HuR),是一种典型的RNA结合蛋白(RNA binding protein, RBP),通过与3′非翻译区(3′untranslated element, 3′UTR)的AU富含元件(AU-rich element, ARE)结合,在mRNA转录和翻译过程中发挥重要作用。ELAVL1的作用十分广泛,可调控肿瘤的发生发展、凋亡、迁移与侵袭,是许多癌症治疗的关键靶点,还能参与调节编码器官发育和组织稳态的蛋白质和mRNA的水平,也有许多研究表明,ELAVL1通过转录后调控和翻译后修饰来调节病毒复制。本文主要综述了ELAVL1的生物学特点、功能、调控机制及其在病毒复制过程中的调控作用,旨在为进一步研究ELAVL1与畜禽病毒复制之间互作的机制提供理论参考。

RNA结合蛋白HuR调控lncRNA DLEU2促进食管鳞癌细胞增殖、侵袭的机制

目的探讨RNA结合蛋白人抗原(Hu)R对食管鳞癌细胞增殖、侵袭的影响及其与长链非编码RNA(lncRNA)淋巴细胞白血病缺失基因(DLEU)2的调控关系。方法收集食管鳞癌组织样本并在体外培养正常人食管鳞状上皮细胞Het-1A及食管鳞癌细胞系KYSE30、KYSE70、KYSE270,实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)实验检测HuR mRNA与DLEU2表达水平。利用Lipofectamime2000试剂对KYSE30细胞进行转染,并随机分组为对照组、pcDNA组、pc-HuR组、sh-NC组、sh-HuR组、sh-HuR+si-NC组和sh-HuR+si-DLEU2组。CCK-8法检测各组KYSE30细胞活性;平板克隆形成实验检测各组KYSE30细胞增殖能力;荷瘤裸鼠实验观察体内肿瘤生长情况;Transwell小室检测各组KYSE30细胞侵袭能力;Western印迹检测各组KYSE30细胞中HuR蛋白表达水平;RNA免疫沉淀(RIP)实验分析HuR与DLEU2的结合关系。结果在食管鳞癌组织和细胞系中,HuR mRNA和蛋白表达及DLEU2水平均显著升高(P<0.05),其中KYSE30细胞系中HuR基因与DLEU2表达水平最高,故选择KYSE30细胞进行转染实验。转染pc-HuR的细胞中HuR蛋白表达明显上调,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均显著增加(P<0.05);转染sh-HuR的细胞中HuR蛋白表达明显下调,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均显著降低(P<0.05)。RIP实验和qRT-PCR检测发现HuR与DLEU2有相互作用关系。同时转染sh-HuR和si-DLEU2的细胞中DLEU2水平明显降低,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均比转染sh-HuR明显更低(P<0.05)。过表达HuR显著增加移植瘤体积和重量,抑制HuR明显减小移植瘤的体积和重量,而同时抑制HuR和DLEU2时移植瘤的体积和重量比单独抑制HuR时明显更小(P<0.05)。结论HuR通过与DLEU2结合,促进食管鳞癌细胞的增殖、侵袭和移植瘤的体内生长。

抑制lncRNA TUG1下调核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1炎症小体在延缓阿尔茨海默病进展的作用

目的探讨敲低长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)抑制核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1(NLRP1)炎症小体在缓解阿尔茨海默病进展中的作用。方法选取9~10周龄遗传背景为C57/BL6的野生型小鼠(WT组,10只)或淀粉样前体蛋白(APP)/早老素1(PS1)转基因小鼠(30只)。APP/PS1转基因小鼠随机分为模型(model)组,模型+敲低lncRNA TUG1组[model+lncRNA TUG1短发夹RNA(shRNA)组]和model+shRNA非靶标(NT)组,每组10只。分别采集12周龄第1天(3月龄)和32周龄第1天(8月龄)小鼠外周血和脑皮质组织,并分离皮质中的原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞,每个时间点每组5只小鼠。Real-time PCR分别测定3月龄和8月龄上述4个分组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和巨噬细胞移动抑制因子(MIF)mRNA的水平,以及原代星形胶质细胞中补体蛋白C1r和C1s mRNA的水平。ELISA法测定其外周血浆中MIF含量。对3月龄和8月龄小鼠脑皮质原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞共培养。CCK-8法测定上述2种细胞的增殖能力。Western blotting分别测定3月龄和8月龄上述4个分组小鼠脑皮质组织中MIF、白细胞介素1β前体(pro-IL-1β)、凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)、NLRP1及NLRP3蛋白的表达水平。采用免疫荧光染色法测定8月龄各分组小鼠脑皮质组织中β淀粉样蛋白(Aβ)表达。结果3月龄和8月龄时,与WT组小鼠相比,model组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF相对表达水平显著上调,原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞增殖能力增强(P<0.05)。与model组相比,model+lncRNA TUG1 shRNA组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF的相对表达水平显著降低,原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞增殖能力降低(P<0.05)。与WT组相比,model组小鼠外周血浆中MIF含量显著升高;小鼠脑皮质组织中pro-IL-1β、ASC、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)、NLRP1以及NLRP3的蛋白表达水平显著升高;Aβ免疫荧光强度明显增强(P<0.05)。与model组相比,model+lncRNA TUG1 shRNA组小鼠外周血浆中MIF含量显著降低;小鼠脑皮质组织中pro-IL-1β、ASC、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)和NLRP1的蛋白表达水平显著降低,Aβ免疫荧光强度明显降低(P<0.05),而NLRP3蛋白质的表达水平无明显变化(P>0.05)。与model组相比,model+shRNA NT组小鼠上述所有检测指标差异均无显著性(P>0.05)。结论APP/PS1转基因小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF因子表达上调与脑皮质内NLRP1炎症小体激活成正相关,敲低lncRNA TUG1可缓解阿尔茨海默病的进展。

RNA结合基序蛋白15在脓毒症小鼠心肌中的表达及与中性粒细胞胞外诱捕网的相关性

目的探讨RNA结合基序蛋白15(RBM15)在脓毒症心肌损伤小鼠中的表达及与中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)的相关性。方法腹腔注射脂多糖(LPS)建立小鼠脓毒症模型,以生理盐水处理小鼠作为对照组。LPS注射7 d后采用心脏多普勒超声检测小鼠心脏功能;采用HE染色观察脓毒症小鼠心肌损伤情况;免疫荧光染色法检测心肌组织切片中瓜氨酸化组蛋白H3(CitH3)表达水平;ELISA法检测心肌组织中CitH3、中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)和血浆中髓过氧化物酶(MPO)的酶活性;RT-qPCR检测中性粒细胞相关分子[人核因子κB抑制蛋白α(ⅠκBα)、核因子κB(NF-κB)、B-细胞淋巴瘤因子10(Bcl10)、肽酰基精氨酸脱亚氨酶4(PAD4)]、RBM15及N6-甲基腺嘌呤(m6A)甲基化酶[甲基转移酶样3(METTL3)、甲基转移酶样14(METTL14)、肾母细胞瘤1关联蛋白(WTAP)、KIAA1429]。Western blot检测中性粒细胞相关分子ⅠκBα、核因子κB/p65(NF-κB/p65)、核因子κB/p50(NF-κB/p50)、Bcl10、PAD4、RBM15及m6A甲基化酶METTL3、METTL14、WTAP、KIAA1429。结果心脏多普勒超声检测小鼠心脏功能结果显示,与对照组相比,实验组小鼠左心室射血分数(LVEF)、短轴缩短率(FS)均降低(P均<0.001);HE染色结果显示,对照组小鼠心肌组织结构正常,实验组小鼠心肌部分断裂,可见炎性细胞浸润,细胞水肿;免疫荧光染色结果显示,实验组CitH3荧光强度增强,表达上调(P<0.05);ELISA结果显示,与对照组相比,脓毒症小鼠心肌组织中NETs相关分子CitH3、NE及血浆中MPO均升高(P均<0.01);RT-qPCR结果显示,与对照组相比,实验组Bcl10(P=0.960)、PAD4(P=0.324)、METTL14(P=0.592)、WTAP(P=0.505)mRNA表达水平差异均无统计学意义,ⅠκBα(P<0.01)、NF-κB(p65/p50)(P<0.05)、RBM15(P<0.05)mRNA表达水平上升,METTL3(P<0.05)、KIAA1429(P<0.05)mRNA表达水平均降低;Western blot结果显示,与对照组相比,ⅠκBα(P=0.171)、NF-κB/p65(P=0.191)、NF-κB/p50(P=0.063)、PAD4(P=0.687)、RBM15(P=0.176)、METTL3(P=0.430)、METTL14(P=0.089)、KIAA1429(P=0.238)蛋白表达水平差异均无统计学意义,WTAP蛋白表达水平升高(P<0.05),Bcl10蛋白表达水平降低(P<0.05)。RBM15 mRNA表达水平与CitH3(r=0.631,P=0.011)水平呈正相关性,与MPO(r=0.318,P=0.114)及NE(r=0.099,P=0.410)水平无相关性。结论RBM15、NETs在脓毒症心肌损伤中表达上调,且RBM15与NETs相关分子CitH3具有正相关性,RBM15可能通过调节NETs相关分子参与脓毒症心肌损伤。

RNA结合蛋白QKI可通过调节EMT相关基因转录物的切割形成circRNA促进胃癌的发生发展

目的通过生物信息学分析震颤响应蛋白(quaking,QKI)参与胃癌(gastric cancer,GC)发生和发展的可能分子机制。研究QKI在GC细胞中的增殖、侵袭和迁移能力。方法联合TCGA和GTEx数据库分析QKI在常见人类癌症样本中的差异表达。分析QKI蛋白表达与肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)评分、微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)评分以及ESTIMATE评分的相关性,并分析QKI蛋白表达与总生存期(overall survival,OS)、无病生存期(disease free survival,DFS)及无进展生存期(progression free survival,PFS)的相关性。通过生物信息学分析获得可编码DEcircRNAs的EMT相关基因,构建QKI-EMT-circRNAs调控网络。在TMK1细胞中对差异表达的circRNAs和EMT相关基因进行表达验证,并验证敲降QKI后对TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力的影响。结果QKI在绝大多数肿瘤中差异表达,且与TMB、MSI以及肿瘤微环境(tumour microenvironment,TME)密切相关;QKI可作为高风险因子预测常见人类癌症患者的OS、DFS和PFS。QKI通过调控6个EMT相关基因转录本剪切形成8个circRNAs,它们均与胃癌患者预后明显相关。细胞实验表明,相对于正常胃上皮细胞,只有hsa_ccirc_0004015、CALD1和CDK14在TMK1细胞中表达下调。敲降QKI可抑制TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力。结论QKI通过调控6个EMT相关基因转录本剪切形成circRNAs,从而促进GC发生和发展。QKI在TMK1细胞中高表达,敲降QKI可抑制TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力。

RNA结合蛋白在心血管疾病中作用机制的研究进展

综述RNA结合蛋白的生物学意义,重点介绍其在心房颤动、急性冠脉综合征及特殊类型心脏病方面的作用机制及研究进展,展望RNA结合蛋白转导蛋白β样蛋白2在心肌梗死疾病中的作用。

RNA结合蛋白在慢性肾脏病中的研究进展

当前慢性肾脏病已成为一个全球的公共健康问题而受到关注。我国慢性肾脏病的发病率呈逐年升高趋势,其发病机制复杂、病情缓慢迁延、并发症多等因素成为临床诊治的难题,如不能有效防治将成为沉重的社会和经济负担。随着对RNA结合蛋白的研究不断深入,发现其与慢性肾脏病的发生、发展密切相关。本文对RNA结合蛋白与各种慢性肾脏病间的作用机制进行综述,以期为慢性肾脏病的临床诊断、治疗及预后提供新的方向。

水稻双链RNA结合蛋白同源基因OsRBP的克隆及其表达的分析

在基因数据库中发现两个水稻EST片段与大白菜BcpLH基因的双链RNA结合结构域 (dsRBD)有同源的区域 ,根据同源片段的位置特征设计引物 ,用RT-RCR扩增粳稻 (Oryzasativasubsp .japonica)愈伤组织的cDNA ,得到大小为 1.8kb的DNA片段。该cDNA片段含完整的编码区 ,有两个典型的dsRBD ,分别与BcpLH的dsRBD在氨基酸水平上同源性为 75 %左右 ,故将其命名为OsRBP。RT -PCR表达分析显示该基因在未成熟的种子和愈伤组织中表达 ,在根、茎、叶、穗、成熟种子及胚芽鞘中没有表达信号 ,由此推测该基因的表达可能与种子和胚的早期发育相关。该研究首次从水稻中分离到双链RNA结合蛋白基因 ,并初步研究了其表达方式 。

小鼠RNA结合蛋白QKI-5的生物信息学和组织表达分析及其过表达对癌症相关基因表达的影响

【目的】旨在构建小鼠Quaking基因的主要转录本Quaking-5(Qki-5)的真核表达载体,利用生物信息学软件预测分析其结构与功能特征,检测该基因的组织表达谱,并在小鼠AML12肝细胞系中探究Qki-5过表达对癌症相关基因表达的影响。【方法】提取小鼠肝脏组织的总RNA,反转录为cDNA,通过PCR扩增Qki-5转录本的蛋白编码区(Coding Sequence,CDS)全长,将获得的目的片段与线性化载体pcDNA3.1-Puro-N-3HA进行同源重组连接以获得pcDNA3.1-mQki-5。通过在线软件对Qki-5基因序列及其编码蛋白进行生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测Qki-5基因在小鼠不同组织中的表达谱,同时使用免疫组织化学技术检测QKI-5蛋白在小鼠肝脏组织的表达分布。之后,将pcDNA3.1-mQki-5重组质粒和pcDNA3.1-Puro-N-3HA空质粒分别转染至AML12细胞,通过qPCR和Western Blotting(WB)检测Qki-5基因在mRNA和蛋白水平的表达,并进一步检测Qki-5基因在AML12细胞中过表达后对癌症相关基因表达的影响。【结果】成功构建了pcDNA3.1-mQki-5真核表达载体;小鼠Qki-5基因的CDS区长度为1026 bp,共编码341个氨基酸;小鼠QKI-5蛋白为亲水性蛋白,不含跨膜结构和信号肽,存在26个磷酸化位点,且小鼠QKI-5蛋白的三级结构与人和大鼠完全一致;在检测的12个组织中,Qki-5在小鼠全脑的表达量最高,在十二指肠的表达量最低;QKI-5在小鼠肝脏组织中主要表达于肝细胞细胞核中;在AML12细胞过表达QKI-5后,会引起癌症相关基因P53和Ccnd1的mRNA表达水平显著升高。【结论】研究成功构建了小鼠Qki-5基因真核表达载体;Qki-5基因在小鼠全脑、肺脏等组织中表达量较高;QKI-5主要表达分布于小鼠肝细胞细胞核内;此外,在AML12细胞中QKI-5的过表达会引起P53和Ccnd1的表达水平升高。研究为进一步探究小鼠Qki-5基因的功能提供了关键材料。

黏虫保幼激素结合蛋白基因MsJHBP3生物学功能及对黏虫生长发育的影响

保幼激素结合蛋白(juvenile hormone binding protein,JHBP)是一类载体蛋白,与保幼激素(juvenile hormone,JH)结合形成复合体后将保幼激素运送到靶器官处调控昆虫的生长发育。本试验在黏虫Mythimna separata转录组中获得7条保幼激素结合蛋白基因,筛选获得一条经保幼激素诱导后高表达的保幼激素结合蛋白MsJHBP3(GenBank登录号:MZ577068),c DNA全长为839bp,开放读码框长度729bp,编码242个氨基酸,氨基酸等电点为5.35,分子量为27.02kDa。不同发育阶段研究表明,Ms JHBP3在蛹期表达量最高,2龄表达量最低。RNA干扰处理4龄幼虫后6 h基因抑制效率最好,达79.72%。干扰后虫体内保幼激素含量为对照的1.14倍;羽化率和化蛹率均较对照组显著降低,羽化率下降7.42%,化蛹率下降3.75%;Ms JHBP3干扰后转录组测序数据分析共获得212个差异基因,其中105个上调基因,107个下调基因,其中保幼激素甲基转移酶基因、保幼激素环氧水解酶基因、保幼激素酯酶基因均上调。本研究表明MsJHBP3影响黏虫生长发育并参与调控JH代谢。本研究结果为黏虫生长发育关键基因的挖掘提供基础数据,为黏虫生物防治提供新的靶标基因和途径。

慢性心力衰竭患者血清环状RNA同源域相互作用激酶3和转录因子GATA结合蛋白4与心室重构及心功能的相关性

目的探究慢性心力衰竭(CHF)患者血清环状RNA同源域相互作用激酶3(circHIPK3)和转录因子GATA结合蛋白4(GATA4)与心室重构及心功能的相关性。方法选取2021年6月至2023年6月河南科技大学第一附属医院收治的152例慢性心力衰竭(CHF)患者为观察对象,作为CHF组,选取同期健康体检者110例,作为对照组,参照纽约心脏病协会(NYHA)心功能分级标准将CHF患者分为Ⅰ~Ⅱ级(53例)、Ⅲ级(50例)、Ⅳ级(49例),采用实时荧光定量PCR法检测血清样本中circHIPK3表达水平,酶联免疫吸附法检测血清中GATA4蛋白水平,彩色多普勒超声心动图检测心室重构及心功能指标:左心室质量指数(LVMI)、左心室重构指数(LVRI)、左心室后壁厚度(LVPW)、左室舒张内径(LVEDD)、左心室短轴缩短率(LVFS)、心输出量(CO)、左心室射血分数(LVEF),多因素logistic回归分析CHF患者心功能分级的影响因素,Pearson法分析CHF患者血清circHIPK3、GATA4与LVMI、LVRI、LVPW、LVEDD、LVFS、CO、LVEF的相关性。结果与对照组比较,CHF患者血清中circHIPK3[(1.14±0.25)比(1.89±0.59)]、GATA4[(17.26±2.52)pg/ml比(26.94±4.24)pg/ml]水平显著升高,差异存在统计学意义(t=12.538、21.363;P<0.05),circHIPK3、GATA4水平随心功能分级的增加而升高。circHIPK3、GATA4、LVMI是心功能分级为Ⅲ~Ⅳ级的独立危险因素,CO、LVEF是保护因素(P<0.05)。CHF患者血清中circHIPK3、GATA4水平与LVMI、LVPW、LVEDD呈正相关,与LVRI、LVFS、CO、LVEF呈负相关(P<0.05);CHF患者血清中circHIPK3与GATA4呈正相关(P<0.05)。结论circHIPK3、GATA4在CHF患者血清中呈现高表达,与心室重构、心功能指标存在一定关联性,可能对该病的诊治、预后评估有重要参考价值。

冷诱导RNA结合蛋白在大鼠低体温性急性肺损伤中的表达变化

背景海上遇难者落水后常死于海水长时间浸泡后的低体温及相关并发症,肺是低体温损伤的重要器官之一,但目前针对低体温造成急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的研究相对匮乏。目的探讨冷诱导RNA结合蛋白(coldinducible RNA-binding protein,CIRP)在低体温性ALI大鼠模型中的变化及其可能的作用机制。方法将40只雄性成年SD大鼠随机分为0 h组(0 h,8只)和实验组(32只)。实验组分别用低温海水浸泡12 h、16 h、20 h、24 h(每组8只),构建低体温性ALI动物模型。ELISA检测白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、IL-1β、细胞外CIRP的含量,对肺组织进行HE染色、TUNEL染色和CIRP免疫组织化学染色,qRT-PCR检测CIRP mRNA的表达。结果与0 h组相比,实验组出现不同程度肺损伤,病理切片可见肺泡壁增厚或结构破坏,肺泡腔内出血,伴中性粒细胞和淋巴细胞浸润等;16 h、20 h、24 h实验组血清中IL-6的表达显著增加,20 h、24 h实验组血清中IL-1β表达显著增加,差异均有统计学意义(P<0.01);各实验组大鼠血清中CIRP表达增加均有统计学差异(12 h、16 h、20 h组,P<0.05;24 h组,P<0.01)。TUNEL结果显示,各实验组的大鼠肺组织出现不同程度的细胞凋亡现象(P<0.01);通过炎症因子的表达水平、肺组织病理改变以及细胞凋亡情况选择低温海水浸泡24 h为最佳构建模型时间,免疫组织化学染色和qRT-PCR观察到24 h组肺组织内CIRP的表达增加。结论肺组织和外周血清的CIRP在低体温性ALI大鼠模型中随时间延长而表达增高,提示其可能与低体温致ALI相关,同时与炎症因子IL-1β、IL-6水平呈现一致性趋势变化,因此推测CIRP可能通过促进炎症因子释放发挥作用,本研究初步证实了CIRP在肺组织区域和整体与低体温ALI的相关性。

RNA结合蛋白Aly/REF输出因子通过上调Yes相关蛋白表达促进胃癌细胞的增殖和迁移

胃癌是一种常见的发病率高、起病隐匿、侵袭性强的消化道恶性肿瘤,其发病机制错综复杂。RNA结合蛋白Aly/REF输出因子(RNAbinding protein Aly/REF export factor, ALYREF)作为一种RNA胞嘧啶的5-甲基化修饰(m~5C)后的结合蛋白质,在调控RNA出核及稳定其表达的过程中具有关键作用;Yes相关蛋白(yes-associated protein, YAP)作为Hippo-YAP信号通路中的关键分子,调控各种恶性肿瘤的生长和转移。本文旨在探讨ALYREF与YAP在促进胃癌细胞增殖和迁移中是否存在相关性,并初步探索这两者之间的作用机制。本文在胃癌细胞AGS和MKN-45中运用RT-PCR和Western印迹方法检测相关基因表达;CCK8试验检测细胞增殖;划痕试验和Trans-well试验分别检测细胞迁移和侵袭。结果显示,过表达ALYREF后YAP的表达增加(P<0.05),并且促进细胞的增殖、迁移和上皮细胞-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)(P<0.05);靶向敲低YAP,细胞的增殖、迁移和EMT能力显著抑制(P<0.05);过表达ALYREF且靶向敲除YAP与单独过表达ALYREF相比,YAP的表达显著降低(P<0.05),且细胞的增殖、迁移和EMT能力同样得到抑制(P<0.05);靶向敲低ALYREF,细胞的增殖、克隆形成和侵袭能力显著抑制(P<0.01)。综上所述,ALYREF通过上调YAP表达进而促进胃癌细胞的增殖和迁移。

RNA结合蛋白在肝脏疾病中作用机制的研究进展

RNA结合蛋白(RBPs)作为细胞发生发展的关键调控因子,通过与目标RNA结合参与剪切、信使RNA的稳定、亚细胞定位、翻译等生理过程,从而控制编码蛋白的表达水平。近年来,越来越多的研究表明RBPs参与多种肝脏疾病的发生发展,包括酒精性肝病、非酒精性脂肪性肝病、病毒性肝炎、肝纤维化和肝细胞癌等。但由于RBPs的作用和肝脏疾病发病机制均较复杂,RBPs在肝脏疾病中的作用和机制有待进一步阐明,同时了解RBPs在肝脏疾病中的作用机制,对肝脏疾病的药物开发、临床治疗均具有重要意义。

RNA结合蛋白与肿瘤生物治疗:新机遇与新策略

RNA结合蛋白(RBP)由于其独特的生物学功能,目前已经成为肿瘤生物治疗相关靶点筛选的宠儿,很可能为肿瘤生物治疗带来新的机遇。RBP能调控肿瘤细胞及肿瘤微环境免疫细胞和间质细胞的DNA-RNA-蛋白质相互作用网络,进而广泛影响肿瘤发生发展、抗肿瘤免疫应答及肿瘤免疫逃逸过程,目前RBP相关肿瘤生物治疗的研发,主要聚焦在治疗性疫苗、免疫细胞治疗、表观调控治疗等方面,部分研发成果已处于临床试验阶段。随着新理论、新技术的发展以及研究模式的创新,靶向RBP的治疗逐渐摆脱了既往靶向难、疗效欠佳的困局,迎来了新的机遇,通过改良精准靶向和优化组合用药等新策略,为肿瘤生物治疗注入了新的活力,对精准个体化医疗的发展具有重要意义。

RNA结合蛋白参与肝癌转移过程的研究进展

RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBP)是在细胞的一系列生理过程中与RNA分子相结合、伴随RNA代谢调控的一类功能十分重要的蛋白。在肝癌的转移过程中常伴有RBP的功能异常。基于最新的相关研究,本文总结了与肝癌转移相关的RBP,并就其参与该过程的具体作用机制进行综述,以期为癌症治疗的新靶点提供新思路或新方法。

RNA结合蛋白在肾癌发生发展中作用机制及生物学功能的研究进展

RNA结合蛋白(RBPs)是基因调控的重要组成部分,其涉及与rRNA、ncRNA、snRNA、miRNA、mRNA和tRNA等各种类型RNA的相互作用。其表达失调可能会促进细胞增殖、促进血管生成、抑制凋亡,在多种疾病尤其是恶性肿瘤的发生发展中扮演着关键角色。随着对肾癌分子机制研究的逐渐深入,人们发现RBPs的异常表达与肾癌的增殖、侵袭和转移密切相关,这些研究对肾癌的诊断、治疗和预后评价提供了一些新思路。本文就RNA结合蛋白在肾癌发生发展中作用机制及生物学功能的研究进展进行综述。

肿瘤中环状RNA泛素结合相关蛋白2的表达及调控作用研究进展

泛素结合相关蛋白2(UBAP2)是一种新发现的环状RNA,其在诸多人类肿瘤中异常表达并能参与调控肿瘤恶性生物学行为进程如肿瘤细胞的增殖、侵袭转移、抗凋亡和上皮间质转化等。环状RNA UBAP2(circ-UBAP2)的异常表达也与肿瘤的淋巴结转移、TNM分期、微血管浸润等病理特征有关;并且circ-UBAP2与环状RNA临床应用的研究热点如调控肿瘤细胞自噬、诱导细胞放疗和化疗耐受等也紧密相关。本文就circ-UBAP2在肿瘤中的表达、生物学作用及调控机制进行综述。

多房棘球蚴RNA结合蛋白EWS的原核表达及其细胞定位与功能的初步鉴定

通过对多房棘球绦虫(Echinococcus multilocularis)RNA结合蛋白EWS(EmEWS)基因的原核表达、抗体制备、细胞定位等研究,初步探究EmEWS基因特征以及与RNA的结合能力。根据Wormbase数据库中EmEWS基因序列设计引物,利用RT-PCR扩增EmEWS基因并构建重组表达质粒,诱导表达、纯化重组蛋白,制备EmEWS多克隆抗体后进行Western blot、实时荧光定量PCR、免疫荧光定位、双荧光测定。结果表明,EmEWS基因长度为1485 bp,编码495个氨基酸,在多房棘球蚴原代细胞中表达量较高,在原头蚴中最低。生物信息学分析表明,细粒棘球蚴EWS与EmEWS相似性高达98.3%,且EmEWS的RBD结构域在绦虫中高度保守。EmEWS重组蛋白大小约为54 ku,制备的多克隆抗体可识别多房棘球绦虫中天然EmEWS蛋白。细胞定位显示EmEWS主要分布在细胞膜上。双荧光试验证明EmEWS可以与结合富含UG的RNA序列结合。综合上述结果,推测EmEWS可能作为转录调控因子参与小RNA的形成,同时有助于核蛋白的运输。

RNA结合蛋白人类抗原R在肝细胞癌中的研究进展

肝细胞癌(HCC)具有发病率高、早期症状不明显、治疗手段局限、患者预后差等特点,因此寻找有效的早期诊断、监测、治疗HCC的方法迫在眉睫。RNA结合蛋白人类抗原R(HuR)作为一种重要的转录后调节因子,可通过调节相关靶信使RNA的稳定性、翻译、亚细胞定位和降解等生物过程参与肿瘤的发生发展。与邻近正常肝组织相比,HuR蛋白在HCC中持续高表达,并参与肝脏恶性转化相关基因的转录后调控。因此,HuR蛋白可作为HCC患者生存率较差的预测指标,深入研究HuR在HCC中的作用机制,可以为疾病的治疗提供新思路。