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抑制lncRNA TUG1下调核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1炎症小体在延缓阿尔茨海默病进展的作用 被引量:1
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作者 马婷婷 陈建红 +1 位作者 刘爱翠 李海宁 《解剖学报》 CAS CSCD 2024年第1期32-42,共11页
目的探讨敲低长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)抑制核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1(NLRP1)炎症小体在缓解阿尔茨海默病进展中的作用。方法选取9~10周龄遗传背景为C57/BL6的野生型小鼠(WT组,10只)或淀粉样前体蛋白(APP)/早... 目的探讨敲低长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)抑制核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1(NLRP1)炎症小体在缓解阿尔茨海默病进展中的作用。方法选取9~10周龄遗传背景为C57/BL6的野生型小鼠(WT组,10只)或淀粉样前体蛋白(APP)/早老素1(PS1)转基因小鼠(30只)。APP/PS1转基因小鼠随机分为模型(model)组,模型+敲低lncRNA TUG1组[model+lncRNA TUG1短发夹RNA(shRNA)组]和model+shRNA非靶标(NT)组,每组10只。分别采集12周龄第1天(3月龄)和32周龄第1天(8月龄)小鼠外周血和脑皮质组织,并分离皮质中的原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞,每个时间点每组5只小鼠。Real-time PCR分别测定3月龄和8月龄上述4个分组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和巨噬细胞移动抑制因子(MIF)mRNA的水平,以及原代星形胶质细胞中补体蛋白C1r和C1s mRNA的水平。ELISA法测定其外周血浆中MIF含量。对3月龄和8月龄小鼠脑皮质原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞共培养。CCK-8法测定上述2种细胞的增殖能力。Western blotting分别测定3月龄和8月龄上述4个分组小鼠脑皮质组织中MIF、白细胞介素1β前体(pro-IL-1β)、凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)、NLRP1及NLRP3蛋白的表达水平。采用免疫荧光染色法测定8月龄各分组小鼠脑皮质组织中β淀粉样蛋白(Aβ)表达。结果3月龄和8月龄时,与WT组小鼠相比,model组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF相对表达水平显著上调,原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞增殖能力增强(P<0.05)。与model组相比,model+lncRNA TUG1 shRNA组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF的相对表达水平显著降低,原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞增殖能力降低(P<0.05)。与WT组相比,model组小鼠外周血浆中MIF含量显著升高;小鼠脑皮质组织中pro-IL-1β、ASC、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)、NLRP1以及NLRP3的蛋白表达水平显著升高;Aβ免疫荧光强度明显增强(P<0.05)。与model组相比,model+lncRNA TUG1 shRNA组小鼠外周血浆中MIF含量显著降低;小鼠脑皮质组织中pro-IL-1β、ASC、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)和NLRP1的蛋白表达水平显著降低,Aβ免疫荧光强度明显降低(P<0.05),而NLRP3蛋白质的表达水平无明显变化(P>0.05)。与model组相比,model+shRNA NT组小鼠上述所有检测指标差异均无显著性(P>0.05)。结论APP/PS1转基因小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF因子表达上调与脑皮质内NLRP1炎症小体激活成正相关,敲低lncRNA TUG1可缓解阿尔茨海默病的进展。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 长链非编码rna 牛磺酸上调基因1 巨噬细胞移动抑制因子 核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1 免疫印迹法 小鼠
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RNA结合蛋白ELAVL1的功能及其调控病毒复制的研究进展
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作者 余祖华 高梦茹 +4 位作者 齐志颖 张静雨 何雷 陈建 丁轲 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1914-1925,共12页
胚胎致死异常视觉蛋白1(embryonic lethal abnormal vision like 1, ELAVL1),又被称为人类抗原R(human antigen R, HuR),是一种典型的RNA结合蛋白(RNA binding protein, RBP),通过与3′非翻译区(3′untranslated element, 3′UTR)的AU... 胚胎致死异常视觉蛋白1(embryonic lethal abnormal vision like 1, ELAVL1),又被称为人类抗原R(human antigen R, HuR),是一种典型的RNA结合蛋白(RNA binding protein, RBP),通过与3′非翻译区(3′untranslated element, 3′UTR)的AU富含元件(AU-rich element, ARE)结合,在mRNA转录和翻译过程中发挥重要作用。ELAVL1的作用十分广泛,可调控肿瘤的发生发展、凋亡、迁移与侵袭,是许多癌症治疗的关键靶点,还能参与调节编码器官发育和组织稳态的蛋白质和mRNA的水平,也有许多研究表明,ELAVL1通过转录后调控和翻译后修饰来调节病毒复制。本文主要综述了ELAVL1的生物学特点、功能、调控机制及其在病毒复制过程中的调控作用,旨在为进一步研究ELAVL1与畜禽病毒复制之间互作的机制提供理论参考。 展开更多
关键词 ELAVL1 rna结合蛋白 病毒 调控机制
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RNA结合蛋白HuR调控lncRNA DLEU2促进食管鳞癌细胞增殖、侵袭的机制
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作者 王伟 何天乐 +1 位作者 李扬 杨素清 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2024年第4期883-888,共6页
目的探讨RNA结合蛋白人抗原(Hu)R对食管鳞癌细胞增殖、侵袭的影响及其与长链非编码RNA(lncRNA)淋巴细胞白血病缺失基因(DLEU)2的调控关系。方法收集食管鳞癌组织样本并在体外培养正常人食管鳞状上皮细胞Het-1A及食管鳞癌细胞系KYSE30、K... 目的探讨RNA结合蛋白人抗原(Hu)R对食管鳞癌细胞增殖、侵袭的影响及其与长链非编码RNA(lncRNA)淋巴细胞白血病缺失基因(DLEU)2的调控关系。方法收集食管鳞癌组织样本并在体外培养正常人食管鳞状上皮细胞Het-1A及食管鳞癌细胞系KYSE30、KYSE70、KYSE270,实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)实验检测HuR mRNA与DLEU2表达水平。利用Lipofectamime2000试剂对KYSE30细胞进行转染,并随机分组为对照组、pcDNA组、pc-HuR组、sh-NC组、sh-HuR组、sh-HuR+si-NC组和sh-HuR+si-DLEU2组。CCK-8法检测各组KYSE30细胞活性;平板克隆形成实验检测各组KYSE30细胞增殖能力;荷瘤裸鼠实验观察体内肿瘤生长情况;Transwell小室检测各组KYSE30细胞侵袭能力;Western印迹检测各组KYSE30细胞中HuR蛋白表达水平;RNA免疫沉淀(RIP)实验分析HuR与DLEU2的结合关系。结果在食管鳞癌组织和细胞系中,HuR mRNA和蛋白表达及DLEU2水平均显著升高(P<0.05),其中KYSE30细胞系中HuR基因与DLEU2表达水平最高,故选择KYSE30细胞进行转染实验。转染pc-HuR的细胞中HuR蛋白表达明显上调,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均显著增加(P<0.05);转染sh-HuR的细胞中HuR蛋白表达明显下调,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均显著降低(P<0.05)。RIP实验和qRT-PCR检测发现HuR与DLEU2有相互作用关系。同时转染sh-HuR和si-DLEU2的细胞中DLEU2水平明显降低,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均比转染sh-HuR明显更低(P<0.05)。过表达HuR显著增加移植瘤体积和重量,抑制HuR明显减小移植瘤的体积和重量,而同时抑制HuR和DLEU2时移植瘤的体积和重量比单独抑制HuR时明显更小(P<0.05)。结论HuR通过与DLEU2结合,促进食管鳞癌细胞的增殖、侵袭和移植瘤的体内生长。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 人抗原R 食管鳞癌 淋巴细胞白血病缺失基因2 增殖 侵袭
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RNA结合蛋白ZCCHC17在肝细胞癌中的研究进展
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作者 梁家东 刘肸琳 +2 位作者 黄云美 杨伟鹏 罗春英 《中国现代医生》 2024年第23期132-134,139,共4页
肝细胞癌是人类最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁人类生命健康。肝细胞癌常见的治疗手段包括手术治疗、放疗和化疗等。受肿瘤复发和转移等多种因素影响,肝细胞癌患者的预后及5年生存率并不理想。探索早期诊断的生物标志物是肝细胞癌研究... 肝细胞癌是人类最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁人类生命健康。肝细胞癌常见的治疗手段包括手术治疗、放疗和化疗等。受肿瘤复发和转移等多种因素影响,肝细胞癌患者的预后及5年生存率并不理想。探索早期诊断的生物标志物是肝细胞癌研究的热点之一。多项研究证实,RNA结合蛋白功能异常可使多种肿瘤相关标志物发生改变,进而影响肿瘤的发生发展。本文对RNA结合蛋白ZCCHC17的生物学功能、ZCCHC17与DNA甲基化的相关性及ZCCHC17与肝细胞癌的相关性等研究进展进行综述。 展开更多
关键词 rna结合蛋白ZCCHC17 肝细胞癌 生物学功能 甲基化 预后
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RNA结合蛋白FMRP在实体瘤中作用的研究进展
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作者 韩宜倩 周康杰 +3 位作者 蒋薇薇 张淼 毛晨曦 吴风雷 《山东医药》 CAS 2024年第25期99-102,共4页
迄今为止,绝大部分恶性肿瘤的病因和发病机制尚不完全清楚。基因表达调控能够从多个层面影响RNA分子结构并改变其稳定性,还能使其获得更多的生物学功能,从而对肿瘤的发生、发展产生重要影响。RNA结合蛋白(RBPs)是基因表达调控的关键效... 迄今为止,绝大部分恶性肿瘤的病因和发病机制尚不完全清楚。基因表达调控能够从多个层面影响RNA分子结构并改变其稳定性,还能使其获得更多的生物学功能,从而对肿瘤的发生、发展产生重要影响。RNA结合蛋白(RBPs)是基因表达调控的关键效应因子,能够参与人体多种重要的生理过程,其表达缺陷可导致多种疾病的发生,包括癌症。脆性X智力低下蛋白(FMRP)是由脆性X智力低下1(FMR1)基因编码的一种RBP。有研究报道,FMRP在多种肿瘤组织中过表达,可通过调控不同的信号通路,参与肿瘤细胞增殖、侵袭、迁移等生物学过程。但由于肿瘤的发生、发展机制极其复杂,往往存在多条信号通路的交叉重叠,许多信号通路中上下游分子和转录因子的作用尚不完全清楚。因此,FMRP在实体瘤中的作用机制仍需进一步探索。 展开更多
关键词 实体瘤 rna结合蛋白 脆性X智力低下蛋白 信号通路
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慢性阻塞性肺疾病患者外周血中冷诱导RNA结合蛋白和髓样细胞触发受体-1的表达水平及其临床意义 被引量:1
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作者 张政 陈雪儿 卢献灵 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第7期1275-1280,共6页
目的探讨慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者外周血中冷诱导RNA结合蛋白(CIRBP)和髓样细胞触发受体-1(TREM-1)的表达水平及其临床意义。方法选取2022年10月—2023年6月40例住院的COPD患者为急性加重期组,其经过治疗进入稳定期后纳入稳定期组,同... 目的探讨慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者外周血中冷诱导RNA结合蛋白(CIRBP)和髓样细胞触发受体-1(TREM-1)的表达水平及其临床意义。方法选取2022年10月—2023年6月40例住院的COPD患者为急性加重期组,其经过治疗进入稳定期后纳入稳定期组,同期40例健康体检者为对照组。收集各组一般资料,采集外周血,通过酶联免疫吸附法测定血浆中CIRBP、TREM-1水平,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)法测定CIRBP mRNA和TREM-1 mRNA的相对表达量,并检测COPD患者和健康体检者的肺功能。结果COPD急性加重期外周血中的CIRBP、TREM-1表达水平均高于稳定期组,差异有统计学意义(均P<0.001);急性加重期和稳定期外周血中的CIRBP、TREM-1表达水平均高于对照组,差异有统计学意义(均P<0.001);在急性加重期和稳定期,CIRBP水平均与TREM-1水平呈正相关;急性加重期CIRBP、TREM-1水平与白细胞计数、中性粒细胞百分比、中性粒细胞/淋巴细胞比率呈正相关;稳定期CIRBP、TREM-1水平与第1秒用力呼气容积占预计值百分比、第1秒用力呼气容积/用力肺活量比值呈负相关,与白细胞计数、中性粒细胞百分比、中性粒细胞/淋巴细胞比率呈正相关。结论CIRBP和TREM-1的表达水平在COPD患者外周血中升高,CIRBP的表达与TREM-1表达具有相关性,并且与肺功能、白细胞计数、中性粒细胞百分比、中性粒细胞与淋巴细胞比率、单核细胞与高密度脂蛋白比率等临床指标相关,提示CIRBP和TREM-1可能共同参与COPD的发生发展。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 冷诱导rna结合蛋白 髓样细胞触发受体-1
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RNA结合蛋白在慢性肾脏病中的研究进展 被引量:1
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作者 张佳慧 张雪琴 +1 位作者 朱国强 陆晨 《中国现代医生》 2024年第3期115-118,共4页
当前慢性肾脏病已成为一个全球的公共健康问题而受到关注。我国慢性肾脏病的发病率呈逐年升高趋势,其发病机制复杂、病情缓慢迁延、并发症多等因素成为临床诊治的难题,如不能有效防治将成为沉重的社会和经济负担。随着对RNA结合蛋白的... 当前慢性肾脏病已成为一个全球的公共健康问题而受到关注。我国慢性肾脏病的发病率呈逐年升高趋势,其发病机制复杂、病情缓慢迁延、并发症多等因素成为临床诊治的难题,如不能有效防治将成为沉重的社会和经济负担。随着对RNA结合蛋白的研究不断深入,发现其与慢性肾脏病的发生、发展密切相关。本文对RNA结合蛋白与各种慢性肾脏病间的作用机制进行综述,以期为慢性肾脏病的临床诊断、治疗及预后提供新的方向。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 慢性肾脏病 基因调控 细胞凋亡
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RNA结合基序蛋白15在脓毒症小鼠心肌中的表达及与中性粒细胞胞外诱捕网的相关性
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作者 刘纯瑶 杨丽婷 +2 位作者 牛泽粟 胡怡 潘东峰 《宁夏医科大学学报》 2024年第6期563-570,共8页
目的探讨RNA结合基序蛋白15(RBM15)在脓毒症心肌损伤小鼠中的表达及与中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)的相关性。方法腹腔注射脂多糖(LPS)建立小鼠脓毒症模型,以生理盐水处理小鼠作为对照组。LPS注射7 d后采用心脏多普勒超声检测小鼠心脏功... 目的探讨RNA结合基序蛋白15(RBM15)在脓毒症心肌损伤小鼠中的表达及与中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)的相关性。方法腹腔注射脂多糖(LPS)建立小鼠脓毒症模型,以生理盐水处理小鼠作为对照组。LPS注射7 d后采用心脏多普勒超声检测小鼠心脏功能;采用HE染色观察脓毒症小鼠心肌损伤情况;免疫荧光染色法检测心肌组织切片中瓜氨酸化组蛋白H3(CitH3)表达水平;ELISA法检测心肌组织中CitH3、中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)和血浆中髓过氧化物酶(MPO)的酶活性;RT-qPCR检测中性粒细胞相关分子[人核因子κB抑制蛋白α(ⅠκBα)、核因子κB(NF-κB)、B-细胞淋巴瘤因子10(Bcl10)、肽酰基精氨酸脱亚氨酶4(PAD4)]、RBM15及N6-甲基腺嘌呤(m6A)甲基化酶[甲基转移酶样3(METTL3)、甲基转移酶样14(METTL14)、肾母细胞瘤1关联蛋白(WTAP)、KIAA1429]。Western blot检测中性粒细胞相关分子ⅠκBα、核因子κB/p65(NF-κB/p65)、核因子κB/p50(NF-κB/p50)、Bcl10、PAD4、RBM15及m6A甲基化酶METTL3、METTL14、WTAP、KIAA1429。结果心脏多普勒超声检测小鼠心脏功能结果显示,与对照组相比,实验组小鼠左心室射血分数(LVEF)、短轴缩短率(FS)均降低(P均<0.001);HE染色结果显示,对照组小鼠心肌组织结构正常,实验组小鼠心肌部分断裂,可见炎性细胞浸润,细胞水肿;免疫荧光染色结果显示,实验组CitH3荧光强度增强,表达上调(P<0.05);ELISA结果显示,与对照组相比,脓毒症小鼠心肌组织中NETs相关分子CitH3、NE及血浆中MPO均升高(P均<0.01);RT-qPCR结果显示,与对照组相比,实验组Bcl10(P=0.960)、PAD4(P=0.324)、METTL14(P=0.592)、WTAP(P=0.505)mRNA表达水平差异均无统计学意义,ⅠκBα(P<0.01)、NF-κB(p65/p50)(P<0.05)、RBM15(P<0.05)mRNA表达水平上升,METTL3(P<0.05)、KIAA1429(P<0.05)mRNA表达水平均降低;Western blot结果显示,与对照组相比,ⅠκBα(P=0.171)、NF-κB/p65(P=0.191)、NF-κB/p50(P=0.063)、PAD4(P=0.687)、RBM15(P=0.176)、METTL3(P=0.430)、METTL14(P=0.089)、KIAA1429(P=0.238)蛋白表达水平差异均无统计学意义,WTAP蛋白表达水平升高(P<0.05),Bcl10蛋白表达水平降低(P<0.05)。RBM15 mRNA表达水平与CitH3(r=0.631,P=0.011)水平呈正相关性,与MPO(r=0.318,P=0.114)及NE(r=0.099,P=0.410)水平无相关性。结论RBM15、NETs在脓毒症心肌损伤中表达上调,且RBM15与NETs相关分子CitH3具有正相关性,RBM15可能通过调节NETs相关分子参与脓毒症心肌损伤。 展开更多
关键词 脓毒症心肌损伤 中性粒细胞胞外诱捕网 rna结合基序蛋白15
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RNA结合蛋白QKI可通过调节EMT相关基因转录物的切割形成circRNA促进胃癌的发生发展
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作者 崔逸爽 郑璇 +4 位作者 吴亚男 么艺涵 王珺 刘子情 孙国贵 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1462-1473,共12页
目的通过生物信息学分析震颤响应蛋白(quaking,QKI)参与胃癌(gastric cancer,GC)发生和发展的可能分子机制。研究QKI在GC细胞中的增殖、侵袭和迁移能力。方法联合TCGA和GTEx数据库分析QKI在常见人类癌症样本中的差异表达。分析QKI蛋白... 目的通过生物信息学分析震颤响应蛋白(quaking,QKI)参与胃癌(gastric cancer,GC)发生和发展的可能分子机制。研究QKI在GC细胞中的增殖、侵袭和迁移能力。方法联合TCGA和GTEx数据库分析QKI在常见人类癌症样本中的差异表达。分析QKI蛋白表达与肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)评分、微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)评分以及ESTIMATE评分的相关性,并分析QKI蛋白表达与总生存期(overall survival,OS)、无病生存期(disease free survival,DFS)及无进展生存期(progression free survival,PFS)的相关性。通过生物信息学分析获得可编码DEcircRNAs的EMT相关基因,构建QKI-EMT-circRNAs调控网络。在TMK1细胞中对差异表达的circRNAs和EMT相关基因进行表达验证,并验证敲降QKI后对TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力的影响。结果QKI在绝大多数肿瘤中差异表达,且与TMB、MSI以及肿瘤微环境(tumour microenvironment,TME)密切相关;QKI可作为高风险因子预测常见人类癌症患者的OS、DFS和PFS。QKI通过调控6个EMT相关基因转录本剪切形成8个circRNAs,它们均与胃癌患者预后明显相关。细胞实验表明,相对于正常胃上皮细胞,只有hsa_ccirc_0004015、CALD1和CDK14在TMK1细胞中表达下调。敲降QKI可抑制TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力。结论QKI通过调控6个EMT相关基因转录本剪切形成circRNAs,从而促进GC发生和发展。QKI在TMK1细胞中高表达,敲降QKI可抑制TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力。 展开更多
关键词 胃癌 QKI rna结合蛋白 上皮间充质转化 circrna 生物信息学分析
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采用MS2 pulldown和质谱分析法检测BT549细胞中的LncRNA SNHG15结合蛋白
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作者 陈少英 彭佩 +1 位作者 周艳春 顾巍 《癌变.畸变.突变》 CAS 2024年第5期395-398,共4页
目的:鉴定乳腺癌BT549细胞中与长链非编码RNA SNHG15结合的蛋白。方法:用慢病毒感染乳腺癌BT549细胞,构建稳定过表达SNHG15的BT549-SNHG15-MS2细胞株。通过MS2 pulldown和质谱分析法,检测BT549细胞中与SNHG15结合的蛋白。随后采用RNA免... 目的:鉴定乳腺癌BT549细胞中与长链非编码RNA SNHG15结合的蛋白。方法:用慢病毒感染乳腺癌BT549细胞,构建稳定过表达SNHG15的BT549-SNHG15-MS2细胞株。通过MS2 pulldown和质谱分析法,检测BT549细胞中与SNHG15结合的蛋白。随后采用RNA免疫共沉淀(RIP)和逆转录-定量PCR(RT-qPCR)法,以HEAD框肽5(DEAD box helicases 5,DDX5)为模板验证共沉淀蛋白和SNHG15的结合。结果:经MS2 pulldown和质谱分析筛选出386个潜在的SNHG15结合蛋白。RNA免疫沉淀结合RT-qPCR检测结果证实DDX5与SNHG15的结合。结论:本研究介绍了一种有效分析RNA-蛋白质相互作用的生物学方法,同时为深入研究SNHG15的作用机制提供了新的实验证据。 展开更多
关键词 长链非编码rna MS2 pulldown 小核仁rna宿主基因15 rna免疫沉淀 rna结合蛋白
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RNA结合蛋白在心血管疾病中作用机制的研究进展
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作者 刘嘉欣 杨五小 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年第8期1437-1441,共5页
综述RNA结合蛋白的生物学意义,重点介绍其在心房颤动、急性冠脉综合征及特殊类型心脏病方面的作用机制及研究进展,展望RNA结合蛋白转导蛋白β样蛋白2在心肌梗死疾病中的作用。
关键词 心血管疾病 rna结合蛋白 转导蛋白β样蛋白2 心肌梗死 综述
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冷诱导RNA结合蛋白介导氧化应激促进脑缺血再灌注损伤的机制研究
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作者 范阳 张西安 +3 位作者 豆涛涛 刘立承 皇甫慧源 刘展会 《临床医学进展》 2024年第8期1633-1644,共12页
目的:探究冷诱导RNA结合蛋白(cold-inducible RNA-binding protein, CIRP)是否能通过TLR4/MyD88途径介导氧化应激促进脑缺血再灌注损伤的发生发展过程,目前尚无报道。本研究将为脑缺血再灌注损伤的治疗提供新的靶点,亦为临床急性缺血性... 目的:探究冷诱导RNA结合蛋白(cold-inducible RNA-binding protein, CIRP)是否能通过TLR4/MyD88途径介导氧化应激促进脑缺血再灌注损伤的发生发展过程,目前尚无报道。本研究将为脑缺血再灌注损伤的治疗提供新的靶点,亦为临床急性缺血性脑卒中(acute ischemic stroke, AIS)患者术后缺血再灌注损伤的治疗应用提供了理论依据。方法:首先通过检测AIS患者术后外周血、构建HMC3细胞缺氧/复氧模型,观察缺血再灌注损伤对CIRP表达水平的影响;其次通过培养SH-SY5Y细胞,使用人重组CIRP蛋白(Recombinant human CIRP protein, rhCIRP)及C23干预,观察CIRP的表达及氧化应激水平。最后利用慢病毒敲减HMC3细胞的CIRP基因,再次构建细胞缺氧/复氧模型,探究CIRP通过TLR4/MyD88途径激活NADPH氧化酶,释放ROS上调Drp-1水平,进而促进线粒体分裂的分子机制。结果:AIS患者脑缺血再灌注后血清CIRP表达较术前显著升高。在人小胶质细胞HMC3缺氧/复氧模型中,细胞内CIRP表达水平显著升高且8小时后CIRP表达水平达到巅峰,并分泌到细胞外,激活炎症因子TNF-α、IL-6表达。rhCIRP可以作用于SH-SY5Y细胞促进TLR4、GP91、P47、DRP-1、MFN-2、Cleaved-caspase-3、TNF-α、IL-6的表达,介导氧化应激。而使用C23和敲减CIRP后则可以抑制上述蛋白和炎症因子的表达,保护组织细胞。结论:缺血再灌注损伤使小胶质细胞释放大量CIRP,分泌到细胞外,TLR-4/MyD88通路介导氧化应激,引起神经细胞缺血再灌注损伤。Objective: To explore whether CIRP can promote the occurrence and development of cerebral ischemia-reperfusion injury through TLR4/MyD88 pathway through oxidative stress, there is no report at present. This study will provide a new target for cerebral ischemia-reperfusion injury, and also provide a theoretical basis for the treatment and application of ischemia-reperfusion injury after acute ischemic stroke surgery. Methods: The effect of ischemia reperfusion injury on the expression of CIRP was observed by detecting the peripheral blood of patients with acute ischemic stroke after operation and constructing the hypoxia/reoxygenation model of HMC3 cells. Secondly, SH-SY5Y was cultured, and human recombinant CIRP protein (rhCIRP) and CIRP inhibitor (C23) were used to observe the level of CIRP and oxidative stress. Finally, the CIRP gene of HMC3 cells was knocked down by lentivirus, and the cell hypoxia/reoxygenation model was constructed again to explore the molecular mechanism of CIRP activating NADPH oxidase through TLR4/MyD88 pathway, releasing ROS to up-regulate the level of Drp-1, and promoting mitochondrial division. Results: The expression of serum CIRP in AIS patients after cerebral ischemia reperfusion was significantly higher than that before operation. In the hypoxia/reoxygenation model of human microglial cell HMC3, the expression level of CIRP in the cell increased significantly and reached the peak after 8 hours, and secreted to the outside of the cell to activate the inflammatory factor TNF-α, IL-6 expression. rhCIRP can be used as SH-SY5Y cells to promote TLR4, GP91, P47, DRP-1, MFN-2, Cleved-caspase-3, TNF-α, IL-6 expression, and mediate oxidative stress. C23 and knockdown of CIRP can inhibit the expression of the above proteins and inflammatory factors, and protect the tissue cells. Conclusion: Ischemia reperfusion injury causes microglia to release a large amount of CIRP, which is secreted into the extracellular space. The TLR-4/MyD88 pathway mediates oxidative stress, leading to neuronal ischemia-reperfusion injury. 展开更多
关键词 冷诱导rna结合蛋白 缺血再灌注损伤 急性缺血性中风 氧化应激 线粒体分裂
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黏虫保幼激素结合蛋白基因MsJHBP3生物学功能及对黏虫生长发育的影响 被引量:2
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作者 胡育硕 张春雨 +3 位作者 孟祥昕 李朔涵 张津博 樊东 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期80-90,共11页
保幼激素结合蛋白(juvenile hormone binding protein,JHBP)是一类载体蛋白,与保幼激素(juvenile hormone,JH)结合形成复合体后将保幼激素运送到靶器官处调控昆虫的生长发育。本试验在黏虫Mythimna separata转录组中获得7条保幼激素结... 保幼激素结合蛋白(juvenile hormone binding protein,JHBP)是一类载体蛋白,与保幼激素(juvenile hormone,JH)结合形成复合体后将保幼激素运送到靶器官处调控昆虫的生长发育。本试验在黏虫Mythimna separata转录组中获得7条保幼激素结合蛋白基因,筛选获得一条经保幼激素诱导后高表达的保幼激素结合蛋白MsJHBP3(GenBank登录号:MZ577068),c DNA全长为839bp,开放读码框长度729bp,编码242个氨基酸,氨基酸等电点为5.35,分子量为27.02kDa。不同发育阶段研究表明,Ms JHBP3在蛹期表达量最高,2龄表达量最低。RNA干扰处理4龄幼虫后6 h基因抑制效率最好,达79.72%。干扰后虫体内保幼激素含量为对照的1.14倍;羽化率和化蛹率均较对照组显著降低,羽化率下降7.42%,化蛹率下降3.75%;Ms JHBP3干扰后转录组测序数据分析共获得212个差异基因,其中105个上调基因,107个下调基因,其中保幼激素甲基转移酶基因、保幼激素环氧水解酶基因、保幼激素酯酶基因均上调。本研究表明MsJHBP3影响黏虫生长发育并参与调控JH代谢。本研究结果为黏虫生长发育关键基因的挖掘提供基础数据,为黏虫生物防治提供新的靶标基因和途径。 展开更多
关键词 黏虫 保幼激素结合蛋白 rna干扰 实时荧光定量PCR 转录组
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花蓟马化学感受蛋白FintCSP2与聚集信息素苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯的结合特性
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作者 李恒 田厚军 +3 位作者 陈艺欣 林硕 魏辉 陈勇 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期897-908,共12页
【目的】本研究旨在明确花蓟马Frankliniella intonsa化学感受蛋白(chemosensory protein,CSP)FintCSP2与聚集信息素苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯[neryl(S)-2-methylbutanoate]的结合能力。【方法】利用RT-PCR法扩增花蓟马FintCSP2的开放阅... 【目的】本研究旨在明确花蓟马Frankliniella intonsa化学感受蛋白(chemosensory protein,CSP)FintCSP2与聚集信息素苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯[neryl(S)-2-methylbutanoate]的结合能力。【方法】利用RT-PCR法扩增花蓟马FintCSP2的开放阅读框序列,并对其进行生物信息学分析;利用RT-qPCR检测FintCSP2在花蓟马雌成虫不同组织(触角、去除触角的头、胸、腹和足)中的表达量;利用RNAi通过向花蓟马雌成虫注射dsRNA沉默FintCSP2,24 h时通过触角电位(electroantennogram,EAG)实验检测花蓟马对苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯的反应,利用Y型嗅觉仪测定花蓟马雌成虫对苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯的的选择性;原核表达FintCSP2重组蛋白,利用荧光竞争结合实验检测FintCSP2重组蛋白与苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯结合力;采用分子对接模拟技术和蛋白定点突变技术分析FintCSP2与苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯结合的关键氨基酸残基。【结果】花蓟马FintCSP2(GenBank登录号:MT211602.1)开放阅读框长390 bp,编码129个氨基酸,N端有一个包含20个氨基酸的信号肽,含有4个保守的半胱氨酸。氨基酸序列分析结果表明,FintCSP2氨基酸与花蓟马CSP1(GenBank登录号:WBW64307.1)、西花蓟马F.occidentalis CSPs(GenBank登录号:WBW64306.1,AJL33750.1)和牛角花齿蓟马Odontothrips loti CSP2(GenBank登录号:WBU77202.1)的亲缘关系最近,氨基酸序列一致性分别为99.22%,99.22%,86.05%和65.85%。RT-qPCR结果表明,FintCSP2在雌成虫各组织中均有表达,其中在触角中的表达量最高。与对照组(注射ds EGFP)比,沉默FintCSP2显著降低花蓟马对苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯的EAG反应绝对值和选择率。分子对接预测Tyr24,Phe29,Leu38,Val71,Cys76,Cys79和Gln83这7个氨基酸残基最可能参与FintCSP2结合苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯;定点突变和荧光竞争结合实验结果表明,与野生型蛋白相比,FintCSP2-Tyr24Ala和FintCSP2-Gln83Ala突变蛋白与苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯结合能力显著下降,FintCSP2-Phe29Ala突变体蛋白失去与苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯的结合能力。【结论】花蓟马FintCSP2蛋白在识别苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯过程中起关键作用,Tyr24,Phe29和Gln83是FintCSP2结合苨肉基(S)-2-甲基丁酸酯的3个关键氨基酸残基。 展开更多
关键词 花蓟马 聚集信息素 化学感受蛋白 rna干扰 定点突变 荧光竞争结合实验
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小鼠RNA结合蛋白QKI-5的生物信息学和组织表达分析及其过表达对癌症相关基因表达的影响 被引量:1
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作者 王逢博 高登科 +6 位作者 李超 李丹 刘薇 张海森 杨王浩 靳亚平 陈华涛 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期453-466,共14页
【目的】旨在构建小鼠Quaking基因的主要转录本Quaking-5(Qki-5)的真核表达载体,利用生物信息学软件预测分析其结构与功能特征,检测该基因的组织表达谱,并在小鼠AML12肝细胞系中探究Qki-5过表达对癌症相关基因表达的影响。【方法】提取... 【目的】旨在构建小鼠Quaking基因的主要转录本Quaking-5(Qki-5)的真核表达载体,利用生物信息学软件预测分析其结构与功能特征,检测该基因的组织表达谱,并在小鼠AML12肝细胞系中探究Qki-5过表达对癌症相关基因表达的影响。【方法】提取小鼠肝脏组织的总RNA,反转录为cDNA,通过PCR扩增Qki-5转录本的蛋白编码区(Coding Sequence,CDS)全长,将获得的目的片段与线性化载体pcDNA3.1-Puro-N-3HA进行同源重组连接以获得pcDNA3.1-mQki-5。通过在线软件对Qki-5基因序列及其编码蛋白进行生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测Qki-5基因在小鼠不同组织中的表达谱,同时使用免疫组织化学技术检测QKI-5蛋白在小鼠肝脏组织的表达分布。之后,将pcDNA3.1-mQki-5重组质粒和pcDNA3.1-Puro-N-3HA空质粒分别转染至AML12细胞,通过qPCR和Western Blotting(WB)检测Qki-5基因在mRNA和蛋白水平的表达,并进一步检测Qki-5基因在AML12细胞中过表达后对癌症相关基因表达的影响。【结果】成功构建了pcDNA3.1-mQki-5真核表达载体;小鼠Qki-5基因的CDS区长度为1026 bp,共编码341个氨基酸;小鼠QKI-5蛋白为亲水性蛋白,不含跨膜结构和信号肽,存在26个磷酸化位点,且小鼠QKI-5蛋白的三级结构与人和大鼠完全一致;在检测的12个组织中,Qki-5在小鼠全脑的表达量最高,在十二指肠的表达量最低;QKI-5在小鼠肝脏组织中主要表达于肝细胞细胞核中;在AML12细胞过表达QKI-5后,会引起癌症相关基因P53和Ccnd1的mRNA表达水平显著升高。【结论】研究成功构建了小鼠Qki-5基因真核表达载体;Qki-5基因在小鼠全脑、肺脏等组织中表达量较高;QKI-5主要表达分布于小鼠肝细胞细胞核内;此外,在AML12细胞中QKI-5的过表达会引起P53和Ccnd1的表达水平升高。研究为进一步探究小鼠Qki-5基因的功能提供了关键材料。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 QKI 表达谱 哺乳动物 癌症
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RNA-蛋白质复合物规模化富集与鉴定新方法
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作者 董沛滢 刘彤 秦伟捷 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2024年第11期209-217,共9页
RNA-蛋白质复合物调控着生物体内各种生理过程,在RNA从合成到降解的生理活动历程中发挥关键作用.为了更全面解析RNA-蛋白复合物(RNA-protein complexes,RPC)相互作用网络,近年来研究者除了开发RNA直接结合蛋白(RNA-binding proteins,RBP... RNA-蛋白质复合物调控着生物体内各种生理过程,在RNA从合成到降解的生理活动历程中发挥关键作用.为了更全面解析RNA-蛋白复合物(RNA-protein complexes,RPC)相互作用网络,近年来研究者除了开发RNA直接结合蛋白(RNA-binding proteins,RBP)规模化富集方法,也将目光转向了与RBP存在相互作用的RNA间接结合蛋白(RNA-associated proteins,RAP),二者与RNA共同组成了结构复杂、功能各异的RPC.但以往方法均将RPC中包含的所有蛋白视为整体,统一鉴定,缺乏能够规模化区分RBP和RAP的有效途径.基于此,本文联合使用254 nm紫外交联法和二硫双琥珀酰亚胺丙酸酯(DSP)蛋白交联剂,通过不同反应原理将RBP与RAP分别富集于链霉素磁珠,进而通过分步洗脱方法分别获取纯化的RBP和RAP,并结合质谱分析实现二者的各自独立鉴定.采用该方法在HeLa细胞中共鉴定到2007个高置信RBP,927个高置信RAP,其中有243个RAP为首次鉴定.此方法的建立有助于细化RPC中各组分间的相互作用网络,为后续的生物应用提供方法和数据基础. 展开更多
关键词 rna结合蛋白 蛋白质组学 富集 分离 质谱
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慢性心力衰竭患者血清环状RNA同源域相互作用激酶3和转录因子GATA结合蛋白4与心室重构及心功能的相关性 被引量:3
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作者 解乔木 李影 杨喜山 《中国心血管病研究》 CAS 2023年第11期982-987,共6页
目的探究慢性心力衰竭(CHF)患者血清环状RNA同源域相互作用激酶3(circHIPK3)和转录因子GATA结合蛋白4(GATA4)与心室重构及心功能的相关性。方法选取2021年6月至2023年6月河南科技大学第一附属医院收治的152例慢性心力衰竭(CHF)患者为观... 目的探究慢性心力衰竭(CHF)患者血清环状RNA同源域相互作用激酶3(circHIPK3)和转录因子GATA结合蛋白4(GATA4)与心室重构及心功能的相关性。方法选取2021年6月至2023年6月河南科技大学第一附属医院收治的152例慢性心力衰竭(CHF)患者为观察对象,作为CHF组,选取同期健康体检者110例,作为对照组,参照纽约心脏病协会(NYHA)心功能分级标准将CHF患者分为Ⅰ~Ⅱ级(53例)、Ⅲ级(50例)、Ⅳ级(49例),采用实时荧光定量PCR法检测血清样本中circHIPK3表达水平,酶联免疫吸附法检测血清中GATA4蛋白水平,彩色多普勒超声心动图检测心室重构及心功能指标:左心室质量指数(LVMI)、左心室重构指数(LVRI)、左心室后壁厚度(LVPW)、左室舒张内径(LVEDD)、左心室短轴缩短率(LVFS)、心输出量(CO)、左心室射血分数(LVEF),多因素logistic回归分析CHF患者心功能分级的影响因素,Pearson法分析CHF患者血清circHIPK3、GATA4与LVMI、LVRI、LVPW、LVEDD、LVFS、CO、LVEF的相关性。结果与对照组比较,CHF患者血清中circHIPK3[(1.14±0.25)比(1.89±0.59)]、GATA4[(17.26±2.52)pg/ml比(26.94±4.24)pg/ml]水平显著升高,差异存在统计学意义(t=12.538、21.363;P<0.05),circHIPK3、GATA4水平随心功能分级的增加而升高。circHIPK3、GATA4、LVMI是心功能分级为Ⅲ~Ⅳ级的独立危险因素,CO、LVEF是保护因素(P<0.05)。CHF患者血清中circHIPK3、GATA4水平与LVMI、LVPW、LVEDD呈正相关,与LVRI、LVFS、CO、LVEF呈负相关(P<0.05);CHF患者血清中circHIPK3与GATA4呈正相关(P<0.05)。结论circHIPK3、GATA4在CHF患者血清中呈现高表达,与心室重构、心功能指标存在一定关联性,可能对该病的诊治、预后评估有重要参考价值。 展开更多
关键词 慢性心力衰竭 环状rna同源域相互作用蛋白激酶3 转录因子GATA结合蛋白4 心室重构 心功能
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基于生物信息学研究EIF3D在肝癌中对靶标RNA非修饰区的结合调控作用机制
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作者 刘子瑶 刘思远 +4 位作者 陈衣强 戴知言 李晶晶 沈洁 谢正尧 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2024年第8期779-785,共7页
目的基于生物信息学方法在公共数据库中探索真核翻译起始因子3亚基D(EIF3D)基因在肝癌中的靶标结合模式和转录水平的调控机制。方法通过肿瘤公共数据库获取EIF3D在肝癌组织中的表达情况和生存差异。利用公共数据库对EIF3D在肝癌HepG2细... 目的基于生物信息学方法在公共数据库中探索真核翻译起始因子3亚基D(EIF3D)基因在肝癌中的靶标结合模式和转录水平的调控机制。方法通过肿瘤公共数据库获取EIF3D在肝癌组织中的表达情况和生存差异。利用公共数据库对EIF3D在肝癌HepG2细胞株的联合增强紫外交联免疫共沉淀(eCLIP)数据进行分析,获取靶标结合位点,HOMER注释并统计学筛选后得到靶标结合区域占比和靶基因集,对该基因集进行基因本体论/京都基因和基因组百科全书(GO/KEGG)分析和PPI分析。对EIF3D敲降后的RNA-seq数据进行差异分析获取差异基因集,对该基因集进行GO/KEGG分析和PPI分析及下游个性化数据库分析。结果公共数据库数据显示,肝癌组织中EIF3D的表达水平显著升高(P<0.001),EIF3D高表达人群的生存率显著低于低表达人群(P<0.001)。EIF3D在正常肝组织的胆管细胞中未见表达,在肝细胞中弱表达;EIF3D在肝癌细胞的细胞质和胞膜上中度表达。在肝癌HepG2细胞株中,EIF3D倾向于结合在靶标的外显子区域,通过调控RNA靶标参与细胞分化、周期进程和mRNA代谢等过程。EIF3D敲降后表达下调的靶基因集参与有丝分裂、细胞周期和DNA修复等过程,该基因集中存在一个互作网络:ATAD2-TOP2A-TPX2-KNTC1-FANCA,其在肝癌中显著上调并对预后造成不良影响。结论EIF3D可能通过结合靶标基因网络的RNA非修饰区在转录水平进行调控,从而促进肝癌进展。 展开更多
关键词 肝癌 真核翻译起始因子3亚基D 生物信息学 rna结合蛋白
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肿瘤中环状RNA泛素结合相关蛋白2的表达及调控作用研究进展 被引量:1
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作者 王海存 高欣 +1 位作者 刘广麟 姜兴明 《中国医药》 2023年第3期467-471,共5页
泛素结合相关蛋白2(UBAP2)是一种新发现的环状RNA,其在诸多人类肿瘤中异常表达并能参与调控肿瘤恶性生物学行为进程如肿瘤细胞的增殖、侵袭转移、抗凋亡和上皮间质转化等。环状RNA UBAP2(circ-UBAP2)的异常表达也与肿瘤的淋巴结转移、TN... 泛素结合相关蛋白2(UBAP2)是一种新发现的环状RNA,其在诸多人类肿瘤中异常表达并能参与调控肿瘤恶性生物学行为进程如肿瘤细胞的增殖、侵袭转移、抗凋亡和上皮间质转化等。环状RNA UBAP2(circ-UBAP2)的异常表达也与肿瘤的淋巴结转移、TNM分期、微血管浸润等病理特征有关;并且circ-UBAP2与环状RNA临床应用的研究热点如调控肿瘤细胞自噬、诱导细胞放疗和化疗耐受等也紧密相关。本文就circ-UBAP2在肿瘤中的表达、生物学作用及调控机制进行综述。 展开更多
关键词 肿瘤 环状rna 泛素结合相关蛋白2 表达 调控作用
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冷诱导RNA结合蛋白在大鼠低体温性急性肺损伤中的表达变化
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作者 徐耀迪 王佳新 +6 位作者 陈旭昕 张春阳 王凡 丁毅伟 彭聪 肖漓 韩志海 《解放军医学院学报》 CAS 北大核心 2023年第4期380-387,共8页
背景海上遇难者落水后常死于海水长时间浸泡后的低体温及相关并发症,肺是低体温损伤的重要器官之一,但目前针对低体温造成急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的研究相对匮乏。目的探讨冷诱导RNA结合蛋白(coldinducible RNA-binding prot... 背景海上遇难者落水后常死于海水长时间浸泡后的低体温及相关并发症,肺是低体温损伤的重要器官之一,但目前针对低体温造成急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的研究相对匮乏。目的探讨冷诱导RNA结合蛋白(coldinducible RNA-binding protein,CIRP)在低体温性ALI大鼠模型中的变化及其可能的作用机制。方法将40只雄性成年SD大鼠随机分为0 h组(0 h,8只)和实验组(32只)。实验组分别用低温海水浸泡12 h、16 h、20 h、24 h(每组8只),构建低体温性ALI动物模型。ELISA检测白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、IL-1β、细胞外CIRP的含量,对肺组织进行HE染色、TUNEL染色和CIRP免疫组织化学染色,qRT-PCR检测CIRP mRNA的表达。结果与0 h组相比,实验组出现不同程度肺损伤,病理切片可见肺泡壁增厚或结构破坏,肺泡腔内出血,伴中性粒细胞和淋巴细胞浸润等;16 h、20 h、24 h实验组血清中IL-6的表达显著增加,20 h、24 h实验组血清中IL-1β表达显著增加,差异均有统计学意义(P<0.01);各实验组大鼠血清中CIRP表达增加均有统计学差异(12 h、16 h、20 h组,P<0.05;24 h组,P<0.01)。TUNEL结果显示,各实验组的大鼠肺组织出现不同程度的细胞凋亡现象(P<0.01);通过炎症因子的表达水平、肺组织病理改变以及细胞凋亡情况选择低温海水浸泡24 h为最佳构建模型时间,免疫组织化学染色和qRT-PCR观察到24 h组肺组织内CIRP的表达增加。结论肺组织和外周血清的CIRP在低体温性ALI大鼠模型中随时间延长而表达增高,提示其可能与低体温致ALI相关,同时与炎症因子IL-1β、IL-6水平呈现一致性趋势变化,因此推测CIRP可能通过促进炎症因子释放发挥作用,本研究初步证实了CIRP在肺组织区域和整体与低体温ALI的相关性。 展开更多
关键词 低体温 肺损伤 大鼠 冷诱导rna结合蛋白 炎症因子
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