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荧光定量聚合酶链反应法比较标准管家基因3-磷酸甘油醛脱氢酶、β-肌动蛋白、酸性核糖体磷蛋白P0及18S核糖体RNA在老年大鼠不同组织中的表达 被引量:14
1
作者 叶文静 侯配强 +2 位作者 赵晓民 蔡洪信 夏作理 《中国组织工程研究与临床康复》 CAS CSCD 北大核心 2008年第18期3515-3518,共4页
背景:反转录聚合酶链反应用于基因表达分析越来越显示出其重要性,其中合适的内参基因选择很重要,目前并没有适合于所有体系可作为内参的管家基因。大鼠是常用动物模型,选择合适的大鼠管家基因作为内参尤其必要。目的:比较分析使用最广泛... 背景:反转录聚合酶链反应用于基因表达分析越来越显示出其重要性,其中合适的内参基因选择很重要,目前并没有适合于所有体系可作为内参的管家基因。大鼠是常用动物模型,选择合适的大鼠管家基因作为内参尤其必要。目的:比较分析使用最广泛的4个标准管家基因3-磷酸甘油醛脱氢酶、β-肌动蛋白、酸性核糖体磷蛋白P0及18S核糖体RNA在老年大鼠肝、肾、心、肺组织和大脑皮质中的表达情况。设计、时间及地点:观察对比实验,于2007-07/08在泰山医学院生命科学研究所分子生物学实验室及泰安市疾控中心病毒检测中心实验室完成。材料:选用老年SD大鼠3只,用于检测管家基因表达情况。方法:采用反转录实时荧光聚合酶链反应技术检测老年大鼠肝、肾、心、肺组织和大脑皮质中有着不同表达丰度和功能的4个管家基因3-磷酸甘油醛脱氢酶、β-肌动蛋白、酸性核糖体磷蛋白P0及18S核糖体RNA的表达情况。主要观察指标:老年大鼠不同组织内4个管家基因的表达水平及不同组织间的表达差异。结果:①酸性核糖体磷蛋白P0在老年大鼠不同组织间表达差异最小。②老年大鼠肾组织中表达最稳定的管家基因是β-肌动蛋白;心脏组织和肺组织中表达最稳定的管家基因是3-磷酸甘油醛脱氢酶。结论:老年大鼠组织间信使RNA分析仅用1个内参基因是不合适的,至少应该使用两个参照基因,1个选用18S核糖体RNA;另一个基因的选择标准如下:适用于分析不同组织间基因表达情况的内参基因是酸性核糖体磷蛋白P0,而心脏和肺组织研究适用3-磷酸甘油醛脱氢酶,肾组织研究适用β-肌动蛋白。 展开更多
关键词 管家基因 内参基因 rna 信使 逆转录聚合链反应
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载体介导的人支气管上皮细胞DNA聚合酶β基因的靶向RNA干扰 被引量:3
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作者 胡大林 庄志雄 +6 位作者 刘移民 何云 纪卫东 方道奎 沙焱 涂晓志 杨建平 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期143-145,共3页
目的运用载体介导的RNA干扰技术靶向抑制人DNA聚合酶β基因在支气管上皮细胞中的表达,为研究DNA聚合酶β在环境化学污染物所致DNA损伤修复中的功能和机制作准备。方法利用分子克隆技术构建含pU6启动子的人DNA聚合酶β基因RNA干扰特异性... 目的运用载体介导的RNA干扰技术靶向抑制人DNA聚合酶β基因在支气管上皮细胞中的表达,为研究DNA聚合酶β在环境化学污染物所致DNA损伤修复中的功能和机制作准备。方法利用分子克隆技术构建含pU6启动子的人DNA聚合酶β基因RNA干扰特异性绿色荧光蛋白C1载体重组子“pEGFP-C1-U6-dsRNA”;以脂质体法将载体重组子转染人支气管上皮细胞,同时以空白细胞和空载体转染细胞作对照;在经G418筛选后,以荧光显微成像技术观察细胞的转染效果,以蛋白印迹法分析转染后细胞中的DNA聚合酶β表达情况。结果在转染重组子的细胞中,DNA聚合酶β的表达明显下调,仅相当于正常细胞的17·3%。结论人支气管上皮细胞DNA聚合酶β基因的靶向抑制成功。 展开更多
关键词 重组载体 rna干扰 DNA聚合β基因
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猪囊尾蚴RNA聚合酶亚基基因的筛选及结构初探 被引量:2
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作者 骆学农 郑亚东 +3 位作者 窦永喜 侯俊琳 景志忠 才学鹏 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期160-163,共4页
的 从构建的剪切引导序列 (SL)cDNA文库中筛选猪囊尾蚴相关基因。 方法 提取猪囊尾蚴总RNA ,利用SL特异序列和带有噬菌体M13M4的olig(dT)为引物 ,反转录成cDNA ,构建猪囊尾蚴SLcDNA文库。随机筛选并通过酶切、PCR鉴定阳性克隆 ,分析... 的 从构建的剪切引导序列 (SL)cDNA文库中筛选猪囊尾蚴相关基因。 方法 提取猪囊尾蚴总RNA ,利用SL特异序列和带有噬菌体M13M4的olig(dT)为引物 ,反转录成cDNA ,构建猪囊尾蚴SLcDNA文库。随机筛选并通过酶切、PCR鉴定阳性克隆 ,分析其同源性。 结果 鉴定出一 3 3 2bp的插入片段 ,含有 2 0 4bp的开放阅读框(ORF)和 3′端 2 0bp的polyA尾巴 ,经核苷酸和氨基酸序列分析 ,所克隆的基因的氨基酸序列与其他真核生物如人、秀丽隐杆线虫、果蝇及拟南芥等的RNA聚合酶亚基基因同源性均高达 71.6%以上。 结论 筛选鉴定的基因推测为猪囊尾蚴RNA聚合酶亚基基因 ,而且在不同物种间很保守。 展开更多
关键词 囊尾蚴 rna聚合 亚基基因 噬菌体 基因文库
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人DNA聚合酶β基因靶向RNA干扰重组子克隆及序列分析 被引量:2
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作者 胡大林 庄志雄 +8 位作者 何云 纪卫东 唐冬生 袁建辉 方道奎 沙焱 杨建平 涂晓志 胡恭华 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期4-7,共4页
目的克隆用于人DNA聚合酶β(DNApolymerasebeta,Polβ)基因靶向RNA干扰的双链RNA(doublestrandRNA,dsRNA)寡核苷酸绿色荧光蛋白C1载体重组子“pEGFPC1pU6dsRNA”,为进一步研究人Polβ基因在环境化学污染物所致的DNA损伤修复中的作用机... 目的克隆用于人DNA聚合酶β(DNApolymerasebeta,Polβ)基因靶向RNA干扰的双链RNA(doublestrandRNA,dsRNA)寡核苷酸绿色荧光蛋白C1载体重组子“pEGFPC1pU6dsRNA”,为进一步研究人Polβ基因在环境化学污染物所致的DNA损伤修复中的作用机制作准备。方法依据Genbank中人polβ基因的cDNA序列,运用dsRNAoligonucleotidedesigner设计出用于RNA干扰用的dsRNA寡核苷酸序列,并以化学方法合成之。通过重组DNA技术将合成好的dsRNA克隆到含人pU6启动子的pSIRENRetroQ逆转录病毒载体上,以此重组子转化感受态E.coliDH5α,经氨卞青霉素筛选后进行扩增,并抽提质粒。运用EcoRⅠ和BglⅡ消化并回收“pU6dsRNA”目的片段,再将“pU6dsRNA”亚克隆到pEGFPC1上,获“pEGFPC1pU6dsRNA”重组子,并进行酶切鉴定和序列分析。结果经酶切鉴定发现,“pEGFPC1pU6dsRNA”载体重组子处于预期条带位置,序列分析显示与所设计的目的片段序列完全相符。结论作者克隆了用于人Polβ基因靶向RNA干扰的dsRNA绿色荧光蛋白C1载体重组子“pEGFPC1pU6dsRNA”,为进一步研究Polβ基因功能作好了准备。 展开更多
关键词 DNA聚合Β rna干扰 DSrna 重组子 基因克隆
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一种简单有效的T7 RNA聚合酶调控的植物基因表达系统 被引量:5
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作者 路子显 魏晓丽 +2 位作者 伍晓丽 常团结 朱祯 《自然科学进展》 北大核心 2002年第7期702-707,共6页
T7 RNA聚合酶在原核系统的基因表达与调控中起重要作用。将T7 RNA聚合酶基因的5’端与来自SV40大T抗原基因的核定位信号编码序列融合在一起,利用rolC启动子控制修饰的T7 RNA聚合酶基因,与Φ10启动子控制的β-葡萄糖醛酸酶基因串联在一起... T7 RNA聚合酶在原核系统的基因表达与调控中起重要作用。将T7 RNA聚合酶基因的5’端与来自SV40大T抗原基因的核定位信号编码序列融合在一起,利用rolC启动子控制修饰的T7 RNA聚合酶基因,与Φ10启动子控制的β-葡萄糖醛酸酶基因串联在一起,构建了植物表达载体,通过基因枪介导法转化了烟草叶片。结果表明,这一表达系统能够增加β-葡萄糖醛酸酶基因的瞬时表达,这为提高外源基因在转基因植物中的高效表达提供了新的工具。 展开更多
关键词 植物基因表达系统 T7 rna聚合基因 φ10启动子 β-葡萄糖醛酸基因 串联表达载体 基因调控
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草鱼呼肠孤病毒RNA聚合酶基因功能区在原核细胞中的表达 被引量:6
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作者 方勤 朱作言 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期86-88,共3页
An about 1.5kb functional domain sequence of GCRV-RdRp gene was obtained by using RT-PCR amplification.The amplified fragment was cloned into T7 promoted prokaryotic expression system pRSET-C vector and then was trans... An about 1.5kb functional domain sequence of GCRV-RdRp gene was obtained by using RT-PCR amplification.The amplified fragment was cloned into T7 promoted prokaryotic expression system pRSET-C vector and then was transformed into CaCl 2 treated TOP10F’and BL21(DE3)pLysS competent cells respectively.The recombinants were detected with restriction enzyme digestion and further confirmed the interest insert by sequencing pRSET-C/GCRV-RdRp plasmid,which was in frame with the N-terminal tag and in the proper orientation.SDS-PAGE revealed that the highly expressed fusion protein is produced by inducing with l nm IPTG,and its molecular weight is around 55kD,which is the right size corresponding to the predicted value.It indicated the fused protein was produced in the form of inclusion body with its yield remained steadly more than 60% of total bacterial protein. It also showed that the expressed protein was able to bind immunologically to rabbit anti-GCRV-VP2 serum. 展开更多
关键词 草鱼 呼肠孤病毒 rna聚合 基因表达 原核细胞
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口蹄疫病毒RNA聚合酶3D基因在毕赤酵母中的表达 被引量:4
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作者 张腾国 刘在新 谢庆阁 《中国兽医科技》 CSCD 北大核心 2004年第1期8-11,共4页
以口蹄疫病毒 (Foot and mouthdiseasevirus ,FMDV)RNA聚合酶基因 3D为研究对象 ,对其部分碱基进行定点诱变 ,替换成在毕赤酵母 (Pichiapastoris)中使用频率较高的密码子以优化其表达。改造后的目的片段用NotⅠ和AvrⅡ内切酶双酶切 ,然... 以口蹄疫病毒 (Foot and mouthdiseasevirus ,FMDV)RNA聚合酶基因 3D为研究对象 ,对其部分碱基进行定点诱变 ,替换成在毕赤酵母 (Pichiapastoris)中使用频率较高的密码子以优化其表达。改造后的目的片段用NotⅠ和AvrⅡ内切酶双酶切 ,然后与相应内切酶双酶切的穿梭载体pPIC9K相连接 ,构建重组表达载体 pPIC9K/ 3D ,转化大肠埃希氏菌JM 10 9,筛选阳性克隆pPIC9K/ 3D。经测序表明 ,插入位置、突变碱基、片段大小和读码框均正确。重组质粒用SacⅠ内切酶线化 ,电转化毕赤酵母SMD116 8,采用G4 18抗性梯度法筛选 ,获得高拷贝整合重组菌株SMD116 8/ pPIC9K/ 3DHIS+MUT+,利用甲醇进行诱导分泌表达 ,经SDS PAGE和Westernblot ting鉴定 ,3D基因在毕赤酵母中表达成功 ,目的蛋白分子质量大小为 5 2ku ,与预期的大小吻合 ,并能够被FMDV阳性血清所识别 ,表达量占总分泌蛋白量的 36 %。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 rna聚合 3D基因 毕赤酵母 表达 碱基 诱变 重组表达载体 甲醇 蛋白 基因克隆
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赭纤虫RNA聚合酶Ⅰ基因片段的分析 被引量:2
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作者 梁爱华 王伟 K.Heckmann 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 1999年第4期435-439,共5页
赭纤虫被认为是一类进化过程中较为原始的纤毛虫。本研究以储纤虫基因组DNA为模板,利用锚定PCR技术,扩增出RNA聚合酶I第二大亚基基因片段,并对扩增出的基因片段进行了克隆和序列分析。结果表明:由该基因片段导出的氨基酸序列中共有1... 赭纤虫被认为是一类进化过程中较为原始的纤毛虫。本研究以储纤虫基因组DNA为模板,利用锚定PCR技术,扩增出RNA聚合酶I第二大亚基基因片段,并对扩增出的基因片段进行了克隆和序列分析。结果表明:由该基因片段导出的氨基酸序列中共有10个半胱氨酸,均由通用密码子UGU、UGC编码,开放读框中不存在由UGA转译为半眈氨酸这一非通用密码的现象。 展开更多
关键词 纤毛虫 赭纤虫 PCR rna聚合基因 遗传密码
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RNA斑点印迹法检测人食管癌DNA聚合酶β的基因表达 被引量:2
9
作者 金戈 张婷 +3 位作者 赵勤 赵继敏 吴景兰 董子明 《河南医学研究》 CAS 2003年第4期304-306,共3页
目的 :探讨人食管癌组织DNA聚合酶 β(polβ)RNA水平的表达。 方法 :提取 5 1例食管癌患者的手术标本组织 ,包括 :17例癌灶组织 ,17例癌旁组织 ,17例“正常”组织细胞总RNA ,以生物素标记的polβcDNA探针进行RNA斑点印迹。结果 :DNApol... 目的 :探讨人食管癌组织DNA聚合酶 β(polβ)RNA水平的表达。 方法 :提取 5 1例食管癌患者的手术标本组织 ,包括 :17例癌灶组织 ,17例癌旁组织 ,17例“正常”组织细胞总RNA ,以生物素标记的polβcDNA探针进行RNA斑点印迹。结果 :DNApolβRNA水平的表达癌组织高于癌旁组织 (P <0 .0 5 ) ,癌旁组织高于“正常”组织 (P <0 .0 5 ) ,癌组织高于“正常”组织 (P <0 .0 1)。结论 :人食管癌组织及癌旁组织的DNApolβ基因RNA水平表达显著高于“正常”组织 ,提示DNApolβ的过表达可能在食管癌的发生、发展中起 作用。 展开更多
关键词 rna斑点印迹法 食管癌 DNA聚合Β 基因表达 肿瘤发生
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草鱼呼肠孤病毒RNA聚合酶基因的表达与产物纯化 被引量:1
10
作者 方勤 丁清泉 +1 位作者 汪亚平 朱作言 《中国病毒学》 CSCD 2003年第2期169-173,共5页
草鱼呼肠孤病毒是引起草鱼出血病的主要病原,隶属于呼肠孤病毒科水生呼肠孤病毒属。序列分析表明,GCRV S2 片段长为3 877核苷酸,编码一个分子量为138kDa 的蛋白VP2,具有RNA聚合酶性质。为进一步了解该病毒 RNA聚合酶特性,本研究在对GCRV... 草鱼呼肠孤病毒是引起草鱼出血病的主要病原,隶属于呼肠孤病毒科水生呼肠孤病毒属。序列分析表明,GCRV S2 片段长为3 877核苷酸,编码一个分子量为138kDa 的蛋白VP2,具有RNA聚合酶性质。为进一步了解该病毒 RNA聚合酶特性,本研究在对GCRV RNA聚合酶基因(GCRV-RdRp)保守区(约1.5kb)重组质粒pR/RRp高效表达的基础上,分别构建了编码GCRV RNA聚合酶保守区N端与C端部分基因的 pR/RRpN及pR/RRpC重组表达载体,并在原核细胞中获得成功表达。筛选的重组表达菌株经IPTG诱导培养,得到分子量分别为98kDa、103kDa的目的表达融合蛋白。Western blot分析表明,该表达产物与兔抗GCRV-VP2血清呈阳性反应。通过ProBond柱亲和层析,纯化了融合有6个组氨酸的重组表达产物,并获得约90%纯的目的蛋白。上述结果为GCRV RNA聚合酶特性分析提供了依据。 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒 草鱼 出血病 rna聚合 基因表达 纯化
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Ⅰ型鸭肝炎病毒RNA聚合酶基因的克隆及原核表达
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作者 王超 付玉志 +5 位作者 张伟伟 陈宗艳 李传峰 杨宗伟 吴润 刘光清 《中国动物传染病学报》 CAS 2011年第2期20-25,共6页
根据Ⅰ型鸭肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV-Ⅰ)ZJ-Ⅴ株基因组序列(GenBank登录号:EF382778),设计了一对扩增RNA聚合酶基因(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)的特异性引物,以ZJ-Ⅴ株基因组为模板,扩增DHV-Ⅰ的RdRp基因。运... 根据Ⅰ型鸭肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV-Ⅰ)ZJ-Ⅴ株基因组序列(GenBank登录号:EF382778),设计了一对扩增RNA聚合酶基因(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)的特异性引物,以ZJ-Ⅴ株基因组为模板,扩增DHV-Ⅰ的RdRp基因。运用DNAStar软件对ZJ-Ⅴ株病毒与GenBank上已发表的其他不同DHV毒株的RdRp基因序列进行同源性比较和遗传进化分析,结果表明,ZJ-Ⅴ株与A型DHV-ⅠR85952株(DQ226541)的同源性为97.1%,亲缘关系最近,与2株台湾新型(B型)DHV之间为76.9%和77.0%,与C-GY株和4株韩国新型(C型)DHV株之间为76.2%~76.5%,亲缘关系较远。将RdRp基因克隆至原核表达载体pET-32a(+),获得重组表达质粒pET-RdRp,转化宿主菌E.coli BL21(DE3),用IPTG进行诱导表达。SDS-PAGE分析结果显示RdRp蛋白分子量约为65 kDa,Western blot检测证明RdRp蛋白能与Ⅰ型鸭病毒性肝炎阳性血清产生特异性免疫反应,具有良好的免疫学活性。本文为进一步研究DHV-Ⅰ的复制机理奠定了基础。 展开更多
关键词 Ⅰ型鸭肝炎病毒(DHV-Ⅰ) rna聚合基因(rdrp) 原核表达 序列分析
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水稻叶绿体RNA聚合酶α亚基基因的克隆及结构分析 被引量:1
12
作者 孙崇荣 杉浦昌弘 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1989年第10期763-769,共7页
Southern 印迹杂交结果表明,水稻叶绿体基因组也能编码自身的 RNA 聚合酶。该酶的α基基因片段已经被克隆于大肠杆菌质粒 pUC 19中。应用逐次丢失法和双脱氧方法测定了它的核苷酸排列顺序。该基因由337个密码子组成。在单子叶的水稻和... Southern 印迹杂交结果表明,水稻叶绿体基因组也能编码自身的 RNA 聚合酶。该酶的α基基因片段已经被克隆于大肠杆菌质粒 pUC 19中。应用逐次丢失法和双脱氧方法测定了它的核苷酸排列顺序。该基因由337个密码子组成。在单子叶的水稻和双子叶的烟草之间该基因有很高的同源性。 展开更多
关键词 水稻 叶绿体 rna聚合 基因
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siRNA干扰HSV-1 UL30 DNA聚合酶基因的研究
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作者 张春龙 何秋璟 +5 位作者 仁哲 朱钦昌 张美英 刘秋英 张佩琢 王一飞 《生物技术》 CAS CSCD 2008年第5期11-16,共6页
目的:筛选高效沉默HSV-1UL30基因的siRNA,研究siRNA沉默UL30基因后对HSV-1繁殖的影响。方法:设计并化学合成12对靶向UL30基因的siRNA,与pEGFP-N1-Fi融合表达质粒共转染VERO细胞,流式细胞术筛选高效抑制Fi-EGFP融合蛋白的siRNA,实时荧光... 目的:筛选高效沉默HSV-1UL30基因的siRNA,研究siRNA沉默UL30基因后对HSV-1繁殖的影响。方法:设计并化学合成12对靶向UL30基因的siRNA,与pEGFP-N1-Fi融合表达质粒共转染VERO细胞,流式细胞术筛选高效抑制Fi-EGFP融合蛋白的siRNA,实时荧光定量PCR检测siRNA对感染细胞内UL30mRNA表达的抑制效果,CPE法和空斑减数实验评价siRNA对HSV-1繁殖的抑制效果。结果:共转染实验筛选出高效抑制Fi-EGFP融合蛋白的siRNA4、siRNA10及siRNA8,这3对siRNA均能显著降低感染细胞内UL30mRNA的表达水平及病变细胞释放到培养上清的子代病毒滴度,siRNA4和siRNA10在感染后36h对HSV-1的繁殖有明显的抑制效果,其病斑分别比对照组减少61.17%、51.46%(P<0.05),siRNA4、siRNA10及siRNA8组最终形成的空斑直径分别比对照组减小29.94%、23.49%、21.69%(P<0.01)。结论:筛选到高效抑制UL30的3对siRNAs,siRNA4及siRNA10在病斑形成早期对HSV-1的繁殖有明显的抑制效果,说明siRNA4、siRNA10及siRNA8均能延缓病斑的扩大和病斑数目的增长,对病毒的繁殖有一定的抑制效果。 展开更多
关键词 SIrna rna干扰 UL30基因/DNA聚合/HSV-1
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用逆转录-聚合酶链反应检测海南岛登革热流行区蝙蝠体内登革病毒基因RNA的研究
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作者 张浩燕 杨新科 +2 位作者 李柱英 王凤莲 佟玉品 《友谊医学》 1999年第1期61-64,共4页
采用1-4型登革病毒通用引物,用逆转录一聚合酶链反应(RT-PCR)检测海南岛登革热流行区蝙蝠脑细胞登革病毒基因RNA。在35例中,20例阳性;检测18例蝙蝠血清,3例阳性;检测三组埃及伊蛟,1组阳性。用单克隆荧光抗体技术检测20例登革病... 采用1-4型登革病毒通用引物,用逆转录一聚合酶链反应(RT-PCR)检测海南岛登革热流行区蝙蝠脑细胞登革病毒基因RNA。在35例中,20例阳性;检测18例蝙蝠血清,3例阳性;检测三组埃及伊蛟,1组阳性。用单克隆荧光抗体技术检测20例登革病毒基因RNA阳性的蝙蝠脑细胞压印片,16例阳性,与RT-PCR检测登革热流行区登革病毒基因RNA阳性蝙蝠脑细胞的阳性符合率为80.00%。用PT-PCR检测非流行区蝙蝠脑细胞登革病毒基因RNA,均为阴性。本研究首次证实蝙蝠是登革病毒的贮存宿主,为登革热流行的有效控制提供了一定的科学依据。 展开更多
关键词 逆转录-聚合链反应 海南岛 登革热 蝙蝠 登革病毒 病毒基因rna
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RNA依赖的RNA聚合酶(RdRP)与非编码RNA(ncRNA)调控的研究进展 被引量:6
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作者 丁超 张兰 +1 位作者 曹洁 于文强 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期256-261,共6页
RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRP)是一类以单链RNA为模板合成互补RNA链的聚合酶。根据其来源可分为病毒RdRP和细胞RdRP,病毒RdRP对病毒基因组复制及病毒引起的宿主免疫反应有重要作用,宿主细胞RdRP主要参与RNA干... RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRP)是一类以单链RNA为模板合成互补RNA链的聚合酶。根据其来源可分为病毒RdRP和细胞RdRP,病毒RdRP对病毒基因组复制及病毒引起的宿主免疫反应有重要作用,宿主细胞RdRP主要参与RNA干扰(RNA interference,RNAi)现象。越来越多研究证明RdRP的功能与非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)密不可分,本文对病毒RdRP、细胞RdRP与ncRNA调控之间的关系作了较详细的阐述,同时对丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)诱发的肝癌机制提出新的观点。 展开更多
关键词 rna依赖的rna聚合(rdrp) 非编码rna(ncrna) rna干扰(rnaI) 丙型肝炎病毒(HCV)
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家蚕质型多角体病毒RNA聚合酶的基因克隆及鉴定 被引量:2
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作者 孙京君 戴伟君 +4 位作者 谭佩婵 谭玉蓉 张勤奋 张景强 徐兴耀 《蚕业科学》 CAS CSCD 2004年第4期451-451,共1页
关键词 质型多角体病毒 家蚕 CPV 呼肠孤病毒科 基因克隆 rna聚合 鉴定 电镜 研究结果
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RNA依赖性RNA聚合酶作为抗戊型肝炎病毒药物作用靶点的研究进展
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作者 何振文 刘丁语 +7 位作者 刘宝玲 张翩 王晓虎 王刚 黄元 陈晶 刘文俊 蔡汝健 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期4568-4577,共10页
戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)是造成急性肝炎最常见的原因之一。HEV基因组由5′非编码区、3个开放阅读框(ORF1、ORF2、ORF3)和3′非编码区组成,仅在HEV-1中发现了ORF4,并与ORF1重叠。各种编码蛋白在HEV的复制和感染中发挥着不... 戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)是造成急性肝炎最常见的原因之一。HEV基因组由5′非编码区、3个开放阅读框(ORF1、ORF2、ORF3)和3′非编码区组成,仅在HEV-1中发现了ORF4,并与ORF1重叠。各种编码蛋白在HEV的复制和感染中发挥着不同的作用,而HEV的复制是由ORF1编码的RNA依赖性RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)所介导的。HEV RdRp是由多个蛋白亚基组成的复合酶,具有7个保守基序,这些保守基序在RNA合成过程中发挥核苷酸识别、合成、延伸、修饰和稳定等作用,保证了RdRp的功能,在HEV的复制和转录中起到关键作用。因此,以RdRp作为抗HEV药物作用靶点的治疗方案具有很好的应用前景,是目前药物开发的一种主流思路。目前,已发现利巴韦林、索非布韦、2′-C-甲基胞苷(2CMC)等核苷类RdRp抑制剂和锌、GPC-N114等非核苷类RdRp抑制剂对HEV有较强的抑制作用,可作为潜在的抗HEV药物进行深入研究。笔者对HEV编码蛋白和HEV RdRp的结构与功能进行阐述,总结目前发现的对HEV有抑制作用的RdRp抑制剂,以期为HEV的药物开发提供一种新的思路。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒(HEV) rna依赖性rna聚合(rdrp) 药物开发
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黄曲霉基因敲除体系的构建及其RNA依赖的RNA聚合酶1基因在生长发育中的作用 被引量:1
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作者 刘翔 杨碧 +4 位作者 田询 周建鸿 禹文峰 齐晓岚 江银辉 《贵州医科大学学报》 CAS 2023年第11期1282-1291,共10页
目的探讨黄曲霉(A.flavus)基因敲除体系的构建和RNA依赖的RNA聚合酶1(RDRP1)基因在A.flavus生长发育中的作用。方法通过National Center for Biotechnology Information网址查找RDRP1基因,设计上下游序列引物,引入融合片段20 bp,采用重... 目的探讨黄曲霉(A.flavus)基因敲除体系的构建和RNA依赖的RNA聚合酶1(RDRP1)基因在A.flavus生长发育中的作用。方法通过National Center for Biotechnology Information网址查找RDRP1基因,设计上下游序列引物,引入融合片段20 bp,采用重叠PCR(overlap PCR)法融合RDRP1基因上下游片段和嘧啶磺胺抗性基因(ptrA);采用聚乙二醇(PEG)介导方法将该融合片段导入A.flavus的原生质体中获得RDRP1阳性转化子(ptrA抗性),采用Sourthern blot鉴定筛选RDRP1基因突变菌株;对RDRP1基因突变菌株,采用十字交叉法测定生长速率、血细胞计数板统计产孢量,手动计数Wickerham Medium(WKM)+尿嘧啶尿苷(UU)培养基上产生的菌核数量。结果获得ptrA抗性转化子13个;Sourthern blot鉴定4个为RDRP1基因缺失菌株,效率30.8%;与CA14相比,RDRP1基因突变菌株在表型、生长率、产孢量及菌核发育上差异无统计学意义(P>0.05)。结论overlap PCR结合PEG介导转化的方式可短时间内获得A.flavus基因敲除突变菌株,RDRP1基因不参与A.flavus表型、生长率、产孢量及菌核发育的调控作用。 展开更多
关键词 基因敲除技术 原生质体 黄曲霉 重叠延伸聚合链式反应 聚乙二醇 rna依赖的rna聚合1
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利用脊髓灰质炎病毒5'NCR和RNA聚合酶基因可提高外源基因表达
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作者 谭明岐 纪志武 +2 位作者 张帆 李殿俊 阮力 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期7-11,共5页
将含脊髓灰质炎病毒 (PV)RNA聚合酶的不同长度基因片段克隆到载体 pSG5质粒上 ,分别构建了 4个表达RNA聚合酶的质粒。体外转录实验证明 ,pSG5 POL1 99和 pSG5 POL2 0 3质粒转染细胞的提取物促进了特异的RNA转录 ,表明两质粒可表达RNA... 将含脊髓灰质炎病毒 (PV)RNA聚合酶的不同长度基因片段克隆到载体 pSG5质粒上 ,分别构建了 4个表达RNA聚合酶的质粒。体外转录实验证明 ,pSG5 POL1 99和 pSG5 POL2 0 3质粒转染细胞的提取物促进了特异的RNA转录 ,表明两质粒可表达RNA聚合酶。将PV的 5'NCR序列插在载体 pGREENLANTERN 1的CMV启动子下游 ,构建了 pGREENLANTERN 1 5'NCR质粒 ;用 LacZ基因替换GFP基因分别插入到PGREENLANTERN 1和pGREENLANTERN 1 5'NCR质粒上 ,构建成 pLacZLANTERN 1和 pLacZLANTERN 1 5'NCR质粒。表达RNA聚合酶的质粒与 pLacZ 5'NCR调控表达报告基因的质粒共转染 ,明显提高了报告基因的表达水平 ,表明PV的表达调控元件和RNA聚合酶基因可用于构建外源基因高效表达载体。 展开更多
关键词 基因疫苗 脊髓灰质炎病毒 rna聚合 5'NCR LACZ
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沉默羊传染性脓疱皮炎病毒DNA聚合酶基因的RNAi载体的构建
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作者 李姗姗 潘求真 +1 位作者 崔玉东 连正兴 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第10期14-17,163,共5页
为了构建用于沉默羊传染性脓疱皮炎病毒(Orf virus,ORFV)DNA聚合酶基因的2种载体,试验选择病毒复制所必需的DNA聚合酶基因作为干扰靶基因,并设计靶基因的扩增引物,经PCR扩增后测序;随后,与Check2载体分别经PmeⅠ和NotⅠ双酶切,酶切后连... 为了构建用于沉默羊传染性脓疱皮炎病毒(Orf virus,ORFV)DNA聚合酶基因的2种载体,试验选择病毒复制所必需的DNA聚合酶基因作为干扰靶基因,并设计靶基因的扩增引物,经PCR扩增后测序;随后,与Check2载体分别经PmeⅠ和NotⅠ双酶切,酶切后连接产生Check2-靶基因(Check2-D)重组质粒;然后,利用公用网站按照RNAi序列设计的原则,设计RNAi靶点序列并合成靶序列的Oligo DNA,退火形成双链DNA,与经XhoⅠ和HpaⅠ酶切后的pll3.7载体连接产生pll3.7-shRNA质粒;最后,利用磷酸钙法进行pll3.7-shRNA质粒和Check2-D质粒共转染293T细胞,利用双荧光检测系统试剂盒检测其RNA干扰效果。结果表明:成功构建了pll3.7-shRNA质粒和Check2-靶基因重组质粒,干扰效果最好,可达到91.0%。 展开更多
关键词 DNA聚合基因 rna干扰 pll3 7载体 Check2载体
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