LncRNA靶向miRNA调控子宫内膜癌发生发展的研究进展

长链非编码RNA(LncRNA)在多种肿瘤进展中扮演重要角色,MicroRNAs(miRNAs)是目前研究最多的LncRNA下游靶点,LncRNA靶向miRNAs可以直接参与肿瘤细胞生物学行为的调控。高表达或低表达的LncRNA可靶向miRNA调控下游信号通路,促进或抑制子宫内膜癌(endometrial cancer, EC)进展。随着对LncRNA/miRNA调控轴在子宫内膜癌研究的深入,LncRNA和miRNA有望成为EC诊疗的新靶点和预后标志物。本文围绕LncRNA及miRNA对EC的调控、lncRNA调控miRNA在EC中的作用进行综述。

干扰hsa_circ_0103232对葡萄膜黑色素瘤细胞生物学行为的影响

目的探讨干扰hsa_circ_0103232对葡萄膜黑色素瘤C918和MUM2B细胞增殖、迁移、细胞周期及凋亡的影响。方法培养C918和MUM2B细胞株,通过实时荧光定量PCR分别检测3个靶向hsa_circ_0103232的小干扰RNA(siRNA)的干扰效果,并选择干扰效果最好的siRNA进行后续实验。将C918和MUM2B细胞均分为阴性对照转染(siCtrl)组和干扰(si-hsa_circ_0103232)组,采用细胞计数试剂盒8(CCK-8)和细胞克隆形成实验检测细胞增殖情况;采用Transwell实验检测细胞迁移情况;采用流式细胞术检测细胞周期分布和细胞凋亡情况;采用荧光原位杂交实验检测hsa_circ_0103232在细胞中的定位。结果实时荧光定量PCR结果显示,3个靶向hsa_circ_0103232的siRNA中,以si-hsa_circ_0103232#1的靶点效果最好,在C918和MUM2B细胞中的干扰后表达水平分别为0.263±0.016和0.469±0.028,显著低于对照组的1.013±0.008和1.004±0.108(均P<0.001)。CCK-8结果显示,与siCtrl组相比,si-hsa_circ_0103232组C918和MUM2B细胞增殖活力在转染后不同时间均显著降低,差异均有统计学意义(均P<0.05);细胞克隆形成实验结果显示,si-hsa_circ_0103232组C918和MUM2B细胞形成克隆数分别为(12±1)和(45±7)个,分别少于siCtrl组的(28±4)和(83±3)个,差异均有统计学意义(t=4.93、7.42,均P<0.05);Transwell实验结果显示,si-hsa_circ_0103232组C918和MUM2B细胞迁移数量分别为(4±1)和(24±2)个,分别少于siCtrl组的(37±12)和(57±3)个,差异均有统计学意义(t=3.91、10.80,均P<0.05);流式细胞术检测结果显示,与siCtrl组相比,si-hsa_circ_0103232组C918和MUM2B细胞中G1期细胞的比例均明显升高、G2/M期比例均显著下降,细胞凋亡率均显著升高,差异均有统计学意义(均P<0.05);荧光原位杂交实验结果显示,hsa_circ_0103232在C918和MUM2B细胞中定位在细胞核。结论干扰hsa_circ_0103232可抑制C918和MUM2B细胞增殖、迁移和周期进程,并促进细胞凋亡。hsa_circ_0103232可能成为葡萄膜黑色素瘤新的治疗靶点。

LncRNA MAFG-AS1:恶性肿瘤的潜在生物标志物和治疗靶点

长链非编码RNA(long non-coding RNAs,LncRNAs)在肿瘤发展中的调控作用已引起广泛关注。LncRNA MAFG-AS1是一种新型的致癌长链非编码RNA,在肺癌、乳腺癌和肝细胞癌等多种肿瘤组织中高表达,与肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭等恶性行为密切相关。此外,大量证据表明,LncRNA MAFG-AS1的上调与肿瘤患者的临床病理分期和不良生存预后有关。本文系统总结了近年来LncRNA MAFG-AS1在各种肿瘤中的表达、生物学功能、分子机制和临床意义的研究,并强调了LncRNA MAFG-AS1可作为新型诊断、预后生物标志物,以及癌症治疗的重要靶标。

长链非编码RNA在肝细胞癌耐药中的研究进展

肝细胞癌是原发性肝癌中最常见的类型,进展迅速、侵袭力强,治疗方法多样。但因其发生、发展所涉及的基因较多、机制复杂,不可避免地出现了治疗耐药性,导致治疗效果不明显,而耐药相关机制尚未完全明确。lncRNA是一类具有多种生物学功能的新型非编码RNA,能通过基因突变等作用于肝癌的发展、转化和侵袭,同时可以通过影响肿瘤免疫微环境、调节肿瘤细胞生物学功能等参与肝癌耐药。本文对lncRNA在肝细胞癌放化疗、靶向和免疫治疗耐药中的作用机制及相关进展进行综述,以期为解决肝癌耐药提供新思路。

靶向B7-H3抑制人脐静脉血管内皮细胞生长、迁移和血管形成

目的探讨靶向抑制协同信号分子B7-H3对人脐静脉血管内皮细胞(human umbilical vein endothelial cells,HUVECs)生长、迁移及血管生成能力影响。方法使用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)敲减HUVECs B7-H3分子,采用CCK-8实验检测24 h、48 h和72 h细胞增殖;采用Transwell实验检测24 h细胞迁移;三维细胞培养观察细胞血管生成。结果与空序列转染的阴性对照(siRNA-Control)组比较,siRNA-720、siRNA-1707和siRNA-16903条备选siRNA对B7-H3表达的抑制效果不同,siRNA-1690抑制率明显高于siRNA-720和siRNA-1707,因此,选择使用siRNA-1690序列进行后续实验。CCK-8细胞活力实验结果显示,敲减B7-H3后24 h、48 h和72 h HUVECs增殖能力分别下降24%、22%(P>0.05,与24 h比较)和15%(P<0.05,与48 h比较);Transwell迁移实验表明,与siRNA-Control组对比,敲减B7-H3的HUVECs 24 h迁移能力明显减低(P<0.01);三维细胞培养结果表明,采用si-B7-H3敲减B7-H3基因后,HUVECs血管生成能力明显下降(P<0.01)。结论靶向B7-H3抑制HUVECs生长、迁移及血管生成。

长链非编码RNA-LUCAT1在泌尿生殖系统肿瘤中的作用

长链非编码RNA(Long non-coding RNAs,lncRNAs)是指一种长度超过200个核苷酸、缺乏蛋白质编码能力的RNA分子。它们通过与蛋白质、RNA和DNA相互作用调节基因表达。肺癌相关转录物1(the lung cancer-related transcript 1,LUCAT1),又名SCAL1(Smoke and Cancer Associated LncRNA1),是首次于吸烟相关性肺癌组织中发现的一种lncRNA,它位于5号染色体q14.3区的反义链上。已有众多研究表明,lncRNA-LUCAT1在泌尿生殖系统肿瘤、消化系统肿瘤、肺癌、胶质瘤等肿瘤中均高表达,且与这些肿瘤的增殖、迁移、侵袭有密切的关系。另外已有研究明确表明,lncRNA-LUCAT1在肿瘤中的高表达与其不良预后显著相关。本文就lncRNA-LUCAT1在泌尿生殖系统肿瘤中的表达情况、致病机理、分子机制进行综述,为泌尿生殖系统肿瘤的早期诊断、靶向治疗、预测预后提供新方向和新策略。

微小RNA-34a-5p通过靶向鼠双微体4抑制巨噬细胞氧化应激损伤的作用

目的探讨微小RNA-34a-5p(miR-34a-5p)通过靶向鼠双微体4(MDM4)抑制巨噬细胞氧化应激损伤的作用。方法THP-1人单核细胞复苏后,培养分化为巨噬细胞。设立空白对照组。剩余细胞加入人源氧化低密度脂蛋白,孵育48 h,分化为巨噬泡沫细胞。设立动脉粥样硬化(AS)对照组。miR-34a-5p质粒转染,设为miR-34a-5p质粒转染组。每组24个重复。比较三组巨噬细胞凋亡情况,丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)蛋白及活性氧(ROS)水平,MDM4阳性率。结果空白对照组凋亡率为(2.55±0.32)%,AS对照组凋亡率为(28.16±4.23)%,miR-34a-5p转染组为(13.48±1.66)%,三组比较差异有统计学意义(P<0.05)。AS对照组高于空白对照组与miR-34a-5p转染组,miR-34a-5p转染组高于空白对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。三组MDA、SOD蛋白及ROS水平比较,差异均有统计学意义(P<0.05);AS对照组MDA、ROS水平最高,SOD水平最低,其次为miR-34a-5p转染组,组间比较差异均有统计学意义(P<0.05)。空白对照组MDM4阳性率为(8.33±0.35)%,AS对照组为(29.26±3.48)%,miR-34a-5p转染组为(14.26±1.59)%,三组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论miR-34a-5p可下调MDM4,进而抑制巨噬细胞氧化应激损伤。

非编码RNA调控内皮间质转化在疾病中的研究进展

内皮间质转化(endothelial to mesenchymal transition,EndMT)是内皮细胞失去其内皮细胞表型和功能而获得间充质细胞表型和功能的过程。在胚胎时期,EndMT是心脏瓣膜、肺动脉和主动脉发育的必须途径。近年来大量研究表明,EndMT也参与如动脉粥样硬化、心肌纤维化、肺动脉高压、脑血管畸形等心血管疾病,以及器官纤维化和肿瘤等疾病的发生发展。非编码RNA(non-coding RNAs,ncRNAs)是指由基因组转录而成的不编码蛋白质的RNA分子。研究表明,ncRNAs异常表达可以通过调控EndMT参与多种疾病的发生发展,此类具有调控功能的ncRNAs主要包括微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)。该综述总结了ncRNAs在多种疾病中调控EndMT的分子机制,讨论了其在疾病治疗中的应用前景,为临床EndMT相关疾病治疗提供了新思路。

长链非编码RNA CYP1B1-AS1对急性髓系白血病细胞增殖和迁移的影响及机制实验研究

目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)CYP1B1-AS1对急性髓系白血病细胞增殖和迁移的影响及机制。方法:实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测CYP1B1-AS1在急性髓系白血病细胞系THP-1、NB4、HL-60、KG-1、SKM-1和骨髓基质细胞HS-5中的表达量。通过5-氮杂-2’-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)处理急性髓系白血病细胞系,RT-qPCR检测5-Aza-CdR对CYP1B1-AS1表达的影响。根据转染物不同分别将HL-60细胞分为NC组和CYP1B1-AS1组。克隆形成实验和划痕实验依次检测HL-60细胞的增殖和迁移能力。双荧光素酶实验验证CYP1B1-AS1与微小RNA(miR)-1306-5p的靶向关系。RT-qPCR检测CYP1B1-AS1对HL-60细胞miR-1306-5p表达的影响。免疫印迹法检测CYP1B1-AS1对HL-60细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、细胞周期素E(Cyclin E)和转录因子(Twist)、纤维连接蛋白(Fibronectin)表达的影响。结果:与HS-5细胞比较,CYP1B1-AS1在急性髓系白血病细胞系中表达量降低,且HL-60细胞系中CYP1B1-AS1表达量最低(均P<0.05)。5-Aza-CdR能够明显促进急性髓系白血病细胞系中CYP1B1-AS1的表达(均P<0.05)。与NC组比较,CYP1B1-AS1组HL-60细胞增殖能力和迁移率降低(均P<0.05)。过表达miR-1306-5p能够抑制野生型CYP1B1-AS1的荧光素酶活性(P<0.05)。与NC组比较,CYP1B1-AS1组HL-60细胞中miR-1306-5p表达减少,细胞增殖和迁移相关蛋白CDK2、Cyclin E、Twist、Fibronectin表达降低(均P<0.05)。结论:过表达CYP1B1-AS1可能通过靶向下调miR-1306-5p表达抑制急性髓系白血病细胞的增殖和迁移。

海南黑山羊及其F1代杂交羊背最长肌转录组测序比较分析

为了鉴定和分析海南黑山羊与其F1代杂交羊(努比亚山羊公羊与海南黑山羊母羊杂交)背最长肌中差异表达的mRNA和lncRNA,试验以6月龄海南黑山羊及其F1代杂交羊公羊为试验动物,逐头采集背最长肌样品,采用RNA-Seq技术和生物信息学方法对两种山羊背最长肌进行转录组测序分析,运用DESeq软件鉴定两种山羊背最长肌组织间差异表达的mRNA和lncRNA,对差异表达基因进行GO功能注释、KEGG信号通路富集分析,同时对差异表达的lncRNA进行靶基因预测分析。结果表明:海南黑山羊及其F1代杂交羊背最长肌间存在276个差异表达的mRNA,其中1个mRNA只在海南黑山羊背最长肌中表达,2个mRNA只在F1代杂交羊背最长肌中表达;在273个共同表达的mRNA中,根据差异倍数大小,排名前10位的分别是NDUFB5、TMEM237、LOC102170968、TXLNB、GPR63、OSBPL1A、KERA、LOC108638040、BMF、HSP70.1。存在145个差异表达的lncRNA,其中16个只在海南黑山羊背最长肌中表达,7个只在F1代杂交羊背最长肌中表达。276个差异表达基因共富集在50个GO功能条目上,主要包括生物学过程、细胞组分和分子功能,富集的KEGG信号通路主要包括PI3K-AKI、细胞因子与细胞因子受体相互作用、趋化因子、MAPK和黏着斑信号通路。获得197个差异表达lncRNA顺式作用靶基因和142个差异表达lncRNA反式作用靶基因。说明海南黑山羊及其F1代杂交羊背最长肌具有不同表达水平的mRNA和lncRNA,两种山羊肌肉组织中均存在特异性表达的mRNA和lncRNA。

Snail1对牛脂肪细胞增殖分化影响及作用机制的研究

旨在探究Snail 1基因对于牛脂肪细胞增殖分化的影响及其潜在的作用分子机制。本研究利用腺病毒在秦川牛脂肪细胞中过表达Snail 1基因并设置试验组和对照组各3个生物学重复,采用流式细胞术、CCK-8、EdU染色、油红O染色、甘油三酯测定、qRT-PCR和蛋白质印迹等试验方法探究Snail 1对牛脂肪细胞增殖和分化的影响;进一步通过RNA-Seq、双荧光素酶报告试验筛选其作用信号通路及靶基因。结果表明,过表达Snail 1抑制了细胞增殖(CCK-8)且减少了处于S复制期阳性细胞比例(EdU,P<0.05)。结合流式细胞术试验,结果表明Snail 1上调导致了细胞周期G1/S期阻滞。进一步的实时荧光定量PCR和蛋白质印迹结果表明,Snail 1抑制了细胞周期蛋白基因CCNB1、CCND 2的表达(P<0.05)。对诱导分化第6天牛脂肪细胞进行油红O染色和甘油三酯检测,结果表明Snail 1抑制了牛脂肪细胞的成脂分化和甘油三酯的生成。qRT-PCR分析表明,过表达Snail 1抑制了PPARγ(P=0.06)、FABP4(P<0.05)、LPL(P<0.05)基因表达,而PIK 3R3基因表达水平显著上调(P<0.01);蛋白质印迹结果表明,Snail 1表达显著抑制了FABP4蛋白表达。进一步通过RNA-Seq测序分析发现,Snail 1过表达引起的差异基因主要富集在PPAR、ECM受体互作、PI3K-AKT、MAPK、尼古丁成瘾及胰岛素分泌等信号通路。基于FIMO靶基因筛选联合RNA-Seq数据分析及荧光素酶试验等证实,转录因子Snail1可能通过靶向Wnt信号通路的拮抗剂SFRP2影响牛脂肪细胞的分化过程。Snail 1基因抑制牛脂肪细胞的增殖和分化过程,且可能通过“Snail1/SFRP2-Wnt/β-catenin-GSK3β”正反馈环参与了牛脂肪细胞分化调控过程。

基于RNA-based NGS检测非小细胞肺癌融合基因临床实践中国专家共识

基于RNA水平的二代测序(RNA-based next-generation sequencing, RNA-based NGS)技术已被非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)临床实践指南和专家共识推荐为融合基因的检测方法之一。NSCLC可用药靶点主要包括基因突变和融合,用于评估靶向治疗可行性的基因突变和融合基因检测均不可或缺。目前,基于DNA水平的NGS(DNA-based NGS)结合RNA-based NGS一次性同步检测基因突变和融合的技术已部分应用于临床实践。然而,RNA-based NGS检测融合基因的应用时机、应用场景和质控方面在我国仍缺乏规范和标准。本共识将进一步明确RNA-based NGS在融合基因检测中的应用时机、应用场景和质控,并给予指导性建议,推动RNA-based NGS在NSCLC临床诊疗中的应用,使患者能够最大程度地从融合基因检测中获益。

信使RNA药物修饰及其递送系统研究进展

信使RNA(mRNA)药物在多种疾病的预防和治疗中展现了巨大的应用价值。最大程度提高mRNA的稳定性和翻译效率,保证mRNA免受核酸酶的降解并靶向特定组织和细胞是临床转化的要求。通过修饰核苷酸降低mRNA免疫原性,密码子优化增加mRNA翻译效率,5'帽结构和3'多聚腺苷酸尾结构增加mRNA稳定性,以及添加5'和3'非翻译区功能调控mRNA稳定性和翻译效率。通过纳米粒递送系统保护mRNA不被核酸酶降解,增加mRNA血液循环,并帮助mRNA进入细胞质发挥治疗和预防作用。本文综述了mRNA药物的制剂工程技术进展,讨论了提高mRNA稳定性和翻译效率的方法及设计原理,总结了具有产业转换潜力的mRNA递送系统的设计要求及其临床应用,并展望了mRNA药物未来可能的研究方向,以满足实现个性化精准医疗的需求。

马铃薯干旱相关microRNA的鉴定及其表达分析

马铃薯是世界第三大粮食作物,随着气候变暖以及淡水资源短缺,干旱成为制约其生长发育的重要因素。为了明确马铃薯响应干旱胁迫相关的microRNA(miRNA)及其靶基因的调控模式,利用small RNA测序技术、生物信息学方法和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,对20%PEG6000模拟干旱处理0,1,3,6,12,24和48 h共7个时间点马铃薯组培幼苗的sRNA进行高通量测序、筛选和鉴定。从7个处理2个生物学重复共计14个样本中鉴定到621个miRNAs,包括308个已知miRNAs和313个新预测的miRNAs。其中250个已知miRNAs属于69个家族,166个新的miRNAs属于59个家族。miRNA长度分布在20~24 nt,其中主要集中在21和24 nt。差异表达分析共鉴定到40个差异表达的miRNAs,包括16个已知miRNAs和24个新的miRNAs。联合靶基因预测结果和干旱转录组数据,分别对16个已知和17个新miRNAs的81个和70个靶基因进行了功能注释,其主要参与生长代谢、胁迫响应、氧化还原反应及生物合成等过程;qRT-PCR分析结果与测序结果基本一致。研究为进一步挖掘马铃薯响应干旱胁迫的miRNA,以及阐明马铃薯中miRNA参与干旱响应的分子机制提供理论依据。

附睾中非编码小RNA(sncRNA)的研究进展

非编码小RNA(sncRNA)主要通过抑制性调控靶基因发挥作用。近年的研究发现sncRNA在哺乳动物附睾的各个部位均有表达,并且在调控附睾不同节段的基因表达方面起着非常关键的作用。附睾上皮细胞中sncRNA的多样性及其表达水平的时空差异会影响很多潜在的靶基因,从而调节附睾的生理功能,另外,这些sncRNA还可以通过附睾小体传递给精子,对精子产生一系列的调控作用。综述了附睾中sncRNA表达、sncRNA对附睾和附睾中精子功能调节方面的研究进展,以期为探究sncRNA对雄性生殖细胞调控作用的分子机制提供参考。

基于免疫相关长链非编码RNA及基因建立膀胱癌预后模型并筛选靶向分子药物

目的:膀胱癌(bladder cancer,BLCA)是具有高发病率的泌尿系统肿瘤之一,临床常规诊疗方法可提高患者的生存率,但肿瘤的复发和转移致使患者的预后仍然较差。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在调控肿瘤发生、发展及癌症免疫中具有重要作用,可以作为一种新型的标志物预测患者预后及免疫应答。本研究基于生物信息学分析,构建BLCA预后模型,并筛选出BLCA的靶向分子药物。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载RNA测序数据和临床数据,并将BLCA患者分为训练集和验证集。基于加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)的方法提取免疫相关lncRNAs(immune related lncRNAs,IRlncRNAs),通过最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归的方法构建预后模型,利用美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库和泛癌数据进行预后基因集的肿瘤相关性分析,并依据Kaplan-Meier分析和受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评价该模型的预后准确性。根据风险打分将样本分为高风险组与低风险组,并在此基础上通过风险差异基因筛选出高风险基因。最后,通过CMap数据库筛选抑制高风险基因表达的药物,从而降低BLCA患者的发病风险,提高患者的生存率。结果:基于TCGA数据库中的414例肿瘤样本和19例癌旁样本,预处理得到1342个免疫相关基因(immune related genes,IRGs)和409个临床数据,并通过WGCNA得到927个生存数据。根据Pearson相关分析和单因素Cox分析,得到74个与预后相关的IR-lncRNAs(|R|>0.4,P<0.05)。运用LASSO回归构建预后模型,得到12个IR-lncRNAs和21个IRGs。通过后续分析可知:该预后模型可预测高、低风险组患者的生存及预后情况,并验证了预后模型的独立预测能力及预测准确性,最后筛选了11种BLCA的潜在靶向药物。结论:本研究为BLCA患者构建了一个基于IRGs和IR-lncRNAs的预后模型,筛选了11种潜在的靶向分子药物,为BLCA患者的治疗提供了新思路。

非编码RNA调控脊髓损伤后神经元细胞凋亡的作用和机制

背景:脊髓损伤后神经元细胞凋亡是造成脊髓永久性损伤的一个主要原因,探索防止脊髓损伤后神经元凋亡的方法意义重大。现有的动物实验研究表明,非编码RNA能够对脊髓损伤后神经元细胞凋亡进行调控,这或许可以给临床脊髓损伤后神经元保护性治疗提供一定参考。目的:对非编码RNA调控脊髓损伤后神经元凋亡作用和机制进行综述,为脊髓损伤的保护性治疗提供新的靶点。方法:以“microRNA,miR,lncRNA,circRNA,noncoding RNA,RNA,SCI,spinal cord injury,spinal cord,apoptosis”为检索词在PubMed数据库中进行检索,制定纳排标准,通过阅读文题、摘要和全文进行筛选,最终纳入87篇相关文献。结果与结论:(1)神经元细胞凋亡为继发性脊髓损伤中极其重要的病理生理改变,是神经元死亡、脊髓功能障碍的重要致病机制之一。(2)动物实验研究发现,在脊髓损伤后的脊髓组织中,与神经元细胞凋亡相关的miRNA、长链非编码RNA(lncRNA)与环状RNA(circRNA)可出现差异性表达,一些促进神经元凋亡的miRNA,lncRNA与circRNA过表达,而另一部分抑制神经元凋亡的miRNA、lncRNA与circRNA表达下调。(3)调控特定miRNA的相应表达,主要通过靶向下调凋亡基因Bax、抑制TLR4/核转录因子κB信号通路、激活PI3K/Akt信号通路等方式可抑制脊髓损伤后神经元细胞过度凋亡。(4)调控lncRNA和circRNA的表达,主要通过靶向负调控的方式使得特定miRNA出现沉默或过表达,从而发挥其抗神经元细胞凋亡的作用。(5)在miRNA中,miR-125b对Smurf1/KLF2/ATF2轴及JAK1/STAT1信号通路等均可产生调节,而miR-21-5p对程序性细胞死亡因子4(PDCD4)和PI3K/AKT信号通路等可产生调节,具有多途径抗凋亡的作用。(6)在lncRNA和circRNA中,lncRNA-PTENP1,lncRNA-TCTN2和circRNA-HIPK3均对于多种miRNA具有靶向调节作用,这些非编码RNA也许可以成为脊髓损伤后神经元保护性治疗的新靶点。(7)目前对于非编码RNA调控脊髓损伤后神经元细胞凋亡还仅停留在动物及细胞研究层面,未来需要继续探索更加具有靶向作用的非编码RNA药物载体,联合生物组织工程以及其他新兴技术,争取早日向临床转化过渡。

转录组测序结合TMT蛋白质组学技术对脊髓损伤小鼠关键基因预测及相关病理机制研究

目的:通过转录组测序(RNA sequencing,RNA-Seq)和TMT蛋白质组学技术,筛选差异表达的基因及蛋白,探讨脊髓损伤后复杂的病理机制。方法:50只雌性C57BL/6小鼠随机分为假手术组、模型组,每组25只。采用钳夹法在腰1处制备小鼠脊髓损伤模型,14 d后进行取材。采用后肢运动功能评分(basso mouse scale,BMS)评估小鼠后肢运动功能变化;HE染色法观察脊髓损伤区病理形态学变化;RNA-Seq技术筛选差异基因;TMT蛋白组学分析筛选差异蛋白;结合2种测序技术筛选变化趋势吻合的mRNA和蛋白并进行生物信息学分析。结果:与假手术组相比,模型组中BMS评分明显降低(P<0.05);HE染色显示脊髓损伤区域结构疏松紊乱,出现空洞,细胞核固缩,炎性浸润严重,神经元坏死;RNA-Seq共筛选出565个差异mRNA,其中545个上调,20个下调,TMT蛋白组学共筛选出339个差异蛋白,其中278个上调,61个下调;2种测序的聚类热图显示2组样本的表达模式差异大;韦恩图分析获得83个趋势上调的mRNA或蛋白;蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析获得11个核心靶点;GO富集分析显示分子功能或生物过程主要在免疫应答、溶酶体途径、细菌反应、液泡裂解等方面;KEGG富集通路主要在结核病变、溶酶体、吞噬小体途径等通路。结论:本研究筛选出的11个mRNA或蛋白可能是调控脊髓损伤病理过程的核心靶点,病理机制可能与免疫应答途径、溶酶体和吞噬小体等通路密切相关。

微小RNA在心肾综合征中的诊治进展

心肾交互性疾病即心肾综合征(cardiorenal syndrome,CRS)是一种由于心脏或肾脏中的一个器官出现急性或慢性功能不全从而导致另一器官同样出现急性或慢性功能紊乱的一种病理状态。虽然CRS目前的治疗手段已经在不断的改善,但是其难以兼顾心脏容量与肾脏灌注的缺点一直无法克服,从而导致了CRS预后差,病死率高。探寻CRS新的诊疗手段是目前的研究热点。近年来,大量有关微小RNA(micro RNA)在心血管及肾脏疾病中的调控作用研究表明,miRNA可以作为诊治心脏、肾脏相关疾病的生物标志物及治疗新靶点,为CRS的诊治提供了新的思路。

长链非编码RNA在血液肿瘤中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)作为肿瘤发病机制研究领域的热点,其在血液系统恶性肿瘤中的重要性正逐渐被阐明。lncRNA不仅影响细胞增殖、分化、多能性和凋亡等多种生物学过程,调控血液肿瘤发生和进展,而且lncRNA异常表达和突变与耐药和预后密切相关,可作为血液肿瘤的新型生物标志物和潜在治疗靶点。本文将重点介绍lncRNA在血液肿瘤中的最新进展,为血液病的临床诊断、预后评估和靶向药物的研发提供新思路。