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中药调控circRNAs及相关ceRNA网络治疗胃癌研究进展 被引量:1
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作者 韩明 张梦圆 +3 位作者 郑沁薇 张楠 李富龙 方盛泉 《上海中医药杂志》 CSCD 2024年第4期86-91,共6页
环状RNA(circRNAs)是非编码RNA大家族中的一员,在胃癌组织中差异表达,以circRNAs形成的内源竞争RNA(ceRNA)网络可以促进或抑制胃癌的进展,在胃癌的发生发展过程中具有重要作用。通过梳理相关文献,综述中药调控circRNAs及相关ceRNA网络... 环状RNA(circRNAs)是非编码RNA大家族中的一员,在胃癌组织中差异表达,以circRNAs形成的内源竞争RNA(ceRNA)网络可以促进或抑制胃癌的进展,在胃癌的发生发展过程中具有重要作用。通过梳理相关文献,综述中药调控circRNAs及相关ceRNA网络治疗胃癌的研究进展,中药复方及中药单体均可以通过靶向circRNAs或调控ceRNA网络有效抑制胃癌的恶性进展。 展开更多
关键词 胃癌 中药 环状RNA 内源竞争RNA网络 作用机制 研究进展
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CircRNAs对家畜肌肉发育、脂肪沉积及泌乳的调控作用研究进展
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作者 孙萍 黄园园 +3 位作者 曲秀文 王健 江明生 李辉 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期28-38,共11页
产肉量、产奶量和脂肪沉积等是衡量家畜生产性能和品质的重要指标,是与畜牧业的发展有着紧密联系的性状。CircRNAs是一种非编码RNA,参与调控家畜肌肉和脂肪的生成发育以及泌乳等过程。circRNAs作用机制不同、发挥作用的大小不同,其呈现... 产肉量、产奶量和脂肪沉积等是衡量家畜生产性能和品质的重要指标,是与畜牧业的发展有着紧密联系的性状。CircRNAs是一种非编码RNA,参与调控家畜肌肉和脂肪的生成发育以及泌乳等过程。circRNAs作用机制不同、发挥作用的大小不同,其呈现在家畜上的表型也不尽相同。本文重点介绍了circRNAs在肌肉和脂肪发育过程以及泌乳这一生命活动中的功能和作用机制、不同circRNAs干扰和敲除技术的优缺点,并对circRNAs在畜牧产业发展及其敲除技术在动物中的应用做出展望,旨在为circRNAs在畜牧业中的研究和应用提供新的思路和理论基础。 展开更多
关键词 circrnas 肌肉发育 脂肪沉积 circrnas敲除
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HMG蛋白家族相关CircRNAs在肺癌中调控作用的研究进展
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作者 贺丽萍 蒋莉 《四川医学》 CAS 2024年第5期534-539,共6页
肺癌是全球癌症死亡的主要原因之一,具有极高的发病率及死亡率,严重威胁了人类的生命健康安全[1]。目前肺癌的治疗方法主要有手术、放化疗、靶向及免疫治疗,随着精准医疗的兴盛,一定程度改善了肺癌患者的生活质量,但癌症复发和药物耐药... 肺癌是全球癌症死亡的主要原因之一,具有极高的发病率及死亡率,严重威胁了人类的生命健康安全[1]。目前肺癌的治疗方法主要有手术、放化疗、靶向及免疫治疗,随着精准医疗的兴盛,一定程度改善了肺癌患者的生活质量,但癌症复发和药物耐药性仍是肺癌死亡率高的原因,其预后不尽如意[2]。环状RNA(CircRNAs)是具有保守、稳定性的一类非编码单链RNA分子[3]。大量的研究表明,CircRNAs在高迁移率族蛋白(high mobility group protein,HMG)家族成员中调节不同的信号通路,在肺癌等多种疾病中发挥关键作用。CircRNAs异常高或低表达可激活或抑制HMG蛋白分子,调节不同生物学过程[4]。随着下一代基因测序技术(next-generation sequencing,NGS)的探索,CircRNAs成为RNA领域肿瘤抑制靶点的研究新热点,为生物医药领域开拓了全新思路,然而其在肺癌中的病理生理机制尚未系统阐明。本文通过总结HMG蛋白家族成员相关CircRNAs在肺癌中的分子作用机制的研究进展,有助于为以CircRNAs为基础的作用靶点及新型抗癌药物的研发提供指导思路,提出潜在有效的治疗策略。 展开更多
关键词 肺癌 HMG蛋白家族 circrnas 分子机制
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circRNAs在肝癌诊疗中的研究进展
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作者 郑盛伟 汪兴 +3 位作者 吕乐 张涛 吴霏 陈浩 《右江民族医学院学报》 2024年第3期424-427,438,共5页
肝癌是在世界范围内具有高发病率和高致死率的恶性肿瘤之一,对人类的健康构成严重威胁。因此研究其发生发展的分子机制对其诊断、治疗及预防具有重要意义。目前肝癌的治疗手段主要有手术切除、肝移植等手术治疗方式以及系统化疗、分子... 肝癌是在世界范围内具有高发病率和高致死率的恶性肿瘤之一,对人类的健康构成严重威胁。因此研究其发生发展的分子机制对其诊断、治疗及预防具有重要意义。目前肝癌的治疗手段主要有手术切除、肝移植等手术治疗方式以及系统化疗、分子靶向药物、介入治疗等非手术治疗方式。而近年来发现的circRNAs可参与肝癌的发生发展、侵袭、转移及耐药等过程;其在肝癌方面的研究逐渐成为热点,并有望成为潜在的诊断标志物和治疗靶点。本文将归纳总结circRNAs在肝癌发生发展、诊断、治疗及预后等方面的研究进展。 展开更多
关键词 circrnas 肝肿瘤 生长 转移
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有氧运动调节circRNAs m6A甲基化修饰改善高脂饮食小鼠心脏病理性重塑研究
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作者 徐祖杰 马哲莹 +1 位作者 张冰 田振军 《体育科学》 CSSCI 北大核心 2024年第2期63-76,共14页
目的:通过甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-seq)和转录组测序(RNA-seq)绘制N6-甲基腺苷(m6A)修饰图谱,探讨环状RNA(circRNAs)m6A甲基化修饰在有氧运动改善高脂饮食小鼠心脏病理性重塑中的作用。方法:C57BL/6J野生型小鼠随机分为正常饮食安... 目的:通过甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-seq)和转录组测序(RNA-seq)绘制N6-甲基腺苷(m6A)修饰图谱,探讨环状RNA(circRNAs)m6A甲基化修饰在有氧运动改善高脂饮食小鼠心脏病理性重塑中的作用。方法:C57BL/6J野生型小鼠随机分为正常饮食安静(normal diet-sedentary,ND-SED)组、正常饮食运动(normal diet-exercise,ND-EX)组、高脂饮食安静(high-fat diet-sedentary,HFD-SED)组和高脂饮食运动(high-fat diet-exercise,HFD-EX)组。ND-SED组和ND-EX组小鼠给予普通饲料喂养,HFD-SED组和HFD-EX组小鼠给予60%脂肪供能高脂饲料喂养12周后,ND-EX组和HFD-EX组小鼠进行8周有氧运动。运动干预结束后,检测小鼠体重、体脂含量和心功能。采血、取心脏,检测血清TC和TG含量,酶联免疫吸附测定检测心脏组织TG含量,RT-qPCR检测m6A调节因子,Western blot检测METTL3和FTO蛋白表达,比色法检测心脏组织m6A RNA甲基化含量,MeRIP-seq检测HFD-SED组和HFD-EX组小鼠心脏circRNAs m6A甲基化修饰,SRAMP预测发生m6A甲基化差异和表达差异的circRNA甲基化位点,MeRIP-qPCR验证其m6A水平。结果:8周有氧运动显著降低了高脂饮食小鼠体重和体脂含量,提高了左心室射血分数和短轴缩短率,抑制心脏纤维化和脂质沉积,改善心脏病理性重塑。有氧运动可以显著降低高脂饮食小鼠心脏m6A甲基化水平,甲基转移酶METTL3在其中发挥了重要作用。MeRIP-seq显示,HFD-SED组和HFD-EX组小鼠心脏受m6A修饰的circRNAs大部分都只具有1个m6A修饰位点,且m6A circRNAs主要来自重叠区和外显子。与HFD-SED组比较,HFD-EX组小鼠心脏有13个circRNAs发生了甲基化上调,19个circRNAs发生了甲基化下调,两组差异甲基化的circRNAs大部分来源于重叠区,长度主要富集在1~10000 bps,大部分位于1号、7号和13号染色体上。RNA-seq显示,与HFD-SED组比较,HFD-EX组小鼠心脏有40个circRNAs发生差异表达,其中22个显著上调,18个显著下调。MeRIP-seq和RNA-seq联合分析发现,只有circRNA_4614|Chr7:127484542_127486889_+(以下简称“circRNA_4614”)同时发生m6A甲基化差异和表达差异,其m6A水平和表达水平均显著上调。SRAMP预测显示,circRNA_4614存在8个潜在的m6A位点,其中1个位点具有非常高置信度,2个位点具有高置信度。MeRIP-qPCR验证显示,与HFD-SED组比较,HFD-EX组小鼠心脏circRNA_4614的m6A水平显著上调,其趋势与MeRIP-seq测序结果一致。结论:有氧运动可以显著降低高脂饮食小鼠心脏m6A甲基化水平,调节心脏circRNAs表达谱和m6A修饰谱。circRNA_4614介导的m6A修饰在有氧运动改善肥胖性心脏重塑中可能发挥重要作用。 展开更多
关键词 环状核糖核酸 有氧运动 N6-甲基腺苷甲基化 肥胖 心脏病理性重塑
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基于外周血circRNAs构建抑郁症严重程度的预测模型
6
作者 严焕然 许冬琴 陈晶 《中国现代医生》 2024年第20期17-22,共6页
目的基于外周血环形RNA(circular RNAs,circRNAs)表达构建抑郁症严重程度的预测模型。方法选取2022年8月至2023年8月于笔者医院就诊的抑郁症80例患者,分为轻中度组49例、重度组31例,并以40名健康人作为健康组,经基因芯片筛查,选择差异... 目的基于外周血环形RNA(circular RNAs,circRNAs)表达构建抑郁症严重程度的预测模型。方法选取2022年8月至2023年8月于笔者医院就诊的抑郁症80例患者,分为轻中度组49例、重度组31例,并以40名健康人作为健康组,经基因芯片筛查,选择差异较大的5种circRNAs,进一步分析circRNAs与抑郁症严重程度的关系,分析影响抑郁症严重程度的独立危险因子,根据分析结果构建基于外周血circRNAs表达的抑郁症严重程度列线图预测模型。结果与健康组、轻中度组比较,重度组circRNA_100679、circRNA_103636相对表达量降低,circRNA_102802、circRNA_103964、circRNA_002143相对表达量升高(P<0.05)。circRNA_100679、circRNA_103636与抑郁症严重程度呈负相关(r=-0.594、-0.512,P<0.05),CircRNA_102802、circRNA_103964、circRNA_002143与抑郁症严重程度呈正相关(r=0.603、0.425、0.412,P<0.05)。CircRNA_100679、circRNA_102802、circRNA_103636、circRNA_103964、circRNA_002143、家族精神疾病史、5-羟色胺(5-hydroxytryptamine,5-HT)均为抑郁症严重程度的危险因子(P<0.05)。基于外周血circRNAs等危险因子构建的列线图预测模型的预测曲线下面积为0.900(95%CI:0.811~0.945),模型区分度较好,内部验证一致性较高。结论构建基于circRNAs表达的抑郁症严重程度的列线图模型预测价值良好,可为临床抑郁症严重程度的诊断提供参考。 展开更多
关键词 环形RNA 抑郁症 严重程度 预测模型
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黔北黑猪骨骼肌中肌纤维类型转化相关circRNAs的筛选
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作者 赵园园 孟金柱 +2 位作者 宋兴超 安清明 吴震洋 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期71-77,共7页
选取9头6月龄健康黔北黑猪,随机分成3组,采集背最长肌(LDM)和腰大肌(PMM)肌肉组织,通过RNA-seq构建环状RNA(circRNAs)的表达谱,筛选差异表达的circRNAs,在黔北黑猪2种肌肉中共鉴定出63个差异表达circRNAs,其中31个在LDM中表达上调,32个... 选取9头6月龄健康黔北黑猪,随机分成3组,采集背最长肌(LDM)和腰大肌(PMM)肌肉组织,通过RNA-seq构建环状RNA(circRNAs)的表达谱,筛选差异表达的circRNAs,在黔北黑猪2种肌肉中共鉴定出63个差异表达circRNAs,其中31个在LDM中表达上调,32个表达下调;对差异表达circRNAs的源基因进行GO、KEGG富集分析,结果表明,差异表达的circRNAs的源基因主要富集在磷酸酶活性的调控、肌节组织活动、肌球蛋白-轻链-磷酸酶活性的正调控等条目;富集的KEGG通路中与肌纤维类型转化相关的通路包括肌动蛋白细胞骨架的调控、ECM-受体互作、PI3K-Akt信号通路。预测差异表达circRNA的靶miRNAs,并筛选对应的靶mRNAs,构建的circRNA-miRNA-mRNA调控网络显示,circ_0003749-miR-27a-MSTN、circ_0003749-miR-27a-PPARγ、circ_0012316-miR-23a-Myh1/2/4、circ_0007093-miR-214-3p-MEF2C、circ_0010118-miR-132-FoxO1和circ_0010118-miR-374a-5p-FoxO1可能通过ceRNA网络调控肌纤维类型的转化。 展开更多
关键词 黔北黑猪 骨骼肌 肌纤维类型转化 circRNA-miRNA-mRNA网络
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差异表达circRNAs在脊髓损伤组织炎症反应和神经细胞自噬凋亡、再生中的调节作用及其机制研究进展
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作者 陈峒江 连邱健 +1 位作者 赵浩南 王志伟 《山东医药》 CAS 2024年第15期108-111,共4页
脊髓损伤是一种病情严重的中枢神经系统疾病。circRNAs在中枢神经系统中广泛表达,参与神经发育、神经细胞增殖和分化。脊髓损伤组织中circRNAs发生差异表达,通过circRNA微阵列发现,在脊髓损伤后6 h,脊髓组织中共有150个circRNAs显著差... 脊髓损伤是一种病情严重的中枢神经系统疾病。circRNAs在中枢神经系统中广泛表达,参与神经发育、神经细胞增殖和分化。脊髓损伤组织中circRNAs发生差异表达,通过circRNA微阵列发现,在脊髓损伤后6 h,脊髓组织中共有150个circRNAs显著差异表达;脊髓损伤后3天,脊髓组织中有1676个差异表达的circRNAs,其中1261个下调,415个上调。cirRNA在脊髓损伤发生后的常见病理反应中,如脊髓组织炎症反应、神经细胞凋亡、神经细胞自噬以及神经细胞再生和修复等过程中发挥调节作用。差异表达的circRNAs可能通过参与趋化因子/细胞因子信号通路来调节脊髓损伤组织的炎症,如一些差异表达的circRNAs可激活NF-κB促进炎症反应,circRNA_005470通过竞争性结合miR-145-5p,调节κ轻链免疫球蛋白信号通路的表达,减少炎症反应。circ-HIPK3通过吸附miR-558减弱了脊髓损伤组织神经细胞的凋亡;一些差异表达的circRNAs(如circRNA_07079和circRNA_01282)通过AMPK和cAMP信号通路参与脊髓损伤组织的神经细胞凋亡。在缺氧、缺血或再灌注损伤状态下,circ016719表达上调,触发MAPK/p38信号通路激活,导致神经细胞自噬;高表达的circHIPK2通过激活MIR 124-2 HG及其靶标SIGMAR1促进星形胶质细胞自噬。circHDAC9可能作为miR-138-5p的“海绵”,有助于促进神经干细胞分化并抑制其增殖;circRNA_01477是参与脊髓损伤组织神经细胞再生环境的重要调节剂。 展开更多
关键词 环状RNA 炎症反应 细胞凋亡 细胞自噬 脊髓损伤
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Research Progress of circRNAs during Epithelial- Mesenchymal Transition of Hepatocellular Carcinoma
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作者 Yuqing Li Cuicui Ren +3 位作者 Yu Cai Chang Tian Yuanyuan Jia Ge Wu 《Proceedings of Anticancer Research》 2024年第2期24-35,共12页
Hepatocellular carcinoma is prone to invasion and metastasis.It often receives a low diagnosis rate in the early stage but has an extremely high mortality rate.Epithelial-mesenchymal transformation(EMT)is a key factor... Hepatocellular carcinoma is prone to invasion and metastasis.It often receives a low diagnosis rate in the early stage but has an extremely high mortality rate.Epithelial-mesenchymal transformation(EMT)is a key factor in promoting tumor cell invasion and metastasis.Circular RNA(circRNA)is involved in regulating EMT in hepatocarcinoma cells through multiple pathways,thereby affecting the occurrence and progression of hepatocellular carcinoma.This article mainly reviews the research progress of circRNA related to EMT core transcription factors,circRNA that promotes EMT in liver cancer,and circRNA that inhibits EMT in liver cancer. 展开更多
关键词 circRNA Epithelial-mesenchymal transformation(EMT) Hepatocellular carcinoma(HCC)
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Non-coding RNAs in acute ischemic stroke:from brain to periphery
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作者 Shuo Li Zhaohan Xu +7 位作者 Shiyao Zhang Huiling Sun Xiaodan Qin Lin Zhu Teng Jiang Junshan Zhou Fuling Yan Qiwen Deng 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第1期116-129,共14页
Acute ischemic stroke is a clinical emergency and a condition with high morbidity,mortality,and disability.Accurate predictive,diagnostic,and prognostic biomarkers and effective therapeutic targets for acute ischemic ... Acute ischemic stroke is a clinical emergency and a condition with high morbidity,mortality,and disability.Accurate predictive,diagnostic,and prognostic biomarkers and effective therapeutic targets for acute ischemic stroke remain undetermined.With innovations in high-throughput gene sequencing analysis,many aberrantly expressed non-coding RNAs(ncRNAs)in the brain and peripheral blood after acute ischemic stroke have been found in clinical samples and experimental models.Differentially expressed ncRNAs in the post-stroke brain were demonstrated to play vital roles in pathological processes,leading to neuroprotection or deterioration,thus ncRNAs can serve as therapeutic targets in acute ischemic stroke.Moreover,distinctly expressed ncRNAs in the peripheral blood can be used as biomarkers for acute ischemic stroke prediction,diagnosis,and prognosis.In particular,ncRNAs in peripheral immune cells were recently shown to be involved in the peripheral and brain immune response after acute ischemic stroke.In this review,we consolidate the latest progress of research into the roles of ncRNAs(microRNAs,long ncRNAs,and circular RNAs)in the pathological processes of acute ischemic stroke–induced brain damage,as well as the potential of these ncRNAs to act as biomarkers for acute ischemic stroke prediction,diagnosis,and prognosis.Findings from this review will provide novel ideas for the clinical application of ncRNAs in acute ischemic stroke. 展开更多
关键词 acute ischemic stroke apoptosis blood–brain barrier damage circular rnas excitatory toxicity long non-coding rnas MICROrnas NEUROINFLAMMATION non-coding rnas oxidative stress
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自噬相关miRNAs、lncRNAs、circRNAs在骨质疏松症中的作用 被引量:2
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作者 李志超 薛海鹏 +2 位作者 苏辉 徐展望 谭国庆 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1695-1699,1710,共6页
骨质疏松症由骨吸收增加和骨形成减少引起,是一种常见代谢性骨疾病,其发生发展的详细分子机制尚不清晰。自噬作为一种应激反应性分解代谢过程,在维持细胞和组织稳态中起着关键作用。非编码RNAs,如微小RNAs、长链非编码RNAs和环状RNAs,... 骨质疏松症由骨吸收增加和骨形成减少引起,是一种常见代谢性骨疾病,其发生发展的详细分子机制尚不清晰。自噬作为一种应激反应性分解代谢过程,在维持细胞和组织稳态中起着关键作用。非编码RNAs,如微小RNAs、长链非编码RNAs和环状RNAs,通过作为调节因子对基因表达进行转录后调控,在包括自噬在内的许多细胞过程中发挥重要作用。研究表明,部分自噬相关ncRNAs通过调节骨髓间充质干细胞、成骨细胞、骨细胞和破骨细胞生理和发育过程参与维持骨稳态。基于此,笔者综述了影响骨微环境的自噬相关微小RNAs、长链非编码RNAs和环状RNAs参与调控骨质疏松发生发展的最新研究进展,为探索骨质疏松症发病机制和确定临床治疗潜在靶点提供理论基础。 展开更多
关键词 骨质疏松症 自噬 微小rnas 长链非编码rnas 环状rnas
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感染肺炎支原体姜曲海猪肺组织差异表达circRNAs的筛选与分析 被引量:2
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作者 倪黎纲 赵旭庭 +3 位作者 王宵燕 徐盼 甘源 金文 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第6期2212-2220,共9页
为探明姜曲海猪感染猪肺炎支原体(Mycoplasma hyopneumoniae,Mhp)后肺组织环状RNA(circular RNA,circRNA)差异性表达谱及其在抗Mhp感染中的作用,试验以姜曲海猪为研究对象,分为感染组和对照组,人工感染Mhp 28 d后,解剖采集肺组织,采用... 为探明姜曲海猪感染猪肺炎支原体(Mycoplasma hyopneumoniae,Mhp)后肺组织环状RNA(circular RNA,circRNA)差异性表达谱及其在抗Mhp感染中的作用,试验以姜曲海猪为研究对象,分为感染组和对照组,人工感染Mhp 28 d后,解剖采集肺组织,采用高通量测序和生物信息学软件分析circRNA的表达情况。测序数据比对参考猪基因组序列,共鉴定到23632个circRNAs,差异表达circRNAs为213个,其中97个上调,116个下调。随机选择4个差异表达circRNAs进行实时荧光定量PCR验证,检测结果与测序结果基本一致。差异表达circRNA来源基因可注释到包括抗原加工递呈、溶酶体、白细胞跨内皮迁移等免疫应答信号通路。circRNA-miRNA-mRNA靶标关系分析显示,筛选到海绵结合miRNA数量最多的3个差异表达circRNAs,分别为:circRNA-17284(21个)、circRNA-04848(19个)和circRNA-17270(19个);预测到6个与免疫调控相关的靶向miRNAs,分别为:ssc-miR-4331、ssc-miR-370、ssc-miR-328、ssc-miR-30c-3p、ssc-miR-122和ssc-miR-125b。本研究测定了感染Mhp的猪肺组织circRNA表达谱,筛选到与免疫调控相关的差异表达circRNA,这有助于阐明姜曲海猪对Mhp的易感机制,为抗病育种研究提供了参考依据。 展开更多
关键词 姜曲海猪 猪肺炎支原体 环状RNA 高通量测序
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CircRNAs在骨质疏松症中的研究进展 被引量:2
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作者 张素华 徐月新 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期143-146,156,共5页
骨质疏松症是最常见的与年龄相关的骨骼退化型疾病,常常无临床症状,一般骨折发生后才被确诊。通过骨密度和常规骨标志物难以判断骨质疏松症患者的骨质量及预测其骨折风险。Circular RNAs(circRNAs)即环状RNA,是真核生物中具有组织特异... 骨质疏松症是最常见的与年龄相关的骨骼退化型疾病,常常无临床症状,一般骨折发生后才被确诊。通过骨密度和常规骨标志物难以判断骨质疏松症患者的骨质量及预测其骨折风险。Circular RNAs(circRNAs)即环状RNA,是真核生物中具有组织特异及细胞特异表达模式的一类内源性闭合环状非编码RNA,其稳定性高、保守性好,在基因调控中发挥复杂作用。研究发现circRNAs作为miRNA海绵,调控基因表达和蛋白相互作用,参与骨质疏松症的发生和发展。本文将对circRNAs在骨质疏松症中调控作用的最新研究进行综述,并探讨circRNAs作为骨质疏松症新型标志物的可能性。 展开更多
关键词 骨质疏松症 circrnas 生物标志物
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circRNAs在肿瘤中的研究进展 被引量:1
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作者 郭佳妮 何敬东 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期728-730,共3页
环状RNA(circular RNA,circ RNA)是一种共价闭合的单股环状分子,属于非编码RNA家族成员。circRNA以保守、稳定、特异、高含量为特点,可作为microRNA海绵调控靶miRNA的活性,并参与基因转录和蛋白生成的调控,逐渐成为非编码RNA调控网络的... 环状RNA(circular RNA,circ RNA)是一种共价闭合的单股环状分子,属于非编码RNA家族成员。circRNA以保守、稳定、特异、高含量为特点,可作为microRNA海绵调控靶miRNA的活性,并参与基因转录和蛋白生成的调控,逐渐成为非编码RNA调控网络的新星。circRNA在多种疾病的发生发展中发挥重要作用,并且在肿瘤诊断、治疗和预后等方面具有巨大的潜能,有望成为新的肿瘤生物标志物或分子靶向治疗靶点。 展开更多
关键词 环状RNA 基因表达调控 肿瘤标志物 靶向治疗
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CircRNAs与阿尔茨海默病相关性的研究进展与未来方向 被引量:1
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作者 何香花 张为 +1 位作者 杨泽 胡才友 《中国老年保健医学》 2023年第3期112-116,122,共6页
阿尔茨海默病(Alzheimer s disease,AD)是一种进行性神经退行性疾病,以认知障碍、记忆丧失和功能下降为特征。阿尔茨海默病的病理特征包括β-淀粉样斑块和tau蛋白缠结,这些病理改变最终引起大脑特定区域的退化,包括海马体、内嗅皮层和... 阿尔茨海默病(Alzheimer s disease,AD)是一种进行性神经退行性疾病,以认知障碍、记忆丧失和功能下降为特征。阿尔茨海默病的病理特征包括β-淀粉样斑块和tau蛋白缠结,这些病理改变最终引起大脑特定区域的退化,包括海马体、内嗅皮层和新皮层,从而导致阿尔茨海默病的特征性临床症状。阿尔茨海默病病理的确切机制仍不完全清楚,尽管学者们对阿尔茨海默病进行了广泛的研究,但仍然没有有效的治疗方法可以减缓或阻止疾病的进展。因此,迫切需要开发新的针对阿尔茨海默病潜在病理生理学治疗策略。环状RNA(Circular RNAs,circRNAs)是一类非编码RNA,在各种生物过程中发挥着重要作用,它们的调节异常与包括阿尔茨海默病在内的多种疾病的发病机制有关。本综述将阐述阿尔茨海默病患者中环状RNA的失调、失调的机制、环状RNA在阿尔茨海默病疾病进展中的潜在作用和诊断、治疗的意义以及未来的研究方向。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 circrnas 失调
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circRNAs在肝内胆管癌中的作用研究进展和应用前景 被引量:4
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作者 杨新伟 李亮 张宝华 《肝胆胰外科杂志》 CAS 2018年第3期260-262,265,共4页
肝内胆管癌(intrahepatic cholangiocarcinoma,ICC)恶性程度高,易复发和转移,预后差。肝内胆管结石、病毒性肝炎和既往胆道寄生虫感染等炎症相关因素被认为是ICC的临床高危因素。肿瘤相关炎症网络(IL6-STAT3)在肝内胆管癌发生、进展之... 肝内胆管癌(intrahepatic cholangiocarcinoma,ICC)恶性程度高,易复发和转移,预后差。肝内胆管结石、病毒性肝炎和既往胆道寄生虫感染等炎症相关因素被认为是ICC的临床高危因素。肿瘤相关炎症网络(IL6-STAT3)在肝内胆管癌发生、进展之间起着重要的调控作用。环状RNA(circRNAs)是近年来继miRNA和lncRNA之后,RNA研究领域的又一全新热点。已发现某些环状RNA在肿瘤过程中发挥重要的调控作用,但在肝内胆管癌进展和转移过程中的作用仍未明确。通过高通量测序技术在高低转移潜能ICC中筛选出重点circRNAs,以Let-7/STAT3信号通路为切入点开展重点circRNAs-关键信号通路-靶基因-细胞转移表型的机制研究。随着对circRNA在肝内胆管癌发病机制和转移过程中的不断研究,circRNA有望成为ICC早期诊断的标志物。 展开更多
关键词 环状RNA 肝内胆管癌 标志物 转移 转录信号传导子及激活子3(STAT3)
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基于铜死亡相关lncRNAs的胰腺癌预后模型构建与验证 被引量:1
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作者 黄菲菲 杨馨奕 +2 位作者 秦振溜 张杰 金约朋 《肝胆胰外科杂志》 CAS 2024年第6期348-359,共12页
目的研究铜死亡相关lncRNAs在胰腺癌(PAAD)患者中的预后预测价值,并进一步构建预后预测模型。方法从TCGA数据库中下载胰腺癌患者的转录组测序数据和相应临床信息,通过Pearson相关性分析筛选与预后相关的铜死亡相关lncRNAs,先后利用单因... 目的研究铜死亡相关lncRNAs在胰腺癌(PAAD)患者中的预后预测价值,并进一步构建预后预测模型。方法从TCGA数据库中下载胰腺癌患者的转录组测序数据和相应临床信息,通过Pearson相关性分析筛选与预后相关的铜死亡相关lncRNAs,先后利用单因素Cox回归和Lasso回归分析并进一步构建预后模型。根据模型的风险评分中位数,将所有患者分为高风险组和低风险组。通过Kaplan-Meier生存分析、亚组分析、ROC曲线分析及一致性指数分析评估模型的预后预测价值,并利用单因素和多因素回归分析验证模型的独立性。对高、低风险组的差异表达基因进行GO及KEGG功能富集分析,并对高、低风险组患者进行肿瘤突变负荷(TMB)分析、免疫治疗反应预测以及药物敏感性分析。结果通过Pearson相关性分析,确定了127个铜死亡相关的lncRNAs,先后利用单因素Cox回归分析及Lasso回归分析构建了一个基于6个铜死亡相关lncRNAs的预后预测模型。根据模型计算结果将PAAD患者队列分成高风险组和低风险组,Kaplan-Meier生存分析表明低风险组患者的生存时间要长于高风险组(P<0.05)。ROC曲线证明了该模型对胰腺癌患者预后的预测性能良好:1、3、5年ROC曲线下面积分别为0.687、0.753、0.771;基因功能富集分析表明,高、低风险组差异表达基因主要富集于免疫相关通路。此外,高风险组患者的TMB值明显大于低风险组,而TIDE评分明显低于低风险组。最后,通过药物敏感性分析发现不同组的胰腺癌患者对特定药物的敏感性存在统计学差异,对临床用药具有一定的指导意义。结论本研究基于铜死亡相关lncRNAs成功构建了一个PAAD患者预后模型,可精准预测PAAD患者的预后,并为患者的临床药物治疗选择提供个性化指导。 展开更多
关键词 胰腺癌 铜死亡 长链非编码RNA(lncrnas) 预后模型 构建与验证
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肿瘤中lncRNAs和circRNAs关系的研究进展 被引量:7
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作者 高元峰 刘昭前 +2 位作者 李珊 肖望重 欧阳荣 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期1203-1205,共3页
随着基因测序技术的发展,越来越多的长链非编码RNAs(lncRNAs)和环状RNAs(circRNAs)在肿瘤的研究中被发现,并引起学者对它们持续的关注。lncRNAs和circRNAs同属非编码RNA,在起源和功能上两者存在着密切关系,现均被证实在肿瘤发生、发展... 随着基因测序技术的发展,越来越多的长链非编码RNAs(lncRNAs)和环状RNAs(circRNAs)在肿瘤的研究中被发现,并引起学者对它们持续的关注。lncRNAs和circRNAs同属非编码RNA,在起源和功能上两者存在着密切关系,现均被证实在肿瘤发生、发展中发挥重要作用。该文总结了lncRNAs和circRNAs国内外的最新研究进展,专注于它们之间的关系,进一步了解与区分,以期更好识别肿瘤生物标志物。 展开更多
关键词 肿瘤 长链非编码RNA 环状RNA 非编码RNA 生物靶标 药理作用
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西藏牛和三江牛大脑组织中低氧适应相关circRNAs的比较分析 被引量:6
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作者 邓磊 柴志欣 +6 位作者 王嘉博 王会 王吉坤 武志娟 信金伟 钟金城 姬秋梅 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期490-504,共15页
旨在从circRNA层面加深哺乳动物对高原低氧环境适应性的认识,探索西藏牛和三江牛大脑组织中差异表达的circRNA及相关调控网络,为研究circRNA在西藏牛低氧适应性方面的分子调控机制奠定理论基础。本研究分别采集3头4.5岁健康、雌性西藏... 旨在从circRNA层面加深哺乳动物对高原低氧环境适应性的认识,探索西藏牛和三江牛大脑组织中差异表达的circRNA及相关调控网络,为研究circRNA在西藏牛低氧适应性方面的分子调控机制奠定理论基础。本研究分别采集3头4.5岁健康、雌性西藏牛和三江牛的大脑组织作为试验样本,构建cDNA文库进行高通量测序,利用生物信息学方法对宿主基因进行GO和KEGG分析,预测差异表达circRNA下游靶向基因,构建circRNA-miRNA和circRNA-miRNA-mRNA可视化调控网络,辅以RNaseR酶抗性检测和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证测序数据的可靠性。结果,在西藏牛和三江牛的6个样本中,共筛选获得858个显著差异的circRNAs,其中上调表达394个,下调表达464个。其宿主基因共参与49个功能亚类,注释到31条显著富集的信号通路(P<0.05),主要涉及MAPK信号通路、谷氨酸能突触、Rap1信号通路、磷脂酶D信号通路及cGMP-PKG信号通路等生物学过程。靶基因预测结果显示,350个上调和364个下调差异表达circRNAs分别靶向结合492和508个miRNAs。其中,miRNA靶点数最多的是novelcirc017825和novelcirc046762,说明这两个circRNAs可能在西藏牛脑功能调控方面发挥重要作用。circRNA-bta-miR-2284z-mRNA调控网络展示了bta-miR-2284z与circRNA、mRNA间的靶向关系,推测上述circRNAs可能通过充当bta-miR-2284z海绵的方式,间接影响西藏牛脑组织中相关靶向mRNA的表达水平。随机挑选6个circRNA进行RNaseR酶抗性试验和qRT-PCR验证,表达趋势与测序结果一致,说明所获得的circRNA为环状转录本。本研究利用高通量测序技术获得了西藏牛和三江牛大脑组织中circRNA的表达谱及信号通路,并初步构建了circRNA-miRNA-mRNA网络互作模型,为后续进一步探索circRNA参与西藏牛低氧适应性的生物学过程和分子功能,研究circRNA在大型哺乳动物低氧适应性方面的调控机制提供了可靠的数据支持。 展开更多
关键词 西藏牛 三江牛 低氧适应性 转录组 circRNA
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circRNAs在植物中的研究进展 被引量:2
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作者 岳慧芳 任永哲 +2 位作者 王志强 辛泽毓 林同保 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期386-392,共7页
circular RNA(circRNA)是一类具有闭合环状结构的内源性非编码RNA,广泛存在于多种真核生物中,具有结构稳定、序列保守、表达特异性等特征。研究表明circRNAs可作为海绵(sponge)吸附microRNA(miRNA)并参与其表达调控过程,也可通过与蛋白... circular RNA(circRNA)是一类具有闭合环状结构的内源性非编码RNA,广泛存在于多种真核生物中,具有结构稳定、序列保守、表达特异性等特征。研究表明circRNAs可作为海绵(sponge)吸附microRNA(miRNA)并参与其表达调控过程,也可通过与蛋白互作调控基因表达等生物过程;发现circRNAs不仅参与植物激素信号转导等生理过程,而且还能在植物响应逆境胁迫中起到重要作用。该文主要对近年来国内外有关circRNAs的类型、形成机制、功能及其在植物生长发育过程中的研究进展进行了综述,并讨论了circRNAs的研究意义及存在的问题,为进一步研究circRNAs在植物中的作用机制及其基因调控网络提供参考。 展开更多
关键词 circrnas 基因表达 植物 研究进展
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