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细菌中RNase HI介导RNA降解的研究进展
1
作者
沈崇杰
包乌尼尔
莫日根
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期1031-1043,共13页
在细菌细胞中,为了维持基因组稳定和正常的生命活动,RNase HI通常以降解RNA/DNA杂合链中RNA的方式来防止复制中引物的积累以及转录中R环的形成。RNase HI对底物的识别主要依赖于DNA与RNA结合槽,对底物的催化主要依赖于DEDD基序和位于活...
在细菌细胞中,为了维持基因组稳定和正常的生命活动,RNase HI通常以降解RNA/DNA杂合链中RNA的方式来防止复制中引物的积累以及转录中R环的形成。RNase HI对底物的识别主要依赖于DNA与RNA结合槽,对底物的催化主要依赖于DEDD基序和位于活性位点附近柔性环中的一个组氨酸。以Mg2+为代表的金属离子在催化过程中发挥了至关重要的作用。杂交双链中ssDNA突出部分的类型决定了RNase HI的作用模式:在没有突出或在ssDNA的5′端存在突出部分的情况下,RNase HI作为一种非序列特异性核酸内切酶随机地降解RNA;当ssDNA的3′端存在突出部分时,RNase HI依靠5′核酸外切酶活性对RNA进行连续切割。RNase HI、Rep、DinG和UvrD通过与单链DNA结合蛋白(single-stranded DNA-binding protein,SSB)的C端尾部的6个残基相互作用被招募到复制叉附近,并可能以协作的方式解决复制−转录冲突。RNase HI的缺失或活性降低将引起DNA结构不稳定、基因突变、转录装置回溯和复制不协调等一系列有害后果。RNase HI在反义技术、R环检测和联合抗生素的靶向治疗等方面展现出巨大的应用价值。关于RNase HI与其他酶降解引物的合作机制也是未来值得研究的一个内容。
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关键词
rnase
hi
RNA/DNA杂合链
RNA降解
DNA复制
转录
引物
R环
原文传递
题名
细菌中RNase HI介导RNA降解的研究进展
1
作者
沈崇杰
包乌尼尔
莫日根
机构
内蒙古大学生命科学学院
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期1031-1043,共13页
基金
国家自然科学基金(32260233)
内蒙古自治区细胞分子调控重点实验室项目(2021PT0002)
内蒙古大学本科一流课程建设项目(21400-12105/014)。
文摘
在细菌细胞中,为了维持基因组稳定和正常的生命活动,RNase HI通常以降解RNA/DNA杂合链中RNA的方式来防止复制中引物的积累以及转录中R环的形成。RNase HI对底物的识别主要依赖于DNA与RNA结合槽,对底物的催化主要依赖于DEDD基序和位于活性位点附近柔性环中的一个组氨酸。以Mg2+为代表的金属离子在催化过程中发挥了至关重要的作用。杂交双链中ssDNA突出部分的类型决定了RNase HI的作用模式:在没有突出或在ssDNA的5′端存在突出部分的情况下,RNase HI作为一种非序列特异性核酸内切酶随机地降解RNA;当ssDNA的3′端存在突出部分时,RNase HI依靠5′核酸外切酶活性对RNA进行连续切割。RNase HI、Rep、DinG和UvrD通过与单链DNA结合蛋白(single-stranded DNA-binding protein,SSB)的C端尾部的6个残基相互作用被招募到复制叉附近,并可能以协作的方式解决复制−转录冲突。RNase HI的缺失或活性降低将引起DNA结构不稳定、基因突变、转录装置回溯和复制不协调等一系列有害后果。RNase HI在反义技术、R环检测和联合抗生素的靶向治疗等方面展现出巨大的应用价值。关于RNase HI与其他酶降解引物的合作机制也是未来值得研究的一个内容。
关键词
rnase
hi
RNA/DNA杂合链
RNA降解
DNA复制
转录
引物
R环
Keywords
rnase hi
RNA/DNA hybrids
RNA degradation
DNA replication
transcription
primer
R-loop
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
细菌中RNase HI介导RNA降解的研究进展
沈崇杰
包乌尼尔
莫日根
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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