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RPL35A基因在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的表达及其生物信息学分析
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作者 贺名扬 刘爱菊 +4 位作者 张鑫 周荣艳 田树军 白莹 陈晓勇 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第4期85-90,共6页
本实验旨在探究核糖体蛋白基因(RPL35A)在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的mRNA表达及其生物学功能。选取1月龄、7月龄和13月龄寒泊公羊各3只,采集背最长肌,利用转录组测序(RNA-seq)与荧光定量PCR(qRT-PCR)技术相结合,分析比较RPL35A基因的... 本实验旨在探究核糖体蛋白基因(RPL35A)在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的mRNA表达及其生物学功能。选取1月龄、7月龄和13月龄寒泊公羊各3只,采集背最长肌,利用转录组测序(RNA-seq)与荧光定量PCR(qRT-PCR)技术相结合,分析比较RPL35A基因的表达丰度。应用生物信息学方法分析RPL35A基因的核苷酸和氨基酸序列的分子结构特征、蛋白质特性及网络互作。结果表明:1月龄寒泊羊背最长肌RPL35A基因mRNA高于7月龄,后者低于13月龄,RNA-seq与qRT-PCR结果趋势一致。绵羊RPL35A基因核苷酸及氨基酸序列与山羊、牛、家马和猪的相似性较高;RPL35A编码蛋白为碱性蛋白(PI=11.07)、亲水蛋白(亲水值为-0.579),稳定性较好,属于非跨膜蛋白,在线粒体(69.6%)、细胞核(17.4%)、细胞质(8.7%)、过氧化物酶体(4.3%)内发挥作用。蛋白互作网络分析表明RPL35A蛋白在核糖体合成过程中发挥着重要作用。综上,RPL35A基因可能参与寒泊羊肌肉生长发育过程。 展开更多
关键词 rpl35a基因 寒泊羊 生物信息学 MRNA QRT-PCR
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