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RPL35A基因在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的表达及其生物信息学分析
1
作者
贺名扬
刘爱菊
+4 位作者
张鑫
周荣艳
田树军
白莹
陈晓勇
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2021年第4期85-90,共6页
本实验旨在探究核糖体蛋白基因(RPL35A)在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的mRNA表达及其生物学功能。选取1月龄、7月龄和13月龄寒泊公羊各3只,采集背最长肌,利用转录组测序(RNA-seq)与荧光定量PCR(qRT-PCR)技术相结合,分析比较RPL35A基因的...
本实验旨在探究核糖体蛋白基因(RPL35A)在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的mRNA表达及其生物学功能。选取1月龄、7月龄和13月龄寒泊公羊各3只,采集背最长肌,利用转录组测序(RNA-seq)与荧光定量PCR(qRT-PCR)技术相结合,分析比较RPL35A基因的表达丰度。应用生物信息学方法分析RPL35A基因的核苷酸和氨基酸序列的分子结构特征、蛋白质特性及网络互作。结果表明:1月龄寒泊羊背最长肌RPL35A基因mRNA高于7月龄,后者低于13月龄,RNA-seq与qRT-PCR结果趋势一致。绵羊RPL35A基因核苷酸及氨基酸序列与山羊、牛、家马和猪的相似性较高;RPL35A编码蛋白为碱性蛋白(PI=11.07)、亲水蛋白(亲水值为-0.579),稳定性较好,属于非跨膜蛋白,在线粒体(69.6%)、细胞核(17.4%)、细胞质(8.7%)、过氧化物酶体(4.3%)内发挥作用。蛋白互作网络分析表明RPL35A蛋白在核糖体合成过程中发挥着重要作用。综上,RPL35A基因可能参与寒泊羊肌肉生长发育过程。
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关键词
rpl35a基因
寒泊羊
生物信息学
MRNA
QRT-PCR
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职称材料
题名
RPL35A基因在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的表达及其生物信息学分析
1
作者
贺名扬
刘爱菊
张鑫
周荣艳
田树军
白莹
陈晓勇
机构
河北农业大学动物科技学院
河北工程大学生命科学与食品工程学院
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2021年第4期85-90,共6页
基金
农业农村部政府采购服务项目(16190050)
河北农业大学人才引进项目(YJ201938)。
文摘
本实验旨在探究核糖体蛋白基因(RPL35A)在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的mRNA表达及其生物学功能。选取1月龄、7月龄和13月龄寒泊公羊各3只,采集背最长肌,利用转录组测序(RNA-seq)与荧光定量PCR(qRT-PCR)技术相结合,分析比较RPL35A基因的表达丰度。应用生物信息学方法分析RPL35A基因的核苷酸和氨基酸序列的分子结构特征、蛋白质特性及网络互作。结果表明:1月龄寒泊羊背最长肌RPL35A基因mRNA高于7月龄,后者低于13月龄,RNA-seq与qRT-PCR结果趋势一致。绵羊RPL35A基因核苷酸及氨基酸序列与山羊、牛、家马和猪的相似性较高;RPL35A编码蛋白为碱性蛋白(PI=11.07)、亲水蛋白(亲水值为-0.579),稳定性较好,属于非跨膜蛋白,在线粒体(69.6%)、细胞核(17.4%)、细胞质(8.7%)、过氧化物酶体(4.3%)内发挥作用。蛋白互作网络分析表明RPL35A蛋白在核糖体合成过程中发挥着重要作用。综上,RPL35A基因可能参与寒泊羊肌肉生长发育过程。
关键词
rpl35a基因
寒泊羊
生物信息学
MRNA
QRT-PCR
Keywords
rpl
35a
gene
Hanper sheep
Bioinformatics
mRNA
qRT-PCR
分类号
S826.2 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
RPL35A基因在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的表达及其生物信息学分析
贺名扬
刘爱菊
张鑫
周荣艳
田树军
白莹
陈晓勇
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2021
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