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RT-PCR一步法检测甲型肝炎活病毒方法的建立 被引量:3
1
作者 李淑焱 刘大维 +6 位作者 田旺 刘令九 薛勇 岳丹 顾丹阳 王信鹏 刘景晔 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2005年第4期28-31,共4页
建立灵敏、特异、快速检测甲型肝炎活病毒(HAV)的方法。提取HAV总RNA,选用HAV高保守区为目标区,设计合成一对引物,通过RT-PCR反应扩增其核酸,用琼脂糖凝胶电泳法检测其扩增产物,紫外灯下观察,约200bp处为目标片段,根据观察结果,计算HAV... 建立灵敏、特异、快速检测甲型肝炎活病毒(HAV)的方法。提取HAV总RNA,选用HAV高保守区为目标区,设计合成一对引物,通过RT-PCR反应扩增其核酸,用琼脂糖凝胶电泳法检测其扩增产物,紫外灯下观察,约200bp处为目标片段,根据观察结果,计算HAV滴度。RT-PCR一步法快速、灵敏、重复性好、特异性强,可用于甲型肝炎活病毒检测。 展开更多
关键词 rt—PCR 引物 高保守区 甲型肝炎病毒
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基于边缘检测的焊接RT图像中缺陷分割方法 被引量:1
2
作者 耿道华 徐桂云 +1 位作者 李国庆 王恩元 《煤矿机械》 北大核心 2006年第10期77-79,共3页
针对RT焊接图像,提出一种sobel算子与动态的自适应阈值相结合的边缘检测方法,并利用基于奇偶判断的填充算法,准确提取缺陷。对RT焊接图像进行边缘检测分割前,为去除噪声、检测和识别特征更加容易,首先在图像预处理中去除焊缝外背景,并... 针对RT焊接图像,提出一种sobel算子与动态的自适应阈值相结合的边缘检测方法,并利用基于奇偶判断的填充算法,准确提取缺陷。对RT焊接图像进行边缘检测分割前,为去除噪声、检测和识别特征更加容易,首先在图像预处理中去除焊缝外背景,并进行了全方位多级组合滤波、局部区域的直方图均衡处理,然后还利用列灰度波形分析划分焊缝内区域。 展开更多
关键词 rt焊接图像 缺陷 边缘检测 分割 区域填充
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HBV RT区耐药变异对HBsAg的影响 被引量:2
3
作者 庞亚博 汪莉萍 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2018年第10期1191-1194,共4页
由于HBV DNA S区完全重叠于RT区,当RT区某些碱基发生改变时,不可避免地会导致S区相应位点发生改变,从而使S区编码的HBsAg发生变化。本文就RT区耐药变异对HBsAg的影响作一概述。
关键词 HBVrt S区 耐药变异 HBSAG
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Cloning and Sequence Analysis on 3′ Coding Region of Wild Boar and Cross Bred Pig Myostatin Gene
4
作者 LIUDi YANGXiu-qin YANGJia-fang 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2004年第2期148-150,共3页
Myostatin, with a highly conservative gene among breeds is a negative regulator of muscle. The 3′ coding regions of wild boar and crossbred pig myostatin were cloned by RT-PCR and sequenced respectively. The homology... Myostatin, with a highly conservative gene among breeds is a negative regulator of muscle. The 3′ coding regions of wild boar and crossbred pig myostatin were cloned by RT-PCR and sequenced respectively. The homology of the nucleotide sequence between wild boar and crossbred pig was 100% and there was no difference in this region compared with pig myostatin gene of Genbank. This indicated that there was not change of gene sequence in this region during the evolution processes. 展开更多
关键词 myostatin gene rt-PCR 3'coding regions
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内蒙古自治区部分地区规模化牛场牛冠状病毒流行病学调查 被引量:1
5
作者 陈柯佳 谢梦圆 +6 位作者 郭宇 尚和卫 常继涛 高登军 张娜 王建龙 徐晓静 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2023年第14期77-81,共5页
为了解内蒙古地区规模化牛场牛冠状病毒(Bovine coronavirus,BCoV)的流行情况,试验分别采用酶联免疫吸附测定(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)和逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR... 为了解内蒙古地区规模化牛场牛冠状病毒(Bovine coronavirus,BCoV)的流行情况,试验分别采用酶联免疫吸附测定(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)和逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)方法对2020年采自内蒙古部分地区规模化牛场的500份血液样本的BCoV抗体和580份粪便样本的BCoV抗原进行检测,对不同地区、月龄和季节的BCoV抗体和抗原阳性率进行统计。结果表明:500份血液样本的BCoV抗体总阳性率为48.80%,其中呼和浩特市为51.50%,鄂尔多斯市为48.33%,巴彦淖尔市为45.00%;0~2月龄、3~6月龄、7~18月龄、18月龄以上牛血液样本的BCoV抗体阳性率分别为55.29%、40.00%、35.00%、52.94%;春季、夏季、秋季、冬季牛血液样本的BCoV抗体阳性率分别为67.22%、16.67%、23.75%、52.22%。580份粪便样本的BCoV抗原总阳性率为18.79%,其中呼和浩特市为16.79%,鄂尔多斯市为14.44%,巴彦淖尔市为30.00%;不同月龄牛均存在不同程度的BCoV感染,0~2月龄、3~6月龄、7~18月龄、18月龄以上牛粪便样本的BCoV抗原阳性率分别为34.42%、10.00%、11.76%、8.42%;春季、夏季、秋季、冬季牛粪便样本的BCoV抗原阳性率分别为25.94%、1.67%、15.29%、16.84%。说明内蒙古地区BCoV呈普遍流行趋势,在春季牛更易感染BCoV,0~2月龄牛更易感染BCoV,因此应做好内蒙古地区BCoV的防控工作,并加强对易感牛群BCoV的血清学、病原学监测,实时调整疫病防控措施,减少牛腹泻疾病的发生。 展开更多
关键词 牛冠状病毒(BCoV) 酶联免疫吸附测定(ELISA) 逆转录-聚合酶链反应(rt-PCR) 流行病学调查 内蒙古地区
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广西地区传染性囊病病毒超强毒株的分离鉴定及其VP2基因高变区的序列分析 被引量:8
6
作者 何秀苗 官丁明 +3 位作者 韦平 禤金彩 屈祖平 秦爱建 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2009年第9期7-9,共3页
研究通过鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种、琼脂扩散试验、致细胞病变和RT-PCR等方法,成功从广西疑似病鸡的腔上囊组织中获得了8个传染性囊病病毒(IBDV)毒株,分离株可致攻毒鸡发病率100%,死亡率60%~90%;分子特征上,8个分离株VP2... 研究通过鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种、琼脂扩散试验、致细胞病变和RT-PCR等方法,成功从广西疑似病鸡的腔上囊组织中获得了8个传染性囊病病毒(IBDV)毒株,分离株可致攻毒鸡发病率100%,死亡率60%~90%;分子特征上,8个分离株VP2高变区在酶切位点和特征性氨基酸上均属于vvIBDV的特征。同源性分析表明,8个分离株之间在核苷酸和氨基酸上的同源性分别为96.8%~99.1%和95.9%~99.3%,与其他参考vvIBDV毒株的同源性分别为94%~97.7%和92.5%~97.3%,而与常用疫苗株Bursine-2、B87(in),变异株GLS,经典强毒株的同源性仅有90%左右。遗传进化树上,8个分离株与国内外参考vvIBDV同处于一个大分支,与疫苗株和经典强毒株的距离较远,8个分离株与中国内地毒株SD1/97的亲缘关系最近。研究表明,广西仍然存在vvIBDV的流行。 展开更多
关键词 传染性囊病 超强毒株 rt—PCR VP2基因高变区
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人sCD40L基因的克隆及表达 被引量:1
7
作者 程琳玲 聂红 +5 位作者 王利 尤强 路丽明 沈佰华 张冬青 李宁丽 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期125-127,共3页
目的  克隆人sCD40L基因片段,并在原核细胞中表达。方法用RT-PCR技术,从激活的人外周血淋巴细胞总RNA中,扩增CD40L胞外区cDNA,并克隆至载体pGEM-T。测序验证后,转至载体PQE31中,并在大肠杆... 目的  克隆人sCD40L基因片段,并在原核细胞中表达。方法用RT-PCR技术,从激活的人外周血淋巴细胞总RNA中,扩增CD40L胞外区cDNA,并克隆至载体pGEM-T。测序验证后,转至载体PQE31中,并在大肠杆菌M15中进行表达,最后通过亲和层析柱得到纯化蛋白。结果纯化所得的产物经Western blot证实,确为人sCD40L蛋白。结论 应用基因重组法构建了人sCD40L基因片段,并在原核细胞内成功地进行了表达,为今后进一步研究CD40L与凋亡、疾病的发病机制及临床治疗奠定了基础。 展开更多
关键词 CD40L 胞外区 rt-PCR WESTERNBLOT 基因克隆 基因表达
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传染性法氏囊病病毒广西流行毒株的分离鉴定及其遗传进化分析 被引量:2
8
作者 何秀苗 官丁明 +3 位作者 韦平 禤金彩 屈祖平 秦爱建 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期650-653,659,共5页
为了解传染性法氏囊病病毒(IBDV)广西流行株的遗传变异规律,本研究通过鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种的方法对2006年~2007年间采集自广西各鸡场的疑似传染性法氏囊病(IBD)的病料进行病毒分离,设计针对VP2高变区(vVP2)的引物对分离物通过RT-... 为了解传染性法氏囊病病毒(IBDV)广西流行株的遗传变异规律,本研究通过鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种的方法对2006年~2007年间采集自广西各鸡场的疑似传染性法氏囊病(IBD)的病料进行病毒分离,设计针对VP2高变区(vVP2)的引物对分离物通过RT-PCR进行鉴定及序列分析。共分离出9个IBDV毒株,其ELD50在105/0.2mL~106.5/0.2mL之间。分离株vVP2序列通过具有分型意义的酶切位点和关键位点氨基酸分析,证实9个分离株均属于vvIBDV。同源性分析表明,9个分离株之间在核苷酸和氨基酸的同源性分别为97.2%~100%和95.2%~100%,与vvIBDV参考株同源性分别为93.8%~98.2%和92.4%~98.6%,而与常用疫苗株Bursine-2、B87(in),变异株GLS,经典毒株,中等偏强毒力株YL052的同源性仅有90%左右。遗传进化分析发现,分离株与vvIBDV参考株同处于1个大分支,与DV86和OKYM株的亲缘关系最近,与2000年~2005年间广西分离的vvIBDV株距离较远,它们之间形成了明显的分群。研究表明,近2年来广西仍然存在vvIBDV的流行。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病 广西流行株 超强毒株 rt-PCR VP2基因高变区
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从兔外周血直接克隆B细胞κ轻链的可变区 被引量:1
9
作者 周吉航 周世权 +3 位作者 王晔恺 曾芳 马利娜 刘晓光 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期479-483,共5页
目的从兔外周血总RNA中直接扩增出B细胞κ轻链的可变区序列。方法首先从IMGT/GENE-DB数据库中获取大耳白兔Ig胚系基因Vκ(IGKV)、Jκ(IGKJ)和Cκ(IGKC)的cDNA序列、设计引物,然后以非免疫兔外周血总RNA为模板进行RT-PCR扩增,回收产物并... 目的从兔外周血总RNA中直接扩增出B细胞κ轻链的可变区序列。方法首先从IMGT/GENE-DB数据库中获取大耳白兔Ig胚系基因Vκ(IGKV)、Jκ(IGKJ)和Cκ(IGKC)的cDNA序列、设计引物,然后以非免疫兔外周血总RNA为模板进行RT-PCR扩增,回收产物并克隆到T载体,随机挑选单克隆测序,最终将序列提交到IMGT/V-QUEST,分析出每个克隆的Vκ-Jκ组合,并利用BioEdit的本地Blast程序比较出Cκ的基因型。结果共设计出4对引物,其中引物对RK.C1[4-5-9]无产物,引物对RK.C1[1-2-7]、RK.C1[3-6-8]和RK.C2[1-2-3-4]有产物,分别回收、克隆到T载体后各挑取20个克隆,共获得51个克隆的插入子序列。没有任何2个克隆的插入子序列完全相同,每个克隆均包含完整的兔Vκ、Jκ及Cκ的5’端序列,其中Vκ-Jκ-IGKC1组合的克隆33个,Vκ-Jκ-IGKC2组合的克隆18个;68个Vκ胚系基因中有22个出现,其中频率最高的是IGKV1S10*01(12次),其次是IGKV1S36*01、IGKV1S37*01和IGKV1S4*01(各5次),其余均为3次以下;8个Jκ胚系基因中只有1个出现,为IGKJ1-2*01;2个Cκ基因的等位基因分别为IGKC1*01和IGKC2*03。33个Vκ-[IGKJ1-2*01]-[IGKC1*01]克隆中有17种不同的组合方式,其中频率最高的为[IGKV1S10*01]-[IGKJ1-2*01]-[IGKC1*01](7次)。18个Vκ-[IGKJ1-2*01]-[IGKC2*03]克隆中有11种不同的组合方式,频率最高的为[IGKV1S10*01]-[IGKJ1-2*01]-[IGKC2*03](5次)。Vκ-Jκ-Cκ组合方式相同的克隆,序列仍具有明显的差异。结论利用自行设计的兼并引物,成功并特异地从兔外周血总RNA中直接扩增出了κ轻链的可变区,且产物具有良好的多样性,但所有Vκ-Jκ-Cκ组合中只出现了1种Jκ基因。 展开更多
关键词 外周血 免疫球蛋白 轻链 可变区 反转录聚合酶链式反应
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从兔外周血直接克隆IgG重链可变区 被引量:1
10
作者 周世权 廖智 +2 位作者 杨林 周吉航 刘晓光 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期762-766,共5页
目的从兔外周血总RNA中直接扩增出IgG重链可变区基因。方法先从IMGT/GENE-DB数据库中获取编码大耳白兔免疫球蛋白(Ig)重链可变区(VH)的3个胚系基因片段VH(IGHV)、D(IGHD)和JH(IGHJ),以及编码γ重链恒定区(CH)基因Cγ(IGHG)的cDNA序列,... 目的从兔外周血总RNA中直接扩增出IgG重链可变区基因。方法先从IMGT/GENE-DB数据库中获取编码大耳白兔免疫球蛋白(Ig)重链可变区(VH)的3个胚系基因片段VH(IGHV)、D(IGHD)和JH(IGHJ),以及编码γ重链恒定区(CH)基因Cγ(IGHG)的cDNA序列,然后设计嵌套引物,以兔外周血总RNA为模板,进行RT-PCR和Nested-PCR扩增,产物经胶回收后克隆到T载体,随机挑选白色克隆测序,最后将序列用Bioedit软件的Local Blast功能比对出Cγ的基因型,同时提交到IMGT/V-QUEST分析出所属的VH、D和JH胚系基因。结果获得25个克隆的插入子序列,每个克隆均为兔IgG重链可变区的编码基因,且包含了完整的VH、D、JH胚系基因片段,以及Cγ基因第1个外显子(CH1)序列的5’端部分,但没有任何2个克隆的序列完全相同。37个IGHV功能基因出现了2个;11个IGHD功能基因出现了8个;11个IGHJ功能基因出现了4个。VH-D-JH组合方式共出现18种,即使VH-D-JH组合方式相同,序列仍具有明显的差异。结论从兔外周血总RNA中直接扩增出了IgG重链可变区,自行设计的引物显示出了高度的特异性和良好的兼并性。 展开更多
关键词 外周血 免疫球蛋白 重链 可变区 反转录-聚合酶链反应 序列分析
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鸡传染性法氏囊病一个自然病例的病原分离及其分子特征分析 被引量:4
11
作者 何秀苗 官丁明 +1 位作者 韦平 秦爱建 《中国家禽》 北大核心 2009年第14期18-22,共5页
设计针对传染性法氏囊病病毒(IBDV)VP2基因高变区(vVP2)的引物对湖南永州送检的一群疑似传染性法氏囊病病例的法氏囊组织通过逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术进行检测,应用鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种的方法对阳性样品进行病毒分离,同时... 设计针对传染性法氏囊病病毒(IBDV)VP2基因高变区(vVP2)的引物对湖南永州送检的一群疑似传染性法氏囊病病例的法氏囊组织通过逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术进行检测,应用鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种的方法对阳性样品进行病毒分离,同时对IBDV分离株中的vVP2进行限制性内切酶分析和核苷酸序列测定,分析关键位点的氨基酸特征和同源性,绘制遗传进化树。结果成功分离出了4个IBDV毒株,其中HuN0801、HuN0802和HuN0803的特征性位点的氨基酸为222A、249Q、254G、256I、279D、284A、294I和299S,属于vvIDBV的特征,并与vvIBDV参考株具有较高的同源性;HuN0804的则为222P、249Q、254G、256V、279N、284T、294I和299N,符合弱毒株的特征,与弱毒参考株的同源性较高;4个分离株与常用疫苗株的同源性普遍较低。遗传进化分析表明,3个vvIBDV分离株与vvIBDV参考株和中等偏强毒力株YSLMB同处于一个大的分支,并与欧洲株DV86、湖南株HuN亲缘关系最近;而HuN0804与弱毒株、经典毒株和常用疫苗株同处于一个大分支。研究表明,本病例中存在不同致病型IBDV毒株的混合感染。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病 超强毒株 弱毒株 rt-PCR VP2基因高变区 分子特征
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乙肝免疫球蛋白抗体的多样性 被引量:1
12
作者 周世权 周吉航 +4 位作者 徐岳军 庄晓玲 李翊卫 李世波 刘晓光 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期479-484,共6页
目的基于重链可变区的编码基因序列对乙肝免疫球蛋白(HBIG)中的IgG抗体进行分类。方法借用文献提供的引物,以HBsAb强阳性健康个体外周血中的总RNA为模板进行RT-PCR和Nested-PCR扩增,通过将产物克隆到T载体、随机挑选测序,分析并统计出... 目的基于重链可变区的编码基因序列对乙肝免疫球蛋白(HBIG)中的IgG抗体进行分类。方法借用文献提供的引物,以HBsAb强阳性健康个体外周血中的总RNA为模板进行RT-PCR和Nested-PCR扩增,通过将产物克隆到T载体、随机挑选测序,分析并统计出插入子的VH-D-JH-Cγ组合方式。结果共获得56个有效克隆,全部为人VH3-D-JH-Cγ序列,可分成49种序列,其中5种序列有2或3个序列完全相同的克隆。4个Cγ功能基因也全部出现,其中IGHG2频率最高(28次);23个VH3功能基因有11个出现,其中频率最高的是IGHV3-23(29次);23个D功能基因有16个出现,其中频率最高的是IGHD1-26(8次);6个JH功能基因则全部出现,其中频率最高的是IGHJ4(33次)。VH3-D-JH组合有33种,频率最高的是IGHV3-23/IGHD1-26/IGHJ4(8次),其中5种与IGHG2拼接,但这5种VH3-D-JH-Cγ2序列仍有明显的差异。结论成功地从HBsAb强阳性健康个体外周血中克隆到由VH3亚家族参与重排的IgG重链可变区序列;初步证实可变区序列不仅在VH3-D-JH-Cγ组合方式上具有极大的多样性,而且在序列上也具有明显的差异性;基于可变区测序对IgG抗体或B细胞进行分类是可行的,但需大大提高挑取克隆的数量或改用新一代大规模测序技术。 展开更多
关键词 乙肝免疫球蛋白 重链 可变区 反转录一聚合酶链反应 DNA测序
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小型猪专用复合麻醉剂对大鼠不同脑区β-arrestin2基因mRNA转录的影响 被引量:1
13
作者 牛栋梁 姜胜 +3 位作者 李新 陈皓 范宏刚 王洪斌 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期839-843,共5页
为研究小型猪专用复合麻醉剂(XFM)对大鼠不同脑区β-arrestin2mRNA转录的影响,将30只大鼠随机分为对照组(C组)和麻醉组(M组),M组分为4个亚组:M1组(注射XFM后大鼠翻正反射消失即刻)、M2组(注射XFM后大鼠翻正反射消失后1h)、M3组(注射XFM... 为研究小型猪专用复合麻醉剂(XFM)对大鼠不同脑区β-arrestin2mRNA转录的影响,将30只大鼠随机分为对照组(C组)和麻醉组(M组),M组分为4个亚组:M1组(注射XFM后大鼠翻正反射消失即刻)、M2组(注射XFM后大鼠翻正反射消失后1h)、M3组(注射XFM后大鼠翻正反射恢复即刻)和M4组(注射XFM后大鼠翻正反射恢复后1h),各组大鼠到达预定的时间点后分别采取脑组织,应用实时荧光定量PCR技术检测各组织中β-arrestin2mRNA转录量。结果显示,大鼠经过XFM麻醉后,大脑皮层、小脑β-arrestin2mRNA的相对转录量在麻醉期间受到明显的抑制,与对照组相比差异极显著(P<0.01),海马和脑干β-arrestin2mRNA的相对转录量在麻醉期间明显增加,与对照组相比差异极显著(P<0.01)。结果表明,XFM能影响中枢神经系统中β-arrestin2mRNA的转录,为继续探索麻醉对MAPK通路的影响奠定基础。 展开更多
关键词 小型猪专用复合麻醉剂 不同脑区 β-arrestin2mRNA 实时荧光定量PCR
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水稻黑条矮缩病毒与南方水稻黑条矮缩病毒的检测及其在江西省的区域分布 被引量:6
14
作者 杨迎青 李湘民 +3 位作者 兰波 钟玲 孟凡 张洁 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期918-921,927,共5页
为明确水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)和南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)这2种病毒在江西省的分布,首先从永修县、南昌县和大余县等8县市采集水稻疑似矮缩病株,用2种病毒一步检测法对这2种病毒进行RT-PCR检测。结果表明:永修县所有样品均检出RBS... 为明确水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)和南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)这2种病毒在江西省的分布,首先从永修县、南昌县和大余县等8县市采集水稻疑似矮缩病株,用2种病毒一步检测法对这2种病毒进行RT-PCR检测。结果表明:永修县所有样品均检出RBSDV,检出率为100%;南昌县同时检出RBSDV和SRBSDV,检出率分别为90%和20%,其中南昌县的1个样品同时检出2种病毒,存在复合侵染;大余县、莲花县、崇义县、婺源县、万安县和井冈山市等6县的所有样品均检出SRBSDV,检出率100%。然后,对这2种病毒在江西省的分布特点进行分析。统计分析结果表明:江西省西南部和东北部只有SRBSDV分布,江西省北部只有RBSDV分布,而处于以上3个病毒重发区之间的南昌县同时有RBSDV和SRBSDV分布。同时基于S9序列和S10序列建立这2种病毒及其近缘种的系统发育树,分析其亲缘关系。 展开更多
关键词 水稻黑条矮缩病毒 南方水稻黑条矮缩病毒 rt-PCR 检测 区域分布
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甜菜花叶病毒新疆分离物基因组3′末端序列分析 被引量:6
15
作者 向海英 李菁博 +3 位作者 王颖 韩成贵 李大伟 于嘉林 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期204-206,共3页
The 3’ terminal genomic 1 611 nucleotides of Beet mosaic virus Xinjiang isolate(BtMV-XJ)from China was determined(GenBank accession number DQ345522).The sequence started within a single open reading frame which was e... The 3’ terminal genomic 1 611 nucleotides of Beet mosaic virus Xinjiang isolate(BtMV-XJ)from China was determined(GenBank accession number DQ345522).The sequence started within a single open reading frame which was expected to encode part C-terminus of NIb protein of 201 amino acids,complete capsid protein(CP)of 276 amino acids and followed by a 3’ untranslated region(UTR)of 168 nucleotides.The comparison of sequence diversity among BtMV-XJ and other three previously reported isolates revealed that it shared 98.3%,98.1%,91.4% nucleotide identity,and 99.79%,99.58%,97.69% deduced aa sequence identity with the corresponding 3’ terminal regions of BtMV-SL,BtMV-UK and BtMV-US,respectively,and that most nucleotide mutations were silent with no effect on aa sequence.In addition,a virus-specific and ra-pid RT-PCR detection method of BtMV was also developed based on the nucleotide sequence obtained. 展开更多
关键词 花叶病毒 序列分析 分离物 甜菜 新疆 马铃薯Y病毒属 基因组 分子结构特征
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草鱼MHCI区基因的表达特征 被引量:1
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作者 吴凡 郭稳杰 +4 位作者 詹柒凤 张锋 胡晓坤 梁旭方 刘红 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期60-66,共7页
为全面了解草鱼MHC I区基因及其表达特征,利用已知斑马鱼MHC I区基因序列,通过本地Blast得到草鱼MHC I区的部分基因序列。采用RT-PCR技术,检测MHC I区BRD2、KNSL2、RXRB、TAPBP、FABGL、MHC Ia、PSMB9以及TAP2等8个基因在健康草鱼各组... 为全面了解草鱼MHC I区基因及其表达特征,利用已知斑马鱼MHC I区基因序列,通过本地Blast得到草鱼MHC I区的部分基因序列。采用RT-PCR技术,检测MHC I区BRD2、KNSL2、RXRB、TAPBP、FABGL、MHC Ia、PSMB9以及TAP2等8个基因在健康草鱼各组织的表达水平。结果表明,除FABGL在肾脏表达量最高外,其他基因都在血液中的表达量最高。通过实时荧光定量PCR检测草鱼在嗜水气单孢菌感染后4、12、24、48及96h,MHC I区免疫相关基因在脾脏和肾脏中的表达情况。结果发现,BRD2表达量分别在12h和24h在肾脏和脾脏中达到最高;MHC Ia表达量在脾脏和肾脏中都先上升后下降,并都在24h达最大值;PSMB9表达量在脾脏先上升后下降,在12h达最大值,在肾脏中则先下降后上升,在24h达最大值;TAP2在脾脏和肾脏中整体呈先下降后上升的趋势,在24h都达最大值,并最后都回调至正常范围。BRD2、MHC Ia、PSMB9、TAP2的表达量在攻毒后都有显著性变化,表明这4个基因在草鱼免疫方面具有重要的作用。 展开更多
关键词 MHC I区基因 半定量PCR 组织表达 实时荧光定量PCR 草鱼
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5例应用恩替卡韦治疗的慢性HBV感染者发生HBV逆转录酶区单独A181位点突变的分析 被引量:19
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作者 赵攀 钟彦伟 徐东平 《临床肝胆病杂志》 CAS 2011年第3期289-291,共3页
目的探讨恩替卡韦与HBV逆转录酶区单独A181位点突变的关系。方法对5例应用恩替卡韦治疗后逆转录酶区出现单独A181位点突变的慢性HBV感染者做回顾性调查与随访,并分析其突变前后病毒学指标的变化。结果 5例应用恩替卡韦治疗的慢性HBV感... 目的探讨恩替卡韦与HBV逆转录酶区单独A181位点突变的关系。方法对5例应用恩替卡韦治疗后逆转录酶区出现单独A181位点突变的慢性HBV感染者做回顾性调查与随访,并分析其突变前后病毒学指标的变化。结果 5例应用恩替卡韦治疗的慢性HBV感染者中,3例发生逆转录酶区A181V突变的病例均对恩替卡韦产生了应答,2例发生逆转录酶区A181T突变的病例血清HBV DNA也出现了明显下降。结论 5例应用恩替卡韦治疗的慢性HBV感染者逆转录酶区的单独A181位点的突变为自然产生,HBV逆转录酶区发生自然突变的临床意义需要进一步明确。 展开更多
关键词 肝炎 乙型 慢性 肝炎病毒 乙型 点突变 基因 病毒 恩替卡韦
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基于区域发电可靠性的指数解析模型及其应用 (一)理论基础 被引量:6
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作者 孙荣富 程林 孙元章 《电力系统自动化》 EI CSCD 北大核心 2007年第22期11-15,93,共6页
电力系统通过互联可以实现发电容量的相互支援,提高各独立系统的可靠性水平。当前各种可靠性水平的算法在计算时间与计算精度之间难以折中。文中提出了基于区域可靠性的发电可靠性指数解析模型,考虑了本区域和互联区域的备用容量以及联... 电力系统通过互联可以实现发电容量的相互支援,提高各独立系统的可靠性水平。当前各种可靠性水平的算法在计算时间与计算精度之间难以折中。文中提出了基于区域可靠性的发电可靠性指数解析模型,考虑了本区域和互联区域的备用容量以及联络线的传输容量变化对各个区域的发电可靠性的影响,建立了基于影响分布因子矩阵的直观表达式。分别将区域可靠性水平表达成区域备用容量和联络线传输容量的指数解析式。此模型可以快速准确计算不同备用水平以及联络线传输容量时的区域发电可靠性,且考虑了区域之间的耦合关系,对简单二区域系统和TH-RTS系统的优化结果表明了模型的准确性和有效性。 展开更多
关键词 区域发电可靠性 影响分布因子 TH-rtS系统 指数解析模型 区域备用容量 联络线传输容量
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基于网络视角的区域旅游系统概念体系辨析 被引量:2
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作者 赵磊 《北京第二外国语学院学报》 2011年第7期15-25,共11页
由于国内外区域旅游系统研究中所存在的理论探究深度不够,以及旅游系统自身属性的复杂性和研究者研究视角的不同,使得区域旅游系统的理论研究体系框架未能形成一个有机的整体。从区域旅游系统的内在逻辑结构出发,针对区域旅游系统研究... 由于国内外区域旅游系统研究中所存在的理论探究深度不够,以及旅游系统自身属性的复杂性和研究者研究视角的不同,使得区域旅游系统的理论研究体系框架未能形成一个有机的整体。从区域旅游系统的内在逻辑结构出发,针对区域旅游系统研究中概念应用模糊的扭曲现实,本文在对国内外区域旅游系统研究进行精炼分析的基础上,创新性地提出了"区域旅游系统关系网络模型",旨在揭示区域旅游系统的内在网络结构关系以及进一步完善区域旅游系统概念界定体系。 展开更多
关键词 区域旅游系统(rtS) 关系网络模型 概念界定体系
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环形件非环焊缝周向分区射线检测的应用 被引量:3
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作者 朱绍华 《无损检测》 2015年第6期37-39,共3页
分析了电子束焊的加工工艺特点及生产过程中可能产生的缺陷;通过对比源在外透照和源在内周向透照的两种射线透照工艺,最终确定了最优射线检测工艺——周向分区透照,确保了产品质量并提高了检测效率。
关键词 射线检测 周向检测 周向分区检测 电子束焊 环形件
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