疣粒野生稻抗白叶枯病相关基因ME281半定量RT-PCR分析

以从疣粒野生稻受白叶枯病菌诱导所建的差减文库中筛选出的一个具有CC-NBS-LRR抗病结构域的基因(克隆号为ME281),用半定量RT-PCR法,以肌动蛋白(β-actin)基因为内参,研究疣粒野生稻抗白叶枯病相关基因ME281基因mRNA的表达水平。通过对PCR体系中循环次数及Mg2+浓度的优化,最终建立了一个稳定、方便的半定量RT-PCR体系。通过ME281基因与β-actin基因PCR产物的灰度之比,确定ME281为诱导性表达,并进一步推测其为疣粒野生稻抗白叶枯病相关基因,甚至为抗病基因。

番茄环斑病毒的普通RT-PCR和巢式PCR检测方法

根据番茄环斑病毒(ToRSV)外壳蛋白(CP)基因的保守序列设计了2对引物(引物对I和II),利用RT-PCR分别扩增出预期大小的800bp和580bp的条带,其中引物对II扩增效率较高、特异性较好。以引物对I和II进行2轮PCR扩增,建立了巢式PCR检测方法,其灵敏度比普通RT-PCR提高100～200倍。序列测定和分析表明所测定的序列为ToRSVCP基因的部分序列,在系统关系树上与ToRSV的其他分离物形成一簇,亲缘关系很近。

半巢式RT-Realtime PCR检测南芥菜花叶病毒

根据南芥菜花叶病毒(Ar MV)外壳蛋白(CP)基因的保守序列,设计合成了3条巢式PCR引物和1条Taq MAN荧光探针,建立了半巢式RT-Realtime PCR检测Ar MV的新方法。该方法有机地结合了巢式PCR和Taq MAN探针检测技术。第二步半巢式-RT-Realtime PCR既是对第一步信号的进一步放大,也是对第一步PCR产物的确认,因此,检测的准确性、灵敏度比巢式PCR、Realtime PCR等方法高。结果表明:该方法检测灵敏度可达0.06 fg/μL植物总RNA。

新余市甲型H1N1流感病毒H275Y突变监测

目的分析2013年-2014年新余市甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)第275位氨基酸变异情况,掌握甲型H1N1流感病毒耐药特性。方法收集新余市流感监测哨点医院的流感样病例的咽拭子标本,采用狗肾传代细胞(MDCK)对标本进行病毒分离,随机选择15株甲型H1N1流感病毒进行核酸提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒NA基因部分片段,应用限制性内切酶片段长度多态性分析(RFLP)方法进行酶切分析。结果新余市15株甲型H1N1流感病毒中,仅有A/江西渝水/SWL1220/2014(H1)发生了H275Y突变,它具有Oseltamivir耐药性。结论新余市绝大多数甲型H1N1流感毒株对Oseltamivir敏感,但仍有必要持续监测和防范Oseltamivir耐药毒株的出现。

神经特异性转录因子DAT1基因的表达

采用生物信息学分析、细胞培养和RT-PCR等方法,以初步解DAT1基因在小鼠主要组织及神经系统相关肿瘤细胞中的表达.生物信息学的基因表达谱分析发现与DAT1同源的EST有100多条,大多数EST分布于胎脑、成年脑、脑肿瘤、肺及肺部的良性肿瘤等组织.SAGE分析发现DAT1在脑及神经系统肿瘤组织中表达非常广泛;RT-PCR方法检测发现DAT1只在脑组织中特异表达,而其它组织如心脏、肺、肝脏、骨骼肌、肾脏、睾丸、卵巢等未见表达;DAT1在培养的正常星形胶质细胞C8中不表达,在胶质瘤、神经母细胞瘤等细胞株中有不同水平的表达.由于DAT1是一种LIM蛋白,而LIM蛋白在细胞的分化、发育调控和肿瘤形成中有重要作用,DAT1在脑及神经系统相关肿瘤中的较高表达提示,DAT1在神经系统中有重要功能,并可能与神经系统肿瘤的发生相关.

强直性脊柱炎和类风湿关节炎患者外周血单个核细胞中Toll样受体4基因的表达及临床意义

目的探讨Toll样受体4(TLR4)mRNA在强直性脊柱炎(AS)、类风湿关节炎(RA)患者以及健康个体外周血单个核细胞(PBMC)中的表达差异及其临床意义。方法应用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测2006年3月至10月第二军医大学附属长征医院60例AS患者、20例RA患者及30例健康对照PBMC中TLR4 mRNA的表达水平;应用ESR自动化分析仪和特定蛋白电泳仪分别测定红细胞沉降率(ESR)和血浆C-反应蛋白(CRP)。结果AS和RA患者PBMCTLR4 mRNA的表达水平明显高于对照组,但两疾病组之间差异并无显著性意义;人类白细胞抗原(HLA-B27)阳性和阴性AS患者均显著高于健康对照组,且HLA-B27阳性AS患者显著高于RA组,但两组AS患者以及HLA-B27阴性AS与RA患者之间,TLR4 mRNA差异无显著性意义;在HLA-B27阳性AS患者中,TLR4 mRNA的表达与ESR及CRP呈显著相关性,但在HLA-B27阴性AS患者中则无这种相关性。在RA患者中,TLR4 mRNA与CRP呈显著相关性。结论AS和RA患者PBMCTLR4 mRNA的表达均上调,AS患者上调与HLA-B27阳性与否无关,但HLA-B27阳性AS患者比RA上调更明显,且HLA-B27抗原影响AS患者TLR4 mRNA与ESR及CRP的相关性。TLR4的异常表达可能在AS和RA的发生和发展中起作用。

济宁地区无偿献血者人细小病毒B19感染的相关研究

目的为了解济宁地区献血人群中人细小病毒B19(human parvovirus B19,简称HPV B19)感染情况,探讨血浆合并对其检出率的影响情况,降低临床输血风险提供一定依据。方法采用酶联免疫吸附法(ELISA)和实时荧光定量PCR(RTPCR)法对采集的960份献血员血液样本进行单人份及随机8人份血浆合并样本进行HPV B19-Ig G、Ig M抗体及DNA检测。结果单人份血浆与随机8人份血浆合并样本HPV B19 Ig G抗体、Ig M抗体阳性率分别为36.15%、5.94%、35.83%、12.50%,抗体阳性标本中单人份及血浆合并样本DNA阳性率分别为0.83%、5.00%。其中Ig M抗体阳性组B19 DNA检出率明显高于Ig G阳性组。结论献血人群中存在较高的HPV B19感染率,血浆合并后Ig M抗体及DNA检出率较高,未提示其传播风险降低,应对儿童、老年人、孕妇等免疫功能低下者选择性输注B19-Ig G抗体滴度较高的血液制品。