树突状细胞中Rab40b/c相互作用蛋白质的鉴定研究

目的改进串联亲和纯化质谱(TAP-MS)技术,鉴定并验证Rab40b和Rab40c在树突状细胞中的相互作用蛋白质。方法用分子克隆技术构建融合蛋白基因e Xact-6×His-EYFP-Rab40b和e Xact-6×His-EYFP-Rab40c的表达载体,采用慢病毒感染建立融合蛋白e Xact-6×His-EYFP-Rab40b和e Xact-6×His-EYFP-Rab40c稳定表达的树突状细胞系。改进串联亲和纯化技术,通过e Xact-6×His标签进行新型串联亲和纯化和q TOF液质检测,运用Comp PASS算法过滤和GO富集分析,鉴定Rab40b和Rab40c的相互作用蛋白,并采用免疫共沉淀验证。结果成功构建e Xact-6×His-EYFP-Rab40b和e Xact-6×His-EYFP-Rab40c融合蛋白稳定表达的树突状细胞系。采用新型串联亲和纯化方法,鉴定获得26个Rab40b高可信相互作用蛋白和16个Rab40c高可信相互作用蛋白。Rab40b、Rab40c分别与Elongin B、Elongin C、Cullin5具有相互作用。结论成功建立新型串联亲和纯化方法。Elongin B、Elongin C、Cullin5是Rab40b、Rab40c的相互作用蛋白。

Rab40家族在肝癌中的表达及临床意义

目的探讨Rab40家族在肝癌中的表达及临床意义。方法收集TIMER2.0数据库和The Human Protein Atlas数据库中肝癌数据集,分析Rab40家族在肝癌患者中的表达水平,并分析其表达与患者临床病理资料、肿瘤微环境免疫细胞浸润的关系;收集Kaplan-Meier Plotter数据库中肝癌数据集,分析Rab40b和Rab40c的表达水平与肝癌患者预后的关系。结果肝癌组织中的Rab40a、Rab40al、Rab40b和Rab40c表达水平显著高于癌旁组织,差异具有统计学意义(P<0.05)。Rab40c高表达与肝癌患者TNM分期可能存在相关性(P=0.064)。Rab40b、Rab40c高表达肝癌患者的总生存期(OS)、无复发生存期(RFS)短于Rab40b、Rab40c低表达肝癌患者,差异具有统计学意义(P<0.05)。肝癌组织中Rab40b的表达水平与肿瘤微环境的B细胞和CD8^(+)T细胞无关(P>0.05),而与CD4^(+)T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞密切相关,差异具有统计学意义(P<0.05)。肝癌组织中Rab40c的表达水平与肿瘤微环境的B细胞、CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞密切相关,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论Rab40家族在肝癌中高表达,尤其是Rab40b和Rab40c,通过影响肿瘤微环境中的免疫细胞促进肝癌的发生、发展,可作为肝癌治疗和预后的潜在生物标志物。