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Detection of short stature homeobox 2 and RAS-associated domain family 1 subtype A DNA methylation in interventional pulmonology
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作者 Jian Wu Peng Li 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2021年第20期5391-5397,共7页
One of the most important aspects of interventional pulmonology is to obtain tissue or liquid samples of the chest to diagnose a respiratory disease;however,it is still possible to obtain insufficient tissue or cytolo... One of the most important aspects of interventional pulmonology is to obtain tissue or liquid samples of the chest to diagnose a respiratory disease;however,it is still possible to obtain insufficient tissue or cytologic specimens.Indeed,methylation detection is an effective method by which to establish a diagnosis.This review focuses on the clinical application of short stature homeobox 2 and RAS-associated domain family 1 subtype A DNA methylation detection in interventional pulmonology,including bronchoscopic fluid biopsy,transbronchial needle aspiration,and pleural effusion. 展开更多
关键词 DNA methylation Interventional pulmonology Short stature homeobox 2 ras-associated domain family 1 subtype A Fluid biopsy Transbronchial needle aspiration
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联合SHOX2、RASSF1A及CEA构建的列线图模型对肺癌发生的预测价值
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作者 王萌萌 穆坎代斯·吐尔迪 +2 位作者 努尔孜巴·艾力 考吾沙尔·巴合提江 夏宇 《新疆医科大学学报》 CAS 2024年第7期996-1000,1007,共6页
目的 联合矮小同源盒基因2(Short stature homeobox gene 2,SHOX2)、RAS相关结构域家族1亚型A(RAS association domain family 1,isoform A,RASSF1A)及癌胚抗原(Carcinoembryonic antigen,CEA)构建预测肺癌发生的列线图模型,并确定该模... 目的 联合矮小同源盒基因2(Short stature homeobox gene 2,SHOX2)、RAS相关结构域家族1亚型A(RAS association domain family 1,isoform A,RASSF1A)及癌胚抗原(Carcinoembryonic antigen,CEA)构建预测肺癌发生的列线图模型,并确定该模型的预测价值。方法 选择2020年1月至2022年12月在新疆医科大学第一附属医院就诊的88例肺癌患者及肺良性肿瘤患者219名。比较两组患者的人口统计学和临床特征信息以及支气管肺泡灌洗液(Bronchoalveolar lavage fluid,BALF)中SHOX2和RASSF1A基因的甲基化水平。进行单因素分析及多因素Logistic回归分析筛选出影响肺癌发生的变量构建列线图,并评估其预测效能。结果 肺癌患者中SHOX2阳性36例(41.4%),RASSF1A阳性30例(34.5%)。肺癌患者CEA、细胞角蛋白19片段(Cytokeratin 19 fragment,CYFRA21-1)、鳞状上皮细胞癌抗原(Squamous cell carcinoma antigen,SCCA)、胃泌素释放肽前体(Pro-gastrinreleasing peptide,Pro-GRP)水平与肺良性肿瘤患者比较差异有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析显示,SHOX2、RASSF1A和CEA为肺癌发生的独立危险因素(P<0.05),基于上述独立风险因素所构建的列线图模型显示出良好的区分能力(AUC=0.926),具有较好的一致性且获益良好。结论 联合SHOX2、RASSF1A和CEA构建的列线图模型对肺癌发生具有较高的预测价值,可为肺癌的早期诊断提供依据。 展开更多
关键词 矮小同源盒基因2 RAS相关结构域家族1亚型A 癌胚抗原 肺癌 列线图
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lncRNA MEG3调控NLRP3/caspase-1/GSDMD通路影响三阴性乳腺癌对紫杉醇的敏感性 被引量:3
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作者 于冰 杨旭 +1 位作者 陈之梦 雷萌 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第4期597-602,共6页
目的:探究长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)母系表达基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)调控含NLR家族Pyrin域蛋白3(NLR family,Pyrin domain containing protein 3,NLRP3)/含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶(cysteinyl a... 目的:探究长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)母系表达基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)调控含NLR家族Pyrin域蛋白3(NLR family,Pyrin domain containing protein 3,NLRP3)/含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶(cysteinyl aspartate specific proteinase 1,caspase-1)/消皮素D(gasdermin D,GSDMD)通路对三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)对紫杉醇(paclitaxel,PTX)敏感性的影响。方法:通过逐渐增加PTX剂量间歇作用的方法诱导TNBC耐药细胞MDA-MB-231/R,qRT-PCR检测lncRNA MEG3表达;将MDA-MB-231细胞分为对照组(未转染+PTX)、Vector组(空载体+PTX)、pcDNA3.1-MEG3组(pcDNA3.1-MEG3表达载体+PTX)、pcDNA3.1-MEG3+BAY11-7082组(pcDNA3.1-MEG3表达载体+PTX+5μmol/L NLRP3抑制剂BAY11-7082),qRT-PCR检测转染后lncRNA MEG3表达;CCK-8法检测MDA-MB-231细胞增殖情况;通过免疫荧光染色和扫描电镜(scanning electron microscope,SEM)观察MDA-MB-231细胞焦亡情况;Western blot检测MDA-MB-231细胞中NLRP3/caspase-1/GSDMD通路蛋白表达;体内成瘤实验检测肿瘤质量。结果:与MDA-MB-231细胞相比,MDA-MB-231/R细胞中lncRNA MEG3表达水平显著降低(P<0.05);与对照组相比,pcDNA3.1-MEG3组细胞增殖抑制率、GSDMD-N+细胞数量、细胞焦亡、细胞凋亡率及NLRP3、cleaved-caspase 1/caspase-1、GSDMD-N/GSDMD表达水平显著增加,IC50、肿瘤质量显著降低(P<0.05);与pcDNA3.1-MEG3组相比,pcDNA3.1-MEG3+BAY11-7082组细胞增殖抑制率、GSDMD-N+细胞数量、细胞焦亡、细胞凋亡率及NLRP3、cleaved-caspase 1/caspase-1、GSDMD-N/GSDMD表达水平显著降低,IC50、肿瘤质量显著增加(P<0.05)。结论:上调lncRNA MEG3表达可通过激活NLRP3/caspase-1/GSDMD通路,促进MDA-MB-231细胞焦亡,以此增加TNBC对PTX的敏感性。 展开更多
关键词 母系表达基因3 含NLR家族Pyrin域蛋白3/含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶/消皮素D 三阴性乳腺癌 紫杉醇 敏感性
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Ras相关区域家族1A基因甲基化与恶性肿瘤关系的研究进展 被引量:5
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作者 于正洪 王玉才 +1 位作者 马驰原 苏全胜 《医学研究生学报》 CAS 2007年第9期985-989,共5页
Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因是新近发现的新型候选抑癌基因,其正常表达能抑制肿瘤的发生。启动子区域CpG岛异常甲基化可以导致其失活,并在肿瘤的发生、发展中起着重要作用。RASSF1A的甲基化状态检测具有重要的临床意义,有望为肿瘤... Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因是新近发现的新型候选抑癌基因,其正常表达能抑制肿瘤的发生。启动子区域CpG岛异常甲基化可以导致其失活,并在肿瘤的发生、发展中起着重要作用。RASSF1A的甲基化状态检测具有重要的临床意义,有望为肿瘤的早期诊断提供新的思路,而逆转RASSF1A的甲基化则可能成为肿瘤治疗的新方向。 展开更多
关键词 RAS相关区域家族1a 抑癌基因 肿瘤 甲基化
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胃癌RASSF1A基因启动子CpG岛甲基化与DNMT1表达的意义 被引量:2
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作者 杜芳 常志伟 +2 位作者 孙哲 高珊珊 蒋宗彩 《山东医药》 CAS 北大核心 2009年第1期26-28,共3页
目的探讨RAS相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子CpG岛甲基化和DNA甲基转移酶1(DN-MT1)的表达与胃癌发生的关系。方法运用甲基化特异性聚合酶链反应和免疫组织化学方法检测胃癌癌旁正常组织和癌组织RASSF1A基因启动子CpG岛甲基化发生率及... 目的探讨RAS相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子CpG岛甲基化和DNA甲基转移酶1(DN-MT1)的表达与胃癌发生的关系。方法运用甲基化特异性聚合酶链反应和免疫组织化学方法检测胃癌癌旁正常组织和癌组织RASSF1A基因启动子CpG岛甲基化发生率及DNMT1的表达情况。结果癌旁正常组织中RASSF1A基因启动子CpG岛甲基化发生率、DNMT1阳性表达率显著低于相应癌组织(P均<0.01)。RASSF1A启动子CpG岛甲基化患者DNMT1阳性表达率与非甲基化患者比较无统计学差异(P>0.05)。结论RASSF1A基因启动子区CpG岛甲基化和DNMT1的高表达可能与胃癌发生有一定关系。 展开更多
关键词 胃肿瘤 基因 RAS相关区域家族1a DNA甲基转移酶1 甲基化
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白血病患者RASSF1A基因甲基化状态及其临床意义 被引量:1
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作者 陈卫群 黄琛 +4 位作者 詹喜炎 刘水逸 余洁 张红梅 卢忠心 《检验医学》 CAS 2012年第7期554-556,共3页
目的研究白血病患者骨髓中Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子甲基化状态及其临床意义。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应(MS-PCR)检测86例白血病患者和60例非白血病患者对照组骨髓中RASSF1A基因启动子的甲基化状况,分析不同白血病... 目的研究白血病患者骨髓中Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子甲基化状态及其临床意义。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应(MS-PCR)检测86例白血病患者和60例非白血病患者对照组骨髓中RASSF1A基因启动子的甲基化状况,分析不同白血病类型之间的差异。结果 86例白血病患者中,有12例(13.95%)RASSF1A基因启动子甲基化,而60例非白血病患者骨髓均未检测到甲基化,二者比较差异均有统计学意义(P<0.05)。淋巴系白血病患者RASSF1A基因甲基化比例(23.1%)明显高于髓系白血病患者(6.4%)(P<0.05)。结论白血病患者骨髓中存在RASSF1A基因甲基化,淋巴系白血病甲基化比例明显高于髓系白血病。RASSF1A基因甲基化检测可能成为白血病分型的生物标志物之一。 展开更多
关键词 白血病 Ras相关区域系统1a基因 甲基化 生物标志
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RASSF1基因SNP与陕西地区结直肠癌发病风险关系的研究 被引量:1
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作者 王纪全 陈谦 +1 位作者 柯娟 邓怀慈 《现代肿瘤医学》 CAS 2013年第7期1545-1549,共5页
目的:探讨RASSF1基因第三外显子G133T和第六外显子A315G单核苷酸多态性(SNP)与陕西地区汉族人群结直肠癌(CRC)易感性的关系。方法:采用基于人群的病例对照研究,聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测61例CRC和122例健康... 目的:探讨RASSF1基因第三外显子G133T和第六外显子A315G单核苷酸多态性(SNP)与陕西地区汉族人群结直肠癌(CRC)易感性的关系。方法:采用基于人群的病例对照研究,聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测61例CRC和122例健康对照个体RASSF1基因多态位点的基因型频率分布,比较不同基因型与CRC发生风险的关系。结果:RASSF1基因G133T多态的T等位基因频率在CRC患者组为24.6%,显著高于健康对照组的6.1%(P=0.00)。与G/G基因型相比,携带G/T基因型的个体CRC的发病风险显著增加,经性别、年龄、吸烟状况、GIC家族史校正后的OR值为2.33(95%CI=1.05-5.15)。RASSF1基因A315G多态的G等位基因频率在CRC患者组为25.4%,显著高于健康对照组的11.9%(P=0.00)。根据个体吸烟状况进行分层分析发现,与A/A基因型相比,携带A/G基因型和G等位基因(A/G+G/G基因型)可显著增加吸烟个体CRC的发病风险,经性别、年龄、GIC家族史校正后的OR值为4.5(95%CI=1.65-12.28)。根据GIC家族史进行分层分析发现,与A/A基因型相比,携带A/G基因型或G等位基因(A/G+G/G基因型)可显著增加GIC家族史阳性个体CRC的发病风险,经性别、年龄、吸烟状况校正后的OR值为3.78(95%CI=1.39-10.19)。结论:携带RASSF1基因G133T多态的T等位基因(G/T+T/T基因型)可能显著增加陕西地区人群CRC的发病风险。携带RASSF1基因A315G多态的G等位基因(A/G+G/G基因型)可能显著增加陕西地区人群CRC的发病风险。分层分析发现,G等位基因(A/G+G/G基因型)可能显著增加吸烟个体和GIC家族史阳性个体CRC的发病风险。 展开更多
关键词 结直肠癌 RASSF1基因 单核苷酸多态性 肿瘤易感性
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SHOX2和RASSF1A基因组合甲基化检测参与诊断的肺结节1例假阴性分析 被引量:1
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作者 周淼 闫五玲 +2 位作者 赵栋梁 刘元元 焦莉 《中国当代医药》 2021年第2期201-204,共4页
河南中医药大学第三附属医院肺病科开展了矮小同源盒基因2(SHOX2)和Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因组合的甲基化检测技术,进行肺结节诊断和肺癌早期筛查。其中1例的结果与手术病理结果不一致,出现假阴性。本文分析此病例出现假阴性结... 河南中医药大学第三附属医院肺病科开展了矮小同源盒基因2(SHOX2)和Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因组合的甲基化检测技术,进行肺结节诊断和肺癌早期筛查。其中1例的结果与手术病理结果不一致,出现假阴性。本文分析此病例出现假阴性结果的原因,可能与标本类型选择不到位、标本量不够充足、SHOX2和RASSF1A基因组合的甲基化检测对不同病理类型及不同分化程度的肺癌的阳性率和敏感性不同有关。 展开更多
关键词 肺结节 肺癌 基因甲基化 矮小同源盒基因2 RAS相关区域家族1a
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RASSF1A基因启动子区甲基化在胃癌阶段性发生及进展中的作用及临床意义
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作者 滕玥 戴冬秋 +1 位作者 沈文静 刘红波 《重庆医学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第17期1689-1692,共4页
目的通过检测胃癌癌旁距离原发灶不同距离组织及胃癌原发灶RASSF1A基因启动子区甲基化状态的差异,分析正常胃组织、癌前病变及癌组织中该基因甲基化的动态变化以及RASSF1A基因甲基化与胃癌原发灶病理生物学行为的关系,探讨RASSF1A基因... 目的通过检测胃癌癌旁距离原发灶不同距离组织及胃癌原发灶RASSF1A基因启动子区甲基化状态的差异,分析正常胃组织、癌前病变及癌组织中该基因甲基化的动态变化以及RASSF1A基因甲基化与胃癌原发灶病理生物学行为的关系,探讨RASSF1A基因启动子区甲基化在胃癌阶段性发生及进展中的作用及临床意义。方法采用甲基化特异性PCR(MSP)法检测距胃癌癌灶边缘5、3、1cm组织及胃癌原发灶组织中RASSF1A基因甲基化状态。结果 RASSF1A基因启动子区甲基化发生率在距胃癌灶边缘5、3、1cm组织及胃癌组织中分别为5.0%、7.5%、22.5%及42.5%,从距癌灶边缘5cm胃组织至胃癌原发灶组织中的表达中随距癌灶边缘距离的减少呈上升趋势,差异有统计学意义(P<0.01)。从组织病理学角度分析,RASSF1A基因启动子区甲基化发生率在正常胃组织、癌前病变组织及胃癌原发灶中分别为0.0%、17.39%、42.5%,动态上升,三者间差异具有统计学意义(P<0.01)。RASSF1A基因甲基化发生率在胃癌患者透浆膜组显著高于未透浆膜组(P<0.05);在转移淋巴结数7枚以上组显著高于0~7枚组(P<0.05),与胃癌胃壁浸润深度、转移淋巴结数相关,在不同大体类型、生长方式、分化程度、性别及年龄胃癌患者间差异无统计学意义(P>0.05)。结论 RASSF1A基因启动子区异常甲基化可能与胃癌的阶段性发生及临床进展相关。 展开更多
关键词 胃肿瘤 RASSF1a基因 甲基化
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MGMT、RASSF1A、FHIT基因启动子甲基化水平在非小细胞肺癌患者早期诊断中的意义 被引量:2
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作者 冯悦静 《河南医学研究》 CAS 2019年第2期199-201,共3页
目的探讨DNA修复基因06-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)、Ras凋亡家族1A(RASSF1A)、脆性组氨酸三联体(FHIT)基因启动子甲基化水平在非小细胞肺癌(NSCLC)患者早期诊断中的意义。方法选取2016年2月至2018年2月在郑州市第六人民医院收治的... 目的探讨DNA修复基因06-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)、Ras凋亡家族1A(RASSF1A)、脆性组氨酸三联体(FHIT)基因启动子甲基化水平在非小细胞肺癌(NSCLC)患者早期诊断中的意义。方法选取2016年2月至2018年2月在郑州市第六人民医院收治的136例NSCLC患者作为肺癌组,选取同期145例健康体检者作为对照组,采用实时荧光定量甲基化特异PCR(qMSP)法检测外周血DNA中MGMT、RASSF1A和FHIT基因启动子甲基化水平并进行分析。结果肺癌组MGMT、RASSF1A、FHIT基因启动子甲基化水平高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。肺癌组不同病理组织学类型MGMT、FHIT基因启动子甲基化水平比较,差异有统计学意义(P<0.05),肺癌组RASSF1A基因启动子甲基化水平与其临床分期有关(P<0.05)。NSCLC患者MGMT、RASSF1A、FHIT基因启动子甲基化水平联合检测灵敏度、阴性预测值、准确性高于单独检测,差异有统计学意义(P<0.05)。结论检测MGMT、RASSF1A和FHIT基因启动子甲基化水平对早期诊断NSCLC及鉴别临床病理组织学分型有一定的指导价值。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 脆性组氨酸三联体基因 Ras凋亡家族1a基因 06-甲基鸟氨酸DNA甲基转移酶基因 实时荧光定量甲基化特异PCR
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C型凝集素结构域家族1成员B在肝细胞癌中的表达及临床意义
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作者 汪慧 胡亮 +3 位作者 邹珊珊 刘文迪 周华邦 胡和平 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期547-553,共7页
目的 探讨C型凝集素结构域家族1成员B(CLEC1B)在肝细胞癌(HCC)组织中的表达及其与HCC患者临床病理特征和预后的关系。方法 利用基因表达汇编(GEO)数据库检索HCC组织芯片数据(GSE49515、GSE115018)对癌组织及正常对照样本中的基因进行差... 目的 探讨C型凝集素结构域家族1成员B(CLEC1B)在肝细胞癌(HCC)组织中的表达及其与HCC患者临床病理特征和预后的关系。方法 利用基因表达汇编(GEO)数据库检索HCC组织芯片数据(GSE49515、GSE115018)对癌组织及正常对照样本中的基因进行差异表达分析。在肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库筛选HCC转录组数据集,分析CLEC1B在HCC中的差异表达。采用基因集富集分析(GSEA)探寻HCC中与CLEC1B相关的信号通路。收集37例HCC患者的癌组织和相应的癌旁组织,采用实时荧光定量PCR法检测CLEC1B mRNA表达,蛋白质印迹分析法检测CLEC1B蛋白表达,并采用χ^2检验分析CLEC1B表达与患者临床病理特征的关系,通过Kaplan-Meier法和log-rank检验分析CLEC1B mRNA表达与HCC患者预后的关系;留取37例HCC患者和37名健康志愿者血液标本,用酶联免疫吸附试验检测血浆中CLEC1B水平,通过受试者工作特征(ROC)曲线评估CLEC1B对HCC的诊断价值。结果 CLEC1B在HCC癌组织中低表达,CLEC1B的低表达与HCC患者的肿瘤出血有关(P<0.01)。血浆中CLEC1B水平可作为诊断HCC的生物标志物,以62.44 ng/mL作为截断值时,CLEC1B的诊断效能最佳(ROC曲线下面积为0.966,灵敏度为92.7%,特异度为91.3%)。高表达CLEC1B的HCC患者总生存期长于低表达CLEC1B的患者,差异有统计学意义(P<0.01)。在HCC中,CLEC1B基因与ATR通路(ATM and Rad3-related pathway)、细胞周期通路、DNA修复通路、myc信号通路呈现出一致的表达差异趋势。结论 CLEC1B在HCC中低表达并与肿瘤出血有关,CLEC1B低表达的患者预后较差。 展开更多
关键词 C型凝集素结构域家族1成员B 肝细胞癌 诊断 预后 基因富集
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RASSF1基因单核苷酸多态性与食管癌的发病风险
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作者 陈谦 王纪全 +1 位作者 柯娟 邓怀慈 《现代肿瘤医学》 CAS 2010年第10期1946-1951,共6页
目的:探讨RASSF1基因第三外显子G133T和第六外显子A315G单核苷酸多态性(SNP)与陕西地区汉族人群食管鳞状细胞癌(ESCC)易感性的关系。方法:采用基于人群的病例对照研究,聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测120例ESCC和... 目的:探讨RASSF1基因第三外显子G133T和第六外显子A315G单核苷酸多态性(SNP)与陕西地区汉族人群食管鳞状细胞癌(ESCC)易感性的关系。方法:采用基于人群的病例对照研究,聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测120例ESCC和122例健康对照个体RASSF1基因多态位点的基因型频率分布,比较不同基因型与ESCC发生风险的关系。结果:RASSF1基因G133T多态的T等位基因频率和A315G多态的G等基因频率在ESCC患者组分别为17.5%和23.8%,显著高于健康对照组的6.1%和11.9%。根据个体吸烟状况进行分层分析发现,携带G/T基因型或T等位基因(G/T+T/T基因型)和携带A/G基因型或G等位基因(A/G+G/G基因型)可显著增加吸烟个体ESCC的发病风险,经性别、年龄、GIC家族史校正后的OR值分别为11.7和5.02(95%CI=3.95-34.9和2.09-12.06)。GIC家族史分层分析发现,携带G/T基因型或T等位基因(G/T+T/T基因型)和A/G基因型可显著增加GIC家族史阳性个体和GIC家族史阴性个体ESCC的发病风险,经性别、年龄、吸烟状况校正后的OR值为5.08和3.51(95%CI=1.85-13.92和1.69-7.21)。结论:携带RASSF1基因G133T多态的T等位基因(G/T+T/T基因型)可能显著增加陕西地区人群ESCC的发病风险。携带RASSF1基因A315G多态的G等位基因(A/G+G/G基因型)可能显著增加陕西地区人群ESCC的发病风险。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌 RASSF1基因 单核苷酸多态性 肿瘤易感性
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骨肉瘤组织中RASSF1A基因启动子区甲基化状态观察及意义 被引量:4
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作者 章振华 桂斌捷 +2 位作者 朱立新 李晓明 周健 《山东医药》 CAS 2012年第2期24-26,共3页
目的观察骨肉瘤组织中Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子区域的甲基化状态,并探讨其临床意义。方法应用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测30例骨肉瘤组织及瘤旁组织中RASSF1A基因启动子区域的甲基化状态。结果骨肉瘤组织中RASSF1A基因... 目的观察骨肉瘤组织中Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子区域的甲基化状态,并探讨其临床意义。方法应用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测30例骨肉瘤组织及瘤旁组织中RASSF1A基因启动子区域的甲基化状态。结果骨肉瘤组织中RASSF1A基因启动子区域发生甲基化14例(46.7%),瘤旁组织中4例(13.3%),两者比较,P<0.05。RASSF1A基因启动子区甲基化与骨肉瘤患者的性别、年龄及血清碱性磷酸酶水平有关(P均<0.05)。结论骨肉瘤组织中RASSF1A基因启动子区甲基化发生率高,其可能在骨肉瘤的发生发展中发挥重要作用。 展开更多
关键词 DNA甲基化 Ras相关区域家族1a基因 骨肿瘤 骨肉瘤
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HPVE2/E6、CDCP1、RASSF2A甲基化水平与局部免疫、HR-HPV持续感染的关系 被引量:2
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作者 柯艺文 庞春玉 +1 位作者 王绪松 温云花 《中国性科学》 2021年第9期65-68,共4页
目的探讨人乳头瘤病毒(HPV)E2/E6、含CUB结构域蛋白1(CDCP1)、RAS相关结构域蛋白2A基因(RASSF2A)甲基化水平与宫颈病变级别、局部免疫的关联性。方法选取2018年1月至2020年6月海口市妇幼保健院诊治的158例高危型HPV(HR-HPV)感染患者作... 目的探讨人乳头瘤病毒(HPV)E2/E6、含CUB结构域蛋白1(CDCP1)、RAS相关结构域蛋白2A基因(RASSF2A)甲基化水平与宫颈病变级别、局部免疫的关联性。方法选取2018年1月至2020年6月海口市妇幼保健院诊治的158例高危型HPV(HR-HPV)感染患者作为研究对象。比较不同宫颈病变级别患者HPVE2/E6、CDCP1、RASSF2A甲基化水平,并给予重组人干扰素治疗,根据治疗效果分为转阴组(n=132)、持续感染组(n=26),比较两组HPVE2/E6、CDCP1mRNA、RASSF2AmRNA、局部免疫功能水平及其相关性,探讨HR-HPV持续感染影响因素,评估上述指标预测HR-HPV持续感染的效能。结果高级别宫颈上皮内病变(HSIL)患者CDCP1阳性率、RASSF2AmRNA、CDCP1mRNA高于无宫颈上皮内病变(NSIL)、低级别宫颈上皮内病变(LSIL)患者,HPVE2/E6、RASSF2AmRNA低于NSIL、LSIL患者(P<0.05)。HPVE2/E6、RASSF2AmRNA与CD4^(+)呈正相关,与CD8^(+)呈负相关;CDCP1mRNA与CD4^(+)呈负相关,与CD8^(+)呈正相关(P<0.05);HPVE2/E6、CDCP1mRNA、RASSF2AmRNA是HR-HPV持续感染的重要影响因素(P<0.05);HPVE2/E6+CDCP1mRNA+RASSF2AmRNA预测HR-HPV持续感染的AUC最大,为0.887。结论HPVE2/E6、CDCP1、RASSF2A甲基化水平与宫颈病变级别、局部免疫密切相关,联合应用对临床预测HR-HPV持续感染、评估宫颈病变级别、预防宫颈癌变发生具有较高的临床应用价值。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒E2/E6 含CUB结构域蛋白1 RAS相关结构域蛋白2A基因甲基化 宫颈病变级别
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5HRE联合CEAp靶向调控RASSF1A基因对SGC7901胃癌细胞株抑制作用的研究 被引量:1
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作者 周培华 孙学军 +8 位作者 郑见宝 王炜 王孝珑 陈南征 魏光兵 范渊 李孝彬 王训凯 禄韶英 《中国普外基础与临床杂志》 CAS 2015年第10期1201-1208,共8页
目的探讨人5拷贝低氧反应元件(5HRE)联合癌胚抗原启动子(CEAp)调控元件的靶向性及调控RAS相关区域家族1A(RASSF1A)抑癌基因的慢病毒载体对SGC7901胃癌细胞的抑制作用。方法 1分别采用实时定量RT-PCR(qRT-PCR)、免疫组织化学SP染色及West... 目的探讨人5拷贝低氧反应元件(5HRE)联合癌胚抗原启动子(CEAp)调控元件的靶向性及调控RAS相关区域家族1A(RASSF1A)抑癌基因的慢病毒载体对SGC7901胃癌细胞的抑制作用。方法 1分别采用实时定量RT-PCR(qRT-PCR)、免疫组织化学SP染色及Western blot法检测SGC7901、MKN28和MCF-10A细胞株中癌胚抗原(CEA)mRNA及其蛋白,以及RASSF1A蛋白的表达水平,以确定实验细胞和阴性对照细胞。2构建p GL4.20-5HRE-CEAp-Luc载体以转染SGC7901、MKN28和MCF-10A细胞株,将各细胞株分为2组,分别加入(缺氧组)或不加入CoCl2(常氧组),比较各细胞株中缺氧组和常氧组细胞的启动活性。3将重组慢病毒载体(p LV-5HRE-CEAp-RASSF1A)及相应空病毒载体包装成病毒颗粒LV-5HC-RASSF1A(感染组)和LV-NC(阴性对照组),感染SGC7901细胞。以未感染任何病毒的SGC7901细胞作为空白对照组,将该3组细胞再分为2个亚组,分别加入(缺氧组)或不加入CoCl2(常氧组),比较缺氧组和常氧组细胞中RASSF1A蛋白的表达水平和细胞增殖抑制率。结果 1 q RT-PCR结果显示:SGC7901细胞株中CEA m RNA的表达水平高于MKN28及MCF-10A细胞株(P<0.05);免疫组织化学染色结果显示:CEA的表达水平在SGC7901、MKN28及MCF-10A细胞株中依次递减,两两比较差异均有统计学意义(P<0.05);Western blot结果显示:在SGC7901及MKN28细胞株中未检测到RASSF1A蛋白的电泳条带,而在MCF-10A细胞株中可检测到。据此确定SGC7901细胞株为实验细胞,MKN28细胞株为阴性对照细胞。2转染p GL4.20-5HRE-CEAp-Luc载体后,在SGC7901及MKN28细胞株中,同种细胞株内与常氧组比较,缺氧组细胞的活性倍数均升高(P<0.01);而在MCF-10A细胞株中,常氧组和缺氧组细胞的活性倍数比较差异无统计学意义(P>0.05)。在不加入CoCl2条件和加入CoCl2条件下,同等条件下与SGC7901细胞株比较,MKN28及MCF-10A细胞株的活性倍数均较低(P<0.05);与MKN28细胞株比较,MCF-10A细胞株的活性倍数较低(P<0.05)。3细胞感染病毒后的Western blot检测结果显示:在SGC7901细胞,空白对照组及阴性对照组细胞在常氧和缺氧条件下其RASSF1A蛋白均呈弱表达,差异不明显;感染组细胞在常氧条件下RASSF1A蛋白呈弱表达,而在缺氧条件下RASSF1A蛋白的表达水平明显增加。在MKN28细胞,空白对照组、阴性对照组及感染组细胞在常氧及缺氧条件下均未见电泳条带。细胞活性检测实验结果显示:在SGC7901细胞,与感染-缺氧组比较,其余5组细胞的生长抑制率均较低(P<0.05);在MKN28细胞,与空白对照-常氧组和空白对照-缺氧组细胞比较,其余4组细胞的生长抑制率均较高(P<0.05),但该4组细胞间比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论 5HRECEAp调控元件具有低氧诱导及靶向CEA转录阳性胃癌细胞的双调控能力;RASSF1A慢病毒载体(p LV-5HRECEAp-RASSF1A)在低氧诱导下具有抑制SGC7901胃癌细胞株增殖的能力。 展开更多
关键词 5拷贝低氧反应元件 癌胚抗原启动子 RAS相关区域家族1a基因 胃癌 基因治疗
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脓毒症急性肺损伤患者RhoA/ROCK1和NF-κB/NLRP3信号通路及其下游信号分子的变化 被引量:2
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作者 吴清松 饶平 +2 位作者 符史健 林亚发 符名勇 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第19期2886-2890,共5页
目的 分析Ras同源基因家族成员A(RhoA)/Rho激酶1(ROCK1)、核因子κB(NF-κB)/核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(NLRP3)信号通路及其下游信号分子在脓毒症患者急性肺损伤(ALI)中的变化。方法 回顾性分析海口市第四人民医院2018年1月-2... 目的 分析Ras同源基因家族成员A(RhoA)/Rho激酶1(ROCK1)、核因子κB(NF-κB)/核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(NLRP3)信号通路及其下游信号分子在脓毒症患者急性肺损伤(ALI)中的变化。方法 回顾性分析海口市第四人民医院2018年1月-2020年12月122例脓毒症患者临床资料,其中41例并发ALI(ALI组),81例无ALI(非ALI组),并纳入32名健康体检者作为对照组。脓毒症患者均于入院24 h内收集外周静脉血标本,对照组则收集体检当日外周静脉血。比较3组外周血单个核细胞(PBMCs)NF-κB、NLRP3信使核糖核酸(mRNA)表达水平,并记录NF-κB/NLRP3信号通路上游基因(RhoA、ROCK1)、下游基因[半胱氨酸天冬氨酸特异性蛋白酶-1(caspase-1)]mRNA表达水平及下游炎症因子[白细胞介素-1β(IL-1β)、IL-18];根据肺损伤预测评分(LIPS)将41例并发ALI的脓毒症患者分为LIPS≥7分组,LIPS<7分组,比较两组上述基因mRNA、炎症因子水平,并评估脓毒症并发ALI患者LIPS评分与上述基因mRNA、炎症因子表达水平的相关性。结果 ALI组LIPS评分高于非ALI组(P<0.05)。ALI组与非ALI组PBMCs NF-κB、NLRP3、RhoA、ROCK1、caspase-1 mRNA相对表达水平及血清IL-1β、IL-18高于对照组(P<0.05),ALI组高于非ALI组(P<0.05)。脓毒症并发ALI患者中,LIPS≥7分组PBMCs NF-κB、NLRP3、RhoA、ROCK1、caspase-1 mRNA相对表达水平及血清IL-1β、IL-18高于LIPS<7分组(P<0.05);Pearson相关性分析显示,LIPS评分与上述各基因mRNA及炎症因子均呈正相关(r=0.389、0.472、0.511、0.539、0.518、0.469、0.457,P均<0.05)。结论 Rho/ROCK、NF-κB/NLRP3信号通路及其下游信号分子可能共同参与了脓毒症ALI的发生发展,临床可针对该发生机制探寻治疗新方向。 展开更多
关键词 脓毒症 急性肺损伤 核因子κB/核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3 Ras同源基因家族成员A/Rho激酶1 半胱氨酸天冬氨酸特异性蛋白酶-1 肺损伤预测评分
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Frequent 3p21 Allelic Loss and Methylation-Associated RASSF1A Inactivation in Non-Small Cell Lung Cancer and Its Clinical Implication
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作者 ZHU Hong WONG Maria P 《Wuhan University Journal of Natural Sciences》 CAS 2009年第5期457-464,共8页
A total of 110 primary NSCLCs (non-small cell lung cancers) were recruited in this study to characterize the pattern of 3p21 LOH together with the RASSF1A methylation status and their clinical implication. 3p21 LOH ... A total of 110 primary NSCLCs (non-small cell lung cancers) were recruited in this study to characterize the pattern of 3p21 LOH together with the RASSF1A methylation status and their clinical implication. 3p21 LOH by 8 microsatellite markers, RASSF1A methylation status by methylation-specific PCR (MSPCR) as well as bisulfite genomic sequencing (BGS), and RASSF1A expression level by real-time quantitative PCR was performed. 3p21 LOH is frequent in NSCLC with a mean frequency of (41.2±3.7)%. Significant associations between 3p21 LOH and gender, smoking history, histological type, and tumor size were observed. Cases with LOH have a slightly lower RASSF1A expression than cases without LOH but not statistically significant. Comparison of RASSF1A methylation that resulted from the three analyses shows significant correlations from one another. Higher frequency of methylation was observed in larger tumors and in smokers compared with smaller tumors and non-smokers, respectively. A significant correlation was also observed in extent between methylation and RASSF1A expression, illustrating that epigenetic mechanism could affect gene expression. The significant clinicopathological relations of 3p21 LOH may be of great use for both early detection and therapeutic interventions. 展开更多
关键词 non-small cell lung cancer loss of heterozygosity RAS association domain family IA gene (RASSF1a METHYLATION real-time quantitative PCR
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