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Real-Time PCR Technique and Its Application in Quantification of Plant Nucleic Acid Molecules 被引量:8
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作者 刘进元 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2003年第6期631-637,共7页
Real-time PCR is a closed DNA amplification system that skillfully integrates biochemical, photoelectric and computer techniques. Fluorescence data acquired once per cycle provides rapid absolute quantification of ini... Real-time PCR is a closed DNA amplification system that skillfully integrates biochemical, photoelectric and computer techniques. Fluorescence data acquired once per cycle provides rapid absolute quantification of initial template copy numbers as PCR products are generated. This technique significantly simplifies and accelerates the process of producing reproducible quantification of nucleic acid molecules. It not only is a sensitive, accurate and rapid quantitative method, but it also provides an easier way to calculate the absolute starting copy number of nucleic acid molecules to be tested. Together with molecular bio-techniques, like microarray, real-time PCR will play a very important role in many aspects of molecular life science such as functional gene analysis and disease molecular diagnostics. This review introduces the detailed principles and application of the real-time PCR technique, describes a recently developed system for exact quantification of AUX/IAA genes In Arabidopsis, and discusses the problems with the real-time PCR process. 展开更多
关键词 real-time pcr technique quantification of plant nucleic acid molecules gene expression molecular medicine
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奶牛乳房炎病原微生物20联核酸检测试剂盒(PCR-荧光探针法)的临床应用评估
2
作者 胡秀花 王子华 +5 位作者 黄鹏成 刘园园 毛君杰 王桂琴 马翀 王少林 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第11期61-69,共9页
为了评估商品化的奶牛乳房炎病原微生物20联核酸检测试剂盒(PCR-荧光探针法)(后文简称为“检测试剂盒”)在临床应用中的适用性,本试验采用传统细菌分离培养、检测试剂盒、16S rRNA基因扩增子测序和药物敏感性试验对宁夏回族自治区9个牧... 为了评估商品化的奶牛乳房炎病原微生物20联核酸检测试剂盒(PCR-荧光探针法)(后文简称为“检测试剂盒”)在临床应用中的适用性,本试验采用传统细菌分离培养、检测试剂盒、16S rRNA基因扩增子测序和药物敏感性试验对宁夏回族自治区9个牧场155份奶牛乳房炎奶样分别进行菌株鉴定和耐药性检测,并将检测试剂盒与其他3种检测结果进行比较和分析。结果显示,检测试剂盒与传统细菌分离培养在病原菌检出情况上基本保持一致,均主要检出了大肠杆菌、芽孢杆菌属和凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)等;检测试剂盒与16S rRNA基因扩增子测序结果在菌属组成上一致性较高,均主要检出了假单胞菌属、链球菌属和葡萄球菌属等;药物敏感性试验结果显示,检出率较高的66株病原菌分离株对β-内酰胺类抗菌药物的耐药率普遍偏高;奶样中β-内酰胺酶耐药基因blaZ的检测试剂盒检出结果与同一奶样中分离菌株的药物敏感性试验结果一致率达58%(7/12)。综上所述,该检测试剂盒具有较高的准确度和病原覆盖率,可为牧场奶牛乳房炎主要病原的快速诊断和耐药基因(blaZ)监测提供有效的技术支持,从而降低抗菌药物的使用量,以减少牧场经济损失。 展开更多
关键词 奶牛乳房炎病原微生物20联核酸检测试剂盒(pcr-荧光探针法) 细菌分离培养 16S rRNA基因扩增子测序 药物敏感性试验
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荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸的质控结果分析
3
作者 宋广萍 《实验室检测》 2024年第7期101-103,共3页
目的分析浅析荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸的质控结果。方法在2021年5月至2022年11月期间,120例流感病毒感染样本进行研究。对这些样本的流感病毒RNA进行了核酸抽提,并利用PCR实时荧光定量技术进行检测以评估其效果。结果运用该... 目的分析浅析荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸的质控结果。方法在2021年5月至2022年11月期间,120例流感病毒感染样本进行研究。对这些样本的流感病毒RNA进行了核酸抽提,并利用PCR实时荧光定量技术进行检测以评估其效果。结果运用该技术检测到乙型流感病毒44例,甲1型40例,以及甲3型36例。所有检测结果均符合分子生物学操作的质控标准,合格率达到100.0%。结论实时核酸PCR技术在临床流感病毒检测中被广泛应用。PCR实时荧光定量检测法在流感病毒核酸检测中的表现精确且迅速,适宜作为应对突发公共卫生事件的首选检测手段。 展开更多
关键词 荧光实时定量 pcr法检测 流感病毒核酸 质控结果
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PCR和核酸探针检测猪源沙门氏菌四环素耐药基因tetC的研究 被引量:15
4
作者 代敏 王红宁 吴琦 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期482-485,共4页
对沙门氏菌的四环素耐药性进行了检测,结果表明,沙门氏菌对四环素类抗生素产生了广泛的耐药性,耐药率达100%,对其四环素耐药基因tetC进行了扩增,结果获得以质粒为模板的特异性产物,与药敏试验结果阳性符合率75%,具有较高的检出率。用光... 对沙门氏菌的四环素耐药性进行了检测,结果表明,沙门氏菌对四环素类抗生素产生了广泛的耐药性,耐药率达100%,对其四环素耐药基因tetC进行了扩增,结果获得以质粒为模板的特异性产物,与药敏试验结果阳性符合率75%,具有较高的检出率。用光生物素对PCR产物进行标记,制备核酸探针,采用菌落原位杂交的方法对沙门氏菌进行检测,结果表明13株阳性、3株阴性,杂交结果与PCR结果阳性符合率为93.75%,具有较高的特异性。通过条件的优化,建立的四环素耐药基因tetC的PCR和核酸探针检测技术,为四环素耐药性的分子流行病学监测提供了有效的途径。 展开更多
关键词 沙门氏菌 TETC 耐药基因 核酸探针 pcr 四环素类抗生素 流行病学监测 pcr产物 耐药性 试验结果 原位杂交 检测技术 特异性 符合率 耐药率 阳性 检出率 生物素 药敏
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动物源性食品鸭血、猪血DNA提取及多重PCR鉴别研究 被引量:12
5
作者 吕二盼 周正 +6 位作者 周巍 李洋洋 张薇 吴涛 曾小盼 李波 张伟 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2012年第16期228-231,256,共5页
目的:研究从鸭血、猪血中提取DNA的快速简便方法并建立多重PCR鉴别方法。方法:用KI提取法从固体块状鸭血、猪血中提取DNA,经PCR扩增检测提取效果。建立多重PCR方法鉴别动物源性食品中的鸭血、猪血成分,并对市售动物源性血制品进行检测... 目的:研究从鸭血、猪血中提取DNA的快速简便方法并建立多重PCR鉴别方法。方法:用KI提取法从固体块状鸭血、猪血中提取DNA,经PCR扩增检测提取效果。建立多重PCR方法鉴别动物源性食品中的鸭血、猪血成分,并对市售动物源性血制品进行检测。结果:这种方法提取到的DNA纯度较高,凝胶电泳条带整齐,背景清晰;PCR反应能扩增出目的条带。多重PCR能同时扩增出鸭和猪的条带。结论:这种改进的DNA抽提方法能获得高纯度DNA,比传统方法安全、简便、节省试剂,PCR扩增结果很好,应用多重PCR方法能同时检测出血样制品中的鸭、猪成分。 展开更多
关键词 鸭血、猪血DNA 核酸提取 多重pcr检测
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基于锁核苷酸(LNA)增敏的植烟土壤中烟草黑胫病菌定量PCR检测方法 被引量:4
6
作者 刘芳 宋纪真 +3 位作者 范艺宽 牟文君 奚家勤 胡利伟 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第12期14-19,共6页
为了快速有效地检测植烟土壤中的烟草黑胫病菌的定殖数量,以一种锁核苷酸(LNA)引物为基础,进行了植烟土壤中烟草黑胫病菌数量的定量PCR检测方法研究。结果表明:①与普通DNA引物相比,LNA引物提高了PCR反应的退火温度,减少了引物... 为了快速有效地检测植烟土壤中的烟草黑胫病菌的定殖数量,以一种锁核苷酸(LNA)引物为基础,进行了植烟土壤中烟草黑胫病菌数量的定量PCR检测方法研究。结果表明:①与普通DNA引物相比,LNA引物提高了PCR反应的退火温度,减少了引物二聚体和非特异性产物的形成,提高了烟草黑胫病菌分子检测的灵敏度与特异性;②定量分析检测出14个烟草一大蒜轮作土样中烟草黑胫病菌的定殖数量为2.76×10^3~5.20×10^4个/g,且在4~5h内完成检测,具有较高的灵敏度和检测效率。 展开更多
关键词 植烟土壤 烟草黑胫病菌 锁核苷酸(LNA) 荧光定量pcr 分子检测
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半巢式RT-PCR法检测呼吸道合胞病毒 被引量:2
7
作者 茅海燕 卢亦愚 +4 位作者 汤宏峰 严菊英 李婵 谢荣辉 冯燕 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1448-1450,共3页
目的 建立快速、敏感、特异的人呼吸道合胞病毒 (Respiratorysyncytialvirus ,RSV)检测方法。 方法 根据RSVF基因的保守序列设计 3条引物 ,建立半巢式RT -PCR(semi-nestedRT -PCR)检测方法。用该方法检测12 5例患急性下呼吸道感染的... 目的 建立快速、敏感、特异的人呼吸道合胞病毒 (Respiratorysyncytialvirus ,RSV)检测方法。 方法 根据RSVF基因的保守序列设计 3条引物 ,建立半巢式RT -PCR(semi-nestedRT -PCR)检测方法。用该方法检测12 5例患急性下呼吸道感染的婴幼儿的鼻咽吸引物 (nasopharyngealaspirates,NPA)标本 ,同时对标本进行病毒分离和直接免疫荧光法检测。结果 该半巢式RT -PCR灵敏度为 0 .1TCID50 ,用该方法在 12 5例标本中共检出RSV阳性标本 6 3例 ,阳性率 5 0 .4 %。结论 建立快速、敏感、特异的RSV半巢式RT -PCR检测方法 。 展开更多
关键词 呼吸道合胞病毒 半巢式RT-pcr 核酸检测
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鲑鱼甲病毒阳性核酸物质制备及RT-PCR检测方法的建立 被引量:1
8
作者 刘敏 杜航 +4 位作者 宋傲臣 高帅 唐丽杰 蒋烨 李一经 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期56-62,共7页
为建立快速检测鲑鱼甲病毒(Salmonid alphavirus,SAV)RT-PCR方法,根据Gen Bank公布的E2基因序列(1 375 bp)设计引物,扩增S AV E2全长基因,利用假病毒制备技术获得包裹E2核酸物质(RNA)的SAV假病毒溶液。以SAV假病毒作为阳性核酸物质质控... 为建立快速检测鲑鱼甲病毒(Salmonid alphavirus,SAV)RT-PCR方法,根据Gen Bank公布的E2基因序列(1 375 bp)设计引物,扩增S AV E2全长基因,利用假病毒制备技术获得包裹E2核酸物质(RNA)的SAV假病毒溶液。以SAV假病毒作为阳性核酸物质质控品,以E2F:5'CCG-TTG-CGG-CCA-CAC-TGG-ATG 3',E2R:5'CCT-CAT-AGG-TGA-TCG-ACG-GCA-G 3'为引物,优化反应条件,建立SAV的RT-PCR检测方法。结果表明,该方法可扩增SAV E2特异性516 bp的DNA片段,引物最适反应浓度为1.0μmol·L-1,最佳退火温度为57.5℃,对SAV的三种亚型SAV1(V4640)、SAV2(V4619)、SAV5(V4638)检测结果均为阳性,对SVCV、IHNV和IPNV的PCR扩增结果均为阴性;并确定对SAV的核酸最低检出量达1.59 pg;以RT-PCR方法在不同时间对每份样品作3次重复检测,检测结果一致。表明此方法特异性强,敏感性高,稳定性和重复性较好,可用于SAV临床诊断和检测。 展开更多
关键词 鲑鱼甲病毒 SAV E2 核酸物质 RT-pcr 检测方法
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PCR和核酸探针在临床尖周炎检测中应用的对比研究 被引量:1
9
作者 刘鲁川 史俊南 吉昌华 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1997年第4期297-299,共3页
采用聚合酶链反应(PCR)和核酸探针杂交技术,检测了100例临床尖周炎患牙根管内标本中牙龈卟啉菌(Pg)的分布,并对两种方法进行了对比研究。结果显示:①PCR对尖周炎中Pg的检出率为74%,核酸探针为76%,两者的总... 采用聚合酶链反应(PCR)和核酸探针杂交技术,检测了100例临床尖周炎患牙根管内标本中牙龈卟啉菌(Pg)的分布,并对两种方法进行了对比研究。结果显示:①PCR对尖周炎中Pg的检出率为74%,核酸探针为76%,两者的总符合率达到94%;②在两种方法检测的所有项目对比组之间均未见显著性差异(P>0.05);③Pg与尖周炎临床症状中的自发痛、叩痛、臭味和尖周肿胀有关(P<0.01或P<0.05)。提示PCR和核酸探针技术均具有准确、快速、方便的优点。 展开更多
关键词 核酸探针 牙龈卟啉菌 根尖周围炎 聚合酶链反应
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数字液滴PCR图像的荧光信息提取 被引量:1
10
作者 李姗姗 王子超 +2 位作者 于成壮 魏春阳 李军委 《光学精密工程》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第7期821-829,共9页
针对数字液滴聚合酶链式反应(droplet digital Polymerase Chain Reaction,ddPCR)核酸检测中数字聚合酶链式反应由液滴数量多、尺寸小、排列紧密、荧光强度不均匀而导致的液滴难以计数问题,提出一种图像处理方法,基于灰度遍历法采集图... 针对数字液滴聚合酶链式反应(droplet digital Polymerase Chain Reaction,ddPCR)核酸检测中数字聚合酶链式反应由液滴数量多、尺寸小、排列紧密、荧光强度不均匀而导致的液滴难以计数问题,提出一种图像处理方法,基于灰度遍历法采集图像的信息,通过微分分析法对液滴进行分类和计数,可准确采集ddPCR实验的图像信息。通过卷积算法去除图像中的噪声,使用灰度分布均衡化法增强图像的对比度。以灰度遍历的方式将图像在逐个阈值下二值化,并以几何条件为限制统计液滴数量。通过微分分析法对数据进行分析,得出荧光液滴与全部液滴的计数结果。在以人类gDNA(genomic DNA)为检测样本的ddPCR实验中,该算法的平均检测准确率为99.36%,与商用仪器算法和同类算法相比分别提高了2.24%,2.53%。该方法为ddPCR实验提供了可靠的检测结果,可更好地适用于ddPCR实验。 展开更多
关键词 荧光斑点检测 数字液滴pcr 核酸检测 图像处理 图像分析
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荧光定量PCR仪计量校准结果的影响因素分析及控制 被引量:5
11
作者 梁文 罗超 盛舒瑶 《上海计量测试》 2020年第1期2-3,6,共3页
分析了荧光定量PCR仪计量校准过程中,温度检测部分和核酸样品定量检测部分的影响因素和控制方法,为校准实验室减小试验误差,提供准确可靠的荧光定量PCR仪计量校准结果提供参考。
关键词 定量pcr 温度检测 核酸检测
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PCR-核酸试纸条法检测食品中假结核耶尔森菌 被引量:1
12
作者 莎日娜 赵良娟 +1 位作者 庞璐 张宏伟 《食品安全质量检测学报》 CAS 2018年第23期6107-6111,共5页
目的建立一种基于PCR-核酸试纸条技术快速检测食品中假结核耶尔森菌的方法。方法将10株假结核耶尔森菌株和9株其他耶尔森氏菌及18株来源菌株作为实验菌株进行特异性实验;通过纯菌液计数、干扰菌实验检测进行灵敏度验证。结果 DNA检测可... 目的建立一种基于PCR-核酸试纸条技术快速检测食品中假结核耶尔森菌的方法。方法将10株假结核耶尔森菌株和9株其他耶尔森氏菌及18株来源菌株作为实验菌株进行特异性实验;通过纯菌液计数、干扰菌实验检测进行灵敏度验证。结果 DNA检测可达到10^(-3)μg/mL,25g样品加菌实验灵敏度可达100 CFU/25 g,添加10倍干扰菌不会降低检测灵敏度。利用建立方法对市场购买的食品进行筛查并与国标方法进行比较,建立方法的灵敏度优于国标方法。结论该方法检测结果准确,灵敏度高,适用于检测食品中假结核耶尔森菌。 展开更多
关键词 假结核耶尔森菌属 pcr-核酸试纸条 快速检测
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乳品检测中实时荧光定量PCR仪的研制
13
作者 彭年才 苏明权 张镇西 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2007年第5期62-64,共3页
完成了荧光检测系统、PCR热循环扩增系统、DNA核酸定量分析诊断系统等仪器关键技术研究,针对乳品检验及临床应用要求,在国家权威部门完成了仪器性能检测、使用验证、临床试验等全过程,实现了产品化和应用示范,并达到了准确性、安全性和... 完成了荧光检测系统、PCR热循环扩增系统、DNA核酸定量分析诊断系统等仪器关键技术研究,针对乳品检验及临床应用要求,在国家权威部门完成了仪器性能检测、使用验证、临床试验等全过程,实现了产品化和应用示范,并达到了准确性、安全性和有效性的要求。 展开更多
关键词 乳品检验 荧光pcr 快速检测
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改良多重PCR在流感病毒检测中的应用
14
作者 张辉 邸红芹 +3 位作者 吴海峰 孙红梅 孟自立 刘战地 《河北医药》 CAS 2022年第6期919-922,共4页
目的评估改良多重PCR在流感病毒临床检测中的效能。方法以达安基因检测试剂盒为参照检测方法,通过检测具有流感样症状的患者咽拭子样本,比较改良多重PCR和达安基因检测试剂盒的检出率。结果共检测261例标本,改良多重PCR和达安基因试剂... 目的评估改良多重PCR在流感病毒临床检测中的效能。方法以达安基因检测试剂盒为参照检测方法,通过检测具有流感样症状的患者咽拭子样本,比较改良多重PCR和达安基因检测试剂盒的检出率。结果共检测261例标本,改良多重PCR和达安基因试剂盒检出甲型流感和乙型流感阳性分为156例(59.8%)、7例(2.7%)和161例(61.7%)、8例(3.1%),两种检测方法甲型流感和乙型流感的检出率差异无统计学意义(P>0.05)。一致性分析显示两种方法检测甲型流感和乙型流感均具有高度一致性(Kappa=0.97,P=0.02和Kappa=0.93,P=0.07)。结论改良多重PCR与达安基因试剂盒检测一致较高,在流感病毒检测中具有良好的应用价值。 展开更多
关键词 流感病毒 核酸检测 荧光定量pcr
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数字PCR在功能核酸精准检测中的研究进展 被引量:12
15
作者 刘晓 朱鹏宇 +2 位作者 王垚 朱水芳 付伟 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期149-162,共14页
数字PCR是近年来迅速发展起来的一种定量分析技术。该技术结果判定不依赖于扩增曲线的循环阈值(Ct),不受扩增效率的影响,具有很好的准确度和重现性,并且可以实现绝对定量分析。数字PCR已经在功能核酸检测、鉴定等研究领域显示出巨大的... 数字PCR是近年来迅速发展起来的一种定量分析技术。该技术结果判定不依赖于扩增曲线的循环阈值(Ct),不受扩增效率的影响,具有很好的准确度和重现性,并且可以实现绝对定量分析。数字PCR已经在功能核酸检测、鉴定等研究领域显示出巨大的技术优势和应用前景。在对数字PCR技术的基本原理和定量方法介绍的基础上,对该技术在功能核酸检测的主要应用领域进行综述,并对数字PCR在功能核酸检测领域中的研究前景做出了展望。 展开更多
关键词 数字pcr 功能核酸 精准检测
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牛肉PCR-核酸试纸条快速鉴定方法的建立及试剂盒的研制 被引量:13
16
作者 姜海瀛 张志杰 +5 位作者 王艳双 张莉 高丽君 李明成 孙丽媛 张丽华 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2021年第18期275-281,共7页
该研究建立肉类食品中牛肉PCR-核酸试纸条快速鉴定方法,并开发快速检测试剂盒。对国家标准中牛的特异性引物进行标记,研发牛肉DNA快速提取试剂和基因检测试剂,采用核酸试纸条进行可视化检测;应用分子克隆及测序技术,克隆牛肉标准品;并... 该研究建立肉类食品中牛肉PCR-核酸试纸条快速鉴定方法,并开发快速检测试剂盒。对国家标准中牛的特异性引物进行标记,研发牛肉DNA快速提取试剂和基因检测试剂,采用核酸试纸条进行可视化检测;应用分子克隆及测序技术,克隆牛肉标准品;并对试剂的特异性、重现性、稳定性及灵敏度进行考察。提取基因组DNA的方法简单、快速,DNA的完整性、浓度及纯度均非常好;退火温度59℃、在20个循环时试纸条检测结果最特异,牛肉正品均出现2条条带,易混品及空白对照均出现1条条带。克隆测序后的牛肉DNA序列与牛线粒体DNA特异指纹区段序列同源性100%。自主研发的试剂盒特异性、重现性、稳定性良好,模板DNA最低检出量为1 pg/μL。该研究建立的PCR-核酸试纸条方法特异性强、灵敏、准确、简便、快速;研制的试剂盒操作简便快速、结果可视稳定,适用于实地监测。 展开更多
关键词 pcr 核酸试纸条 牛肉 快速检测试剂盒 分子克隆 测序
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用于高集成度数字PCR平台的微流控芯片 被引量:5
17
作者 张道远 林树靖 +2 位作者 王菲 王砚璞 陈迪 《微纳电子技术》 CAS 北大核心 2022年第3期242-249,共8页
数字聚合酶链式反应(PCR)是一种强大且应用广泛的核酸检测技术。现有数字PCR平台大多存在体积庞大、集成度低、耗材价格高、样品消耗大和人工干预多等缺点。设计并制备了一款基于样本自分离的低成本数字PCR微流控芯片,该芯片的独立PCR... 数字聚合酶链式反应(PCR)是一种强大且应用广泛的核酸检测技术。现有数字PCR平台大多存在体积庞大、集成度低、耗材价格高、样品消耗大和人工干预多等缺点。设计并制备了一款基于样本自分离的低成本数字PCR微流控芯片,该芯片的独立PCR微反应腔室数量达到37440个。通过对芯片进行进样效率、亲水性改良以及透光性研究,验证了该芯片完全可以满足高集成度数字PCR平台的实验需求。实验结果表明,芯片样液注入与防蒸发矿物油注入全过程可以在2 min内完成,且样品消耗总体积在2μL以内。根据进样腔室数量占总腔室数量比例,得出芯片进样效率可以达到99%以上,且经过亲水性处理后的芯片透光率可达到90%以上。该微流控芯片能很好地满足高集成度数字PCR平台的使用需求。 展开更多
关键词 数字聚合酶链式反应(pcr) 微流控芯片 核酸检测 亲水性改良 透光率
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扎伊尔型、苏丹型埃博拉病毒TaqMan探针实时定量PCR核酸检测方法的建立 被引量:2
18
作者 贾佳 康晓平 +6 位作者 李裕昌 吴晓燕 张雨 张雪松 霍耐凡 冉鑫 杨银辉 《国际药学研究杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期80-84,共5页
目的建立针对扎伊尔型(ZEBOV)及苏丹型埃博拉病毒(SEBOV)特异、灵敏和快速的Taq Man探针实时定量PCR核酸检测方法。方法选用世界卫生组织(WHO)参比实验室所使用的引物和探针序列,建立针对扎伊尔型及苏丹型埃博拉病毒的NP基因序列保守区... 目的建立针对扎伊尔型(ZEBOV)及苏丹型埃博拉病毒(SEBOV)特异、灵敏和快速的Taq Man探针实时定量PCR核酸检测方法。方法选用世界卫生组织(WHO)参比实验室所使用的引物和探针序列,建立针对扎伊尔型及苏丹型埃博拉病毒的NP基因序列保守区的Taq Man探针实时定量PCR核酸检测方法,验证检测方法的灵敏性、特异性和稳定性,并与常规PCR检测方法进行比较。结果所建立的实时定量PCR方法可用于ZEBOV及SEBOV的特异性检测,较传统PCR方法反应快捷、灵敏,分别可达:ZEBOV 34拷贝/反应、SEBOV 24拷贝/反应;具有良好的特异性、稳定性和可重复性。结论建立了ZEBOV及SEBOV Taq Man探针实时定量PCR核酸检测方法,该方法可有望用于埃博拉病毒(EBOV)的实验室、临床及现场核酸检测。 展开更多
关键词 埃博拉病毒 扎伊尔型 埃博拉病毒 苏丹型 TaqMan探针实时定量pcr 核酸检测
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RT-PCR检测蓝舌病毒技术的建立 被引量:2
19
作者 张芃玮 董长垣 +3 位作者 涂攀 郭淑芳 陈晓 严银芳 《中国病毒学》 CSCD 2001年第4期393-396,共4页
Using primers complementary to the conserved sequence previously published of BTV genomic dsRNA segment 7,a part of the 5′end of segment 7 was synthesized and amplified by RT PCR method.We adapted this method to test... Using primers complementary to the conserved sequence previously published of BTV genomic dsRNA segment 7,a part of the 5′end of segment 7 was synthesized and amplified by RT PCR method.We adapted this method to test on 12 blood samples suspected to be with BTV and the blood sample of a health sheep as a negative control.The results suggested that eleven of the twelve samples were positive,one was negative.In order to compare the sensitivity and reliability of RT PCR technique,Vero cells were used to isolate BTV from these suspected samples and the results will be a control.The study proved that RT PCR is a rapid,sensitive and precise method for detection and identification of bluetongue virus in clinical samples,animal quarantine and scientific research. 展开更多
关键词 蓝舌病毒 DSRNA RT-pcr 病毒核酸检测
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基于锁核酸及等位位点特异性扩增技术的KRAS基因突变检测荧光定量PCR方法研究 被引量:3
20
作者 刘明华 景奉香 +4 位作者 李瑶 吴海 张冀申 张亚龙 孙文洁 《生命科学研究》 CAS CSCD 2017年第3期189-194,共6页
基于等位位点特异性扩增的原理,设计锁核酸修饰KRAS基因突变特异性扩增引物,结合封阻探针技术,建立检测KRAS基因突变的荧光定量PCR方法。结果发现,锁核酸修饰的引物及探针可显著提高等位位点特异性扩增技术用于复杂样本中的微量基因突... 基于等位位点特异性扩增的原理,设计锁核酸修饰KRAS基因突变特异性扩增引物,结合封阻探针技术,建立检测KRAS基因突变的荧光定量PCR方法。结果发现,锁核酸修饰的引物及探针可显著提高等位位点特异性扩增技术用于复杂样本中的微量基因突变检测的敏感度,该技术检测KRAS基因突变的敏感性可达0.01%~0.1%。进一步用建立的荧光定量PCR方法检测52例结直肠癌患者血浆标本,并用DNA测序法作为对照,同时用健康人血浆标本建立阴性检测结果判读标准,以初步评价该方法应用于循环DNA中KRAS基因突变检测的可行性。结果发现结直肠癌患者KRAS基因突变主要是G12C、G12A和G12R,而且q PCR法的阳性检出率为46.15%,高于DNA测序法(13.46%),阴性结果与DNA测序法的符合率为100%。此外,结直肠癌患者外周血KRAS基因的突变检出率与文献报道组织标本中的突变检出率及常见突变类型基本相符。上述结果说明该方法检测循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ct DNA)具有较高的可靠性,可以用于肿瘤患者循环血液中KRAS基因突变的检测。 展开更多
关键词 结直肠癌 循环肿瘤DNA(ct DNA) KRAS基因突变检测 荧光定量pcr方法(q pcr) 等位基因扩增 锁核酸(LNA) 分子靶向治疗
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