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Automated Red Deer Algorithm with Deep Learning Enabled Hyperspectral Image Classification
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作者 B.Chellapraba D.Manohari +1 位作者 K.Periyakaruppan M.S.Kavitha 《Intelligent Automation & Soft Computing》 SCIE 2023年第2期2353-2366,共14页
Hyperspectral(HS)image classification is a hot research area due to challenging issues such as existence of high dimensionality,restricted training data,etc.Precise recognition of features from the HS images is importa... Hyperspectral(HS)image classification is a hot research area due to challenging issues such as existence of high dimensionality,restricted training data,etc.Precise recognition of features from the HS images is important for effective classification outcomes.Additionally,the recent advancements of deep learning(DL)models make it possible in several application areas.In addition,the performance of the DL models is mainly based on the hyperparameter setting which can be resolved by the design of metaheuristics.In this view,this article develops an automated red deer algorithm with deep learning enabled hyperspec-tral image(HSI)classification(RDADL-HIC)technique.The proposed RDADL-HIC technique aims to effectively determine the HSI images.In addition,the RDADL-HIC technique comprises a NASNetLarge model with Adagrad optimi-zer.Moreover,RDA with gated recurrent unit(GRU)approach is used for the identification and classification of HSIs.The design of Adagrad optimizer with RDA helps to optimally tune the hyperparameters of the NASNetLarge and GRU models respectively.The experimental results stated the supremacy of the RDADL-HIC model and the results are inspected interms of different measures.The comparison study of the RDADL-HIC model demonstrated the enhanced per-formance over its recent state of art approaches. 展开更多
关键词 Hyperspectral images image classification deep learning adagrad optimizer nasnetlarge model red deer algorithm
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Population and genetic diversity of Tibetan red deer based on fecal DNA 被引量:6
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作者 Hejiao Hu Bo Xing +3 位作者 Miao Yang Hamenya Mpemba Zhonghai Lv Minghai Zhang 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2018年第1期227-232,共6页
The Tibet Shannan Red Deer Nature Reserve is the center of the geographic distribution of Tibetan red deer. This paper presents the results of DNA analysis of 199 red deer fecal pellet groups collected during 2013 and... The Tibet Shannan Red Deer Nature Reserve is the center of the geographic distribution of Tibetan red deer. This paper presents the results of DNA analysis of 199 red deer fecal pellet groups collected during 2013 and 2014 during the green-plant period. We successfully extracted DNA from 87 DNA pellet groups and determined individual identification with 12 microsatellite loci. We evaluated the genetic diversity of the population and various population estimates with Capwire in R software. The87 successfully extracted pellet groups were from 50 individuals. In the population, the average number of alleles was 7.58 ± 0.18, the average effective number of alleles was 4.58 ± 0.15, and average polymorphism information content was 0.67 ± 0.01. Among the 12 loci,only T123 was moderately polymorphic; the other 11 loci were highly polymorphic. Expected heterozygosity ranged from 0.45 to 0.91, with an average of 0.72 ± 0.01, and average observed heterozygosity was 0.52 ± 0.11.Although Tibetan red deer remains endangered, the high genetic diversity indicates that this population has a good chance of recovery. This study provided insight that could be used by the local forestry department to develop programs to protect Tibetan red deer. 展开更多
关键词 Fecal DNA Individual identification POPULATION Tibetan red deer
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The nutritional composition and digestion of plants foraged by red deer(Cervus elaphus xanthopygus) in northeast China 被引量:2
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作者 Yuan Feng Yanze Yu +2 位作者 Linqiang Zhong Weiqi Zhang Minghai Zhang 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2018年第3期840-847,共8页
We studied species of plants foraged by red deer in the Muling forest region of northeastern China during January 2014 and 2015. We focused on nutritional composition, energy content, and the digestibility of these pl... We studied species of plants foraged by red deer in the Muling forest region of northeastern China during January 2014 and 2015. We focused on nutritional composition, energy content, and the digestibility of these plants. Crude protein content varied by plant species.Average crude protein content was 7.5 ± 1.7% of dry matter, ranging from 4.5 to 10.3%. Crude lipid content did not vary by species and averaged 7 ± 1.5%(range5.4–9.8%). Non-fiber carbohydrate(NFC) and neutral detergent fiber(NDF) content varied broadly with average values being 20.1 ± 4.8%(range 13.5–28.8%) and64.7 ± 5.9%(range 53.5–71.8%), respectively. Energy content ranged from 16.7 to 19.7 k J/g. Average dry matter digestibility(DMD) was 46.1 ± 4.8%, with a range from38.7 to 54.6%. Only three plants, Saussurea manshurica,Aralia elata and Equisetum hyemale exhibited DMD [ 50%. NFC content explained most of the variation in energy content(r = 0.451). In contrast, energy content was inversely related to NDF(r =-0.443). There was no correlation between crude protein, crude lipid, and energy content(r= 0.004, r=-0.190). S. manshurica,A. elata and E. hyemale had higher NFC and lower NDF content. Thus, these species offered the greatest nutritional value for wintering red deer in the study area. Along with high CP and NFC content, Taxus cuspidate also had high lignin content, and was thus, considered a good forage species for red deer. 展开更多
关键词 Dry matter digestibility Nutritional composition red deer Winter diets
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Variation in winter daily range area of red deer(Cervus elaphus xanthopygus) based on DNA extracted from fecal samples 被引量:1
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作者 Miao Yang Yue Sun +2 位作者 Wei Qi Zhang Hongyi Yuan Minghai Zhang 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2019年第5期1951-1958,共8页
With environmental change and increased human activity,wild red deer(Cervus elaphus xanthopygus)populations and habitat area continue to decrease.Red deer is a main prey species of Amur tiger(Panthera tigris altaica).... With environmental change and increased human activity,wild red deer(Cervus elaphus xanthopygus)populations and habitat area continue to decrease.Red deer is a main prey species of Amur tiger(Panthera tigris altaica).Factors affecting red deer winter home range in the Wanda montains of northeast China are not well understood.In this study,we aimed to better document red deer daily ranges to support conservation of red deer.A second objective was to develop a practical research method combining macro-and micro-technology for home range research on a variety of rare or endangered wild species.We collected 105 fresh fecal samples of red deer in three different periods during winter from December 2012 to March 2013 in the Wandashan region,Heilongjiang Province,China.Individual and sex identities were analyzed based on fecal DNA using microsatellite DNA.We used samples from deer farms for correction and validation of our identifications from field samples.We used a combination of molecular scatology,3S techniques(GPS),and direct observation to estimate winter daily range areas.Based on eleven microsatellite loci,we identified 18 individuals,10 females and 8 males,with a correction factor of 1.00 and sex ratio of 1:0.8.The mean(±SE)number of alleles was 5.1±0.41,and mean polymorphism information content was 0.63±0.03.Expected heterozygosity ranged from 0.46 to 0.81,with a mean of 0.69±0.03,and mean observed heterozygosity was 0.73±0.07.Sizes of mean daily ranges were 26.1±1.1 ha in December,89.3±1.6 ha in January,and 67.5±1.9 ha in March,indicating the following trend for daily range area:middle winter>late winter>early winter.Mean daily range area was insignificantly larger for males than for females.Estimated winter daily ranges were similar to those reported for Europe.Our combination of macro-and micro-technology proved useful for estimating winter home range areas of red deer. 展开更多
关键词 DAILY range Molecular scatology red deer TEMPORAL scale WINTER
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Protein Nutrition in Red Deer (Cervus elaphus)
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作者 罗理扬 陈化鹏 +2 位作者 谢绪昌 韩亚贞 王玉清 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 1997年第3期174-181,共8页
Red deer can adjust to seasonal change of forage quality to maintain a relatively constant crude protein level (21. 1±4.0, 14.7± 1 .0, 11. 1± 1. 1 and 6.5 ±0.8 in spring. summer. fall and winter. r... Red deer can adjust to seasonal change of forage quality to maintain a relatively constant crude protein level (21. 1±4.0, 14.7± 1 .0, 11. 1± 1. 1 and 6.5 ±0.8 in spring. summer. fall and winter. respectively). Apparent protein digestibility is variable from -99.9% to 97.5%, depending upon season and forage type. True protein digestibility is 99%. Digestion of protein is significantly influenced by phenolics in diets.Minimumm digestible energy intase of 153.5kcal/kg0.75/day is necessary to maintain a positive nitrogen balance. Red deer recycles 18-85% of the urea produced and urea kinetic parameters (urea pool size, urea entry rate and urea excretion rate) are correlated to plasma urea conccntration. Rumen NH3-N production changes with season, but seasonal changcs in other NH3-N kinetic parameters (NH3-N concentration, NH3-N pool size and NH3-N outflow rate) are in dispute. Protein metabolism may be promoted in response to cold strcss. Endogenous urinary nitrogen is 0.09 (red deer) and 0. 16 g N/kg0.75day (elk), and metabolic frcal nitrogen is 5.58 g N/kg dry-matter intake. Protein requirements ranges from 100 g/kg DM to 170 g/kg DM for red deer of various ages and physiological stages. In conclusion.the knowledge of protein nutrition of red deer is limite.Much work is urgently needed in metabolism and requirements of protein before the appropriate feeding standard of red deer is coming. 展开更多
关键词 red deer cervus elaphus PROTEIN NUTRITION
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Wintering Habitat Evaluation of Red Deer (Cervus elaphus)in Forest Area of Northeastern China
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作者 张明海 许庆翔 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 1998年第2期102-104,共3页
Six ultimate factors (forage abundance, horizontal sheltering class, distance from human disturbance,snow depth, tree coverage, and edge effect) of Red deer (Cervus elaphus) were investigated in eastern Heilongjiang P... Six ultimate factors (forage abundance, horizontal sheltering class, distance from human disturbance,snow depth, tree coverage, and edge effect) of Red deer (Cervus elaphus) were investigated in eastern Heilongjiang Province during winter from 1988 to 1991. On the basis of analysis of field data, we evaluated winter habitat conditions of Red deer. The results showed as follows; the wintering habitat quality of Red deer in poplar-birch stands was excellent in the Wanda Mountains, and was moderate in shrub-woods and Korean pine seed stands.According to habitat index (HI) values, the habitat quality in poplar-birch stands (HI=0.8185) was superior to that in shrub-woods (HI=0.4825) and in Korean pine seed stands (HI=0.4385). The wintering habitat quality of Red deer in the Wanda Mountains was superior to that of Daning Forestry Region. According to the current situations of forestry areas in northeastern China, strengthening habitat management was important for the conservation and management of Red deer population in the next decades. 展开更多
关键词 red deer CERVUS ELAPHUS HABITAT EVALUATION HABITAT suitability index
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吉林省黄泥河林区东北马鹿野外放归成效评估
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作者 田新民 宋雅祺 +1 位作者 赵雨桐 靳勇超 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第14期6383-6390,共8页
野外放归是维系濒危物种野生种群长期续存的重要途径,对放归成效的监测研究有利于濒危动物种群科学有效的管理。采用非损伤性标志重捕法评估了吉林省张广才岭南部黄泥河林区东北马鹿的种群数量与分布;利用粪便DNA信息,从亲权鉴定和遗传... 野外放归是维系濒危物种野生种群长期续存的重要途径,对放归成效的监测研究有利于濒危动物种群科学有效的管理。采用非损伤性标志重捕法评估了吉林省张广才岭南部黄泥河林区东北马鹿的种群数量与分布;利用粪便DNA信息,从亲权鉴定和遗传多样性方面对其放归成效进行了评估。结果显示:(1)黄泥河林区马鹿种群数量平均90(68—124)只,密度0.045(0.034—0.063)只/km^(2),主要分布于林区北部,呈现一定程度的地理隔离;(2)性别鉴定显示,野生种群的雌雄性比1.71∶1,放归后雌雄性比1.83∶1,放归提高了种群的可繁殖概率;(3)亲权鉴定检测到,放归个体(R3)与野生个体在野外成功繁殖,并产下子代;(4)野外放归向野生种群引入了平均2.9个“新”的等位基因,提高了其遗传多样性水平。在种群密度、可繁殖率、遗传多样性方面对马鹿放归的有效性进行了证实,但建议进一步在行为节律、家域和生境选择等方面开展研究,系统性评估马鹿种群的放归成效。 展开更多
关键词 东北马鹿 野外放归 黄泥河林区 粪便DNA
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基于SMRT测序技术的塔里木马鹿冬季肠道菌群多样性分析
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作者 祁程 姜李欢 +3 位作者 阿卜杜萨拉木·努尔麦麦提 王开彦 单文娟 钟林强 《野生动物学报》 北大核心 2024年第1期58-66,共9页
为探究塔里木河流域塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)冬季肠道菌群群落结构、多样性与功能,采用PacBio平台的单分子实时测序技术(single molecule realtime sequencing,SMRT)对塔里木河上游湿地自然保护区采集并筛选的25份塔里... 为探究塔里木河流域塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)冬季肠道菌群群落结构、多样性与功能,采用PacBio平台的单分子实时测序技术(single molecule realtime sequencing,SMRT)对塔里木河上游湿地自然保护区采集并筛选的25份塔里木马鹿粪便样本的16S rRNA基因全长进行测序,共获得298578个clean reads,clean reads聚类获得28026个OTU,包括25门684属。Alpha多样性分析结果显示,塔里木马鹿冬季肠道菌群Shannon指数为(7.764±0.044),Simpson指数为(0.015±0.001),Chao1指数为(12242.668±695.106),ACE指数为(9366.423±407.612)。塔里木马鹿优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes,60.51%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,26.02%)、变形菌门(Proteobacteria,3.61%)、疣微菌门(Verrucomicrobia,1.57%)和浮霉菌门(Planctomycetes,1.46%)。相对丰富度在前10的菌属为Papillibacter(5.48%)、拟杆菌属(Bacteroides,5.12%)、Muribaculum(4.69%)、Phocaeicola(4.49%)、Lawsonibacter(4.31%)、瘤胃球菌属(Ruminococcus,4.09%)、Intestinimonas(3.06%)、普氏菌属(Prevotella,2.87%)、克里斯滕森菌属(Christensenella,2.71%)和弯曲杆菌属(Campylobacter,2.54%)。PICRUSt 16S功能预测结果表明,塔里木马鹿肠道菌群基因功能主要富集于新陈代谢(48.58%)、遗传信息处理(19.04%)和环境信息处理(12.08%);其中新陈代谢主要以碳水化合物代谢(9.47%)、氨基酸代谢(9.93%)为主,并且环境信息处理的膜转运(9.96%)基因相对丰富度最高。研究揭示了野生塔里木马鹿冬季肠道菌群特征和功能,为塔里木马鹿野生种群的保护提供基础数据。 展开更多
关键词 塔里木马鹿 肠道菌群 单分子实时测序(SMRT) PICRUSt功能预测
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两幅古代画作所见“鹿形象”反映的宋辽关系
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作者 王欣 《赤峰学院学报(哲学社会科学版)》 2024年第3期73-76,共4页
《丹枫呦鹿图》与《秋林群鹿图》是藏于台北故宫博物院的知名古代画作,艺术价值极高,但作者已无从考察,创作年代也存疑。这导致相关研究成果缺乏年代信息,难以形成结论。针对这两幅画作的缘起、作者及年代,古书画鉴定专家张珩和台北故... 《丹枫呦鹿图》与《秋林群鹿图》是藏于台北故宫博物院的知名古代画作,艺术价值极高,但作者已无从考察,创作年代也存疑。这导致相关研究成果缺乏年代信息,难以形成结论。针对这两幅画作的缘起、作者及年代,古书画鉴定专家张珩和台北故宫博物院原副院长李霖灿曾发表见解,多重证据都指向辽代的一组五幅通景屏风画。两位学者的推论有理有据,很值得借鉴,但均基于美术学层面的分析,仅涉及画幅、画法、画风、题材等方面,并未结合当时宋辽两国特殊的政权关系来探讨“鹿形象”在此出现的深层含义、合理性以及所承载的政治象征。本文旨在以历史学视角,对这两幅画作进行深入挖掘,结合宋辽政权关系,探讨“鹿形象”在当时政治环境下可能呈现的特殊内涵。 展开更多
关键词 《丹枫呦鹿图》 《秋林群鹿图》 鹿形象 宋辽关系
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Digestive Rate of Dongtian F_1 Red Dear in Weaning Period and Growth Period
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作者 马泽芳 赵玉芳 +2 位作者 郑雪莉 李铮男 邹奇 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 1998年第2期124-126,共3页
in this paper, 4N-HCLAIA method was adopted to conduct digestive tests in young female and male Dongtian F1 red deer (Cervus elaphus) of rearing seperatefy in growth period and mixed raising in weaning period in Harbi... in this paper, 4N-HCLAIA method was adopted to conduct digestive tests in young female and male Dongtian F1 red deer (Cervus elaphus) of rearing seperatefy in growth period and mixed raising in weaning period in Harbin Specialty Research Institute. Results indicated that digestive rate of crude protein and crude fiber were 95.35% and 73.68% respectively when rational protein content was 26.8% in growth period. Digestive rate was not significantly different between female and male(P>0.05)i During weaning period, When rational crude protein content is 22.06%, digestive rate of crude protein and crude fiber were 93.05% and 63.96%, respectively. The tests suggest that higher rational protein can be effective in accelerating groWth of young Dongtian F1 red deer during growth period and weaning period(before 10 months old). 展开更多
关键词 WEANING period. Growth PERIOD Dongtian F1 red deer Cervus ELAPHUS DIGESTIVE RATE
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穆棱林区野生东北马鹿种群冬季食物组成模式与植物代谢产物的关系
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作者 王琳 周良俊 +2 位作者 魏楷丽 张明海 张玮琪 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第17期7170-7180,共11页
高纬度地带,在冬季食物资源有限的环境中,野生大型有蹄类动物满足营养需求的同时,需要对植物中次生代谢产物进行平衡,回避有害物质并选择对机体有益的成分,从而形成特定的食物组成模式。以东北马鹿(Cervus elaphus xanthopygus)为研究对... 高纬度地带,在冬季食物资源有限的环境中,野生大型有蹄类动物满足营养需求的同时,需要对植物中次生代谢产物进行平衡,回避有害物质并选择对机体有益的成分,从而形成特定的食物组成模式。以东北马鹿(Cervus elaphus xanthopygus)为研究对象,于2020年11月,在黑龙江穆棱东北红豆杉国家级自然保护区境内,采集东北马鹿粪便和植物样本。通过粪便显微分析法确定保护区内马鹿冬季食物组成,采用k-means聚类分析揭示马鹿冬季食物组成模式。应用广泛靶向代谢组技术对部分植物中次生代谢产物的含量进行全覆盖定性和相对定量检测,将食物组成与次生代谢产物数据整合,进行曼特尔检验(Mantel test)分析,以探究植物次生代谢产物对马鹿种群内食物组成模式的影响。结果表明,林区内马鹿种群冬季共采食30种植物,其中木本植物占92.48%;且种群内分别呈现出以东北红豆杉(Taxus cuspidata),簇毛槭(Acer barbinerve),毛榛子(Corylus mandshurica)为主要食物的不同食物组成模式。广泛靶向代谢组技术共检测出638种次生代谢产物,有25种代谢物与马鹿采食频率显著相关,其中多数萜类物质抑制马鹿采食,而鞣质类物质对马鹿的采食选择有一定的正向作用;Mantel test结果显示,上述25种物质中黄酮、鞣质、萜类化合物相对含量与不同马鹿个体食物组成显著相关,说明这些代谢物相对含量和性质的差异会造成种群内不同个体食物组成的差异,是种群内形成不同食物组成模式的原因之一。从植物次生代谢产物角度揭示了该地区东北马鹿种群冬季食物组成模式呈现差异的可能因素,为进一步研究大型有蹄类营养策略和植物化学防御关系提供基础依据。 展开更多
关键词 东北马鹿 食物组成模式 植物次生代谢产物 广泛靶向代谢组
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新疆尉犁县某养殖场塔里木马鹿体表蜱和游离蜱的种类鉴定及分子遗传特征 被引量:1
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作者 方晨 王彦龙 +5 位作者 司俊飞 蒋玉曦 罗慧丽 王云峰 赵爱云 齐萌 《畜牧与饲料科学》 2023年第1期17-23,70,共8页
[目的]了解塔里木马鹿体表蜱及其圈舍环境游离蜱种类及分子遗传特征。[方法]收集新疆尉犁县某规模化养殖场塔里木马鹿体表寄生和圈舍游离蜱共69只,使用体视显微镜对其进行形态学观察和种类初步鉴定;基于蜱线粒体SSU rRNA基因位点和COX ... [目的]了解塔里木马鹿体表蜱及其圈舍环境游离蜱种类及分子遗传特征。[方法]收集新疆尉犁县某规模化养殖场塔里木马鹿体表寄生和圈舍游离蜱共69只,使用体视显微镜对其进行形态学观察和种类初步鉴定;基于蜱线粒体SSU rRNA基因位点和COX I基因位点对其DNA进行PCR扩增,通过序列比对数据鉴定其种类,利用生物信息学方法解析其分子遗传特征。[结果]经形态学观察,鉴定69只蜱均属璃眼蜱属,雌蜱和雄蜱分别有37只和32只。基于SSU rRNA基因位点,对成功获得的63只蜱序列进行比对,鉴定出18只为残缘璃眼蜱,均为同一序列型,命名为SCtype1(n=18);45只为亚洲璃眼蜱,具有4种序列型,分别命名为SYtype1(n=3)、SYtype2(n=40)、SYtype3(n=1)和SYtype4(n=1)。基于COX I基因位点,对成功获得的64只蜱序列进行对比,鉴定出24只为残缘璃眼蜱,具有2种序列型,分别命名为CCtype1(n=22)和CCtype2(n=2);40只为亚洲璃眼蜱,具有5种序列型,分别命名为CYtype1(n=25)、CYtype2(n=7)、CYtype3(n=4)、CYtype4(n=3)和CYtype5(n=1)。种系进化分析显示,在SSU rRNA基因位点,亚洲璃眼蜱序列单独形成一个亚群分支,与其他璃眼蜱属蜱的序列形成一个大的亚群分支;在COX I基因位点,亚洲璃眼蜱序列和残缘璃眼蜱序列单独形成一个亚群分支,与其他属蜱的序列形成不同的亚群分支。[结论]新疆尉犁县塔里木马鹿体表蜱与游离蜱种类为亚洲璃眼蜱和残缘璃眼蜱。研究结果为鹿科动物寄生蜱的种类分布调查和遗传进化特征分析提供了基础数据。 展开更多
关键词 形态学 序列 鉴定 塔里木马鹿
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基于RNA-Seq技术的野生和圈养塔里木马鹿皮肤组织转录组比较分析 被引量:1
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作者 布威海丽且姆·阿巴拜科日 单文娟 +1 位作者 马合木提·哈力克 钟林强 《野生动物学报》 北大核心 2023年第1期76-89,共14页
为探寻野生和圈养塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)的基因表达谱是否存在差异,并进一步筛选该物种适应干旱环境的相关基因,利用RNA-Seq技术对野生和圈养塔里木马鹿的皮肤组织进行转录组测序,对测序数据质控后比对参考基因组,筛... 为探寻野生和圈养塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)的基因表达谱是否存在差异,并进一步筛选该物种适应干旱环境的相关基因,利用RNA-Seq技术对野生和圈养塔里木马鹿的皮肤组织进行转录组测序,对测序数据质控后比对参考基因组,筛选差异表达基因并对其进行功能注释和富集分析,利用qRT-PCR方法对转录组测序结果进行可靠性检测。结果显示:与圈养塔里木马鹿相比,在野生塔里木马鹿皮肤组织中共有3 303个差异表达基因,包括上调表达基因1 535个,下调表达基因1 768个,其中上调表达基因显著富集在221个GO terms和12个KEGG通路上,下调表达基因显著富集在1 104个GO terms和38个KEGG通路上;qRT-PCR分析结果显示,转录组测序结果可靠。相比于圈养塔里木马鹿,皮肤和表皮发育相关基因、DNA损伤修复相关基因、转谷氨酰胺酶编码基因和热休克蛋白家族基因在野生塔里木马鹿皮肤组织中上调表达,表明这些基因可能直接或间接参与塔里木马鹿在极端干旱炎热环境中的皮肤保护策略,通过最大限度地减少水分流失和调节体温来保护机体免受外界刺激的损伤。皮肤发育相关基因(K2C6A)、热应激相关基因(HSPA4、TRAP1和HSPH1)和氧化应激相关基因(PRDX2和PRDX6)在塔里木马鹿干旱环境适应性中可能发挥潜在作用。 展开更多
关键词 塔里木马鹿 环境适应性 转录组 差异表达基因
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小鼠骨髓和鹿茸来源间充质干细胞基本生物学特征比较 被引量:1
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作者 张荠允 方翟 +3 位作者 贾小东 刘嘉伟 侯正创 韩春梅 《塔里木大学学报》 2023年第3期12-17,共6页
为研究塔里木马鹿茸间充质干细胞(MSCs)的生物学特征,本试验对来源于小鼠骨髓和塔里木马鹿茸的2种MSCs进行了体外培养,检测比较了其生长曲线;同时利用光学显微镜和透射电镜对细胞形态特征、结构、细胞器组成和数量进行观察对比。研究发... 为研究塔里木马鹿茸间充质干细胞(MSCs)的生物学特征,本试验对来源于小鼠骨髓和塔里木马鹿茸的2种MSCs进行了体外培养,检测比较了其生长曲线;同时利用光学显微镜和透射电镜对细胞形态特征、结构、细胞器组成和数量进行观察对比。研究发现鹿茸MSCs体外培养呈“S”形生长趋势,增殖速度极显著高于小鼠BMSCs(P<0.01)。鹿茸MSCs形态呈梭形,排列规律,形态均一;小鼠BMSCs形态不规则,呈三角形,多边形;鹿茸MSCs胞体、胞核面积分别为963.053μm^(2)和134.093μm^(2),极显著高于小鼠BMSCs的551.026μm^(2)和79.938μm^(2)(P<0.01);鹿茸MSCs的核质比为0.167,显著低于小鼠BMSCs的0.206(P<0.05);超微结果显示鹿茸MSCs胞体面积较大,细胞器种类简单,线粒体、内质网等细胞器形态具备早期幼稚细胞发育特征。塔里木马鹿茸MSCs增殖能力高于小鼠BMSCs,在开发利用方面具备更广泛的优势。 展开更多
关键词 塔里木马鹿茸 间充质干细胞(MSCs) 生物学特性 超微结构
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小兴安岭马鹿粪便的分解速率
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作者 邵雪峰 平晓莹 +4 位作者 李月圆 陈龙 聂志文 胡远满 李月辉 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期157-163,共7页
粪便分解速率是粪便堆在自然条件下消失所用的时间,利用粪便距离取样法估算鹿科动物种群数量,是种群数量管理研究的重要基础。为揭示高纬度温带大陆性气候条件下的鹿科动物粪便分解速率,解决在我国普遍存在的目标种相对隐蔽、种群密度... 粪便分解速率是粪便堆在自然条件下消失所用的时间,利用粪便距离取样法估算鹿科动物种群数量,是种群数量管理研究的重要基础。为揭示高纬度温带大陆性气候条件下的鹿科动物粪便分解速率,解决在我国普遍存在的目标种相对隐蔽、种群密度低、粪便分散导致的原地回访观测耗时耗力难以完成的问题,本研究在温带大陆性气候的小兴安岭范围内,选择铁力林业局建设林场为研究区,于2015年1月收集38堆马鹿(Cervus elaphus)的新鲜粪便,将这些粪便堆集中移至方便回访的一处马鹿代表性生境——阳坡针阔混交林,记录每堆粪便的原始粪粒数,之后间隔一定时间进行回访并记录每堆粪便剩余的粪粒数和各粪便堆是否分解完全,共回访8次。利用R 4.1.2中的逻辑斯蒂回归得出回归方程的截距b0和斜率b1,再利用MATLAB R2020b计算粪便分解速率。结果表明,马鹿粪便的平均分解速率为(646±53)d。本研究将粪便人工移动集中放置于一处进行观测实验,为研究低种群密度的动物粪便分解速率提供了可行途径,丰富了我国鹿科动物粪便分解速率研究,从而减小了利用粪便距离取样法估算种群数量的阻碍。 展开更多
关键词 马鹿 粪便分解速率 小兴安岭 种群数量 距离取样法
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内蒙古赛罕乌拉自然保护区马鹿夏季肠道菌群多样性 被引量:1
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作者 刘夫仁 赛罕 +4 位作者 贺伟 张正一 冯中华 张梓琪 鲍伟东 《野生动物学报》 北大核心 2023年第1期90-97,共8页
为更好地监测马鹿(Cervus elaphus)的生存状态,有效促进隔离小种群复壮,使用16S rRNA高通量测序技术对内蒙古赛罕乌拉国家级自然保护区马鹿夏季肠道菌群多样性及结构进行分析。结果表明:拟杆菌门(Bacteroidetes,29.55%)、变形菌门(Prote... 为更好地监测马鹿(Cervus elaphus)的生存状态,有效促进隔离小种群复壮,使用16S rRNA高通量测序技术对内蒙古赛罕乌拉国家级自然保护区马鹿夏季肠道菌群多样性及结构进行分析。结果表明:拟杆菌门(Bacteroidetes,29.55%)、变形菌门(Proteobacteria,29.30%)、厚壁菌门(Firmicutes,29.30%)和放线菌门(Actinobacteria,5.78%)是马鹿主要优势菌门;拟杆菌属(Bacteroides,4.30%)、瘤胃球菌属(Ruminococcaceae UCG-005,3.34%)、埃希氏菌-志贺氏菌属(Escherichia-Shigella,2.87%)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter,2.62%)和毛螺菌属(Lachnospiraceae_NK4A136_group,2.43%)是马鹿主要优势菌属。变形菌门、柠檬酸杆菌属和埃希氏菌-志贺氏菌属等与肠道疾病相关的菌群丰度偏高,推测该地区马鹿或许存在肠道疾病。 展开更多
关键词 马鹿 夏季 肠道菌群多样性 16S rRNA测序
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基于mtDNA和Y染色体基因片段的塔河马鹿种公鹿遗传多样性分析
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作者 杨苏坤 董依萌 +3 位作者 王洪亮 赵喜堂 陈旭 邢秀梅 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期2402-2413,共12页
旨在从分子层面探究塔河马鹿种公鹿的遗传多样性和塔河马鹿的祖先类型。本研究在锯茸期采集新鲜血液并提取DNA,通过PCR扩增和直接测序的方法对38头塔河马鹿种公鹿Y染色体的AMELY2、DBY、SRY基因和mtDNA的ND1、COX1、ATP6、ND5、Cytb基... 旨在从分子层面探究塔河马鹿种公鹿的遗传多样性和塔河马鹿的祖先类型。本研究在锯茸期采集新鲜血液并提取DNA,通过PCR扩增和直接测序的方法对38头塔河马鹿种公鹿Y染色体的AMELY2、DBY、SRY基因和mtDNA的ND1、COX1、ATP6、ND5、Cytb基因进行分析,计算碱基组成、核苷酸多样性(Pi)、平均核苷酸差异数(K)、Tajima’D值、单倍型数量(H)以及单倍型多样性(Hd)来评估塔河马鹿种公鹿的遗传多样性;构建单倍型网络图并计算各单倍型之间的遗传距离,以白唇鹿为外群构建系统进化树,分析塔河马鹿种公鹿父母系的类型。结果显示,Y染色体的AMELY2、DBY、SRY基因比对后拼接长度为3577 bp,共检测出17个SNPs多态位点,定义4个单倍型,优势单倍型为Hap-1,所占频率为65.79%。核苷酸多样性为0.00195,单倍型多样性为0.4950,遗传多样性水平较低,基于Y染色体基因构建的系统进化树显示存在A、B两大分支。mtDNA的ND1、COX1、ATP6、ND5、Cytb基因比对后拼接长度为6160 bp,共检测出41个SNPs多态位点,定义8个单倍型,优势单倍型为Hap-1,所占频率为47.37%。核苷酸多样性为0.00154,单倍型多样性为0.6999,表现出高单倍型多样性低核苷酸多样性的不平衡状态,遗传多样性处于较低水平,基于mtDNA构建的系统进化树显示存在Ⅰ、Ⅱ两大分支。塔河马鹿种公鹿的遗传多样性处于较低的水平,塔河马鹿群体存在两个祖先类型。 展开更多
关键词 MTDNA Y染色体 塔河马鹿种公鹿 遗传多样性
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圈养条件下新疆马鹿两个亚种的肠道菌群比较分析
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作者 徐尚华 吴家慧 +4 位作者 张宝峰 石明慧 王一晨 胡昕 胡德夫 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2023年第5期28-37,共10页
肠道菌群组成复杂,与宿主肠道内环境动态平衡和健康息息相关。马鹿是鹿科动物中分布最广的种类,亚种分化众多,但现有马鹿肠道菌群研究较少。为丰富马鹿肠道菌群数据,以马鹿的两个亚种为阶元,运用高通量16S rRNA基因测序技术检测了7头雄... 肠道菌群组成复杂,与宿主肠道内环境动态平衡和健康息息相关。马鹿是鹿科动物中分布最广的种类,亚种分化众多,但现有马鹿肠道菌群研究较少。为丰富马鹿肠道菌群数据,以马鹿的两个亚种为阶元,运用高通量16S rRNA基因测序技术检测了7头雄性天山马鹿和7头雄性塔里木马鹿的肠道微生物,对其核心菌群、结构组成、多样性及肠道微生物的差异进行分析,旨在了解不同马鹿亚种肠道微生物组成差异,为两亚种间肠道菌群的差异提供参考。研究结果表明,塔里木马鹿菌群多样性及丰度低于天山马鹿。厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)及拟杆菌门(Bacteroidetes)为两组马鹿的优势菌门。此外,天山马鹿肠道中分解蛋白质、脂质的拟杆菌门和变形菌门相对丰度高于塔里木马鹿,而分解植物纤维的双歧杆菌(Bifidobacterium)、瘤胃球菌科UCG 014(Ruminococcaceae UCG 014)的相对丰度低于塔里木马鹿。本研究对天山马鹿及塔里木马鹿肠道菌群组成进行初步了解,可根据研究结果调整其饲料配比,为马鹿饲养管理的改善提供参考。 展开更多
关键词 天山马鹿 塔里木马鹿 肠道菌群 16S rRNA基因测序 饲养管理
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饲料霉败原因及对马鹿生产危害和防治探讨 被引量:1
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作者 张生帅 李超程 贾斌 《现代畜牧科技》 2023年第9期63-66,共4页
饲喂霉败饲料在马鹿养殖过程中普遍存在,已成为当今马鹿养殖业一大忧患,而饲喂霉变饲料所产生的危害常被养殖户忽略。由于饲料的购买、运送和储存不当,以及因雨水淋、水泡、潮湿以及加工调制不当等原因,都会导致饲料的腐烂,并会生成蛋... 饲喂霉败饲料在马鹿养殖过程中普遍存在,已成为当今马鹿养殖业一大忧患,而饲喂霉变饲料所产生的危害常被养殖户忽略。由于饲料的购买、运送和储存不当,以及因雨水淋、水泡、潮湿以及加工调制不当等原因,都会导致饲料的腐烂,并会生成蛋白降解、细菌毒素等多种毒性物质。霉变饲料进入马鹿日粮,引起马鹿发生不同程度中毒,给马鹿养殖户造成巨大经济损失,是目前许多马鹿养殖户经常遇到的实际问题。该文就饲料发生霉变的原因、马鹿采食霉败饲料中毒临床症状及其防治措施进行阐述。 展开更多
关键词 马鹿 霉败饲料 防治要点
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仔鹿感染绵羊链球菌、肠球菌的分离鉴定
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作者 王宏图 张金江 +4 位作者 冷婧 赵颖婕 梁蓉蓉 胡建军 敖维平 《现代畜牧兽医》 2023年第2期19-22,共4页
研究旨在掌握新疆南疆某规模鹿场仔鹿发病死亡的细菌性病原,更好地采取防治措施。无菌采集死亡仔鹿的病变组织进行细菌分离培养、生化试验、CAMP试验及16S rRNA的PCR鉴定、药敏试验、动物致病性试验等。结果表明,分离获得两株分离株为... 研究旨在掌握新疆南疆某规模鹿场仔鹿发病死亡的细菌性病原,更好地采取防治措施。无菌采集死亡仔鹿的病变组织进行细菌分离培养、生化试验、CAMP试验及16S rRNA的PCR鉴定、药敏试验、动物致病性试验等。结果表明,分离获得两株分离株为β溶血性绵羊链球菌和肠球菌,经检测筛选出对绵羊链球菌、肠球菌均敏感的药物:哌拉西林、羧苄西林、氨苄西林及亚胺培南。研究表明,试验发病仔鹿存在β溶血性绵羊链球菌和肠球菌的混合感染的情况。 展开更多
关键词 马鹿 细菌分离 β溶血性绵羊链球菌 耐药性
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