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滋肾育胎丸防治早发性卵巢功能不全的转录组和生物信息学研究
1
作者
党蕾
董盈盈
+5 位作者
张春波
宁娜
栗妍
苏碧茹
黄秋凌
王世宣
《世界中医药》
CAS
2023年第24期3500-3507,共8页
目的:通过转录组与生物信息学结合解析滋肾育胎丸防治早发性卵巢功能不全的关键机制。方法:滋肾育胎丸对早发性卵巢功能不全小鼠模型行预防给药,采用二代高通量测序技术对模型组和给药组小鼠卵巢组织行转录组测序,应用基因本体(GO)富集...
目的:通过转录组与生物信息学结合解析滋肾育胎丸防治早发性卵巢功能不全的关键机制。方法:滋肾育胎丸对早发性卵巢功能不全小鼠模型行预防给药,采用二代高通量测序技术对模型组和给药组小鼠卵巢组织行转录组测序,应用基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)行生物功能富集分析,通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析方法预测靶基因。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术验证转录组预测靶基因结果的一致性。结果:给药组较模型组,雌激素、抗米勒管激素和卵巢系数升高,组织中不同发育阶段卵泡数目增加;转录组学结果显示,2组间差异表达基因共57个。GO富集分析发现,差异表达基因涉及调控补体和凝血级联反应等通路;KEGG富集分析发现,差异表达基因涉及胆固醇代谢和脂肪消化与吸收等信号通路。PPI与KEGG富集通路结果中重合基因有Apob、Fga、Plg、Fgb、Apoh,是潜在的靶基因;qRT-PCR验证发现,滋肾育胎丸明显升高Fga和Fgb mRNA表达,降低Apob、Plg、Apoh mRNA表达。结论:滋肾育胎丸可通过Fga、Plg、Fgb调控补体和凝血级联反应通路,Apob和Apoh调控胆固醇代谢和脂肪消化与吸收,进而发挥防治早发性卵巢功能不全作用。
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关键词
滋肾育胎丸
防治早发性卵巢功能不全
转录组学
生物信息学
中药
调控补体和凝血级联反应
胆固醇代谢
脂肪消化与吸收
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题名
滋肾育胎丸防治早发性卵巢功能不全的转录组和生物信息学研究
1
作者
党蕾
董盈盈
张春波
宁娜
栗妍
苏碧茹
黄秋凌
王世宣
机构
华中科技大学同济医学院附属同济医院
广州医药集团有限公司博士后科研工作站
广州白云山中一药业有限公司
出处
《世界中医药》
CAS
2023年第24期3500-3507,共8页
基金
国家自然科学基金项目(82002768)
广东省名优中成药二次开发项目(20174002)。
文摘
目的:通过转录组与生物信息学结合解析滋肾育胎丸防治早发性卵巢功能不全的关键机制。方法:滋肾育胎丸对早发性卵巢功能不全小鼠模型行预防给药,采用二代高通量测序技术对模型组和给药组小鼠卵巢组织行转录组测序,应用基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)行生物功能富集分析,通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析方法预测靶基因。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术验证转录组预测靶基因结果的一致性。结果:给药组较模型组,雌激素、抗米勒管激素和卵巢系数升高,组织中不同发育阶段卵泡数目增加;转录组学结果显示,2组间差异表达基因共57个。GO富集分析发现,差异表达基因涉及调控补体和凝血级联反应等通路;KEGG富集分析发现,差异表达基因涉及胆固醇代谢和脂肪消化与吸收等信号通路。PPI与KEGG富集通路结果中重合基因有Apob、Fga、Plg、Fgb、Apoh,是潜在的靶基因;qRT-PCR验证发现,滋肾育胎丸明显升高Fga和Fgb mRNA表达,降低Apob、Plg、Apoh mRNA表达。结论:滋肾育胎丸可通过Fga、Plg、Fgb调控补体和凝血级联反应通路,Apob和Apoh调控胆固醇代谢和脂肪消化与吸收,进而发挥防治早发性卵巢功能不全作用。
关键词
滋肾育胎丸
防治早发性卵巢功能不全
转录组学
生物信息学
中药
调控补体和凝血级联反应
胆固醇代谢
脂肪消化与吸收
Keywords
Zishen Yutai Pills
Prevention
and
treatment
of
premature ovarian insufficiency
Transcriptome
Bioinformatics
Traditional Chinese medicine
regulation of complement and coagulation cascade reaction
Cholesterol metabolism
Fat digestion
and
absorption
分类号
R271.9 [医药卫生—中西医结合]
R711.15 [医药卫生—妇产科学]
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作者
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1
滋肾育胎丸防治早发性卵巢功能不全的转录组和生物信息学研究
党蕾
董盈盈
张春波
宁娜
栗妍
苏碧茹
黄秋凌
王世宣
《世界中医药》
CAS
2023
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